5TBOA

Crystal structure of plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase bound with inhibitor dsm421
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
374
structure length
362
Chain Sequence
NPEFFLYDIFLKFCLKYIDGEICHDLFLLLGKYNILPYDTSNDSIYACTNIKHLDFINPFGVAAGFDKNGVCIDSILKLGFSFIEIGTITPRGQTGNAKPRIFRDVESRSIINSCGFNNMGCDKVTENLILFRKRQEEDKLLSKHIVGVSIGKNKDTVNIVDDLKYCINKIGRYADYIAINVEAGKLKNIILSVKEEIDNLEKNNIMNDEFLWFNTTKKKPLVFVKLAPDLNQEQKKEIADVLLETNIDGMIISNTTTQINDIKSFENKKGGVSGAKLKDISTKFICEMYNYTNKQIPIIASGGIFSGLDALEKIEAGASVCQLYSCLVFNGMKSAVQIKRELNHLLYQRGYYNLKEAIGRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A Triazolopyrimidine-Based Dihydroorotate Dehydrogenase Inhibitor with Improved Drug-like Properties for Treatment and Prevention of Malaria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Plasmodium falciparum (isolate 3d7)
total genus 138
structure length 362
sequence length 374
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2016-09-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5tboA00
5EPDA 3UWWA 2ZA1A 4MJZA 3C61A 2EAWA 1YTDA 1P4CA 1TPH1 4Q4KA 3N14A 4GRSA 1TV8A 2C15A 1OX6A 2ZZ1A 2WJZA 3FYPA 3T78A 1F05A 3PBUA 3P84A 2C1HA 5KZDA 2JKPA 5CPOA 3OBKA 2C13A 4WXZA 5G1TA 5K3VA 2Y6ZA 4GUGA 3UQNA 1AW2A 4Z1DA 3FLUA 2Y7DA 4L4MA 3A5FA 3NZ1A 5LSMA 1P5BA 1F6PA 5G2WA 1PL9A 1KFJA 1Z42A 3BPWA 3W7RA 5I3GA 2G97A 1XBVA 4ADSA 1SR9A 3T7VA 1SUXA 3V75A 1LYXA 1S3HA 2X1SA 3N3MA 3QM3A 4LU0A 2QJGA 1BKSA 1TIMA 4DF0A 5IBXC 4N4QA 1W5PA 3N73A 1ML1A 1W3NA 3MUXA 5EA9A 1RD5A 3TH6A 1SO5A 3IGXA 2HSAA 1FY6A 1WBJA 1V7YA 1NF0A 2WPBA 3BG3A 1GG0A 4MKNA 2VEIA 4O1CA 1W56A 5G2HA 1FDJA 2QAFA 1X8FA 3PUDA 5L6UA 3B05A 2EKCA 1ME9A 2BZNA 1Z41A 2DP3A 3GLCA 3TX9A 3GDKA 5E1QA 1X1OA 2H3DA 2ZRZA 3P80A 1JCYA 2C0AA 3SJ3A 4AMAA 1LM1A 3JRKA 3JR2A 3MP5A 2A6LA 5C55A 1VC4A 2V81A 2NV2A 4Z1AA 4EIVA 1KBIA 2Y63A 3W1AA 4AHOA 2NXGA 3LV5A 3NL5A 2Y85A 3BLEA 2A2IA 1QPOA 2VOMA 3LB0A 4IMGA 4XTIA 4NUWA 3W6YA 3W1XA 4ADTA 3EX1A 2FTPA 1W31A 3WJZA 4JYFA 4NJGA 3SECA 1FXPA 5G4WA 4JTJA 1OX5A 4HN4A 2ISSA 4KWVA 1SZNA 4JN6A 3R5EA 2WKJA 3FS2A 1T8XA 