5BW6A

Tryptophan synthase from salmonella typhimurium in complex with a single molecule of 2-({[4-(trifluoromethoxy)phenyl]carbonyl}amino)ethyl dihydrogen phosphate (f6) in the alpha-site.
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
268
structure length
255
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Visualizing the tunnel in tryptophan synthase with crystallography: Insights into a selective filter for accommodating indole and rejecting water.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
total genus 94
structure length 255
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2015-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5bw6A00
2V2CA 1H61A 4GE8A 3W76A 2VEPA 5G2WA 2NV2A 1HTIA 4P2VA 4DF2A 1RQHA 4R33A 1MSSA 4BK9A 3NGJA 3R5EA 4HT3A 3LHVA 2EAWA 1TREA 3NOEA 3W2JA 5LZLA 3C2RA 3W1NA 4NQ1A 3KRUA 4E0CA 5D02A 1FCQA 3M7WA 3TW7A 4Q32A 1ZENA 4FNSA 2Q8LA 4JTJA 2ZQ0A 4ADTA 2QUVA 1W31A 1F2JA 3KVLA 1CI1A 3UY7A 3W7JA 3NVTA 3SGUA 1FY6A 3EWZA 3NQFA 4DPQA 1G4EA 4GUGA 3LCXA 4LV9A 2O7QA 3HF3A 3QEZA 3QRHA 1FWTA 3W2KA 4A22A 4YCPA 2QEZA 3P80A 3B04A 2Z0IA 4UNKA 3T55A 1JCJA 3YPIA 3DFSA 3QQ0A 1F74A 2BXVA 5FI8A 5LHFA 1I4NA 1BEUA 2BZNA 1RZMA 3G0XA 2QUTA 3UD6A 1TCDA 1EWDA 3VCRA 3TSDA 1EP1A 5HWJA 2ZTJA 1SO3A 4O53A 4NX0A 3SIZA 4MJZA 3T40A 3LX9A 2RDUA 3GR7A 3UZ5A 3HG5A 1JUEA 3TH6A 4IQLA 5C55A 2ZBTA 3EWWA 4X3ZA 3ABSA 5CKSA 2QJGA 3W88A 4M6VA 1HFBA 2FQIA 3E96A 1OFDA 5LNVA 4K39A 4WXYA 5BRBA 2E6YA 3S5NA 5CSSA 3M5YA 5I3HA 4EVZA 3PS7A 4U4MA 1WBJA 4N2YA 3IIVA 1SU5A 3HBLA 2QJIA 1D9EA 2WQPA 3ELFA 1OYBA 3NYZA 2A7PA 3CQ0A 4Y6GA 2C19A 3IIXA 3HB9A 5CZ0A 3WK2A 2NWRA 2V81A 4PODA 1FUYA 1KTCA 3W85A 3VI2A 1G69A 3O05A 5HJLA 1R46A 4AF0B 1ONRA 5AHLA 3VNDA 4PTNA 1KM2A 3FEMA 1WAUA 1MO0A 4AWTA 4LC6A 4Z1AA 1KM0A 1JCXA 4OV4A 3CTLA 1I2PA 3GXTA 3L5LA 2W0UA 3GR8A 1FWSA 1AW1A 2WSYA 5DXXA 3G8EA 4EOUA 3STEA 3B4UA 2BX7A 3TMQA 4JDBA 2ZZ6A 4O0ZA 2H3DA 4S2CA 3TCEA 5G1YA 2NX9A 3IVSA 1ZAHA 4YXGA 2UV8G 5CPOA 4CNOA 5K4ZA 1XBYA 4JTKA 5L9FA 1IXOA 3M0ZA 