5I3DA

Sulfolobus solfataricus beta-glycosidase - e387y mutant
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
487
structure length
487
Chain Sequence
SFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTYNGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A front-face 'SNi synthase' engineered from a retaining 'double-SN2' hydrolase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-galactosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus solfataricus (strain atcc 35092 / dsm 1617 / jcm 11322 / p2)
total genus 192
structure length 487
sequence length 487
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2016-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5i3dA00
1D2KA 2NT1A 1QI2A 2WZHA 3GH4A 1JIBA 1TA3A 1FA2A 4OUEA 4H04A 4TTUA 3N04A 1KWGA 1JYNA 2CXGA 2XTKA 1W9XA 5EMYA 3DYMA 2VRKA 3VOCA 4ZE4A 2ZICA 1JYVA 5I5RA 1G0CA 4KWUA 1ZBWA 3MUAA 2WZEA 4TX6A 1B31A 1CGYA 2WMJA 2PC8A 1W1TA 3W27A 1E4IA 4XX6A 4AZCA 3GXMA 1E6RA 3BAIA 1NARA 3VIJA 4WSJA 1WB0A 5BYWA 3VD9A 2BV9A 1ZBVA 1VRXA 3WD0A 5LA0A 1CTNA 4P8WA 1UD4A 3UESA 2WCSA 1LL4A 4J3WA 2O9OA 1HJWA 2YL9A 3WL0A 4ATWA 3WDPP 5E6ZA 1W9BM 1KCKA 4GI9A 5D9PA 3L4YA 4W8BA 1RP8A 2XFYA 1NWSA 1HKKA 1XH0A 2DT3A 4CN4A 3VIMA 2WVVA 2G3NA 4P7NA 4XUYA 4WF7A 2D1ZA 1W91A 3CHDA 2ZXAA 5DT5A 1QW8A 3AXHA 3ZO9A 2FHBA 2G3MA 2XSBA 3W25A 1F4AA 4JIEA 3U5UA 3AS1A 4OKDA 1R8LA 4TX8A 4H7VA 1GQJA 1MQQA 3ZM8A 9CGTA 5A6KA 1ZS2A 1MQPA 5HXMA 2CITA 2WM0A 1DTUA 2YIHA 5A8QA 4W88A 2D22A 1CPUA 3BH4A 5ABFA 4CCEA 1NOFA 2TAAA 4XB3A 4D6FA 5CPQA 2J79A 3PN8A 3N11A 4AZGA 3SCWA 4W5ZA 1UR2A 3RDKA 3AIVA 3AS2A 3VD5A 2PWEA 5CSYA 4AIUA 3T09A 3N9KA 1E5NA 3ZT6A 5ABEA 3RM9A 1JDDA 3NSNA 3OA5A 1J9YA 1HVXA 1WZKA 2JEPA 4UOQA 4QCFA 4TVUA 1KCLA 4ZEPA 2DSKA 1W1VA 1JG9A 2WBKA 3UETA 1AMYA 4F79A 1H4PA 5IHSA 1HL8A 3LPOA 3S6TA 3ARVA 3WQVA 4W87A 