5KSWA

Dhodb-i74d mutant
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
306
structure length
306
Chain Sequence
NRLSVKLPGLDLKNPIIPASGCFGFGEEYAKYYDLNKLGSIMVKATTLHPRFGNPTPRVAETASGMLNADGLQNPGLEVIMAEKLPWLNENFPDLPIIANVAGSEEDDYVAVCAKIGDAPNVKVIELNISCPNVKHGGQAFGTDPDVAAALVKACKAVSKVPLYVKLSPNVTDIVPIAKAVEAAGADGLTMINTLMGVRFDLKTRKPVLANITGGLSGPAIKPVALKLIHQVAQVVDIPIIGMGGVESAQDVLEMYMAGASAVAVGTANFADPFVCPKIIEKLPEVMDQYGIDSLENLIQEVKNSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Isoleucine 74 Plays a Key Role in Controlling Electron Transfer Between Lactococcus lactis Dihydroorotate Dehydrogenase 1B Subunits
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lactococcus lactis
total genus 97
structure length 306
sequence length 306
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 1.3.1.14: Dihydroorotate dehydrogenase (NAD(+)).
pdb deposition date 2016-07-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5kswA00
2A85A 3P62A 4ADSA 1AMKA 4PA8A 2QAPA 2GJNA 3DFPA 3U2OA 4MVAA 4LS2A 2YFOA 3UD6A 5LZLA 4FEZA 3CWNA 3GXNA 3W7PA 1ZHAA 2BZNA 5DCEA 1TTJA 3MBFA 5KZEA 1XBYA 8TIMA 4A2SA 4RK8A 3WK2A 5G2IA 1DHPA 3IVUA 3TMQA 3ZS4A 1VHCA 4MLJA 3L2IA 4FHAA 4K36A 3PBYA 3HG4A 4X2RA 1JCYA 3I7QA 4K38A 1OHLA 1W3IA 5IBXA 3TCEA 3S5NA 4LTSA 5AB3A 4M5PA 4BWLC 4N6EA 3NPUA 2GUUA 3AJXA 3TC7A 4Z1CA 3W1LA 4HKPA 5FEZA 3LHUA 4ZMGA 1FWWA 4DO4A 3QPZA 4O0KA 2HS6A 3S1VA 1F05A 1GQNA 1LLWA 3W6YA 1SU5A 4K7VA 3P7YA 4DBDA 5CSSA 1T96A 4WJEA 4GJ1A 3W1NA 3GDTA 1L9WA 3LERA 1A53A 3TSBA 2IQTA 2YYTA 1VQTA 4UCGA 5DN1A 1G67A 3O07A 2GQ8A 1QAPA 4O12A 3EWYA 3DHDA 4DPPA 5HQEA 2G97A 1KFLA 1TQJA 5DXYA 1E51A 1F6KA 2A1YA 2GQAA 4Y90A 4TO8A 2WV8A 4NX5A 4S2BA 2FPTA 3EX4A 4IOTA 4CCEA 1WOAA 4JN6A 5KITA 3NL6A 2JK2A 4JR5A 4C1KA 3B8DA 2J24A 3PBUA 4JGDA 1JVNA 4ORIA 3I65A 4QIUA 2W0UA 3TIMA 3KOFA 1TV8A 2UV8G 1KM1A 3SW6A 2Y85A 4JX6A 1DQXA 1SFLA 3O15A 5I3HA 4I7WA 1QPRA 4PODA 2C13A 5FESA 1TPC1 2J9ZA 5LNWA 2XFWA 2RDTA 2ZTKA 5HUPA 1QOPA 2I1OA 4NXSA 3TV8A 5FEWA 1W5NA 2H8ZA 3FKKA 1TREA 4GE8A 2ZZ6A 4UUIA 5LHEA 3NO5A 4O19A 3FIGA 1KM6A 4BK9A 1IXQA 