1YDNA 3LBMA 2Y7GA 4AHPA 2DORA 3W1XA 5EMUA 2CFFA 4MFDA 2P1FA 1KFCA 1KBJA 2ZZ2A 1WA3A 3M1ZA 4Z1BA 3GLCA 3LBCA 4K36A 2TSYA 1MZHA 4AAJA 1KFEA 2J27A 2GJLA 1UB3A 2GQ8A 5TIMA 3WJZA 4N6EA 3CWOX 4ZQOA 3PULA 2YX0A 2NX1A 3EX2A 3NZ1A 2CW6A 4QISA 2ZRUA 4NJHA 3G1FA 3IVUA 4AB4A 3ZR4A 4DO5A 4FO4A 1TPDA 1YXYA 2XFWA 4IMGA 5I3GA 1SZGA 4UFIA 2YFOA 2QJHA 3GB6A 2EGZA 3HO8A 3MP5A 1F5ZA 1WBHA 4O17A 4P61A 2QUUA 3NQAA 3S5ZA 5KZEA 1IF2A 2VELA 1QO5A 1O60A 4JTTA 1ADOA 1GQNA 1F6KA 3L5AA 5F4SA 2P0OA 3LHYA 2V5LA 3W7EA 3MBDA 3WK1A 4CCCA 3OVQA 1H5YA 5KSWA 1OX4A 3PUEA 4NNBA 4OBTA 2RDWA 4O10A 3SSJA 1WXJA 3E49A 3MBFA 3N2XA 1XKYA 1LORA 4AWSA 4A3UA 3N9RA 1H63A 3S1XA 1TPB1 3AO0A 3DKJA 3TK7A 1WOBA 2J9ZA 1OG0A 5FEWA 5D2WA 4PCFA 3JR2A 1ZY9A 4NZJA 3LHWA 1BKSA 2OX1A 1T96A 3VKJA 3LRMA 3S5YA 5D04C 3PG9A 3N14A 4CCDA 3M5ZA 2PRHA 4UTKA 5FEZA 2GOUA 1GVFA 3B0PA 5A5WA 2EKCA 3L0GA 3LHTA 3UXAA 3UWYA 4LS1A 4WUIA 4H6KA 3NPUA 5HULA 3L5MA 3RK8A 5HUOA 4NVTA 4UR8A 4HN4A 1G6CA 4QQ3A 3U8GA 1FCUA 3P5YA 3IIPA 4B5NA 2FPYA 1VYPX 4UCGA 3W7QA 5I3KA 4ZQCA 1J4EA 1KM3A 2Y70A 3FJ6A 4GUHA 2A21A 3RMJA 3MP4A 3PAJA 3DHDA 1DOSA 1TJPA 4N9CA 2B0MA 3ZFHA 4PH6A 4E2DA 4J9JA 4O4WA 2GJNA 3SW6A 3CPRA 4UTJA 1W5MA 1KM1A 1TB3A 3N34A 2Y61A 1YDOA 4I7UA 5G5IA 2ZZ1A 5C6MA 3H55A 4WY0B 4NUWA 3HQ1A 3L9CA 4ZL1A 1N55A 1YPFA 4FX7A 4ZQRA 4UC5A 5IM51 3N3MA 2V5BA 3LTPA 1OX5A 5H2ZA 1R2RA 4O14A 4JX5A 3KOFA 1AW2A 1GYLA 1RV8A 1ZFJA 3FOKA 4N4QA 3R13A 5AYZA 1PHWA 3C0JA 5HR7A 5C54A 3A5FA 3P67A 3UY8A 3QH2A 4JX4A 1G7VA 4WX2A 4YCOA 1WV2A 3V1PA 1O95A 2Y89A 1I2QA 4WOQA 3LCHA 4QIUA 1QPOA 3U2OA 2A5HA 3DFPA 3M5XA 4MYAA 2C0AA 1MXSA 4PL1A 4JY9A 4ZQPA 3LM7A 2WO5A 4TX9A 1AW5A 2WNNA 3TSBA 3UYCA 1R2SA 2FPTA 4JDYA 3TE9A 4DO6A 4QM1A 3NQDA 1W3NA 2G96A 3PUDA 2Z6IA 1TV7A 2V2HA 3QPYA 3R89A 4LVBA 1EIXA 3T44A 2E5BA 2JK2A 3KAOA 2RHGA 3M5VA 4Y96A 2NUWA 1PV8A 2JKEA 1VHNA 2QCDB 2X16A 4TO8A 3W6YA 4POCA 1RVGA 2QR6A 3W1MA 3W73A 2WNZA 3I65A 1XL9A 4IJBA 3DH7A 4U28A 3W1TA 1DORA 3M43A 4AWUA 3T7VA 3NQCA 2NXIA 4XTIA 6TIMA 2BSLA 3W87A 1F05A 3N2MA 2BTMA 1OABA 