5KIT | Genus

Total Genus 167

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	167
sequence length	480
structure length	470
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Minimizing CYP2C9 Inhibition of Exposed-Pyridine NAMPT (Nicotinamide Phosphoribosyltransferase) Inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	167
structure length	470
sequence length	480
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2016-06-17

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5kitA02

1OVDA 5DBUA 5HULA 3TJXA 1KM2A 4JTEA 3S42A 1O94A 3LHYA 2CLHA 3MI6A 2ISWA 1TPH1 2P1FA 3C0JA 1LRTA 3W23A 1XDLA 1Q6OA 5D30A 1C9DA 1PV8A 4OU1A 3S1UA 2GJLA 5DXYA 3IIXA 3DFOA 2OMAA 2R94A 4GNJA 5CPNA 3S8HA 4KKXA 3P60A 3W71A 1S5WA 3I7RA 3TC7A 2V2CA 4AWTA 3OHIA 4WX2A 1W37A 1TB3A 2Q3OA 4I7VA 2XN2A 1AG1O 2WJZA 3VE9A 5KSWA 4KWVA 3ATZA 2ISSA 4IX0A 2Q8LA 1Z48A 1TTPA 3RU6A 4UTWC 3W1UA 3L0KA 1JJKA 3S1VA 1PCKA 4Q32A 2Z0IA 3W7CA 5KMYA 2X16A 4ORMA 4O19A 4OE7A 4AWSA 1VCGA 5H91A 2YXGA 2WO5A 5HWJA 3NL2A 3A24A 2VFHA 3LV5A 2Z2UA 1ME7A 2GQ9A 1H60A 1QPQA 4GUFA 4K38A 4YL2A 1W56A 5AFDA 3P74A 4JTTA 1GVQA 1H61A 1BWLA 5CZTA 4MKNA 1RR2A 5F4XA 1FDYA 3GAKA 3CT7A 2V81A 5F2LA 1QO5A 3UY7A 2VFDA 3H55A 4UMBA 5LGZA 4LVAA 1ZENA 4N02A 2DZPA 2QCEA 3M44A 1FBAA 2B7NA 2QJIA 2C13A 1VHCA 1VQTA 2Q3RA 4CCCA 3T40A 5AC7A 1KTNA 1GT8A 2VEMA 3R2GA 1QO2A 5HUPA 1GTHA 4RJEA 4IXXA 3W87A 2D73A 4RCXA 4IX2A 1G69A 2YW3A 2RKXA 1MO0A 4O18A 4N6FA 5FEXA 3P8IA 3FA5A 1WBJA 1OFEA 4UTHA 3CLMA 1I8JA 4KFOA 5D32A 5DELA 1K02A 2J88A 3TQ0A 1TPUA 2Q8ZA 4JS3A 1SZFA 3S6DA 5D37A 1Z44A 2GVLA 5C54A 3LXBA 4NNAA 4JXCA 2E09A 3LI1A 1TQXA 3UWQA 3UWZA 3GXPA 3LXAA 3GX9A 4NX0A 3W84A 4BWLC 3M5ZA 1NFBA 2RDTA 3W7JA 2H8ZA 3GAYA 1DOSA 4WY0B 4E0CA 3KRUA 3NL6A 3TSMA 5F1UA 3DHFA 3F4NA 2FPVA 2A1YA 