5JBFA

4,6-alpha-glucanotransferase gtfb (d1015n mutant) from lactobacillus reuteri 121 complexed with maltopentaose
Total Genus 306
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
306
sequence length
854
structure length
854
Chain Sequence
MGPGTWENMAFAQDSSAINNIDGYLSYTDWYRPYGTSQDGKTWYKTTAMDWRPLLMYIWPSKDVQAQFIKYFVNNGYENANYGLTKDTVANINKDTNTTVLANMAQNLRYVIEQSIAANKGTSKLANDINSFAATVPELSASSELSLQSMPNYRPDKSGTIDSDQVIFVNNNSKDPRKGNTSYADSNYRLMNRTINNQAGNNNSDNSPELLVGNDIDNSNPVVQAENLNWEYFLLNYGKLMGYNPDGNFDGFRVNAADNIDADVLDQMGQLMNDMYHTKGNPQNANDHLSYNEGYHSGAAQMLNEKGNPQLYMDSGEFYTLENVLGRANNRDNIGNLITNSIVNRQNDTTENEATPNWSFVTNHDQRKNLINRLIIKDHSNIPDIMGSAYKVEYANQAWQEFYADQEKTNKQYAQYNVPAQYAILLSNKDTVPQVYYGDLYNETAQYMQEKSIYYDAITTLMRARKQFVSGGQTMTKLNNNLLASVRYGKGVVDANSNGTDKLSRTSGMAVLVGNDSNMAQQSVAINMGRAHANQQYRNLIDTTENGLTYDADNSENPAILTTDSNGILKVTVKGYSNPYVSGYLGVWVPVISGDQDVTTNASDVVANKEKTFESNAALDSHMIYEDFSLFQPEPTSVENHAYNVIAKNASLFSDLGITDFWMAPAYTPFGRSRYNEGYSMTDRYNLGTTANPTKYGSGEELANTIAALHKAGLKVQEDIVMNQMIGFSGQEAVTVTRTNNRGMQIHVNGQTYANQIYFAYTTGGGNGQETYGGKYLAELQKNYPDLFTTKAISTGVAPDPTVRINKWSAKYQNGTSLQNIGIGLAVKLANGDYAYLNSGDNKAFNTLLPTAIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of 4,6-alpha-Glucanotransferase Supports Diet-Driven Evolution of GH70 Enzymes from alpha-Amylases in Oral Bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inactive glucansucrase
molecule tags Transferase
source organism Lactobacillus reuteri
total genus 306
structure length 854
sequence length 854
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2016-04-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5jbfA02
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 5jbfA03
4JL2A 5DT7A 3WF0A 3WDJA 4W5UA 1BF2A 3CUFA 4AY1A 2VTFA 1WDSA 2VZVA 4W87A 1LQ0A 1H11A 1WP6A 4LX4A 1L0PA 4PCTA 2X8RA 1GONA 1E6QM 1WZLA 4J3SA 3HN3A 1EHAA 3NJ3A 2Y24A 3PHAA 4M81A 1H1NA 4GZEA 1WE5A 3W4RA 1GUVA 3FHAA 3L2LA 3NDYA 3S2CA 2W92A 3IANA 3ZOAA 4EK7A 1O6IA 1JNEA 3UCQA 2BVDA 2TAAA 2ZUVA 3I3DA 1HKIA 2WHJA 1CIUA 