3PBWA 4IWWA 1D9EA 3GDRA 2WQPA 3R89A 5DCDA 3CQ0A 3ZS4A 1OYCA 2VEMA 2R8WA 4FIRA 4UC5A 3DU0A 3STEA 7TIMA 6TIMA 2Q3RA 1DQWA 3O6DA 3W7DA 3LHVA 1LLZA 3G0UA 2ZA2A 4M6PA 3G22A 2B7OA 4NX0A 5C2XA 4JIPA 4PC8A 3G3DA 1GYNA 1R30A 2ABAA 4WY0F 4IMFA 2I1OA 1DL3A 4MIMA 1WOAA 3W2LA 3U2OA 3G3MA 2DJLA 1PS9A 4BI5A 4MUZA 3NZRA 4LS0A 3CLMA 1LP6A 1FWNA 3NA8A 3QMTA 4X9SA 1A5AA 3F03K 1XUZA 4OE7A 4AF0A 1Z48A 3O07A 1F76A 2RHGA 2FPVA 2RDTA 3H53A 2WNZA 1JQVA 3CB8A 3W1UA 3CIXA 2YGYA 5LGXA 2CLLA 3B0VC 3LRKA 5BOOA 2CW6A 5F4SA 4DO4A 3E0IA 5D2TA 3B0UX 3WJWA 3NYZA 3NQFA 1X6UA 4OBTA 2KZHA 4M6VA 3LLFA 2GQAA 3RLUA 3RU6A 1XC4A 3KRZA 5MHBA 2OCZA 3KFTA 3C8FA 1DBTA 2NX1A 1AL8A 3SI9A 4UNLA 5AOUA 2FFCA 3F4WA 3G1YA 4O12A 2DU2A 5F1VA 2Q8LA 1Q6RA 1WX0A 3HGRA 2CLOA 3BO9A 2F7FA 4QM1A 3EKZA 3EX6A 3TV8A 1GVSA 3Q94A 4TO8A 3P8JA 1K8ZA 2C16A 3G1FA 2E77A 3W1MA 4HNNA 2V30A 3GNNA 4N02A 3EWXA 4UTWA 1H1ZA 4UMCA 1VHCA 5FF2A 3PBVA 4UFMA 3UXAA 4OGZA 3QYQA 4IPJA 4X22A 2GVLA 1NVMA 3SY5A 1TV7A 1RVGA 4ORIA 4HHPA 3S1WA 1QAPA 1OFPA 1SO4A 3CM4A 1OFEA 1PHWA 4YCPA 2DJXA 5K9DA 1A5CA 3LTYA 1OK4A 1TPEA 1TQJA 1TB3A 5D2YA 1SQ7A 3GDLA 3NAVA 2GVJA 2J9XA 1ICSA 1W5QA 3UWUA 3TXZA 2FPYA 3S5OA 1YXCA 3WK1A 1QPQA 2A4AA 4MZ8A 3PF3A 3GK0A 3NM3A 3EXRA 3DFOA 1EPXA 4RKAA 4G1KA 1OF6A 2E1DA 1OFOA 2I14A 2ZQ0A 4RCXA 4AVFA 1LBFA 1TMHA 4K6AA 4O28A 5AN7A 3IIOA 1U5JA 4NT0A 4Y96A 1AK5A 3UNDA 1EB3A 1FQ0A 4JXCA 4LY8A 1HUVA 4IQLA 2NXIA 4FX7A 4O4WA 1OX4A 1BEUA 2A7PA 3TU9A 5CPMA 5KMYA 3UWZA 3USBA 1K02A 4MYAA 1LZOA 1TPUA 3VNDA 4C1KA 5AC6A 2H6RA 4EWND 4MFEA 3S6DA 1FWRA 2HTMA 3IGUA 2XN1A 4NXSA 2X2GA 3DXIA 1G69A 1GG1A 2NUYA 3OA3A 3EWYA 3TCEA 2OZ0A 3W2UA 4X2RA 5ABTA 4QITA 2YFOA 1F6KA 1Q6LA 1N8FA 3HIJA 4IMDA 4O4VA 3NGJA 3C2RA 5AHLA 1VR6A 4UTTC 1PHQA 4QNEA 3NVTA 4JX4A 1TTPA 3ABOA 1OVDA 4UFKA 4XWUA 4Y6GA 4POCA 5E0KA 3IVSA 3PY2A 3MBFA 3MHGA 4LVBA 4C1LA 2GVGA 5TBOA 2AGKA 1UASA 2CLFA 3ATZA 4QISA 3UZJA 2YX0A 1TQXA 1KW1A 2PRHA 3R8RA 1JRBA 3IEBA 1UUMA 4YWIA 5G1YA 1SZFA 2V2DA 1Y0EA 1W3IA 5D09A 5HWJA 1SSGA 1OG0A 5C5YA 2ISVA 2ZZ6A 3F1QA 3W7PA 3CT7A 1FXQA 4RK8A 1MXSA 3GKFA 1N55A 3EWBX 2QCDA 4YLWA 1KLZA 3D0CA 1IXOA 