5G2IA

S. enterica hisa mutant dup13-15(vvr)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
247
structure length
230
Chain Sequence
MIIPALDLIDGTVVRVVQRDYGNDPLPRLQDYAAQGAGVLHLVDLTGAKDPAKRQIPLIKTLVAGVNVPVQVGGGVRTEEDVAALLKAGVARVVIGSTAVKSPDVVKGWFERFGAQALVLALDVRIDEHGTKQVAVSGWQENGVSLEQLVETYLPVGLKHVLCTDISSNVSLYEEVCARYPQIAFQSSGGIGDIDDIAALRGTGVRGVIVGRALLEGKFTVKEAIQCWQN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and functional innovations in the real-time evolution of new ( beta alpha )8 barrel enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PHOSPHATE ION
molecule tags Isomerase
source organism Salmonella enterica
total genus 82
structure length 230
sequence length 247
ec nomenclature ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date 2016-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5g2iA00
3MHFA 5ABTA 1WQ5A 5C5YA 3BW3A 1K8ZA 3M5VA 3QFEA 1LROA 3NL6A 3MI3A 4MPQA 1K7FA 4O52A 1VH7A 2QEZA 2A85A 2QCNA 2C3ZA 4WOZA 3CHVA 4NJIA 2YXGA 3TUUA 1J2WA 4I7WA 4LRSA 3CTLA 1GT8A 3STCA 1VC4A 1Q6OA 1T8XA 1X1OA 1GZGA 1JCXA 2E09A 2C15A 2WOQA 1OFDA 3KRSA 3E9AA 1KM6A 4EVZA 4BF9A 1RV8A 1GPWA 2Y7DA 5K2ZA 4UTKA 1MEIA 3HG5A 3NPWA 2XFWA 1H7XA 3ZFHA 1EWDA 3LCLA 3BK0A 3QM3A 2P0OA 1GG1A 3UQNA 1TJRA 3BW2A 1NF0A 3QMSA 1Q6RA 3DI0A 4IUOA 2V82A 1C9DA 1H7PA 3O6DA 4WXYA 1OF6A 5EKYA 4K8EA 2Y61A 1ZAJA 3M1ZA 2ZCGA 4IXHA 3W7PA 5CPLA 1RD5A 4XTDA 2QDHA 1UB3A 5CPOA 3STEA 4LT9A 4AWUA 1W5MA 1EA0A 3L5AA 2ABAA 4LUIA 3H55A 4U4MA 1PL9A 3M7WA 1GEQA 4JN6A 3USBA 3IIOA 3HGOA 1GWJA 1PCWA 4JGDA 4BWLC 4E2BA 4E38A 4UMCA 1QDSA 2Y7GA 3MP4A 3RLUA 2DORA 3PF3A 3A22A 4A22A 5U7SA 1OG0A 3T44A 5K7JA 2CWNA 3GDTA 3PM6A 4QIUA 1WXJA 3INPA 3B0VC 1P0KA 3SR7A 2QAPA 3BG3A 4QNEA 1KTCA 1GVFA 2FB2A 4FNUA 4AB4A 2H90A 2YYTA 4HPJA 1FXPA 2CFFA 2IQTA 4XKYA 3L5LA 3GDLA 3DI1A 5CZJA 4UC5A 1F7BA 4AHQA 1K7EA 1TJPA 2Y70A 3PAJA 2AQWA 4DPQA 3GNNA 2DJLA 2PCQA 1KA9F 4GUHA 2QJGA 3BGGA 1XBVA 3ABRA 3HG2A 4UCGA 4JDBA 4JDYA 2PURA 3LCHA 3C2RA 4FEZA 5HWMA 4M6VA 5F4WA 5I3KA 4JNMA 4O0KA 2QUTA 1KM4A 1UASA 3CC1A 3L67A 