5A2CA 4UOZA 4W85A 2O9RA 3CZEA 2OSXA 3NSNA 2DSKA 1J18A 4LGXA 3MMWA 1NQ6A 1PBGA 2V5DA 1UQYA 7CGTA 5BRPA 3PZNA 1XV8A 1UH3A 2XG9A 3QHOA 4M8UA 5JBDA 1C8XA 3UERA 1H4PA 1HL9A 4JHOA 2PWFA 1B3VA 2WKGA 3AICA 4GINA 5LA1A 2D1ZA 1JXJA 1FH8A 3WH7A 1EHNA 3ALGA 3TTOA 1WZAA 4XZWA 1BPLB 4PMDA 3ZJ6A 3K8KA 2QV4A 4NZCA 1V02A 2E40A 4P8VA 2VO5A 1XHGA 1V0MA 3VIPA 1OD0A 3KEHA 2D3NA 1CYGA 5AYIA 1M01A 4HZ7A 3BAIA 3B9DA 5A8NA 1J0JA 3K46A 3VD7A 2ZX8A 2ESCA 1HJVA 2J8GA 4HPGA 5DO8A 4GQRA 5IHRA 2ZXQA 3W38A 3THDA 2QPSA 3HU7A 4KGLA 2CBUA 1MQPA 4UZUA 3RILA 2WVTA 2OWCA 2O9PA 2CPUA 1GPFA 1TG7A 4PUDA 4Q22A 4MAZA 5HNNA 4XX6A 2EBNA 4ATDA 3TP4A 4CVWA 3ZJKA 1VEOA 4ATWA 1EOMA 1M03A 3A4AA 1E4LA 1BFNA 2ZWYA 3SURA 1H41A 4PMXA 3W29A 3ARZA 1E6SM 2GSJA 1QOXA 2Y2WA 2BHZA 4ACZA 1XRVA 4TOQA 3VVGA 3L4ZA 1C8YA 1IZJA 4HOWA 1VEMA 1B31A 4JL1A 4LQ1A 1SMAA 2DSVA 1PZ3A 1ZJAA 3KL3A 4KGJA 5KEZA 1QI3A 5CPQA 5DEZA 4TTGA 1V6WA 1J0IA 4GQQA 3MV11 2XSBA 2GUYA 4Z2JA 3WDRA 5I77A 3K1DA 4GZJA 1OD8A 3IK2A 2CHOA 1HNYA 2VL4A 2IXUA 1AVAA 3NSXA 2CYGA 4H8UA 1V6YA 4X0NA 2J62A 1VIWA 3A4XA 5HPCA 1B3XA 1V3LA 4B3LA 5A6MA 2XGBA 2F61A 2YL8A 4F9DA 3OZPA 4D6FA 5DFAA 2XSAA 3AMDA 3CUHA 3UESA 5E0CA 3AMCA 1NARA 1WDPA 1LG2A 2JF6A 3RDKA 4D6GA 5D8WA 1MFVA 4OBRA 1FH7A 2G3IA 3WN6A 4BQ2A 5FL1A 1X6NA 1CWYA 4GI8A 2EQDA 2J7FA 4QFUA 3W0KA 4ZE4A 4V28A 5AYBA 1HKJA 2WMKA 3HJEA 2FGLA 1FFQA 3BSGA 3PTKA 1ISWA 5JIWA 5I79A 8A3HA 2JALA 4OKDA 1DHKA 1O7AA 3NYDA 1GOWA 4E8CA 1UZ1A 3K8LA 2J7BA 4EKJA 4LXFA 2J74A 2MANA 4JCMA 4PTWA 2WM0A 3A47A 3AHXA 1ITXA 2YA0A 1ZU8A 4PUEA 2BY2A 3K4DA 4P8WA 1JZ3A 3O6AA 5HBFA 3WH5A 3VPLA 4OJYA 4YN5A 4ML4A 4HMCA 1E6XM 4RE2A 3TOPA 3T09A 4AW7A 1ZS2A 1YHTA 4PMQA 3PTMA 2VVSA 4W7VA 4H04A 1GOIA 2ZUNA 2EPMX 4U5KA 2GJXB 4JHZA 3WF3A 3CIVA 1MVYA 3MUIA 4WLCA 3PN8A 3OIHA 1J11A 3T2PA 1VBRA 2XVLA 4UNIA 4AYGA 4FLRA 3CLWA 3WKZA 3EMCA 4JFWA 1ISXA 3TTQA 4MNJA 1XYZA 2EXOA 1K9TA 5IHSA 6CGTA 2NSXA 3PZVA 4HU8A 4GIAA 1V6VA 5DMYA 1GOQA 4M56A 2ZOXA 3VD3A 1E43A 3VINA 4PMOA 2F8QA 3IAQA 1UWUA 3BAJA 1JFHA 2A3AA 4BQ4A 2DDXA 1E9LA 2FGZA 