5AYB | Genus

Total Genus 178

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	178
sequence length	440
structure length	440
Chain Sequence	ERFPADFVWGAATAAYQIEGAVREDGRGVSIWDTFSHTPGKIADGTTGDVACDSYHRYGEDIGLLNALGMNAYRFSIAWPRIVPLGAGPINQAGLDHYSRMVDALLGAGLQPFVTLYHWDLPQPLEDRLGWGSRATATVFAEYADIVVRQLGDRVTHWATLNEPWCSAMLGYYLGVHAPGHTDLKRGLEASHNLLLGHGLAVQAMRAAAPQPLQIGIVLGLTPTYPASDSPEDVAAARRFDGFVNRWFLDPLAGRGYPQDMLDYYGAAAPQANPEDLTQIAAPLDWLGVNYYERMRAVDAPDASLPQAQRLDDPDLPHTADREVYPEGLYDILLRLHNDYPFRPLYITENGCALHDEIAEDGGIHDGQRQAFFEAHLAQLQRALAAGVPLKGYFAWSLLDNFEWAMGLSMRYGICYTNFETLERRIKDSGYWLRDFIAGQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	BETA-GLUCOSIDASE
publication title	Crystal structure and identification of a key amino acid for glucose tolerance, substrate specificity, and transglycosylation activity of metagenomic beta-glucosidase Td2F2 pubmed doi rcsb
source organism	Metagenomes
total genus	178
structure length	440
sequence length	440
ec nomenclature	ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date	2015-08-12

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	5aybA00

3BAXA 5A8OA 3AZRA 2WKLA 2G8ZA 5A94A 3F4VA 4BA0A 3AICA 4J7RA 4QLKA 2J75A 4PTMA 2PF0A 1EOKA 1R7AA 1X6LA 3LPOA 4IM4A 1V02A 3W28A 2HVMA 4JKMA 1KCKA 1UQZA 1DWJM 3FHAA 4ACZA 4OIFA 1G01A 4UQAA 3RM9A 3T09A 4W93A 2EXOA 2V3DA 1C7SA 5D9OA 1KR1A 3N11A 4UOQA 3MANA 4OJYA 1UD5A 2YLAA 1ISZA 1TR1A 4Q22A 1M53A 2WANA 1H5VA 1HX0A 2CKRA 5A6MA 2YDRA 3VKKA 3WY1A 4DUWA 4XX6A 5A6BD 1D7FA 4MDOA 3TTQA 4D6DA 1PZ3A 2J77A 2CBIA 3GXIA 3FN9A 3MUY1 2ZXBA 4IPLA 3ECQA 4MB4A 1C8YA 5M3WA 1QNRA 1J01A 1J0YA 2BNJA 3K4DA 2IXVA 5HNNA 3T2OA 3WD3A 2PB1A 3CUGA 3AMDA 2GFTA 1E0WA 1U30A 1QNOA 3CZJA 1BHGA 1ISYA 4XUYA 4ZE5A 3WH7A 4MB1A 3W37A 