5I2UA

Crystal structure of a novel halo-tolerant cellulase from soil metagenome
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
SIVAQNGRLQVIGTQLSNEKGEPVVLRGASLGWHNLWPRFYNKNAVQWLADDWKCTVVRAAMGLEIEDNYRENPEFALQCITPVIESAIENGIYVIIDFHAHNKYTEEAKTFFAGMAEKYGEYPNVIYEIWNEPDYFEWEEVKTYSEEVIAVIRAIDPDNIILVGSPHWDQDLHLVAEDPIRDVSNIMYTMHFYAATHEAWLRDRTDEAIAKGIPVFVSECGGSEANGDGRLGIEEWKTYVDWMESRKISWVAWSVSDKNETCSMLLPRASADGNWTEDLLKPWGKLTRNSIRNAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Biochemical and structural characterization of a novel halotolerant cellulase from soil metagenome
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cellulase
molecule tags Hydrolase
source organism Soil metagenome
total genus 119
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5i2uA00
1LL7A 4B9ZA 1WDQA 3VIHA 5DT7A 5GPRA 1FFRA 3B9EA 3SCPA 4JFTA 3DC0A 4U3AA 2WNWA 3ZR5A 3CHCA 1BYAA 4HP5A 4W88A 1G0CA 1W3HA 3AS3A 4AEFA 1VFOA 4W89A 4HZ7A 1R87A 2PB1A 1PX3A 1TR1A 5C71A 1G1YA 4CU8A 2DSUA 1FHDA 4IISA 2D0GA 3ZM8A 2W63A 3W6MA 3PZOA 4GI9A 4IUGA 3VVGA 1CGWA 1K9EA 4MB4A 4MNMA 4B9YA 2X8RA 3RM8A 1E0XA 1VENA 3O2LA 2E0PA 4ATDA 4IPLA 1PIFA 3I3DA 1QBAA 3VPLA 3OB8A 2EPKX 3AYSA 1DWJM 1HJUA 3WQ5A 5ABFB 1HKMA 3SIMA 4N0RA 4GKLA 1V3IA 3CUJA 4UCFA 3WDRA 1W3LA 1BSIA 1RD6A 1PPIA 3MU7A 2BY2A 2XVNA 1H2JA 1RP9A 4HTYA 4AD3A 2Y5EA 3DYOA 3VGFA 3WF0A 3AHZA 1UD2A 5D9NA 1HXJA 4WIWA 3SUUA 2OWXA 3FAXA 1H0GA 2AOSA 5E09A 4YHGA 3AXXA 2DGAA 3D3AA 4PMYA 1DHKA 1X1NA 2X2YA 1GJWA 2DIEA 3L4TA 4JKLA 2VMFA 1EDQA 4GQRA 3UETA 1K9FA 3WF3A 4D71A 1LJYA 3T09A 1VAHA 4HOWA 2VCAA 4EANA 1G94A 3MS8A 2Y24A 4HMEA 2XSBA 3DYPA 2PWGA 4P8VA 3PZTA 4Z2LA 4BQ5A 2WZIA 1B3VA 4AD0A 1UKSA 4UFJA 4MAZA 4GIAA 4QCFA 1V6XA 4QLKA 3AZTA 4HZ8A 1WP6A 3HN3A 1ZBVA 5M5DA 5A6BA 3OG2A 2HISA 3KEHA 3I3EA 1KXVA 2BS9A 1NWSA 2VZVA 4GINA 2YLLA 4D6FA 