2QKFA 1CI1A 2Z6IA 1GVQA 1NF7A 3G1HA 1DVJA 1ZAIA 5D02A 3IVTA 3UPBA 1RQHA 3IIPA 3IIXA 3PG8A 2ZZ3A 1AMKA 4E2BA 2W6RA 4UR7A 5J5DA 3TROA 4K37A 2EGZA 4JTEA 5LNSA 3TSMA 1G6CA 4ORMA 3W74A 3SZ8A 2CLEA 4NJJA 4DXVA 3INPA 5BRBA 5C6MA 4O0KA 4GNJA 3SGZA 1JCLA 2RDWA 1QOQA 3LHWA 1UB3A 4JY9A 4UTJA 1TPVA 5H2ZA 1O4UA 3C2EA 3HB9A 1ICPA 1SFJA 1K7XA 5D33A 1KM6A 5LGZA 3LCXA 4XKYA 4AWTA 5IBXA 3W7OA 3PB0A 4UIOA 3NQCA 2E6AA 3PULA 3M43A 4MZYA 4LUIA 2WSYA 4R33A 4CLMA 1P0NA 5HNRA 3GAYA 1TV5A 2VFEA 3S5ZA 1I2QA 3R2GA 2JBMA 1GEQA 3W7MA 3EX2A 2FJKA 3G18A 4DEFA 2XN0A 1OFAA 1DOSA 1YDVA 2Y7EA 5AC7A 3KVKA 4FX6M 5K9CA 1ME7A 4OV4A 2QUVA 4I7VA 4LUJA 1Q6OA 3M47A 1M7PA 3L5AA 3BW3A 1KBJA 2V9DA 1ME8A 4LOCA 1FCVA 3FOKA 3T55A 1KFBA 4HNTA 3U8GA 3GDMA 3W7CA 4PH6A 4EVZA 1EIXA 1LTDA 4CCDA 1C29A 3SFKA 4YL2A 3EX3A 4HKPA 2A21A 3G24A 2ISWA 2CZDA 4A21A 5G4EA 2NWRA 4O15A 1YDOA 1EUAA 2TRSA 4O57A 3EXSA 4E38A 1LRTA 4Y9AA 3DFNA 1P0KA 3NXFA 4HIBA 5D04C 3NL6A 1YPIA 3PC0A 1JCXA 3TQ0A 2VFGA 5F4WA 3IIVA 2GQ9A 2CWNA 2Y61A 3W76A 2P10A 4U28A 1OF8A 3TR2A 1XDMA 5EY5A 4NNAA 4WXYA 3IIZA 3W85A 1LOQA 1JJKA 1G4PA 2QUTA 3KVMA 4DPPA 5KSWA 4MLJA 2ATMA 2A1YA 3EEGA 2F84A 4JX6A 2VFDA 4DELA 5LNVA 5G5IA 4RXGA 1EWDA 3THAA 3S5YA 4O10A 2JKAA 1V5XA 4P2VA 4WX2A 2V2CA 3ZR4A 3GYEA 4WUIA 2B4GA 4EF8A 4CQAA 3BG9A 1TJPA 1RZMA 2NUWA 3IGSA 2A0NA 4K39A 5I3HA 1TPWA 4MY8A 2J88A 3WK3A 2FB2A 1C9DA 4RLIA 4FXSA 3CEPA 2E5DA 1XKYA 3P81A 4CCCA 4ML9A 2E6DA 4PFMA 4J9JA 4ONVA 3W9ZA 4QAIA 3NQDA 1QPNA 1TO3A 3IVUA 3E49A 1M6JA 4GUFA 1T96A 1BWLA 2YPIA 2ZZ2A 1VHNA 3QW4B 3GR8A 1L6YA 5KTLA 3HBLA 4A22A 4JTSA 3M5XA 2QUUA 2A7NA 4O11A 3LCIA 3NPWA 2X1TA 5AHEA 5AHMA 3LXCA 1W5OA 5FF4A 5FESA 5E93A 3UWYA 3DFQA 1EWEA 3N9SA 1SU5A 4Z0JA 5HR6A 3WK0A 3QMRA 4JDBA 4AH7A 3QQ0A 1HTIA 3TK7A 3LM7A 4EOUA 3E9AA 3HPXA 1H51A 1FX6A 2E6FA 3S9YA 2YSWA 3W84A 1U83A 4N6EA 5DLCA 1JR1A 3EWUA 3W7LA 1W5MA 4QIUA 1KFKA 5D32A 1EP3A 3O05A 1SW7A 1YPFA 2H8ZA 2A85A 1OFQA 3LHTA 3TMLA 1ZALA 3W75A 1LORA 3KAOA 4JTGA 1R2TA 5HINA 1WDWA 2QCEA 1W54A 1EP1A 1S5WA 3WJYA 1VYPX 4RJEA 3P61A 4RR4A 3OVRA 2GJNA 2B7PA 2YFNA 4YMZA 3HGSA 3W72A 2GUUA 4GWEA 4PEKA 1PCWA 