5BMXA

Crystal structure of t75n mutant of triosephosphate isomerase from plasmodium falciparum
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
ARKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYNGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Probing the role of highly conserved residues in triosephosphate isomerase - analysis of site specific mutants at positions 64 and 75 in the Plasmodial enzyme
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Plasmodium falciparum
molecule keywords Triosephosphate isomerase
total genus 98
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5bmxA00
5IBXA 3TU9A 4EOUA 2FDSA 3NPWA 1XBZA 3S5OA 3LCWA 1LLWA 1RQEA 5A8GA 3STFA 3DFOA 1TTQA 4JTHA 1JCNA 4TIMA 3CQ0A 3G0SA 1O94A 5DXYA 4UUIA 1OX6A 3O06A 5CPMA 3UWZA 4AVFA 1F5ZA 3NGJA 4Y6GA 5HUOA 2B7OA 1YTEA 3KHJA 4XKYB 1XUZA 2YFOA 3N19B 5HR6A 3DHDA 5HJLA 2EAWA 3IIOA 1UB3A 3E96A 5FF2A 2TRSA 1R2TA 4K6AA 4P2VA 5F2LA 5AYZA 4LT9A 3YPIA 2ZA1A 4HPJA 1QPOA 1GVFA 3UWUA 2EPHA 4TMBA 2YSWA 3LBMA 2J24A 1KA9F 2C19A 1KM4A 1KFBA 4ORIA 2P0OA 3BGGA 3SIZA 3PSWA 3TQ0A 6ALDA 2YDAA 3GKAA 1GT8A 4JNMA 1W3TA 1O95A 2HMCA 4FXRA 5DY2A 3TH6A 3TAOA 1OYAA 1PHWA 2NX1A 3LLDA 1LORA 2RDTA 1P4CA 1OVDA 1JUKA 4YXGA 1EP3A 3N14A 1XKYA 1W37A 3A21A 4GFSA 1UUMA 5U7SA 3GXNA 2ZRUA 3NL5A 4OWGA 4MY9A 3TSDA 4NJGA 3CWNA 5CSSA 1JCLA 3KX6A 3LCHA 4JTSA 2VFIA 4DO4A 2ZZ2A 3W2UA 3IRDA 1FBAA 3TJXA 2QCEA 3OHIA 5LNUA 3O6YX 2ZFAA 3W88A 4JTIA 3EXRA 5D2WA 3JRKA 2A7PA 2WNZA 4R33A 2YGYA 2JGYA 3TFXA 2CZDA 1M5WA 4KWWA 4XTIA 4EF9A 3A22A 3QMRA 1S3HA 1SO4A 1Z42A 1DQWA 3C8FA 1DJNA 2NWRA 2JKEA 3SGZA 5EA9A 1OFQA 3PAJA 3TC7A 2QCDB 3WJXA 3MHFA 5AHFA 4BF9A 4DF2A 4IMDA 3FKKA 2E5CA 2HSAA 4UMCA 1C8VA 1PCKA 3W1RA 4NXKA 2VEPA 2JBMA 1GPWA 4I7VA 1DV7A 4O57A 3S8HA 3W74A 1KM0A 1TJRA 2YCEA 4DELA 