5EFFA

Crystal structure of an aromatic mutant (f4a) of an alkali thermostable gh10 xylanase from bacillus sp. ng-27
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
354
structure length
354
Chain Sequence
VQPAAWQVASLADRYEESFDIGAAVEPHQLNGRQGKVLKHHYNSIVAENAMKPISLQPEEGVFTWDGADAIVEFARKNNMNLRFHTLVWHNQVPDWFFLDEEGNPMVEETNEAKRQANKELLLERLETHIKTVVERYKDDVTAWDVVNEVVDDGTPNERGLRESVWYQITGDEYIRVAFETARKYAGEDAKLFINDYNTEVTPKRDHLYNLVQDLLADGVPIDGVGHQAHIQIDWPTIDEIRTSMEMFAGLGLDNQVTELDVSLYGWPPRPAFPTYDAIPQERFQAQADRYNQLFELYEELDADLSSVTFWGIADNHTWLDDRAREYNDGVGKDAPFVFDPNYRVKPAFWRIID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an aromatic mutant (F4A) of an alkali thermostable GH10 xylanase from Bacillus sp. NG-27
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp. ng-27
molecule keywords Beta-xylanase
total genus 141
structure length 354
sequence length 354
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2015-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5effA00
2WVTA 1H49A 2Y5EA 5FKYA 3IANA 3ARVA 1JYWA 1E3XA 4CU7A 4PBGA 1R86A 1UKPA 4W8BA 4P7RA 1B3YA 3LMYA 2XSAA 1PIFA 4FLRA 1GHRA 3VIIA 2VCAA 2VZSA 1ZBWA 3MKKA 2BV9A 5AC5A 4PUDA 4U2YA 1J0KA 3ZJKA 3WIJA 3CIVA 4E4PA 3AI0A 2GSJA 3BC9A 1XYFA 2EPOA 1GUVA 2XVLA 1GVYA 1J0IA 1UQZA 1CGXA 1CTNA 5CGTA 1U30A 4MAVA 1JD9A 2OYLA 3W81A 1OT1A 2J79A 4P8VA 1Q6DA 3BAWA 2WHKA 5JBEA 1ZJAA 3WFLA 1JZ4A 2EJ1A 1OT2A 4B9ZA 1B3ZA 5HOSA 3AZRA 3BAXA 1GPFA 2WHMA 2YKKA 1UD3A 4PMXA 1WZLA 1I75A 3N9KA 3UG3A 3VUPA 1G5AA 2IUZA 1QNOA 1W9DM 3VDBA 3MUZ1 5HNNA 3WD3A 3VDHA 3UR7A 1KXHA 1CLXA 5ABFA 4E8DA 1C93A 3WH9A 3GXMA 2W91A 3CZEA 4CKQA 2VX7A 5AYBA 1W9PA 4W5ZA 3NJ3A 3CUIA 3WELA 1Z32X 2YLLA 2CBVA 2J62A 4EE9A 2YDQA 1NM9A 4PTXA 3WNMA 2WCGA 3W6MA 4DUVA 3OLEA 5I5RA 5FIPA 2VUYA 5D9PA 1QW8A 5I23A 2NT0A 2DSZA 3GBDA 3KWXA 3EDEA 1E73M 2PBGA 5I6SA 1BAGA 2X2YA 4Q22A 4D1JA 4J3VA 3FXYA 3GXFA 4M24A 2J75A 3MSGA 4AEEA 5CGMA 1X1NA 5DO8A 3RPMA 3LPPA 4UR9A 2XUCA 2D23A 3W28A 1ISYA 4AWEA 2V5DA 2XM2A 3IAPA 1J0JA 1GQKA 5IFPA 2WKLA 3CTTA 4IISA 4MNKA 1UA7A 1QI3A 1EHNA 2DIJA 1E0XA 3E1F1 2BVYA 2HVMA 4J3XA 4D6DA 4AD3A 3N04A 1WCGA 1B90A 2OYMA 1JNEA 2ZIDA 1EO7A 1UD4A 1H5VA 4AZIA 