5LGZA

Structure of photoreduced pentaerythritol tetranitrate reductase
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
AEKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Combining X-ray and neutron crystallography with spectroscopy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pentaerythritol tetranitrate reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Enterobacter cloacae
total genus 140
structure length 363
sequence length 363
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5lgzA00
3A5VA 4TIMA 4O4VA 2Q8LA 2CLHA 2Z2UA 3GDKA 1KM5A 3IIOA 3NQ6A 4UTLA 1H7WA 3EXSA 3NNTA 4OU1A 3QZEA 3P7YA 5F4WA 4DXVA 2CFFA 1I8JA 3M0ZA 4U28A 1G4EA 2I9EA 4BK9A 2GJLA 4LVAA 3C2RA 1HL2A 4MVAA 4ORMA 4NX5A 2G5WA 5HINA 3P8IA 5D32A 4Y6GA 3W7CA 5CGQA 4WQ6A 3MWAA 4NJJA 3LI1A 3PBUA 5FF0A 4TU1A 1TQJA 4UTHA 1GVSA 3GZ3A 4DELA 4XZ9A 1ML1A 4NNCA 1JQVA 1EPXA 4UC5A 1SR9A 4JTEA 4LUJA 3PB0A 1Q6QA 3W1TA 4I7WA 3ANYA 4K8HA 5K3VA 4RV8A 1YDNA 2YZRA 3FYPA 1M6JA 1WOAA 3ABSA 3DFOA 3ABOA 3M5XA 4C1KA 3TW7A 3W1UA 1TTPA 3I7SA 2O7SA 2E1DA 2HTMA 2LLEA 1OFPA 4ALDA 4XBKA 3MMTA 2QCHA 1AW2A 1LOLA 2Q3RA 3IVUA 3EWBX 1R30A 3CT7A 2R91A 3H54A 3NQGA 5G2HA 4IMFA 1W37A 4JYFA 2QCDB 4AMAA 3HGSA 3CIXA 3W1PA 1HG3A 1KM1A 1NSJA 1TMHA 1CX9A 2NV2A 1SUXA 1VCGA 1F5ZA 3VE9A 4UTMA 3G0SA 2W0UA 4AF0B 4TR9A 3M9YA 3PF3A 4N4PA 2G97A 4FNQA 3W85A 5G2IA 2ZBTA 4GFSA 4K37A 2C18A 1ME9A 5DY3A 1LORA 2Z6IA 2EF9A 4X3ZA 2V2HA 4O28A 3DFQA 4OGZA 1NFBA 3CPRA 1ONRA 3IIZA 4WXYA 3W7EA 1TTQA 2A7PA 3INPA 1OYCA 3B8DA 1GTHA 5H2ZA 5H91A 1J4EA 4UFJA 3SY5A 1PCKA 3CTLA 1GVOA 1JCXA 2FB2A 3GDRA 1OG0A 3TQ0A 1D9EA 4YCPA 4AHQA 2ABAA 5EPDA 3TIMA 1XCFA 2QF7A 2XN1A 4XBSA 3HG4A 3FJ6A 2E6AA 3W83A 1FXPA 1N55A 3O63A 3N9RA 1S5VA 1V5XA 2ZTJA 1TPEA 2H90A 2E77A 4NXSA 4QSHA 3EB2A 4QIUA 3T7VA 3W7HA 