2A3CA 3APGA 4HMDA 1WDRA 1WE5A 2GVYA 5A8PA 1FFRA 3MSGA 2J7HA 2OLHA 2WLZA 4WLCA 1IT0A 4W5UA 2F2HA 1Q6EA 3F5LA 1UZ1A 3L2LA 4AEFA 5AC5A 3LMYA 2D3NA 2QHAA 1R85A 5A69A 3WNKA 1XRVA 5CLWA 2MANA 2FH8A 1E5JA 4UTFA 3EDKA 2AAAA 4HZ8A 5D9OA 3VX1A 2A3HA 3IAPA 3ALGA 3SCOA 4QFUA 3WQ8A 1HN1A 1UKQA 1LLOA 2W61A 4J3VA 5TD4A 1ZJBA 2ZUMA 5GPRA 4JHZA 1C90A 1CXHA 4HP5A 3THDA 4A3YA 3I3EA 1GCYA 1HKJA 2AOSA 5AY7A 1CDGA 2YL8A 4W89A 2O92A 3SCVA 1M03A 3WNNA 3VGEA 1V02A 2CBVA 2DT1A 4CU6A 2GK1B 3AHVA 1KQZA 3GXFA 2WK2A 4UQAA 4D6HA 2PWHA 4E4PA 3T0AA 1GVIA 5LYRA 4U3AA 4UFMA 3BSGA 1XD1A 4PYSA 5BXPA 2PBOA 3EDFA 1V3JA 5DT7A 1NOUA 4C7DA 1E71M 1ITCA 4MAVA 2VO5A 4JFSA 4LGXA 2XWEA 2WANA 7A3HA 3PZGA 3UR8A 3O6AA 1XYZA 4ZENA 4PTWA 3DHUA 4AD4A 4F9JA 4TUFA 3GNRA 4Z2LA 1UWTA 3AYSA 2G8ZA 1CXEA 3CIVA 1JZ8A 4XZWA 1QNRA 2FDMA 1OM0A 4EAMA 3WQ5A 1J0ZA 4P8VA 3WF4A 3AS3A 5IDIA 2XFRA 2F8QA 4MNMA 4CGTA 2VX4A 4JHOA 4IISA 1DWAM 1DHKA 3RO8A 1GOQA 1PIGA 2VCCA 3PHAA 3L4UA 3CUJA 3WL1A 1G5AA 1C8XA 1PAMA 1PPIA 4L4PA 2ZX6A 3LPFA 1BLIA 2J7EA 2J47A 3CZJA 3NSMA 1KQYA 1IV8A 2OSWA 1UA7A 3VGFA 4IM4A 1V6YA 4LQ1A 4PRWA 3JUGA 1FOBA 2XJ7A 2CKSA 4HMCA 3RJXA 3WF0A 1X6LA 5CJ5A 1TE1A 1HP5A 1F4HA 4D72A 1H2JA 2G4FA 1FP8A 3QGVA 4QCEA 3WQ4A 3IJ9A 4AZIA 1QNPA 3VIFA 2YLAA 1C3FA 1UR9A 4H8UA 1D7FA 1XCXA 2VZVA 4GQQA 1ZBCA 1J0KA 2V5DA 2J7CA 4NF7A 3GDBA 1VFMA 1FH7A 3CZKA 4NI3A 2WAGA 2WLYA 7CGTA 2Y8VA 2VRQA 1C92A 3PZIA 5CPTA 3M7SA 2GDUA 1CGVA 1UA3A 2O9RA 3WENA 4TXEA 3AHXA 2J8GA 2CESA 6CGTA 1JDAA 1PZ2A 2QF8A 1J18A 4F8XA 5E0CA 1WNOA 3WD1A 1CXIA 2QLYA 1XV8A 3FY1A 3A3HA 3ZT7A 4MAZA 1CXKA 3AXXA 1SYTA 1JAKA 3EBVA 1NWRA 2B31A 1H09A 3G6MA 2OYMA 3WUEA 1QNQA 4PCSA 3ZSSA 3AS0A 4GZJA 5HOSA 1HJUA 3W81A 3M6DA 2GJPA 1JI2A 1JGIA 1R87A 3BGAA 1SMDA 1GZJA 1YHTA 2ZUSA 3BXWA 2J25A 3DHPA 2Y8KA 2PBGA 3T2PA 1BVNP 3ZJ6A 5DF0A 3CUIA 1UD5A 4ACZB 4JFUA 