2WCSA 3WELA 2J7FA 5A6AA 3MMWA 2ZXDA 5A8MA 3TONA 5IFPA 5BRPA 1FFQA 1TFVA 1UH4A 2E9BA 3RJYA 3ZIZA 1ZS2A 4F8XA 1KGWA 3AIQA 4JFTA 4GZIA 2WPGA 2GK1B 4W7UA 1GQIA 1FFRA 1Q6FA 4PMUA 1ZBCA 1ZU8A 1ZBVA 4PYSA 3VGGA 3EYPA 1CLXA 4TVCA 3I3BA 3F5KA 2XVGA 4PMQA 3W81A 4MB5A 3AS2A 3W82A 2D23A 3VMOA 4V28A 4B16A 4D71A 3WEOA 4LYPA 2J4GA 4CCEA 3QHOA 3AYSA 3L4VA 3VM7A 5A8QA 5EBAA 1HKJA 1RH9A 1E1EA 3VGHA 5CSYA 1E3ZA 1WKYA 1ISWA 1V6XA 4UQCA 1YQ2A 4LYRA 1AQHA 5CLTA 1JFXA 5I3DA 1HVXA 4J3TA 4B3KA 3AIBA 4HA3A 3IJ7A 1A3HA 1XH1A 3WKZA 2VRQA 1JZ6A 1MFUA 9CGTA 3ZJ6A 1HJUA 1GOOA 4HTYA 5AY7A 1CYGA 4AEFA 1BYAA 3VDAA 3ZT6A 3OLGA 1GONA 3SCRA 3WEMA 3AS3A 3ARVA 4E8DA 1ISVA 4AYSA 3WQ5A 1GPFA 1GJUA 2XVKA 4PMRA 1QHOA 1VEMA 4P8UA 3SEPA 3K1DA 1PX8A 1V6UA 2JF6A 4JCMA 2XIBA 4CKQA 5EFDA 1E6RA 3AIUA 3J7HA 1V0LA 3AXIA 2F2HA 3ZR5A 1V3JA 3TTSA 4ZEPA 5D9MA 3O6AA 6A3HA 2DSZA 1J0KA 1JL8A 2E0PA 2Y24A 3F5LA 1AMYA 5BRQA 1JAKA 3DYOA 1WDPA 4H41A 3BCFA 1GVIA 1U2YA 3SCNA 3PZNA 3VOCA 1EA9C 4GI9A 1JGIA 2JF7A 2VZUA 3MKKA 3LPFA 1UR1A 3TTYA 4GQQA 1SMAA 3WQ6A 2J79A 3K8MA 3AI0A 1CENA 1KB3A 1H09A 2QLYA 1KQZA 4B9ZA 1QI2A 4NF7A 2VR5A 2YOCA 4AIEA 1KWGA 3CTTA 4V27A 3RM4A 3SUWA 3WL1A 1FHLA 4P7OA 3WUGA 3ZO9A 4X0NA 1VFUA 4H2CA 3K8LA 2W4XA 4UFHA 2WMIB 3VO0A 1EDQA 2X1IA 3PN8A 5E6ZA 1R86A 1UWIA 2WC7A 4W7VA 1Y7VA 2OSYA 2A3EA 4PBGA 3G6LA 2EBNA 3ZJKA 3KWXA 3ARTA 3CBWA 3GYCA 4KMQA 4PMNA 1CGYA 2WZIA 4AD4A 2YLLA 3N15A 4H7VA 3TA9A 4X0VA 2ZWZA 2GJRA 4GO8A 2CHNA 5E0FA 1JD7A 4BQ3A 2XG9A 2VVSA 1BF2A 2VZVA 4PTWA 1XH0A 1OGGA 2DIEA 1OT1A 3D5HA 4AMCA 1NARA 1OB0A 2WK2A 1B9ZA 3QOMA 5CSUA 2BS9A 1NWUA 4UFMA 1UWSA 4WKHA 4YPJA 4KH2A 1XYZA 2ZXQA 4PTVA 3VIGA 2G3IA 2VVNA 5CGMA 3AQUA 4FLQA 2VMFA 4P7LA 5JBEA 2CERA 3WDHA 2X8RA 3WQ8A 2VZSA 3TTOA 2J7EA 1G5AA 4LX4A 5C70A 