5IXEA

1.75a resolution structure of 5-fluoroindole bound beta-glycosidase (w33g) from sulfolobus solfataricus
Total Genus 200
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
200
sequence length
489
structure length
485
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDGYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Full and Partial Agonism of a Designed Enzyme Switch.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-galactosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 200
structure length 485
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2016-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5ixeA00
2GJPA 4GI9A 5A6KA 2VCCA 1JFHA 1GOOA 3WEOA 2J75A 1B2YA 4JL1A 2EXOA 2Y24A 4CU8A 1GHRA 1HJXA 3POCA 1XH1A 4ZE5A 1GUVA 1KXQA 3GBDA 4YHEA 3HU7A 4PUEA 1GQLA 1OD8A 1UD3A 5JIPA 1M04A 4UTFA 2BVYA 3AS1A 4AEEA 1OT2A 1HNYA 2OLHA 1UD6A 1UKOA 3ZJKA 4QAWA 4UZUA 3U57A 3ZIZA 4D6JA 1V0KA 2GJXA 3KEHA 3M46A 3WQ4A 3T08A 3CHEA 1LL7A 3VUPA 1C7SA 1EXPA 8A3HA 1C8XA 2C0HA 3GDBA 1DHKA 3CZKA 1BVNP 1UQZA 4V27A 2OYKA 5A8NA 1Y7VA 5CPTA 1V03A 2ZXQA 1I75A 5I2UA 1JNEA 3OZPA 2Y5EA 5A6BA 4DWSC 1V08A 5D8ZA 1CNVA 4M24A 3DYOA 4J7RA 1FHLA 2C7FA 3SCQA 3FAWA 5A3HA 4CN4A 2VZOA 4WSJA 3SUUA 5A8QA 1QHZA 1E9LA 5IFPA 3PTMA 4PYSA 2WHMA 3ARYA 2XIBA 2ZUTA 1GW1A 2J4GA 2XWDA 3MSDA 2BHUA 4D6CA 2BVTA 2Y8KA 2XPKA 5I5RA 4PMYA 3MANA 3LMYA 1FP9A 1ZBKA 2QMKA 3KE0A 1V6UA 3BCFA 4CGTA 4AZ6A 4V2XA 2J25A 3UR7A 1JYVA 2VZTA 2VQTA 1QW8A 3M6DA 2PWHA 3DECA 3KL3A 3ZM8A 4ML4A 1K6AA 2CBVA 5I3DA 2E0PA 2UY5A 4AD5A 3WH9A 5JIWA 2XSBA 4TXEA 4PMNA 1QHOA 1XRVA 4MDPA 4JFTA 1UOKA 3OLEA 5A69A 1W9UA 3WSUA 1CECA 1W9VA 2FHFA 1HF6A 4QLLA 1GQKA 1XYFA 1OINA 1H4PA 1OWQA 2D1ZA 2VRKA 3AZSA 3BMWA 4AW7A 1FFQA 2EBNA 2QPUA 3IANA 1US3A 2WMHA 1XD0A 1MW1A 4QCEA 1L8NA 4W5ZA 2WM0A 4HA3A 1E6PA 4OUEA 3WQWA 3WH5A 1ISXA 2IXVA 3BLKA 4U2YA 3WUEA 1CBGA 3AMDA 3WBEA 4BQ4A 1WDRA 2XVNA 4URIA 2VVSA 5D9OA 3EDJA 4PRWA 3WY1A 1PX3A 1NWUA 4U33A 4AZBA 4UQCA 1LWHA 4GI6A 1FH7A 3EDEA 3NIYA 3L4WA 2GDUA 4OKDA 2D2OA 2D24A 