5U4N | Genus

Total Genus 129

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	129
sequence length	350
structure length	350
Chain Sequence	MALVSMRQLLDHAAENSYGLPAFNVNNLEQMRAIMEAADQVNAPVIVQASAGARKYAGAPFLRHLILAAVEEFPHIPVVMHQDHGASPDVCQRSIQLGFSSVMMDGSLLEDGKTPSSYEYNVNATRTVVNFSHACGVSVEGEIGVLGNLETGEAGEEDGVGAAGKLSHDQMLTSVEDAVRFVKDTGVDALAIAVGTSHGAYKFTRPPTGDVLRIDRIKEIHQALPNTHIVMHGSSSVPQEWLKVINEYGGNIGETYGVPVEEIVEGIKHGVRKVNIDTDLRLASTGAVRRYLAENPSDFDPRKYLGKTIEAMKQICLDRYLAFGCEGQAGKIKPVSLEKMASRYAKGELN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of a fructose-bisphosphate aldolase from Neisseria gonorrhoeae rcsb
molecule keywords	Fructose-1
molecule tags	Lyase
source organism	Neisseria gonorrhoeae
total genus	129
structure length	350
sequence length	350
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2016-12-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5u4nA00

2G5WA 2NLIA 4N6EA 4MZ8A 2KZHA 3G1YA 4IUOA 1VCGA 3LHVA 1HO1A 1QMLA 3L68A 4WQ6A 1EUAA 4FX8A 1L9WA 2E6AA 3R5EA 4MIMA 1W5MA 2Y7GA 1MEHA 3T44A 2WKJA 4N4QA 1X1ZA 3W23A 4UNKA 4JTFA 3C2FA 5K9CA 5BMWA 5FEWA 4JD4A 3VE7A 2P0OA 2JBMA 2YW4A 3PB2A 5KMYA 1EP2A 2Z6JA 3LV5A 4PEKA 4DBDA 5L9FA 2GVGA 4O4VA 1XM3A 3W1MA 2QUTA 5G2IA 3OEXA 3W1RA 1OK6A 1OX6A 1OYBA 2E6FA 1KW1A 5L6UA 3W7OA 2BLEA 4Q4KA 4O52A 3JS3A 1RQHA 3L0KA 3PBVA 3IIXA 3FA5A 1QO2A 3QYQA 1K8XA 2H6RA 3A24A 3C2RA 2X1UA 3P67A 1FX6A 3W1LA 4U4MA 2X16A 3R2GA 2ZA2A 3GR8A 3S5YA 5C2XA 2QCHA 4LVDA 2VFIA 1TSIA 1G67A 4GC4A 2DJXA 1GTHA 1AK5A 4K8HA 2BTMA 2JK2A 2QCGA 2VELA 3N14A 5CG7A 3WJZA 5E1QA 3T40A 3M1ZA 4NJKA 1LORA 5F4XA 4WJEA 5J5RA 1TPDA 3MYOA 3DFNA 1B4EA 2VENA 3N9RA 4JYDA 4C1KA 3C2OA 3M16A 3JR2A 1TV5A 5FESA 3CHVA 4AF0A 4HHPA 2GOUA 3S1UA 4IQLA 4EOUA 2UV8G 3L2IA 5LHEA 4FNPA 3IGXA 4HNVA 5D30A 4Z08A 4XTDA 4HSOA 2RDUA 4JTGA 2TYSA 3S6DA 4M6VA 1JJKA 3I7RA 3SECA 3HQ1A 2Z6IA 3LX9A 3P5ZA 4NNBA 3IIZA 5KITA 1A5CA 1ALDA 3HGOA 2TSYA 2FPVA 3BLIA 1U83A 3GDLA 3P8JA 4J9JA 5FF0A 5LSMA 3C8FA 2G96A 3S5NA 2BSLA 1PIIA 2Y7FA 5BNKA 3KHJA 4CNPA 3HO8A 1UJPA 3AJXA 2QAPA 3C0JA 1VGAA 4O19A 1C29A 5LNSA 