1RVGA 4WY0A 5CPLA 3JS3A 4LVDA 1EP3A 1H61A 1XFBA 3BO9A 3W23A 4IJBA 1VS1A 4JTFA 4NJHA 2NLIA 1JCXA 1ME8A 3A24A 4R34A 4BI6A 5DCDA 2P1FA 2C6QA 4O1CA 3BLFA 2CLOA 3ATYA 4M19A 2QCDB 1OX4B 1N8FA 2VFIA 4UMBA 5AOUA 4FXSA 3W7KA 3IIVA 2DORA 3W7LA 3P80A 1HG3A 1NAL1 3P84A 4E2DA 4X9SA 5HJLA 3IEBA 4IQLA 5U4NA 3S6DA 1KFBA 1KW1A 5DY2A 2QJHA 4O0ZA 2Y7EA 2E68A 3EX1A 3FLUA 2Y7GA 1YTEA 1LDCA 2TMDA 3LV5A 5F2MA 1I2PA 2A7PA 4Q33A 5AYYA 1A5SA 5HWMA 1JQXA 1K7FA 2ZZ1A 3DH7A 3HB9A 2WSRA 2HMCA 4L4LA 4FXRA 1O5XA 5BMXA 1TRIA 1XCFA 5LGZA 3QPYA 1G4TA 3W2KA 3W1AA 3QMTA 3S42A 3KHJA 5D02A 3PAJA 3LRLA 5DLCA 2DZXA 4FNRA 1H5YA 1H51A 2V8ZA 4YL2A 3EX3A 1SO4A 2J6XA 1OFRA 3R2GA 3OBKA 1G4PA 2EGZA 5CZJA 1JCLA 1H60A 3G1XA 5D2XA 5AHNA 4EF9A 3BG5A 3G1YA 3QRHA 2NV1A 3V75A 2V5LA 2EF9A 3MP4A 2Y63A 3SIZA 2V9DA 5AC7A 1G7VA 2Z6JA 4TIMA 3EWBX 1Q3NA 3NQGA 2Z0IA 4DXVA 1WYIA 3G8EA 4LV9A 4M6VA 4R7JA 3TDFA 3MBDA 1TSIA 1DJNA 3CIXA 2XN2A 1OVDA 5K7JA 3L0GA 3MHGA 3LTSA 3LM7A 3HOJA 2DZPA 1SW7A 2ABAA 4AHQA 2QKFA 3NL5A 3DAQA 1TIMA 4LS0A 3A21A 2QF7A 5K9CA 4MIMA 1TPUA 4KFOA 1ZAIA 3E12A 5CPMA 3W70A 5HWNA 3PVFA 1IIGA 3RFAA 3UWVA 3TC6A 1JCNA 3GNDA 1K8YA 3P5ZA 1WOBA 2YX0A 2RKXA 4ICNA 4GUFA 2QUTA 3G1DA 3H54A 2QCLA 3LCFA 2FTPA 1MEHA 4OBTA 3TA6A 5D04C 5U7SA 3JRKA 4AH7A 5LHFA 5E0KA 3GDRA 2ZA2A 4X3ZA 1JCMP 3W3OA 1AW5A 4O1BA 2X1UA 3LCHA 3TSMA 2E6DA 5AFDA 4UFJA 4UC5A 4DQWA 4WXYA 3S5OA 3N2XA 1PCWA 1MEIA 4W9TA 3PC0A 3TQVA 1HO1A 3NQCA 5D30A 2Z1BA 4QNEA 4FNSA 1SR9A 3C2FA 4CQ8A 5T26A 3MWAA 2QJIA 2OX1A 4HSOA 3BG3A 4UR7A 3CM4A 4Z08A 2VOMA 1IF2A 1RQHA 3QC3A 3HIJA 5D2VA 1WX0A 2V0TA 1GVQA 5EYWA 4O53A 2V2DA 2QCGA 2RHGA 1KM0A 1U5JA 3NOEA 3T55A 1J5TA 1O95A 2BX7A 3A22A 2BLEA 2JGYA 3C4UA 3W75A 2DP3A 3DU0A 1ICPA 1DV7A 1V7YA 3M5ZA 3DFOA 4UTTC 2VENA 3G3MA 4NT0A 2C1HA 3N9RA 3NYZA 1VLWA 1WQ5A 1T0OA 1XM3A 2EKCA 3EWXA 3G0XA 3QF0A 3WK0A 4JTKA 3C0JA 4K39A 3OEXA 1Q45A 1WV2A 3RNDA 3THQA 4XTIA 3B0UX 4BR1A 3CEPA 1EX5A 5D38A 3R5EA 3PUDA 3W86A 1ONRA 5D2YA 3IGXA 2YR1A 3W7MA 1VYRA 1W1ZA 2W6RA 4G1KA 3U8GA 1IGSA 3W88A 3NVTA 3LXBA 3HGJA 1Y0EA 2A7NA 3FJLA 3DFQA 3RLVA 1FX6A 2PE4A 