2DIEA 1U33A 2WANA 2OYLA 4H41A 1P6WA 5CXPA 3IK2A 1VJZA 1HT6A 3A4XA 1NOUA 1BVZA 2PWEA 4W8LA 5C70A 3ARPA 4QDMA 1S46A 3AS3A 3SCOA 5FIPA 3N1AA 1MQPA 2O9PA 5CSYA 4CD7A 5I24A 3VDBA 3WENA 3VGDA 1E4LA 5AYBA 4W5UA 5DF0A 1UKTA 3F5LA 2W91A 3VD4A 2PWDA 4J3SA 2X09A 5BXTA 5DEZA 4HTYA 4R5EA 2VX5A 1KBKA 1BYDA 1WNOA 2WZHA 2O92A 4NRRA 2CERA 1TE1A 2YA2A 2DH3A 2GVYA 1CXIA 3CUGA 5AY7A 2DT3A 2BY2A 3W37A 2WHLA 1QNPA 3GH4A 4Z2KA 1PX4A 2XTKA 3ZT5A 1VEOA 3DHPA 1TUXA 1BLIA 1JF6A 1LLOA 1JG9A 3VGHA 1TMQA 2YLAA 1OGBA 3QHMA 1G1YA 4D6GA 1I1XA 4HZ8A 5CLTA 3J7HA 1JF5A 3ECQA 4HZ7A 5E09A 5HBFA 1UD8A 1OBAA 4CN1A 4KWUA 4AZIA 2PBGA 2V38A 4UQEA 4B9ZA 2PBOA 1JXKA 3W26A 1GONA 2WB5A 3ZOAA 1F4AA 2W5FA 2AMGA 5A95A 1TR1A 4M80A 3UR8A 1RPKA 4C7FA 2UWFA 1JYNA 3WF3A 5E0CA 3MO4A 1E1FA 5A2AA 1LL6A 4D6IA 2JF6A 3WH6A 1FHDA 3EMZA 3CUFA 4PCTA 1MWOA 4B3KA 1KQZA 1FP8A 1UKSA 2OYMA 4P7QA 3OGSA 2EO7A 4H04A 4W8AA 2OWWA 1E56A 1CLVA 5EFDA 2D0GA 1E73M 6CGTA 3NUKA 1ESWA 5GNZA 3WIJA 5F7UA 5BRPA 1E6ZA 4KRUA 2BS9A 4PMQA 2WZIA 4NSBA 1J0YA 1B9ZA 1KCKA 1W1TA 1BHGA 4AYSA 1V3HA 3L2MA 2GJXB 2YLLA 2CCRA 3AIWA 3GNOA 3K4DA 1E55A 5DT7A 1V0NA 1JAKA 3ARSA 2W66A 4UZSA 4HOXA 2YIHA 4LYQA 4Z2HA 1CGTA 2VUYA 4V28A 2V5DA 1Q6GA 4JAWA 4UNIA 2VZVA 1E40A 4P7RA 3GXIA 1EOKA 1HX0A 3VPLA 1E6NA 4Q7NA 3B9EA 2FH8A 1VBRA 4DWSD 2VCAA 1G01A 2BVDA 3BCDA 2AAAA 2ZIDA 4D6EA 3ARRA 1D2KA 3PZOA 2VR4A 1B3ZA 4AMCA 1JDCA 2QHAA 5HDRA 4GKLA 3A3HA 2BHYA 4TX6A 1BG4A 1WDSA 2VMFA 2GDVA 2UY4A 3K8KA 1HJVA 1CXLA 1E0VA 5KZ6A 1DTUA 4MB1A 3M7SA 3A4WA 1MXGA 3NJ3A 4XZBA 2ZUUA 1XV8A 3AQUA 5BXPA 4FLRA 1PAMA 1EQPA 2VOTA 4CD6A 2GJRA 3HN3A 1GOQA 2VC9A 2XWEA 2CITA 3L4ZA 4JFWA 7CGTA 1NOWA 3FW6A 3SCWA 4FMVA 4X0NA 4JHZA 2ZUWA 4H8UA 3WNOA 2NSXA 3VNYA 2XFYA 1B0IA 3WNKA 2DT2A 2VCBA 3GH7A 5D9NA 1IV8A 1LF1A 3A47A 5DO8A 3RM9A 1GOKA 1KWGA 4E2OA 1A47A 3PZIA 2X05A 4BCEA 6A3HA 3QHNA 3NSNA 4TTUA 3AMCA 3RJYA 3OLIA 5D9MA 3TTOA 3THCA 2WCAA 4BQ5A 2VZSA 4CU6A 3OG2A 1GQIA 1UA3A 3W6LA 1GVIA 4HZ6A 3K46A 4ZXLA 1HJWA 3ARUA 4OOZA 2WVUA 2YDRA 2ZX8A 1E43A 3WQ8A 1JNDA 4JCMA 1KWKA 3WDPP 3ZJ8A 