3PWAA 4BR1A 4KFNA 3UQNA 1SZFA 4UUIA 2XN0A 2R91A 3PBYA 1JCYA 5KITA 2CZ5A 1MEIA 1FWRA 4FIQA 3NQ7A 3P61A 1W5NA 2NWSA 4O1AA 5J5RA 1Q6QA 1Z48A 4CCEA 2NX3A 3NZRA 3KVKA 3GYEA 2B7QA 2DJXA 5AHEA 3PB2A 3CWNA 1KFJA 3P74A 4JY8A 1Q3NA 4Z1CA 3LRKA 2Y6ZA 5DELA 4JGDA 4LV4A 3FS2A 3QSRA 1F7BA 2TMDA 3TKFA 4DBEA 3RU6A 3TFXA 4NXKA 5CPNA 4RZ6A 3LB0A 3KVJA 1GTHA 5GVJA 1VCFA 5LSMA 1PL9A 1GVRA 4DXVA 1FQ0A 3S1WA 2O7SA 4KFPA 3ANYA 4JTSA 1EUNA 3BGJA 4EWND 3GXNA 1GG1A 2WSRA 1FDJA 1SSDA 1JULA 1VCVA 3PR2A 3UWUA 1KM4A 3PY2A 4FXRA 3S42A 1O5XA 2D73A 2PURA 4X22A 2FDSA 4LU0A 4YWIA 1OFBA 2GQAA 1JR1A 2VENA 1W1ZA 1KM5A 5DN1A 5LNUA 1D3GA 2ZZ4A 3NPVA 5EL1A 3NQ6A 2BLEA 4MYXA 3ABQA 2ISSA 2RH9A 3O16A 4WXZA 1W5OA 1XBZA 4IUOA 1W37A 4E38A 5CZJA 5AFDA 4MPQA 4RXFA 3TA6A 4XWUA 1NFBA 1W3IA 3BPWA 2PRMA 5L6UA 4KWVA 1LDCA 1MEWA 1XC4A 2VEKA 1HO1A 1PCKA 3BLEA 3FLUA 1SW0A 1M7OA 3LI1A 2A4AA 3W7MA 1JCLA 3NG3A 5CZSA 2V9DA 5AC8A 4JYEA 1LROA 2JBMA 1LCOA 1UASA 4LNYA 1LLWA 4IGHA 2W79A 4HNVA 3S9YA 1TPC1 4DO4A 1UUOA 2PCQA 3NL6A 3NO5A 4NXSA 4ORIA 1G4SA 5F2GA 1QPQA 4GXMA 3SJ3A 3TXZA 2CWNA 4PEKA 5F4WA 3EXRA 3GKAA 1KFLA 1TRIA 1TPUA 1QMLA 1W56A 3TDFA 4ZMGA 3B0VC 2DZPA 3L0NA 3KXQA 1DV7A 3I68A 1P0KA 1KLYA 4JN6A 5J5DA 2ISVA 4AMAA 4FX8A 3L68A 2YCEA 3G1DA 2WV8A 4IWWA 4JYFA 3TC6A 3NM1A 3TROA 4I7VA 4RLIA 4XZ9A 2DP3A 3CIWA 3GDMA 1H7PA 3LXAA 3P81A 3HPSA 4LT9A 1B9BA 1YTEA 4O28A 4MZYA 4K7YA 3W86A 4Q4KA 1KW1A 1UJPA 3IRDA 1Q6RA 4H4IA 5FEPA 4DBDA 1UCWA 3C52A 1YYAA 2Y7DA 3LHZA 1SZEA 5AYXA 3ATYA 5F1VA 4NJGA 2ZYFA 1DJNA 3G1AA 5CSRA 5KMYA 1E51A 1I2NA 4BI5A 2ZRVA 1B3OA 3RFAA 5I3IA 4R7JA 4CQAA 2G95A 5MHBA 5AYYA 1EX5A 3CEUA 3QW4B 1WOAA 2Q3OA 3L66A 1JCNA 1QR7A 3IVTA 1SW3A 4NJIA 2AGKA 3DI0A 2VFEA 3PSVA 1ICSA 3PBUA 1K7XA 4GC4A 3W2MA 2HS6A 4EF8A 1TPWA 2E5CA 4AH7A 3G1SA 2Y7EA 3NA8A 1TIMA 5K9CA 1A53A 3BW3A 2QDGA 5BNKA 3OIXA 5T26A 1M5WA 3EB2A 2X30A 2WOQA 2Z6JA 4M6PA 1R47A 4TMBA 2YW3A 1RQEA 5D33A 5LNSA 2A6NA 3S1VA 5K7JA 1P4CA 1QPNA 4JXCA 3WFAA 1OFAA 1GWJA 4UIOA 2ZRWA 3W1PA 1TTIA 4MOZA 5CG7A 1GEQA 4TMCA 5EYWA 3G0UA 