4RL3A 3I3BA 4LX4A 3CHEA 1E1FA 4PMVA 1B2YA 4X9YA 1DWFM 1WAWA 4OOUA 1B1YA 3A4XA 3CUHA 2WHMA 1LG1A 1UH3A 1KGXA 2EJ1A 1U2YA 4F9DA 2YKKA 3ARTA 3GXDA 3SCNA 4DUXA 3A47A 3RJYA 3QR3A 2WMGA 3VGDA 4P7QA 3WH7A 1R7OA 2QMKA 4UQBA 1UH2A 1AQ0A 2VZUA 3CO4A 3MSDA 5E6YA 1BG9A 3FHAA 4QLKA 5I2UA 2W92A 2V38A 4FLRA 1GHSA 5I0DA 1GQKA 5FL0A 4R27A 3OGVA 4UZUA 1W3JA 3QOMA 5BCAA 4HPHA 5M03A 4D6GA 4QAWA 1EDGA 3CUGA 4DWSC 3WQ6A 1CXFA 3OLEA 2VL4A 2VR4A 1UR1A 1UH4A 2JIEA 1B3XA 2VQTA 2W67A 3AMCA 5C71A 1N82A 3PZ9A 1V0NA 1GNXA 1NM9A 4MNKA 5HBFA 2BHYA 1QI3A 4CD7A 1X6NA 4J7RA 1BQCA 1I75A 2UY3A 3VPLA 3MMWA 4PMUA 3VNZA 4M56A 1U33A 3VM5A 1US2A 3PTQA 1NH6A 4UFHA 2XUCA 3N18A 4U2ZA 3CZEA 1LJYA 3T2QA 4UQCA 1CEOA 1Q4NX 1Q6DA 2ZWZA 1JF5A 1EQPA 1ZU8A 2RGMA 3QOKA 1TUXA 4MB5A 3WELA 4B9ZA 3VIGA 2GFTA 5BXSA 5AYBA 1GVYA 1MQRA 2GUYA 1MFVA 2X1IA 4Q7NA 1UKPA 2YA2A 4FLSA 3SCTA 4D6EA 1GORA 1JD7A 3TOPA 3WFZA 4RE3A 1MXGA 3KEHA 1MWOA 1OD8A 1V02E 1W2PA 2ZUVA 4TOQA 3ZT5A 1B9ZA 3PZVA 2F61A 1E40A 1E56A 1CBGA 5KZ6A 1KGWA 2D0GA 1E15A 4AIEA 3PZNA 3W24A 4MDOA 1K9EA 3FAWA 3QHOA 3W0KA 2D24A 3ARYA 3UG3A 2JE8A 1Q6GA 1V0LA 3OLIA 5E9AA 4Z2IA 2VZSA 2J74A 1OT1A 4DM1A 1BGAA 5JBEA 2UY2A 2W66A 1MW2A 3VX0A 1OINA 5A6SA 1O7AA 2V3DA 4CU8A 4MADA 3CZLA 4HU0A 4ATLA 5IFPA 3MO4A 4C7FA 5DEZA 1CLVA 2WMIA 4NSBA 2JEQA 2GJRA 2OYKA 5D8WA 2XIIA 1E0VA 2YDRA 3WMBA 3FHQA 1OIFA 4WKFA 1AVAA 1E3ZA 5BXTA 3VDBA 1VENA 2ZWYA 3VIOA 2BXYA 1XD0A 3CBWA 3QHMA 5GNZA 1JXKA 4UOZA 3ECQA 1E4MM 1ISXA 1XC6A 3NCOA 4AD2A 3BAJA 2VI0A 1TVPA 2GJXA 2Y2WA 1LF1A 4CVWA 3WQWA 2CETA 1OBAA 4CKQA 3AIUA 5FL1A 3EMZA 1XGZA 5E70A 1PIFA 1O6IA 3A4AA 2BY2A 4ZXLA 4M29A 2YOCA 5EFDA 8A3HA 5GNXA 1VEMA 1GONA 2X8RA 1C7SA 1FHLA 3VIKA 3M46A 1MW0A 1HJXA 2WHLA 3GNOA 4Z2GA 1JAEA 1E72M 1KR1A 5JUVA 2XGIA 1LL7A 1KFWA 3BC9A 1UD8A 1C91A 5A95A 4TVDA 3T2OA 3PZUA 3RILA 4WKHA 2WC7A 3N15A 4XZBA 