5SWUA

Dehydroquinate dehydratase from a. fumigatus arom
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
DSLGTIKKKQHSFFVSLTLPDVRGADQILEQACVGSDAVELRVDLLEDPDSSNGIPTVDFVADQISYLRSRITLPVIFTIRTKGQGGRFPDDAHAEAMQLYRLAVRSGCEFVDLEIAFPDEMLRAVTEMKGYSKIIASHHDPNGELSWANMSWMKYYNRALEYGDVIKLVGVARNLDDNTALRKFKNWAEEAHDVPLIAINMGGNGQLSRILNGFMTPVSHPALPFRAAPGQLSATDIRKGLSLMGEIKKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Dehydroquinate dehydratase from A. fumigatus AroM
rcsb
molecule keywords Pentafunctional AROM polypeptide
molecule tags Hydrolase
source organism Neosartorya fumigata (strain cea10 / cbs 144.89 / fgsc a1163)
total genus 85
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.25: Shikimate dehydrogenase.
pdb deposition date 2016-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5swuA00
1GWJA 3NPXA 2CFFA 4XTDA 3W1TA 3PBVA 3QMTA 2NX3A 4X22A 3S5YA 4LV9A 1W8SA 3LHUA 5F1VA 3PB0A 4Z08A 3NZRA 2Y7DA 2Q8ZA 3H55A 4N4QA 3ATYA 1TSIA 1IIGA 2ZA3A 4HIBA 3O05A 2QCCA 2QKFA 2WSQA 3FOKA 4JTFA 1GYLA 2CLFA 3EXSA 4UR7A 1RPXA 1YPIA 1EWDA 4Z1BA 2V5BA 4LNYA 3VCRA 2R91A 3LTSA 3QSRA 3HIJA 2BWGA 2RKXA 1GVQA 5KITA 5D2WA 1TTQA 1FWSA 2XN0A 1GZGA 2BXVA 3NQMA 2ATSA 5EPDA 2WV8A 3KX6A 3UNDA 4BI5A 5FF0A 5IM51 4LV4A 4HPJA 3W1RA 1P0NA 5AC7A 1XDMA 2B7OA 3JS3A 1OFDA 3EWZA 3R89A 3E02A 2CW6A 1YDVA 3OVRA 3P8JA 3W87A 2YPIA 2YX0A 1OYCA 3PVFA 4PTNA 4FB7A 1TJRA 1F2JA 4IPJA 4DF1A 3W75A 4NJKA 5G2IA 1K8ZA 1W5MA 3Q58A 3LLDA 5KTLA 3IV3A 4UR8A 1OX4B 5CG7A 4ONVA 3M1ZA 3L5AA 1OF6A 2I9EA 3HGSA 1O5XA 2EPHA 5DY2A 4JTIA 3TAKA 3PC0A 1TPB1 5EYWA 1UCWA 1AK5A 5EY5A 1MO0A 4YLWA 1G4TA 1VJIA 5H91A 5F4WA 2V82A 4I7UA 4IWWA 5D03A 4O1AA 1LYXA 1UJPA 3NQAA 3N9RA 3V1PA 2D73A 3G1YA 4UTWA 2GQ9A 4UIOA 3QM3A 4K39A 4LUJA 4NX0A 1LDCA 3M5ZA 3C2RA 5BOOA 1LOQA 4ADSA 1DL3A 2J27A 1L2UA 4N9DA 1F6KA 5HUOA 2CLIA 1GT8A 4E2BA 4AXKA 1EP3A 