5SWUA

Dehydroquinate dehydratase from a. fumigatus arom
Total Genus 85

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
DSLGTIKKKQHSFFVSLTLPDVRGADQILEQACVGSDAVELRVDLLEDPDSSNGIPTVDFVADQISYLRSRITLPVIFTIRTKGQGGRFPDDAHAEAMQLYRLAVRSGCEFVDLEIAFPDEMLRAVTEMKGYSKIIASHHDPNGELSWANMSWMKYYNRALEYGDVIKLVGVARNLDDNTALRKFKNWAEEAHDVPLIAINMGGNGQLSRILNGFMTPVSHPALPFRAAPGQLSATDIRKGLSLMGEIKKG

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Neosartorya fumigata (strain cea10 / cbs 144.89 / fgsc a1163)
publication title Dehydroquinate dehydratase from A. fumigatus AroM
rcsb
molecule keywords Pentafunctional AROM polypeptide
total genus 85
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.25: Shikimate dehydrogenase.
pdb deposition date 2016-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5swuA00
3WFAA 3TE9A 3PBUA 4AB4A 3W7HA 3W1MA 1YXCA 3W86A 5ABTA 1W3TA 4O17A 4DEFA 3OG3A 2TMDA 5K9XA 3UD6A 2A7PA 2ZZ4A 2EGZA 1FQ0A 1QAPA 1G6CA 4LWWA 1YDVA 5I3GA 3G1XA 4O1CA 4RV8A 1SQ7A 4X2RA 1VGAA 4ZL1A 5C55A 1UUMA 2QF7A 4O4WA 4JIPA 4GC4A 3TMQA 2QKFA 2CLFA 4FEZA 3QRHA 2E77A 1LLZA 4GUIA 1BWLA 2ATMA 4IMCA 3R13A 3GKAA 4BFAA 3WJYA 3M7WA 3FA5A 3BO9A 3W74A 1R2TA 2EPHA 4IQLA 5D2VA 4MYAA 1OF6A 1WAUA 4FB7A 4IMFA 2V2HA 5HWNA 3GIYA 3W7DA 2PE4A 2Z6IA 3TAKA 1QOPA 1QOQA 3KVJA 2TRSA 3S1VA 3S0CA 3CIXA 3WK3A 2QCHA 5LHFA 5J5DA 5HWMA 3W2KA 3EWYA 1H7PA 3G1FA 1XDLA 4QITA 3ELFA 2B7OA 4WXYA 3MBDA 3THAA 1J2WA 4MIMA 1LOLA 2A0NA 4O28A 4EVZA 3ABQA 2H8ZA 1DHPA 1FDJA 1FWWA 2ZZ7A 4M19A 2QUUA 1N55A 2JGYA 3B05A 4TX9A 1DQXA 4UFKA 3C0JA 1XC4A 3O8AA 3FIGA 1FCVA 3O6CA 2V5LA 1WA3A 3PUDA 2ABAA 1XBVA 5FF7A 1LDCA 2X1UA 1SZNA 2GUUA 3ZS4A 3CU2A 3NQDA 3CPRA 3LTYA 4LVDA 3GXNA 3MHFA 4K8EA 3QYQA 3W70A 5TIMA 3UYCA 1VH7A 4JYEA 1I45A 3G1AA 1Y0EA 2E6DA 4Z1BA 4JTJA 2CU0A 4PL1A 1QDSA 3TC7A 8TIMA 5DCBA 2E5DA 2UV8G 4CLMA 4CQ8A 3RMJA 2EF9A 1H7OA 1H7NA 1B57A 3SSJA 5HJLA 1NF7A 4NXKA 3LLFA 3W2MA 4HNNA 3G3DA 3IIZA 4A3UA 3SI9A 4JDYA 3P67A 2V0TA 2J9ZA 3BW2A 4EOUA 5G2IA 2A7NA 1TPEA 4BK9A 5FEPA 3RNDA 4HPJA 1O95A 3LI0A 4LC6A 