5JBEA

4,6-alpha-glucanotransferase gtfb from lactobacillus reuteri 121 complexed with an isomalto-maltopentasaccharide
Total Genus 309
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
309
sequence length
854
structure length
854
Chain Sequence
MGPGTWENMAFAQDSSAINNIDGYLSYTDWYRPYGTSQDGKTWYKTTAMDWRPLLMYIWPSKDVQAQFIKYFVNNGYENANYGLTKDTVANINKDTNTTVLANMAQNLRYVIEQSIAANKGTSKLANDINSFAATVPELSASSELSLQSMPNYRPDKSGTIDSDQVIFVNNNSKDPRKGNTSYADSNYRLMNRTINNQAGNNNSDNSPELLVGNDIDNSNPVVQAENLNWEYFLLNYGKLMGYNPDGNFDGFRVDAADNIDADVLDQMGQLMNDMYHTKGNPQNANDHLSYNEGYHSGAAQMLNEKGNPQLYMDSGEFYTLENVLGRANNRDNIGNLITNSIVNRQNDTTENEATPNWSFVTNHDQRKNLINRLIIKDHSNIPDIMGSAYKVEYANQAWQEFYADQEKTNKQYAQYNVPAQYAILLSNKDTVPQVYYGDLYNETAQYMQEKSIYYDAITTLMRARKQFVSGGQTMTKLNNNLLASVRYGKGVVDANSNGTDKLSRTSGMAVLVGNDSNMAQQSVAINMGRAHANQQYRNLIDTTENGLTYDADNSENPAILTTDSNGILKVTVKGYSNPYVSGYLGVWVPVISGDQDVTTNASDVVANKEKTFESNAALDSHMIYEDFSLFQPEPTSVENHAYNVIAKNASLFSDLGITDFWMAPAYTPFGRSRYNEGYSMTDRYNLGTTANPTKYGSGEELANTIAALHKAGLKVQEDIVMNQMIGFSGQEAVTVTRTNNRGMQIHVNGQTYANQIYFAYTTGGGNGQETYGGKYLAELQKNYPDLFTTKAISTGVAPDPTVRINKWSAKYQNGTSLQNIGIGLAVKLANGDYAYLNSGDNKAFNTLLPTAIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of 4,6-alpha-Glucanotransferase Supports Diet-Driven Evolution of GH70 Enzymes from alpha-Amylases in Oral Bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inactive glucansucrase
molecule tags Transferase
source organism Lactobacillus reuteri
total genus 309
structure length 854
sequence length 854
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2016-04-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5jbeA02
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 5jbeA03
3ZIZA 4WSKA 5FIPA 3WF4A 4LYPA 4D6DA 5A6AA 2J74A 3LPOA 3SCNA 2CKSA 1TMQA 3PHAA 3OIHA 3MUY1 2Y8VA 2G8ZA 4UZUA 5BXTA 4A3HA 1RPKA 3ARPA 1HJUA 1GPFA 3OLIA 3FHAA 4KWUA 3WMSA 4GIAA 1G9HA 2X0HA 5ABFB 1V02E 4TVDA 4AZ6A 1LL6A 1ODZA 2D3NA 1WZKA 2YDSA 3ZOAA 2YL8A 4W5ZA 3F5LA 1ISXA 2WMJA 5FCZA 2QLYA 2BY2A 3AICA 5A6JA 2WZEA 