5SWUA

Dehydroquinate dehydratase from a. fumigatus arom
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
DSLGTIKKKQHSFFVSLTLPDVRGADQILEQACVGSDAVELRVDLLEDPDSSNGIPTVDFVADQISYLRSRITLPVIFTIRTKGQGGRFPDDAHAEAMQLYRLAVRSGCEFVDLEIAFPDEMLRAVTEMKGYSKIIASHHDPNGELSWANMSWMKYYNRALEYGDVIKLVGVARNLDDNTALRKFKNWAEEAHDVPLIAINMGGNGQLSRILNGFMTPVSHPALPFRAAPGQLSATDIRKGLSLMGEIKKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Dehydroquinate dehydratase from A. fumigatus AroM
rcsb
molecule keywords Pentafunctional AROM polypeptide
molecule tags Hydrolase
source organism Neosartorya fumigata (strain cea10 / cbs 144.89 / fgsc a1163)
total genus 85
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.25: Shikimate dehydrogenase.
pdb deposition date 2016-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5swuA00
5CG7A 4WXYA 2GOUA 3G0UA 3W23A 1JRCA 1TRIA 2FB3A 2J27A 3LB0A 4NNCA 4YWIA 3C2EA 5G4EA 3D0CA 3A9IA 3ATZA 4AB4A 3B4UA 2R14A 4ZQOA 4EWND 3UPBA 1EEPA 4MLRA 1W5PA 1JQVA 4LS1A 3W1TA 4O53A 2CZFA 4Y6GA 5D09A 4IJBA 1XUUA 1G67A 1TPFA 4LVBA 4YLWA 3L66A 4ADUA 1IXQA 3NL6A 3S1WA 1QFEA 1VR6A 3GDTA 4ZVJA 3O16A 3LXAA 4RZ6A 3I7RA 1HTIA 1GVQA 5G5IA 2GQ9A 1PCWA 3M43A 1I2QA 3F4NA 2C19A 5D38A 3DGRA 3OHIA 1KFJA 1FCBA 1PS9A 3QMRA 2ATMA 4AXKA 3PUDA 4CNOA 1ZJIA 1JCMP 3MBFA 3LHTA 5K9CA 4N02A 2YXGA 3AJXA 3OVRA 1W1ZA 2JKAA 3EKZA 1RQHA 4TMBA 1I8JA 3FEMA 4Y9AA 2WJZA 3LRLA 3S42A 4DPPA 4X9SA 3MI6A 4O50A 1VCFA 3DI0A 4O14A 3ANYA 1EUAA 3C6CA 3L5AA 3LHUA 4I7UA 4NX5A 1LLWA 2E5BA 2FPVA 3GAKA 3BW4A 4PL2A 4HSOA 2RFGA 4NJGA 2NZLA 1OHLA 2VOMA 1OX4A 5FF0A 2VFGA 3W2LA 1AW5A 1OYBA 5U4NA 3P84A 1L6SA 2VEIA 3JS3A 3NVTA 3TSDA 3HQ1A 5D2WA 4CQ8A 1FX6A 3LBCA 4R7JA 2VELA 1T8XA 3TXZA 2CFFA 2RDWA 5D37A 3O6CA 4RCXA 4UTWC 1OFEA 1MXSA 3MP3A 2ISWA 3W88A 3QSTA 1Z44A 1GG0A 2C16A 5AYXA 4L4MA 4A21A 2ABAA 1SZNA 4O57A 4EIVA 