5AYIA

Crystal structure of gh1 beta-glucosidase td2f2 n223q mutant
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
ERFPADFVWGAATAAYQIEGAVREDGRGVSIWDTFSHTPGKIADGTTGDVACDSYHRYGEDIGLLNALGMNAYRFSIAWPRIVPLGAGPINQAGLDHYSRMVDALLGAGLQPFVTLYHWDLPQPLEDRLGWGSRATATVFAEYADIVVRQLGDRVTHWATLNEPWCSAMLGYYLGVHAPGHTDLKRGLEASHNLLLGHGLAVQAMRAAAPQPLQIGIVLQLTPTYPASDSPEDVAAARRFDGFVNRWFLDPLAGRGYPQDMLDYYGAAAPQANPEDLTQIAAPLDWLGVNYYERMRAVDAPDASLPQAQRLDDPDLPHTADREVYPEGLYDILLRLHNDYPFRPLYITENGCALHDEIAEDGGIHDGQRQAFFEAHLAQLQRALAAGVPLKGYFAWSLLDNFEWAMGLSMRYGICYTNFETLERRIKDSGYWLRDFIAGQR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE
publication title Crystal structure and identification of a key amino acid for glucose tolerance, substrate specificity, and transglycosylation activity of metagenomic beta-glucosidase Td2F2
pubmed doi rcsb
source organism Metagenomes
total genus 178
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2015-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5ayiA00
2XFYA 1LF1A 2XWDA 4XX6A 1HL9A 3WD2A 1KCKA 5GNZA 3ARPA 3PZNA 8A3HA 1LWHA 1QHPA 4DUWA 1CENA 5A2BA 4CKQA 3PZQA 2YA2A 3N04A 4JFTA 3MMUA 4EE9A 3T0AA 1QI3A 1PX3A 6CGTA 4V2XA 4H8VA 2VURA 3EBVA 1GQJA 1ISYA 3OLEA 1VBUA 1GHSA 4FLOA 2PWFA 4TX8A 1OWQA 4FLRA 3VIFA 2Y4SA 4PSPA 3WH7A 1UR8A 2F8QA 3U5YA 3THCA 3F5LA 1J0YA 4A3YA 3BXWA 3QOKA 3CHFA 1QNPA 3VPLA 2V38A 2XJ7A 5E0FA 1KBKA 1JYWA 1H11A 1E5NA 2WMIA 1UA7A 1OIMA 3B9AA 3G6LA 5C70A 2X09A 3GXMA 3AIBA 3ALGA 2XVKA 3RDKA 2WC4A 4AEEA 4J3UA 1DTUA 2O92A 3K4DA 1CXKA 4KMQA 4FF5A 5BXRA 4OOUA 2WZHA 3L4WA 4AW7A 2B31A 5I23A 3WUEA 2WKGA 3WL1A 4XZWA 3WNMA 1BSIA 4B3LA 4MNMA 1CTNA 2WWDA 3QOMA 4MAVA 1E6PA 1HJWA 2EJ1A 3T2PA 1OB0A 2XVLA 3MSDA 1CXLA 3MUAA 4LYQA 1KXVA 1GONA 4M8UA 1WKYA 4WK9A 2WYSA 1FHDA 3LPPA 1KWGA 3VGBA 1K9EA 1L8NA 3WMBA 4CCDA 1G5AA 3WKZA 1GOOA 2YL9A 1GVYA 3DC0A 3WEZA 4NRSA 1HJUA 4PN2A 4IISA 