3MUXA 1JJKA 3LV6A 1GVSA 3C2VA 1WQ5A 1OFRA 1NF0A 4OHQA 5G4WA 4K37A 4WJEA 3LXBA 2QCHA 3EXSA 1G67A 4W9TA 4N9EA 5C5YA 3FJLA 3L67A 4Z1DA 3O63A 1XDLA 2C18A 4JS3A 1H7NA 4IPIA 3NQEA 1K7EA 2PRLA 5I3FA 1KV5A 1VRDA 4LRTA 4O52A 4QNEA 1O4UA 4ORMA 2AQWA 5AHNA 1BTMA 1LLZA 1B4KA 4XBKA 3RLVA 4O54A 4CQ8A 1KTNA 5HNRA 1P5BA 2I14A 5H91A 5D05A 4UR7A 3W3OA 1H62A 3IGSA 5D32A 3HOJA 5HQEA 1PE1A 1Z44A 4FNRA 4XUGA 3UPWA 4Z0SA 1D3HA 3GX9A 2VFHA 4A29A 4GWEA 2EPHA 3HG2A 1TPH1 3PVFA 3WJWA 3BGGA 3CIXA 1FCBA 1OX4B 1SR9A 2H8ZA 1T0OA 3Q37A 1VQTA 4DEFA 4JIPA 1LRQA 2VEMA 1LOLA 1XXXA 1AL8A 5F4XA 3W83A 2ZZ5A 1JRBA 3TC7A 3GNDA 2C14A 1L6YA 3TFCA 1IXNA 1H7XA 1GZGA 1ME9A 2CLEA 4UMCA 1V5XA 4NU7A 1B57A 2IQTA 3P8IA 1SZNA 4HHPA 5EKYA 4FNTA 1SPQA 4UFMA 2ZZ3A 2JKPA 3C8FA 3OHIA 1F6PA 3CT7A 3EWBX 2FTPA 2R14A 3D0CA 4O18A 2AAMA 4FNPA 1X7FA 3DAQA 4PA8A 3WJYA 1K8ZA 2V2DA 1SSGA 4MIMA 3R2GA 4KWWA 1RD5A 2G97A 2ZA1A 3L21A 4N6FA 3A24A 3F1QA 3MJYA 3I7RA 4O1CA 4DQWA 3W7CA 3C2EA 3WJXA 3CC1A 5EY5A 1QCWA 5HINA 3UNDA 2YZRA 5D2VA 3B0UX 2X1UA 3IIZA 5IBXA 1TJRA 2BWGA 5AN7A 2Y63A 5BOOA 3W2UA 3WK3A 5AC7A 2TRSA 4MFEA 4AEOA 1X1ZA 1XCFA 1QFEA 3O6CA 5K9DA 4HIBA 4Y90A 3ABRA 4RV8A 3MYOA 4LS2A 1EUAA 4GUFA 1QAPA 2EHHA 3LERA 5HUPA 1VC4A 3Q94A 4Z0JA 2KZHA 1NVMA 3GDKA 3E12A 4K38A 2H8XA 3F4NA 1P1XA 4WOZA 3M16A 4UFJA 1HUVA 1ZNNA 3W7RA 1S3HA 1K7FA 1NSJA 2E5DA 1B4EA 2QDHA 3ZS4A 3W7HA 4HSNA 5DCDA 1TTPA 3CU2A 3G1HA 3TX9A 1LTDA 1UBSA 1ZHAA 1QPRA 1PVNA 2QAPA 3PSWA 4GRSA 5LHEA 3QF0A 1OYAA 2QCNA 1DJQA 2WNQA 3R12A 4QAIA 3EX4A 3CLMA 4WQ6A 2YXGA 3BG5A 3TU9A 3NM3A 4RXGA 3LLFA 2FIQA 3B03A 2QAFA 3NQMA 1M6JA 3RF9A 1VGAA 3FA5A 1TQJA 4YL2A 3THQA 4MVAA 3UPBA 3I7QA 3NQVA 1TV5A 4OV9A 1TPVA 3W74A 5KINA 5E0KA 4NX5A 4ALDA 2DZVA 1SO4A 2QKFA 5CPMA 3NPXA 1I2RA 5HWMA 3RNDA 5LKYA 3DHFA 3OA3A 3E0IA 1XFBA 2QF7A 1A50A 1OK4A 3IEBA 4IOTA 3LDVA 3B06A 1K03A 4LUIA 2CLMA 6ALDA 5K4XA 2P10A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2VFD A;  4JIC A;  2GVJ A;  1U83 A;  3W75 A;  1KBI A;  4DF0 A;  2R8W A;  3M6Y A;  4UFK A;  3GKF A;  