1W5PA 3LTYA 6ALDA 3S0CA 3HMJG 3F4WA 3NVTA 3JRKA 3W88A 1QPOA 1NFBA 1TYGA 2WSRA 4R33A 4D2JA 2ALDA 2E6AA 2NUXA 2OZ0A 3FJ6A 4YMZA 4GUIA 5BW6A 3UWQA 4XKYB 3NQMA 1DBTA 1TPB1 4JX5A 3O8AA 3P67A 3TROA 4UR8A 3QPZA 5I3IA 3FLUA 3NQFA 3MI2A 1KBJA 2GVGA 4XWUA 3W7QA 1O60A 4Y8FA 3W7KA 1W54A 3L2IA 3N9SA 4IMDA 2Z0IA 2ZZ7A 1H7OA 4N4PA 1JCLA 2NXGA 3PBYA 2J27A 3L5MA 3EWXA 1IIHA 3IGSA 5F4XA 4WUIA 1YXCA 3W7OA 5FF3A 4O53A 3QJAA 4CCDA 4B5NA 4ALDA 2QCGA 5CSSA 4JTFA 2NV1A 3ZWTA 1K8XA 1OABA 3HOJA 4RZ4A 3LGEA 4IXXA 4Y9AA 1H60A 2TMDA 3IEBA 1Q3NA 4MKNA 2WV8A 3NQ6A 3W76A 4HHPA 4ORMA 5K4XA 3B03A 2J24A 1KLYA 3LCXA 1QPNA 2NXHA 2O7SA 5KSWA 5AHNA 1ADOA 2CW6A 2E5DA 4ZQOA 4AHOA 3LDVA 4AVFA 4ORIA 3W73A 3QRHA 4O15A 1KV8A 1VRDA 4BI5A 1YXDA 5IBXA 3BV4A 3O6CA 3LRMA 1LLWA 4K8HA 3G22A 3VNDA 1MO0A 3R8RA 5BRBA 3LHTA 5G1TA 4CNPA 3O6YX 4CQ8A 1A50A 1QMLA 2EGZA 3LRLA 3MI6A 1TRIA 4TIMA 1FUYA 4MY9A 5HR7A 1XFBA 2B4GA 4HPXA 4N6FA 3OHIA 1CX9A 2LLEA 3NA8A 4IWWA 3EX3A 4LV4A 1F74A 4JYEA 1H1YA 3DFNA 2NXIA 1ICPA 1JRCA 3DFTA 1TIMA 3LXCA 1TPDA 4JTEA 1N8FA 2FPYA 5TQLA 2AAMA 4EF9A 3G1DA 1ICQA 3PUDA 3PY2A 4GUJA 3TFXA 4IMEA 4M5PA 1KFEA 1LRTA 1KM5A 3GB6A 5DBUA 3ABQA 1N55A 1SQ7A 3TJLA 4FNPA 3P74A 3QH2A 2R8WA 3RMJA 4EF8A 1A5AA 2VFGA 1VCVA 1F6KA 3FKRA 4PEKA 4C1KA 2OX1A 5DBTA 1A53A 2VOMA 4JYDA 4M6PA 5G2WA 4FNTA 5FI8A 1ML1A 2A2IA 1PV8A 1LOQA 4UTTC 4ADSA 2PRHA 2V5LA 3W2NA 1F76A 3VE7A 4IX2A 4UMAA 1XL9A 4K39A 4LV9A 2FIQA 3DAQA 4L4MA 2A7RA 2NLIA 4LWWA 1XCFA 2VENA 4DF0A 3GKFA 2KZHA 3BVJA 4ONVA 1W3TA 2J6XA 3PWAA 5F1UA 2FB3A 1EEPA 1DORA 3NZ1A 3RF9A 1NVMA 4K7YA 4FHAA 4GFSA 1E51A 1KM3A 5CSRA 4LC6A 4E0CA 1S5TA 2A7NA 1TV8A 3GDRA 4R34A 3LHZA 3LLFA 1FDYA 4HIBA 4PA8A 3TW7A 2ATMA 2V0TA 1BEUA 4Q32A 5I3GA 3HIJA 1GG0A 2WSYA 2YZRA 5G4WA 4K6AA 1LBMA 2ISVA 3MMTA 1N7KA 5CZTA 5FF2A 1IIGA 4X9SA 1VZWA 4CNOA 4PL2A 1XDMA 2FFCA 5FEXA 1B4KA 1QNVA 3S1UA 3C2FA 1LORA 3DKLA 4J9JA 5KZMA 1WX0A 1Q45A 4AMAA 3GIYA 3KX6A 5DELA 4TX9A 2C19A 3N34A 3LX9A 4MIMA 3WJSA 5D2VA 1JUKA 4AHPA 2ZZ1A 3C56A 2GQ9A 4IQLA 1HUVA 3N9RA 4ZQPA 1HTIA 1VPXA 1SSDA 1YPIA 3OVRA 4NQ1A 