2X8RA 3LPFA 1WDSA 1BAGA 1JD7A 1V0MA 1CYGA 2GVYA 2WBKA 3DYPA 2DT1A 3W37A 2OWXA 1ISVA 5DMYA 5AC5A 1U30A 2VMFA 5A2AA 3KEHA 4GO9A 4AD2A 3ARQA 2WAGA 1WNOA 2FGLA 3VIPA 2XFRA 1QOXA 5CZKA 4D6EA 1NP2A 3AMDA 5CGTA 3OBAA 4UFLA 1E15A 3BGAA 2ZUNA 3CHCA 1LL7A 2OSYA 2QMJA 2PWEA 2VVNA 1EOKA 5DF0A 4WKAA 4S3KA 5I79A 1V6WA 2ZE0A 3WSUA 2EPKX 3WF4A 1J12A 5AYIA 2VQUA 1V02E 4W8LA 4GQRA 1IZKA 1HJXA 1WE5A 4ATWA 9CGTA 3PZUA 3WMCA 4BS0A 3CZ8A 4LPCA 5CPSA 1R8LA 4XZBA 4U3CA 8CGTA 1WCGA 3SUTA 1FFQA 1EXPA 2J7GA 1G1YA 1ESWA 3W26A 2JALA 1GCYA 4MNLA 2EQDA 3M6DA 1V6UA 3W38A 3SIMA 4W93A 3AIUA 5D9PA 3SUSA 1KWKA 3O2LA 2UY4A 4PMOA 1WZKA 4HMEA 2ZXAA 4GXPA 3ARXA 2BXYA 5AC4A 2WHJA 2V5CA 2E0PA 4OUEA 2UY2A 4J3SA 2XTKA 4QLJA 1DP0A 1CGXA 3BLKA 3QHMA 3FHQA 5D9OA 1CXEA 2WHMA 4YHEA 5A8NA 3WEOA 3MV01 2BHYA 4J27A 3VIKA 4ACZB 2ZXQA 3W81A 1GORA 1E6QM 4PCSA 1J0IA 1K9TA 1W32A 5E09A 1MFVA 5A1AA 2VX5A 2PI6A 1B3XA 1W2PA 3BLPX 3K8KA 1ZBWA 3SEPA 1OINA 4W7WA 1UR1A 1H49A 1I75A 3SCTA 3VIMA 3WBAA 1JNDA 4W86A 1PPIA 3SCPA 2ZUTA 2WC7A 4GPNA 2CHNA 4GQQA 1O7AA 5ABEA 2VQTA 5FOOA 3AS3A 1JZ3A 3VIIA 1UD5A 4WSJA 1BVZA 1UD3A 2AAAA 1XSKA 2BY3A 2JE8A 1MXDA 2ZX9A 1N82A 1W1VA 1ZBCA 2E4TA 1C91A 3BSHA 2Y24A 3KL3A 2X2YA 2EEXA 1TR1A 2YBTA 3N1AA 5IHRA 1CGWA 1OD8A 1VJSA 3FNDA 4OJYA 4PUDA 3JUGA 4PTMA 1CIUA 2WHKA 1CZ1A 3CGTA 4AXNA 3BAWA 3TTSA 3AZRA 1MWOA 3MV11 5BCAA 1UD8A 2EXOA 1C8QA 4Z2LA 1XSJA 1UZ4A 1YHTA 1NWSA 5EMYA 4HOZA 2ZX5A 1AQ0A 3EYPA 2FGZA 2ZX8A 2QF8A 3K4AA 1HVXA 1FH7A 5M5DA 4J28A 4MB3A 3CHDA 3ARWA 1HP4A 3A47A 3AOFA 1UH2A 1GOKA 3WNPA 3WH8A 1QW9A 3ZSSA 4PMZA 2VZVA 2VZUA 3VIGA 3WD4A 3TOPA 5JUVA 4UFKA 2NSXA 2GJRA 1VAHA 1LLOA 2VO5A 2XVNA 4PMYA 1E0VA 2PWDA 3N18A 2WM0A 4RE3A 2VR4A 2J75A 3LMYA 3L4YA 3KWXA 3PZVA 3SUUA 4TTGA 1JYNA 1BVNP 2UWFA 3OGRA 1ODZA 3GNRA 1UYQA 4JKMA 4URIA 3AISA 2FHCA 4AEFA 1B30A 1UKOA 6A3HA 1MQQA 4D6CA 3WEMA 2DPEA 3WDIA 4CD8A 1W9BM 1WB0A 1EO5A 4R5EA 2E8YA 