1V0NA 4U5IA 3MMDA 1WP6A 4Z2KA 2CCRA 3CMJA 1EDGA 1EQPA 3CHEA 1H0IA 3DYMA 3VIJA 1L0PA 4AZ7A 1BVNP 4PMDA 1K6AA 2PBOA 3GNPA 5M17A 1WAWA 2DGAA 2WZEA 1RP9A 3K8KA 3VIKA 2XIIA 1JYXA 2V38A 4GPNA 1BLIA 4J3SA 1EHAA 1GJWA 4PUEA 3E1F1 2UY2A 1JYNA 5BXSA 3AYRA 2G3NA 2VQTA 2YDQA 3CHCA 2G3JA 4UFLA 5JUVA 5A8PA 1E15A 2WKGA 3NSXA 1NOFA 3WDRA 3SCSA 5BWFA 4AZCA 2J7DA 3ARXA 1BPLB 3KL5A 1MXDA 4D1IA 1DTUA 3CLWA 3U5UA 4PMZA 1E3XA 1XYFA 2GSJA 3SCUA 3QR3A 2CPUA 3VUPA 4AC1X 3SUVA 1BFNA 4H8VA 4PN2A 1C7TA 3T0BA 1HL9A 2VO5A 1IV8A 3A4WA 1RPKA 3BLKA 2XVLA 5JIWA 1E70M 2JALA 3WD1A 3AXHA 1MWOA 4HOXA 1R85A 4EAMA 1G0CA 4FLOA 4UNIA 3SCWA 1E0XA 3HN3A 4GI6A 2XHYA 3MO4A 5E6YA 2D0GA 5A6KA 2EPOA 3GH7A 4WF7A 1WDSA 2VZTA 3LPGA 3T2PA 4ACYA 2W66A 1JYVA 1QI5A 3GXFA 3A4AA 4JHOA 2YA2A 3IJ8A 4F66A 1UA7A 1OD0A 1B2YA 1BYDA 4AISA 2QMKA 3WF1A 5A2BA 4TTGA 1B90A 3GTNA 4AD1A 4CN6A 1HP5A 1TA3B 1J9YA 2D3LA 4PTXA 2J25A 2ZUWA 2CETA 3KZSA 4CCCA 4BCEA 2ZUMA 2Y4SA 3SCQA 2EO7A 4QLLA 1NH6A 1FP8A 2XSAA 3WQWA 4MNMA 3N04A 1VIWA 3AIEA 3A47A 1E5JA 2ZX6A 2QV4A 1E9LA 1CEOA 1UHVA 3ZJ7A 2J62A 3EDJA 1E71M 1JZ5A 1R8LA 2BY1A 1V02E 3WD2A 2J8FA 2EPNA 3WNKA 3ZOAA 3GNOA 3SCOA 4M82A 2XWDA 3WNPA 4HP5A 2V3FA 2YKKA 3B9DA 4JIEA 4PSRA 1SMDA 1XRVA 2XSBA 4JZ5A 3UG4A 1BTCA 2WM0A 1XC6A 4L4OA 1NWSA 1FA2A 3PBGA 2DSWA 2VRJA 1I75A 2XVNA 3VX1A 3OLIA 4BQ4A 5DT5A 1E6PA 3FAWA 2WHLA 2BFGA 1JZ3A 5GNYA 4HPGA 2FDMA 4U31A 1C8QA 1EH9A 4CD8A 3I3DA 2WMIA 3VD7A 3QHMA 3W24A 5D8ZA 1WPCA 1EDTA 4C7DA 3RMEA 4W8AA 2E8YA 3CPUA 3CUJA 1U33A 2WCGA 3O2LA 1CGXA 3PZIA 1QNPA 1VFFA 3WNNA 1HL8A 1SR0A 4AIUA 2VURA 3MV11 4HMDA 3WDQA 1VEPA 1NM9A 2J7CA 5BROA 2RGMA 3KEHA 3NUKA 4FK9A 4XZBA 4OKDA 5CZKA 4J3XA 1MXGA 4MNKA 1J0IA 4B3LA 4GINA 7A3HA 1XH2A 3PZMA 2G3MA 3IAQA 2D24A 2GJXB 4DWSB 1TG7A 3RCNA 5JIPA 