4N6EA 2ZZ2A 4WXZA 4Q33A 4UFHA 4WZHA 3SECA 1LYXA 1TPVA 3NL5A 2ATSA 2TPSA 3E9AA 4OWGA 3CWOX 2YYUA 2I1OA 4N9EA 3W1MA 4NZJA 4XTDA 4NVTA 1SUXA 3TAOA 4M7TA 5C6MA 3MP4A 2GVJA 5KINA 2BLEA 5AYZA 2YPIA 3PY2A 3T55A 2RFGA 1TIMA 4FIQA 1QWGA 3IEBA 2AQWA 4LOCA 1TTIA 5AHEA 4I7UA 3C4UA 4Q4KA 3M41A 4AH7A 5G5IA 4Y9AA 3TC6A 3U8GA 2FQIA 4I7WA 2ZZ3A 1EEPA 3P5YA 1ME9A 3OA3A 4NJGA 1KM6A 4BFAA 2DZTA 3SSJA 3HPXA 2ZRYA 2KZHA 3CB8A 1HG3A 3RNDA 4Z0JA 1A53A 1MEHA 1TV5A 2Y88A 1BTMA 3LGEA 4IPJA 3UPBA 4GWEA 3W3OA 1A5CA 1W5NA 5L9FA 3W7LA 1XUZA 3MP3A 5FI8A 1G4TA 1BWKA 5H2ZA 4TIMA 3OEXA 3GVGA 2QJGA 1GVFA 3W7HA 1A5SA 1DORA 2BZNA 1SSGA 1KV8A 3SZ8A 3F03K 1THFD 3L67A 4X22A 1OYAA 2FLIA 1M5WA 3NQ6A 2NX3A 1W5PA 3UPWA 4HSNA 3PBVA 1OYBA 1W5QA 2NX1A 1XUUA 4QAIA 2QCHA 5D03A 4K7YA 1R46A 4XKYA 3EX3A 5AYXA 3RLUA 3TFXA 2TRSA 2Y7GA 3IGSA 4EF9A 3G1DA 1VS1A 4UFIA 4JTFA 4NX5A 3BO9A 3L0GA 4JGDA 1P0NA 3NDOA 2QDGA 3FJ6A 3NPVA 3P82A 5I3KA 3P7YA 3VNDA 2ZDRA 2J9ZA 4HNTA 4YCPA 4A3UA 4B5NA 3LDVA 3FYPA 3TK7A 1ZNNA 3TH6A 1T0OA 5LHFA 5BMWA 1SFLA 4EOUA 3TMLA 4N2YA 1XBYA 3DI1A 1LDCA 4BF9A 2QCLA 1SO4A 4MY9A 3STFA 3DI0A 3GDKA 3M7WA 4PL1A 1TPFA 3LHZA 4O50A 2E6YA 4Y8FA 3EXTA 2IQTA 4JTLA 4MY8A 2YR1A 3GR7A 3DKLA 4DBEA 2HS8A 1TRIA 1F6KA 2PRMA 3KRSA 3IVSA 4S2BA 2C3ZA 1K7XA 4AB4A 2H3DA 5FEZA 4JTIA 3NQ2A 3G8EA 3PBUA 3WK1A 3M16A 2B4GA 3GXNA 3KVMA 2VFFA 4LVDA 1ZY9A 1W3IA 3EWYA 3G0SA 3P84A 1DVJA 3QQ1A 4WOZA 3P62A 4DO5A 3TX9A 1OYCA 2WOQA 1PS9A 4JDBA 1YTDA 3QF0A 2V5BA 3EWBX 5FEPA 4AAJA 1F5ZA 1L6SA 4JYFA 2EHHA 1GWJA 3M5XA 2DZWA 3PS7A 4CQ8A 4E2DA 3SR7A 5DCBA 3QM3A 1MZHA 3QMSA 1QDSA 3SFKA 2J6XA 1I2OA 2O7QA 3AO0A 4MYXA 2VFEA 2NZLA 8TIMA 4WY0A 5HINA 1I45A 3HPSA 3NGJA 1O4UA 4MLJA 4GUJA 3MBDA 1K8XA 1K3UA 3IV3A 4RXGA 1AL7A 4ZQCA 4ZQPA 5K9XA 4D2JA 1W31A 3TUUA 3CTLA 3LXCA 5LNSA 1KM4A 4NNCA 