5U4N | Genus

Total Genus 129

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	129
sequence length	350
structure length	350
Chain Sequence	MALVSMRQLLDHAAENSYGLPAFNVNNLEQMRAIMEAADQVNAPVIVQASAGARKYAGAPFLRHLILAAVEEFPHIPVVMHQDHGASPDVCQRSIQLGFSSVMMDGSLLEDGKTPSSYEYNVNATRTVVNFSHACGVSVEGEIGVLGNLETGEAGEEDGVGAAGKLSHDQMLTSVEDAVRFVKDTGVDALAIAVGTSHGAYKFTRPPTGDVLRIDRIKEIHQALPNTHIVMHGSSSVPQEWLKVINEYGGNIGETYGVPVEEIVEGIKHGVRKVNIDTDLRLASTGAVRRYLAENPSDFDPRKYLGKTIEAMKQICLDRYLAFGCEGQAGKIKPVSLEKMASRYAKGELN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of a fructose-bisphosphate aldolase from Neisseria gonorrhoeae rcsb
molecule keywords	Fructose-1
molecule tags	Lyase
source organism	Neisseria gonorrhoeae
total genus	129
structure length	350
sequence length	350
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2016-12-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5u4nA00

3ABOA 2H8ZA 3L5AA 3W1RA 3CEUA 5BNKA 1L6WA 1FQ0A 3C0JA 3P5YA 1OF6A 4MZ8A 3STGA 4ZQNA 1VHCA 2A2IA 1H61A 3RU6A 2ZRYA 5CPLA 1B4EA 3BW4A 3G18A 1LOQA 3DFQA 3EX3A 1OFBA 1FXQA 1KA9F 4JY9A 2ISSA 3F4NA 4HN4A 1Q45A 3T4CA 3HPSA 1QO2A 1OVDA 2BWGA 4ALDA 1C9DA 4O52A 2CLFA 4XZ9A 5KINA 5ABTA 4UFMA 1JRBA 1XKYA 1OF8A 1KM4A 4Z0SA 3IGUA 4NXSA 1K7EA 3C6CA 4W9TA 4WY0B 5G1TA 4JNMA 2FDSA 2E68A 3NM1A 4JGDA 2TSYA 4BFAA 4MZYA 3F1QA 4N9DA 2A6NA 1PCWA 4DO6A 1KM5A 4OGZA 3STEA 3UY7A 3TX9A 1UUOA 5D09A 5K3VA 2AAMA 2HMCA 1XBVA 4ADSA 1HL2A 3P67A 2VEKA 3VNDA 4QITA 3QQ1A 3W3OA 2E6AA 5D2TA 4GUIA 4RXFA 1IXPA 1PHWA 4GNJA 3OG3A 1P5BA 1OFDA 2YW3A 1OX5A 2ZZ5A 3O6YX 4MIMA 1TQJA 3NQ2A 5F2IA 4MYAA 4IMEA 2JKPA 1U5JA 1LRQA 1VGAA 3M5YA 4IMFA 4TX9A 3N73A 1K8YA 1VLWA 1GVFA 1EUNA 1P0KA 3CIXA 4MUZA 4O57A 1QOPA 4UTWA 4UC5A 4FO4A 2VFEA 4JTEA 2JK2A 3OVPA 4O13A 4UUIA 1HO4A 4M7TA 2F7FA 1Q6OA 3NL5A 4DQWA 1MO0A 2FB3A 3BG3A 1V5XA 5HWNA 1X1OA 1GWJA 3E96A 3FFSA 2ZRVA 3HPZA 3HOJA 