5KTLA

Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis.
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
295
structure length
294
Chain Sequence
SVGDFGTVLTAMITPFKADGSVNYAVAAELAAHLVDNGTDTLVVCGTTGESPTLSWDEEYNLFVEVLQTVAGKAKVIAGCGSNSTKEAIAATQKAAKIGVHGTLQVVPYYNKPPQAGLYQHFQAIAQACPDLPLLLYNVPGRTGQNLSPETVVRLAEIDNIIGVEASGNLDQAGEIRRSTPKEFQIYAGDDSLTLPLLAIGAKGVVSVASHLVGNQLQQMIQAFNSGQVTVASDIHLRLLPLFKALFITTNPIPIKQALKLQGWEVGSTRPPLSDADAEVSQKLEAVMKHLNLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Anabaena variabilis
publication title Structure and Function of Cyanobacterial DHDPS and DHDPR.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase
total genus 114
structure length 294
sequence length 295
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.3.3.7: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase.
pdb deposition date 2016-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5ktlA00
5DELA 2QCNA 3PS7A 1ICQA 3T55A 3L66A 3MMTA 3SGZA 3TX9A 5CKSA 2G5WA 4N4QA 2OX1A 3GNDA 4JNMA 4OV9A 3SY5A 3FOKA 1WXJA 3TNOA 1LLWA 3BARA 3MP3A 5K9CA 1OYAA 1K3UA 2V2HA 5AYZA 1TO3A 2QKFA 1TTIA 4CQ8A 2ISSA 3DU0A 1I4NA 3Q37A 2ZRXA 4FNTA 2VEKA 3LB0A 2E6YA 4QNWA 1G7UA 5C5YA 2Y85A 3PSVA 1LBFA 3O07A 1F7BA 3PUEA 1NVMA 4RZ4A 3N34A 3M5ZA 3NQMA 4J9JA 2ZRYA 1KTBA 5EPDA 3R12A 3B04A 4NZJA 4Z0JA 1NSJA 1VZWA 2E77A 4HSNA 3T78A 1DJNA 1CW2A 4HIBA 1FCVA 1HG3A 2TMDA 4O50A 3EWBX 1T99A 2YPIA 4MY8A 4UXDA 3LCIA 2V0TA 3PC0A 4LVBA 4N4PA 4I7WA 3RU6A 3LRLA 3H53A 4AHPA 5AHIA 2ZYFA 1FXQA 4O16A 2YFNA 1QPQA 5IBXC 1S3HA 1EEPA 3P8JA 4R33A 3L9CA 2IQTA 1G4EA 3KAOA 1KFKA 1K8ZA 1TCDA 3FFSA 4JD4A 1TJRA 1BKSA 3UZJA 1TSIA 1EWEA 3FKRA 1TQJA 1XFBA 4QJ1A 5I3HA 1C29A 5HQEA 4HN4A 3LXBA 1UUMA 4NU7A 4GUGA 3ABRA 2ZZ4A 4E38A 4CLMA 1ZY9A 1DOSA 2H8ZA 4JYDA 4DXVA 1H7RA 1YDNA 3VFLA 2FPYA 2Z6JA 3GVGA 3W71A 3M47A 1S5WA 3S1WA 2DZUA 4MLJA 1F74A 4PCFA 3C52A 1ZJIA 1FCUA 3W9ZA 3W1TA 5HR6A 3TXZA 1G6CA 4MJMA 2ZA1A 4QISA 3W2LA 3HGJA 4ML9A 2VFIA 3BVJA 1G7VA 3FS2A 3NA8A 3BW3A 1KFLA 1MXSA 1RQBA 3GB6A 1R46A 2GJNA 4MOZA 4OWGA 3Q58A 4UC5A 