4JTTA 2JKAA 4WY0F 3W1NA 3P82A 1NSJA 5TQLA 4RV8A 4LU0A 2VEKA 2C14A 1W5PA 2ISVA 3HG4A 1ONRA 3PR2A 2R94A 4GUFA 3T7VA 1FXPA 2HS6A 3M41A 3QW4B 1WBHA 4UC5A 2OMAA 2PRHA 4JTEA 3OVQA 2QCMA 3KX6A 4L4LA 1GJPA 3F1QA 5U4NA 2OJPA 3W1AA 4NX5A 1TJPA 5DCBA 1VQTA 4RKAA 3PY2A 1XDMA 3CTLA 3I65A 2ZRYA 3RNDA 3L9CA 2FPTA 3G1XA 4GXMA 1JCNA 1GG1A 4I7VA 1DKWA 3QFEA 5I3GA 3LLDA 1K7EA 3MHGA 1MEWA 4FX7A 2ZRVA 2AAMA 4OHQA 3NXFA 4JIQA 4O53A 2W79A 1H7WA 2Y7EA 2Y85A 4O0KA 5CKSA 5K9XA 3OHIA 3Q58A 2FLIA 5CGQA 2VEPA 2QCCA 3SZ8A 4KFOA 3A5VA 2Y6ZA 1TTQA 4BFAA 2A85A 3RMJA 3EKLA 6ALDA 1UUOA 1KFJA 1VHNA 1H63A 3LRMA 2C3ZA 5D37A 5HUPA 5CSRA 3VE9A 1T8XA 1K7FA 4FXRA 2G97A 1OFOA 1KM0A 1LOQA 5CPMA 2WO5A 2ZA1A 4DXVA 1BWKA 1TMHA 2ZDRA 1H7PA 2BXVA 4ZQPA 3DFTA 3NQVA 3DI1A 4L4MA 4RCXA 3BV4A 2PCQA 4TU1A 3LCWA 1KBJA 3MBFA 5EA9A 1B9BA 3DFPA 2ABAA 2R8WA 3M5ZA 2ISSA 2ISWA 1LP6A 1EP1A 1YPIA 2X1SA 1SZEA 4PA8A 3U6WA 1TO3A 1TB3A 2FTPA 4NVTA 2CZFA 3N2MA 1ICQA 1OFBA 3B8DA 1XFBA 4BI6A 2GVJA 3GZ3A 2H8XA 1W3NA 1F7BA 3ANYA 1KM4A 4RR4A 3LRLA 3LDVA 3MO7A 3UWUA 4FXSA 4DPQA 2X1TA 3I68A 1O5XA 3TKFA 4R53A 3FS2A 1VHCA 3DXIA 4NXSA 1Z42A 4IMDA 4TR9A 1Q6QA 2C16A 1PE1A 3S8HA 4WX2A 2O7QA 5C5YA 1YDNA 4AWUA 2RDWA 4GJ1A 1SSGA 1W8SA 1XL9A 3U2OA 3W2JA 2NUXA 1AW1A 3E0IA 4HPXA 3G18A 1OF8A 3O07A 5F1UA 3W9ZA 1TJRA 2HS8A 1OJXA 3THAA 4LUJA 4ZQCA 4HSNA 4HN4A 1SFLA 1V7YA 5CPNA 3N3MA 1VLWA 3QEZA 3LHZA 2QJIA 5KZMA 4BWLC 5AC7A 1GVSA 1WAUA 2J24A 4JN6A 1G7VA 1X8FA 5K4XA 4O12A 3G1VA 3W83A 2CZDA 4QNWA 2ABBA 1LZOA 1L2UA 5HR6A 2ATSA 4QITA 3GIYA 4O4WA 3O6CA 3KVJA 1THFD 3HG2A 4UTWA 4YMZA 3PBUA 4I9AA 3UXAA 1WOBA 3OG3A 4FX6M 3FOKA 3B04A 4OBTA 4JY8A 4DPPA 3HG5A 4WXYA 1PL9A 5KTLA 4IX2A 1XUUA 1KTBA 1I2RA 1YXCA 1L6SA 5IBXC 5AHLA 1GVFA 4ZQNA 1G69A 5DN1A 1ZENA 1I45A 3NQ6A 3E12A 3TUUA 2WQPA 3BPWA 2Y88A 4YXGA 1N7KA 4NJGA 3W84A 2QDHA 3BARA 3BG5A 4LV4A 1S5VA 1KV8A 4UMBA 1RQEA 1R2SA 1O94A 2A21A 2PC4A 3UZ5A 1YXYA 4ZMGA 4JICA 3DH7A 5FF2A 2YR1A 5AC6A 1H7NA 4MY1A 2XFWA 3M6YA 2YPIA 4O54A 4LRTA 3A21A 3G1DA 5EPDA 3GNDA 1I2QA 1T99A 2BX7A 2VC6A 3GNNA 1GOXA 1FBAA 4UTLA 4A2SA 4K8EA 3O05A 3TK7A 