2ESCA 2G3JA 1EDGA 4KWUA 2E9LA 4DWSC 3AS0A 4ZENA 1LJYA 5ABGA 3IK2A 1OCQA 3VNYA 4OIFA 2BHUA 1UWRA 4D1IA 5A2CA 1QVBA 4C7DA 1JDAA 2EBNA 2X0YA 3GBDA 1ZB5A 4HZ7A 1UWSA 5D9MA 1PZ2A 2VX7A 1E0WA 3RJXA 3PN8A 2ZUWA 1UQYA 2CBVA 3II1A 3W29A 1L0PA 4MB4A 1M7XA 2DH3A 1C7TA 4AD3A 1GVIA 4UQCA 5HPCA 3OGVA 3U7BA 4WJXA 2PWHA 1GPFA 3WQ8A 2WMJA 4QP0A 3U5UA 4HU8A 3MSGA 3WFZA 2V3FA 2W61A 1E1EA 1G0CA 5E0CA 2FH8A 2PC8A 1HIZA 2CNCA 2D23A 4W7VA 3GXIA 2XUCA 3M46A 1SFSA 4CGTA 2VJXA 3APGA 4IPLA 5A95A 1UKQA 1BYCA 4GIAA 3MUZ1 4IPNB 5ABHA 5JBFA 1XHGA 4AC1X 4PMXA 1P6WA 4PCTA 1Q6DA 4PEEA 2CESA 3WH5A 1H0IA 4P7RA 2WVUA 1KQZA 5FCZA 3WD1A 1UR2A 1KCLA 2VC9A 3DECA 5ABFB 2J74A 4AZCA 4NRRA 2WPGA 1B3VA 4P8XA 1KBBA 4CN4A 3PZ9A 2DT3A 3WL0A 1E6NA 3WF3A 4JKLA 1PJ9A 4F9JA 3CZGA 1V0KA 2WZEA 3ZJ8A 1LL6A 1OBAA 1PIGA 4ACZA 2XHYA 3CUFA 4AMCA 3UERA 1CXFA 4P7QA 1B3YA 3RMEA 1F4HA 1R87A 1CECA 4M80A 1BYAA 1GJUA 1E6XM 2XSAA 3GBEA 4UQEA 1CGTA 4XUYA 2YA1A 3WF2A 1V03A 5I2UA 1CGVA 3GH4A 3OA5A 1MW0A 3L4TA 1QW8A 2D1ZA 3THDA 1KB3A 4ZE4A 3NCOA 1RH9A 1UH3A 4AWEA 3RM9A 2YIHA 1J10A 1VB9A 1NARA 1CPUA 1J11A 2NT1A 1R7OA 3VUPA 2VRJA 1J18A 2WC3A 3BCDA 4X0NA 2G3MA 4EAMA 2WBGA 2WK2A 2WLYA 3WD3A 3NDZA 2BHZA 3GTNA 3VDAA 2PBOA 1UD6A 1B3ZA 3VGEA 2EPMX 2DT2A 3WDJA 1X6LA 3CZLA 1E5JA 4JIEA 4B3KA 3PTMA 1JG9A 4JL2A 2BS9A 4HZ8A 3RO8A 3VKKA 3GH7A 1E4MM 2CBUA 2ZUVA 4LYPA 4BQ3A 2D24A 1UD4A 1D7FA 2VT0A 4Z2JA 2YL6A 5I78A 1SMDA 1ITCA 4H04A 3VD9A 4CD7A 2GDUA 1W9UA 2BFGA 1HJVA 3I3DA 3VTRA 1E1FA 3VGHA 2HVMA 1C8XA 4UFJA 3ZM8A 1ZJBA 2ZXBA 1G01A 2EO7A 3EDJA 3OIHA 3ZQ9A 5A8PA 3CMGA 2BVTA 3ARVA 3W6MA 3VIOA 2CKSA 5CSUA 3OLIA 5IXEA 4M1RA 1V08A 1VENA 4S3JA 1C7SA 1V0LA 4JCMA 4CVUA 3A4WA 2GUYA 2BY2A 3QHOA 2WANA 2G41A 3AI0A 2IUZA 5A6JA 4EANA 4U33A 2WCGA 1QBAA 1XGZA 4LGXA 3MUIA 1VIWA 5BXSA 5KEZA 5KZ6A 3I3EA 5D4YA 1TZ7A 4HA1A 1HVQA 3CUJA 1MQPA 4KRUA 4QLLA 3WNKA 1D2KA 5M3WA 3W82A 3VDCA 2C0HA 1PZ3A 3SCOA 