5HPCA

Structure of xaccel5a crystallized in the space group p41212
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
MLKYVGVNLSGAEFNSRKKPGTLFKDYTYPAASDFSYFAGKGMNTIRLPFLWERVQPELNGPLDQAQLGLIKKSLEAAKANKQYLILDLHNYATYSGKRIGTSDVPAGALADLWRRLAPEFKDDKAVIFGLMNEPNGISAPDWANAAQGTITAIRKTGAKNLILVPGTAYTGAHSWRSTSYGVSNAKALEILKDPGNNLAFEAHQYLDKDYSGTKPVCTSDSVGQEKLQGFTSWLRENKQKGFLGEFATANNPVCDKALEGMLTYMEKNSDVWLGWTWWAAGAWWKPDYPFTVQPGKDGSDKPQMAILSKYARRAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of XacCel5A crystallized in the space group P41212
rcsb
molecule keywords Cellulase
molecule tags Hydrolase
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
total genus 117
structure length 316
sequence length 316
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5hpcA00
1GOIA 2XFRA 2XSBA 1MYRA 9CGTA 3AISA 3UG5A 1XHGA 1WZKA 1V08A 2QF8A 3BMWA 4UFKA 1H0GA 1MW3A 3ALFA 4ACZB 3A6OA 3ARSA 1UD8A 2WC4A 4CCDA 3EDFA 4W93A 4YHGA 1PIFA 4WIWA 4A3HA 4DUVA 4P8WA 2PWFA 5A8OA 5A6KA 1FOBA 1WB0A 2E9BA 1MW2A 4CD5A 1B90A 3ARZA 4W7WA 1M01A 1TR1A 4PTMA 2X8RA 1FFRA 1AQ0A 3AMGA 4M1RA 3VD9A 5BXRA 1XYFA 3LPFA 4AXNA 3ALGA 1UH4A 5GQBA 2J7EA 3TOPA 3RM4A 1VEMA 5A6JA 1OGBA 4F9DA 4WF7A 5BYWA 5KZ6A 2XGIA 4UQCA 4UQBA 2WANA 1K6AA 1JG9A 2XTKA 3ARWA 4WKAA 4B3KA 3THCA 2BHYA 2D1ZA 1V02E 4W8BA 4CVUA 2OYKA 3CMGA 3W24A 1CNVA 3UERA 2GK1A 2OWWA 1B1YA 4UOJA 4JHOA 1E73M 5D4YA 3POCA 2YA0A 3AMKA 1ODUA 3CLWA 2UWFA 2ZOXA 3GH7A 3SEPA 4CU6A 3ARQA 4H8VA 2YIHA 1UQYA 2BFGA 4GZJA 3W81A 3DYOA 1D3CA 5BWFA 2VC9A 2BXYA 3CHEA 4FLSA 4D6IA 1DP0A 1Q6FA 4F66A 1OT2A 2VRKA 1UZ4A 3WENA 4OIFA 1JNEA 3TONA 4HPHA 4JFUA 2X05A 2FHCA 2CNCA 2D20A 2G3JA 4PMZA 3T0AA 2HVMA 1J9YA 1HKJA 2X1IA 2V38A 2DPEA 1MVYA 4B9ZA 1AVAA 2ZUTA 2W67A 3L2MA 1UD4A 1BVZA 1PEZA 2ZUWA 1BGAA 4DWSD 5A6AA 3FXYA 1X6NA 2BHUA 1TG7A 5C71A 4CD6A 3VDCA 2WCAA 3OBAA 1JDDA 