4UFLA 3ARQA 3ARPA 1GUVA 4KRUA 3PTKA 1DWHM 1ODZA 1PEZA 3OLGA 3MU7A 1W3LA 4M82A 3MKKA 4J28A 1XCWA 4JFVA 4W8AA 6A3HA 4AWEA 4Q22A 3B8SA 3SUUA 4V28A 5A6JA 4P8UA 4IPNB 2WBGA 3VUPA 1D3CA 1KB3A 2VTFA 4CN1A 1UWQA 1ESWA 1JI1A 2WVSA 1M04A 3NSXA 5FCZA 4UQDA 5CPSA 2YDQA 1CZ1A 4JL2A 1CENA 1WKYA 3AIWA 2EBNA 4W7VA 3IAQA 3WUGA 1H49A 4BQ3A 3GH7A 2J75A 3A6OA 3AZSA 1LWHA 3B9DA 1JZ5A 4TVCA 1HXJA 4BF7A 1XH2A 3ARZA 2CERA 4JZ5A 3KL0A 2VZOA 4V2XA 5HPCA 2XVPA 1GOIA 5CZKA 3EDEA 4EANA 1W3KA 5CLTA 3SCSA 2PF0A 5CGMA 3L4XA 3QHNA 3AZTA 4CCCA 3RIKA 1UR0A 3VKKA 1QI5A 1LWJA 1BF2A 4OJYA 3POHA 2XM2A 5FKYA 4Z2HA 5CSUA 4Y7EA 4B16A 4LYRA 1LG2A 2DPEA 5FD0A 3VM7A 4D6IA 5JIWA 2DSUA 1J0JA 1QHOA 1DWJM 2ZUUA 5JIPA 3CMGA 4UQ9A 2D0FA 1TA3B 5CXPA 1E4LA 1W1YA 2BFGA 1SFSA 3WUFA 5BRQA 4URIA 2PB1A 1FP9A 2V3GA 3HMCA 1MW3A 4WJXA 5A1AA 1UKTA 2JIWA 3L2MA 1PX4A 1TVNA 3EDJA 4AZCB 3WY1A 1L0PA 5D8ZA 1WZAA 2VVSA 2CNCA 2QPSA 3LPPA 1RPKA 1H5VA 1M01A 4GIAA 1GOOA 4YHEA 5ABHA 3EDDA 3WF2A 4Z2KA 2E8ZA 3PBGA 1E55A 1E9LA 2GJXB 3KL5A 4CU7A 4HOWA 3OZPA 2J7FA 4NRRA 1OGGA 2YL6A 1EH9A 5D9MA 5CQ1A 3UCQA 7TAAA 2WC4A 1L8NA 2E0PA 4UQEA 4PMNA 3UERA 1BPLB 2WVVB 3NUKA 4N42A 4W8LA 3NYDA 1HL9A 5CGTA 3WBAA 2Y24A 4AD0A 2YBUA 1BYBA 5I24A 1V6WA 2XGBA 1DP0A 3VGGA 5D9NA 4P7OA 1AQMA 3ZR5A 1G1YA 3U7VA 5A8NA 1JZ7A 2EXOA 4V27A 4U2YA 4GZEA 3SUTA 4HMEA 1HJQA 1TMQA 3ARXA 3SIMA 2BY3A 1SR0A 3AXIA 2WW5A 1PZ3A 3SUSA 4ATDA 3WDHA 3CTTA 5ABFB 3VGHA 4D6JA 3WMSA 4CD8A 3AIBA 2X0HA 1W1PA 3NIYA 3KZSA 1UWSA 2YDSA 3WDRA 4YN5A 3F5KA 3OZOA 1LQ0A 3D3AA 2VQUA 4B3LA 3B9AA 3BCFA 3N12A 3W6MA 2XVLA 4BQ2A 3IK2A 3L4TA 2BVDA 1ISZA 3VDAA 1BVZA 1ZB5A 1ECEA 5I23A 2J7GA 3VILA 1QNOA 2X05A 4FLQA 4MDPA 1UKSA 1CNVA 2NW0A 2CPUA 1JZ2A 2EPOA 2RGLA 4PMQA 1W9PA 1K9DA 3IANA 3MMDA 4GINA 4P8XA 2X0YA 1MXDA 4WSKA 1W9VA 3CZGA 4RE2A 1KR0A 4H41A 2VZTA 4MJ2A 2VCBA 3CPUA 2A3AA 