4CCEA 3QHOA 5ABGA 1BYBA 3WDIA 1BYAA 4ATLA 1UWTA 2XHYA 3ALFA 4LX4A 2W92A 2Z1KA 4UFKA 3RM4A 5C70A 3FY1A 5E9AA 3CBWA 1UQYA 2O9RA 1FP8A 2ZE0A 1K6AA 2J7FA 3PBGA 4JKKA 1W2PA 1B30A 1NWTA 4UQEA 2DSUA 2WMHA 3AZTA 3WQVA 4FF5A 1UR2A 1UYQA 4EK7A 3GXFA 1KXVA 3CZGA 1KQZA 1LF1A 5HPOA 3KE0A 2DT2A 3SUSA 2CBUA 5HDRA 4Q7NA 1BHGA 4E2OA 1Q6CA 4HU0A 3U57A 5A8NA 5I3DA 1E1EA 3WH6A 5HXMA 2O9PA 4AZCA 2BHUA 2VZUA 3AZSA 3WQ8A 4JFTA 3WDHA 1CGTA 3VIHA 1JDDA 1VBRA 4D1JA 4GKLA 3AJ7A 5KEZA 2EBNA 2WNWA 3K8MA 1KBBA 4CU7A 2VR5A 2D3LA 3B9AA 3N18A 2F61A 2WC3A 4D6GA 5CJ5A 3SCUA 3CO4A 3KL3A 2AOSA 1PX3A 3AIQA 1NP2A 5GNZA 5FL1A 3VUPA 3ARQA 3CUFA 2DQXA 4F79A 5A6BD 5ABFA 1JAKA 1QNSA 2VT0A 4WLCA 4H8VA 1BVZA 4HOXA 1A3HA 4MNLA 4OZOA 3WEOA 3VIJA 1JAEA 1XSKA 1VFUA 1WDRA 1E72M 1JI2A 3BCFA 2BHYA 4GZIA 2XSAA 1HX0A 1OBAA 1GW1A 8CGTA 1UKSA 4HP5A 3W25A 1QOXA 2Y24A 1ISYA 5CPTA 3SUVA 1NWRA 2ZXAA 3A4WA 1HJSA 4P8XA 1PEZA 1KGWA 2J62A 1H4PA 4CVUA 4F9JA 4UFIA 1LJYA 1JDCA 2HVMA 5A3HA 3AXIA 2GDUA 1M01A 4PMQA 2BVYA 3UR8A 4H8HA 4IPNB 1WP6A 2G4FA 4P8VA 2WMFA 1GJWA 2XWDA 3FHQA 1H2JA 1OGGA 3KL0A 2PWFA 1J0ZA 3VIOA 2XG9A 4JHOA 1E71M 5M17A 2EO7A 1H0IA 1ZBKA 3CMJA 2ZX8A 1QI5A 5DFAA 3NUKA 2PBGA 4FLOA 3NSNA 1GHRA 1P6WA 2ZICA 1HIZA 4DWSC 2WAGA 1H5VA 2A3CA 3GXIA 2D0FA 4D6IA 2F8QA 1H3GA 3VGEA 1V3LA 1W3JA 2WC7A 3AZRA 1XH2A 3AMDA 1JZ2A 3BLKA 3CGTA 2EPMX 6CGTA 3ZQ9A 2ZUWA 4PSRA 1NOUA 2VRQA 2YA1A 2ZUSA 4BQ4A 4KH2A 2WM0A 3VTRA 5F7UA 1J10A 2VZTA 2JFEX 3AI0A 3ZT6A 1MFUA 3AROA 4XB3A 1UOKA 3VIMA 2D0GA 3AIVA 1XHGA 1EIBA 2WZHA 2A3EA 4DM2A 5C8BB 3BMWA 1I75A 4U2ZA 4GI6A 1JXJA 2VCAA 2E9MA 3SCTA 3B9EA 1CPUA 4OOUA 2DSVA 3WMBA 2XSBA 3PZ9A 1GOKA 4PMUA 4WJXA 2BVDA 2WSPA 1WDQA 1KXTA 3T0AA 5A2CA 2CBJA 1NM9A 5JUVA 1TFVA 1UR0A 4H8UA 4CD8A 2TAAA 1GUVA 1E55A 1F4AA 3CZLA 1J0JA 2PWGA 3WEZA 1V3KA 3WUFA 3WNKA 1JIBA 3ZSSA 4OIFA 2EPKX 4UNIA 1Z32X 3MANA 1GQLA 5I79A 4F66A 2QF8A 1QI0A 1V6XA 1ZJBA 2X2YA 1ZBCA 1CXEA 3W4RA 2WMGA 3AMCA 4JCLA 1XYZA 3WQ5A 1QNOA 1PZ3A 2QMKA 1ZBWA 4JHZA 5D9OA 1ZBVA 3WH7A 1HNYA 3KZSA 1TUXA 2YL6A 4TX6A 5HOSA 