4P61A 3DFOA 4HSNA 1D9EA 1AK5A 3NEVA 3NG3A 1K8YA 4JS3A 3RNDA 1PHQA 4OU1A 5HWJA 3NQEA 3PG9A 1VS1A 3EEGA 1AMKA 1YTEA 4BWLA 3QW4B 2OJPA 4YCPA 2QJIA 2RFGA 2DJXA 3MUXA 1TB3A 2YX0A 1ZENA 1OF8A 2V81A 3QC3A 5LZLA 3LCIA 2VEKA 2QCEA 5EYWA 1OFBA 2EF9A 4KWVA 1W5OA 1PE1A 2R14A 2V2HA 2B0MA 1OHLA 2TSYA 4TMCA 1G69A 2CLOA 1NSJA 4UTIA 4MLJA 4IOTA 2YW4A 3CEUA 1SO5A 3DU0A 2FPTA 2WSQA 4M7SA 4O54A 3TQVA 1I4NA 3HB9A 2EAWA 1W5QA 1FCUA 3P61A 4H3DA 1ONRA 4ZQNA 3G1AA 5D2YA 3E0IA 3Q58A 1DKWA 1DQWA 3TCEA 4RKAA 4H6KA 3RK8A 3A21A 1F6PA 5HWNA 4IX0A 1TQXA 1VCGA 3T40A 1DV7A 3OG3A 3WJZA 2ZRXA 3TC6A 1SPQA 2Q8ZA 3CWOX 3S5NA 1OFPA 5D33A 3QSTA 3W7MA 2ZZ2A 5CGQA 1WAUA 3GDMA 2P10A 2YFOA 3S5YA 5D04C 3S5OA 4ADTA 5E1QA 1JVNA 3GZ3A 1GVSA 3FIGA 3NO5A 4JXCA 3B06A 2X1SA 1EUAA 5AYYA 3GK0A 1F73A 3G0SA 5FEWA 3MHUA 5D2WA 4KWWA 4MYAA 5CG7A 4XBSA 3TIMA 3L68A 4NNCA 3LCWA 1EP1A 3W1NA 4QJ1A 5K9XA 3PBVA 1G7VA 4NJGA 4N9BA 3A5VA 1K3UA 5DN1A 4UTHA 2E6DA 4AAJA 3A23A 2PRMA 4O28A 2JGQA 1TPVA 1TSIA 3GX9A 4JY8A 1W5NA 2QR6A 3UZ5A 4MOZA 5DCEA 4UNKA 2YSWA 2ZQ0A 1ZY9A 4FO4A 2CU0A 4R7JA 1SFLA 1MZHA 1SZGA 3I65A 4U28A 3ZR4A 3PR2A 1XKYA 3M5XA 1H7WA 4CNNA 2Q3OA 3ANYA 4O1CA 2B7QA 5AHIA 5F2MA 3FA5A 1LZOA 5D32A 5AYXA 3G1XA 5HUOA 2C14A 1OFAA 2ZTKA 4LVGA 3GLCA 4N2YA 1QPRA 2BLEA 2RDUA 4MJMA 4IGHA 3FEMA 3TSMA 4IPIA 1X1ZA 2TRSA 1OFRA 4NJJA 1FWNA 4A2SA 3EWUA 1H5YA 1KFKA 3U8GA 5DY2A 4HNTA 3MBFA 3CM4A 3DXIA 1OK4A 2NWSA 4NJKA 2CZDA 2VELA 3CB8A 1EB3A 2BSLA 1Z41A 3O1NA 3SECA 4MZ1A 3NQDA 4KFOA 1LCOA 1WOBA 3LHWA 3AJXA 4BK9A 1O5KA 1Q6LA 2DP3A 1M5WA 2ZA1A 1G6CA 2GQ8A 4PTNA 1O94A 3CIWA 3WFAA 3TU9A 1YXYA 3YPIA 5AC7A 1L6YA 1B3OA 2ATSA 3KVJA 1DJQA 3UD6A 3R2GA 3P81A 2QCHA 3QZEA 1A5CA 1UJPA 4GUFA 3AO0A 3L66A 2DZPA 3W9ZA 1XDLA 1FDZA 1SUXA 3TC7A 4OE7A 2Z6JA 3WK2A 3HGJA 4N4QA 3QEZA 2BWGA 3MYPA 5FF4A 3W7NA 3G1HA 3TK7A 4UTUA 3GVGA 1KFBA 4DQWA 1B4EA 1LBLA 2WO5A 1HO4A 3C2EA 3W7JA 4TMBA 2NUWA 2E68A 1THFD 1R47A 2B7NA 4UTTA 4FB7A 3SJ3A 4LC8A 4CQ9A 1Z48A 2X16A 2DZWA 3HPXA 1SR9A 4LU0A 2JKPA 2QAFA 1IXQA 3C2OA 1A5BA 3S42A 5LHEA 3NM3A 1FXQA 1GVQA 4NX5A 