4ACZB 1PZ2A 4AZHA 4JFSA 4UR9A 6TAAA 2C8NA 3WUBA 1Z32X 1V3LA 3RCNA 3VVGA 1ISWA 2D22A 1WDPA 4A3YA 5BROA 1OGGA 2WCSA 2XFFA 3PZMA 1DWJM 1J11A 3U7VA 1HKIA 3SCRA 1V3KA 3MUZ1 3W53A 1PEZA 1XSJA 2YL8A 2WVVA 1R85A 1KXHA 1E0XA 1CXFA 2V3FA 2BHZA 4GIAA 2XIIA 1BAGA 1US2A 3BC9A 4WK9A 1E71M 1BYBA 2JEQA 3RPMA 3W6MA 3VMOA 1C3FA 1WDQA 1VEMA 1M01A 4AWEA 3WH8A 1H0IA 3VDAA 1ODZA 4AC1X 4UOJA 4ACYA 1GZJA 2YL9A 3L4YA 1N82A 2XM2A 3GBEA 2XFRA 1UR0A 3VGGA 2IXUA 2WC4A 1UWUA 3CPUA 4HU8A 4EK7A 3RM4A 1GJUA 1VENA 3BAWA 1CZ1A 4CU7A 1BQCA 1E6XM 3VMNA 1C92A 3CGTA 3T09A 4ATLA 2J7BA 2DPEA 4PMXA 1TZ7A 2DEPA 1W2PA 2DT1A 5M5DA 1Q4NX 1E3XA 3L4UA 5A8PA 2PB1A 4PTMA 5EBAA 5EB8A 1WZMA 3CZJA 1HKMA 2CHNA 1SMDA 4OZOA 3W28A 1B1YA 1GHSA 3WF0A 1Q6EA 4JKMA 4P7OA 5IFTA 4MB4A 3ARXA 3VILA 2JIWA 2XGIA 3WD1A 2UY2A 1ZS2A 4XX6A 1CGXA 4CVUA 1UG6A 3OZOA 3VM5A 2OSXA 4HMDA 3CUHA 1W32A 2ESCA 4LX4A 4B16A 1B3XA 1NP0A 3PZNA 1C90A 1V6VA 4MADA 5D8WA 1V0LA 2D3LA 3NSXA 3LPPA 3UG3A 4QLJA 1AMYA 1PJ9A 2XYLA 3AFBA 4Z2IA 3WH7A 3LPOA 3CUJA 4X0VA 3EMQA 1YHTA 3ZO9A 3ZR5A 3ZR6A 1JZ3A 4UQ9A 3GXMA 1W9XA 3OBAA 3D3AA 1UYQA 3WNPA 1V3MA 1E72M 3K8MA 3CZGA 1LWJA 3VIIA 1EGZA 1CXKA 1XH0A 1KFWA 4BQ2A 1XC6A 3ZMRA 4UFMA 2W92A 1GPFA 2E9BA 2J7FA 2VRJA 4MAVA 4W7WA 4AD0A 3UETA 2WMKA 1ECEA 1JZ8A 3OGRA 3CMJA 4HU0A 2D20A 2EPOA 1WP6A 1FH9A 5FL1A 3ZSTA 1KQYA 3PZUA 1ZL1A 1VEPA 1ZBVA 5JBEA 2EEXA 4WJXA 1B3WA 4PTVA 5FOOA 1W1YA 1CGUA 2FDMA 2VRQA 4JL2A 4MNMA 3WF4A 3KL0A 4AD4A 5CLWA 1UR8A 4R27A 1BSIA 1HKKA 2VVNA 2WHKA 3AHYA 1QW9A 3VINA 5KEZA 4B9YA 2YA0A 4H2CA 2VX6A 4RE3A 1VB9A 3SCPA 2A3AA 4OIFA 5A94A 3O6AA 1J18A 1JYWA 4GZJA 3FAXA 2ZXBA 3MMDA 1GOWA 1LL4A 1HJQA 2WYSA 1HJUA 3WNMA 4LYPA 2FH6A 3EDKA 4CN6A 1FOBA 2E8YA 2FGLA 1SR0A 4J3TA 1EQCA 2Z1KA 5EMYA 1VFFA 3VX0A 3N13A 1R8LA 3VMPA 3PZTA 3VDHA 2ZXDA 5A2BA 2XUCA 3A4AA 3L2LA 3VIPA 4MJ4A 3AIRA 1Q6CA 2ZUMA 4C7GA 5CQ1A 1XCXA 1J0KA 2QPSA 2VX4A 2DSUA 4U2ZA 3NCOA 5D9PA 4AZCB 1WE5A 2ZE0A 3MS8A 1NH6A 1C7TA 2PWGA 5M03A 3FN9A 4DUXA 3NDYA 3OLDA 5DT5A 2DIJA 1UH2A 4GZIA 5AC5A 2EPLX 4P8WA 4D6FA 1UWRA 5LA1A 1JZ5A 