4DBEA 2GQ9A 3FYOA 2YYTA 1AMKA 4LTSA 4IX2A 1Z41A 4X9SA 3EWUA 2FPTA 1R30A 3P74A 1L6YA 3B03A 1LOSA 4RZ4A 3LHZA 2V30A 3NO5A 4MYXA 1KLZA 4O1DA 2ZRXA 3LV5A 3BGJA 1PIIA 2CLEA 4O17A 1FDJA 4O1CA 4QIUA 4FNTA 3M5ZA 3G0XA 4ADSA 1TPEA 4CCEA 5BRBA 3P5ZA 1TB3A 1YDVA 5KZDA 3UNDA 1FCVA 2DZUA 3NQGA 4N9BA 3PULA 1AG1O 1QOQA 4QNEA 1BWKA 4LC6A 5G1YA 2J88A 3R89A 5E93A 1DJQA 1S5TA 2DP3A 2LLEA 4Y8FA 3EWWA 4O4WA 1UJPA 3PB0A 3DHFA 3NPUA 2VXNA 1ICSA 2J9XA 3F4NA 2ISSA 3O8AA 3OVQA 1F76A 3HGRA 3TSMA 1XM3A 2H3DA 4QJ1A 4O50A 4KWVA 2HTMA 4UTWA 5D09A 3STCA 3S1WA 3DFNA 2CZ5A 4J9JA 4WX2A 4UFHA 2C13A 4AXKA 3L5MA 3THQA 1J5TA 2Y7FA 3HJZA 2QJGA 2PRMA 5KINA 3QEZA 1G6CA 4AHQA 5G2WA 1H5YA 2EKCA 3BLEA 3UQNA 2VEMA 3PS7A 3DU0A 1A53A 2ZRYA 3PR2A 5K4XA 1TV8A 1H7RA 4PC8A 2QAFA 1TV7A 4IXXA 3TW7A 4ZQNA 3HF3A 2UV8G 1L2UA 3IVUA 2Y6ZA 3TXZA 3RLUA 3M7WA 4NZFA 1Q6OA 2QCNA 4POCA 1VYPX 5KZMA 2V8ZA 1EUAA 1KFJA 1KW1A 1W5QA 1AL7A 3MBFA 1RPXA 2A2IA 2WO5A 3GDLA 2QCGA 1YLVA 2DORA 1D3GA 4PODA 5FF7A 3C52A 5HR7A 1PCWA 4UTJA 3HBLA 1E51A 4H3DA 5BOOA 3KVLA 5D04C 5AYYA 1NVMA 3GK0A 3DKJA 3ABSA 2ZZ5A 3PF3A 4NJIA 3RF9A 4ADUA 2TMDA 1TQXA 2X1SA 2RDWA 1RZMA 3MYOA 3R5EA 2A4AA 3W7OA 1I8JA 1SPQA 1X8FA 1H60A 3QF0A 2GOUA 4HPXA 1QWGA 2QDGA 3BVJA 1FCQA 5AHLA 1H1ZA 5D2TA 1G67A 4LS1A 3NL3A 4PCFA 2H6RA 2Y7EA 1BEUA 1QPNA 4CNOA 4KFNA 3CPRA 3KVMA 3MMTA 1JCJA 1NF7A 1QCWA 1PE1A 1ALDA 4A2SA 1YYAA 3P60A 3PSVA 2QJHA 4UFJA 1KM6A 2QF7A 4CNNA 3Q37A 1K8YA 4TX9A 1GZGA 3EX4A 3R2GA 3LHUA 1A50A 1EP2A 1Z48A 2V81A 4Z1AA 4XKYA 4O12A 3ANYA 2BTMA 3DI1A 4A22A 5EMUA 3HO8A 4GUIA 2NV2A 4YCPA 1BWLA 1KBIA 3CT7A 2V2HA 4K8EA 5GVJA 3O05A 5HMSA 4A21A 1SW7A 4D2JA 2ZBTA 1I2RA 4IOTA 5CZTA 1ZNNA 2NV1A 2RDUA 2VEKA 1TPB1 3EX1A 4JN6A 4DF1A 3M43A 1ZAIA 5K2ZA 4Z0JA 4QNWA 1YDOA 2E6DA 1LLZA 5H2ZA 1HFBA 1NSJA 5FESA 2TYSA 3P61A 4L4LA 3L68A 