5HJLA

Crystal structure of class i tagatose 1,6-bisphosphate aldolase lacd from streptococcus porcinus
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
322
structure length
322
Chain Sequence
SNKKAYLEKVSRDGIISALAFDQRGALKRMMASHQKEEPTTEQIVSLKRLVSEELTPYASSILLDPEYGLPAIEVKDQKAGLLLAYEKTGYDAKTSSRLPDCLEDWSVKGLKAAGADAIRFLLYYDVDGNEAVNHQKKAYIERIGSECQAEDLPFFLEILTYDEKISDNSSIAFAKVKAHKVNEAMRVFSAKRFGIDVLKVEVPLNMAYVEGFTEGPILYSKADAALAFKEQEAASHLPYIYLSAGVSAQLFQETLIFAAQSGATFNGVLCGRATWADVVSVYIKEGEAAARQWLRQEGVKNIESLNDVLAKTASPWTNKVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Streptococcus porcinus str. jelinkova 176
publication title Structure and Characterization of a new class I Tagatose-1,6-bipshosphate aldolase from Streptococcus porcinus : switch in specificity directed by an Arginine
rcsb
molecule keywords Tagatose 1,6-diphosphate aldolase
total genus 120
structure length 322
sequence length 322
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.40: Tagatose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2016-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5hjlA00
2EAWA 1GEQA 2C19A 3LCIA 1KFBA 5KSWA 3NQAA 1PHWA 3W83A 3TXZA 5K9XA 1EIXA 5FF3A 4XZ9A 1LM1A 3TSDA 1XBXA 4JX6A 2V9DA 2R94A 2PE4A 1TSIA 3PSVA 1TREA 2GOUA 4DO4A 3HG3A 2DZTA 3QQ0A 3T7VA 1VHNA 3KAOA 4FNPA 3GK0A 3B0PA 1T96A 3TAKA 4LC6A 3SY5A 1UUOA 2I1OA 1K7XA 1B4KA 1BKSA 5I3KA 2F84A 4WY0F 2BTMA 1H7XA 3A21A 1I4NA 2NX9A 2C13A 2CZ5A 3Q58A 4JTIA 3P8IA 1VYRA 1FDYA 4WY0B 3C2FA 4MOZA 5CG7A 3P82A 1LORA 4GRSA 1MXSA 2XN1A 1YXCA 1PV8A 4EIVA 1P0NA 3C61A 2A6LA 2ZQ0A 1L6WA 1VRDA 2FB2A 3L0GA 3UWWA 1LTDA 1P4CA 4O52A 2JKEA 1P0KA 4CQ9A 4LUIA 1NSJA 4RCXA 3L68A 1KTBA 2QJHA 5D09A 8TIMA 5LKYA 2RKXA 3GR7A 5AHMA 1ALDA 3HGOA 3FKKA 5AYYA 5A5WA 2NV2A 1UASA 4O12A 4BI7A 4LTSA 1OF6A 1AL7A 3W86A 1SFJA 2V2CA 3GB6A 3F03K 1XCFA 4P2VA 1P5BA 4QJ1A 1AW2A 1QFEA 2B7PA 3K30A 3WFAA 3FYOA 3L66A 1F73A 1TB3A 1T99A 2QJGA 1DJNA 4DXVA 3LI0A 1LBMA 4GJ1A 3W2LA 3MHUA 4HNVA 3E49A 2EF9A 1YXDA 4LC8A 5TBOA 3TAOA 1C8VA 1JCLA 1W37A 3PUDA 3NQGA 4TMCA 4ADSA 4GC4A 1THFD 4NVTA 1J5TA 5AHIA 3A5FA 1LBFA 4UFLA 