1JYWA 1ZJAA 4M8UA 4UFJA 1XH1A 4MB4A 4PCTA 4AISA 3TA9A 1AQMA 3ZO9A 1WPCA 6TAAA 2J7CA 3WSUA 4Z2IA 3SUWA 3MS8A 4WSKA 4AD4A 3EDKA 3AIEA 1M03A 3AIVA 4KWUA 1DWHM 1JD9A 2YL6A 1K9DA 1MQRA 4HZ7A 2IUZA 2GJXA 2FHFA 4W8AA 4FK9A 1GVIA 4ZENA 2VX5A 4MPKA 4W88A 3OLGA 1J0ZA 1E1EA 3WQ4A 1G1YA 1VF8A 1J11A 1LL7A 2CBVA 4QLLA 1WKYA 4GQRA 1XYZA 4BCEA 2QMJA 3PZUA 4E2OA 1KWKA 5M3WA 2W61A 2PWEA 3GH4A 3GXDA 1ZBWA 3MSDA 2A3AA 3IJ7A 4H8HA 2DIEA 2DEPA 1EXPA 3RM8A 1KXTA 2WPGA 3VILA 3WH5A 1HN1A 3PTKA 3ARXA 2QPUA 4CN6A 2AAAA 2W91A 1E0VA 2XFYA 5CG0A 1LL4A 3HMCA 2DT2A 4XZWA 3F5KA 1GHSA 3K4DA 3AHZA 3SCWA 1E55A 1MQQA 3NYDA 3AZSA 1JZ2A 2WYSA 4V28A 3EBVA 2D0GA 3WDRA 3DYPA 4OOZA 1XCXA 3M07A 5LYRA 2YKKA 4C7FA 2XVKA 4W85A 4TX8A 3CHCA 1UR0A 3OG2A 2CHNA 2QLYA 4NZCA 3QHNA 1W9BM 1GONA 1VJSA 1WZLA 4EK7A 1LF1A 2E8ZA 2G3NA 1E72M 3TTQA 1W3JA 3II1A 5CSYA 3VD5A 1E9LA 3WMSA 4AZCA 4TVUA 3ARTA 4TOQA 1FH8A 2QPSA 3NSNA 3L4UA 4QP0A 1JZ3A 4IPNB 4U33A 3WKZA 1PX4A 4YPJA 5CLWA 2YLAA 3TP4A 4P7RA 3A4AA 1E5NA 4U5KA 1VENA 2VNCA 5JUVA 2VX4A 4GZIA 4HPGA 1ISYA 3T09A 3N13A 1JL8A 5D9NA 7A3HA 4W7UA 4WSJA 3ZQ9A 3N12A 2D2OA 2J74A 2F2HA 3OGVA 4X9YA 5FIPA 1E6NA 2GJPA 1TVNA 4ZXLA 1KGWA 3BXWA 3VOCA 4KGJA 1H3GA 1QNRA 2J8GA 1A47A 1C8QA 1D2KA 1J0YA 4BZYA 4E8DA 1LG2A 2FGLA 2YDQA 1FP8A 1GVYA 2YL5A 4GO8A 1C91A 2NT0A 2XSAA 4PMQA 5D8ZA 4CD4A 5EBAA 4JCMA 1OBAA 1N82A 3WQWA 3VIHA 1W9VA 4UFHA 3UG4A 4A3YA 3IJ9A 1BG4A 1KB3A 1W9UA 1JZ4A 5JIPA 4W5ZA 5A6SA 2ZX9A 1JGIA 2W5FA 3MMUA 2BY0A 1MXGA 2UY2A 3AMCA 4HMCA 2GVYA 1OD0A 4R27A 1JF5A 3ZJKA 2VR5A 3QHOA 1V6VA 4M82A 3ZJ6A 4D6EA 2PC8A 1GCYA 3W6MA 2WSPA 3EDEA 3N11A 4D6FA 4AD5A 2DT1A 3U5UA 1UKPA 2VUYA 3CTTA 2ZX7A 1X1NA 4D6JA 1UWSA 1NARA 5GNYA 4QLKA 3CMJA 1UWTA 3MANA 1W9PA 3WBEA 1WAWA 3U57A 1OD8A 1TA3A 2QHAA 5A2CA 3GXFA 1HJSA 2NW0A 1HKIA 2DSKA 3AYSA 1BSIA 5IFTA 4JCLA 5EMYA 3WH9A 4GI9A 4PTVA 5JBFA 4MDPA 