2G96A 1WBJA 2A2IA 1W5QA 1KFCA 4UTUA 3HMJG 1G4PA 3QSTA 3H53A 3TX9A 3LHZA 4C1LA 1FX6A 1TV7A 2GVLA 4XUGA 4A22A 2YFNA 3EX3A 2VKZG 3BLIA 3EXRA 1QAPA 4CQ9A 1SU5A 3LBMA 2R94A 3TK7A 5AHNA 1A5AA 3PUDA 2VXNA 3QMSA 2A5HA 3VNDA 4RK8A 3TMLA 2Y61A 3ZWTA 5F4XA 1K7EA 2OZ0A 2X16A 5AOUA 3HPZA 2E5CA 4FXSA 4ADTA 2DZXA 2OCZA 1VHNA 2V2DA 2GVJA 3M16A 1YXCA 4XTDA 1FDYA 3MJYA 4ZL1A 5FEXA 2WJZA 3LXBA 3LTSA 5DLCA 1K7FA 3C2FA 5G4EA 4Q32A 3UWQA 4WZHA 4IQLA 2NXGA 3LX9A 2EAWA 2H3BA 1VYPX 3M5YA 3TR2A 3A22A 3TKFA 3W71A 3BV4A 2QDHA 2F7FA 4E2BA 2JGQA 4Z1AA 2KZHA 3KRZA 3TFXA 3W7OA 4GXMA 2X1UA 4M7TA 3S1XA 3T4CA 3GXNA 5DCBA 3SSJA 3GNNA 4GNJA 4R53A 1R2TA 3V1PA 5AC7A 4CLMA 2NWSA 4O53A 3B06A 4GWEA 5LNUA 3RLUA 1O95A 3R13A 3UPWA 3SI9A 1W8SA 4N9BA 3TH6A 1WOBA 1DBTA 2YSWA 3W23A 2A21A 5BMXA 4ORIA 3TQKA 3HF3A 3O15A 5F4SA 3PWAA 4M7SA 2NXHA 3NAVA 3TW6A 2Y89A 4HKPA 4Z0SA 1YTKA 1LRTA 1HFBA 3NQDA 3WFAA 4TX9A 3U8GA 4FNRA 1LM1A 3IIVA 2VFDA 3OIXA 1TCDA 4PODA 4JTFA 5F2LA 3W7NA 3NYZA 2QJHA 2ZZ1A 2RHGA 5D38A 1I2RA 4LW7A 4UUIA 5K9DA 3DKJA 3EXTA 3IIPA 4O15A 3W7LA 5CPOA 2ZZ4A 3CHVA 1DKWA 5HWMA 4KFNA 3NPUA 1LYXA 3P67A 5IBXA 3W7KA 2ZZ6A 3NZ1A 4PA8A 2W79A 1XKYA 2CLKA 3G1DA 3LRLA 4LC8A 1DJQA 3TDFA 1N7KA 3S6DA 4UFMA 1QPRA 1JVNA 3W2UA 3WK0A 5E1QA 4ZQCA 3QYQA 4O1BA 1WA3A 3TUUA 1EP1A 3W7RA 1JQXA 1GJPA 5J5DA 4L4LA 3G0XA 4FNTA 4FX7A 1KM2A 1H50A 1OX6A 3LCGA 2EKCA 4FO4A 3ZFHA 3HG2A 5F1VA 2E6FA 7TIMA 1ZALA 4LVGA 1MEHA 2P10A 4UTJA 1OFQA 2J9ZA 2YXGA 4IUOA 3G1VA 1Q6OA 4JR5A 4MJMA 4K7VA 2R14A 1SZFA 1ZAIA 4K8EA 4J9JA 3T40A 1P5BA 2OJPA 3CWNA 1L9WA 4BR1A 2J24A 2BXVA 3TQVA 3CU2A 4NUWA 4Y8FA 2VEKA 5I3KA 3C4UA 1KV5A 3GNDA 3S0CA 4RJEA 3GX9A 3BW2A 4EVZA 1A5SA 3EKLA 1J2WA 3TFCA 4DO5A 1IGSA 1YLVA 3GXPA 2ZRWA 1KTBA 4PL1A 3LHYA 1SQ7A 4QJ1A 2IQTA 4GBUA 4FIRA 2UV8G 5I3HA 1Y0EA 1JR1A 3PB2A 