3U57A 3BAYA 1HJXA 4HU0A 5FD0A 4K68A 1FHDA 3AHVA 4DUVA 1GOMA 3N1AA 4M29A 1PX4A 3W6MA 4ATLA 3GXDA 3GZAA 3ZM8A 4W5ZA 3BH4A 1B31A 1PBGA 1E4IA 1BYBA 1GNXA 5E0CA 2ZUTA 3FW6A 1C8XA 1PZ2A 3ZMRA 2F61A 1UKOA 1XV8A 3AFBA 1LG2A 3MSGA 1HP4A 2VX4A 4AZHA 4TVDA 3T2QA 1UUQA 3ZR6A 2JIWA 3EDDA 4U2YA 2Y5EA 5HOSA 3OIHA 3SUUA 3N18A 3VU2A 3W6LA 1UWTA 3UG5A 3T08A 1CZ1A 1OT2A 4AEEA 1UOKA 2NSXA 4HA1A 3WNMA 2WMKA 1BGGA 3WIJA 1S46A 1H4PA 1W3LA 3VX0A 3SURA 4AWEA 1V03A 2DSVA 3NDZA 4D1JA 2PWEA 2DEPA 1GOWA 1UYQA 3W38A 5I2UA 1MFVA 2DPEA 4M1RA 4CD5A 4JKLA 1QW9A 3AHYA 4CU7A 2X2YA 1VAHA 1ZL1A 3AHXA 4F79A 1JG9A 4D6CA 3PTMA 3AMLA 2XFFA 1WB0A 1W1PA 1HVQA 1MQPA 4CGTA 1KXTA 1VBUA 3THDA 3BMVA 3IJ9A 4E2OA 1SYTA 2A3BA 2EPMX 1CGTA 4AXNA 3BAJA 2BVYA 4LPCA 2E40A 4AZCB 5E70A 5DT7A 4KRUA 1OINA 3FNDA 5KEZA 3UERA 1JF5A 3OB8A 4AZ5A 1CIUA 5IXEA 5AC4A 1W9PA 4YN5A 3OG2A 2C8NA 2XWEA 2VX6A 5EMYA 1TA3A 1VEOA 3O9NA 1MW3A 2WAGA 1R7OA 2D1ZA 3FXYA 5CG0A 2WVVB 4W89A 3VNYA 4HU8A 5ABEA 4UOZA 3VGBA 1ITXA 1ODUA 3OZPA 2WWCA 3II1A 2VOTA 4U5KA 4V2XA 4WSJA 1CGVA 4GIAA 4IUGA 1LF1A 3WBAA 4HOWA 2OWCA 3BC9A 3EMQA 4WIWA 2AMGA 1NQ6A 3W25A 1BYCA 2ZX8A 3CUIA 4MAVA 3A3HA 2WBGA 1UG6A 3VIOA 6TAAA 1GCYA 1W1YA 4MJ4A 4FLSA 4JCLA 1V3MA 1QI3A 1H41A 2BXYA 1W91A 3NCOA 1ISXA 3A6OA 4UZSA 3PZGA 2NW0A 2E4TA 2W62A 3FY1A 1E0VA 2WVSA 2CBJA 4PEEA 4H8HA 1UD3A 3THCA 3KL3A 2JIEA 2F8QA 3LPPA 4XV0A 1XHGA 1MYRA 1EHNA 1HJQA 4D72A 3ARWA 5AYBA 3W53A 3PZUA 2X0HA 5HXMA 2UY5A 3ARSA 3FHQA 3AMCA 4W85A 4NRRA 2VUYA 2AOSA 1GQLA 4B15A 1EQCA 3ZSSA 3WDJA 1H3GA 3VIHA 3RIKA 3NDYA 3APGA 4OUEA 3WH5A 1JDAA 1HJVA 1R87A 3VGFA 4CU8A 1JNDA 4LGXA 2O9RA 2FHFA 4UQ9A 3VM5A 3CMGA 4CN1A 3CUHA 3NJ3A 3VDCA 3PZQA 3AS1A 4U2ZA 1E6NA 2ZX5A 3BAIA 3POHA 2QF8A 3B8SA 1X1NA 2VTFA 3TP4A 4D6IA 5D9PA 2Z1KA 