4GUIA 4CQ9A 3SI9A 4LC6A 1PV8A 3G0XA 4YCPA 2QUTA 5CKSA 3TR2A 5LZLA 5I3KA 3EWUA 3KAOA 2CW6A 2PURA 2TYSA 1QDSA 1VC4A 4DO5A 1F5ZA 5AOUA 2J88A 3STGA 4O10A 4BI6A 5AHNA 2AAMA 4UR8A 3IRDA 1V7YA 3LCLA 5EYWA 2V5BA 1RVGA 1AW1A 2C15A 5G4WA 2CLLA 4O52A 2VFHA 4XZ9A 4QJ1A 3MP4A 3DZ1A 1AK5A 1GOXA 4AF0B 3C2RA 3M1ZA 1ZHAA 1SZGA 3N73A 3PVFA 4KWVA 5LSMA 2E68A 2DZSA 3NPVA 5DBUA 1ZALA 1P5BA 1YDVA 1G4TA 1VJIA 4W9TA 1KM4A 3P8IA 5D30A 1OFAA 4M5PA 2EHHA 4HPXA 1I45A 5AHFA 1KBIA 4RKAA 4UTMA 2ZDRA 4IPIA 5AHMA 1FCVA 1EIXA 4ZMGA 3DKLA 4JTUA 1LRTA 1K3UA 1NF7A 4OQVA 4OWGA 1RD5A 2H90A 1G69A 4JIPA 5FEZA 4MPQA 1P0KA 5K9DA 4UIOA 2QCDB 4RZ5A 4IWWA 1ONRA 3R2GA 1LZOA 1IIGA 3W7DA 4FNSA 1OF8A 4E2DA 4Z1BA 3QF0A 2G97A 1BWLA 4I9AA 4UTIA 3T40A 4ADSA 3C56A 3LHZA 1RV8A 4UFHA 4CCDA 2FB2A 1ZAIA 4Q33A 1TPC1 2DORA 3W74A 5F2GA 3L9CA 1FXQA 4JYDA 1OFBA 4MZYA 3W2NA 1UBSA 2ZTKA 2C0AA 1YTDA 2Z1BA 3QJAA 3W1PA 1B4EA 5D02A 2XN2A 3IIVA 3I7QA 4JGDA 3LI1A 4O16A 1AG1O 2I9EA 3LLFA 2QJIA 1LM1A 3GKAA 1VHCA 3W1AA 3B05A 3LHYA 2NUYA 1YXYA 3W7EA 3GXTA 3PM6A 4FNUA 5K9XA 5D05A 2Y7DA 4DF1A 1WYIA 2X1SA 1ADOA 5EY5A 1SFLA 2R91A 3SGZA 2WOQA 2WNQA 3TJXA 3L21A 1X8FA 4IXXA 1FCQA 1DORA 5FF4A 4RXFA 5I3HA 2VFIA 3SFKA 3LDVA 1LBFA 1WAUA 3KVLA 1WQ5A 2D73A 2B7NA 4IXHA 4NXKA 4ML9A 4LVGA 1TO3A 4OBTA 4FIQA 1IXOA 2DP3A 1TTJA 3F03K 5F4SA 2PCQA 3LHWA 5LNWA 4GUHA 3P81A 3LCIA 3NQ6A 1YDNA 4MOZA 3W70A 4M6VA 5HUPA 4LY8A 4POCA 4Y96A 1XL9A 4O18A 1AL8A 3UZ5A 1S5WA 1LTDA 5D04C 4NZJA 3EKLA 1G4PA 4IMDA 4FIRA 3B06A 2X1RA 3FKKA 3G1SA 4D2JA 3O15A 3W1UA 4YL2A 1MEHA 4JY9A 5LHEA 4P2VA 2JGYA 4UMBA 4WJEA 3MYPA 1MSSA 4M19A 4JX6A 2F84A 5KINA 1TB3A 5IM51 4OU1A 5G2HA 2B7QA 4JTEA 4GXMA 3GR8A 1X6UA 4O13A 3B0PA 2JKEA 4H4IA 4UMCA 3R13A 2QCEA 4BR1A 4FEZA 3W1XA 2C14A 5DCDA 1E51A 4JTLA 1RPXA 1W3NA 4FXSA 2A85A 3WK0A 3NQVA 3BV4A 3M5XA 5AC6A 2A7NA 5F2MA 3B8DA 3EWXA 3CIXA 