5KTLA

Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis.
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
295
structure length
294
Chain Sequence
SVGDFGTVLTAMITPFKADGSVNYAVAAELAAHLVDNGTDTLVVCGTTGESPTLSWDEEYNLFVEVLQTVAGKAKVIAGCGSNSTKEAIAATQKAAKIGVHGTLQVVPYYNKPPQAGLYQHFQAIAQACPDLPLLLYNVPGRTGQNLSPETVVRLAEIDNIIGVEASGNLDQAGEIRRSTPKEFQIYAGDDSLTLPLLAIGAKGVVSVASHLVGNQLQQMIQAFNSGQVTVASDIHLRLLPLFKALFITTNPIPIKQALKLQGWEVGSTRPPLSDADAEVSQKLEAVMKHLNLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and Function of Cyanobacterial DHDPS and DHDPR.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase
molecule tags Lyase
source organism Anabaena variabilis
total genus 114
structure length 294
sequence length 295
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.3.3.7: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase.
pdb deposition date 2016-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5ktlA00
1ZAIA 4IGHA 4UNKA 4UFKA 3W7DA 1BTMA 1A5BA 3LDVA 3KX6A 6ALDA 4WXYA 3WK0A 3W76A 4JIPA 5FF3A 3PWAA 4PEKA 4TR9A 3I7SA 3LHYA 2E5DA 1X6UA 4M6VA 5TBOA 1XM3A 1JQXA 3L67A 2GOUA 4UTWA 3PSWA 2X16A 3PBUA 4LWWA 2Z1BA 3IV3A 5D04C 5FEWA 4UMCA 4XTDA 1VRDA 3NOEA 3CC1A 1FDYA 1FWSA 5AHFA 4MVAA 3TSBA 2OX1A 2C18A 2BWGA 3S8HA 1B4EA 2TPSA 2Y62A 3CTLA 1TO3A 4UFLA 5U4NA 3N2XA 1PHWA 1ZCOA 3UYCA 3W83A 5LNRA 4LVDA 1OK4A 3HG5A 3W87A 3QQ1A 2ZZ4A 1GTEA 3GDLA 1OFPA 2GJNA 3G3MA 4LVBA 3DAQA 4NNAA 3VKJA 4YL2A 1KFLA 3EX3A 3L5MA 3W1NA 5CZJA 3M5VA 3BVJA 4G1KA 1MEHA 4DO4A 5FF4A 5KTLA 2BZNA 3G8RA 1JR1A 1PL9A 4PH6A 4IJBA 3GIYA 1ADOA 3MMTA 2ZYFA 4Z0JA 4MKNA 3CHVA 3ELFA 4NX5A 4FNUA 4YLWA 3HJZA 3W7OA 1P0KA 1U5JA 3CQ0A 1T99A 1QPRA 3LCIA 3LHVA 4FX7A 4NUWA 4OV4A 1PIIA 1FWWA 3FKKA 1Q6OA 4IMGA 1W5NA 1VHNA 1B9BA 1H1YA 4MLRA 1YADA 4UFMA 5CGQA 2QCFA 4WY0F 1WX0A 2G95A 2HTMA 1K7EA 4JGDA 1K8YA 1TPEA 3DFNA 4DPQA 1JCXA 3HF3A 1C8VA 3TH6A 4NNBA 4UTTC 4NNCA 3LB0A 1KTBA 1RV8A 5K9XA 2WO5A 1LRTA 3O1NA 1LORA 1DL3A 3NDOA 4PC8A 3O8AA 4JY9A 3GDKA 2Y7GA 4RZ5A 2J9YA 3QMRA 4O0ZA 4Z1CA 3DXIA 3W7EA 1JQVA 1DV7A 4O12A 2B4GA 5D2TA 