5FF0A 4FF7A 1L9WA 6TIMA 2A7RA 3WK0A 2E5CA 4NVTA 5DCDA 1YDNA 5FF4A 4DF2A 5D09A 5E1QA 5D37A 4E2DA 1AW5A 1ZAIA 3TA6A 3FKKA 3LI1A 3W2UA 4ORMA 4LC8A 3HB9A 5D30A 5LNUA 1WDWA 4LY8A 2C3ZA 4O15A 3T40A 1AK5A 2CZ5A 2WV8A 3W3OA 3W6YA 2C15A 3N34A 4YXGA 5F1UA 3W1NA 1OHLA 1X8FA 4NNAA 3DKJA 4K7YA 3FYPA 5D2TA 1WQ5A 4RZ6A 5AYYA 2FPVA 4Z1CA 4L4MA 4K37A 2Y63A 3MUXA 5LGXA 4JTUA 1YXDA 2VC6A 3G1VA 4EIVA 5K9DA 2R8WA 5AC6A 4IUOA 4CNOA 1F76A 2FPYA 2ISWA 1SW0A 1TV8A 3OHIA 4O18A 1ZENA 3G0SA 5LZLA 4UUIA 5A5WA 2GPTA 3RLVA 3THQA 2VEIA 1BKSA 2D73A 2ZRXA 3MMTA 1JQVA 1OFPA 4NU7A 5HMSA 3CIWA 1ME7A 1T96A 1IXNA 3SGUA 3LHWA 3NPVA 1T8XA 2E68A 1AMKA 2NZLA 3C2VA 3N9SA 5DBUA 5LNVA 3O63A 2CZEA 4O1DA 5EKYA 4OV9A 4QM1A 3C2EA 2DZSA 1H61A 3W7NA 5AHFA 2OX1A 2R94A 1EP1A 4O53A 2B7NA 3DFOA 4M5PA 1FCBA 5CZSA 3O1NA 1W54A 1H63A 4PEKA 2WKJA 4X9SA 2WO5A 4WY0F 4PTNA 1ONRA 5G2WA 3CB8A 3CEUA 3SJ3A 2RKXA 2A2IA 3W1AA 4X22A 4A29A 1WBJA 3TFCA 2WQPA 1VC4A 2P0OA 1KFJA 1SZGA 3KX6A 3TSDA 4TO8A 1XBZA 4MKNA 1FWTA 3EB2A 2X1SA 1DJNA 4BR1A 5AHNA 3MI3A 3W7QA 2JGQA 3T7VA 3EX4A 4NNBA 4N2YA 4LNYA 3W2LA 3G8RA 3S5NA 1XCFA 3F4WA 3PUOA 2QAPA 4K39A 4ALDA 3TV8A 5D2WA 2FB3A 1WX0A 2O7QA 2CLOA 4PC8A 4S2CA 3P81A 5AYXA 3UZ5A 5EBUA 1A5AA 4OGZA 4LV4A 3RFAA 3P74A 2WJZA 1X6UA 2QCLA 3CEPA 2ZFAA 4IWWA 2V5BA 4AF0B 2NX1A 1H7XA 5DBTA 4GFSA 5CZJA 3VNDA 1UBSA 2YXGA 2WSRA 4FHAA 1P5BA 4NUWA 4R53A 1I4NA 1QFEA 2Y7DA 2CLKA 4XBKA 3NQVA 3LBCA 4O11A 1MEHA 3G0UA 2GQ8A 1D9EA 1Q6LA 2OZ0A 4P2VA 3TH6A 3E49A 3BVJA 4UTJA 1LOQA 2YW4A 2H3DA 3M47A 3GAYA 4UTWA 3GB6A 1KLYA 3P84A 3ZFHA 1GOXA 4M7SA 3S8HA 4ADSA 2QDGA 4JY9A 4L4LA 1VJIA 2C1HA 1QPQA 2ZBTA 2VFGA 3A24A 2HS8A 1Z44A 4O12A 3LCLA 2HSAA 3CC1A 3B0UX 1PHQA 4JN6A 1A5SA 4GUHA 1JJKA 5DXXA 3ATZA 1THFD 4RJEA 3FLUA 4JX4A 1GYLA 1KTCA 2W6RA 2QUTA 3W7CA 4O14A 1TQXA 3G1SA 3HG3A 4LU0A 4Q32A 3TSBA 1M6JA 3CHVA 3HBLA 1RQEA 3S42A 3KHJA 4WD0A 3NGJA 1PVNA 4JTTA 2ZRUA 2X1RA 3A23A 1ALDA 1O60A 3W71A 4UTTC 1EWDA 4BI6A 4HSNA 5D02A 3M43A 1U5JA 3KXQA 1IXPA 3S1XA 2Q3OA 2RDWA 1LOSA 1RD5A 2P10A 3W75A 2DJLA 1F5ZA 1SO4A 3W1PA 1F74A 3G3MA 