1EWDA 1VC4A 2ISVA 5HR7A 2ALDA 2OZ0A 4ZVJA 2A21A 1YPIA 2NX1A 1VLIA 4AWTA 1EIXA 4NUWA 4ORMA 2WO5A 3C56A 3W7DA 3CB8A 4DF2A 1H50A 2H3DA 2TSYA 3PULA 3FS2A 1IXOA 4Q32A 5F4XA 4LWWA 3KVLA 1Q6QA 4AF0B 1LCOA 4U28A 1B57A 1ME7A 2EAWA 4A3UA 3C61A 2WNZA 4DF0A 2VEPA 1YLVA 4JEQA 2VFDA 4QM1A 1PCKA 3RLUA 1OF6A 1ZCOA 1O60A 1W31A 4HSNA 4XKYA 1N7KA 3I6RA 5CZ0A 4NU7A 1FDZA 2QUVA 3C8FA 1EUNA 1S3HA 4UFIA 2Z2UA 1VPXA 2DZVA 4MJZA 5IM51 4BWLA 2AGKA 2J27A 2ISSA 3C2VA 3NZRA 5K3VA 1VYPX 2A7RA 3HQ1A 2VFEA 2CLHA 4JTUA 3W83A 2AQWA 4LUJA 2EPHA 5I3FA 1QPOA 3TW6A 4N4QA 2WSQA 1FCUA 3PUEA 1PVNA 1GPWA 3MO7A 1TJRA 2E5CA 3C2EA 1LBLA 2HSAA 1BTMA 1KFKA 3GAKA 5K4ZA 4YWIA 3EWZA 3M5VA 5DY3A 1O4UA 1RD5A 3RK8A 3GKFA 2WQPA 4FO4A 4EVZA 3P5YA 4MYAA 1SO6A 1GVFA 4UTUA 5SWUA 3NEVA 4JTIA 3KVKA 3CQ0A 1JJKA 3UY8A 4FNTA 5D05A 5HWJA 4CCCA 2V2CA 3ABOA 1OYCA 3VNDA 1DOSA 1UCWA 4NZJA 1K7XA 4GFSA 1D9EA 2Y6ZA 3LRMA 4HNUA 1WAUA 3M5XA 1LM1A 1GTEA 1JR1A 1RQBA 3R12A 3W87A 3FEMA 3QYQA 1XUZA 3O6YX 4JIPA 4N4PA 1B4EA 3GKAA 3Q2DA 5D09A 3P8JA 1I4NA 2RDUA 3QH2A 1OK4A 5I3KA 1LZOA 1L2UA 1VGAA 1GOXA 3C2OA 4IPJA 4ZL1A 1P0KA 3PB0A 5CZSA 3E9AA 4RXGA 4I7UA 1OX6A 1KV8A 3HPXA 3TAOA 4IMFA 2VC6A 4E2BA 3ZR4A 5MHBA 4CNNA 5I3JA 2QCMA 4I7VA 1S5WA 1LRNA 4IWWA 2GQ9A 1OFPA 4LVGA 1O94A 1DORA 4FX8A 1GTHA 2V5BA 3WJZA 4PH6A 3MP5A 4JYFA 3H53A 4JTSA 1L6WA 2E5DA 1W3TA 1KLZA 5BNKA 4MYXA 1UUMA 2Q8ZA 4LRTA 3HMJG 3UZJA 3GZ3A 3FOKA 3W1RA 4IXXA 1ZFJA 2NXGA 3NQVA 1M7OA 2CU0A 1OFAA 4H3DA 4CNPA 2OT1A 5TQLA 5CKSA 4OHQA 2DJLA 4RZ6A 1TTIA 3SFKA 3KRSA 3DENA 4YMZA 1H1YA 1KTCA 4NJJA 1NSJA 2ZZ4A 1MZHA 1SZEA 3CU2A 4Z0JA 4MZ1A 4ZQRA 5E93A 1LRTA 1KLYA 3LTYA 3MI3A 4AXKA 3GR7A 4D2JA 3W07A 1YXDA 4JNMA 3TR2A 3LXCA 2QDHA 1GJPA 2X16A 3UWUA 3T4CA 1FDJA 5D33A 1F7BA 3L0KA 4IX2A 1M5WA 1S5TA 1VRDA 2VELA 3MMTA 4YCPA 3MP3A 4EWND 2YZRA 1R47A 4WUIA 3TJXA 5TBOA 3S1XA 3NQFA 4JYEA 3SZ8A 1YDVA 3TNOA 4JD4A 1VR6A 1F76A 4FX7A 5GVJA 5LNRA 4TMCA 3L68A 5K9DA 2DJXA 3ZWTA 3RMJA 3TAKA 1M6JA 5AHIA 3UWYA 5BW6A 2GOUA 1EUAA 1WXJA 3ANYA 4QJ1A 2J88A 3W7JA 5TIMA 3MI2A 4JTTA 1VCVA 1TO3A 1ICQA 1OYBA 1KFEA 2V2HA 3B03A 2YSWA 