5ECUA 2BNJA 3VIMA 4MNMA 3GYCA 1GZJA 2YLLA 1JNDA 4PEEA 4MJ2A 3ZR5A 4DUVA 2FHCA 3U57A 3NSMA 2PB1A 2UY2A 4N0RA 4AD4A 2PWEA 2WW5A 4IPLA 3PZTA 1E4IA 3BXWA 1EDTA 1EGZA 1MQQA 2DIEA 4AZ5A 1BHGA 3QHNA 3MANA 1DWJM 4JFUA 5A6BD 1E6ZA 3PZUA 2E3ZA 2V3EA 1PX4A 3DYOA 3MSGA 3PZMA 1G1YA 1BG9A 1J9YA 1UQZA 1OB0A 2QMKA 5E70A 3QR3A 3CHDA 4V2XA 5FCZA 2J47A 1FP9A 3UG5A 4NF7A 2V5CA 2O92A 2ZXDA 4H8VA 2W91A 4AZIA 5A69A 1KGXA 3LMYA 5M17A 4DM2A 3M07A 1E5JA 1HP5A 1E3XA 1Q6GA 2ZICA 3BAKA 3AS1A 2OYKA 1B1YA 4M80A 4W7UA 4HA1A 1H0IA 4UCFA 3ZJ8A 2WMHA 5CG0A 1V02E 4M82A 1W9PA 3WD4A 3WBEA 1HXJA 5HXMA 1OWQA 1OT2A 2HVMA 3SEPA 3W28A 3GXDA 1E0VA 1W9XA 3W24A 4OUEA 1LG1A 4AIEA 4H2CA 5BXPA 8CGTA 4AIUA 4UR9A 1B3WA 5HPOA 2WMGA 4UFMA 3N13A 1ZB5A 3W82A 1B90A 4J7RA 3MV01 3W37A 4W7WA 2VT0A 2YL5A 1UR8A 2Z1SA 3SUWA 3TONA 3ZT5A 4BA0A 4B9YA 3THCA 4ACZB 1Q6CA 1PIGA 2QPUA 4D6HA 1DP0A 3BAWA 5CQ1A 4CN4A 4W8LA 3O9NA 3U7BA 2CNCA 4CN6A 5CZKA 3AIQA 2J78A 3OLGA 1UR9A 1FP8A 1WO2A 1MW1A 2EPOA 3DC0A 4UFKA 3WQ4A 5C71A 3VD4A 3UR8A 1E73M 1V6UA 2X1IA 3ZSTA 2GK1A 2D22A 2VUYA 1WDQA 3FAWA 2VRJA 2Z1KA 1Z32X 4Z2HA 1UHVA 2CHNA 1RP8A 2WCAA 4V27A 3CTTA 3PTQA 3W25A 1LL4A 1CXLA 1HVQA 4S3KA 2ZX7A 3FAXA 4CCDA 3SCNA 3VGEA 1PEZA 9CGTA 2ZX5A 2XPKA 5IFTA 4GI6A 2PWHA 1AQMA 3SCTA 1GCYA 1WDRA 2V38A 4PN2A 1BTCA 5I0DA 1R8LA 1QPKA 2CXGA 1B0IA 2GJXA 3HMCA 1WZKA 1KQYA 2DSUA 4UFHA 1ECEA 2Y8VA 3WQVA 3KLLA 3RM8A 4W86A 1UWQA 5CPTA 4UOQA 3MKKA 1UKPA 3EDKA 3SCPA 4PMUA 3HZ3A 3NUKA 1W2PA 1HKKA 2CBVA 2G3JA 2WZIA 1QI0A 2WVSA 5I5RA 4AZHA 1NM9A 2PBOA 2YIHA 3N04A 3PZIA 2FHFA 2AAAA 1JZ2A 1M7XA 1NP0A 3CGTA 2ZXBA 1XD1A 4CD7A 4QLJA 1NOWA 4D6IA 4QDMA 2D0HA 4AD2A 1V3IA 3ARSA 2VJXA 1W3KA 3L4VA 4B15A 3AMGA 2DQXA 5IFPA 1U2YA 2VC9A 4YPJA 1FFRA 1TUXA 4WSKA 3WH6A 5E6ZA 3QGVA 1XSKA 2OWXA 1W3HA 1E4NA 1A3HA 1DWIM 2HISA 3U5UA 1QNSA 3SCSA 5D9MA 1LL7A 1V3HA 2AMGA 3GBDA 3ARYA 3WQ8A 1CNVA 2J79A 2PWGA 4W8AA 3GTNA 2WZEA 1WAWA 1G94A 5FOOA 3D5HA 4U2YA 2DSZA 3WMBA 1GOOA 1H5VA 1SR0A 2WYSA 1GW1A 2DH2A 4HA3A 5M5DA 3NIYA 4OZOA 1JI1A 1NWRA 1HJSA 5I6SA 3WUBA 