3QYQA 1KM6A 3NQDA 4J9JA 3VE9A 4CQAA 3IIOA 2W6RA 4A22A 3E0IA 4HPXA 3VNDA 1TREA 4DF1A 1AK5A 3EKLA 3L66A 4FX6M 5KZEA 3DH7A 4GNJA 4TX9A 3W2NA 2GUUA 1SW7A 2FB3A 5F2IA 2Y85A 4R7JA 4AXKA 4UTUA 3V1PA 5K2ZA 1W8SA 3LERA 1BEUA 1FWTA 1TYGA 4MZ1A 4O13A 1O60A 2WNZA 2DZSA 3CIWA 4HNVA 1XBYA 3QPZA 4N4PA 1QO2A 5CPOA 4IMDA 1HFBA 1JJKA 5HR7A 2TSYA 3LHUA 2CLIA 3NGJA 3SGZA 4WD0A 1A53A 1Z44A 1EUAA 1XBZA 1KM3A 3NQVA 1ZNNA 2ZRXA 2CZ5A 3P74A 3H55A 4N6EA 1G69A 3P7YA 3L5AA 3L0KA 2QJIA 3G1DA 4FXRA 4NXSA 1VQTA 4WY0A 1SFLA 4UFJA 4K38A 3R2GA 3S1XA 3NQMA 2DZWA 4BFAA 2ATSA 3TE9A 1SO4A 5LHEA 4IMEA 1LRNA 2DJLA 2DZTA 2NXIA 2UV8G 1X1OA 2CW6A 3GLCA 3DKJA 3W7JA 1XUUA 4JX5A 1ZAHA 2ZFAA 3PUDA 3OG3A 5EL1A 1EB3A 3O63A 4X3ZA 1SU5A 1DBTA 3NQ6A 4O10A 3GK0A 1KV5A 3E96A 3TMQA 4ADSA 1QNVA 3W7KA 3BW4A 3GXNA 4MJMA 4JEQA 5KSWA 3TUUA 1JUKA 1P0NA 5D2XA 4A2RA 3OIXA 3R12A 3DHDA 2NUYA 3LTPA 3I68A 2QAFA 5DBUA 1JULA 3UWWA 1VC4A 4LC6A 4O53A 5E93A 4ADUA 3HG3A 4O1AA 4JTTA 4M6QA 3RNDA 4HPJA 1TV7A 3LXBA 1X7FA 2CZDA 2QDGA 2VELA 4JX6A 2R94A 4PTNA 2JBMA 3TNOA 3CPRA 1G4PA 3W22A 1TRIA 3C8FA 4JTGA 5D09A 4UTIA 1SFJA 1KFBA 3W7CA 4MPQA 1BKSA 2FPTA 3EWYA 4Y96A 1TRDA 4AF0B 1ME8A 2WV8A 4I7WA 5C54A 4OE7A 2RDTA 2YDAA 5D05A 3W1PA 3TW7A 3BGGA 2ZRWA 3CEUA 3N2MA 3UY8A 4XKYB 3L68A 4JTFA 5HR6A 4ZQCA 1KTNA 2NXHA 3C52A 2EKCA 1TV5A 4JYEA 4O50A 3W73A 1XUZA 4UFIA 4AMAA 5FF0A 1TPC1 2ZZ3A 2G96A 3GXTA 3Q58A 3W7RA 3UWUA 1ICPA 2NZLA 1Q6RA 2GQ9A 1LBLA 4LY8A 2E6FA 5ABTA 4RCXA 5LNVA 2Q3RA 1R2RA 3NQFA 4KFPA 1GVFA 3M16A 3NO5A 2Z0IA 2V2CA 3LX9A 2J6XA 1TB3A 5SWUA 2V81A 5F4XA 1S5TA 4PODA 1F73A 1ML1A 1IXQA 4GUFA 3SZ8A 2VFFA 1WOBA 2DZVA 3M6YA 2B7NA 1TPB1 3WJZA 3FLUA 4JDYA 1GG1A 2BLEA 4N02A 4K37A 4IX0A 3NQEA 3PBWA 4FNTA 1KFCA 1TTIA 4FXSA 3W1TA 3STCA 3SFKA 3LCXA 1OF8A 1YDNA 3C56A 2HS6A 3N34A 1X1ZA 4N6FA 1JCNA 2A7RA 3TCEA 1FCQA 4Z0SA 3LRLA 1ZENA 3MBFA 2A6NA 4WZHA 4QITA 4QM1A 2VKZG 4RK8A 2FPYA 1VCGA 2EAWA 1AW1A 4E38A 3STEA 5D32A 3S1WA 5FF2A 4JICA 4I7UA 2FB2A 3CWNA 2ZZ1A 4N4QA 5F4WA 3PS7A 5HUOA 3NL5A 2FTPA 3HMJG 4NZFA 4XWUA 3W7MA 3W1XA 2ZQ0A 1AW2A 1N7KA 4M7TA 4OGZA 3CT7A 2GVGA 