5H2ZA

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with 7gf
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
364
structure length
364
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Human Dihydroorotate Dehydrogenase (DHODH) with 7GF
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 138
structure length 364
sequence length 364
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2016-10-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5h2zA00
1QDSA 5CG7A 5EY5A 5EMUA 1EWDA 1QOQA 1VPXA 1G67A 6TIMA 1F05A 1FX6A 3G1VA 4MFEA 2HMCA 3PUEA 2YFNA 3W1MA 5J5DA 3ZWSA 4YXGA 2DJLA 2CLOA 3PG9A 1NVMA 2E5CA 3CEPA 1ZENA 2G97A 5F2LA 4UFJA 1SSGA 3FS2A 2BWGA 3HGOA 1DOSA 1O60A 3SZ8A 1OX4B 4UTWC 3E12A 2XFWA 2JKEA 3ATYA 2YCEA 5CZJA 1DHPA 1NEYA 1ZJIA 2BZNA 3NL3A 1SU5A 2TSYA 1U5JA 4HN4A 1JUEA 4BR1A 4BF9A 2ISSA 2VFFA 3THAA 4PA8A 4GE8A 3QFEA 2O7QA 1Q3NA 1TJRA 5D05A 3SGZA 2H8ZA 4AF0A 3SY5A 1QCWA 2I9EA 2J9YA 2ZTKA 1KBJA 3P8JA 3W7PA 5AC7A 5AHFA 5BOOA 1H7OA 3BK0A 4ADSA 2J27A 4GXMA 1WOAA 2F7FA 3BLFA 3OG3A 3KRZA 2VELA 3R12A 5K2ZA 2VEMA 4W9TA 1DJQA 4IX2A 1SZNA 5FF0A 1I2QA 1DKWA 1K7XA 4KFPA 1WOBA 5CKSA 1JUBA 2YYUA 5DELA 1G4TA 2Z2UA 3LGEA 1GTEA 4DO4A 3DFNA 3T44A 2E5BA 3A21A 2FPVA 1AL7A 3W2LA 3HMJG 2ISWA 1LBFA 1WX0A 1D9EA 4NNCA 3G1XA 4O13A 2C14A 2HS6A 2QCNA 4H3DA 4MLRA 1EX5A 1TQJA 2ZTJA 4FO4A 1VHNA 2EGZA 4QITA 3W1LA 2XN1A 3LDVA 1GTHA 4QJ1A 5I3HA 2C3ZA 3CM4A 3ZS4A 1W1ZA 4N9DA 3DBPA 2ZYFA 1FCUA 3RLUA 3W7JA 1W5QA 2WOQA 2A7NA 4MUZA 4UTJA 3LCLA 5F1VA 4JY9A 4CNPA 4JX6A 2VFIA 3A24A 3KRUA 1HO1A 2H90A 5HUOA 1RQBA 3TMQA 3W7GA 3EKLA 5HNRA 3SIZA 1QMLA 3N9SA 1DQWA 2Q3OA 1RPXA 2C1HA 4CCDA 1S5VA 3NZ1A 3CC1A 4FF7A 3HG2A 3TXZA 3T4CA 1RVGA 2GJNA 1XM3A 1AL8A 3NQ2A 5D2WA 2WNNA 1TV8A 3GK0A 4MY1A 3NQFA 3TDFA 4M6PA 3MO7A 3IV3A 4K6AA 3DKLA 3F4NA 5BMXA 5DBUA 5H91A 4LUIA 3V75A 2E1DA 3NQAA 4HHPA 5KTLA 2ZCGA 3C0JA 1RR2A 3NOEA 4XUGA 5D33A 3LHYA 1GVOA 1LLZA 3DAQA 3G1YA 5G1TA 3W74A 4JTEA 1YPIA 4AH7A 