4PSRA 1XH0A 3KL5A 1DWJM 3VD7A 1TCMA 1H09A 2PI6A 1NWSA 5DF0A 5I78A 4AZ6A 2WM0A 2DSVA 1BGGA 3WD0A 1E4LA 1FA2A 3D5HA 4X0NA 3FAXA 1CYGA 3VD4A 1H0IA 4MTVA 1V0NA 4KGLA 3MMDA 2GDUA 2C0HA 3W4RA 5DFAA 4PMVA 2FHBA 2WHKA 2D22A 1B30A 4UFIA 2J78A 1E71M 3CIVA 1OGGA 1LQ0A 2BY3A 1RD6A 1L0PA 4HMEA 4WK9A 4EE9A 4W8LA 3K8LA 2ZE0A 3RPMA 4AC1X 1JZ8A 4ACYA 1KQYA 1E6RA 3O9NA 3B9AA 3DYMA 2VJXA 1A3HA 1Z32X 2A3CA 3VIGA 4OOUA 3VMOA 1E6ZA 4HOXA 3I3BA 4M81A 3SCSA 4PMUA 1UD2A 4QFUA 2YJQA 3OLIA 3AXIA 4UNIA 1NWUA 4D1IA 1R85A 1QI5A 1JZ7A 2Z1SA 3RIKA 1UD6A 5FL0A 2ZUUA 3WH8A 4CGTA 3AIQA 4QAWA 1NP2A 4LYQA 4ML4A 3IAQA 5HDRA 2OYLA 1YHTA 3QOMA 4CUCA 1JF6A 3ZMRA 5BXSA 4LQ1A 2ZXQA 1JD7A 3SUSA 3ZT7A 2GDVA 2B31A 1E3ZA 1M04A 3UR8A 2CBJA 2W62A 2CPUA 1UQZA 2XIBA 4HA1A 4W5UA 4PBGA 1BQCA 1I1WA 1ISVA 1M7XA 2XGBA 3I3DA 1W3KA 1WDPA 5HXMA 4UQ9A 2X0YA 1R7AA 1Y7VA 4RE3A 1UWUA 1CXHA 2Q8XA 4PCSA 2EPMX 4B15A 3KL3A 2E40A 3W38A 5HPCA 5I0DA 3AZTA 3VMNA 4AZGA 3VINA 3CZEA 5FKYA 5IXEA 2JF7A 1BYAA 2CESA 3N9KA 2EQDA 3CZJA 2WHMA 1EO5A 2VO5A 2WKLA 4MJ2A 3CH9A 1TE1A 2ZUMA 5ABFB 2OLHA 5DEZA 2WW5A 4Z2LA 1I75A 2QV4A 1QOXA 4AY1A 4U2ZA 1UR9A 3BC9A 3BSGA 3DHUA 1WZMA 1OB0A 3L2LA 4NF7A 2E3ZA 3LPOA 1CIUA 5CGMA 4W87A 3EMCA 3PZTA 4QCFA 4HOWA 4CCCA 2V5CA 2VI0A 4MAVA 2WVVB 2GUYA 3U7VA 1ISXA 2W66A 1BFNA 4RL3A 3AHVA 4B9YA 1JXJA 2IXUA 5D9MA 4AIEA 3AS2A 3PTQA 3BCDA 3A3HA 3TTSA 2YA2A 1D7FA 1GOMA 1BPLB 3N1AA 3KWXA 4UZUA 3GXIA 1ZJBA 4U3CA 3FHAA 2YDRA 4S3JA 2IXVA 3I3EA 2VR4A 1E0XA 4D71A 1UWRA 4HU8A 1LLOA 1W3HA 2UY5A 4Z2GA 4UQEA 3DECA 3VX0A 2PB1A 5KEZA 3BAWA 1W1PA 1OCQA 1B3WA 3KZSA 1ECEA 1G9HA 4N0RA 1JI1A 1AQHA 2WMIB 3F5JA 4Z2HA 5JBEA 3NDYA 2XVNA 2D24A 2WC7A 3WDHA 3CO4A 5BRPA 3VNZA 3ZSSA 4P7QA 3ZT6A 1B9ZA 4GO9A 4JKLA 2VZOA 3POHA 3GBEA 3PZIA 3WF4A 2WC3A 4CVWA 3VX1A 1HKKA 1H2JA 3AZRA 4NRRA 3BAJA 4H2CA 1V6WA 4DWSB 4TTUA 3RJYA 1W91A 2XWEA 3WUEA 