3WJXA 4LY8A 3LHYA 1R2TA 3QPYA 2O7QA 5LNRA 3S6DA 1JRCA 3MJYA 4UFMA 3NL3A 5FEWA 3H54A 1ICPA 1VH7A 1G6CA 5TBOA 4LVFA 3DFNA 3NNTA 4WY0A 1Q6RA 3LHVA 3WJSA 2TPSA 3EX4A 1Q6QA 1V5XA 3LBMA 4MPQA 5HWNA 5LZLA 3CQ0A 4OHQA 3W7PA 1PL9A 1TV7A 4ICNA 4WZHA 1FUYA 4NX5A 4KFOA 3LTPA 4U28A 3RK8A 2YW4A 4U4MA 2E6YA 4WUIA 4LT9A 3PBYA 4GUJA 1K3UA 4QIUA 4WOQA 1VHCA 3BLFA 3TJLA 4Z1AA 3EKZA 4ZQNA 3HGJA 3NQFA 1FX6A 3DI1A 4KFNA 3MP5A 1Q6OA 3IVTA 1VYPX 1VYSX 1KLZA 1KM5A 1NEYA 2A5HA 3TW7A 1KM6A 3OG3A 1X8FA 1EWEA 5K7JA 2CLEA 4CLMA 1JQVA 2BZNA 2H90A 2VEMA 1AG1O 1OX5A 4PFMA 4HSOA 3NO5A 4ADUA 4Q32A 3KOFA 4Y96A 3NQ7A 4S1FA 1ZALA 2LLEA 2NXIA 3QH2A 3KRSA 5CPOA 2YYUA 2YFNA 4O13A 2GUUA 3NQ8A 2C1HA 3LCXA 1J4EA 3KRUA 3WK0A 3GR7A 3KXQA 5HR6A 4GUGA 3CHVA 1QMLA 2PC4A 1XBZA 2C14A 3S0CA 1DBTA 1JQXA 2ZDRA 4ZQPA 3L0KA 4RZ5A 2GQAA 3BGGA 1FWWA 3W07A 3NQGA 3R12A 3GKAA 4OT7A 5BMWA 3TE9A 1G4PA 4JYEA 1RD5A 4MKNA 3BK0A 1A5SA 3OA3A 2YW3A 3O16A 1W1ZA 2CLKA 3CIXA 3FJLA 5T26A 1FXQA 3N2MA 2OT1A 5D37A 1W37A 5FEPA 4NJHA 3ABRA 1K7EA 1PHQA 3PSWA 4LC6A 2CZ5A 1DVJA 1T8XA 2JKEA 5KZMA 3C8FA 1X1ZA 2CZDA 5D04C 1VS1A 3BPWA 2YZRA 3BG3A 4B5NA 3PS7A 2J9ZA 4DBEA 4QISA 1I2RA 5CZTA 3TSDA 1M5WA 2ISVA 2V2CA 4QNEA 1ONRA 3P74A 4MYAA 2I14A 5LGXA 3UWWA 1SO4A 3EX1A 2EAWA 4O18A 2DZUA 3MI2A 2QJGA 3KHJA 4HNVA 4OV9A 4AB4A 1HFBA 4HT3A 3TROA 3VNDA 1I4NA 5D30A 2AGKA 4ZVJA 1D3HA 2VEIA 3B03A 1KFEA 3QC3A 5D32A 1G67A 3DGRA 1SO6A 5G2HA 6TIMA 1K8XA 4R7JA 1DORA 1IIHA 2DZXA 1GVOA 5AHFA 1OFAA 2ZZ3A 3W1PA 1LBMA 3R8RA 2BTMA 1MEIA 1OFEA 1F74A 2FTPA 2OT0A 1W5OA 3CWOX 3L5LA 1HUVA 3PBWA 2V2HA 3G8RA 1A53A 5IBXC 3S1UA 1R2RA 4M19A 1TPFA 3DHDA 3UWVA 1LM1A 2ZRZA 3LDVA 3M6YA 3LB0A 3I6RA 2YCEA 3IVUA 4NJIA 4YXGA 2H3BA 4IMGA 1THFD 3PF3A 4MFEA 4JYDA 3O6CA 2A85A 3G22A 2Y88A 5AC8A 3KVLA 2Q3RA 1RQEA 3EWWA 3Q2DA 3C4UA 3MO7A 4EVZA 5CGQA 4L4LA 1GJPA 1AMKA 3MHFA 3STFA 5LSMA 4KWVA 