1A5SA 1R2SA 4K36A 1AMKA 2FQIA 2C6QA 2W6RA 2FIQA 1KBJA 4DXVA 4E2BA 3TQKA 1R2RA 3BK0A 3IVTA 3P5YA 3P80A 3G1YA 3CWNA 3KX6A 3N9SA 5KITA 1VQTA 2V2HA 1B3OA 5H2ZA 3OVQA 1ME8A 5FF2A 3HGRA 1SSDA 4GFSA 3PWAA 2CZ5A 1T99A 3EB2A 2ZA1A 1RZMA 2R8WA 1EUNA 3BVJA 3Q94A 2DZTA 5F1UA 3LCFA 3ZWSA 1JR1A 3GZ3A 1JRBA 2ZZ2A 2Q3RA 2DZPA 4BWLC 1Y0EA 4LV4A 3GVGA 4M6PA 3FFSA 2PC4A 1SW7A 3PSWA 2ABBA 4JD4A 3TSBA 1EA0A 4RR4A 1OFOA 4KFOA 1TJPA 5LGZA 1W56A 2A4AA 1LOLA 4MY9A 5EMUA 5K7JA 1WA3A 3W87A 5CPOA 3TK7A 1QPOA 2CLOA 1IIHA 4UXDA 3TC6A 5FF7A 1BKSA 4EVZA 1F2JA 1TJRA 2FJKA 3MHUA 3PUOA 1FY6A 4AVFA 2O7QA 4AWTA 3KVKA 4MVAA 3W1QA 1KM0A 3L0KA 3N34A 2QCMA 2BX7A 3W73A 2YW4A 2ZQ0A 1TTPA 2GQ8A 1W5OA 3TUUA 3OG3A 1QMLA 3Q2DA 4N6EA 1Z48A 2WPBA 4OHQA 4LRSA 4IMEA 2NX3A 2X2GA 4GWEA 3STFA 1LORA 1WBJA 4WX2A 1VCVA 1P1XA 3NQGA 4JX5A 2Z6IA 3DXIA 4HN4A 5DXXA 5D03A 2CLEA 2QCCA 4MKNA 1H62A 2J24A 2EKCA 4DF0A 1XFBA 1JCLA 3EWWA 2Z2UA 2ATSA 3NL3A 2QJGA 1D9EA 2J6XA 3TMQA 4PL1A 3H53A 3G1FA 2ZFAA 1SW0A 3DAQA 3DFPA 1K7XA 2FTPA 2YYUA 3H55A 1Q3NA 3G8EA 4AH7A 3OIXA 4ZQPA 1ML1A 3MWAA 3NPUA 4UMAA 3TFXA 1XBXA 3LM7A 4DO6A 4DELA 2A0NA 4JN6A 5HJLA 3RNDA 3G8RA 4ZQCA 5KSWA 1N55A 4WY0B 1PIIA 1YYAA 4FXRA 2A2IA 3E12A 3A5VA 4QSHA 1OFDA 2HSAA 3O6DA 3EX6A 2Y70A 2VEPA 1MO0A 1GVFA 2CWNA 4HIBA 3C61A 2WV8A 5BMWA 3LTSA 3A22A 1PVNA 1KFCA 2QUUA 3S5OA 3ABOA 1L6WA 4XKYB 3SGUA 6TIMA 3LCGA 2R94A 2ZZ3A 3C0JA 5F1VA 5CSRA 4IQLA 3HGOA 1SFJA 2QCLA 2GVLA 3YPIA 1DQWA 2A7PA 4K8EA 4NU7A 1PE1A 3P5ZA 3UWWA 3C8FA 4E0CA 3TU9A 2JGQA 3L5LA 4HSNA 3QM3A 2YSWA 3SW6A 3NPWA 2P1FA 3QZEA 1KA9F 2PRLA 2DZVA 1WOAA 2ISVA 1KW1A 3QPYA 1WDWA 3M5ZA 3P62A 5KZDA 2PE4A 4N9BA 4TO8A 3ZS4A 5AHIA 3GK0A 2ZRXA 2C1HA 3NQAA 1LYXA 3W1LA 3O1NA 2NV1A 2C3ZA 2RH9A 3CU2A 3W1RA 5E1QA 3P60A 5BMXA 3TROA 4LS0A 3GNNA 1YDOA 2V82A 1VCGA 3TXVA 4WXZA 4RLIA 1BWKA 1GYLA 3TJLA 3WFAA 1ZFJA 3GX9A 3UYCA 