1TV8A 3DU0A 1UBSA 1ZCOA 1SO3A 1FWWA 3CWNA 5G1TA 3AO0A 5FEZA 1EP1A 2QDGA 2B0MA 1D9EA 2Q3RA 1X1ZA 4CQ8A 1Q6RA 3IIXA 2Z1BA 1W0MA 1XDMA 3ATZA 3V1PA 3T4CA 1ICPA 3N34A 1TV5A 3W7DA 2H3DA 3GYEA 4LW7A 3W85A 3C3NA 3TIMA 3C2RA 5HINA 3QPZA 4O4WA 1K8YA 2ZZ3A 4RK8A 5IBXA 4FEZA 1VH7A 4JR5A 5DY3A 1G4PA 1JUEA 1JVNA 4M6QA 1N7KA 5LHFA 2VKZG 5HQEA 4ALDA 3KRUA 1OYBA 3EKLA 3OG3A 5KZEA 3E02A 4Z0JA 3N73A 1G7VA 3G0SA 3W7RA 5HWMA 3QQ1A 3L65A 4CCCA 2Z2UA 1LRQA 4A2SA 4Z1BA 4ZVJA 3NQ2A 1ME7A 1KM1A 2ATMA 4MPQA 2ZZ4A 4AAJA 5KZMA 3FKRA 4N4PA 1IXQA 4IMEA 1I45A 5FESA 3WJYA 1HUVA 2E77A 1UJPA 1R30A 2E6YA 1H5YA 3QMRA 5EPDA 4K39A 2ZCGA 1I2RA 4YL2A 3RMJA 4QIUA 3PS7A 4O16A 3STGA 1TPUA 3M41A 3TUUA 3ZFHA 1GQNA 2XN2A 3R5EA 3NZ1A 1XDLA 2C1HA 1AK5A 2FPYA 3G18A 4RV8A 1VS1A 3B05A 5G5IA 4U4MA 5D2TA 4ZQCA 2ZZ2A 4WY0A 1SPQA 3W2UA 3M43A 5K7JA 1CW2A 3W7PA 1OJXA 4MJZA 3FJ6A 4H6KA 2QEZA 2J9ZA 4UTKA 2AQWA 4XTIA 4PCFA 2GPTA 4ORMA 1TPEA 1SZNA 4JGDA 3P80A 4S2CA 3W7LA 4UTTC 5FF4A 2GUUA 3IIZA 3VKJA 4JYEA 3R89A 4OQVA 1X6UA 1AW5A 5EBUA 1GOXA 2PC4A 1I2OA 3W7EA 4IXHA 4UIOA 3DXIA 3PBYA 1G6CA 3PB2A 5BW6A 2GVGA 2FIQA 2E5DA 1MEHA 3OA3A 2NXGA 1TTQA 1G4SA 4I9AA 1KFJA 2OCZA 3S1VA 4O4VA 1B4EA 1TRDA 1V5XA 3G24A 4PL2A 5BMXA 2W0UA 3LX9A 1PE1A 1U5JA 1RZMA 4N2YA 4MLJA 4AHPA 4JTGA 4ADTA 3HG4A 1G4EA 2KZHA 4LNYA 4M19A 4W9TA 4IWWA 2JK2A 1WV2A 1BTMA 4J9JA 4JX4A 3MMTA 3TXVA 1XBYA 4Y90A 5I3FA 3FLUA 2VXNA 3R12A 3BVJA 5A8GA 5CZTA 3OVQA 5EA9A 2ZZ6A 3LTSA 4NJIA 2JKAA 5GVJA 4X22A 3LTYA 4YWIA 5D33A 2VOMA 1J2WA 3LCGA 2NUWA 1LOSA 2NXIA 2RDTA 4AH7A 1B9BA 1K03A 1JCNA 3NQCA 2WQPA 4UTLA 3VCRA 1OFAA 2ABAA 3N19B 4OV4A 3E9AA 3NGJA 4Z1DA 1IXPA 1F6KA 1FQ0A 4HT3A 5K4ZA 2A2IA 1JRBA 3I68A 1W3NA 3KRSA 4JX5A 1GWJA 4GFSA 3PF3A 1DL3A 1L2UA 3LHVA 3GDKA 3HGRA 5TQLA 2BZNA 3VI2A 3HPSA 4HSOA 1GVSA 2YW4A 4YLWA 2A6NA 1RPXA 5CSSA 3LCWA 1M7OA 3NNTA 2HSAA 3O07A 2R91A 3W1UA 2RDWA 3TROA 1OX6A 3THAA 5K4XA 4WX2A 1F6PA 1TTIA 2WJZA 4DBDA 1ICQA 3EWXA 4O54A 4TO8A 4JTHA 3I7SA 1EUAA 4EWND 4O17A 3C2EA 1ZAHA 5G2WA 4O1AA 2CZDA 3LHYA 3PSWA 4M7TA 4E2BA 5DELA 1K7FA 1RVGA 4IJBA 3SIZA 2E1DA 5D37A 3VFLA 1VYSX 3CPRA 2Z0IA 1LDCA 1T0OA 4DPQA 