5KTLA

Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis.
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
295
structure length
294
Chain Sequence
SVGDFGTVLTAMITPFKADGSVNYAVAAELAAHLVDNGTDTLVVCGTTGESPTLSWDEEYNLFVEVLQTVAGKAKVIAGCGSNSTKEAIAATQKAAKIGVHGTLQVVPYYNKPPQAGLYQHFQAIAQACPDLPLLLYNVPGRTGQNLSPETVVRLAEIDNIIGVEASGNLDQAGEIRRSTPKEFQIYAGDDSLTLPLLAIGAKGVVSVASHLVGNQLQQMIQAFNSGQVTVASDIHLRLLPLFKALFITTNPIPIKQALKLQGWEVGSTRPPLSDADAEVSQKLEAVMKHLNLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Anabaena variabilis
publication title Structure and Function of Cyanobacterial DHDPS and DHDPR.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase
total genus 114
structure length 294
sequence length 295
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.3.3.7: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase.
pdb deposition date 2016-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5ktlA00
4GUIA 3NZRA 3ATZA 1EA0A 2ABBA 3LDVA 5DCDA 3L21A 4PFMA 1A5SA 3FJ6A 1SW0A 1XBYA 3NA8A 1VR6A 3GK0A 2CZEA 4N2YA 2E09A 3B04A 3DFPA 3R13A 3TAOA 1V5XA 2ZFAA 2WNNA 3DFSA 3R12A 4UFMA 4KFPA 1LRNA 4NU7A 3T4CA 3SR7A 5F2GA 3IIZA 5FF2A 3PSVA 4LRTA 1KV8A 1Q6QA 1H1ZA 1KM5A 4WY0A 4IGHA 3TQVA 3LCXA 3W2UA 5K9DA 3GAKA 4AVFA 1VHNA 4HNVA 1J4EA 5AOUA 2ABAA 3TAKA 4GUJA 3TE9A 3V75A 3NQFA 3CWNA 3L0NA 1G69A 4JD4A 4DF1A 4R7JA 4ZQOA 2R94A 3UY7A 1WXJA 3PS7A 4J9JA 1X1ZA 1SPQA 4MLJA 1IIGA 2GQ9A 3C3NA 3CEUA 4IXHA 2GUUA 5C2XA 1GVRA 3DFQA 3ZFHA 3D0CA 2Y88A 2X30A 3GVGA 3I68A 5G2IA 3B0VC 3NOEA 3UZJA 3UWYA 3EXRA 2QCFA 4M7TA 3ZR4A 5LNRA 1XDMA 4JX4A 4L4LA 2Y7DA 1DJNA 3CU2A 4XUGA 4DPPA 3EWZA 5F4SA 3P74A 1TQXA 3CWOX 3SJ3A 4CCDA 5AYYA 5AHFA 2VFFA 1X8FA 1FQ0A 4HIBA 3HOJA 4NUWA 1RD5A 3I7QA 6TIMA 2A7RA 4JTJA 2Y6ZA 3VFLA 1SUXA 2ISVA 4UFJA 2Y7EA 2C19A 3UWZA 1Z48A 3S5YA 4Y8FA 1C9DA 5DXXA 3QYQA 1OYCA 1ZNNA 3CIWA 1W31A 2W6RA 3Q2DA 1WV2A 2TRSA 4TU1A 2WNZA 1TV5A 2QCHA 3PUDA 3UPBA 3TC7A 4Z1DA 1DBTA 1K8YA 2B4GA 2J9ZA 3A5VA 1JQVA 2P1FA 3PB2A 2ZDRA 1M7OA 1I2RA 5EY5A 4FHAA 4PL2A 1SZGA 3LB0A 3G18A 4IX0A 5I3KA 5CSSA 3BG3A 