3S5YA 3EWUA 5C55A 3L66A 4LS0A 1YPIA 4CNNA 1N8FA 4IXXA 1TPWA 2FPTA 5D2XA 3QQ1A 4AAJA 2D73A 2FB3A 1F2JA 4UMBA 5HJLA 4NJKA 1KFBA 3TXVA 2DJLA 2E6YA 2RH9A 4OWGA 4LNYA 1SO5A 3C3NA 2RDTA 3JS3A 3FOKA 2WNQA 4GC4A 1KFJA 4O0ZA 3BVJA 4NJHA 2AAMA 4XKYA 1C8VA 5CPNA 3UWZA 2Y7EA 1LDCA 4RZ5A 3NL3A 4MUZA 3W70A 1O5KA 1NF7A 2C3ZA 4CCDA 3RU6A 3PAJA 3IIXA 1TPC1 2NX9A 3W3OA 1XBYA 2DZTA 3W1QA 1Z44A 2A6NA 1QFEA 3V75A 1UUOA 2VEPA 2B0MA 3FKKA 4WJEA 3GKAA 1TB3A 4O18A 1VLIA 4XTIA 4JYEA 2PRLA 4AVFA 2QCLA 3UYCA 3EX4A 1F05A 4DEFA 5D03A 3L9CA 4S2CA 1PIIA 4UNKA 3P74A 3P8JA 2X30A 4CCEA 1RV8A 1I45A 3ABQA 3N3MA 3NO5A 2A7NA 1KLZA 1XBZA 3W2KA 2BSLA 1O94A 4BI5A 3R2GA 1OFDA 1PE1A 1IXPA 3KXQA 4OHQA 2QR6A 3MBFA 1TPFA 1M7PA 3QFEA 2NLIA 4O0KA 4CNOA 4JTHA 3W2JA 2CWNA 2P0OA 2RDUA 5CG7A 3ELFA 4AH7A 3Q58A 3IRDA 3DI1A 3P5YA 1SZGA 4ZVJA 2J88A 5D04C 2ZQ0A 4AB4A 1EP3A 1H7OA 3C56A 4NQ1A 1JRCA 1P4CA 5LNVA 1K8ZA 2VEMA 3O8AA 1I2NA 1PS9A 2QUUA 1F6KA 4HN4A 4PFMA 2V9DA 4JX5A 3SECA 2VFIA 4JN6A 2YYTA 3BW3A 1SZEA 4UMAA 5KZDA 3TAOA 4JD4A 5CSRA 3QJAA 3BO9A 1XI3A 1OVDA 3TNOA 3EKZA 1ZAHA 1FWRA 5E0KA 4BF9A 3FYOA 5KMYA 3PBVA 1D3GA 1CI1A 2QCEA 1L6SA 2J27A 2OT1A 4MYAA 4A21A 5BMWA 4QAIA 1I4NA 1H63A 2Y7GA 1H7PA 4QITA 2ABBA 3QRHA 4WD0A 3GR8A 3GVGA 1PL9A 3U2OA 2DZWA 1WBHA 3NA8A 5D2VA 5FEPA 1DOSA 3NQAA 4ADSA 1LTDA 4LVDA 2C0AA 3W1MA 3L5LA 1BTMA 3N2MA 3P60A 1OFEA 4NXKA 4O13A 4JTUA 1VH7A 1K8YA 2WSQA 5CZSA 2DJXA 3MBDA 5CZTA 3S5ZA 1X7FA 3DU0A 3AJXA 4I7VA 4BI7A 4PL2A 4R33A 4LRSA 3DH7A 2FJKA 3DENA 4JY9A 2W6RA 3K30A 3CIWA 3M47A 1LCOA 2O7QA 3MYOA 3ZS4A 1VHCA 1EWDA 2QCCA 1IF2A 2V30A 2QJIA 4GUIA 3LBCA 1UUMA 3HJZA 3LCXA 5DY2A 3KHJA 2YR1A 3C6CA 3C2VA 3FEMA 3F4WA 3LHVA 1UCWA 3UQNA 2OMAA 2RDWA 3M44A 5DBTA 2ZRYA 1G7VA 3MI2A 2H3DA 3EEGA 4XWUA 5LKYA 4GUJA 4O10A 4WUIA 2DZVA 5D30A 3UY8A 3W7PA 3GDLA 