4AEOA 3IGSA 2PRLA 4NJIA 1XKYA 5AOUA 2VXNA 3TA6A 4UTIA 3O15A 2DZPA 4JR5A 3IIOA 4YCPA 5AHNA 2D73A 3TROA 3SI9A 3ATZA 4X2RA 1JUKA 1FCBA 3B0VC 3W1QA 3LBCA 3GAKA 2NWRA 5I3HA 1OFDA 1FWNA 5FEXA 5A5WA 5KZEA 2NV1A 3LRKA 5CZSA 3TV8A 2CLLA 2E09A 4QQ3A 3A23A 1NF7A 2I9EA 2ZZ7A 3NQEA 1PCWA 4DEFA 4O0ZA 1KM3A 3T55A 2A7NA 3P7YA 4K36A 4FF7A 3BLFA 5T26A 2ZRWA 3CT7A 1JRCA 3HOJA 3IEBA 1WBJA 4JTKA 3N19B 4PL1A 3HPZA 1IIGA 5TIMA 4N4PA 3HF3A 2RH9A 1C8VA 1S5TA 1IXPA 1H51A 1G4PA 5DCDA 2QR6A 1JCJA 2QJGA 3H53A 3NQDA 5FI8A 1FUYA 5G4EA 4LVBA 4O1BA 3UWYA 4MKNA 2ZFAA 3R12A 3TFXA 4E0CA 4UR8A 3LTYA 4XZ9A 3F4WA 1F05A 5HWMA 2A6LA 3UYCA 1OFQA 4LS0A 5I3JA 1UASA 1Q45A 5I3IA 2YGYA 1L6WA 1C9DA 4MZ1A 1W5NA 1TPFA 3LCHA 4GRSA 4JNMA 3FKKA 3QW3A 1AW5A 1IF2A 1XDLA 3IRDA 4N9BA 1WOAA 5EBUA 3EXTA 5D32A 4O16A 4IMGA 1JQVA 5IBXA 3EEGA 3KRZA 4N2YA 2ZZ3A 1LOLA 4UTTC 1GVOA 4UFIA 3S0CA 2ZZ1A 3SIZA 2Y61A 1ICPA 3EXSA 4K7VA 1W54A 2NXHA 5HNRA 4ZVJA 3QQ1A 3PWAA 2V81A 4GUIA 4RJEA 4O14A 5D2WA 2QKFA 1F2JA 2ZZ5A 1CI1A 3TMQA 2ZYFA 4W9TA 4XKYA 4NNAA 3W7QA 1JCXA 3LCFA 3PUEA 3EX6A 4M6PA 1FWRA 3EXRA 4WOZA 4ONVA 4NQ1A 4NXKA 1UUMA 3B0UX 4G1KA 3L66A 5DCEA 1J2WA 3T4CA 3C6CA 5BOOA 3DU0A 3TSDA 1SU5A 4R33A 3N9SA 1AL8A 2HSAA 2A4AA 3W07A 4X9SA 2WPBA 3W88A 3P62A 1UB3A 4DBEA 4JTLA 3L0GA 1S5WA 1WXJA 3IIVA 1PCKA 1QPOA 1OYCA 1XXXA 4IGHA 3LGEA 3CM4A 3W2LA 5EYWA 1LRTA 4TIMA 3FEMA 5E93A 4QNEA 1EUNA 3S42A 4O1AA 3N2XA 3STCA 4QSHA 3IGUA 1UBSA 4LRSA 3W86A 2J9XA 3I7QA 1F6KA 3W7GA 3NPVA 1YPFA 2QJHA 4LTSA 1T0OA 2C0AA 1EWDA 1HFBA 4HPJA 3W1TA 4AWSA 1KFCA 5BRBA 1DJQA 3KVMA 5CSSA 3S9YA 3NO5A 1TPC1 1UCWA 1O95A 3EB2A 5LNVA 1P1XA 5A8GA 4IPIA 5K7JA 4PC8A 1P4CA 1U5JA 4Q32A 2CWNA 3RU6A 1HUVA 2E1DA 1X7FA 2WJZA 1H5YA 4IMFA 4O50A 3EWZA 3TSMA 3NQMA 5LGZA 4P2VA 2V30A 1X1OA 4PH6A 3WJWA 2FIQA 1ME9A 5LKYA 1YDOA 1VJIA 2TPSA 3I7SA 4A22A 3R13A 1VRDA 3MI3A 2LLEA 4MYXA 4N9EA 5D2TA 4GE8A 4AHPA 2Y62A 4NT0A 3DBPA 1QOQA 3M0ZA 3HPSA 2A7RA 3NGJA 3NM1A 4P61A 3OBKA 4UNLA 1CW2A 4EVZA 2GVLA 3P74A 3OIXA 1KM6A 4O13A 4IMCA 3M5VA 3KVLA 3W74A 5IM51 1P0NA 5K4ZA 4KWWA 1H1ZA 1NEYA 3NL2A 4O28A 2V2HA 5F4WA 