1D3CA 1NOUA 4UFIA 1JF6A 3K46A 1CBGA 3ZOAA 4F8XA 1KXHA 2D0HA 2WVVB 2XVPA 2BV9A 4MTVA 2CEQA 1XH2A 1E0XA 1JNEA 4PMRA 4KGJA 4RE2A 3WN6A 5A6MA 3VILA 4AZ7A 1TVPA 3VGGA 5M03A 3NSNA 1EGZA 3POCA 1J0KA 5CSYA 1W3KA 2DQXA 1V02A 3J7HA 2W4XA 2D0FA 4HOWA 2F2HA 1VFUA 3VMPA 1VFFA 1Q6CA 3VD5A 4RE4A 5EB8A 1QI2A 1E71M 5CJ5A 1HKIA 4CCEA 3VD3A 5I5RA 4Q22A 3E1F1 4MJ2A 3SCQA 4OOZA 4MADA 4P7OA 2D3LA 2VRQA 5A6AA 4Z2IA 3N9KA 3UETA 2VR5A 3FY1A 2XSBA 1AQHA 4PBGA 4PTVA 1B31A 4GO8A 1BGAA 1UWIA 4Z2KA 1HNYA 3RM8A 3TA9A 1H3GA 1E70M 2TAAA 4D6DA 4MAZA 2J25A 5I77A 4TVDA 6TAAA 2WZIA 4NI3A 2WLZA 3BAIA 2OWWA 4QAWA 1GQLA 1C92A 1EHAA 4HZ6A 3MO4A 1BPLB 4B9ZA 3WELA 2XM1A 1XH0A 4GKLA 2J62A 3SCRA 5ABFA 1E56A 4BCEA 1WDPA 1HT6A 3AYRA 3ZT5A 4H41A 1H1NA 4GI6A 3UR8A 5BXPA 4PMNA 2VI0A 1LWJA 3O9NA 1EH9A 4JKKA 3RILA 4HMCA 5A6SA 3UEQA 2FHBA 3PZOA 2J78A 1DWHM 3FHAA 4GZIA 1HP5A 1V3MA 3WIJA 1S46A 3CZEA 1CEOA 3AIRA 5CPQA 3AYSA 3AMCA 1H41A 4HTYA 4AISA 4LYRA 2NT0A 1C90A 4L4PA 5GNYA 2D0GA 4U2ZA 1TE1A 1W2VA 1EA9C 3T08A 5HPOA 1DHKA 5FL1A 3GNOA 3CZKA 5AY7A 1B2YA 1ZJAA 3ARZA 5JIPA 3UR7A 1IT0A 2WSPA 2D20A 3ZT6A 1M53A 4FLSA 3K1DA 3RM4A 5LA2A 4FMVA 1XD1A 1UD2A 1M04A 1BLIA 3ECQA 3IAPA 4UZUA 3RCNA 4ZE5A 1BFNA 1CDGA 2DGAA 3F5JA 2DSZA 4J3VA 4ATLA 2ZX6A 1H4PA 1GQIA 1OT2A 1GHRA 3O6AA 4YHGA 1JFXA 3A3HA 1H09A 2Z1KA 5HOSA 4JL1A 2ZXDA 4P7LA 1W1PA 1U2YA 1OM0A 1NOWA 2WXDM 4UOJA 5FL0A 1J01A 1V6YA 1W3HA 2YL8A 1PBGA 2EPLX 2ZOXA 2BNJA 1GQKA 3AZSA 1VEPA 1BG4A 3CBWA 1JYXA 2DT0A 2A3HA 1JZ4A 2Y5EA 2W92A 4U31A 1FP9A 2CITA 3CHEA 2UY3A 4JFUA 4BQ4A 4DWSB 2C8NA 2G4FA 4UFHA 1MW2A 1QNRA 5BYWA 5DEZA 1JAKA 1DWIM 2ZIDA 1W91A 2WCAA 3B8SA 3VD7A 1US3A 4AD4A 2IXVA 4W88A 1WDRA 1ECEA 3L2MA 1V3KA 4BQ5A 2J7BA 1PIFA 1R86A 5E6ZA 1NP0A 2XWEA 3MKKA 5CLTA 1B0IA 2E40A 4CVWA 1V3HA 1UKSA 3VNZA 3ZSTA 2Q8XA 3WY1A 2WWCA 4BZYA 3KL5A 4J3WA 1E4IA 1NWTA 3CUGA 3HU7A 5F7UA 5BROA 3W53A 2VZTA 3KL0A 1B3WA 1TUXA 4E4PA 