1KCLA 1W9PA 4HU8A 2DPEA 1EOMA 5BXPA 3WD3A 1TE1A 1HVQA 3AHYA 3CH9A 2VRJA 2GK1A 5FKYA 1OIMA 4EAMA 1CGXA 4RL3A 3TA9A 3S2CA 4JAWA 3WD1A 2PI6A 2NSXA 4PTWA 5CLTA 1X6NA 2F2HA 3K4AA 1JI1A 2J8FA 4XUYA 1MFVA 2YKKA 3VINA 2NT0A 3OGSA 1KB3A 3GYCA 3AXXA 2CIPA 2J78A 2DIEA 4AMCA 1B3XA 3LPGA 1GOOA 2J7HA 3WELA 4ACZB 1JD7A 3VD9A 3VD5A 5IFTA 1WZAA 2VX5A 4WKHA 4UTFA 3RPMA 4XZWA 3W29A 1G5AA 3WF1A 4HMEA 1LL7A 1CWYA 2CETA 3T2OA 4B9YA 1UA7A 4QLJA 1V08A 4GO8A 3GH5A 1E1FA 5EFDA 1E4MM 1TG7A 4PTVA 3EBVA 2XVLA 4OOZA 3L4ZA 4ATWA 1ITXA 1GZJA 1AVAA 4PCSA 4PUEA 1OB0A 3EDEA 4IUGA 2QPSA 1OGBA 1JZ4A 3U7VA 4EANA 4LGXA 4J3VA 4QDMA 1BPLB 5DT7A 3SCQA 1PX8A 1VFFA 1UWIA 2EPNA 4NI3A 1VFMA 1JZ5A 4UFLA 3WL1A 1ZJAA 3I3BA 2Q8XA 2YLLA 4W86A 4P8WA 5BROA 3WNLA 1DHKA 2VOTA 2OWWA 1XH1A 3T0DA 1XCXA 1LL4A 1UA3A 1B1YA 3ZJKA 2D24A 3N11A 1MW3A 2UWFA 4CGTA 4W87A 1V0LA 1V6VA 1EGZA 1PIGA 2O9TA 5BRPA 1AQHA 1GVYA 5ABHA 1WCGA 4M8UA 3T09A 4TVCA 1GCYA 1E3ZA 1B9ZA 3CHDA 3FNDA 3NSXA 4PTMA 2ZUVA 3WSUA 1E5JA 2V3DA 1CXLA 4DWSB 2PF0A 3U7BA 4AIOA 4GPNA 3KWXA 3OLDA 1UH4A 4UQCA 4ACZA 1W3KA 2VX7A 1UZ1A 5M03A 1FHDA 2J77A 5IDIA 2DH2A 4CN4A 3ECQA 1VEPA 2YJQA 3OLGA 3ARUA 1VAHA 2G3JA 5JIWA 3BAXA 1JYNA 6TAAA 1PBGA 4D72A 3WKZA 1ZU8A 4M24A 2CXGA 4P7NA 1E70M 2IUZA 4W85A 3A6OA 1KXQA 1UKPA 3NIYA 4JFVA 3NDYA 1US2A 3POCA 2J7DA 3ALGA 5AYIA 1M04A 2RGLA 3DHPA 4PMRA 3MU7A 1AQ0A 3TOPA 3UCQA 4GQQA 3WL0A 1XD0A 5CGMA 1HL9A 2UY3A 3GBDA 4UQDA 2V5DA 2CPUA 5LYRA 1H09A 2DGAA 5A95A 1TR1A 3AQUA 1SMDA 3W53A 2Y8KA 4PN2A 3WNMA 5LA2A 1CXHA 2D22A 2BHZA 2G41A 4MNJA 5E6ZA 3CUHA 1XH0A 4M1RA 4D6CA 3PZMA 1OT2A 1C90A 1GOMA 5AY7A 1UHVA 4JFWA 3W82A 2OSXA 4UCFA 4F9DA 1KWKA 2WVSA 4AD0A 3AIWA 4UQ9A 3WN6A 8A3HA 3WNPA 2ZUMA 3A3HA 2E0PA 1KXHA 3MMUA 4HA3A 3GZAA 3M46A 4GZJA 2BXZA 5AC4A 4DM1A 2EEXA 3AS0A 4HPGA 5M3WA 3K8KA 3VVGA 4BQ2A 3RDKA 2JF7A 3GM8A 3B8SA 1H49A 1JYVA 4IISA 1U33A 1ISVA 2A3AA 5KZ6A 4KRUA 1QBAA 4DWSA 2VJXA 5A8QA 1V3MA 3T2PA 1BYCA 3BCDA 1US3A 4GXPA 3WDJA 2BNJA 4AIUA 4K68A 4B15A 2J79A 5I2UA 3S6TA 1FFQA 3CZ8A 1TZ7A 2YDRA 5EFFA 1KGUA 