1ML1A 2CFFA 5E93A 3C8FA 1ZAIA 2CZFA 4UFMA 5I3GA 3L0NA 3PWAA 3S5NA 1PCKA 4HNVA 3MWAA 1D3HA 4C1KA 1ICQA 1LRQA 3LXAA 1XBVA 3DFTA 1TPH1 4DELA 4H6KA 1JJKA 2ZRVA 2YW3A 3C2OA 1DV7A 4ZQPA 2Y88A 3K30A 3TFXA 1SFJA 4IXXA 3BVJA 3B05A 3RLVA 4P2VA 4KKXA 3UNDA 5AFDA 4NJHA 1YDNA 3QZEA 1OYCA 4IMDA 3IIVA 4RJEA 5C5YA 1G7UA 1TTIA 2PURA 3M9YA 2QEZA 4N4QA 3VE7A 3PR2A 4RV8A 2KZHA 3ZR4A 3HOJA 3MI2A 3A5FA 1A5BA 5TBOA 2QCLA 4ZVJA 2NV1A 4GUGA 1H62A 2A6LA 4ICNA 1ZALA 2FB3A 2QAFA 1EEPA 3R13A 7TIMA 5D04C 2VEKA 3TIMA 2A7PA 4N9CA 2CW6A 5FI8A 3MI6A 2WNQA 4JIQA 2YW4A 1H61A 4PFMA 5FF7A 3DHDA 3USBA 4O54A 5C2XA 4PL1A 1TO3A 1OX6A 4ONVA 3U8GA 1DQXA 1OFBA 4HSOA 1T99A 4MFDA 1GQNA 4O0KA 5K4ZA 1OG0A 3WJYA 1QPQA 4O8RA 1DVJA 3WFAA 3P81A 5HWMA 3TV8A 4NU7A 1T96A 4RZ6A 3CEUA 1LOLA 4JEQA 5EA9A 1Z44A 1G4PA 2CLHA 2NX1A 4JDYA 4NX5A 5HINA 2DZPA 4JGDA 4LVBA 2FB2A 4JNMA 2Z6IA 1XBZA 3GAKA 2NUXA 2VC6A 3LTPA 3M5VA 2RFGA 3W71A 3S1UA 3O8AA 5LNRA 5F2IA 3BLIA 1VYSX 3TSDA 2QUUA 4EIVA 4N2YA 5D37A 5IM51 2OJPA 3TAKA 1OK4A 1FWSA 3LCGA 4A3UA 4HIBA 3ABOA 2ZRWA 3EX3A 4NNAA 4WOZA 5U7SA 2CWNA 2H6RA 1EP2A 3BPWA 3BARA 1L6SA 3R2GA 4LV4A 1RV8A 3MYOA 2ATMA 2E09A 3WJSA 3GNNA 4UTLA 2CZDA 1KW1A 4UNKA 1WDWA 2OT1A 3DXIA 1Q6QA 3IGXA 1YLVA 2NV2A 4MKNA 1XXXA 3W76A 1HTIA 4M7TA 2VEPA 1LRTA 4R7JA 3ANYA 4XTDA 3LCFA 1XUUA 2E68A 4O1AA 4O14A 3HIJA 3NQDA 4AVFA 3BG5A 4TO8A 1S3HA 1UJPA 1Q6RA 2TPSA 1EUAA 2UV8G 2W79A 1X7FA 1TRDA 2B7NA 3PSWA 1IXPA 4UTTC 2ZBTA 2C13A 1I45A 2X1RA 5D2YA 4NJIA 1YTEA 1ZAHA 3GVGA 1LLWA 4CQAA 1LP6A 3EEGA 2E6DA 4ALDA 4LU0A 3HG4A 5LNUA 3A9IA 2C15A 3B0UX 2QDGA 4ADUA 4FHAA 1H1ZA 2OX1A 4AB4A 3LRLA 3JRKA 5HULA 4UTHA 2NXIA 3A23A 3P82A 3DFPA 5CZSA 3C4UA 3H54A 1ME7A 3MJYA 5KITA 2QCHA 2ALDA 5AN7A 4FX6M 4EWND 3N73A 1UUOA 4KFOA 3C2VA 1OK6A 4ML9A 3QMSA 4EF9A 3O6YX 1R30A 1UASA 3O63A 2OMAA 4O10A 3RFAA 4TX9A 1QO2A 2CLEA 3HBLA 2A21A 2CZ5A 1G4SA 4UTTA 4DPQA 3GKFA 5HWNA 1SW7A 3W9ZA 1W5OA 2GQ9A 5DLCA 3NA8A 2G96A 1VCVA 4LVGA 3UWQA 1JCJA 1XBYA 