5E1QA 4TO8A 2V82A 3W2JA 3C3NA 3R12A 1YXYA 2GUUA 4OBTA 1AK5A 3STGA 1Y0EA 1JQVA 2R8WA 4XBSA 2NXIA 3MW7A 4OT7A 3G1AA 1TTPA 4NT0A 1PVNA 3LDVA 5FEZA 4JD4A 4K38A 1R46A 5HULA 3I68A 2ATSA 4A2RA 3BG5A 1GG0A 1SW0A 2YYUA 3VNDA 2PRHA 5FEXA 1QPRA 1RV8A 4O11A 5I3IA 2Z1BA 4JY8A 3LHWA 4QSHA 3BO9A 3PBYA 4W9TA 4BFAA 2NUXA 3IGUA 2F7FA 5I3FA 4LVGA 1WBHA 4E2DA 1XXXA 2QCDA 4AWSA 1EWEA 3MI6A 2Y63A 4MJZA 2CFFA 4BI5A 3STEA 2VFGA 2QDHA 1A5BA 3LBCA 2JKPA 3RFAA 4GUGA 2B0MA 2ZZ1A 3KXQA 1WYIA 3W7PA 3KVJA 3IGSA 3S1XA 3S5ZA 2RFGA 1VGAA 2CU0A 5DBTA 2BX7A 2Y89A 1M7OA 3NVTA 4FX8A 4BWLA 3QZEA 4MKNA 2DZSA 2Y70A 5CZSA 4LVBA 3LB0A 3UYCA 1SR9A 2VENA 3G1VA 3W87A 1K02A 2WPBA 1TREA 2QAPA 3DENA 4NJJA 5CPNA 5TIMA 1VQTA 3GXPA 2NWSA 3RU6A 4O1AA 5HNRA 5LKYA 4QQ3A 2C16A 5EKYA 2NXHA 6TIMA 4UTUA 1V7YA 1ZJIA 2D73A 3ELFA 2E09A 4AMAA 4JTFA 1SFLA 3SI9A 5IBXC 4M6VA 2RH9A 3GLCA 3LXAA 4M19A 1T96A 1K03A 4LV9A 3GIYA 1RVGA 4G1KA 2R94A 3MUXA 4AH7A 1T0OA 1G7VA 2AAMA 2W6RA 1KFCA 3B0PA 3W7IA 3O1NA 3UWQA 4YWIA 1TYGA 4MZ8A 4OHQA 1LZOA 5I3JA 3B8DA 3QM3A 5AB3A 1KM3A 3I65A 1LBMA 3LV6A 1WQ5A 4Q32A 4GUHA 3W1NA 5FEWA 4UXDA 2GJLA 2WNQA 4ORMA 3U2OA 5SWUA 1BTMA 3DFPA 5DN1A 1QOPA 1IIGA 3OBKA 1FWNA 4FF7A 3TNOA 3UPBA 1OX5A 3C61A 2A7RA 4X3ZA 4FNQA 1MXSA 5E0KA 1H63A 2H8XA 1B9BA 3DFQA 3C6CA 3MBDA 1ADOA 3WJSA 3S9YA 4JX6A 2JK2A 2CLFA 1RQHA 1QO2A 3V1PA 1ICQA 2FB3A 2ABBA 2Q3RA 1WV2A 2A6NA 3LI1A 1SQ7A 3FEMA 4ZQPA 1K8ZA 3TR2A 3DFTA 1MO0A 1X6UA 3W7NA 4MFDA 1OF6A 3HG2A 5CZJA 5C6MA 2I9EA 1TIMA 3W84A 3MYPA 3VCRA 4CLMA 2H8ZA 1N55A 1OFRA 1I2OA 3EWXA 5BNKA 1RD5A 3NQDA 1LDCA 2XN0A 3W1PA 3W7HA 3LHVA 5F2GA 3T78A 3EX6A 4MJMA 3IVTA 4MOZA 1IXOA 3C2RA 1Q6QA 4UFLA 1W8SA 2QCCA 2OMAA 1EEPA 1R2RA 5D05A 1JQXA 4NNCA 4PEKA 3OVRA 3LRMA 5LNWA 5AC7A 1F6PA 3UWWA 3T7VA 5A5WA 2E6FA 1GEQA 1J2WA 3W1QA 3F03K 3W23A 2YZRA 2C14A 