4A29A 5F4SA 2QUVA 3T7VA 4O8RA 4N4QA 1OFOA 3E12A 5CSRA 4MZYA 3ZFHA 3NQCA 3W72A 3LHVA 3ATYA 1RQHA 3NQVA 1OFBA 1HO1A 4DO4A 2QCDB 3QMTA 4A21A 5AC6A 3IVTA 2JK2A 4U4MA 3S5OA 3DENA 1HO4A 4M6QA 4BI7A 4PA8A 1OX4A 4GUGA 5K9DA 1IXPA 1SSDA 3LCHA 2C1HA 2V82A 3IIZA 1TJRA 4O1DA 2E5BA 3LERA 1G4EA 4FNQA 1PCWA 5DCEA 4A2RA 5I3GA 3DAQA 5TQLA 3Q94A 3OG3A 3SJ3A 2WSQA 1KLYA 3GNNA 4AHQA 2FJKA 3GR8A 1K8ZA 3G1HA 4Z1BA 1QPRA 3KRZA 3B0VC 3N9RA 5BRBA 3LI0A 1F05A 3LCXA 1D9EA 4BK9A 1JRBA 1KW1A 1G4PA 2ZZ1A 1I2RA 1ZFJA 2YFOA 1X8FA 2WNQA 4JN6A 4JTJA 2CFFA 3O1NA 3UD6A 4FO4A 3C3NA 3MHFA 4CCEA 4UXDA 3DFNA 4O0KA 3FEMA 1QOPA 1I2PA 5FF4A 1SO6A 3R89A 3W7NA 3TXVA 1JUEA 3WJYA 4MPQA 3PVFA 3W1QA 2NWSA 4R53A 4P61A 1H7OA 5EYWA 3ABSA 5EL1A 1FWWA 3W7PA 2BSLA 2H90A 1XI3A 2E5CA 4EVZA 3TKFA 3NQFA 4UIOA 1ONRA 4Z1AA 3PBWA 4NQ1A 4CNNA 2CLKA 3RK8A 2HTMA 3P81A 5IBXC 1R2TA 1VR6A 1ICQA 1LBLA 4RR4A 4R33A 1TV7A 4RKAA 4ZVJA 2ZTJA 5BNKA 3TQKA 4AWUA 3NQGA 4TMBA 3GB6A 1N55A 3G1SA 4R34A 4LS0A 3FLUA 5FF3A 4GUHA 3PF3A 1K03A 1CX9A 3L5MA 1GVRA 4XBSA 5D02A 2CLOA 1LBMA 1A5BA 2WV8A 2FFCA 4IQLA 1TPWA 1B4EA 2ZA2A 3PUDA 4FXSA 3G1XA 1KTCA 4JICA 2V5LA 1VJIA 3W7DA 1R47A 4Z1CA 6TIMA 4RZ4A 3TV8A 5D04C 3NEVA 3VFLA 3W2LA 3T44A 3C52A 4JDYA 1MSSA 3TFCA 2GJNA 2ZRWA 1XBZA 1LOSA 3SIZA 5AHNA 1YADA 3TW6A 1YYAA 4AXKA 4ORIA 4UFJA 2H8XA 4O11A 1RV8A 3UWYA 1LCOA 5CKSA 4O1AA 1TJPA 1O95A 1ZCOA 3W7OA 5HUOA 4S1FA 2H3BA 3O6CA 1Z41A 1H62A 3T4CA 4NXSA 1LLZA 2Y70A 1SW7A 1IF2A 1YPFA 3IIVA 5D2XA 1VCVA 2BX7A 4O17A 3GDLA 3NQMA 4IMCA 2Y89A 3HG3A 2CLIA 4UR8A 3TNOA 2B7OA 3I65A 2UV8G 2ZRUA 5DY3A 3G8RA 3TDFA 1B4KA 1CW2A 3MW7A 4O12A 3RFAA 1ZJIA 4X9SA 3LRMA 3DU0A 4IJBA 4RK8A 3FKRA 3W7MA 4FNSA 2TSYA 4S2CA 5DXXA 1KFLA 2O7SA 4LNYA 3N34A 1UASA 1LORA 4GE8A 1GG0A 2CLEA 2Z6IA 4LT9A 2BXVA 3LBMA 4ZQMA 4JIPA 3KXQA 4O13A 