4NJK A;  2NXG A;  5G1T A;  5K3V A;  1TTJ A;  4HPJ A;  4ML9 A;  3ABO A;  3E9A A;  1S5W A;  5D2T A;  3QC3 A;  1FCV A;  3PUO A;  4BI6 A;  3SY5 A;  5BW6 A;  2J9Y A;  4JTF A;  2NV1 A;  1OVD A;  2J6X A;  5K9X A;  4O1D A;  1TV8 A;  3VE7 A;  2GPT A;  3HG3 A;  3NL5 A;  3S6D A;  2VOM A;  4UMA A;  4XTD A;  5G2I A;  2A2I A;  1L6S A;  5I3J A;  3BW2 A;  4PL2 A;  1EA0 A;  1H60 A;  3QMT A;  2JGY A;  4EIV A;  1N7K A;  4E2B A;  4C1K A;  1JUB A;  1HL2 A;  1BWK A;  3ATZ A;  3C3N A;  2ZA2 A;  1H1Z A;  3LCI A;  5AB3 A;  3W1A A;  2ZRZ A;  3HPX A;  1WX0 A;  1XM3 A;  2H90 A;  3C56 A;  4R53 A;  1VR6 A;  3GAY A;  2NUX A;  3PG8 A;  3N9S A;  1VYS X;  3GDL A;  5FEX A;  2E09 A;  4WZH A;  3G24 A;  4QSH A;  1J5T A;  2X2G A;  4MY9 A;  1QO2 A;  3IGX A;  2WKJ A;  1J2W A;  4MUZ A;  3H53 A;  4FX6 M;  3L65 A;  2HMC A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4I9J A;  4GE8 A;  2J79 A;  2VEP A;  3PK7 A;  4JFS A;  5G2W A;  4TOQ A;  4P2V A;  2MAN A;  4Q8O A;  1EJX C;  4Y9M A;  1MSS A;  4BK9 A;  5CGT A;  5BOF A;  4REQ B;  3NGJ A;  1P6W A;  5I09 A;  3R5E A;  2XFR A;  4PUN A;  3C2R A;  4NQ1 A;  4E0C A;  5D02 A;  3TW7 A;  1K70 A;  1V3L A;  2FJU B;  3H7R A;  2Z1V A;  2E0P A;  4ADT A;  1I9C B;  1W31 A;  3E5P A;  2OYL A;  2GGJ A;  1FY6 A;  4OKD A;  4DPQ A;  3MKK A;  4XZB A;  5EBA A;  2BY3 A;  1FWT A;  4NAF B;  2YLL A;  4A22 A;  4S3G A;  1V6V A;  3B04 A;  2ZWZ A;  4ES4 A;  2PDC A;  5DRC A;  4TVD A;  4DJF D;  5TAO A;  4PUU A;  3T8Q A;  3K4W A;  2EJA A;  2PU1 A;  1BEU A;  4QJ4 B;  1ZJA A;  4WDX A;  1QNQ A;  4W86 A;  1FWB C;  1EWD A;  1EP1 A;  5HWJ A;  2ZTJ A;  2G41 A;  2XM2 A;  4MJZ A;  3T40 A;  2RDU A;  2HPI A;  3UZ5 A;  3HG5 A;  4NI3 A;  4GKT A;  5C55 A;  3EWW A;  4M80 A;  3LGG A;  4X3Z A;  2V5D A;  4FXF A;  2GSE A;  1UQZ A;  3EB3 A;  3W88 A;  4M6V A;  5CQ1 A;  1HFB A;  3WMC A;  4L9Y A;  2XVN A;  4K39 A;  2VD9 A;  3POC A;  3V0S A;  4GBD A;  4WDT A;  5I3H A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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