1KFCA 4EF8A 3HGOA 3G3DA 3QMRA 3L0KA 1O60A 1FWTA 3KOFA 5G2HA 4JD4A 3RFAA 3TMLA 4O17A 1K03A 3WK0A 4HT3A 5A5WA 3UXDA 1XBYA 1G4SA 4QISA 3MBDA 4PCFA 3M41A 4O4WA 1LROA 1D9EA 3QMSA 4R33A 3QH2A 3RLVA 5KSWA 2C14A 4ZQPA 3DFNA 3NQAA 1DHPA 1L6SA 4CCDA 2CFFA 3B03A 2AGKA 3W1UA 1B3OA 4KFNA 1GT8A 4IX0A 4LWWA 3LBCA 4X3ZA 1Z42A 3U6WA 2ZA3A 3PUEA 3GXPA 4MFEA 5LZLA 2CLEA 4C1LA 5K2ZA 3M1ZA 3GYEA 4TU1A 5SWUA 2QEZA 4YXGA 3PC0A 3BW3A 4CNPA 3PBVA 4ZL1A 5I3IA 1XCFA 3LHUA 3NZRA 1DJQA 1WV2A 1FWNA 4D2JA 4ORIA 4IWWA 3A23A 4JTGA 1ICPA 4RZ5A 2E09A 4QSHA 1KM1A 4RCXA 4UNKA 4JTLA 1NEYA 3WJSA 5G1YA 2CLOA 1ZFJA 3DFTA 2OT0A 2ZRZA 4RZ6A 4A21A 4LT9A 1UUMA 1DJNA 2FB2A 3R12A 2ZDRA 2CLLA 4LS1A 1B4KA 4MVAA 2WSQA 4L4MA 1I2PA 3NVTA 1QO5A 4CCEA 3T78A 1K02A 2NWRA 5AOUA 2VFGA 4IMGA 4NXKA 1JULA 1FDZA 1R47A 4CNOA 5D32A 2NUXA 1DL3A 3KVLA 2GUUA 2ZZ7A 3LCHA 2DZVA 1JUEA 1CW2A 1JR1A 4AHPA 2QAFA 4GWEA 4AB4A 3TJLA 3INPA 3LM7A 2X2GA 1L9WA 3M43A 3W2NA 4NJJA 3TW7A 2YFNA 4WUIA 4Y6GA 2V5BA 4RK8A 3DKLA 3OIXA 3BVJA 5AHNA 2G97A 4JYDA 2YFOA 2X1SA 1EUAA 1LBLA 4WZHA 1QOQA 5L9FA 2V5LA 2Y7DA 4A2RA 3TK7A 3MHUA 3N2MA 4FHAA 1TV8A 3C8FA 3G1VA 4LC6A 2VXNA 4O28A 2CU0A 1N55A 3ABRA 4ZQMA 4IXHA 3O1NA 3W72A 4XTDA 3RF9A 4XQ6A 2Y7GA 4B5NA 1Y0EA 3QJAA 1KM2A 5DELA 1K7FA 2Y62A 2Y70A 5CZ0A 5H91A 4KWWA 4X9SA 4EOUA 1JUKA 3MO7A 3TXZA 1Z48A 5LKYA 1FDYA 2XN1A 2ATSA 3VKJA 4FX7A 3TXVA 3Q58A 3W1TA 4IX2A 2PRLA 5CPMA 3UZ5A 1TQXA 2WSRA 5LGXA 3V75A 3NQ6A 2D73A 4MKNA 3UD6A 3G0XA 2ABAA 5LNSA 3HQ1A 5CZTA 2P10A 2W6RA 2Z2UA 4ZVJA 1YXYA 4FXSA 5C6MA 2RKXA 3C4UA 2DU2A 5FI8A 1FWSA 4JDYA 1OX4B 3ZR4A 4LNYA 4A3UA 3KRZA 2GVLA 3I65A 3BARA 1OK6A 2JGYA 1HTIA 1O94A 5HNRA 2CZ5A 4JTJA 3A22A 4DEFA 1G7VA 3RNDA 4A29A 3W76A 2FJKA 1EEPA 3AJXA 4HNVA 2ZZ4A 5U4NA 3PG9A 5LGZA 4AF0B 3LCIA 3SIZA 1ME8A 2A6LA 4UFIA 2CZFA 1OYAA 3L5MA 1ZAHA 3I6RA 3SFKA 1YYAA 1VCGA 4NNCA 4OQVA 3MP4A 5D2VA 4JX4A 3UWZA 3W71A 3NYZA 