1DVJA 2Y88A 5EMUA 3GZ3A 3Q94A 3ATZA 3NZRA 3KHJA 5CKSA 3P5YA 3PR2A 3L0NA 2C13A 4FEZA 2VEIA 5EY5A 5D38A 3RLUA 3GR7A 4WX2A 4PL2A 3NQAA 4OU1A 3WJXA 3GNNA 1UB3A 4FNRA 3T7VA 1B57A 2A2IA 1H7NA 1H60A 2XN2A 2XN1A 2TRSA 4LS0A 4IXHA 1W31A 1JCYA 5DCEA 3H54A 1WDWA 3TX9A 5LHFA 4FNQA 3W84A 1AMKA 2E5CA 1ME9A 5DBTA 2RDUA 4UC5A 1RQBA 2NX9A 3EWZA 2TYSA 4IMFA 3NPXA 3W23A 3QPYA 2AQWA 5U7SA 3O6YX 3IIXA 4EF8A 1LLZA 4MLJA 3E02A 4U4MA 3W85A 3S1VA 3UZJA 2YPIA 1W37A 3G0SA 1VYPX 5AYXA 1I2NA 3NL3A 4LUJA 3C4UA 3LCHA 1J4EA 2ZTJA 4KWWA 4GUIA 3R5EA 3S0CA 1VR6A 1TQJA 2VEMA 3N3MA 3LLFA 3NQ7A 3TC7A 2B0MA 4DBDA 3P60A 2Q8LA 3U2OA 4ADTA 3HGSA 2FQIA 4WOZA 2E5BA 1ONRA 4LV4A 5CSRA 3ZR4A 5C55A 1MO0A 5BMXA 1L6YA 3QMSA 3OVRA 3RF9A 1TJPA 1VJIA 5HWNA 5EKYA 1OVDA 4GE8A 3EXTA 5AHMA 5CPNA 2YYUA 3LXCA 4ORMA 5FESA 3M47A 1GWJA 2WSQA 3PB0A 3TW6A 1M7PA 4W9TA 1JCJA 4UTTA 4U28A 1XKYA 4NJHA 1UASA 4UMBA 3E49A 1KA9F 2YYTA 3QH2A 4Y9AA 5KITA 1B4KA 1Q3NA 4CCDA 3DZ1A 5D2YA 5G1YA 1OK6A 1WOAA 2J88A 4M7SA 1SPQA 1BWLA 3MI2A 1PCWA 2RKXA 4UR7A 3MP5A 2XFWA 3MUXA 4O14A 5AB3A 3QSRA 4Q32A 5I3KA 3W7GA 2A6LA 2DZXA 3ZS4A 4AWUA 4WQ6A 2YFNA 3DU0A 4O57A 4N9DA 3QW4B 4LVFA 1XDLA 3UPWA 1FCVA 1OG0A 3G1VA 5IBXC 1J2WA 1WAUA 3FOKA 2E1DA 3K30A 3GAKA 3RFAA 1H51A 1FUYA 4AAJA 1NEYA 1NF7A 2Y6ZA 1Z41A 1H63A 4MZYA 2O7SA 4QSHA 1TMHA 3N73A 5G2WA 5F2LA 2ATMA 3NQCA 3UY7A 3IGSA 2H6RA 3WFAA 4K6AA 4OT7A 3BGJA 1TPWA 1PHQA 1QR7A 2NX3A 1UBSA 3TFXA 3LI0A 4LVGA 3UWZA 2BTMA 3FYPA 1Q6QA 3PVFA 1F5ZA 3FS2A 3W72A 4AHPA 2WSYA 3UPBA 1G6CA 1MXSA 2A7PA 3KXQA 3ZFHA 4O19A 2X2GA 3T4CA 2WQPA 3IIZA 2V0TA 1O5XA 1TQXA 1LOQA 3CU2A 3LTSA 3W3OA 2C16A 1IIHA 2WPBA 3F4NA 3C61A 3G1YA 4P2VA 4DO6A 1G4EA 5AHNA 3EWXA 1YTEA 5BNKA 5D03A 2ZZ2A 2CZFA 2WNQA 3DFQA 1EP3A 3C2RA 4QAIA 4POCA 2ZCGA 3Q2DA 4PCFA 1VLIA 3RU6A 3NM3A 5FEPA 1OFBA 1I45A 1EIXA 1FCBA 2WNNA 4O1DA 3LV6A 1GT8A 1QAPA 2HSAA 3P61A 2YXGA 5CPMA 1OX4A 4MZ8A 4K8HA 1SSDA 1EP1A 2A7NA 3CIXA 3WK1A 1ICQA 4S2BA 3N9RA 1UUMA 3OVPA 4HSOA 3VI2A 5F4SA 1LCOA 1Q45A 4ZZ9A 3LBMA 1K7FA 2CLEA 5C6MA 2E77A 2ZTKA 4PFMA 4LC8A 3GAYA 3GR8A 1O95A 4P61A 1H61A 5HUPA 