4LYQA 2ZE0A 4MB1A 4C7GA 1OD0A 1GHRA 3DYPA 1B3VA 5A2BA 1K9FA 3AHYA 3VNYA 1R7AA 5M17A 2W62A 2VT0A 2WWCA 3L4ZA 4WIWA 2VX6A 1E6PA 3UR7A 3WDQA 3WKZA 1Q6CA 1EQCA 2GSJA 1EA9C 4M8UA 2W5FA 4HA1A 5DMYA 3OLDA 4ZE5A 1JFXA 1EHAA 3WH5A 5BWFA 3WNOA 3ZJKA 3WD2A 2JF6A 3U5YA 4JFWA 4U5IA 2W4XA 3FW6A 4OOZA 4GI8A 4PUDA 2D23A 4E2OA 5A94A 1MVYA 3VGBA 1V3KA 3WEMA 1NOWA 1GW1A 1UWRA 2Y5EA 4M81A 4HPGA 3L4VA 4FF5A 2O9TA 3K4DA 5KEZA 1CYGA 1EXPA 1JDCA 4AZBA 4UNIA 3BAKA 4AY1A 3FXYA 2CBIA 3THCA 4BZYA 1E6XM 1UUQA 1M53A 1KXHA 1ISYA 3AHTA 1I1XA 1ZJAA 1IZJA 4F66A 2BHUA 3OB8A 4NZCA 3K1DA 5E0FA 2DIEA 2VC9A 1MYRA 1J01A 3RMEA 2JFEX 2E9MA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1D2K A;  2NT1 A;  1QI2 A;  2WZH A;  3GH4 A;  1JIB A;  1TA3 A;  1FA2 A;  4OUE A;  4H04 A;  4TTU A;  3N04 A;  1KWG A;  1JYN A;  2CXG A;  2XTK A;  1W9X A;  5EMY A;  3DYM A;  2VRK A;  3VOC A;  4ZE4 A;  2ZIC A;  1JYV A;  5I5R A;  1G0C A;  4KWU A;  1ZBW A;  3MUA A;  2WZE A;  4TX6 A;  1B31 A;  1CGY A;  2WMJ A;  2PC8 A;  1W1T A;  3W27 A;  1E4I A;  4XX6 A;  4AZC A;  3GXM A;  1E6R A;  3BAI A;  1NAR A;  3VIJ A;  4WSJ A;  1WB0 A;  5BYW A;  3VD9 A;  2BV9 A;  1ZBV A;  1VRX A;  3WD0 A;  5LA0 A;  1CTN A;  4P8W A;  1UD4 A;  3UES A;  2WCS A;  1LL4 A;  4J3W A;  2O9O A;  1HJW A;  2YL9 A;  3WL0 A;  4ATW A;  3WDP P;  5E6Z A;  1W9B M;  1KCK A;  4GI9 A;  5D9P A;  3L4Y A;  4W8B A;  1RP8 A;  2XFY A;  1NWS A;  1HKK A;  1XH0 A;  2DT3 A;  4CN4 A;  3VIM A;  2WVV A;  2G3N A;  4P7N A;  4XUY A;  4WF7 A;  2D1Z A;  1W91 A;  3CHD A;  2ZXA A;  5DT5 A;  1QW8 A;  3AXH A;  3ZO9 A;  2FHB A;  2G3M A;  2XSB A;  3W25 A;  1F4A A;  4JIE A;  3U5U A;  3AS1 A;  4OKD A;  1R8L A;  4TX8 A;  4H7V A;  1GQJ A;  1MQQ A;  3ZM8 A;  9CGT A;  5A6K A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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