4CCCA 3TIMA 2EHHA 5G2WA 3SIZA 1YYAA 3LV6A 3TMLA 4NVTA 1XCFA 1R46A 2VOMA 4XZ9A 1AL7A 3CEUA 2VENA 3W9ZA 2OMAA 2ZA2A 2X1SA 1UB3A 1VC4A 3G8EA 2V5LA 1XKYA 2ATMA 1OHLA 1W3TA 2QCNA 1H1YA 3C61A 3EWYA 1H1ZA 2CU0A 3WK2A 4R34A 3FYOA 2ZYFA 5CPMA 1J2WA 5MHBA 4FNQA 2QCDB 3NG3A 3THQA 3M5VA 1R2SA 3W1MA 3MHUA 1SSGA 3RF9A 5IBXA 4GUIA 1VLIA 4BI7A 5A5WA 4DO4A 2B7QA 5LNWA 3CTLA 1KV8A 3NM3A 3W7OA 3EWBX 3PY2A 4MFDA 1WOBA 1TMHA 1QWGA 3K30A 4M7TA 1PE1A 4PC8A 2UV8G 4XUGA 4GUHA 2RFGA 2HTMA 4WOZA 1WAUA 1JULA 2VEKA 5I3FA 5LNSA 3T7VA 4WXYA 5SWUA 1TV5A 2GJLA 4WXZA 4HKPA 5BRBA 3QPZA 1PCKA 1KFBA 4FNTA 4IUOA 1PV8A 1G69A 2KZHA 4JYFA 4ZL1A 1SQ7A 4DPPA 2JKAA 3DFPA 3R13A 4UTJA 8TIMA 3O07A 1T96A 1EA0A 3NPUA 5DCDA 3ABQA 4O12A 3HF3A 4MOZA 1LROA 1I2QA 3IEBA 1JUEA 3C2FA 1B9BA 2B4GA 2C3ZA 2WNNA 2W0UA 2WNQA 3TA6A 4A21A 3GAYA 5E0KA 3PAJA 2BSLA 3W88A 4G1KA 1OVDA 3Q94A 2NWRA 5F2LA 1H7RA 5KZEA 1W0MA 4HNUA 1SW0A 5F2MA 1AL8A 1GQNA 5U7SA 1RV8A 3TFCA 5F4SA 4GFSA 4FHAA 4BK9A 2Y61A 2WKJA 4JIPA 1T0OA 3MYOA 4M6VA 4ML9A 2J9YA 1GYNA 5C5YA 3NL5A 3PULA 4OV4A 4UNKA 4IMCA 4O8RA 1OFQA 1IXOA 5DXYA 2YSWA 3G3MA 3SW6A 1F76A 3G0UA 3GLCA 1HG3A 3GX9A 1GOXA 4DQWA 1YPFA 3EX6A 2R14A 4MZ1A 3W76A 1JCLA 3B04A 5C6MA 3UD6A 4Q33A 1OFPA 1P4CA 1EIXA 3W7CA 4E38A 2V0TA 4LU0A 1PIIA 2DZTA 2OZ0A 3IGUA 1TIMA 1VRDA 1KLYA 5C2XA 4LC8A 3P62A 5HWJA 1KA9F 1VPXA 3W73A 1H61A 4RCXA 2E6FA 1HO1A 2DZPA 3G18A 3LCIA 4X3ZA 2TSYA 1QPOA 4JDBA 4MUZA 3SGZA 3G1XA 3MI6A 1E51A 3GDKA 1I2NA 1UUMA 5HUPA 4EOUA 3P67A 3ZS4A 1PHWA 4O54A 4K37A 5F1UA 1EUAA 1YLVA 3GZ3A 4LS0A 4JDYA 3BW4A 3UWUA 4UC5A 5D05A 4LTSA 2V2DA 3W7JA 1FCQA 1ICQA 1TPH1 2P1FA 4OU1A 3P5ZA 5J5DA 1R30A 1QO5A 4UFHA 3MHGA 4E0CA 1EUNA 4NUWA 3STEA 4UTWC 1B3OA 4FO4A 1PS9A 3M41A 5F4XA 3S5NA 2AAMA 4MLJA 1MEWA 3EX3A 1G7VA 4I7WA 1TRIA 1JUKA 4UFJA 1ML1A 3P82A 4UTHA 3GVGA 1WOAA 3SGUA 4AWSA 1MEHA 2ZRWA 2ZRYA 3PUOA 