1UKQA 2WMJA 3U5YA 1OIMA 1Q6EA 3BXWA 4J3VA 1E4NA 2YA0A 5EFFA 1B3VA 1QPKA 1MQRA 3PHAA 3T0DA 1B3ZA 2XJ7A 1LWJA 1E6ZA 2UY3A 4HZ7A 5A6SA 4JKKA 3ZSTA 2GJXA 4DWSA 4R5EA 2WMFA 3ARPA 2WC3A 3CZGA 3WEZA 1I1WA 3W26A 4AZ6A 5A1AA 2E3ZA 3L4WA 2DT3A 3A4XA 2QPUA 4EANA 3NYDA 1XD0A 4TOQA 4RE2A 1UR9A 2CESA 1M04A 2W67A 1LL4A 3DC0A 2CBUA 1W3JA 2BHYA 2J74A 3FAXA 1W9VA 2BHUA 1WZKA 3BSHA 2VR4A 2HISA 2PC8A 5DF0A 1TMQA 1CXKA 1KGXA 2VX5A 4UTFA 5C8BB 1DWFM 1XSIA 2CITA 3W0KA 3AIRA 4F9DA 4WLCA 3VILA 1E56A 2W5FA 4W5UA 3M7SA 1UD2A 1BQCA 2CYGA 1V6YA 2WZHA 4QLJA 1V6WA 5CPQA 1OD8A 3MSDA 4CN4A 1H1NA 4BQ2A 4WKFA 3GH4A 3GH5A 1UR0A 4H04A 4ZFMA 1CXIA 1UD4A 3AMKA 1KFWA 4IPNB 4PMXA 1SFSA 3VGDA 4EK7A 3WENA 1M7XA 3ZJ8A 4W84A 2WSKA 2PWGA 1CXEA 2BV9A 2OWWA 3CZEA 3PZOA 4HZ8A 2TAAA 2DSKA 3CIVA 5ABGA 1W32A 4H8UA 3ZT5A 4TTUA 5LYRA 1QW8A 1QBAA 3T0AA 6CGTA 4QCFA 1QOXA 4AZBA 3U7BA 2VCBA 4AY1A 1TE1A 3K4AA 4ZE4A 1KCLA 5FL1A 3B9EA 3M6DA 2J7HA 2WHJA 4QP0A 1YHTA 2ZUUA 3HMCA 2GUYA 4ATDA 1H49A 5BXPA 5HPOA 2RGLA 3WUEA 1US3A 2A3HA 1FOBA 2OSXA 4NZCA 3GM8A 4KWUA 1NOWA 7TAAA 2WMHA 4GZEA 1B3WA 3WDIA 2WVVA 1E6SM 2C0HA 3PZTA 5CGTA 4MB3A 5A95A 5BYWA 4C7FA 4UZUA 2YJQA 1WCGA 4UQEA 1C3FA 1BG9A 5TD4A 1JFHA 4LYQA 4PUDA 2WHKA 3BMWA 4WK9A 1ODZA 1W2VA 4CCDA 3MUIA 2WBKA 4KRTA 3ZQ9A 3BLPX 1CDGA 3WH8A 1CBGA 2V5CA 3L4UA 4S3JA 2ZWYA 1J0JA 3OZOA 1KGUA 1W1VA 2W63A 3CH9A 4U3CA 1D3CA 3VMPA 1HXJA 1Q6GA 5FOOA 2DH2A 5DEZA 4ZXOA 2VZOA 3AROA 4MJ2A 1O6IA 1CXFA 1F4HA 3CHDA 3NIYA 1CXLA 3AOFA 4R27A 1UWUA 4HOZA 4W86A 5E9AA 2WB5A 3RPMA 5AC5A 1BVZA 1CTNA 1NWRA 4Z2HA 4CVUA 1G1YA 1JF6A 2O92A 1C90A 4ML4A 1UKTA 1E6XM 2D2OA 3VIFA 4GO9A 1NP2A 1DWIM 5ECUA 4KGJA 1KBBA 4CD7A 4WSKA 2QMJA 3RJXA 3VD3A 1BSIA 5LA1A 3CZ8A 4BS0A 4AD3A 3PTKA 3IAPA 5BXRA 3JUGA 3WDPP 5HBFA 2FH6A 5A2CA 