3W2UA 4FNSA 1RQEA 1OX4A 3TNOA 3TX9A 3M43A 3P5YA 1BWKA 1P1XA 2PE4A 2H6RA 4O16A 5D09A 1RZMA 1J4EA 2CLKA 4AF0A 2Q8LA 4QM1A 4KFNA 1H1ZA 5D05A 5AFDA 3MP5A 4MYXA 3MBDA 3L0NA 3BARA 4Z0SA 1LRQA 3CPRA 1K02A 3M9YA 3CEPA 3GAYA 2H8XA 5SWUA 5G2IA 4EOUA 1YDNA 2V8ZA 4G1KA 4A21A 3D0CA 4LY8A 4X22A 4GBUA 1I2OA 3WJXA 4LVFA 4OT7A 2ZRZA 1S3HA 3TKFA 2C0AA 3O05A 3W1LA 4RR4A 5F2IA 3PG8A 4AWSA 1OX4B 5DCDA 4NZFA 3THQA 2ZFAA 4A29A 3M5ZA 2FTPA 4IMCA 3EX2A 1QCWA 4H4IA 3MHGA 4O10A 5KZDA 4AF0B 2VFFA 3V1PA 1VQTA 2F7FA 3W2JA 3W2LA 3L65A 1WBHA 5HUPA 4N02A 3LM7A 3OVPA 3EX6A 4O17A 3G3DA 4RJEA 4DBEA 3PBUA 3NQ8A 5DCBA 4YCOA 2C6QA 2X30A 5I3FA 3TR2A 1OYBA 2FLIA 2ISSA 3EX1A 3DFQA 3GXNA 4O1AA 4YXGA 2A7PA 3W70A 1Z44A 4FIQA 2WPBA 2Y88A 2ZRYA 1LOSA 4GC4A 1AL8A 3EXSA 2V2CA 4KFPA 2ISWA 4MZ8A 3CLMA 1AW1A 1TTQA 4Z1DA 1QOPA 4FNRA 2Y7EA 5CZ0A 1OK6A 3HGSA 1JR1A 4S1FA 3LXBA 3CIXA 3IIPA 1LP6A 3V75A 1JJKA 5C2XA 4ADUA 1W31A 4UTWC 2I1OA 1O4UA 1EP3A 1Y0EA 5CKSA 3N73A 3W2KA 2F84A 1PCKA 1Z42A 4GE8A 3UWUA 1AW2A 3IVTA 1FWSA 3VFLA 1RPXA 5LKYA 5AC6A 4S2CA 1DVJA 4A3UA 3B05A 3Q37A 3LHVA 2R94A 5KTLA 4XQ6A 3ZWSA 3UWYA 2VEPA 4M7TA 3NPUA 3DHFA 3NR0A 1O95A 3S9YA 4O0ZA 1FCVA 4Z1AA 3P7YA 3HJZA 5KZEA 5L9FA 1W3IA 2OT1A 2A1YA 4UFIA 4WQ6A 3R13A 5IM51 1U83A 3HO8A 3STFA 3B4UA 4O50A 2G96A 3IGXA 1TQJA 3H53A 1OFEA 3G18A 3MYOA 1JRBA 3CQ0A 2R91A 4WZHA 1F2JA 3R12A 3W1TA 4UTMA 2E5CA 1X6UA 2QCMA 5MHBA 5FF7A 5C55A 1IF2A 5K3VA 3W74A 5H2ZA 1LLZA 1P4CA 2DZUA 3LI1A 3BLFA 5TIMA 4FXRA 2J88A 2Y85A 3FKKA 1IXOA 1I2PA 1JQXA 4FNQA 3W1QA 1QO5A 1VR6A 4RV8A 5AC8A 2BXVA 4DEFA 2QDGA 2RKXA 1TTPA 3G1FA 1FWTA 5T26A 4UNLA 1X8FA 3BO9A 3IVUA 3FYPA 1HG3A 2C13A 3W83A 3TV8A 4JIQA 1OYAA 1G67A 1ALDA 3CT7A 3O16A 5LNWA 5BNKA 4MVAA 5AOUA 5FEZA 2YYUA 3KAOA 1KM0A 4K7VA 3EKZA 1HL2A 1TPFA 4CQAA 1SO6A 1AW5A 4XTIA 4LS1A 3SGUA 5CPMA 5LGZA 3E96A 1TV7A 3SW6A 3W7RA 3W85A 5HULA 4MY8A 4OWGA 4N9CA 2CLFA 3L0GA 4E2DA 1LDCA 2C16A 3G3MA 2G97A 5EA9A 2DU2A 4CCCA 1K03A 3OA3A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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