3CTLA 2WKJA 4GXMA 3TXVA 3NQMA 4Q33A 2R14A 1P1XA 3EX2A 5L6UA 5F1VA 4WXYA 3UXAA 3R8RA 3WFAA 2Q8ZA 3PUEA 1AW2A 3LX9A 5D30A 1W5NA 4R53A 4RJEA 3F4WA 1Q3NA 3M47A 1OFPA 1K7XA 1Z44A 3MP3A 4UNLA 3L21A 1KM1A 1Q45A 4MY8A 1FXQA 3W71A 3TK7A 3BLIA 2DZTA 1D9EA 5DCBA 4FNSA 4K7VA 4BK9A 3NR0A 3CEPA 5I3GA 1GVOA 3N9SA 3IEBA 1TRDA 1YTKA 4Z0SA 1SZGA 1LOLA 2X1TA 4Y96A 3G24A 1PS9A 1ME9A 2E68A 3MHUA 2E5BA 1TMHA 2QJIA 3VI2A 4PA8A 1F2JA 1H7PA 1OG0A 4HSNA 4WY0A 4KKXA 3L5AA 3TROA 2TPSA 1YADA 4UIOA 1FDZA 3BPWA 3M6YA 3ZS4A 3GNDA 1N8FA 2ISWA 4UTWC 2J9YA 3A5FA 4O0KA 4HNTA 5J5DA 2V2DA 3W73A 2YW4A 4TU1A 2GVJA 3NQVA 4QISA 5K9XA 1UASA 1F74A 3NQ7A 4RZ6A 4NX5A 3W2KA 1VC4A 1PL9A 3B06A 3C2FA 3KAOA 3CHVA 3M9YA 3LLFA 4O8RA 1LTDA 2HS6A 1M6JA 2BWGA 5LSMA 5KZEA 4WOQA 2E5DA 2DZXA 4JIQA 2NLIA 5F4XA 3NQCA 4JYEA 1DQXA 5AHMA 5D2YA 1H61A 4NUWA 3AO0A 3IIVA 4NVTA 1I2QA 3EXSA 1QAPA 3G3MA 2GQ8A 4O4VA 3TQKA 1W0MA 1A5CA 2WOQA 3G0UA 3UD6A 3ATYA 1H7OA 5DLCA 1B4EA 2F84A 3KVKA 3TW6A 1OYCA 3IV3A 1JVNA 2Y62A 4NZJA 1GTHA 4FO4A 3M5XA 4LW7A 3QJAA 3NQFA 3R13A 3A23A 3NDOA 3PC0A 1FCBA 3P5YA 3W3OA 3TFCA 1IXNA 2AQWA 1EUNA 4UTHA 3M41A 1O5XA 2ALDA 1RR2A 4UNKA 1GOXA 1UCWA 3SJ3A 1O4UA 1XUUA 3EEGA 3ATZA 3H55A 3W1LA 3MP5A 8TIMA 3HOJA 5KITA 3GDTA 5IM51 2WSRA 2BXVA 3LTSA 4ADTA 1UUOA 3P8JA 2VKZG 3BK0A 4IMFA 5EL1A 4KFPA 5BMWA 2C3ZA 4GUJA 3CIWA 5C5YA 4E0CA 4LVDA 5EBUA 3G1DA 4N9CA 1XCFA 4YCOA 3UXDA 2GVGA 5FF3A 3FIGA 3KRZA 4JYDA 4UTIA 1K8XA 1GG1A 5AN7A 5G4EA 1SU5A 5HQEA 1AW5A 3FLUA 1XBVA 4O54A 5HWJA 1P0KA 1EPXA 4JTUA 4JTTA 4IQLA 3OEXA 1IXQA 5C54A 3GDKA 2A1YA 3DZ1A 3NL6A 3NZ1A 4M7SA 4Y90A 4R34A 5AHEA 3QC3A 3S0CA 4GBUA 1VZWA 3FFSA 3UPWA 3L0NA 3OVPA 3RK8A 2G95A 3TMLA 5AHNA 4NJKA 3P62A 3FJLA 5F4WA 2BSLA 3ABOA 2WQPA 3W1AA 3W1MA 5AC6A 2FB2A 1FDYA 2CWNA 4ALDA 4ONVA 4GUFA 3GVGA 4CCCA 2WNNA 4XWUA 3G8RA 