3L0GA 1PE1A 4S1FA 5DCBA 5FF4A 3PBUA 4AH7A 3OVPA 4N6EA 1D3HA 3INPA 4X2RA 1H7OA 1RVGA 3NQ8A 1QDSA 4MJZA 3QPZA 4FX6M 1UB3A 3T7VA 5IBXA 5E0KA 5KZMA 1TQXA 3M9YA 5E93A 2C14A 3GXPA 2ABAA 1R47A 4IXXA 4O57A 5ABTA 4AB4A 2Z1BA 1GPWA 1H7NA 3NGJA 2P10A 2CWNA 1DHPA 1W31A 4WX2A 3G1DA 4N6FA 4EWND 3QC3A 1ZAJA 4YWIA 3R8RA 4O0KA 3G0SA 1HTIA 5FESA 1LBMA 1H1ZA 5CSRA 4N9CA 3EWYA 2JGQA 1OG0A 5FF3A 4LNYA 1SSGA 3MWAA 2V8ZA 4JY8A 3PWAA 3DAQA 3BW2A 1TYGA 3KFTA 3F03K 1TPC1 1XUZA 1Y0EA 4IX0A 3UQNA 4GC4A 3QMTA 1B4EA 4GE8A 5HNRA 1QNVA 5KZEA 5BOOA 2CZ5A 2C3ZA 4JTSA 3G1HA 3S9YA 1RQHA 3T44A 1W56A 1I2NA 2VOMA 5K2ZA 3DKLA 2HS6A 3A5VA 4LT9A 3P62A 2NZLA 1ME8A 3A23A 3DGRA 3SJ3A 4ZQPA 3CQ0A 4UMBA 3DI1A 3HG3A 3C4UA 2QUUA 3C2EA 3O1NA 1IXQA 2GQ9A 3G0XA 4K39A 2ZTKA 4O12A 4FNPA 4UFHA 1FQ0A 1GTHA 2ZZ5A 2VEMA 1RQEA 3DFNA 3P81A 3OVQA 1H7PA 1H1YA 2NXIA 3UPBA 3G1YA 2CLKA 2NV2A 4FIRA 3P67A 4NVTA 2X1TA 1JUEA 3EX1A 4FB7A 5BW6A 3PVFA 4XKYA 4JTEA 1W37A 2WNNA 4R53A 4JR5A 5KTLA 4JX4A 4O54A 1JCJA 1DQXA 2PURA 1LCOA 2AQWA 1I8JA 1GG0A 1RPXA 5C6MA 2B4GA 1XCFA 4O0ZA 4OV4A 1S5VA 3VE7A 1KLZA 2Z0IA 2A85A 2ABBA 2QAPA 2QJGA 1F73A 2XFWA 4N9DA 1EB3A 2YW4A 3SGUA 3W86A 2V9DA 4MY1A 3IIOA 4RZ5A 3LCXA 2QJHA 4XBSA 4LVFA 5FEPA 5C2XA 1SU5A 3EWWA 2NWRA 3IVTA 3D0CA 4C1KA 1K8YA 1M6JA 1KM6A 3LCFA 4E0CA 3V75A 1XI3A 5F2LA 3VE9A 5F4XA 2NX9A 4WUIA 2BXVA 5U4NA 5EA9A 1QPNA 4N9BA 4LWWA 3W72A 4NQ1A 1Q6LA 3FJ6A 3NQEA 2G97A 3W2MA 4UTLA 1ZENA 3DFTA 3PUOA 4WZHA 2P1FA 4Y6GA 4FNSA 4PL2A 3TC6A 2YCEA 1A50A 2DZVA 3R2GA 4GUFA 4Y90A 3HJZA 3S42A 3MHFA 3BGGA 3TUUA 2WKJA 3USBA 4EIVA 2GVJA 3PR2A 3SFKA 3B06A 5G1YA 2B7NA 2YGYA 1TPVA 5HMSA 3QZEA 4UTUA 5D30A 1EA0A 1FWSA 1AW1A 3P5YA 4JYEA 5BMWA 3TKFA 2Q8LA 5AYYA 2P0OA 4JTGA 3BG5A 2BSLA 1OFOA 4S2BA 3GDLA 4HNTA 2DZSA 3HB9A 2JGYA 3W22A 2Y88A 5BRBA 4M6PA 1KFBA 2FB2A 3C3NA 4JTLA 4LS1A 5CPLA 3WJWA 2WPBA 4BI6A 1A5AA 3A5FA 4H4IA 5EBUA 1KBJA 4RV8A 1H61A 4JY9A 3E02A 4ZQOA 3KRSA 4UR8A 1I2PA 1BTMA 3EWUA 1NF0A 3WJYA 1Z42A 4AVFA 1OX4B 5K9DA 4JDYA 1PCWA 4IMCA 1TPFA 4M5PA 4OGZA 5D33A 4OU1A 4BI7A 1YADA 1OFRA 4MYAA 2JKEA 4FXSA 1V5XA 1BWLA 