5FF2A 1OJXA 2QCDA 4XQ6A 3Q37A 4PH6A 3L0NA 4EF8A 1XUUA 3G24A 4PC8A 4RX0A 3OA3A 5AB3A 1GVQA 2DU2A 1OF6A 5CZJA 1OX4A 2F84A 2GUUA 1LLWA 1PCWA 2R8WA 1S5WA 2HS6A 3KVKA 4H3DA 2Z0IA 1NF0A 1OHLA 4ZZ9A 2Y7FA 1F74A 1O4UA 3HGOA 3HG3A 4N2YA 4YL2A 3OHIA 2A1YA 4O1CA 2FLIA 4UTIA 4HNTA 5TIMA 1ADOA 5LZLA 3L0GA 1OFRA 4S2BA 1EUAA 3CWOX 3NXFA 2Y85A 4LRTA 3NEVA 5FI8A 2V5LA 4MY1A 4ADUA 3LXCA 4X9SA 5KZEA 4GUHA 3N34A 3P81A 3G1YA 1RZMA 2BWGA 3GXTA 5DELA 3W1LA 5K7JA 4BWLA 1K7XA 1TJRA 4JIQA 1R2RA 3PULA 1ME7A 3PSVA 3O6DA 4JX4A 3MP5A 3NQCA 3GAKA 1Q6LA 1AK5A 2FTPA 4KWWA 1QPNA 4NNAA 4UTWC 4UTTC 1G6CA 3NPWA 3NZRA 3NQEA 3B03A 1ZCOA 5J5RA 4K36A 4N4QA 1TTIA 3BLEA 4IGHA 5HNRA 2NX3A 4HIBA 4IMDA 2E09A 3A5FA 4Y96A 1IXOA 2Z1BA 5F2MA 2X2GA 3OVRA 2FQIA 5KTLA 3MI6A 1OYBA 3I65A 3C2EA 1XBXA 3P62A 1H1ZA 1OABA 4FX6M 1H7NA 2Q3OA 1QDSA 3EWYA 2GOUA 2C16A 3DFTA 3L2IA 3STGA 1ZHAA 1XFBA 1K03A 4OQVA 3W7DA 3B0UX 1IIHA 1P1XA 2CLFA 1SSGA 5AHLA 2VFFA 5FEZA 4PTNA 5CSSA 3W88A 2CLIA 3A21A 1G69A 3B04A 4LV9A 1LRQA 2VOMA 3L68A 4NZJA 3RK8A 3P82A 1TPUA 4UFLA 1C29A 3QEZA 5HUPA 4OV4A 4JTLA 4UFKA 2ZZ7A 2J6XA 3O1NA 1H60A 1SSDA 3F03K 5C54A 3UWWA 2AQWA 1UBSA 3LI0A 2YPIA 1ICSA 1CW2A 4GUFA 2JGYA 4GRSA 5FESA 3RFAA 5IM51 1M5WA 3LHTA 4AWSA 3NOEA 5DBUA 1IXQA 3PBWA 3PG9A 1JJKA 3B4UA 3FS2A 1FQ0A 2WNZA 2V81A 4QNEA 1T8XA 3TCEA 3N73A 3MP4A 3G0UA 1RVGA 2J9XA 1GG1A 1JCNA 1E51A 2C6QA 2Y70A 3G8EA 3B0VC 4FEZA 4MY9A 2BTMA 3LCWA 3G22A 3W1NA 1LBFA 3L65A 1XL9A 5LGXA 4Z1DA 1GG0A 4DF2A 1RQEA 4ICNA 4UNLA 1VC4A 3EWXA 3LOTA 3QSRA 3LGEA 1EUNA 1H1YA 4P2VA 4DPPA 4KKXA 2YYUA 2ZYFA 3KVMA 4ZQOA 3NG3A 1VRDA 3E02A 1QO2A 5G4WA 1FCBA 2NXIA 4NX0A 3RLVA 5HULA 1MEIA 3H55A 1AMKA 1X1ZA 4GE8A 4RZ4A 3QW3A 3T44A 1JUEA 1OK4A 1B9BA 2OX1A 3M41A 4S1FA 3W74A 1THFD 4JDYA 1Z41A 4LVBA 1D3HA 3LCLA 1MO0A 1EIXA 3NM1A 1OF8A 