3W7PA 2NX3A 5D05A 5C54A 3G1SA 3QRHA 4NT0A 3EWYA 5EBUA 2VFFA 3L9CA 1XDLA 1KV5A 1KM0A 3P80A 3QMTA 3KRSA 2I14A 1A5CA 3JRKA 2O7SA 4LV4A 1H1YA 3C2OA 2V30A 3G8EA 4FNPA 2YPIA 3MP3A 3PUDA 1JCNA 4WOZA 1FY6A 2P1FA 1W5QA 3S42A 1XBXA 3S1XA 2VFDA 2Q3RA 1EP3A 2QUTA 1BKSA 1QFEA 2YR1A 5E0KA 4ZZ9A 4UTLA 3L21A 2Q3OA 3C2RA 2E6YA 3DGRA 2DZPA 3CTLA 4MYXA 4HNTA 4IXXA 3KX6A 4FF7A 2Q8ZA 3N34A 1L2UA 5LHEA 1SUXA 4IPIA 4JTTA 4ONVA 3M9YA 3OVRA 3TW6A 3NPVA 5I3KA 4TIMA 4EVZA 2RFGA 3SZ8A 1R2RA 5LNVA 2ZQ0A 1TPDA 4LC8A 1ADOA 5DXYA 5BMWA 5F2MA 2YDAA 3UNDA 4RXGA 4JDBA 3H53A 2O7QA 4Z08A 5I3HA 4KKXA 3W23A 1E51A 1VQTA 2G96A 1G7UA 1W37A 3H55A 4LOCA 4XWUA 3WK1A 1LZOA 1PV8A 3MHFA 3NA8A 3IIOA 4ZQOA 5AYXA 3W1AA 1JUBA 1RQEA 5D03A 1TJPA 4UTTC 4PTNA 4ZMGA 1CX9A 1OHLA 3SECA 2C6QA 3QFEA 3ATZA 3THQA 3IVSA 3T44A 3EX4A 1HO1A 1OABA 5HINA 2KZHA 4EF9A 1TTPA 1SO5A 3QYQA 3GIYA 2QDHA 3A24A 1TV7A 5AHIA 2NV1A 1V7YA 5LNRA 2VEIA 1A5AA 3FEMA 4LS2A 1IF2A 3EX1A 3HF3A 1AW2A 2GOUA 3TJXA 1Q3NA 3CB8A 4QJ1A 3BG5A 4JTHA 2QJGA 1Z44A 4GJ1A 5IBXC 4NX0A 3KVJA 2Y89A 2BX7A 3TFCA 3R5EA 1I2RA 2CZDA 2YZRA 3C2EA 3UY8A 1VRDA 3HG4A 3D0CA 5TQLA 2GQAA 1NSJA 4I9AA 1KFJA 1JQXA 2HS8A 1OK4A 5H2ZA 1TCDA 4H6KA 4LVDA 1QR7A 4NZJA 1BEUA 4EWND 1KV8A 4O11A 2DJLA 4O1AA 2WJZA 1W5MA 1MEHA 3LTYA 1WBJA 3BG9A 3PSVA 5DXXA 1FWRA 3RLUA 2X1TA 4XTIA 3ZS4A 3QZEA 5AC6A 4FNQA 3LV6A 4YMZA 3TUUA 2PE4A 4DBEA 1LRTA 3NPXA 1W8SA 3FOKA 1F6PA 1NVMA 3TNOA 1ZY9A 3W7RA 3MJYA 1AG1O 4UIOA 3IIVA 4O10A 3UPBA 3MYOA 4RJEA 3MW7A 1GPWA 3G8RA 1XDMA 3GDMA 5FEZA 1OFAA 3W2JA 2H90A 3MBFA 1P1XA 3W2LA 2F84A 2Z6IA 3SGUA 1WXJA 3C61A 5J5DA 3NAVA 1FXPA 4QNEA 4CNNA 4Y96A 3QC3A 4ADTA 5F1VA 1F2JA 3VI2A 5K9CA 1JCYA 3HG5A 3UWYA 4N4PA 3S5NA 4Q4KA 1W5OA 1PCKA 4UCGA 1NFBA 5HWJA 5AYYA 2WNNA 3PG8A 5CPOA 4JYFA 4TMCA 3TSMA 3LHTA 2CLMA 4LW7A 4LRTA 1LOLA 2NV2A 3NEVA 4R34A 4YLWA 1ICQA 1GG1A 2RDTA 3HJZA 3EKLA 3BK0A 3A21A 3LTPA 3C2FA 2Y7FA 