3OVQA 3W1NA 1SUXA 1D3GA 1ZCOA 4UTTC 1GVFA 4K38A 1LRQA 1SSDA 5FEZA 4W9TA 1K03A 5CSSA 1LBFA 1QCWA 2E5CA 2B0MA 2VFEA 3ABSA 3IIPA 5I3GA 4JN6A 1V7YA 2QR6A 1XXXA 4FX7A 4KWWA 1AW5A 1SFLA 4OGZA 2DORA 4P61A 1EB3A 1ZAHA 4S2BA 2V8ZA 3O63A 3I7SA 1B4EA 3W7KA 3MI3A 1M7PA 4O50A 1YTKA 2Y70A 1AW2A 3DH7A 5I3HA 3TFXA 5I3IA 3LCWA 2DZWA 3C2VA 2YR1A 5D02A 3ATZA 3G1VA 3W1LA 4ZZ9A 1LRNA 3ZWTA 4PODA 1TPUA 1CX9A 3TX9A 4RV8A 1XBYA 2R8WA 4FNUA 3ZWSA 4QITA 1H7NA 5HWMA 1TV8A 2A7RA 3DU0A 3TC7A 4PCFA 5KMYA 1FWTA 2WQPA 3BGJA 2BLEA 1ICSA 1N7KA 3PUEA 2Z1BA 3FFSA 4UTTA 2Z6IA 3OIXA 4N6FA 3JRKA 4WD0A 2ZBTA 3HBLA 3FJ6A 4LVGA 1EP1A 2QF7A 3FEMA 3TV8A 5G5IA 1GPWA 1S5WA 3DKLA 1N8FA 1ZNNA 2VFGA 3T40A 2JK2A 4YWIA 5L9FA 4CNNA 1DJQA 4CQ8A 3HPZA 4FIRA 4TX9A 2E09A 2JKPA 2FLIA 4TR9A 5K9CA 4QSHA 1VYRA 4QQ3A 4JY9A 3TK7A 3P81A 3M5YA 4UTKA 3RNDA 1G4EA 2AQWA 1SZFA 3CM4A 3Q37A 3GNDA 1LTDA 2ZZ6A 3NQVA 3LRMA 5ABTA 4Z1DA 2HS6A 3PSVA 5EKYA 3LXCA 2A4AA 2ZZ4A 4S2CA 1IXPA 3M43A 5AYYA 3L9CA 3TCEA 2O7SA 4GC4A 4N9BA 3WK3A 1TPC1 3HO8A 4M5PA 5HNRA 5K4XA 4JX5A 3PBUA 4Y90A 1ZHAA 3GXNA 4FIQA 4TO8A 1VCGA 3BO9A 1TYGA 3NVTA 4K36A 1OFBA 3WFAA 4K7YA 4N02A 1WV2A 4NT0A 1LZOA 1XBXA 2C16A 4LVDA 4CCEA 3LRKA 4MZ8A 3QEZA 2A0NA 4ALDA 2NLIA 3V75A 2J6XA 1TQXA 1WXJA 3VE7A 1R47A 3B0UX 1SW3A 1NF0A 2YGYA 5G1YA 3FYPA 4NQ1A 4RLIA 1L6YA 4M7SA 4PEKA 4QNWA 7TIMA 3LGEA 3NXFA 4RZ4A 1KBIA 2C19A 1ME7A 3W86A 2GVJA 2NUYA 3S42A 4O19A 1J5TA 2Y7EA 4ORIA 1TJPA 3SZ8A 4BR1A 1VCFA 2NX1A 5L6UA 3W1UA 4NZJA 2VFHA 5DN1A 4CNPA 1W5QA 3DENA 4CQ9A 4NJJA 2DJLA 4JTLA 4NXSA 1DKWA 2CWNA 1OX4A 3G0XA 1F05A 5HJLA 5DBUA 3BG5A 3QZEA 4J9JA 4IGHA 4GBUA 3LOTA 5EL1A 1OYAA 2Q3OA 2VFDA 4JTHA 3GDLA 1OK4A 4UFLA 1TPEA 1A5BA 1A5AA 3D0CA 1LOSA 2VEPA 1O94A 4MLRA 1BKSA 3NEVA 3W1XA 3G24A 3HG3A 4Z0JA 3T78A 4K6AA 3FKRA 1K02A 4UFIA 1H5YA 1H63A 3A24A 3NGJA 3R2GA 1ALDA 2WSRA 1BEUA 2NXGA 1S5TA 2FDSA 