1Q6OA 3K30A 3DHDA 5K4ZA 2BXVA 2A21A 1H7XA 3TH6A 3KAOA 2QCNA 3C61A 3P5ZA 4AWUA 1JCYA 4OU1A 3DKLA 1Y0EA 1T99A 1RR2A 1W37A 1EUAA 3W3OA 1B57A 1QMLA 1W5PA 5E93A 4DO5A 1PCWA 4FXSA 4Y6GA 1FUYA 1DVJA 1SFJA 3NDOA 4HN4A 4HHPA 1TIMA 2ZTKA 2NV1A 3NQ7A 3O63A 2XN1A 1IIHA 3IGSA 4JTUA 4GXMA 1H7NA 5FEWA 3ABSA 1K3UA 1KW1A 1L6WA 5T26A 1P1XA 5A5WA 3EWWA 1N8FA 4NZFA 3W7NA 1R47A 2CLFA 2FDSA 1LBLA 1ZY9A 2V5BA 3NQCA 3NQDA 1OFRA 2NXGA 3ZWTA 4RLIA 3BW2A 3LHYA 2B0MA 3MYPA 1G4PA 4GFSA 1FDZA 3PBYA 4LRSA 3ABQA 2X1UA 4CCCA 1XKYA 3GR7A 3M5ZA 4FX8A 3RLUA 3TJLA 2RHGA 3LV6A 1ZCOA 2QDHA 4M6PA 4OV4A 4ZQMA 3DGRA 4M5PA 2WO5A 3EXSA 1DORA 1JULA 1EEPA 3HBLA 1SSDA 2F7FA 3FFSA 8TIMA 4ICNA 4UC5A 1OABA 1J5TA 2VEKA 3G1AA 4WXZA 1F7BA 4QNWA 3GXNA 3PF3A 4B5NA 5C54A 2CZDA 2W0UA 3GX9A 1D3GA 4WD0A 2Y61A 3P67A 1G6CA 1KBJA 3UD6A 2Z6JA 2YW4A 3LTSA 4N9DA 3O16A 1GVSA 4HNTA 1TPWA 4AHOA 5HWMA 1Z41A 5D02A 1TYGA 1KA9F 1EIXA 2ZCGA 1K7EA 3DU0A 1TQJA 1TPVA 5AN7A 1I45A 5AHEA 5KZMA 3W70A 5G4EA 3G8EA 3P60A 1XL9A 4EF8A 3BG9A 3LXBA 3W1PA 2OMAA 3G0UA 2A0NA 4RK8A 5EYWA 3NQEA 5AB3A 3E0IA 1QPQA 1KV5A 1J2WA 4UR8A 3W2JA 5J5RA 2QAPA 4JS3A 3QW3A 4LY8A 3BARA 3QSTA 4IMDA 1TCDA 3A5FA 4LWWA 4LTSA 4DO4A 1HO4A 3SI9A 1FWWA 1V7YA 5LHFA 5G1YA 1VYSX 4MZ1A 4MZYA 4O10A 3EWUA 3P61A 1OFEA 3HG3A 3NQGA 2V30A 1VRDA 3A21A 4LU0A 2RDUA 4TO8A 3MHFA 4JTEA 3U6WA 2Z2UA 4OE7A 2QCCA 3CB8A 6ALDA 1IGSA 2BZNA 2XFWA 3HGOA 4FO4A 3LTYA 1H7PA 1DQWA 3S1XA 1Q6RA 2VKZG 4XWUA 3KX6A 3TJXA 1OFAA 2Q3OA 1ME8A 4IJBA 3QZEA 3GB6A 3GR8A 1SFLA 3SZ8A 5H2ZA 4WUIA 1AW1A 4TR9A 1U83A 2QJHA 4JYFA 4NJIA 3SGUA 1RQHA 3OVRA 3UWUA 5K3VA 5F2MA 2OX1A 3FS2A 2ZA2A 3FKRA 4A2SA 1OX6A 3W2NA 3GLCA 1K8ZA 4NNAA 5TIMA 1XDLA 2VELA 1X6UA 3QJAA 2NUWA 2GVJA 1S5TA 1K02A 4DBEA 1TMHA 1B9BA 1FWRA 1TPC1 3JS3A 5HR6A 3F4WA 3EX3A 4MLRA 4UMAA 2HTMA 3W7JA 3VNDA 3W1XA 3EKZA 1KFLA 1TTJA 3WK2A 3GDLA 1SR9A 1YTKA 2VEMA 5CPLA 4UXDA 3MUXA 1WBJA 4GNJA 3LLFA 4CQ8A 1WOBA 2DP3A 1SW7A 4FX7A 4MKNA 5KTLA 3GKFA 2CZ5A 5AHIA 4RZ4A 1MO0A 3BLEA 3VE9A 5LSMA 2G95A 1VQTA 3N14A 1XUUA 1T0OA 3HIJA 1LRQA 1PCKA 4HSNA 1GEQA 1QPRA 1O60A 3GYEA 5ABTA 