1ICSA 2ZA2A 4LVFA 4RZ4A 4Y9AA 1KM1A 4GUJA 1IGSA 4L4MA 2ZZ4A 3W7IA 1OJXA 2HTMA 3UZ5A 4A21A 1FXPA 1FXQA 3NPXA 1TTJA 4WX2A 4Z0SA 2W6RA 1ZAJA 4MY9A 2JKPA 3TAOA 2W0UA 1CI1A 2RDUA 3TC7A 3TC6A 2A85A 5CPOA 3MMTA 3B8DA 3G3DA 2YXGA 2J6XA 3BO9A 1ZCOA 4O50A 4UTKA 3LB0A 4IMFA 3CIXA 3PBYA 3EXTA 1GOXA 2Z0IA 3N34A 3M6YA 3TROA 1K3UA 3C56A 2FQIA 2GVLA 2WSQA 2X1SA 3G18A 3NPWA 4IJBA 3TX9A 3H55A 5FEXA 3GDKA 3NL6A 3C61A 3UY8A 1GWJA 5LHEA 5CSRA 4TIMA 1SSDA 4JYEA 3QC3A 3P61A 1JULA 1QNVA 2Y7GA 3W22A 4DF2A 1P4CA 4I7UA 4IPIA 3FYPA 2TRSA 3T55A 1AMKA 3UPWA 3BW2A 3QYQA 4GUIA 5FESA 2CU0A 3M47A 3QMTA 1E51A 4JX4A 5CPMA 5L9FA 2BLEA 3NQ7A 3T40A 5I3IA 5I3KA 4JTIA 1P1XA 1GVQA 3QQ1A 2NWRA 1OHLA 4OE7A 1X8FA 3WJZA 4MPQA 3L66A 4H4IA 3SW6A 5D2TA 3GXPA 2NZLA 2A0NA 3PVFA 3W84A 3IGUA 3UQNA 3TUUA 1HFBA 3GZ3A 1VYRA 2VFHA 1JVNA 4UTIA 1P5BA 4IXHA 3OBKA 1AW1A 4FEZA 3MHFA 2R8WA 4WQ6A 2V30A 4IMCA 4LT9A 1FWTA 1O94A 1W3TA 4YL2A 3UXDA 1TPWA 1SPQA 4O19A 4BWLA 2NLIA 3OVQA 3WJXA 4UIOA 1R47A 3NR0A 1Z41A 2A2IA 4NJKA 4LWWA 3EKZA 5DXYA 1I4NA 2Y7DA 1BTMA 2A4AA 1LRNA 1HO4A 3JS3A 1JUKA 4I9AA 5CSSA 3L0KA 1EA0A 1BKSA 2VKZG 2PC4A 3W75A 4AMAA 3HPZA 2ZRXA 3LHZA 1S5TA 2WQPA 4HNNA 4ZMGA 1PVNA 2V2CA 4ZQNA 2Y85A 2Y6ZA 2BXVA 3HGRA 3TQKA 3W2MA 1JCNA 1KLZA 1W5MA 3BV4A 5F4WA 1YPFA 3PBVA 3W85A 3B03A 3DZ1A 1R2SA 4O52A 3OA3A 3QMRA 3TW6A 4DBEA 2I14A 3G0UA 1IXQA 4JXCA 3S0CA 1KM4A 4U28A 1RQEA 4ZQMA 3KHJA 4CCEA 5LGXA 1I2PA 3LBCA 1KFJA 1A5CA 2QR6A 3ELFA 3WK1A 3HPSA 1K8XA 5FEPA 4AHPA 4WOQA 4M5PA 1R2RA 1Q6LA 1TIMA 4L4LA 3W73A 3P8IA 4UMAA 4YCOA 1TV5A 1FDJA 3W1TA 4BI7A 1MO0A 3SJ3A 4PC8A 3OHIA 3CU2A 2J88A 2H3BA 2WJZA 5LHFA 2QCFA 4FNUA 3W07A 1XDMA 3DFQA 3IRDA 1TPVA 1DJNA 2ZA3A 1H60A 4JX5A 3THQA 4GFSA 2ZA1A 5CPLA 3MHGA 1TREA 3W7OA 1PE1A 3NQEA 4MIMA 2VFGA 1SUXA 1W3NA 2ZFAA 1KV8A 4S2CA 3RNDA 3LM7A 2WNZA 4OV9A 1OFEA 1G69A 3NDOA 3FEMA 3W7QA 3GXNA 2CLMA 3EXRA 4NJJA 2VXNA 1LZOA 1WA3A 1K7FA 3NVTA 2Y62A 3MI3A 1T0OA 1UBSA 1MEWA 4N9BA 1GVRA 5G5IA 3G0SA 4LW7A 