4HNNA 4M6PA 3RMJA 3DKLA 4GUHA 2B7PA 5LNUA 4JX4A 1JCLA 1F2JA 3MW7A 4NVTA 4CQ9A 1MZHA 2Y63A 5HQEA 2X1RA 3QRHA 1R46A 3Q37A 4N9CA 4DXVA 2QCEA 3TKFA 3HPXA 1I8JA 2FLIA 3NEVA 4NXKA 2V2DA 8TIMA 2O7QA 2Q8ZA 5DCDA 1OYBA 1S3HA 2ZA3A 3EB2A 3W07A 3MYOA 2DZUA 2VENA 4GJ1A 5AHEA 3FA5A 3SIZA 3W86A 5CZSA 2YCEA 1CW2A 3P84A 4Y6GA 3P62A 5HNRA 5LZLA 1M7OA 3B04A 2C1HA 4ZVJA 2OZ0A 4R33A 4Z08A 5IM51 4R34A 1R47A 1JRCA 1HO1A 2A1YA 1P4CA 1SSGA 3PUOA 1KM1A 3P67A 3T40A 2A85A 2B7OA 5BRBA 4FX8A 3PG8A 3R8RA 1H1ZA 2NV2A 4X22A 2ALDA 2V5LA 4FNPA 3LCLA 5D2VA 2PURA 3PG9A 3BLFA 1W5OA 3BW2A 3OEXA 3QQ0A 1O94A 3A23A 3NR0A 3P8IA 1PE1A 5LSMA 3LI1A 2YW4A 4L4MA 4K39A 4BR1A 2ABAA 2FJKA 2RH9A 3UD6A 4WY0B 1LROA 4E2BA 2PRMA 4NT0A 4ZQNA 3USBA 2ZA1A 3FJLA 1W5PA 5F2MA 4BWLC 2IQTA 1SO6A 1G4TA 5G4WA 3TR2A 1TV8A 2F7FA 4ML9A 3W7IA 4MYXA 1V7YA 1L6WA 3KVKA 1LTDA 2JGQA 1OX6A 1LLWA 1O4UA 3PF3A 3FJ6A 1EWDA 5AHIA 4NU7A 3W7LA 3LTYA 4AH7A 3MHGA 4IPJA 1AW5A 4LRSA 3GDMA 2I14A 3EX1A 3M1ZA 2QAPA 5CG7A 2ZDRA 4UTMA 2KZHA 3C2OA 2AAMA 4PL1A 3SJ3A 4QNWA 5CPLA 3FFSA 1VH7A 2QCGA 4QQ3A 3TA6A 3NG3A 4N9EA 2BX7A 3KVJA 3TXZA 1MEWA 3IEBA 3QZEA 4TO8A 3U8GA 4UTJA 1OFEA 3ANYA 1JUEA 1ZJIA 3EWWA 1OHLA 2YFOA 1TPVA 5AYYA 1HG3A 4GWEA 4ICNA 4MYAA 5L9FA 2H3BA 4NJGA 2GPTA 5J5RA 2PRHA 3IVSA 2ZZ5A 3DFTA 3BLEA 3GYEA 4UR8A 5G1TA 3THQA 1EPXA 1K8ZA 1S5VA 1K02A 3T55A 2VFEA 1WYIA 4BK9A 1WV2A 4ONVA 3ABQA 3DGRA 5I3GA 2QKFA 3LCGA 2YR1A 1KFEA 1R2TA 1VS1A 4QNEA 2HS8A 4GXMA 4HT3A 3NQ8A 2R8WA 4LRTA 2YSWA 3B8DA 4A2SA 4D2JA 5I3JA 2X1TA 2NUXA 1WXJA 3IIVA 3JRKA 4JTKA 2OT1A 1A5SA 4MFEA 3TK7A 1SR9A 2V82A 4JTEA 1FBAA 3CB8A 3PSVA 3PAJA 4HKPA 2RDWA 1FDJA 4S1FA 4GRSA 3SR7A 1XL9A 3DBPA 3KRZA 2VFHA 3G1SA 3NL6A 1VGAA 3DI1A 4DQWA 3PULA 3EX6A 1ALDA 3MHFA 5T26A 1F74A 4JXCA 1SQ7A 4XBKA 2DORA 4TIMA 4NJIA 3SY5A 4RXFA 1OX5A 1FXPA 4OV9A 1RZMA 2ISVA 3U6WA 3A22A 3QSTA 1TTQA 3LM7A 1TJRA 2CLHA 4UTLA 4ZL1A 3RLVA 3G8EA 4JDBA 2LLEA 3WK2A 4O18A 4PA8A 3TQ0A 2VFDA 1NFBA 3UQNA 5KZDA 3M5YA 2R91A 2VFGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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