4XUGA 1YPIA 1MSSA 1FX6A 1CI1A 3LRKA 1W54A 1W8SA 3LBMA 3C0JA 1ONRA 3O06A 3KFTA 3MI3A 3L0NA 3LRMA 1NF0A 2JGQA 3A9IA 1FXQA 3WK3A 5G1YA 3ABRA 3P5YA 3W7JA 3C8FA 3L5AA 5D2WA 4AVFA 3L21A 1NVMA 3W7MA 4UFKA 2Z6JA 3NYZA 3MJYA 4NNBA 2QJIA 3KXQA 3F1QA 3IRDA 3FFSA 2ZTKA 1EP2A 2A85A 4E2DA 4HN4A 4N9DA 1P1XA 2ZRYA 4WOZA 3P5ZA 3IGXA 1N55A 3G8EA 1NAL1 3NPXA 1G7UA 1DV7A 1IIHA 4LS0A 2OX1A 5F2GA 3GDRA 4WXZA 3IVTA 1W5PA 2ZYFA 2WNQA 2QUTA 5H91A 3FYPA 1O95A 4JTKA 1ADOA 4FHAA 1UCWA 4AWTA 4UTWC 3EX1A 4KKXA 1KV5A 4Y96A 1OABA 5BNKA 4S1FA 5IM51 3HOJA 2CLLA 4O1BA 5J5DA 2V81A 5CPMA 4IX2A 3LGEA 3RU6A 2VFGA 3MBDA 1ZFJA 1K7EA 3P74A 1TPWA 1A5SA 4C1KA 1L6YA 3N9SA 5C54A 1TYGA 3WJZA 1ZHAA 4KFNA 4IXXA 3S1UA 4GNJA 4E38A 4YMZA 1F74A 2QAPA 2H3BA 1GPWA 1KW1A 4UCGA 1V7YA 3SJ3A 3DFSA 3U8GA 4TIMA 2NUYA 3JRKA 3M5ZA 2CFFA 2Y62A 5CZSA 4WOQA 1W31A 3HGJA 3LB0A 4YCOA 4UTUA 2ZRXA 3KVKA 3WJSA 5LGZA 4JS3A 4O18A 1QWGA 2VC6A 1UUMA 3LV5A 5F2LA 4JYFA 2TYSA 1ZAIA 2PCQA 4LVDA 3C4UA 1O60A 2X2GA 1WOAA 2E6FA 1QPNA 4Y9AA 3ZS4A 2PRMA 1GZGA 2JKPA 1DQWA 3F4NA 5K9DA 1W5QA 3CWOX 1WA3A 1O4UA 3GIYA 1KTNA 5H2ZA 3G1SA 2ZBTA 3STEA 1FCUA 3USBA 1LLZA 3GKAA 4KFOA 3DAQA 4Q4KA 1ZJIA 3W2JA 4CLMA 4DO5A 3M7WA 4KWWA 3PC0A 4CNNA 5D03A 1OYCA 3TW7A 3UY7A 1VCFA 4GUJA 1F76A 4JTJA 3NQ6A 5KITA 4LRSA 4IMFA 3CB8A 3HJZA 4X3ZA 4POCA 1VCGA 4AWSA 3N2XA 4AHQA 2CLKA 2WO5A 4R33A 3MHFA 2YXGA 1AL8A 3LXCA 4O0ZA 1R47A 4BWLA 5HUPA 2RH9A 4UC5A 2ABBA 3UWVA 3N3MA 3PBUA 1A5BA 5C5YA 2YDAA 2A7PA 3LHUA 4XBKA 3S5NA 3QJAA 5LNSA 4WZHA 3TCEA 1KFKA 3NZRA 2W6RA 5DY2A 1E51A 3RLUA 4N02A 3S8HA 2ZA3A 4WQ6A 3W2KA 2P1FA 3EX4A 5DLCA 1TO3A 5F1UA 4U28A 4K7VA 3B0VC 2DJXA 5LNRA 3WK0A 3GAKA 1F05A 4NJHA 2NV1A 3U6WA 2ALDA 3BW4A 6ALDA 2G97A 4FNRA 2NX3A 3G0UA 2YX0A 3A5VA 4JD4A 3W2MA 4RX0A 2QCLA 1Z44A 2Y7GA 4IGHA 3T55A 4JN6A 3LRLA 4HNNA 4LVAA 1EP3A 2JBMA 3G0XA 4LVFA 3PR2A 1TV7A 5E0KA 3P84A 4ZQNA 2G5WA 2ZZ5A 3LCLA 1PVNA 4N6EA 1QR7A 3WK2A 2QR6A 5BMWA 2E68A 2NLIA 3PUEA 4UR7A 5J5RA 3HG5A 4X2RA 4NUWA 1YLVA 4K36A 2IQTA 4FXSA 4FX8A 1L9WA 1WBJA 3UZ5A 2QDHA 3NEVA 3BG5A 3OVRA 5D38A 5K3VA 1WBHA 3ZWTA 1A5AA 1R2SA 3LLFA 3THQA 5CSRA 3I7RA 5AHFA 4NJJA 