5CSRA 1O95A 1R30A 3CWOX 2QCMA 1FCBA 3QPYA 4BWLA 3W2UA 5K4ZA 1LYXA 4U28A 1IXQA 2Y61A 2CLKA 4NZFA 3S1WA 2NXIA 3BGGA 4FB7A 5J5RA 1KBIA 4IGHA 5D04C 1KLYA 3B8DA 1KFKA 3EX2A 4L4LA 3BLEA 2Q8LA 4FNTA 3TMQA 3PBYA 1KM3A 1H7OA 2OX1A 1YADA 5TBOA 4AH7A 2GVJA 1TPC1 5FF3A 2X1RA 5F4SA 3F03K 4UTHA 2ISVA 5FEXA 1VH7A 4CQ9A 1SR9A 4BK9A 1TO3A 4UFJA 2JGQA 3NQVA 1H5YA 3NQGA 4O1CA 3EWWA 3W84A 1ME9A 3W7QA 3MUXA 1PHQA 2DORA 5EPDA 3V1PA 2Y85A 2WKJA 3NXFA 2FIQA 1DORA 4JS3A 4KWVA 3LDVA 4OBTA 4ORMA 5KZMA 2Y6ZA 1FWWA 2NZLA 1EX5A 4UXDA 5G4WA 2H3BA 3PF3A 5KZDA 1RV8A 2QCEA 4AEOA 1W5PA 2WQPA 4WX2A 1SSGA 2C19A 3B05A 1DQXA 4JIPA 5DBUA 4O0KA 1OFOA 3W7HA 2ZZ3A 3NDOA 1PS9A 4O14A 2A4AA 1AW5A 3MP5A 3I7SA 4E38A 3NQ8A 1XI3A 5HR7A 2J24A 4O16A 1VYPX 5TIMA 2HSAA 2VEPA 3HGJA 2E5DA 5HQEA 3LRMA 2E6FA 3NQ7A 3OHIA 3R8RA 3EWZA 1SW7A 4CQ8A 3AO0A 4RR4A 3EWUA 4FNRA 2DZUA 3R89A 1LOSA 1NAL1 4TR9A 5FESA 1ZENA 1W3TA 4MLJA 3G0SA 3NQCA 4GC4A 4O15A 4HSOA 2P0OA 4S2CA 1T96A 1B9BA 3LXAA 1C8VA 1EWDA 3U8GA 3LXCA 2FPYA 3HBLA 5LSMA 1OFRA 2YGYA 1TV5A 2XN0A 2QCLA 3O8AA 1ZAJA 3LOTA 1KTNA 1VYSX 2H8XA 1K8XA 3UXAA 5AB3A 1FUYA 3KXQA 3M7WA 3B0PA 4BI5A 4JYEA 1J5TA 4JICA 1K3UA 2OMAA 4N2YA 2UV8G 3A5VA 4MLRA 3OBKA 1GVSA 1SFJA 3FKRA 3W73A 1YTEA 2VELA 1O5XA 1AK5A 2Z1BA 4RZ4A 3DI1A 1GVQA 4WXZA 3M5VA 2DJXA 5HJLA 4MZ1A 1MXSA 3W7KA 1JCXA 3TQVA 4MPQA 2PRHA 1HG3A 3IRDA 3FLUA 4DO4A 5HR6A 1NF7A 2A7PA 3GXTA 3W1LA 4O8RA 4O1DA 5FF7A 1EIXA 5CG7A 5DCEA 3EX6A 1QMLA 1M7OA 4PL2A 3LB0A 4CCCA 4WD0A 3GDKA 1NF0A 5CGQA 4X22A 3DI0A 2NLIA 1GEQA 4Z1CA 2NUYA 3SI9A 1SO6A 3W9ZA 3FJ6A 3R2GA 1FCUA 1R2TA 3PSWA 1JCJA 3OEXA 1WX0A 2RHGA 3UQNA 1LBMA 2XFWA 3NGJA 3G22A 5D02A 2G95A 3S5ZA 3H54A 4O12A 3S5OA 1G67A 2E1DA 4N6EA 1EA0A 2R91A 5CZSA 1ME7A 4NJKA 4UTJA 5EA9A 3GK0A 3USBA 3QF0A 1PL9A 3W22A 2A7NA 1LDCA 3TAKA 4M19A 3N14A 4LVBA 3TSDA 4LVAA 4DF2A 2ZZ2A 3EKZA 4POCA 1FCVA 5HUOA 3GDTA 3QPZA 1BWLA 4C1KA 