3NQ8A 3EX1A 4MYAA 3N3MA 4ZQRA 3E02A 3P61A 3TXZA 3WJWA 1FXPA 3NOEA 3CPRA 3QH2A 1I4NA 4L4MA 1Q3NA 3OVPA 1LLWA 1SZNA 3EWXA 2Z1BA 3LM7A 1RD5A 1F2JA 2V9DA 4FX6M 3G3MA 2F84A 5FEWA 3LV6A 5E0KA 4JEQA 4O1BA 3DBPA 2RHGA 3KHJA 4K7VA 3TR2A 4Y6GA 1VRDA 5K9CA 1GYNA 5IM51 3LLDA 3DZ1A 2A21A 3UXDA 3BLFA 3I68A 4XUGA 4Y90A 1XL9A 1DQWA 4YLWA 1PIIA 1W5OA 4DEFA 5I3JA 1N8FA 3OVRA 4HKPA 4IGHA 4MY1A 5HWMA 3LCIA 4XWUA 2GPTA 3VKJA 3RLVA 1G7UA 3M1ZA 1SR9A 3IGUA 4O10A 3O63A 2G95A 1W1ZA 2XN0A 1OFRA 3EKZA 5LHEA 4QQ3A 4FX8A 2F7FA 5D09A 4CLMA 2JKEA 4QITA 1QMLA 2DP3A 3Q2DA 3L5LA 1QOQA 1JULA 3B8DA 1UUOA 5EY5A 5FESA 3IIOA 4FNPA 3ZR4A 1KFEA 3GDRA 3FOKA 3ANYA 1EUAA 1YLVA 4FF7A 2B7PA 1EUNA 1VLWA 3GXTA 1SZEA 2C15A 2QDHA 5EA9A 1IXNA 3HOJA 4MVAA 3NPUA 3GK0A 4OHQA 3SW6A 4N9DA 1OK4A 1A5AA 1R2SA 2OT0A 3LHTA 2ZCGA 3QFEA 1JVNA 1DKWA 2JKAA 4A22A 2J9XA 3CEUA 2C18A 3EXSA 2DZVA 1OFQA 3L65A 5DN1A 4GRSA 4ALDA 2NXHA 2CW6A 3BG5A 4UMAA 4WJEA 5F2MA 1KFJA 1K7FA 3B0PA 3DGRA 2ZRVA 4LY8A 3HO8A 2ZA3A 2HMCA 1E51A 2QF7A 4IMDA 1X1ZA 1W8SA 3CQ0A 1YTEA 3HG5A 3FKKA 2Y7EA 3BW3A 3IGXA 5AOUA 4IUOA 4UFKA 3PB0A 1ZHAA 4C1LA 4DF1A 2YDAA 2X1RA 3WJSA 3PUOA 2E6FA 3LX9A 1TPB1 1SZGA 3STGA 5D33A 5AHFA 4FNTA 3MP5A 1FX6A 1JCJA 3TU9A 1LRQA 4LRTA 2CZFA 3DHDA 4BR1A 1WXJA 3TW7A 2G5WA 2ZFAA 1FUYA 1OF8A 3CIWA 2DZSA 1R2RA 2NLIA 1IIHA 4IMEA 4UTUA 3QZEA 4DPPA 2QJHA 1UUMA 3VCRA 5EBUA 3DFPA 2X1SA 3TAKA 2PRHA 4O53A 1OX6A 2H6RA 4UFLA 4QIUA 3TA6A 3W7GA 5ABTA 3NG3A 1NAL1 1W5MA 2C6QA 3BLIA 4JX6A 2DJLA 3ZWTA 1EWEA 4QM1A 5TIMA 3Q58A 4PEKA 3V75A 4JYEA 2YCEA 4XBKA 2QAPA 3STEA 4NXKA 3QJAA 3BARA 5U4NA 2VEIA 4CCDA 5LNWA 2RDWA 5CZJA 1NSJA 4YXGA 3BGGA 3EXRA 5E1QA 5K4ZA 4FNUA 4H6KA 1YXDA 3EWZA 3LHUA 5GVJA 1KBJA 3QMRA 3LRKA 3N2XA 1A50A 4HPXA 3FYOA 1JCMP 4H3DA 3CM4A 1JUKA 4Z0SA 1W3TA 5A5WA 3Q37A 1LBFA 4JD4A 