2TSYA 2QR6A 4DO5A 3M9YA 3STGA 1P1XA 2DZVA 2RH9A 5AHFA 1ALDA 1DQXA 4O0ZA 5BNKA 4N9BA 4BWLC 5U7SA 4BFAA 2TMDA 3S8HA 2ALDA 1QMLA 4JGDA 2VEPA 3FIGA 2JK2A 3M44A 4MYXA 3PS7A 4ZQPA 3GIYA 4YXGA 3TIMA 1GWJA 1ONRA 3N2XA 4LVGA 2E09A 1TCDA 1W3TA 3RK8A 5F1UA 3LCFA 4O54A 3ZFHA 2J27A 1EA0A 2CZ5A 5FEWA 2QCFA 3UXDA 3SW6A 1VQTA 3CU2A 2EPHA 3P60A 3UY7A 2JKEA 1MEHA 5T26A 3M1ZA 3RF9A 1TPDA 1KTBA 2V0TA 3MYOA 3WFAA 1JVNA 4TMCA 1F74A 1EEPA 2H90A 2Q8ZA 1F5ZA 1KA9F 2G95A 4JNMA 5KINA 1KV8A 2C14A 1O60A 2PRLA 3NPXA 5CPNA 4Y90A 3SR7A 3QH2A 4UTIA 3W86A 3LX9A 3TSDA 3BG5A 4GBUA 3NQAA 3W73A 2JGQA 1DJQA 2C18A 5CZTA 3RMJA 3OHIA 3P67A 1D3HA 2QAPA 5CZJA 4DF1A 1WBHA 3TJLA 3W22A 4LC6A 4JTFA 1GZGA 4N2YA 1ZENA 1DV7A 3PR2A 5DBUA 3HG5A 5HUPA 5DCBA 8TIMA 2ZRWA 5HULA 3BW4A 2R91A 4N9DA 4AWSA 5HWMA 4S2BA 2DORA 5LKYA 5D38A 3FJ6A 5DXXA 1K7EA 2VXNA 3R12A 3ABRA 3O1NA 3DH7A 2VC6A 4FNQA 3IRDA 3EXTA 1MEWA 1FDZA 3ABQA 3DZ1A 1VCGA 1VH7A 3GDTA 1WYIA 2O7QA 1M7OA 2B0MA 3TW6A 4AXKA 4WY0B 3T44A 3STCA 4FF7A 1W5NA 5DBTA 2VFHA 3MMTA 1K3UA 1WAUA 2P1FA 3LI1A 1HL2A 4NXKA 3P7YA 1H7XA 1XUUA 2ZRUA 3LLDA 5CKSA 3MI3A 4O53A 1G7UA 1OYBA 3T40A 3W7NA 1YYAA 1BTMA 3FYOA 4LTSA 3W1TA 4JR5A 3B06A 4UTHA 3DKLA 3MHFA 4O50A 3Q2DA 3DAQA 3RNDA 1ZAJA 3QC3A 3MW7A 4LV4A 3ATYA 4JTIA 5EKYA 4UTMA 4M5PA 2WSRA 3HG2A 2QCLA 1AW5A 1AL7A 3B4UA 3NQ6A 3DENA 1I4NA 4O52A 4AHQA 2AQWA 3R13A 1KFLA 3KX6A 1IGSA 3C2VA 1H7RA 2TYSA 4UCGA 5AB3A 3ZWSA 3PUOA 1CW2A 4FNTA 1NEYA 3LHZA 4QQ3A 4O16A 4TX9A 2WV8A 2YCEA 1K03A 1XM3A 3GNDA 2A6NA 3B0PA 4I9AA 1R2SA 4RV8A 3NQ8A 4NJHA 3W71A 1IF2A 3LXAA 3TQKA 3W7IA 5CPLA 1H50A 5GVJA 1WOBA 4CQ8A 3FJLA 1XL9A 3MYPA 4JS3A 3C2OA 2EF9A 3M7WA 1F73A 4IJBA 1B57A 2VENA 2Y7GA 3GXNA 1AW1A 4FNUA 3HGJA 5FF0A 1KFCA 2CFFA 4PTNA 3G1SA 4R53A 1J5TA 5EL1A 2CLHA 3LCLA 3HPZA 4IMCA 2ATSA 3O63A 1L6WA 2CLMA 1F2JA 2OX1A 3W07A 4ZVJA 4O8RA 1SZEA 4KFNA 3A24A 3W88A 1JCMP 5U4NA 1JUKA 2R14A 4JTHA 3UZ5A 1THFD 2E68A 5K7JA 3M0ZA 4HNUA 1PE1A 3M41A 1I2PA 4HPXA 4PODA 4I7UA 2ABBA 2DZTA 2DZWA 3MJYA 4R34A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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