1NEYA 3W7IA 1XDMA 2NV1A 5CZTA 3NAVA 3HGJA 4UNLA 3F4NA 4UTHA 1W37A 3B06A 1IIGA 3MJYA 2Y70A 2G95A 4O50A 3MP4A 4PFMA 2C0AA 4GE8A 3C2RA 3W7EA 4EF9A 2BLEA 3W1RA 3NL5A 3PBYA 3R2GA 2NX3A 4C1LA 1TJPA 2KZHA 3IGUA 1MO0A 1SSDA 2QCCA 3A9IA 4GWEA 1TCDA 1VRDA 2Z0IA 4JXCA 1AG1O 2R91A 1Q45A 2CLIA 4LVFA 5EYWA 1V5XA 1OX6A 1H51A 2V8ZA 2OMAA 4RXGA 4DO5A 3LHUA 2ZA2A 4UR7A 3NVTA 3PUEA 1KLZA 2AQWA 2YPIA 3O15A 4TR9A 3B0PA 3I68A 3NQEA 4KFNA 1TPVA 3W84A 2ZTKA 1EP2A 5D05A 4YL2A 1KM1A 3HG5A 3GAKA 3CTLA 1Q3NA 3E02A 3LM7A 2DU2A 3O6YX 4AWSA 2ZQ0A 4P61A 3G8EA 1K8ZA 1TMHA 2ZA3A 1ZHAA 2VOMA 3SFKA 4N9DA 4UNKA 3GDTA 5BMWA 5LKYA 1GYNA 1QR7A 2ZDRA 2C6QA 2QJGA 2Y6ZA 1SO5A 2VFHA 4Y6GA 5CKSA 4ZQOA 4LOCA 3CQ0A 2ZRVA 1ZJIA 2QUVA 4RCXA 3DFSA 2H90A 3IIPA 1XUUA 4K7VA 1DL3A 5D2XA 3O16A 4UC5A 2NUWA 4DPPA 4RXFA 1DVJA 5IBXA 2ZRZA 4GUJA 5CPLA 1EIXA 4ADTA 4IPJA 1VYRA 1ZFJA 3S1WA 3G1YA 3E9AA 4OU1A 4UTIA 3PSVA 1JRCA 1EUNA 2ZZ3A 1L6SA 3B4UA 4JTLA 2V82A 2G5WA 5CPNA 3KVKA 1G7UA 2VFIA 4QJ1A 5AOUA 4NJKA 4D2JA 2BZNA 5I3JA 1OFBA 3IIOA 4UFLA 1N7KA 1R2RA 4A22A 4JTSA 3VKJA 3LTSA 5FF3A 1B3OA 3EWBX 3P8IA 3Q2DA 3EEGA 3W23A 4N9BA 2Z6JA 1WYIA 5IBXC 4YWIA 4YCOA 3LXBA 3QSTA 1K3UA 5E93A 3IGSA 4FX6M 1M5WA 4MY1A 2X30A 3P62A 2QDHA 2E6AA 3NG3A 3INPA 2QCNA 2TPSA 1PL9A 3B03A 4O8RA 3EKLA 4HPXA 2BXVA 2CWNA 2VEMA 3ATYA 3PC0A 3TW6A 4H4IA 1TPDA 3W9ZA 4PCFA 2EHHA 3LOTA 1VLIA 1XXXA 1UJPA 1I8JA 4K38A 5FEZA 1EX5A 4Q4KA 3W1QA 3LHVA 4A21A 3SZ8A 3UQNA 1K03A 3HPXA 2XN0A 3IVUA 3NNTA 5U7SA 2VKZG 1W31A 1ZY9A 1KFLA 5I3FA 3HGOA 4Z1DA 3HPSA 3MWAA 4O54A 3CWNA 3A5FA 3UWYA 3NDOA 4UIOA 4DO4A 1FWRA 1FXQA 3OVQA 4GJ1A 1W56A 4MLJA 3H54A 3S5OA 4UMBA 3N2MA 3G22A 3UWVA 5F4WA 1KW1A 4DQWA 1JUEA 5G2HA 2Q3RA 4HHPA 3PB2A 4N6FA 1FDYA 3GK0A 3FS2A 4JDBA 4OBTA 4AHQA 1R2SA 3BK0A 3C8FA 1Z42A 1FWSA 2DZWA 2LLEA 3MHGA 4J9JA 3NQGA 1OFOA 5AC7A 2X16A 1KFEA 1TRDA 3EX1A 5E0KA 5TQLA 2DZUA 4JX6A 5MHBA 4YMZA 3MYOA 2PCQA 1OFQA 3KVLA 1GZGA 4AF0A 1VHCA 4HNUA 2XN1A 5HINA 3M5YA 4EF8A 1NVMA 2FPTA 3DH7A 2A4AA 3MI6A 1OYCA 4NNCA 3LHTA 4FIRA 2DZXA 4JIQA 3VE9A 4ZQRA 3U6WA 3BW3A 