2WMJA 1HJUA 1EXPA 2ZUUA 1B2YA 3WMCA 4WKFA 4URIA 4ZENA 6TAAA 1UD3A 2X09A 2BXYA 2OYMA 1TVNA 4NI3A 3VIKA 3VM7A 2QLYA 3T08A 1UA3A 2VCBA 2CKSA 3L2MA 4J3UA 5EMYA 1HJWA 2PI6A 3RMEA 1JIBA 1WB0A 1C3FA 5M03A 3SCOA 2GJRA 2PWDA 4LPCA 3W81A 2XM2A 3E1F1 2VR5A 3EYPA 1VENA 1CGWA 3F5KA 5A2BA 4PSPA 2B31A 1C7SA 3UEQA 3AOFA 1W1YA 3VDCA 2E9MA 1US3A 3WD2A 2XFRA 1LWJA 4AYSA 3VDAA 2JEQA 1MWOA 4CU6A 1UD2A 1V6XA 1GHRA 4MNKA 4RL3A 1C7TA 4PMNA 4MNLA 3PZQA 3GBEA 2XVGA 4H7VA 1UA7A 4AXNA 1QVBA 1UG6A 2W5FA 4MB1A 1E5NA 1P6WA 5EFFA 1UD6A 1XD0A 3RO8A 3N11A 2EPNA 4IM4A 3AIBA 2VR4A 4EE9A 1JYVA 5C70A 4JFVA 1IV8A 2YDQA 2J7DA 3FN9A 3WNKA 2EPKX 4AD1A 4TX8A 1DWHM 1J10A 2RGLA 5DF0A 4ACYA 3ZT7A 2W63A 1ZL1A 1GVYA 4HA4A 1W32A 2UY3A 4M24A 2ZUSA 3BMVA 3VTRA 1UWSA 3WF4A 1VFMA 1PIFA 7TAAA 3EDFA 1XC6A 3F5JA 1VB9A 1SYTA 1GQKA 1UR0A 4JIEA 2XGIA 1Q6DA 2CERA 1QNPA 5C8BB 2JEPA 4WIWA 1CGVA 4DWSD 3VGGA 3AIEA 1E70M 4GXPA 1E3ZA 5A1AA 3WNNA 3AXIA 1UOKA 5GQBA 1G01A 3CZGA 4U3AA 3AIWA 1UWTA 3VMOA 2YA2A 2G41A 3OGVA 1R85A 3EDEA 1CXEA 3VGBA 3WF1A 2F2HA 3QHMA 4CU7A 1JYNA 2VCCA 2YL6A 2XIIA 1VRXA 1BLIA 1UWIA 1W1TA 4CD5A 1NP2A 3VDHA 1X1NA 1D3CA 1LF1A 4W93A 2GK1B 2GJPA 1PX3A 4QP0A 2YJQA 3G6MA 1AMYA 2IXVA 5FD0A 1JD7A 1JYWA 4AZBA 1HJXA 3CMGA 2CBIA 1E1EA 3UG4A 4FLQA 3GH5A 4PCSA 2VZOA 2D3LA 1GJWA 1GQLA 4H8HA 3ZSSA 4TTUA 1JXKA 1RP9A 4D6CA 3MUAA 1KQZA 4AC1X 4Z2LA 4U33A 2Y4SA 3AIVA 4MTVA 5LA2A 1UKTA 4GO9A 1G0CA 4U31A 2E0PA 1W1VA 4PTVA 2RGMA 5I2UA 3BGAA 1AQHA 1HL8A 5GNZA 3A3HA 3D3AA 1GORA 5FKYA 1C92A 5A6AA 3ARTA 1TFVA 5BRQA 1X6LA 1B9ZA 5A6BA 3KLKA 1FHLA 2VRQA 1KXTA 1JZ5A 4AZCA 1B30A 2EEXA 2J7HA 4J28A 1HVXA 2XYLA 1XCXA 4OOUA 1W91A 1XYFA 5CGTA 3WUEA 1CXFA 3W6LA 4QLKA 3OLIA 4NRSA 3EBVA 1TMQA 2CCRA 2EPLX 3T0AA 4C7FA 5BXRA 2X0YA 3WNLA 4S3JA 3WFZA 4X9YA 1JZ6A 2XVKA 4F79A 4FMVA 1H09A 4U2ZA 4HMEA 5E0FA 5I24A 3WMSA 2VMFA 5A2AA 3TA9A 3CPUA 1BGGA 1HP4A 1Q4NX 4UFJA 1E72M 5ABFA 1GJUA 1CXKA 2GDUA 3BLKA 1JGIA 2ZX9A 4CCCA 1KGUA 1DWGM 3BAXA 3CHCA 3DYMA 5BXTA 1LJYA 2YKKA 3T0BA 4BCEA 3NCOA 1JDCA 2CBJA 3S6TA 3FXYA 3QOKA 