1EHAA 1TUXA 1H41A 4URIA 4WSKA 3RM9A 2V5DA 2A3CA 3ARPA 1EQPA 2J7FA 2F8QA 3T2QA 4PTWA 1M03A 1V3LA 1HKKA 3FXYA 1J10A 3WUGA 4AMCA 1E5NA 1ZB5A 2J78A 1HJXA 1NOUA 1ZBWA 1W9BM 3BCFA 3GBDA 1XCWA 3AXHA 3K4DA 2CKSA 1ZL1A 1JFXA 1UR1A 4MADA 5CPQA 2J79A 4MDPA 4YHEA 6A3HA 4LYQA 2EPNA 1RPKA 3NDYA 3VUPA 4KGLA 3IAQA 4ZXLA 2WVSA 2ZXAA 4B15A 4LX4A 3MMWA 1LL6A 3OBAA 3A4WA 3VMNA 4CD5A 1UWQA 1RH9A 5IHSA 2AAAA 1W32A 5E70A 1XGZA 4AZ6A 4Z2HA 4Q22A 1CZ1A 3VX1A 3POHA 2J74A 4KGJA 4P8XA 1TE1A 1BPLB 2D20A 2W61A 2YL5A 4JKKA 4UQAA 3KL3A 1CXHA 4WKHA 1J0KA 4CN4A 1MVYA 1UR4A 1OD0A 1PX8A 2WC7A 4UOQA 2WZEA 4GO8A 3ZJKA 3VDAA 1UH4A 4JL2A 1W2PA 4C7GA 4BQ3A 1B3YA 1E6SM 1HP4A 3LPOA 2YIHA 1C8XA 5A3HA 1J0IA 2VI0A 5EMYA 2DSKA 3FNDA 4U33A 2XUCA 5ECUA 3KZSA 1CPUA 4WLCA 1W91A 3GNRA 2BNJA 1A47A 1V02A 2FHCA 2WCGA 4M81A 2ZWZA 3W53A 4EAMA 1UD5A 4M24A 4UTFA 1WCGA 4UQ9A 4Z2JA 1J0JA 3MKKA 5A8PA 2BVYA 5CSUA 5KZ6A 2GSJA 2E40A 3CHEA 1J18A 1CNVA 3GM8A 3F5JA 3WD3A 3WNMA 4JAWA 2W67A 4WF7A 4H8VA 4J3VA 5CG0A 2OYKA 2WCSA 1E1FA 4MJ4A 2NT1A 4M80A 4P7RA 4P7LA 2YA1A 3WD2A 6TAAA 2RGMA 4AZHA 1XD1A 3O9NA 1E6QM 1UD4A 3CUHA 3DECA 1PJ9A 1UKOA 1ZJAA 4W93A 5D9MA 2G4FA 3CMJA 3ARRA 5E0FA 1DTUA 1NQ6A 4OJYA 1VBUA 4W86A 1B9ZA 1AVAA 3AROA 3AIUA 5CJ5A 1LF1A 1UHVA 5CPSA 1UKTA 1KXQA 5D8WA 1JDAA 3RDKA 5D9PA 2GK1A 2BXZA 1GCYA 5LA0A 1ODZA 4UFMA 3GXFA 4E8DA 5A6KA 3VD5A 2BVDA 3CBWA 4AY1A 4D6GA 3TTOA 3BSHA 5E0CA 3LPPA 3BXWA 3PZVA 1C8QA 2XTKA 1E4MM 2CHOA 2WVVB 3A6OA 4MPKA 1CYGA 1J0YA 3BAWA 3CZEA 4JFUA 3UESA 3WBEA 4ACZB 5I6SA 2J7BA 2EJ1A 2G8ZA 1PBGA 3M46A 2ZUMA 1EQCA 3BH4A 4LYRA 2W5FA 3PN8A 4HA1A 1VIWA 4DM2A 4UOJA 1XHGA 3CTTA 4AEEA 4XV0A 4BA0A 2WM0A 3WSUA 2VT0A 5FL0A 3ZQ9A 1VFUA 1KGWA 1HKJA 4W7VA 4RL3A 1U33A 1J0HA 1BF2A 2EBNA 1GHRA 4XUYA 2VR4A 1C8YA 3ZMRA 2ESCA 5M3WA 4C7DA 1MFUA 4CKQA 4UR9A 4J3UA 2XVPA 2CBVA 5HNNA 3MUY1 2CHNA 1JL8A 