2QCLA 3GX9A 1YYAA 3W7EA 1BKSA 4CNOA 2RFGA 4OQVA 2C1HA 2NUWA 2YX0A 1QO5A 1VS1A 3H54A 4K7YA 5KZDA 1RR2A 5LZLA 4WZHA 2WSYA 4FIQA 3MJYA 3USBA 2CLMA 2A7PA 3M5XA 1ME7A 4RXGA 2H8ZA 1W5QA 2ATMA 2E6DA 5C55A 1DQWA 3CWOX 1JCYA 2B7PA 2QCDB 3MBDA 4A2RA 1F6PA 4CQ9A 3Q2DA 3C61A 1VLIA 2EF9A 3P81A 1KM2A 4N6FA 3ABSA 1VYRA 2VFGA 3DKJA 1EB3A 1VCFA 2NWSA 3LI1A 3NNTA 1CX9A 5EY5A 2TMDA 1WYIA 3W7LA 3GDMA 3O63A 4HKPA 4XTIA 1FWTA 1ZCOA 3M9YA 1ME8A 2NXIA 1SO4A 4JTHA 4MYAA 5F4SA 2E77A 3QPZA 4FHAA 1LBLA 3SW6A 1Q6RA 3QH2A 5DXXA 1TQJA 1W37A 3PS7A 1G7UA 4BR1A 4FNUA 1DJNA 2VOMA 1SO6A 2E5DA 3TAOA 4UFHA 2Q3OA 4JTIA 1WA3A 5LNWA 2FQIA 5E0KA 5G1TA 3MHFA 4LY8A 1LOSA 2EKCA 2P10A 3EWYA 1VYSX 1KV5A 3A5FA 3NL6A 2A1YA 4NUWA 4WOQA 1QWGA 3W73A 1Z41A 2YFNA 3NA8A 2YFOA 3NVTA 1Z48A 4JDYA 3IIPA 2DJLA 1DORA 5FEZA 1YTKA 1W31A 4O18A 2NX1A 1GT8A 1TRIA 5CZJA 3E49A 2OX1A 1EWEA 1EP3A 3EWWA 4UMCA 3HBLA 3E02A 4UTJA 4UCGA 7TIMA 3HB9A 3UPWA 3VKJA 5DBUA 5HMSA 2QEZA 3DGRA 3LXAA 4IX0A 2DORA 2QUVA 3PAJA 2OZ0A 3ZWTA 2ZZ2A 4CQ8A 1I2NA 2VEIA 1O4UA 3QJAA 3LCGA 4WY0A 4UFMA 5F1VA 1EX5A 2B4GA 3IV3A 2GPTA 4NJHA 1VYPX 1PS9A 1OVDA 1YXDA 1QDSA 3DFOA 5D03A 3M47A 4D2JA 2VFEA 4MY9A 3LHYA 1SO5A 5D2XA 3TAKA 3FJ6A 1MO0A 1N8FA 1ZAHA 3YPIA 1QAPA 1DV7A 5HR7A 4UXDA 4X22A 3W22A 5EL1A 3C2VA 5J5DA 1LBFA 1B4KA 4OE7A 4Y90A 1E51A 1JUBA 3LOTA 5HUOA 3EWBX 5AHMA 1RV8A 3O16A 1JUEA 3MHUA 3FYOA 3QMSA 2WV8A 3WJSA 2YSWA 3KOFA 1SO3A 3M44A 3CB8A 4MFEA 2OT1A 5AYYA 3PC0A 2V5BA 4Z0JA 2J27A 1H61A 3QZEA 3VFLA 3TW7A 1XBXA 4JX6A 4AF0B 4LVFA 1IXQA 4R7JA 2V8ZA 4XUGA 4OGZA 3CPRA 5SWUA 5I3FA 1TPH1 1H50A 5F2LA 1XBYA 2AGKA 4LC8A 3LHWA 5DELA 3TFCA 1LLZA 3ZR4A 5EKYA 1H7RA 1Q6LA 3LI0A 1RQBA 4LT9A 1IGSA 3L5MA 4LS1A 1LLWA 4Y9AA 3FIGA 1AL7A 1A5SA 2R14A 1YLVA 2W0UA 3GDRA 2JGYA 3PG9A 4M7TA 4RZ5A 3HG3A 1OX5A 4YLWA 5KINA 1JQXA 1FCVA 1RVGA 5LNRA 4BI7A 3HGJA 2H3BA 3EX3A 3UY8A 2C15A 1H62A 2CLIA 4QISA 1ZY9A 1PV8A 5LNUA 2CLFA 4NX0A 1GTEA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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5U4NA

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