1F7BA 1H7WA 3QQ0A 3U8GA 3W85A 2CLLA 2NZLA 1ZHAA 3P80A 5KMYA 1QO5A 4JTLA 1ZY9A 2BZNA 4FEZA 1JULA 3BW4A 1ZAHA 2OZ0A 2W79A 4IPIA 4LRSA 3M16A 3C4UA 4DF0A 1S5VA 1H51A 4PL1A 3LTPA 4NNBA 1G69A 4M7TA 4XQ6A 3G3DA 4LS2A 3EX3A 3ZWTA 1WOAA 2ZZ7A 1W1ZA 4ZQMA 3DGRA 3QMSA 4UC5A 4AWTA 3QFEA 3GX9A 4JICA 4NNAA 4U28A 3NQ2A 1X1ZA 2ABAA 2Y7GA 2A21A 4O10A 1TJPA 4ZQOA 3C0JA 1LCOA 4NU7A 3LTYA 1B57A 3C2OA 2IQTA 4RK8A 1I2PA 1VPXA 3TDFA 3HG4A 3QH2A 3B04A 3PB2A 3O07A 3LM7A 1L6SA 1OX4B 4FHAA 2X30A 2B7NA 1SZNA 1LP6A 4M6QA 4BWLC 4HKPA 1F73A 4RR4A 3DBPA 3GDMA 1ONRA 4O1BA 3RMJA 2ZRZA 3CIXA 1YPIA 4WY0B 1G4EA 3W1TA 3HIJA 4OV4A 1EB3A 4XBKA 3PBVA 3G8EA 3VFLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2A3H A;  2OXN A;  4ICC X;  3TU9 A;  3PJX A;  2INF A;  4IG2 B;  2PLM A;  3CQJ A;  4YHE A;  4OUI A;  1REQ B;  3CQ0 A;  3G0S A;  3M0J A;  1SZR A;  3UWZ A;  3NUK A;  4Y6G A;  3R11 A;  5HUO A;  4GZ7 A;  3P2V A;  3DHD A;  3IIO A;  3W29 A;  1UB3 A;  3Q67 A;  1R2T A;  3R25 A;  3KCL A;  3SN4 A;  3NJ3 A;  4ATW A;  3YPI A;  2ZA1 A;  1S1R A;  3TCS A;  5CBJ A;  3WQC A;  3VM7 A;  3LEP A;  4YNG A;  3COT A;  2V67 A;  4H2C A;  2C19 A;  1KM4 A;  4QR6 A;  2P0O A;  3FEQ A;  3SIZ A;  1R3T A;  4QE4 A;  6ALD A;  5IXE A;  5D8W A;  1O95 A;  2HMC A;  2DQW A;  1H49 A;  2V5K A;  3WF1 A;  4OUE A;  2L5H A;  4PMU A;  5TNV A;  4LUS A;  1R5Y A;  3WNM A;  1P4C A;  1P48 A;  3GQY A;  3KHD A;  5E9A A;  1C8X A;  4M51 A;  1W37 A;  3OOD A;  1UUM A;  4AZB A;  3WUF A;  3NL5 A;  1VBG A;  4NJG A;  2ZZ2 A;  3W2U A;  1BF6 A;  1FBA A;  1GEH A;  4G9P A;  2PDW A;  1TA3 A;  2ZFA A;  2VRK A;  2WZM A;  4GAB A;  3DC8 A;  1MQP A;  1NOU A;  3GSM A;  4MNM A;  4DJF D;  4KWW A;  2Z29 A;  4YS1 A;  1DQW A;  1DJN A;  1A5L C;  5EA9 A;  3T8L A;  3UES A; 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