4DF2A 4XKYB 1WBJA 2NZLA 4O1DA 1HL2A 3VI2A 1VLWA 2NUXA 2DZSA 3GNNA 4KKXA 4IMEA 1GG0A 1A5CA 2YXGA 1FDZA 4QAIA 1N55A 3NQCA 1BTMA 3LCLA 3W22A 2FFCA 1JCMP 4RXGA 3DKJA 3YPIA 4BI6A 3B4UA 1JUBA 2PRHA 4MIMA 3IIZA 5G1TA 3QF0A 2E5DA 3CU2A 1K7XA 1NAL1 1NVMA 3W3OA 1GTHA 4OBTA 5HMSA 1K7FA 4JTJA 1W56A 1W54A 2RHGA 4XTIA 1XI3A 2ZZ2A 3VKJA 4WJEA 3N9SA 1TCDA 3FKKA 1QPQA 1DJNA 2Y6ZA 1F6PA 1TREA 5AHLA 5AB3A 4AWUA 2Z2UA 4A2SA 1H7OA 2OX1A 3CB8A 4C1KA 4AF0B 3NYZA 3E96A 5FESA 1C29A 2E77A 4OWGA 5D09A 3UZ5A 3E49A 3NQEA 3CWNA 3VE9A 3TR2A 1YTDA 3W7NA 3W7RA 4IXXA 3FS2A 4NNCA 3SY5A 4NNAA 3M9YA 3W83A 1QR7A 4NZFA 3RFAA 3NQ6A 2GOUA 5CPLA 1CW2A 2GVLA 2QCGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1GWJ A;  4F0H A;  3THD A;  3GG7 A;  5JQ9 A;  3PBV A;  1XIC A;  3B9D A;  3WH7 A;  4LV9 A;  2W9M A;  3AS1 A;  2DH2 A;  2C1I A;  3LHU A;  4Z08 A;  3NZR A;  4ZFC A;  4GQG A;  3VO0 A;  4PCP A;  4Y9P A;  1P0E A;  3O7U A;  3VD7 A;  1MXD A;  3REQ B;  2WSQ A;  1TVP A;  1GYL A;  4QP0 A;  3DX5 A;  3EXS A;  4GI9 A;  3FCP A;  3BUV A;  4UR7 A;  1EWD A;  1CGU A;  3V0U A;  5CEW A;  3CAS A;  3A4J A;  3VCR A;  2G3I A;  3LTS A;  2XVL A;  4JZ5 A;  3HIJ A;  2BWG A;  2RKX A;  1AOD A;  3WCZ A;  2CZV A;  1D8W A;  1TTQ A;  4IFR A;  4GO9 A;  1EJV C;  3MMU A;  2XN0 A;  4Y7E A;  3ARO A;  4BI5 A;  2CNC A;  1OFD A;  3VD4 A;  1QW9 A;  3PTM A;  1V6U A;  3CH9 A;  3P8J A;  3W87 A;  2YPI A;  2YX0 A;  3ZT6 A;  1TJR A;  2WCA A;  3B8V A;  4DF1 A;  4LB3 A;  2G3F A;  2QJJ A;  4PCT A;  1W5M A;  1HGY A;  5KTL A;  3FXY A;  3IV3 A;  5HAO A;  4UR8 A;  1R7A A;  1V79 A;  4W7V A;  3M1Z A;  3HGS A;  2IKI A;  2EPH A;  3RM4 A;  2OYM A;  1TPB 1;  3GU1 A;  5EYW A;  3P14 A;  1MO0 A;  4HHL A;  1KBB A;  5H91 A;  4EPK A;  4MWA D;  5F4W A;  1XP3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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