4XB3A 3W27A 3QHOA 1CGYA 2WVUA 4HU0A 3SCWA 1UWSA 3SCSA 4NRSA 4OOZA 1W1TA 1VFFA 4AD4A 1B90A 2XM1A 2EXOA 1KBKA 1FOBA 1Q6EA 3N12A 3AZRA 2BFGA 1K9DA 2GVYA 2DSWA 3VDBA 2CEQA 1XH1A 1W9UA 4PN2A 1E1EA 3EYPA 2BV9A 3VIJA 2VRKA 1Q6FA 1UWIA 3AI0A 4AXNA 4DWSA 1H4PA 1JG9A 1MQRA 1VRXA 5ABGA 1CECA 1X6LA 3VIGA 1CLVA 1GOQA 4DM1A 2J25A 2J7EA 3GTNA 1WO2A 4BS0A 4CVWA 5HPCA 3MUAA 3PZGA 2JFEX 1E4NA 5EFDA 4CCDA 1Q4NX 3ZO9A 1QI5A 3AIBA 4WJXA 1VB9A 4TTGA 2DT3A 2D22A 5A6LA 1H0IA 2UY5A 4PSRA 3BAIA 2RGLA 1TCMA 2FH8A 5I23A 1MW2A 1W1VA 4AZ7A 3WUEA 2FHFA 3SCUA 1F4HA 4A3HA 3OLIA 3IAPA 2J77A 3WQWA 5HBFA 2QPSA 3ZJ7A 1J01A 3S2CA 3N17A 1IZJA 4PMOA 4CCEA 3GBEA 5IHRA 3NIYA 1BVZA 3APGA 1UZ1A 1WDSA 3UG4A 4F8XA 4P8UA 1NP2A 1WZKA 3L2MA 3W24A 3VGHA 1TG7A 2XGBA 1EGZA 1NWRA 3PZIA 4HMCA 4PMUA 5D8ZA 1CDGA 3WH5A 3CZ8A 3NJ3A 4UQCA 1VEMA 1KGXA 4W5UA 1XH2A 3ARZA 1E6ZA 1V0KA 3VKKA 4U3CA 1GUVA 1H11A 2WMFA 4TVDA 3WNLA 1US2A 4F9DA 1HKIA 1UA7A 3VO0A 4AZCA 1JZ3A 5GNXA 1CGXA 3OA5A 3OLEA 3AFBA 4PTMA 5CGMA 1MW3A 2W4XA 2WKGA 1QHPA 3RPMA 5E9AA 4R27A 2VX7A 3N04A 5JBEA 3AMKA 5A6MA 5BROA 4OOUA 4FLSA 2Y8KA 2OSWA 2OLHA 3E1F1 4KRUA 1CXKA 2QHAA 1B2YA 4GZEA 4DUVA 3DHUA 1JZ8A 3PZQA 1E6NA 2DSZA 3TA9A 3WBAA 3WENA 1VEPA 4AIOA 5GNZA 4D6JA 2A3BA 1C7SA 1O7AA 3WDPP 3PTMA 3CO4A 3WL0A 1MQQA 2IXUA 1UQYA 3WKZA 3AIEA 1LL4A 1WZMA 5EB8A 4D6DA 1V3HA 3VIKA 3CHDA 4WKFA 4GPNA 2ZX6A 5AYBA 1B3XA 2ZXBA 1B30A 4FMVA 4ATLA 3ARSA 2D0HA 4M8UA 1XC6A 1KGUA 2V3GA 1LG1A 2C0HA 3KWXA 1QNQA 2CBJA 3RMEA 3MO4A 3T0AA 2VR5A 1QI4A 4MB3A 3WEOA 5A94A 3DHPA 3WD1A 2D23A 4AZGA 5A8NA 4UZSA 2BHUA 1R85A 3T0BA 3U5YA 2YL8A 2F61A 4OKDA 1KBBA 5GQBA 5BRQA 1HL9A 2IXVA 4MTVA 1V0MA 3HJEA 1EO5A 2V3FA 1PEZA 2BHZA 1EOMA 1K9TA 4GZIA 2QMKA 1GORA 3WEMA 1CGTA 4J3TA 1Q6CA 4U2YA 1OM0A 1CENA 3N1AA 1UD3A 1NOFA 4H8HA 3T08A 1BLIA 3EDDA 2DT2A 2YLAA 3N11A 1LG2A 1I75A 4PRWA 4CVUA 