2XM1A 4XV0A 5A2CA 4RL3A 1V3IA 4PTWA 2XSAA 4JKLA 2QMJA 3VGBA 3WMBA 4UFJA 3ZJ7A 3WELA 1MYRA 1UR2A 2OWCA 1DP0A 4QLKA 1CTNA 2ZWYA 4ZXOA 1GVYA 4FF5A 3PN8A 1D3CA 4P8VA 3VIMA 1W2VA 5CGTA 1RP8A 4UQBA 4P7NA 1IT0A 2J77A 3CZLA 3U5UA 3VNZA 1ZJAA 4HA4A 3DYMA 4N42A 5FD0A 1J0IA 3DC0A 2A3HA 2GK1A 4D1IA 3RDKA 3PZVA 3AOFA 3THDA 3GM8A 3PZQA 4PCSA 1XYZA 2J62A 3K8LA 1JZ4A 3VD3A 3EDFA 4UFLA 2PC8A 4HP5A 2XGBA 4IPNB 3WNNA 4HOWA 4W93A 1UKQA 2J8FA 2WXDM 2BFGA 1W3JA 5D4YA 3WDQA 3WL0A 3ZT6A 3AXHA 2BY0A 3ARTA 2D0HA 4JCLA 4CD5A 3BAKA 4Z2LA 5C71A 1WZKA 2BY3A 2YL6A 5JUVA 1DWHM 3B9DA 2X0HA 1GOMA 1UHVA 5CPQA 4TVUA 5HNNA 4D6DA 3S2CA 5AC4A 3WN6A 3WQVA 3O9NA 3AIQA 2YBTA 4PN2A 4L4PA 2E40A 4QP0A 4C7DA 3VGEA 4FLQA 1QVBA 1VBUA 3F5JA 4CCEA 1Q6FA 3VM7A 1CWYA 2CIPA 3NSMA 1G0CA 4J3XA 1QBAA 3CH9A 5E0FA 1OD0A 1HP5A 1J0JA 3U7BA 2D3NA 2Z1SA 4JKKA 2J8GA 4AXNA 2VX7A 1R87A 4AY1A 4W89A 3AHXA 1ZJBA 3WFZA 3F5KA 3SCUA 1HVQA 1G5AA 3EMCA 4EE9A 4PEEA 1JXJA 1B3VA 4CKQA 1WB0A 3VD9A 3MV11 1NWTA 4YPJA 3RM8A 3TA9A 3W4RA 3PTKA 2JALA 3SCNA 1MVYA 3FY1A 4W87A 1W1PA 4W7VA 4AIOA 4MPKA 1D7FA 1BF2A 4J27A 1LJYA 3VIOA 4W88A 4F9DA 3KZSA 4MB5A 5LYRA 4XUYA 1KGWA 1U30A 3K1DA 1VAHA 3W82A 1LG1A 3SEPA 3WMCA 5GNYA 2WMGA 2XJ7A 3WDIA 1KXTA 5ABFA 5A6SA 4F9JA 1X6NA 4GXPA 2HVMA 3PZ9A 3AS2A 5A6LA 5A6JA 3N12A 4AEFA 3VX1A 1O7AA 2XVKA 3AICA 4IISA 3RJXA 2V3GA 5ABGA 2YL5A 1GQJA 3I3BA 3JUGA 2CETA 2ZWZA 2WWCA 3D5HA 1JD7A 1OCQA 2VTFA 1W1VA 3BLPX 1K9FA 2J7EA 4IUGA 3VIGA 5GPRA 1ZBCA 3WQ5A 1UH4A 2W62A 3ARQA 5DMYA 3BSHA 5JBDA 1UUQA 4YHGA 1M7XA 5CGMA 2WVTA 5IXEA 3IAQA 5E6YA 1EDTA 2BV9A 4MNKA 4EAMA 3PTQA 2EQDA 3TP4A 3SCTA 4P7LA 2BY1A 4J3WA 3WD0A 4E4PA 1QNSA 3BSGA 2YA1A 4D6HA 3AHTA 4KRTA 1LQ0A 1H3GA 4GI8A 4QFUA 1KBBA 3NDZA 3VIHA 5CPSA 5CJ5A 2E4TA 1RH9A 1QI5A 4MNLA 3M07A 1XH2A 4MAZA 1HIZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2GJP A;  4GI9 A;  5A6K A;  2VCC A;  1JFH A;  1GOO A;  3WEO A;  2J75 A;  1B2Y A;  4JL1 A;  2EXO A;  2Y24 A;  4CU8 A;  1GHR A;  1HJX A;  3POC A;  1XH1 A;  4ZE5 A;  1GUV A;  1KXQ A;  3GBD A;  4YHE A;  3HU7 