3T78A 1S5VA 1AMKA 4DF0A 4ADTA 3CIXA 1UJPA 2V30A 4LW7A 3B04A 5A8GA 3WJXA 2CLMA 4MOZA 4KFPA 5D2VA 1YDNA 3H54A 1KFKA 2RDUA 5KITA 4ZQNA 4UUIA 3P80A 1GTEA 1J2WA 1MXSA 1OFDA 4WUIA 2VENA 5T26A 1ALDA 2FB2A 5K3VA 3OVQA 5D2WA 3DFQA 4UTTA 1NF0A 1VYPX 1M7OA 4N4PA 1ZALA 3V1PA 5F2IA 3G3DA 3HG2A 4M5PA 3W7RA 1MEWA 4RZ6A 1Q6QA 5DBTA 2TYSA 2AAMA 1JR1A 4RX0A 1IXQA 4QISA 1OABA 2EAWA 1AW2A 2DU2A 3JS3A 3H53A 3HGOA 2DZUA 3GDTA 1P1XA 3PSWA 1F73A 4TU1A 3JR2A 3LTSA 4M6VA 3M43A 3SGUA 3QW3A 3W73A 2YZRA 1FCQA 4JTKA 2WNZA 1U83A 3GZ3A 3LCWA 4K6AA 2Y7DA 5BOOA 3HPZA 4UNKA 3LLFA 4Z08A 4O4VA 4ZQOA 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3SI9A 5KTLA 4UTKA 5FF0A 4ML9A 4DBDA 4K8EA 1GYLA 2PC4A 4P2VA 3BGJA 4YCOA 4QNWA 1SO3A 4NJJA 4N9BA 1B57A 2GQ8A 3G22A 4MJMA 2RH9A 2GQAA 3RF9A 1QPOA 4AEOA 3BW4A 2V2DA 3G1FA 3P5ZA 1DBTA 4WD0A 2Y85A 3W2KA 1BKSA 2V2HA 5HQEA 3O06A 3UYCA 4O16A 3TROA 3MYPA 4C1KA 3PB2A 1LOQA 4HN4A 2P10A 1NF7A 1TSIA 5G2WA 2VEKA 3O07A 1ADOA 1F74A 2ABBA 1W54A 3L68A 3P8JA 4UC5A 2VXNA 4A2SA 5D2TA 3W70A 2JBMA 5CZ0A 3GYEA 2ZBTA 4NJIA 2NXIA 3MHUA 5TBOA 3A5VA 2EF9A 1EP3A 4G1KA 1RQBA 2ZQ0A 5F1VA 5I3IA 4LVFA 4FEZA 4NJKA 3HGSA 4AHOA 3W9ZA 1K8YA 1VHNA 5LNUA 1ICPA 1XBXA 3KX6A 3EKLA 3L2IA 4JNMA 1FCUA 4K39A 2WSYA 2R14A 1EPXA 1TCDA 4K37A 4M7SA 4JX4A 3G0UA 1V5XA 2FPYA 3KVLA 2YW4A 1TPDA 3A22A 3TJLA 4NZFA 1OX5A 5U7SA 2J9YA 3PAJA 1WYIA 5HNRA 4IWWA 2Y61A 3N19B 3NZRA 4DF2A 1QR7A 1JCXA 1K7EA 4OT7A 4RZ5A 1LZOA 2Y6ZA 4IPIA 3GDMA 2QR6A 3W6YA 1M7PA 1H7XA 1FCVA 5DCDA 5CPLA 2FPTA 3W1TA 4HHPA 2HSAA 4AF0B 1P4CA 1ML1A 1UCWA 3A5FA 3N9SA 3BV4A 2BTMA 2CU0A 3O05A 1OK6A 3THQA 3INPA 4O28A 2ATMA 4JTGA 1Q45A 2QKFA 4NNBA 5G4WA 4UTWA 4XKYB 4ZZ9A 1I2NA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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