4IM4A 4N42A 3UG5A 2WKLA 1B3YA 4C7FA 5FOOA 1HL8A 1BLIA 1EA9C 1PJ9A 1QHPA 2VI0A 4U31A 1B90A 3BH4A 1CNVA 1C8XA 4UOZA 2EPOA 1VB9A 5D9MA 2ZXQA 1QW9A 3J7HA 1RP9A 2G3NA 3M07A 1VEOA 2PWEA 3MMWA 3VMOA 4ATDA 4BS0A 4X0NA 3VMNA 1FH8A 5I5RA 3WUEA 4B16A 4AC1X 1BF2A 4M80A 2OWCA 4FLRA 1QHOA 4E8DA 4AZGA 3W27A 1NQ6A 2JIWA 1CIUA 3WH8A 2VVSA 2ZUNA 3LPPA 4OJYA 3BAIA 4PEEA 2CBIA 1EHAA 1D2KA 3K4DA 5DF0A 2XJ7A 1E6QM 3FW6A 3VNYA 4TTUA 1N82A 2J7BA 3QGVA 3BAJA 1W1VA 2J7CA 3RMEA 4HMDA 4H7VA 4X0VA 3GDBA 1EDGA 1CLVA 3D5HA 1GOWA 1MQPA 1I1XA 2JEQA 3AIBA 2WVTA 4U2YA 1BG9A 2EJ1A 2CHNA 4PMXA 1FP9A 3CPUA 1HJQA 1HJXA 3L4WA 3ZO9A 1KFWA 2CKRA 1FOBA 1W1PA 3EDFA 1EDQA 2VUYA 2UY2A 2YDQA 4V28A 2CNCA 4R27A 3CZKA 1ITCA 2WANA 3TP4A 1W2VA 2WZIA 4TXEA 3SUWA 3MUZ1 2XUCA 3THDA 3L4XA 2X05A 1MXDA 2NW0A 1JZ8A 2VVNA 4D71A 2CITA 1UQZA 3AHVA 2XVGA 2GVYA 4DWSD 1E9LA 2WVUA 4H41A 4JL1A 1BGGA 1JG9A 4XX6A 4HMCA 1UKOA 3FXYA 4U33A 4W8BA 3KEHA 4A4AA 1OSEA 3GXDA 2D2OA 3WBAA 3WY1A 4Z2KA 1SFSA 4MDOA 7A3HA 4CVWA 5A6LA 2FGLA 3QHNA 5GNYA 1R85A 2YA2A 3UEQA 5M5DA 2UY5A 3SCOA 4W88A 4YN5A 1AQMA 1J12A 1KR1A 1JYXA 3RM9A 4Z2HA 1TCMA 5IXEA 1W1TA 1WPCA 3ZT5A 3ARZA 2VQUA 2XM2A 3W24A 2MANA 2DH3A 1E6XM 3N15A 3PTQA 1UD2A 1WNOA 4JKLA 3O2LA 5AYBA 3NCOA 4MJ2A 1E56A 4NZCA 4AZBA 1CTNA 4JIEA 3KLLA 3HN3A 4L4PA 5GPRA 1GNXA 2OYLA 2C0HA 4ZXLA 5A8OA 2GK1B 3VIPA 1XSJA 3EYPA 1HKIA 1MW0A 1QNPA 2FHCA 2W61A 3WQ6A 4AZ5A 3WEMA 3APGA 4WSJA 2XIBA 1OM0A 4MNKA 1CXKA 5D8WA 1V0NA 2EPLX 5LA0A 3FAXA 3OZOA 2D20A 1MVYA 4XZBA 4MDPA 2PWHA 2BV9A 1RP8A 1NOWA 4PMOA 1HJWA 3TTSA 3WENA 5BWFA 2DDXA 4GI8A 4HZ7A 4MPKA 4E4PA 5D4YA 1JYWA 4E8CA 5CPSA 3N12A 4PMDA 3VDAA 1UWQA 1SR0A 2J7GA 3VD7A 1CLXA 1C93A 3RO8A 1K9EA 1G01A 1HT6A 4PMYA 4M56A 4M82A 5DO8A 3IAPA 3RIKA 2JALA 2WBGA 2XVNA 3AHTA 3SCSA 2YBUA 2JE8A 4HPHA 3VIGA 1HXJA 1R7AA 1EXPA 3AYSA 2GSJA 1HJVA 4CN1A 1FH9A 3L4UA 3MMDA 3ARTA 1CGVA 4H04A 4AWEA 2BVTA 1JD9A 1S46A 2XVPA 1WZMA 5JBEA 3PZQA 1UWUA 2XPKA 1NWUA 3PZOA 2AAAA 2WKGA 3WNNA 1E4IA 3QOKA 3IANA 1QVBA 1CECA 1C8YA 1GQJA 5CXPA 4MNMA 1C7SA 1UH2A 