A;  4PUE A;  1GQL A;  1OD8 A;  1UD3 A;  5JIP A;  1M04 A;  4UTF A;  2BVY A;  3AS1 A;  4AEE A;  1OT2 A;  1HNY A;  2OLH A;  1UD6 A;  1UKO A;  3ZJK A;  4QAW A;  4UZU A;  3U57 A;  3ZIZ A;  4D6J A;  1V0K A;  2GJX A;  3KEH A;  3M46 A;  3WQ4 A;  3T08 A;  3CHE A;  1LL7 A;  3VUP A;  1C7S A;  1EXP A;  8A3H A;  1C8X A;  2C0H A;  3GDB A;  1DHK A;  3CZK A;  1BVN P;  1UQZ A;  4V27 A;  2OYK A;  5A8N A;  1Y7V A;  5CPT A;  1V03 A;  2ZXQ A;  1I75 A;  5I2U A;  1JNE A;  3OZP A;  2Y5E A;  5A6B A;  4DWS C;  1V08 A;  5D8Z A;  1CNV A;  4M24 A;  3DYO A;  4J7R A;  1FHL A;  2C7F A;  3SCQ A;  3FAW A;  5A3H A;  4CN4 A;  2VZO A;  4WSJ A;  3SUU A;  5A8Q A;  1QHZ A;  1E9L A;  5IFP A;  3PTM A;  4PYS A;  2WHM A;  3ARY A;  2XIB A;  2ZUT A;  1GW1 A;  2J4G A;  2XWD A;  3MSD A;  2BHU A;  4D6C A;  2BVT A;  2Y8K A;  2XPK A;  5I5R A; 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 1BG4 A;  1WDS A;  2VMF A;  2GDV A;  2UY4 A;  3K8K A;  1HJV A;  1CXL A;  1E0V A;  5KZ6 A;  1DTU A;  4MB1 A;  3M7S A;  3A4W A;  1MXG A;  3NJ3 A;  4XZB A;  2ZUU A;  1XV8 A;  3AQU A;  5BXP A;  4FLR A;  1PAM A;  1EQP A;  2VOT A;  4CD6 A;  2GJR A;  3HN3 A;  1GOQ A;  2VC9 A;  2XWE A;  2CIT A;  3L4Z A;  4JFW A;  7CGT A;  1NOW A;  3FW6 A;  3SCW A;  4FMV A;  4X0N A;  4JHZ A;  2ZUW A;  4H8U A;  3WNO A;  2NSX A;  3VNY A;  2XFY A;  1B0I A;  3WNK A;  2DT2 A;  2VCB A;  3GH7 A;  5D9N A;  1IV8 A;  1LF1 A;  3A47 A;  5DO8 A;  3RM9 A;  1GOK A;  1KWG A;  4E2O A;  1A47 A;  3PZI A;  2X05 A;  4BCE A;  6A3H A;  3QHN A;  3NSN A;  4TTU A;  3AMC A;  3RJY A;  3OLI A;  5D9M A;  3TTO A;  3THC A;  2WCA A;  4BQ5 A;  2VZS A;  4CU6 A;  3OG2 A;  1GQI A;  1UA3 A;  3W6L A;  1GVI A;  4HZ6 A;  3K46 A;  4ZXL A;  1HJW A;  3ARU A;  4OOZ A;  2WVU A;  2YDR A;  2ZX8 A;  1E43 A;  3WQ8 A;  1JND A;  4JCM A;  1KWK A;  3WDP P;  3ZJ8 A;  4ACZ B;  1PZ2 A;  4AZH A;  4JFS A;  4UR9 A;  6TAA A;  2C8N A;  3WUB A;  1Z32 X;  1V3L A;  3RCN A;  3VVG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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