2X09A 2V3DA 2WB5A 1BGAA 3BLPX 1C7TA 3BCDA 2CETA 3WNNA 3RM4A 3BSGA 2IUZA 3AS0A 4L4OA 1G01A 4PMRA 2WHMA 4AC1X 3M7SA 3GXIA 3UR8A 3MV11 1WKYA 3PZMA 2Z1KA 2Y2WA 3HMCA 1W9VA 4GXPA 3VDCA 4BQ4A 3ZSSA 1E71M 3MMDA 5HOSA 1OT1A 3OLGA 3WELA 2J75A 2BHYA 1A3HA 4PMXA 4ACYA 3WNKA 1GVYA 1KWGA 2VC9A 4AIUA 3NSXA 1ISZA 1PAMA 2XWEA 1G9HA 2WMHA 3CZJA 4ZFMA 2DT1A 2OYMA 3AYRA 3GH7A 4D1IA 1VEOA 4NRRA 4QCEA 1JAEA 1U2YA 2VCCA 4PTVA 1EOKA 2QF8A 3WFLA 3U7BA 4PYSA 1QOXA 1HNYA 3TTYA 2XWDA 4M1RA 3GNOA 4JFWA 2CYGA 2BY1A 3AHXA 1OCQA 4E4PA 1JYNA 3WDQA 4PCSA 1ZU8A 3N9KA 3AMDA 4DWSC 2V38A 1V3KA 3D5HA 1B3ZA 1Y7VA 3WQ4A 4A3YA 4ML4A 5GNYA 1V6YA 3BAXA 3PHAA 2D3LA 2CITA 1W3KA 3N15A 4UNIA 3BLKA 1H5VA 4LGXA 5BRPA 5CZKA 3PTQA 3RO8A 1QI0A 5DMYA 2X1IA 3GYCA 4WKAA 4QDMA 1GJUA 2WMJA 2OWCA 3CMGA 3QHNA 3AS1A 3OIHA 4PMDA 1CIUA 5CLWA 2G3MA 3ZT7A 1FA2A 3POCA 1LLOA 3WDIA 3ARVA 1D7FA 3VNYA 2YKKA 5EFFA 2J7DA 4W85A 3G6LA 4S3KA 5HPOA 1C3FA 1CXLA 4MNJA 1JFHA 5A1AA 5FKYA 5CLTA 3CGTA 1UOKA 3BMVA 4UFLA 1X6NA 1QVBA 2UY4A 3ARTA 1TZ7A 4UFKA 3UG3A 4J3XA 2MANA 2VURA 3NDZA 3WD0A 1FH9A 3PZNA 2WAGA 4LXFA 3NUKA 5D9OA 3HU7A 3J7HA 4QLJA 1W1YA 2A3AA 1BQCA 2FDMA 1E3XA 1NOWA 1JYVA 2V5CA 3WDHA 1DWIM 1ITCA 1XRVA 4D6CA 1DWAM 1B3WA 2EO7A 3NSMA 3T2PA 3WDJA 1OGGA 1F4AA 4W8BA 4ZE4A 4HMDA 3GXMA 3ECQA 3W6LA 5DFAA 5LYRA 1EDTA 4IM4A 1E73M 1KQYA 1W2VA 2VNCA 3VIOA 3BAKA 1EHNA 4D6EA 1QPKA 1MXDA 2BVTA 4GQQA 2EPOA 3NYDA 1HN1A 5A95A 2E9BA 4TVUA 3W29A 5IFTA 1UZ4A 2ZUWA 1C92A 5JBDA 1V08A 4A4AA 4W84A 3W0KA 1VF8A 2XIBA 1PZ3A 2X05A 1NP0A 2ZX8A 4FLRA 1XSJA 3SCRA 4HOXA 1SMDA 4UFHA 1AQHA 1ESWA 1JYXA 3L2LA 2ZOXA 5I5RA 1EDGA 1C93A 3M6DA 1E43A 4LQ1A 1SR0A 1OBAA 1NWUA 5BXPA 3ZR6A 3WMBA 1QHOA 2ZX9A 3PZ9A 1TA3B 1EA9C 3A4AA 2YJQA 1JD9A 1ZS2A 3WQ8A 1MXGA 3OGRA 5DO8A 3THDA 3W25A 1QW8A 4ACZA 2BY3A 3SCTA 3EDKA 3QOKA 1E4LA 2QPUA 3ZT5A 1Z32X 3RJXA 4W7UA 