4JHZA 1JYVA 1J01A 2PBOA 3GYCA 1GOOA 1EA9C 3AIUA 1SFSA 2YBTA 4MAZA 3PZMA 4D6CA 3RM9A 2VX6A 4TVDA 2ZX5A 1JYNA 1NQ6A 1W1VA 1GOQA 1Q6GA 2WXDM 1BG9A 2G3MA 1UR8A 3WD2A 1K9TA 3AS1A 2X0HA 3VGDA 2JIEA 1VJZA 1EHNA 3PHAA 3OA5A 4B3LA 2YL9A 1OSEA 5BCAA 3FW6A 2D3LA 5A69A 1E6SM 3KEHA 2W63A 4AD1A 1C93A 2CIPA 3CZLA 1C8XA 4IPLA 1B0IA 5A3HA 4PTWA 2VTFA 4E4PA 1F4HA 1V6YA 3WNKA 4XX6A 1HVXA 1V3HA 3ARUA 5GNZA 4GINA 1UA7A 2EPLX 2WB5A 3ECQA 4ATWA 2ZWYA 2EJ1A 2BNJA 1CXFA 3B9DA 1UH2A 1JI2A 3NSMA 1U2YA 3BMVA 3W37A 3ZR5A 1KXVA 4HZ6A 1JAEA 4P7NA 4IUGA 3LPPA 2J47A 2YDSA 2GK1B 3IK2A 3NJ3A 3VIMA 1KBKA 2VVNA 3AIRA 3T0BA 3WD3A 3ZSTA 1V0KA 4TX6A 3DHPA 3WFZA 4L4PA 1UR2A 2DQXA 4KH2A 1WCGA 1VB9A 3OGRA 1H5VA 4EAMA 3VGFA 1VFMA 5IFPA 2DT3A 3UETA 1BAGA 3AHXA 4UQAA 4D72A 5HPOA 4PMXA 1CGUA 4Z2KA 3GTNA 1CLVA 1RP9A 1MFUA 5A8NA 2XVLA 1LJYA 3WNNA 3MMWA 2BXZA 2FH6A 3EMQA 3L4ZA 3B9EA 4BQ2A 4CD7A 5A6LA 4N42A 2CERA 1EIBA 1US2A 4M80A 3MSGA 2MANA 2XFFA 1JFXA 4PYSA 3W29A 4FLOA 3TTOA 1V3IA 1CDGA 4DUWA 3TTYA 4XUYA 1WZAA 3MUZ1 2BV9A 3PN8A 4Y7EA 2DGAA 1FH7A 2UY3A 3F4VA 3SUUA 2E8YA 3RCNA 1H11A 3ARYA 1EOKA 1XSKA 2Y5EA 1HJVA 3WIJA 2WMHA 3IAPA 3AS3A 4HMDA 1XD0A 1BLIA 5BXTA 2E9LA 3RJXA 1C90A 2ZXBA 1BTCA 2G4FA 3K8MA 3VGHA 1V3LA 2BS9A 3WUFA 4ATLA 1E6XM 4UOZA 2VCAA 2V3DA 3OGSA 1ITCA 1HNYA 4JFWA 1HVQA 4BA0A 1V02A 5E0CA 3W82A 3FN9A 2GJXB 1ISZA 1VEOA 4BQ3A 5FL1A 3SCUA 1OIMA 5I6SA 2D0FA 4UFMA 4WKFA 1NOUA 2J7FA 2PBGA 3GXMA 1CGVA 3BGAA 5D8WA 1JAKA 2AOSA 1XD1A 4C7DA 4QLJA 2OSXA 2VVSA 2YA1A 5IHSA 1WO2A 4KRUA 2HISA 3WDJA 1GJWA 1U33A 2WZIA 3BH4A 2XPKA 4F8XA 2E0PA 1CGWA 1B3XA 1XSJA 2XG9A 1E4IA 1E6PA 3FNDA 5M03A 4HU0A 1EQPA 5F7UA 3CUFA 1R7OA 4LYRA 4GZEA 3WD1A 4H8UA 4UOQA 2O9RA 3VMPA 3GM8A 3KL0A 1CWYA 1G5AA 1UD3A 1CXEA 2VCCA 3PZOA 2J62A 3OZOA 1QBAA 3ZIZA 5E9AA 1B31A 1GQKA 3L4WA 4P7LA 4DM2A 3PZNA 1G0CA 3AIBA 2WHJA 3L4VA 3M46A 5D9OA 