3G1FA 2CW6A 2FPTA 2V5BA 4DF2A 4UUIA 1EWEA 1SW7A 5KINA 5LZLA 1VZWA 5F2IA 2GVJA 1DQXA 1LOQA 2QCFA 4JY8A 1TPVA 3P7YA 3TK7A 3W70A 2F7FA 3S9YA 3CTLA 5AC7A 3H55A 3U2OA 2V30A 4UMAA 2YFOA 2NX1A 5FF0A 2HMCA 1H50A 5AOUA 2Z6IA 3IGSA 2Q3OA 4ORIA 2ISVA 2P0OA 2CLMA 4GWEA 3UY8A 1FDZA 4R53A 2PRHA 3HPZA 1FCVA 3GDTA 4O53A 1TTPA 3RK8A 3MO7A 1LOLA 3GNNA 2ISSA 2VEKA 1RQHA 5IBXC 3W76A 1G67A 1FBAA 4AWUA 4RZ4A 4LOCA 1JCXA 1JUBA 4NX0A 3S5YA 3N9RA 4N9BA 1AW1A 1VLIA 4AXKA 2VFDA 3FEMA 1OF8A 4JYDA 3L2IA 1S5VA 2DZWA 3GDLA 1LCOA 5HWJA 4YCPA 1SFLA 3RLVA 2ZZ1A 4GBUA 3C56A 1LLWA 5G4EA 2H6RA 3G1DA 4RZ5A 3LHWA 4JTLA 3S0CA 5DBTA 1LRNA 4K8HA 1DHPA 3EXTA 3UXAA 4AF0B 1J4EA 3B4UA 2JGYA 1OFPA 3TQKA 3M5YA 4UFMA 2B7QA 3W1NA 3GDMA 3GNDA 5LNVA 2NUXA 4ZQRA 4PODA 6TIMA 4MFEA 3MYPA 4UFHA 4ADUA 1OG0A 1KM4A 3OEXA 1LYXA 1OX5A 1SO5A 3KOFA 5BOOA 4FIQA 3QMTA 1OFRA 5L6UA 4DO6A 2VEPA 1IIGA 3EWWA 3TC6A 5K9CA 4YXGA 2NXHA 1TPDA 1FDJA 5AHLA 2Y70A 4TR9A 1VYPX 4O28A 1HTIA 1W5NA 3BV4A 2YYUA 4O19A 4RLIA 1TPH1 2TRSA 3SSJA 3TNOA 1YADA 1YDOA 4DF1A 4FX7A 3TFXA 1SO6A 3LOTA 3W88A 4CCEA 1W3IA 2J88A 2X1UA 3KRZA 1WX0A 2FFCA 3UQNA 4ONVA 3M16A 5KZDA 3UNDA 1TJPA 3LXBA 3NOEA 1G69A 3LM7A 1B57A 1JCJA 4ML9A 3L9CA 1KM3A 3MHGA 5HR7A 1BEUA 1FXPA 4A22A 1KFEA 3CIWA 3TJLA 1Z42A 1KTCA 3DHFA 2ZRVA 4NXKA 4O50A 1QMLA 4UXDA 1GTHA 3G3MA 1OK6A 1F7BA 2QCCA 3GZ3A 4BI5A 3HG2A 4Y8FA 4DEFA 1QDSA 1TPFA 1IXOA 3BGJA 1VHCA 4GUGA 5C6MA 3M47A 3M6YA 5CGQA 5FF7A 4FO4A 1TRIA 2FLIA 4B5NA 5LNWA 3DKJA 1DJQA 3QW3A 3Q37A 2QUUA 3LTPA 3BPWA 1SUXA 3GXPA 1EPXA 1TTJA 4Y6GA 1UB3A 2VELA 4I7UA 3S42A 2ZFAA 4MY1A 3OVPA 1FY6A 4LRTA 4BFAA 1C9DA 5AC8A 5FF2A 5AHNA 3SGZA 4FIRA 4MLRA 3QZEA 3NQ8A 5LSMA 1GVFA 1ZENA 1VQTA 2QCDB 3DFNA 4NNAA 4O1DA 1TCDA 3W71A 5AB3A 3O63A 1Z41A 1QOPA 3S5ZA 3UWUA 5DXYA 2QF7A 1T8XA 1F5ZA 1SZEA 3LLDA 3TH6A 3V75A 2A4AA 3GKFA 2CU0A 2CZFA 1GYNA 3PULA 4ZQMA 3P60A 4KFPA 3QFEA 5CKSA 2J24A 1PCWA 3OBKA 1L6SA 4BK9A 4QM1A 3PM6A 3NQFA 4XKYB 1QOQA 4MJMA 5EY5A 3A23A 2YZRA 2DZXA 5LGXA 4NQ1A 4K7YA 4QSHA 3TFCA 1OK4A 4QISA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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