4BCEA 2Y5EA 4LQ1A 2ZX5A 1JL8A 2W4XA 1D7FA 3GTNA 4M81A 3BSHA 1W9DM 4BQ5A 4UOJA 3EDDA 1ODUA 1BAGA 3VPLA 2VZVA 2QV4A 1Q6GA 3F5KA 3AS3A 3WF3A 3CTTA 2GJXB 3RM8A 4W89A 5CLWA 3I3DA 1HKKA 3WQWA 3W6MA 5HPCA 2VMFA 3ARXA 4N0RA 1B0IA 1J0HA 4OUEA 1UUQA 2WLZA 4GO9A 4QCFA 5BXSA 1H11A 3SEPA 1DTUA 4WKFA 2WXDM 4AW7A 3ZT7A 2FDMA 2B31A 2QHAA 2DT3A 1E6PA 3MSDA 4HOWA 1U30A 4P7RA 4P8UA 4WKAA 4AD4A 3VM5A 3WF2A 3CUGA 3WIJA 2BFGA 4CCCA 2DSWA 3POHA 1WE5A 3WD0A 1W1YA 3AHZA 4QAWA 2X0YA 1EHNA 3M7SA 3A4AA 4D6HA 3ARYA 1R8LA 1M7XA 3ZJ8A 1ECEA 1G0CA 2D23A 4W8AA 2GFTA 4PTXA 1B3ZA 1C91A 1J0YA 3QHMA 4W84A 4KGJA 4ML4A 3BXWA 1B3WA 3HZ3A 2FHFA 1J0IA 3CLWA 1BSIA 1DWIM 3VM7A 2WCGA 4M29A 1R86A 4W7VA 4UZSA 1XC6A 4FLQA 2ZUTA 4KRTA 1V6UA 2CBVA 4TVUA 1LWHA 1HN1A 3N04A 3WNOA 2ZXBA 4AD1A 4HZ8A 2VNCA 3T08A 2XIIA 1FA2A 1UWSA 6A3HA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3ZIZ A;  4WSK A;  5FIP A;  3WF4 A;  4LYP A;  4D6D A;  5A6A A;  2J74 A;  3LPO A;  3SCN A;  2CKS A;  1TMQ A;  3PHA A;  3OIH A;  3MUY 1;  2Y8V A;  2G8Z A;  4UZU A;  5BXT A;  4A3H A;  1RPK A;  3ARP A;  1HJU A;  1GPF A;  3OLI A;  3FHA A;  4KWU A;  3WMS A;  4GIA A;  1G9H A;  2X0H A;  5ABF B;  1V02 E;  4TVD A;  4AZ6 A;  1LL6 A;  1ODZ A;  2D3N A;  1WZK A;  2YDS A;  3ZOA A;  2YL8 A;  4W5Z A;  3F5L A;  1ISX A;  2WMJ A;  5FCZ A;  2QLY A;  2BY2 A;  3AIC A;  5A6J A;  2WZE A;  4CCE A;  3QHO A;  5ABG A;  1BYB A;  3WDI A;  1BYA A;  4ATL A;  1UWT A;  2XHY A;  3ALF A;  4LX4 A;  2W92 A;  2Z1K A;  4UFK A;  3RM4 A;  5C70 A;  3FY1 A;  5E9A A;  3CBW A;  1UQY A;  2O9R A;  1FP8 A;  2ZE0 A;  1K6A A;  2J7F A;  3PBG A;  4JKK A;  1W2P A;  1B30 A;  1NWT A;  4UQE A;  2DSU A;  2WMH A;  3AZT A;  3WQV A;  4FF5 A;  1UR2 A;  1UYQ A;  4EK7 A;  3GXF A;  1KXV A;  3CZG A;  1KQZ A;  1LF1 A;  5HPO A;  3KE0 A;  2DT2 A;  3SUS A;  2CBU A;  5HDR A;  4Q7N A;  1BHG A;  4E2O A;  1Q6C A;  4HU0 A;  3U57 A;  5A8N A;  5I3D A;  1E1E A;  3WH6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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