1F74A 5EMUA 5DCBA 5HJLA 1K7XA 4Y96A 4WQ6A 3EXTA 1JRCA 4FX6M 3CLMA 3H55A 2H3BA 1WQ5A 3O15A 3NL3A 3OIXA 3M16A 1IXOA 3S5ZA 3W1UA 4WJEA 2DZVA 3I6RA 1F73A 2A1YA 4LVFA 3Q58A 2D73A 3PULA 1OG0A 5KITA 2PRHA 2GVGA 3W7DA 1I2OA 1LLZA 2PC4A 2J9XA 3FYOA 2PCQA 3LI0A 1XM3A 3LHZA 5D38A 5AC7A 3C0JA 3S8HA 1ZAJA 2PURA 4RXFA 3G1VA 2C6QA 3BG5A 3EX2A 1FDJA 4K39A 4Z1AA 5K4XA 2Q3RA 4MJZA 4N4QA 3MI2A 4O17A 4I7UA 4FB7A 5LGZA 2B7OA 2O7QA 4WY0B 4KFNA 1W5QA 3KVKA 2HSAA 1GYLA 4PH6A 5LNWA 2CLMA 3L65A 2J88A 4YXGA 1G7UA 3F4NA 1C8VA 4UFHA 1QWGA 3LLDA 2QCEA 3LCLA 2ZRZA 1KM2A 4AAJA 3P84A 3FA5A 4Z0SA 3H54A 4AH7A 5FF3A 2YXGA 1TTPA 3LERA 1TTIA 2QCGA 1VPXA 5D2TA 4LUJA 3S42A 5HNRA 1YXDA 1SZNA 1AK5A 5CZTA 3R89A 1KM0A 3PBWA 3KRZA 4UFIA 3ZS4A 4O1CA 4YCPA 4UTJA 1KTNA 2H8XA 5FEZA 4K37A 3FYPA 2FIQA 4FNPA 3G22A 5F2LA 3PUOA 2GJNA 4IMFA 2Y7GA 1HO1A 4X22A 4LS2A 4H4IA 1YADA 4XBSA 1SO6A 3NEVA 4UTHA 4QJ1A 2QUTA 3M1ZA 4MVAA 1RQBA 5E0KA 1WBHA 4N6FA 1B4EA 4GUGA 3DENA 4M19A 1PV8A 4R34A 3STCA 1GZGA 3GIYA 1AG1O 2A5HA 3W7LA 2YFOA 3CC1A 3M5YA 1RVGA 3CQ0A 4Y90A 1SZFA 4IPIA 1B4KA 2R91A 1GQNA 4UR7A 3W6YA 2X1SA 3W1LA 1AL7A 4LW7A 3S6DA 3QMSA 2WNQA 4MY1A 5D03A 4KFOA 4HSOA 2Y89A 2A2IA 3R2GA 1FWNA 3UXAA 3C8FA 1YXCA 3GXTA 2JKPA 4O4VA 3S5NA 4DF0A 3LOTA 1PE1A 3N9SA 3B0PA 3U2OA 3F03K 3EWYA 3QPZA 1TO3A 4RCXA 3IGXA 1GOXA 1F76A 3LBMA 5LKYA 2IQTA 3N34A 2CWNA 1Q45A 5CZSA 7TIMA 4UTUA 4O13A 3TV8A 1I2QA 1ME7A 2QCDB 5AYZA 3HG5A 4AWTA 4NJJA 5CKSA 3QPYA 5AC8A 2JGQA 4NNCA 3UXDA 4D2JA 4JTHA 4O11A 1WX0A 1G67A 2YZRA 1UJPA 3NL6A 3KOFA 4FF7A 1JRBA 1LTDA 4RV8A 2Y85A 4G1KA 3STFA 5BW6A 3LXAA 5LNSA 4IX2A 4JICA 5FF0A 2NZLA 2G5WA 2GQAA 4A2RA 3IIXA 2C14A 3MYOA 4A22A 3QH2A 5HINA 1DQXA 3G1XA 3S1WA 4LVDA 3G1YA 4NVTA 2J27A 3DI0A 2ZA3A 1LCOA 1OFOA 3G3MA 3LHUA 3SFKA 4K6AA 2YPIA 4UTMA 3RF9A 4PEKA 1LROA 1XUZA 3QF0A 4UNLA 1RPXA 3TKFA 3PM6A 1KM4A 1FCBA 2VFEA 1OK4A 2YSWA 3GNNA 3RMJA 3UQNA 5I3JA 4LVGA 1KFKA 3W85A 4UUIA 4BI6A 3UY8A 3MP3A 4DXVA 5K2ZA 3NQMA 3P8JA 4O0ZA 4FNQA 3QC3A 1TRDA 3PR2A 1A5BA 4ZQRA 1Q6LA 3FJLA 2VXNA 3NVTA 3NQAA 3VCRA 4NXSA 5F1VA 3T40A 1SU5A 2OZ0A 3C4UA 