4P7OA 4WSJA 4D72A 2EPLX 2VX6A 3T2OA 4CD8A 5IDIA 4Z2KA 4AZ5A 1HJSA 2WBGA 2D1ZA 3WQ6A 2W91A 1TFVA 1BVNP 3ARQA 5ABHA 1GW1A 1W9XA 3VM5A 2VCBA 2VJXA 1BYDA 2GJXA 4UFIA 4GO9A 1J11A 1QW9A 4CU7A 1J9YA 3L4YA 1DWGM 2BXYA 2VO5A 5BXRA 1JZ4A 5TD4A 4PMZA 3L4ZA 1WAWA 3U7VA 1BG4A 1OD8A 3ZIZA 1NH6A 1DEDA 3AMLA 3VOCA 2WYSA 4FK9A 4W7WA 2OWWA 4NSBA 1E70M 3SCVA 4Z2IA 1AQMA 2GJRA 3CZGA 1V3JA 1V6VA 1JZ6A 5JBFA 3GDBA 4CN6A 2PI6A 1V0LA 1HP5A 3VM7A 2UWFA 2G3NA 4YPJA 4L4PA 1V6UA 2XSAA 1UG6A 4EK7A 3VIFA 3IJ8A 1OINA 3U57A 1JD7A 3RIKA 1QI2A 2DH2A 2G3JA 3PZUA 1ODUA 3I3BA 1UD6A 2WWCA 2A3HA 1TVNA 3RCNA 3QHMA 1BYCA 1PIGA 3GZAA 4CU6A 4DWSB 2A3EA 3EBVA 5D4YA 5AC5A 2VZOA 4MAVA 4W8AA 2WSPA 2ZICA 4GZJA 2PWHA 3JUGA 1HIZA 2GDUA 1DWFM 4KMQA 3UG5A 5BYWA 3WF4A 2WMGA 3CZLA 3TONA 2WC3A 2E9LA 1WDPA 4H2CA 1HL8A 3OZOA 1G5AA 5C8BB 1M04A 3MUIA 3K8KA 7TAAA 2VRQA 1UWTA 4TXEA 2C7FA 2ZXDA 3GNPA 1XCXA 4PCTA 3ZT6A 3QR3A 3VILA 1W3JA 7CGTA 3KL0A 2EEXA 1US3A 2YL9A 1GNXA 5FL1A 3EDEA 1EH9A 2ZUNA 1QHZA 4C7FA 3KE0A 1WZLA 2EQDA 4U5KA 1JIBA 4DWSD 3FHAA 4PUEA 4WK9A 1VJZA 4TOQA 4F66A 4BZYA 3CZKA 2J62A 4XX6A 1AQ0A 4UZUA 2ZIDA 1HJVA 1E55A 4DUXA 1KR1A 5DT5A 1MQPA 3ALFA 1R7AA 1FFQA 1MYRA 2WHLA 3B8SA 4U5IA 3IJ9A 3CLWA 1B1YA 4HOZA 1E6XM 2Z1SA 4BCEA 3DYMA 2C8NA 4AZCB 2CKRA 3WMCA 2B31A 2ZX5A 1FP8A 1VFMA 2X0HA 5FCZA 3L4VA 4J7RA 1ISWA 4DUWA 1QI3A 1MFVA 1FHLA 1CTNA 3TTSA 3NCOA 5E6ZA 2O9OA 3ZJ6A 2E8ZA 2TAAA 2YDSA 4X9YA 2PF0A 3TP4A 4B3KA 2D0FA 3WMSA 2ZXQA 2PBOA 2VUYA 3VINA 1MW1A 4MDOA 2XIIA 4ZEPA 2GUYA 1E72M 1KXHA 1WZAA 3AMCA 3K8LA 2WMIB 3WH7A 2D3NA 4RE4A 2UY3A 4CD7A 1BG9A 5M17A 2FGLA 2ZUTA 4M29A 3EMZA 2CXGA 4PBGA 4P7QA 1WNOA 4XZWA 1WDRA 2NT0A 6CGTA 4AZBA 2W66A 5A2CA 1IT0A 2XFYA 1OGBA 4HZ6A 2GDVA 1GOMA 2FHBA 2XHYA 1SYTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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