1O4UA 3QMRA 3SW6A 1DQWA 2H6RA 3KX6A 3W74A 3ZWSA 4ADSA 5CZ0A 3CEUA 1H63A 3PBWA 3TFXA 1F2JA 2ISWA 2V5LA 3FA5A 1SZNA 2V81A 4FNQA 2QCGA 3CWOX 1XBXA 3MI6A 3EWZA 2RH9A 1C9DA 5AB3A 1HO4A 4S2CA 4GRSA 1K02A 3CLMA 2CLHA 3LHYA 4I9AA 1VCFA 1IGSA 4Z1DA 2ZA3A 3ZFHA 4KWWA 2NX3A 2Q3OA 2V82A 3PB0A 3TU9A 3TMLA 4UTHA 5AHMA 2ZRUA 1E51A 3K30A 1L6WA 4K8EA 1KM5A 1VYPX 1WYIA 3NQGA 4X9SA 3FIGA 2Y6ZA 3OEXA 2E1DA 4PFMA 4Q33A 4L4MA 3GR8A 4Q32A 2W0UA 3FYPA 3HMJG 1QMLA 2GQAA 2RDUA 1N7KA 3ATZA 3HGOA 5CSSA 1YXDA 3FEMA 1KA9F 5CGQA 5I3GA 4Z1CA 2YYTA 2NX1A 3EXRA 4CNNA 3S1XA 1WX0A 1WOBA 4RCXA 2C15A 3TSBA 3CT7A 2RHGA 3UNDA 3L5MA 3QQ0A 3I7RA 1W5PA 2A6LA 3OBKA 5FEXA 4UTTC 4JGDA 1YXCA 4X22A 1P5BA 3NZ1A 3CC1A 2A21A 5I3FA 2CLMA 4ZL1A 3HPSA 1XBYA 1XC4A 3G1XA 4MPQA 1X1OA 1YTKA 3LHTA 2ZZ1A 3HG2A 3O05A 4JTHA 4WOZA 1T8XA 3LCWA 1YPIA 2TRSA 1LTDA 2X2GA 2PCQA 1KLYA 1SR9A 4PL1A 1GVQA 3CEPA 4OHQA 1VPXA 1SZEA 1UASA 4EOUA 4R7JA 1QWGA 4A2SA 2VELA 3MP5A 4ORIA 2QR6A 3DFSA 3S1UA 3T40A 4KFNA 2X30A 3EX3A 4TMBA 1ONRA 2GOUA 5EYWA 1J5TA 4FO4A 4O8RA 1AL7A 3QEZA 3W83A 1LOSA 3L5AA 3STGA 1SSDA 3TJXA 5F1UA 2BX7A 2NWSA 5J5DA 1B4KA 4N02A 4LUJA 4JTJA 3W85A 3WK0A 1TPDA 3HO8A 3QMSA 4KFOA 2ZZ6A 4UTIA 2FPTA 3LX9A 5LZLA 1A5BA 5D02A 1XDMA 1X8FA 3W70A 3G0UA 1EP1A 4UTTA 3WK1A 3LOTA 4UR7A 2E5CA 4O4WA 3LRKA 5AC7A 4NXSA 2OT0A 2GJLA 4H6KA 4O14A 3EB2A 3EEGA 4KWVA 4DPQA 1ZALA 4HKPA 5AFDA 4IUOA 4IGHA 5HULA 1FCBA 1PIIA 4GFSA 1W1ZA 4UTWC 4WY0A 1UCWA 3LBCA 1R30A 4CCCA 3S6DA 3W7LA 2AGKA 4I7VA 4TIMA 2ZZ7A 3KOFA 2ZTJA 3PAJA 1WV2A 3O15A 5DLCA 3EKLA 5CPOA 3IGXA 4XQ6A 3TC7A 1UJPA 3L68A 1ICPA 4FHAA 3THAA 1LRTA 1K7XA 3MI3A 1GZGA 2FDSA 3IEBA 3LXCA 1YXYA 3LHUA 3C2RA 1SPQA 1OYBA 5HINA 2RKXA 1TV7A 1TIMA 1QO2A 3NDOA 2J9YA 2GQ8A 1OABA 3N2XA 1TPWA 3IV3A 1AW5A 4AWTA 1SZGA 5DY2A 1G4SA 5AC8A 5G2IA 4UCGA 1IXPA 5K4XA 3KRZA 3C8FA 4GJ1A 2QAFA 1XKYA 5HWNA 5F4WA 2BLEA 2GVGA 1LROA 3BLFA 2XN0A 2ISVA 2C1HA 1FWTA 3NZRA 1JVNA 1H62A 2CZFA 1JCYA 3UPWA 1YTDA 1OX6A 2QUTA 2TYSA 2VXNA 4JICA 1JQVA 1GVOA 1OK4A 1TRDA 2QCLA 3EXTA 5LHEA 1IXOA 1OX4A 2NUXA 4Z1AA 8TIMA 3GR7A 1KW1A 1MEIA 4FX7A 