1UUQA 1CBGA 1E15A 2PF0A 2BY1A 1E56A 2V3GA 3VDAA 1V0MA 3WH7A 3WUGA 4B16A 5BROA 3OZPA 1WDSA 5TD4A 4HTYA 3FAWA 1PX8A 1AMYA 3OLDA 4MNMA 4ZEPA 1SYTA 4HZ8A 1XRVA 3AHYA 4J3UA 4U5IA 3WD4A 2OSYA 5CGTA 4OKDA 3VIPA 3W26A 3AXXA 3FHQA 3WDPP 3BAXA 4AZCB 3WF1A 4ATDA 2ZX8A 1KCLA 2BHZA 3SCPA 3ZR6A 2J77A 1E43A 3K46A 4J3XA 4J28A 3AMDA 4OUEA 5I77A 3AICA 3AOFA 2YBUA 2WSKA 7TAAA 3MUIA 3CHDA 4AD3A 4OZOA 1E1FA 2Y8VA 1CXIA 4PMYA 2O9OA 1G01A 1JFHA 1XCWA 5CPSA 1E5JA 4V27A 2EBNA 2WNWA 4H04A 4X0VA 2WBKA 1QI4A 5ECUA 1PZ2A 4JKKA 4W89A 4WLCA 2CKRA 3EYPA 4W7VA 1FHLA 1W9DM 2WCGA 1ZBCA 3GH5A 3MUAA 2RGLA 1GJUA 5CSUA 2F8QA 2WMFA 2VCBA 1SMAA 2J8FA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GOI A;  2XFR A;  2XSB A;  1MYR A;  9CGT A;  3AIS A;  3UG5 A;  1XHG A;  1WZK A;  1V08 A;  2QF8 A;  3BMW A;  4UFK A;  1H0G A;  1MW3 A;  3ALF A;  4ACZ B;  3A6O A;  3ARS A;  1UD8 A;  2WC4 A;  4CCD A;  3EDF A;  4W93 A;  4YHG A;  1PIF A;  4WIW A;  4A3H A;  4DUV A;  4P8W A;  2PWF A;  5A8O A;  5A6K A;  1FOB A;  1WB0 A;  2E9B A;  1MW2 A;  4CD5 A;  1B90 A;  3ARZ A;  4W7W A;  1M01 A;  1TR1 A;  4PTM A;  2X8R A;  1FFR A;  1AQ0 A;  3AMG A;  4M1R A;  3VD9 A;  5BXR A;  1XYF A;  3LPF A;  4AXN A;  3ALG A;  1UH4 A;  5GQB A;  2J7E A;  3TOP A;  3RM4 A;  1VEM A;  5A6J A;  1OGB A;  4F9D A;  4WF7 A;  5BYW A;  5KZ6 A;  2XGI A;  4UQC A;  4UQB A;  2WAN A;  1K6A A;  1JG9 A;  2XTK A;  3ARW A;  4WKA A;  4B3K A;  3THC A;  2BHY A;  2D1Z A;  1V02 E;  4W8B A;  4CVU A;  2OYK A;  3CMG A;  3W24 A;  1CNV A;  3UER A;  2GK1 A;  2OWW A;  1B1Y A;  4UOJ A;  4JHO A;  1E73 M;  5D4Y A;  3POC A;  2YA0 A;  3AMK A;  1ODU A;  3CLW A;  2UWF A;  2ZOX A;  3GH7 A;  3SEP A;  4CU6 A;  3ARQ A;  4H8V A;  2YIH A;  1UQY A;  2BFG A;  4GZJ A;  3W81 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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