1GVOA 3NQ7A 4NX0A 3RF9A 4AHPA 3IIVA 3L0KA 1XM3A 4NX5A 4AAJA 3EXTA 3ABRA 3NL2A 1RQHA 3W2NA 3CT7A 3MW7A 4GRSA 3C2OA 1ML1A 1OX4B 4R7JA 2YSWA 5AHIA 1A5CA 2WPBA 1JCXA 4JTGA 3YPIA 5K4ZA 1JCLA 1IF2A 2YX0A 1RQBA 4XBSA 3UZJA 1Z41A 1ZNNA 4JTEA 1XFBA 1W5PA 3I65A 1H1YA 2VFDA 5BW6A 4DF1A 5D2YA 1CW2A 3NPUA 5D32A 1HUVA 4JD4A 1L2UA 1JUKA 1W5OA 1KFCA 1TPWA 1ME8A 3GR8A 1NSJA 3W7PA 1QNVA 4RKAA 4O19A 4M6QA 4OQVA 2Y85A 1G4EA 4QISA 1P1XA 2WSYA 2HMCA 1I2QA 2VEKA 1GTEA 4IX2A 2Y7EA 1O4UA 3N73A 2XN2A 1XI3A 3SR7A 3A5VA 3KFTA 4IMEA 4W9TA 5HWJA 2Y7GA 1EB3A 4ADUA 4LS2A 3P5YA 1K8XA 1A5BA 5HUOA 4Z1AA 4LUIA 3MYPA 3TAOA 1GVRA 3E0IA 1YTKA 3I7QA 1ME9A 3LGEA 1VCGA 4KFOA 1FY6A 3G24A 1VZWA 1LBFA 5K9CA 1K02A 4UFHA 2GVLA 5DELA 1TTIA 3IIXA 5F2LA 3EX2A 3F03K 4OT7A 1OFDA 4NZJA 4HIBA 1XBYA 1TYGA 1TREA 7TIMA 4IMGA 4K6AA 4S2BA 2PRMA 3L66A 4AH7A 2ZRYA 4Y90A 4HT3A 4RZ5A 4KKXA 4O4VA 3LXAA 3W07A 1PHWA 5C5YA 2C14A 3HF3A 1LCOA 5K4XA 3GVGA 4OWGA 4BWLA 3HIJA 5DY3A 2FB2A 4XTIA 3HJZA 3M41A 2NWRA 1SW7A 2CLLA 3AO0A 2ZZ2A 1KTBA 1M7PA 2J6XA 3WK1A 1OF8A 5CPMA 5K7JA 3WJWA 3FOKA 4WOQA 2P1FA 2VEPA 2CZDA 3LLDA 3LXCA 4FNRA 3W1TA 4MVAA 3MP3A 3N14A 1I2NA 1VYSX 4ZMGA 3LV6A 4XUGA 1MEIA 5KZDA 3M9YA 3NM3A 2NUYA 4IPIA 4Z08A 1KM3A 4GNJA 3EWUA 3FKRA 3W83A 4FXRA 4AHOA 3TNOA 4R34A 4N9EA 3TFXA 3W88A 2GOUA 1OG0A 1KBIA 5G5IA 3UNDA 3W73A 3LB0A 3S1UA 5F4XA 3TIMA 4WUIA 2XFWA 3UWUA 3LCXA 3BGGA 3DKLA 3PM6A 2WNNA 3C52A 1T0OA 2B7QA 2RDTA 3O06A 1RZMA 1KA9F 3PWAA 5DLCA 4NQ1A 3QM3A 1NAL1 3H53A 2E6FA 1HFBA 1JRBA 1SUXA 3M16A 4N6EA 3TU9A 4LV9A 5EMUA 1RPXA 2DORA 3QPZA 2BX7A 6ALDA 4CQAA 3IGXA 4WJEA 2QR6A 5GVJA 4O57A 5G1TA 3GYEA 5LHEA 3TC6A 1Q6QA 1EA0A 1B9BA 2B0MA 1XL9A 4FNTA 3BW4A 1VS1A 4LUJA 3HGSA 1NFBA 3TW7A 3Q58A 3M0ZA 3BLFA 4ZQPA 2H6RA 1HO4A 4WQ6A 2Z2UA 3NA8A 1N8FA 1ICPA 2X1TA 3T44A 1QCWA 2CLHA 3BGJA 3H55A 3QJAA 3DU0A 2A1YA 2NXHA 5EL1A 1SPQA 1ZAHA 4E38A 2Y88A 4FX8A 5G1YA 3NOEA 3TDFA 2QJIA 3PSWA 1QPNA 3EWXA 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 2WNQ A;  3UPW A;  3NO5 A;  1F05 A;  3C61 A;  3UXA A;  2R14 A;  2J9X A;  