3WUFA 3BSGA 3NSXA 4AIOA 3PTKA 1JXKA 4U2YA 1CLVA 4D1JA 3WMSA 2BVYA 2WVVA 3MANA 4AZ6A 3VMNA 1MYRA 3A4XA 4D6IA 4HPHA 1EQCA 4ZXOA 1ISXA 2W91A 5A6KA 1KR1A 3IAQA 3F5KA 3NJ3A 1GW1A 4X9YA 4P8WA 1TA3B 4UCFA 1OT1A 3PZTA 3GYCA 2YLLA 3ARTA 3VVGA 1JI2A 5CG0A 4B16A 3WF1A 4UOZA 3T0BA 1PX8A 4QLKA 4PMDA 1J0HA 1FOBA 4DM2A 1WZMA 4N0RA 4JCLA 2VTFA 3AQUA 1XD0A 2OLHA 5TD4A 1HX0A 3WD0A 1PEZA 1QI0A 2JIWA 3W27A 2DEPA 4B9YA 1FH8A 1LL4A 3TP4A 3IJ8A 2VUYA 2J4GA 5A6LA 1JZ8A 3WNNA 3I3BA 3BCFA 2WVTA 4HA3A 1E73M 2YDRA 2BVDA 1ZBVA 1FP8A 1JD9A 1QNQA 5DT7A 2QPSA 2CETA 5IFPA 4L4OA 4V28A 2CERA 2XYLA 3GNPA 1E4LA 4TTUA 4M81A 1K9DA 4UOQA 2GK1B 4DWSD 4OKDA 1M01A 4AZHA 2O9TA 5EFDA 1E40A 3L4UA 1OGBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2XFY A;  1LF1 A;  2XWD A;  4XX6 A;  1HL9 A;  3WD2 A;  1KCK A;  5GNZ A;  3ARP A;  3PZN A;  8A3H A;  1LWH A;  1QHP A;  4DUW A;  1CEN A;  5A2B A;  4CKQ A;  3PZQ A;  2YA2 A;  3N04 A;  4JFT A;  3MMU A;  4EE9 A;  3T0A A;  1QI3 A;  1PX3 A;  6CGT A;  4V2X A;  4H8V A;  2VUR A;  3EBV A;  1GQJ A;  1ISY A;  3OLE A;  1VBU A;  1GHS A;  4FLO A;  2PWF A;  4TX8 A;  1OWQ A;  4FLR A;  3VIF A;  2Y4S A;  4PSP A;  3WH7 A;  1UR8 A;  2F8Q A;  3U5Y A;  3THC A;  3F5L A;  1J0Y A;  4A3Y A;  3BXW A;  3QOK A;  3CHF A;  1QNP A;  3VPL A;  2V38 A;  2XJ7 A;  5E0F A;  1KBK A;  1JYW A;  1H11 A;  1E5N A;  2WMI A;  1UA7 A;  1OIM A;  3B9A A;  3G6L A;  5C70 A;  2X09 A;  3GXM A;  3AIB A;  3ALG A;  2XVK A;  3RDK A;  2WC4 A;  4AEE A;  4J3U A;  1DTU A;  2O92 A;  3K4D A;  1CXK A;  4KMQ A;  4FF5 A;  5BXR A;  4OOU A;  2WZH A;  3L4W A;  4AW7 A;  2B31 A;  5I23 A;  3WUE A;  2WKG A;  3WL1 A;  4XZW A;  3WNM A;  1BSI A;  4B3L A;  4MNM A;  1CTN A;  2WWD A;  3QOM A;  4MAV A;  1E6P A;  1HJW A;  2EJ1 A;  3T2P A;  1OB0 A;  2XVL A;  3MSD A;  1CXL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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