4O0ZA 3UWVA 3W1AA 3S8HA 1KTBA 1YXDA 5EPDA 2FTPA 2ZRYA 1QPNA 4IOTA 4LC8A 4Z0JA 3A22A 3O06A 3G0XA 1VH7A 2YYTA 4R34A 1FWRA 3P62A 4K8HA 1LORA 4WXYA 3B4UA 2V2HA 2Y63A 3LCIA 1LOQA 3DKJA 4QNWA 2NUWA 4UR7A 1F74A 3FJ6A 1PV8A 3GDMA 1C9DA 3PBWA 3EWYA 1TSIA 1CW2A 3TA6A 1BWLA 3VI2A 4ADTA 1I2RA 4XKYB 3FJLA 3O07A 3GLCA 3W1UA 1B4EA 2JGQA 3DFSA 3UWUA 1SO4A 1H7WA 2QJIA 1NSJA 3G1HA 3NO5A 5BRBA 4DF0A 3PY2A 1W8SA 1O5XA 1VQTA 2JK2A 4K8EA 1YADA 1V7YA 3CQ0A 1WAUA 3NM1A 4XQ6A 3UPBA 5GVJA 3F4WA 8TIMA 1MEHA 4K36A 4OU1A 5AC6A 3TH6A 5LNSA 5AHEA 1W37A 1IXOA 3LBMA 5DCBA 4NXSA 4NVTA 1W5NA 1SO6A 1EPXA 5D09A 1A5SA 1JRBA 4JD4A 1VYPX 3N19B 4FB7A 1EP1A 5DN1A 2DU2A 3TFCA 1GPWA 3IVTA 3W23A 4OV4A 1NF7A 5HR6A 3D0CA 3G24A 4IPJA 1SO3A 4UFKA 3BG9A 1YXYA 2FIQA 2O7SA 2Y7EA 4LOCA 3CPRA 3N2MA 4BI5A 1TPUA 3PAJA 1OFDA 5EBUA 5A5WA 4Y90A 4OHQA 3S5OA 1AK5A 3HGJA 5L6UA 1W5PA 3QPYA 2FJKA 1H7NA 1TTPA 2X30A 3N14A 4JTHA 4E38A 1JRCA 2YGYA 3W2UA 1O95A 4O4WA 2ISVA 1U83A 1SW3A 1YYAA 1F76A 1KM6A 1SQ7A 5KZMA 4XBKA 5CZ0A 4PTNA 1B9BA 4NQ1A 3UWZA 1F5ZA 1GVSA 2NX3A 1YXCA 3MW7A 1THFD 4K7VA 1L6YA 3LERA 3NL5A 4QM1A 2Z1BA 3G1SA 5DXXA 3W1RA 3LHWA 3PG8A 1EB3A 3TSMA 1H7XA 3E96A 1M6JA 5HJLA 3B04A 1KFBA 1OFRA 4TMCA 1SR9A 3QF0A 4JTUA 3G8RA 1NFBA 3LHUA 2AQWA 5FEZA 3M43A 2C0AA 1KFKA 4HT3A 2E5DA 1PIIA 2OT0A 1ZNNA 2GVJA 3EX2A 2X2GA 3U6WA 3P74A 2DZUA 2GQAA 3L9CA 4ZQRA 4MOZA 5TQLA 3FLUA 3Q94A 3CTLA 1GVFA 3A5VA 3NQGA 5CGQA 5D2XA 1FUYA 5EYWA 3M5XA 2B7OA 4MJZA 2E77A 1XI3A 3L68A 3NEVA 3HG5A 1S5WA 1HUVA 4XTIA 1QFEA 3CIWA 4I7VA 4LRSA 3LRMA 1H7RA 4RLIA 4N4PA 4NXKA 4MVAA 1EWEA 1A5AA 1L2UA 4OQVA 5AYZA 2ZRUA 2JGYA 3L5LA 5C6MA 3S1XA 2H3DA 4JY8A 1TPDA 3LLFA 4XWUA 3ABQA 4N6FA 3W2NA 1VCFA 2P10A 5AC8A 4JYFA 1MXSA 1N8FA 1M7OA 1QR7A 4MY8A 3E49A 4DQWA 5AYYA 5G4WA 3M41A 3C6CA 1VJIA 2Y70A 4DBDA 2Z6JA 4FX8A 3HG3A 4RXFA 3S9YA 4QQ3A 1A53A 2XN0A 4K37A 1OX4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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