4CQ9A 1NFBA 4RZ4A 1J2WA 1D3GA 4XTDA 4FB7A 1AG1O 4JDYA 1GVRA 1YTDA 3EWWA 5FEXA 1FCVA 2P0OA 4PTNA 3W7QA 3L67A 3NQ6A 1YTKA 4HIBA 1VZWA 1TPEA 3EXSA 2WNNA 5AHLA 4N9EA 4WX2A 1SPQA 3STEA 3BW4A 3VE9A 4O14A 1K3UA 3GR8A 1X1ZA 2E5BA 3S8HA 3QQ0A 4QAIA 1JUKA 4EIVA 4LV4A 1J4EA 3HBLA 2E6FA 4BFAA 3SJ3A 2X1TA 3KX6A 2YDAA 3UPWA 1EPXA 4ADUA 5AN7A 4Z1BA 3BLEA 1XI3A 2TPSA 1NVMA 1P4CA 1LOLA 4WY0F 3TQKA 3W7NA 1GYNA 3S5YA 4J9JA 1HL2A 4GUJA 3L21A 4RKAA 2E6AA 3FFSA 3OVQA 5G1YA 5HULA 1DBTA 3MYPA 3T40A 3GNNA 3SGUA 1YPFA 2Y89A 4CLMA 1TCDA 1R2TA 2QCFA 3USBA 1TQXA 3W1PA 1WBHA 4K6AA 1EP1A 1YXCA 3O05A 5EL1A 1IIHA 3O1NA 4WD0A 2QCDA 1OX4A 4Z0SA 4O1DA 5G1TA 3M16A 1I2NA 2YPIA 4N9BA 3C3NA 4MZ8A 2CLMA 1AL8A 1AW1A 4KFNA 5D03A 4AWUA 3DXIA 3HG5A 1TPFA 4KKXA 3WK3A 3W1TA 3SGZA 4N9CA 4UTTA 4N02A 1HO4A 1KV5A 1F5ZA 4MFDA 3GVGA 1L6YA 1F6PA 4AMAA 3BV4A 1TTQA 3QMRA 2FPYA 4NXKA 1ICSA 4UTMA 3W72A 3UWZA 1JUEA 4GNJA 3G1SA 3NQ7A 3DHFA 2ZRVA 2YGYA 3NM1A 4OE7A 3FYOA 2GPTA 2EHHA 2G5WA 3E96A 3G1AA 3NL3A 4A21A 4AWSA 1FWRA 3LI1A 4EOUA 5FF7A 1ZAHA 1ZENA 4NJGA 2ATSA 2NV2A 1SO5A 4N2YA 1K8XA 2NUYA 4FIRA 3VE7A 2FPVA 3NQEA 3HGRA 3CT7A 7TIMA 1GWJA 3KXQA 4LC6A 3P8IA 4O54A 4E0CA 2A2IA 3W7CA 3NR0A 1QPNA 3MHFA 4CNOA 3R89A 3DI0A 2NUWA 5EBUA 3GDKA 3M0ZA 1LRQA 2OMAA 1S5VA 4NX0A 2H6RA 4K8EA 4L4MA 1Q6OA 1RZMA 6TIMA 1NF7A 3STFA 3IVTA 1B9BA 1PL9A 1SSGA 3P81A 4OV9A 2DZTA 3KRZA 2E6YA 3O16A 4NVTA 3W84A 1G4EA 3LTPA 2KZHA 5CZTA 3W7GA 2C0AA 3LHTA 3W2MA 2H8XA 1LROA 1K8ZA 4MY1A 3QZEA 4HN4A 4MJMA 4X22A 2R94A 5G2HA 3BPWA 3NQMA 3G0UA 3STCA 1FCBA 4H4IA 3LBCA 4NNBA 4XQ6A 3W7OA 3NNTA 3EXTA 3WJYA 1WBJA 1G69A 3FKRA 4WXZA 2FJKA 1KFJA 3PBWA 2PRHA 3DBPA 3G1HA 4RXFA 4MY8A 3GDLA 4JDBA 1W37A 3A5FA 1XUUA 3G1FA 3OIXA 1DJQA 5BMWA 3THAA 5AC8A 5A5WA 2ZTJA 3HO8A 5LGXA 4PL1A 1GVSA 5I3GA 1W56A 4UMCA 1I2RA 1R46A 2QCHA 4B5NA 1DL3A 1XBZA 1KA9F 3UZ5A 3MJYA 3N73A 3P60A 4IXHA 3TK7A 3MHUA 5HUOA 4UNKA 2Y70A 1SW3A 4JTHA 2VFHA 1QFEA 1W5PA 3PG8A 1A5AA 3ELFA 1JQVA 1QR7A 4MUZA 2FFCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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