4S2BA 1ZCOA 1SZNA 3P81A 4MY1A 2ZYFA 3SR7A 4YWIA 3HIJA 5AC8A 2BLEA 3BPWA 1WDWA 2J9XA 2VFIA 3LERA 4N9BA 3W6YA 1M7PA 3KVMA 5D2YA 1T99A 2EF9A 4HPJA 5BRBA 3C52A 2B4GA 2NXHA 4RLIA 2WSYA 2QKFA 1IIGA 3W7CA 1SPQA 1J4EA 3ZFHA 4AWUA 4TMBA 1GYLA 2A21A 1GQNA 2VOMA 3BLFA 3NQEA 4I7VA 2QCGA 3B0UX 4ML9A 3W70A 4GRSA 3W7GA 3UWVA 1TB3A 1F5ZA 3FKKA 4UFLA 1SW3A 3KHJA 1GG0A 3WJXA 4K37A 2GVGA 4OT7A 2ZCGA 4NQ1A 3L2IA 1TRIA 2ZBTA 3B4UA 3HB9A 3NNTA 1YDVA 3N2XA 2TYSA 1VC4A 4QNWA 2FPTA 3W85A 3G0UA 3ELFA 1I2QA 3CHVA 2CLIA 1VZWA 4DF0A 4MY9A 2QR6A 3TQKA 3GR7A 3KAOA 2A85A 2A7RA 1T0OA 4AVFA 2EPHA 4LU0A 2W79A 4OU1A 4X2RA 1RD5A 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3L0NA 1H7NA 4HNNA 2GQ8A 3O15A 3W1QA 1XM3A 4OV4A 4Z0JA 3NO5A 3W7EA 3S0CA 3EWXA 1TREA 1YTDA 2C3ZA 2X30A 4XUGA 4PFMA 3W7IA 3B06A 3RMJA 4PODA 2JKAA 4N4QA 4R53A 1I45A 4UTTA 3K30A 4AXKA 3O6CA 2V0TA 4HSNA 3E9AA 4N6FA 3P8JA 3G1DA 5C2XA 2QJHA 3HG3A 1TPH1 3CT7A 3DH7A 2DP3A 1K7XA 2V2DA 3E49A 4MJZA 1YDNA 3W1PA 3LI0A 5E93A 1BWKA 4UTIA 4P2VA 1GTEA 1H7PA 2DZSA 3LV5A 1GYNA 5IBXA 3FS2A 1WAUA 3S1UA 4YCOA 5DY3A 2QCNA 5D30A 1IXNA 5K9XA 2BSLA 5AN7A 2JBMA 3ANYA 2XN2A 3L5LA 4GE8A 4WJEA 4UTWC 5K7JA 2ZRWA 4OWGA 3S1VA 4LTSA 4JXCA 5G2IA 3P84A 3KRUA 3P5ZA 3PS7A 3IIZA 1LCOA 3MI3A 2PC4A 4FX6M 4Z1DA 5BW6A 3IVUA 3NOEA 1IIHA 4FX8A 3CPRA 3GVGA 2VC6A 4JIQA 4AWSA 5F2GA 1SQ7A 2QCHA 4BI7A 1U83A 2JKEA 1H7WA 5HUPA 4NJHA 2ATMA 3W07A 1YPIA 4HKPA 1RR2A 3EWBX 2G5WA 3T40A 5K4XA 3ATYA 1G4TA 5T26A 5CZJA 1TTQA 1VCVA 1LBFA 2QDGA 2ZTKA 3NL2A 4JTFA 2Z0IA 1N8FA 3EEGA 1KFLA 1Q6QA 5FF4A 1KBJA 1P0NA 3G24A 4E0CA 1H51A 1MSSA 2ZZ1A 1DKWA 1KM6A 2J88A 1ONRA 1W0MA 2WO5A 1YXCA 3W75A 3W1XA 2CZEA 8TIMA 1AL7A 1S5TA 3N9RA 1LTDA 5F4XA 3U2OA 3SSJA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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5U4NA

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