1FUYA 4JTTA 3HO8A 5A8GA 4O12A 3C61A 5HMSA 3MP3A 1KBIA 4NZFA 1DL3A 3GK0A 2V82A 4A2SA 4DQWA 3C8FA 5EBUA 2ZZ5A 1VGAA 4UFHA 4IJBA 3FA5A 2NZLA 1QWGA 3KOFA 2ISSA 2H8ZA 1KLYA 3DFSA 2FIQA 3DHDA 3W76A 5TQLA 5KINA 4YCOA 2RFGA 4LTSA 3UNDA 4N9CA 1KTNA 4JTIA 1NAL1 8TIMA 2WSRA 1G4TA 2ZRXA 1SO4A 1MEWA 1KTCA 1TSIA 4TMCA 1ZAJA 1JCLA 4LS1A 4WOZA 3G3MA 5G5IA 3A23A 4ZQNA 4M6PA 3BG3A 3PBYA 3QPZA 3DFPA 4MYXA 2EPHA 4OT7A 2JKEA 3FFSA 2HS8A 2TSYA 2WOQA 3QMTA 1B4KA 3LCFA 4M6QA 3UWYA 3GKFA 2HMCA 1Z42A 2BX7A 5D2TA 4WOQA 3HGJA 2VELA 4UFIA 2CLEA 5LHFA 3RNDA 3BPWA 3S8HA 4TMBA 5F2IA 4K7YA 3TJLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2Z2U A;  3VIH A;  4LUS A;  5GPR A;  1FFR A;  4UTL A;  3B9E A;  4OU1 A;  3QZE A;  3SCP A;  3DC0 A;  5F4W A;  4U3A A;  1G0C A;  4U28 A;  4RE0 A;  4AEF A;  2IW0 A;  3IJQ A;  2EKG A;  3T05 A;  1HL2 A;  4ORM A;  1G1Y A;  2G5W A;  1OAD A;  4IP5 A;  4HU3 A;  3QV9 A;  3ZM8 A;  2W63 A;  4WQ6 A;  4K1G A;  4ZO6 A;  1CGW A;  4MNM A;  1E0X A;  4TU1 A;  1TQJ A;  1XR2 A;  1M7J A;  4DEL A;  4FAL A;  1QBA A;  1EPX A;  4UC5 A;  4H6R A;  4LUJ A;  4D8Z A;  3LA4 A;  3W1T A;  4I7W A;  4PUU A;  1ZP4 A;  1MDR A;  1YDN A;  1DWJ M;  3SIM A;  3ABO A;  4GKL A;  3TW7 A;  3EWD A;  4HHH A;  1W3L A;  2LLE A;  1BSI A;  4XBK A;  2OZ3 A;  3AC0 A;  2Q3R A;  3IVU A;  3EWB X;  2BY2 A;  4L6H A;  1H2J A;  3CT7 A;  3H54 A;  3NQG A;  4FPS A;  2Y5E A;  1Y5V A;  3GWQ A;  3CIX A;  1NSJ A;  1F5Z A;  2W0U A;  4TR9 A;  2IKG A;  3K2G A;  3PF3 A;  4N4P A;  2X2Y A;  1GJW A;  2G97 A;  3QVQ A;  3KS6 A;  3V5O A;  3R8G A;  4GFS A;  4K37 A;  1ME9 A;  1LOR A;  3QN3 A;  5DQP A;  4D71 A;  3JVA A;  3KOX A;  4WHB A;  3GG8 A;  4IL0 A;  3T09 A;  1S2W A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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