1QO5A 4YCOA 3W84A 3EX6A 3W86A 3P82A 1SZEA 2H6RA 4LS1A 1W1ZA 2YR1A 4GUFA 1RV8A 1KLZA 3W7KA 4LC6A 4HPJA 2CLLA 1QPOA 2NV2A 1MSSA 3CTLA 2QKFA 1DL3A 2H8ZA 3UZ5A 2C13A 1XBVA 1TPFA 3DXIA 1BWLA 2WQPA 3SY5A 1LLWA 3THAA 4CQ9A 1F5ZA 1QOQA 2X1RA 3NPWA 1ZENA 5L9FA 1SSGA 1U5JA 3W07A 2QR6A 4JN6A 2E6DA 4HKPA 3O6CA 4DO6A 3HG2A 2B7QA 1W3IA 5K7JA 4YMZA 4AHQA 2AGKA 1KFBA 2NWRA 4O8RA 4LV9A 3NZ1A 3TU9A 2QCDA 3A22A 3IIVA 3N2MA 3GKAA 2FB2A 3I65A 3W7PA 2ISWA 1TPUA 3WJSA 1RQEA 2CLEA 3LRLA 1G4EA 3W9ZA 4O18A 2G97A 4ADUA 4E2BA 3W75A 2DZWA 5E1QA 3BW3A 1R2TA 3LV5A 2ZBTA 1YTEA 1DJQA 4QITA 3SW6A 3HGRA 2A6LA 1H7OA 3C2RA 2PE4A 4QQ3A 5DLCA 5L6UA 4H3DA 1L6SA 1JQXA 4JDBA 3L5MA 3IV3A 3KVMA 3N73A 3PBVA 1GVOA 3STEA 1VYPX 1YDNA 4A21A 1AW2A 3M5XA 5HULA 4O1BA 4O53A 4OHQA 3TSMA 2XN0A 5AFDA 1FWTA 4EF9A 4UMCA 3EB2A 2ZQ0A 3NO5A 3ZWSA 1SO4A 1W54A 2WSRA 1SO5A 2I1OA 3C2EA 3W76A 4ADSA 3PWAA 1XXXA 4QSHA 2EPHA 2RDTA 3TK7A 5BRBA 5EL1A 1JR1A 3R8RA 4NX0A 5EBUA 4IPJA 1VJIA 3TFCA 4JEQA 3W71A 1KBIA 4OT7A 5I3HA 4HPXA 1TJPA 1HL2A 2A6NA 3L0KA 1N55A 3UPWA 3CM4A 2FB3A 3W7MA 5LZLA 1P4CA 2YX0A 4JIQA 3P62A 4P61A 3G8RA 4AXKA 2CFFA 5HUPA 3SGZA 4DEFA 4O16A 1UUMA 3CT7A 2ATSA 3DZ1A 4IXXA 5A8GA 3TMLA 2CLOA 5HR7A 4JX6A 3W7CA 3TMQA 1GTHA 5IBXA 2E68A 1VCFA 3BV4A 1P5BA 2DORA 1VHCA 4OGZA 4XTDA 1OFBA 2FPVA 4DBDA 5EKYA 1A50A 3STGA 5TBOA 1GVFA 1ALDA 3LXCA 3MP5A 3UWQA 1W0MA 3TA6A 3HPSA 5AHLA 5HUOA 1XBXA 3EEGA 3LRMA 1A5AA 5CZJA 2HS8A 1UBSA 3W7RA 4AB4A 4N4PA 3KRSA 4CNNA 1R30A 4NJGA 3NQVA 4UTTA 3TR2A 1JUBA 4X2RA 2V81A 3GXPA 3KVLA 1L2UA 3EX1A 3U8GA 2WJZA 2DZUA 1ONRA 1W3TA 3HB9A 4FXRA 4JY8A 4WY0F 1P0KA 2CLKA 5G2WA 3TROA 3Q37A 4K38A 4ZMGA 3WK1A 1KM1A 1QFEA 3P7YA 1VCGA 1EWDA 2E77A 1W56A 3C2FA 1CI1A 1O4UA 3M41A 1NVMA 3NPXA 4K36A 4Y9AA 5G2HA 2V82A 4RZ6A 3E12A 2J9YA 3TXVA 3CPRA 1LZOA 3MHGA 1FXPA 1D9EA 4NT0A 2QUUA 3A9IA 5LNVA 2ZTJA 3QQ1A 2I9EA 4IQLA 1H5YA 5AHNA 3TXZA 3LHWA 4LOCA 5CPNA 4MOZA 3NL5A 1ML1A 2B7PA 1TV7A 2FPYA 1MXSA 3NQ2A 5CPMA 2YYTA 4CQAA 1GVQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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