3TNOA 3IIXA 3W7LA 3VCRA 5DN1A 3HPXA 1JVNA 4LTSA 1UCWA 7TIMA 2DZWA 3P61A 3STEA 5AN7A 3FYPA 4FNPA 3BW3A 5FESA 3DENA 3GNDA 1EP2A 1LOSA 5F2IA 3W7IA 1XBVA 5CPNA 3G22A 2I14A 3TQVA 3LRKA 4FNRA 3NG3A 1GVOA 4MJZA 3NQFA 3BG9A 4PC8A 1LP6A 2QCHA 3MUXA 3PAJA 2QR6A 4NT0A 2YZRA 4JTTA 5AC7A 1R2TA 4LNYA 4AEOA 3HIJA 3DKJA 2ZRVA 3FKRA 3UWUA 2OCZA 3C52A 4UFKA 3LCWA 4GUFA 1A5AA 1VLIA 1VS1A 3G3DA 2ZRYA 4Z1DA 3L65A 4B5NA 4BF9A 1DJQA 4JYFA 4MLJA 3N3MA 1DL3A 5LKYA 4NUWA 1H7PA 5FEPA 1TREA 2Y85A 5I3JA 4NVTA 3LOTA 2B7OA 3GDKA 3O63A 1AL7A 1FBAA 1EP1A 1RR2A 2Q8ZA 1YPIA 1YXCA 3KRUA 3LCXA 3L2IA 4A2SA 5CPMA 3S5YA 1H7NA 1Q6RA 4E38A 4XWUA 2X16A 4MFEA 4FNQA 3MBDA 5AYZA 5C55A 4HHPA 2VC6A 2P10A 2ZRUA 2RDTA 1LROA 3SECA 2I1OA 4ADTA 1EP3A 1M7OA 4UFLA 5E0KA 1J2WA 4FX6M 4IGHA 4N9CA 1QAPA 3O05A 3S8HA 1PL9A 3DHDA 4PCFA 4XBSA 1ZAJA 3E49A 1WBHA 1UUMA 4JTGA 3TKFA 2KZHA 3EWBX 5CZSA 2V8ZA 4OV9A 3MW7A 4QIUA 5CSSA 1VYRA 3HF3A 3KFTA 1O60A 1F76A 1GEQA 1TCDA 3M0ZA 4O1BA 1SW3A 3MI3A 4K38A 4JEQA 2E77A 1KM3A 3NQ8A 3NXFA 3NYZA 3W7QA 2E6FA 1C9DA 3S0CA 3P67A 4GUGA 4LUJA 4LVFA 3DFTA 5C5YA 3GAYA 1SO5A 1MEIA 4OV4A 1L6YA 4LRTA 3PR2A 3S1VA 5A8GA 5FF3A 3STCA 1EX5A 2LLEA 4GRSA 4UC5A 4K7VA 3TV8A 1VHNA 3HB9A 1W8SA 4HKPA 5FEXA 1UASA 3LTYA 3R89A 4LV9A 1F05A 3E96A 1CW2A 3LHVA 4ORIA 4N2YA 1G6CA 3DHFA 5SWUA 1HG3A 3PS7A 3CLMA 4KWWA 3WJWA 4X3ZA 2A7RA 4UTJA 3LTPA 4EOUA 3WJXA 2B7PA 1W37A 3PY2A 2C13A 3C2VA 3P7YA 5KZEA 2GJLA 5D2XA 1OF6A 3C3NA 4JICA 3CEPA 1X7FA 3TQ0A 4K8HA 3RLVA 4MZ8A 4TIMA 3RK8A 3VE7A 5F4WA 3GDRA 4JTSA 3QQ0A 1KV8A 4O11A 2CLIA 4HT3A 5DLCA 4R33A 3RU6A 2NLIA 3BG5A 2H8ZA 2QKFA 2E09A 3HGSA 3QMTA 4UTTA 1ZAHA 4CQAA 1K02A 3NOEA 4TMCA 3LV6A 5HWMA 1M5WA 2TMDA 4FX8A 1L9WA 3NQEA 3W71A 1FQ0A 4Z0SA 1KM6A 1O5KA 4C1LA 2G95A 4IX0A 2AGKA 5D32A 3KRSA 3T44A 1CI1A 2QCGA 2V30A 1QCWA 3FYOA 1ZCOA 3N14A 1GZGA 4BI7A 3G1HA 3FA5A 4PTNA 