1K9EA 1CGUA 1MW0A 1KXVA 3WUBA 3SUTA 3ARZA 3EMZA 3UR8A 1AQ0A 3WNLA 1VF8A 1XGZA 4TXEA 2EPLX 3WUFA 2CIPA 2ZE0A 1M01A 2YL8A 2XVPA 1VJSA 4GKLA 4P8WA 1TVNA 4HMEA 4AD5A 1AVAA 2VCAA 1L8NA 2WLZA 4JFSA 1A47A 2WLYA 3RDKA 1QNQA 1QBBA 1EO7A 3AHZA 1TUXA 1UR8A 1Q6CA 5EB8A 1KXQA 1IT0A 3MUZ1 3WQ4A 3WMSA 2QPSA 4LXFA 2PWDA 4N0RA 4AIOA 4DM2A 1C91A 1TVPA 1X6NA 2DT1A 2OYKA 2O9OA 1E4LA 3DYPA 1VRXA 2YL5A 1J12A 3OLDA 1Q4NX 3UETA 1I1XA 4CUCA 5CJ5A 5I0DA 1UQYA 3UR7A 1WE5A 3SUSA 1IZJA 5D9NA 2CHOA 2FHBA 5D4YA 1FH7A 1N82A 3CUFA 2ZXAA 2DDXA 1HJWA 3SCPA 4UFIA 4MNLA 2JFEX 2E9MA 4URIA 3MU7A 2EJ1A 5GQBA 2X0YA 1K9DA 2MANA 4X9YA 5JBFA 1OBAA 5CPSA 1DWGM 2NT0A 3N12A 2O9TA 2WVUA 4J3UA 2PWHA 1LQ0A 2D20A 3EDEA 1CLVA 2G4FA 4NRSA 4HPHA 4W8BA 1E73M 1XCXA 4P7RA 1IZKA 1PPIA 5ABHA 5CXPA 3VDHA 5BXTA 1V3LA 1V0KA 3BGAA 5ABFA 3AZTA 3EMCA 1MQQA 4P7NA 4A3HA 1D2KA 2XFRA 1JDDA 3BSGA 1JZ2A 3OA5A 4UR9A 3ALGA 2XPKA 5A2AA 1VENA 1HIZA 2J7GA 1MW2A 2ZX7A 4UFJA 1JZ4A 5M5DA 5DMYA 2JEPA 3RILA 4Z2LA 4PMOA 2YA1A 5I77A 3RM8A 3OGSA 3WF4A 1CECA 1K9TA 2VX7A 3WFZA 4E4PA 3L4TA 1W2PA 1UD8A 1XSJA 2D22A 2GDUA 1VB9A 2J78A 2G41A 4J28A 3WL0A 3VGEA 5A8NA 1E1FA 4IISA 4GI8A 3PTQA 3SIMA 2PWFA 4AD2A 3LMYA 2BVTA 4MNJA 4BF7A 1RP8A 2XM2A 1JDCA 1UH3A 2DH3A 1OGSA 3VD5A 3L4ZA 5I6SA 3VD4A 1RD6A 3BAKA 1WDQA 5A6LA 1E5NA 3F5JA 1WDRA 3VD9A 1LL6A 1FP9A 1B1YA 5D8WA 1JIBA 2DT0A 1US2A 2VRKA 4M56A 4OOZA 4PMYA 2W92A 4D6JA 2J47A 2JEQA 1V3IA 1CWYA 3OLEA 4XZWA 3WD4A 1HJSA 2W91A 2WNWA 3AIWA 1JNEA 1UH2A 1UR4A 3WH9A 4D6HA 8CGTA 3ZT7A 1UA3A 4N42A 2WC4A 1PX3A 1PJ9A 1UKPA 2W61A 5CQ1A 4M24A 3VDBA 1GQJA 3KE0A 2VI0A 3VVGA 1E4MM 4JFUA 1LWHA 5M03A 2CXGA 1XCWA 1J18A 2UWFA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5AYBA

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