3UXD A;  5TBO A;  4O1B A;  5F2M A;  3TRO A;  1S3H A;  4UTL A;  1UCW A;  4UMA A;  4JTF A;  3Q37 A;  4HN4 A;  2RH9 A;  1GPW A;  3IEB A;  2VFE A;  3S5Y A;  2A6L A;  2F84 A;  4JGD A;  3L21 A;  1YAD A;  3GDM A;  3QF0 A;  3BLE A;  3P7Y A;  4JTI A;  4XKY A;  1LRQ A;  1FUY A;  3AJX A;  1LBM A;  4ZQN A;  1JUB A;  3QQ1 A;  4I7V A;  3TXZ A;  3PR2 A;  1O5X A;  4POD A;  1EWE A;  2QCG A;  3N19 B;  4NXS A;  1A50 A;  5FEX A;  1ZCO A;  3G1H A;  2FIQ A;  4AXK A;  2DP3 A;  2G97 A;  3QMS A;  5C54 A;  2ZRW A;  1TQJ A;  2Q8Z A;  2QEZ A;  1FXP A;  1TPB 1;  4Q33 A;  3BV4 A;  4N02 A;  2QAF A;  4QQ3 A;  3QFE A;  3W7R A;  3W1X A;  1G7V A;  3C2F A;  1TRI A;  4GXM A;  3LRK A;  1K7X A;  3PF3 A;  3C3N A;  5EPD A;  2VEN A;  3WJS A;  3L68 A;  1PCK A;  5FI8 A;  3NYZ A;  4BI7 A;  4C1K A;  3QEZ A;  3L0N A;  3LHY A;  3W72 A;  3UWZ A;  3P5Z A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3WFA A;  5ECU A;  4AB4 A;  5BRQ A;  3I3D A;  3W1M A;  1YXC A;  2OVL A;  3PZN A;  5CC5 A;  1CNV A;  4QP0 A;  3WLJ A;  2A7P A;  4IFK B;  1FQ0 A;  3FW6 A;  1F3X A;  1G6C A;  5I3G A;  3IWP A;  2VQT A;  3BSH A;  3G1X A;  1FH8 A;  4O1C A;  4RV8 A;  3AFB A;  4FXF A;  4NRS A;  4JIP A;  4GC4 A;  4FOK A;  4S3J A;  1A5L C;  1MMF A;  4FEZ A;  2OGY A;  2E77 A;  1LLZ A;  4GUI A;  1SJD A;  4GCA A;  2ATM A;  4IMC A;  4B16 A;  1UQY A;  1AZ2 A;  1LQ2 A;  4QJ4 B;  3RCM A;  3C2Y A;  3EMQ A;  5HJY A;  3GS6 A;  1R2T A;  4IQL A;  1B90 A;  4FB7 A;  2XZ9 A;  4AD5 A;  2V2H A;  3TAK A;  4ZA0 A;  2WZI A;  4OIF A;  3S1V A;  2QCH A;  5LHF A;  3HMC A;  4HU3 A;  3W2K A;  3EWY A;  1H7P A;  2F6X A;  3G1F A;  5H8P A;  4LUT A;  2XHY A;  5I03 A;  1PWL A;  3ELF A;  1TVP A;  1OCB A;  3MBD A;  3OBA A;  2A3B A;  4W7V A;  4MIM A;  2DPE A;  1A5M C;  1V6V A;  3ABQ A;  1DHP A;  2D0H A;  3UJS A;  3DYO A;  1URO A;  3T0C A;  3BUV A;  4AY8 A;  4H41 A;  1OIF A;  4UFK A;  3C0J A;  1XC4 A;  3KDO A;  3PUD A;  1G0C A;  5I7G A;  5FF7 A;  1LDC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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