4LW7A 4MYAA 4NZFA 4N9EA 3C2OA 3W2KA 3EX3A 2A6NA 1JQXA 1A50A 1D3GA 4NNBA 5HWNA 4H3DA 3FIGA 3TAOA 4RV8A 3QRHA 1OYCA 4A2RA 4LUIA 4JXCA 3PC0A 3QSRA 4QISA 1B4KA 1BTMA 2YCEA 3S1UA 4EF8A 1HL2A 2H3DA 2V2CA 4O28A 3S6DA 3FS2A 1XI3A 3EXTA 4UNKA 3ELFA 3HOJA 2ZRWA 4X2RA 3W7NA 2A1YA 4TR9A 4IMFA 1LLZA 3TX9A 5J5RA 4HPJA 2J9XA 5DCBA 1DOSA 1H1YA 3C2FA 4CNPA 2F7FA 2BSLA 3HMJG 3VNDA 2YR1A 1OX6A 2VEKA 3V75A 2TSYA 3W7OA 4PA8A 1G7UA 3DFOA 2TRSA 3LXCA 1OFPA 1FDYA 3N9RA 1H7WA 3IIPA 3UQNA 4R34A 1H5YA 1T96A 2JK2A 1SZEA 1KLZA 5ABTA 2A5HA 3H54A 4ALDA 3TCEA 2NX1A 4NJHA 4WD0A 5BOOA 3P74A 5LGXA 2ZCGA 4MYXA 4O15A 1KM2A 5AHEA 3S5ZA 1P4CA 1TTIA 3BPWA 3T7VA 2DZUA 3BGJA 5TQLA 1CX9A 3NM3A 1DQXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3G0U A;  3LN3 A;  5G4E A;  4HPH A;  5LIY X;  2QUL A;  1F8M A;  4IFO A;  3WQF A;  3ATZ A;  2R14 A;  4EWN D;  1EEP A;  3VDB A;  3WEN A;  4EAC A;  5DEZ A;  1TWS A;  4O53 A;  1UQY A;  2CZF A;  4C6P A;  1BSI A;  2HNE A;  1UG6 A;  2VGI A;  3AFB A;  2I5G A;  4YLW A;  3PZO A;  4ADU A;  1IXQ A;  4NAF A;  1OIN A;  4H7C A;  3AWN A;  4GY7 A;  4QS5 A;  3LXA A;  5HA7 A;  3GW0 A;  4MWA B;  3W24 A;  4XD5 A;  3M43 A;  3F4N A;  2C19 A;  5D38 A;  3DGR A;  1KFJ A;  4L61 A;  1PS9 A;  1RXO B;  1QNQ A;  3MBF A;  2VGF A;  5K9C A;  3AXK A;  3OVR A;  4IID A;  1RQH A;  3MS8 A;  1I8J A;  4Y9A A;  4DYK A;  4O50 A;  4LUT A;  3ANY A;  1EQP A;  2PWH A;  3L5A A;  4I7U A;  1SJD A;  2DVX A;  1KKO A;  1M41 A;  2D22 A;  4AVN A;  3CV6 A;  2PMQ A;  1BXN A;  5XIN A;  4HSO A;  5CJN A;  1OHL A;  5T91 A;  5FF0 A;  1B90 A;  5U4N A;  3P84 A;  1Y5V A;  3ZQ9 A;  3JS3 A;  1J0I A;  3LBC A;  4R7J A;  1F4H A;  4GCX A;  2VEL A;  4UTW C;  4RCX A;  1OFE A;  4WDW A;  3MP3 A;  1GNX A;  1UA7 A;  3W88 A;  3UVI A;  1RY8 A;  1GG0 A;  4A21 A;  4GGB A; 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