1NOFA 1GNXA 5EBAA 1OINA 4U5IA 1G9HA 1PPIA 4HZ6A 4U3CA 4CD4A 2WC4A 3A6OA 2WBGA 3VMPA 1DEDA 1XCWA 2WWDA 2EO7A 2J7GA 1W9VA 2DT0A 4UQCA 2ZWZA 4MDOA 4F66A 3CHEA 3WQ5A 1EDQA 2J7EA 4HMDA 2VI0A 1EQPA 4LYPA 1C91A 3L4WA 1GVIA 3AZSA 2ZUWA 3POHA 3VNYA 1BVZA 3VD9A 3WL0A 1JAKA 4H41A 1MYRA 5A6KA 4HOZA 2CITA 4AISA 1KWGA 4PYSA 4TVDA 4BQ3A 1F4AA 2BFGA 1E40A 4BS0A 1K9DA 1UD4A 2WHKA 4D6DA 3OBAA 1V0KA 3WBAA 1E6PA 2ZE0A 1BVNP 2WMFA 5LYRA 1MXGA 3DHUA 3U5YA 1J0KA 5CGMA 1KWKA 3A4WA 4GPNA 1TZ7A 1JAEA 4AZ7A 4UQBA 1ISYA 4W8BA 1CGUA 2J75A 1MW2A 4JZ5A 3FNDA 2W66A 2VZTA 4KRUA 1CPUA 4WKAA 1PZ2A 4P7OA 1H0GA 2OWWA 1J01A 3ZT6A 1QNRA 3PZGA 2Y5EA 1UZ4A 1ITCA 3T0DA 1BYDA 2WVVA 4B3KA 1B3ZA 4GO8A 1JI2A 1CZ1A 4P8UA 3UR7A 4ATLA 1E15A 5LA0A 4XB3A 4R5EA 1EO5A 3AIRA 4HOXA 1UKSA 2WCGA 2WWCA 5A94A 4TUFA 3BCDA 4KMQA 3KWXA 5AY7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4JL2 A;  5DT7 A;  3WF0 A;  3WDJ A;  4W5U A;  1BF2 A;  3CUF A;  4AY1 A;  2VTF A;  1WDS A;  2VZV A;  4W87 A;  1LQ0 A;  1H11 A;  1WP6 A;  4LX4 A;  1L0P A;  4PCT A;  2X8R A;  1GON A;  1E6Q M;  1WZL A;  4J3S A;  3HN3 A;  1EHA A;  3NJ3 A;  2Y24 A;  3PHA A;  4M81 A;  1H1N A;  4GZE A;  1WE5 A;  3W4R A;  1GUV A;  3FHA A;  3L2L A;  3NDY A;  3S2C A;  2W92 A;  3IAN A;  3ZOA A;  4EK7 A;  1O6I A;  1JNE A;  3UCQ A;  2BVD A;  2TAA A;  2ZUV A;  3I3D A;  1HKI A;  2WHJ A;  1CIU A;  5A2C A;  4UOZ A;  4W85 A;  2O9R A;  3CZE A;  2OSX A;  3NSN A;  2DSK A;  1J18 A;  4LGX A;  3MMW A;  1NQ6 A;  1PBG A;  2V5D A;  1UQY A;  7CGT A;  5BRP A;  3PZN A;  1XV8 A;  1UH3 A;  2XG9 A;  3QHO A;  4M8U A;  5JBD A;  1C8X A;  3UER A;  1H4P A;  1HL9 A;  4JHO A;  2PWF A;  1B3V A;  2WKG A;  3AIC A;  4GIN A;  5LA1 A;  2D1Z A;  1JXJ A;  1FH8 A;  3WH7 A;  1EHN A;  3ALG A;  3TTO A;  1WZA A;  4XZW A;  1BPL B;  4PMD A;  3ZJ6 A;  3K8K A;  2QV4 A;  4NZC A;  1V02 A;  2E40 A;  4P8V A;  2VO5 A;  1XHG A;  1V0M A;  3VIP A;  1OD0 A;  3KEH A;  2D3N A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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