4IMFA 1SFLA 2A7NA 4UTWA 6ALDA 2ZRVA 4Y8FA 4AWUA 2YX0A 3R5EA 3W1NA 1Q3NA 3PULA 3OG3A 4D2JA 2B7QA 4QQ3A 3G1SA 5D05A 3KVKA 2A7RA 4CCEA 5A5WA 5U7SA 5AHNA 5D04C 1JR1A 1VLIA 2J6XA 3E49A 4WJEA 5F2MA 3RF9A 3BLEA 4FIQA 2D73A 5E1QA 3CWNA 1QFEA 5KSWA 3RLUA 3EX4A 1ZHAA 1SQ7A 1DVJA 3M16A 4NJHA 3QQ1A 3GKAA 3TSMA 1F5ZA 1ADOA 4WY0F 4NX5A 5AN7A 1M7PA 1JCXA 1VQTA 2H3BA 3NQ6A 1KM2A 2C18A 1R2TA 4LVGA 1Q6OA 3ATYA 4OE7A 3NXFA 3STCA 2A7PA 1X6UA 4M6VA 4AHOA 1L6SA 2O7SA 2X16A 1FCQA 2J9XA 1TPUA 3LRMA 2HSAA 2YDAA 3BK0A 1OVDA 2QCCA 1DJQA 4O13A 3PBVA 2PE4A 1Q6QA 3C2FA 4RZ6A 4A3UA 1L9WA 1YTEA 1KM3A 3QW4B 3PSWA 3G1VA 1VR6A 3WJZA 1GG1A 3IIXA 1H5YA 3DHDA 3TMQA 5C54A 4MFDA 3R13A 2V5BA 4UUIA 1BWKA 2ZQ0A 4RK8A 1G4TA 3TV8A 5KINA 3TA6A 3TXVA 3HOJA 3A24A 3W1LA 3GXNA 2R94A 1A5CA 1GYNA 2Z6IA 1N8FA 2WO5A 3W84A 4RX0A 3NG3A 1F76A 1KFEA 4YCPA 4UFJA 1TPH1 4YXGA 3NPVA 3UWQA 2E6FA 1Q45A 1G69A 3RNDA 1WBHA 2W79A 4O19A 4LC6A 4NZFA 4E2BA 3C6CA 2QCFA 5AHEA 3B0VC 5H91A 2PRLA 2NXHA 5HR7A 5TIMA 3SIZA 1NF7A 3M6YA 3GDMA 2R91A 2PRMA 1I2QA 2JKPA 3HQ1A 3E96A 3P61A 4NJJA 4P2VA 5T26A 4JS3A 2WOQA 1HL2A 3W1MA 5F2GA 4DELA 3WK2A 1KM0A 4ZVJA 4DO4A 4ADUA 4HSOA 3BPWA 3UXAA 1JULA 3E12A 4TU1A 1M7OA 2DZXA 3TW7A 3W88A 3ABQA 4HHPA 1MO0A 2DZTA 1Z44A 3FKKA 4IOTA 2DP3A 2ZBTA 2WSQA 3TDFA 2BZNA 3OVRA 3UZ5A 3C0JA 2XN1A 3ABOA 4IPJA 1IIHA 4IQLA 4K6AA 3BLIA 1DV7A 3B0PA 2NLIA 2RFGA 4LC8A 2DJLA 1RV8A 3DHFA 3UWYA 1W5QA 4AWSA 2CZEA 3TW6A 2EGZA 4UFLA 5G2HA 3GNNA 1FX6A 1XL9A 5L6UA 4ZQNA 1J2WA 3E9AA 1JQXA 3MBFA 4RR4A 4IPIA 5LGZA 1P0KA 3LERA 3W2JA 3NO5A 3TIMA 1F6PA 3YPIA 1TV8A 1U5JA 2EKCA 1EUNA 4NXKA 3G8EA 1XXXA 2Q3RA 3MP4A 2DORA 4UFMA 2J88A 4DF0A 1P4CA 1LP6A 5AOUA 1AL8A 1FXPA 3EXSA 3NL6A 2VFEA 2RDTA 4O4VA 3TQ0A 4BR1A 3OA3A 3BG3A 5D37A 5LNVA 1UBSA 1FWNA 1OJXA 4B5NA 5KMYA 3HG4A 3G1AA 2XN2A 3I7QA 2I14A 1VYSX 3LM7A 3M43A 3TROA 5CPNA 3P82A 4CQAA 1P0NA 3W7IA 5DN1A 1NAL1 1H7WA 2Y89A 4XTDA 2E6AA 4XWUA 1QR7A 4A29A 2G95A 2QEZA 4UFKA 3HGRA 1EIXA 3GX9A 1LDCA 4UMAA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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