3WUFA 5DT5A 4DUWA 3EMQA 3F5KA 5C8BB 3PZGA 1HXJA 2J47A 2YDSA 1QPKA 2WWDA 2GDUA 5EBAA 1E1EA 2VR4A 4P8WA 1J0ZA 1V6WA 3AIVA 3VM7A 4QLJA 3TTYA 5CLTA 2J7EA 2XVPA 4HZ8A 2ZX9A 4ZENA 1TUXA 3POHA 4X0VA 4BA0A 4LXFA 4PUEA 2UWFA 3QGVA 2JE8A 4ACZB 3AIEA 1GZJA 4AZGA 4JKMA 3CO4A 1KGWA 4ZE4A 4XZBA 3SUVA 1VJSA 1IZKA 1HVXA 1M7XA 4JL1A 3W0KA 3SCUA 2XTKA 2J74A 2DH2A 4D6CA 2TAAA 3OZOA 4LYQA 3KE0A 1D7FA 1XD0A 3N12A 1BG9A 3MMDA 2WVSA 1M03A 5I79A 4HMEA 4RE4A 2DEPA 4U2ZA 5E0CA 4IUGA 4DWSA 1DTUA 4P8UA 4Z2HA 1LL7A 3WDHA 3M7SA 3GH5A 3AZTA 3F5LA 1B31A 1ISXA 2JFEX 4D6FA 3WMBA 3DYPA 1CGTA 3VD4A 3N11A 1WDQA 2E4TA 3ZJ8A 2VQUA 3MO4A 3ZQ9A 4TVUA 5HXMA 2CNCA 3ARWA 3THCA 1HKMA 5JIPA 3UG4A 3U5YA 2J8GA 1HT6A 1VFMA 3L2MA 4AZCA 1E0WA 4W87A 2WLZA 3RJXA 4CN1A 5A6SA 5JIWA 1HNYA 1HN1A 1CXLA 1GCYA 3K46A 2V38A 3OZPA 2ZX8A 4U33A 1R7AA 1V6YA 4LQ1A 5DMYA 1OB0A 1MW2A 4HA3A 1DWGM 1WDRA 1V3MA 5M3WA 4F8XA 1NOUA 1JDAA 2EXOA 4DWSC 5BXTA 1G0CA 4MB5A 3KEHA 1W9XA 4HA4A 3WF3A 1VEPA 1OWQA 3OB8A 3PZVA 4WLCA 4W8LA 4AZ6A 3VGBA 1RPKA 3PTKA 1WAWA 3DYMA 3BAYA 1O6IA 3A4AA 4AYSA 4XB3A 4H8UA 2OSXA 3FAWA 1AQ0A 1RP8A 5CSYA 4GIAA 1LL6A 4NSBA 2CKSA 2GFTA 3PZQA 3MMWA 3GNOA 3BSHA 2X0YA 1GOMA 4W5UA 1K9EA 2W92A 3ARXA 3N17A 3U57A 1NP0A 3VDCA 4LYRA 4QP0A 2DT1A 1BVZA 4GO8A 4M80A 4BQ3A 3WKZA 1UZ4A 1KGUA 4MNLA 3BAJA 2W62A 1XGZA 3BXWA 1ZB5A 2VRQA 2VCBA 3BLKA 2WMJA 2WC7A 2CXGA 2WM0A 1L0PA 3KL3A 3NSNA 2XFRA 1VBUA 2WZHA 2VQTA 3O2LA 4UFLA 3WD2A 4B16A 2VCCA 1ZBCA 1XSKA 4CU6A 2WVUA 3T0DA 1W2VA 4J3TA 3QR3A 2C0HA 1HIZA 1H09A 1KQZA 1KXVA 3WEOA 3SUUA 2GK1A 1V3HA 2D0HA 3PZ9A 1M04A 2WZIA 4IM4A 3SCRA 1ISWA 1GHSA 4NZCA 2OSWA 4U31A 4WK9A 1WPCA 5BROA 4L4PA 2D1ZA 4HMDA 2A3HA 3NSMA 2ZXAA 2WC3A 4NRRA 4GXPA 2G8ZA 4XUYA 4PMRA 2Y2WA 3WD4A 1KFWA 3AIWA 1NH6A 1KBKA 1FH9A 5E70A 3AMKA 3LPOA 1WDPA 5DFAA 3AIBA 3L4VA 5D8WA 1E71M 1HJQA 1BYAA 1G1YA 1UYQA 1J11A 3I3BA 2PF0A 1XSJA 3FHAA 2G3MA 1GQIA 3MUAA 3EBVA 3WNPA 1EDTA 1V3KA 4MJ2A 4QFUA 3VMOA 4C7FA 3WL0A 4FMVA 5M03A 3ZOAA 3K8MA 1HJSA 1G01A 5LA1A 1GONA 4MTVA 1JI1A 1C7TA 4B3LA 1UOKA 1KWKA 4E2OA 4OOUA 3ARZA 1DWFM 4CN6A 2BY3A 1MQPA 2VZOA 1Y7VA 3ZSTA 5CSUA 2PC8A 2VO5A 1OCQA 5CPQA 1EHAA 2VJXA 1A47A 1XV8A 1QI5A 4L4OA 3B9EA 3A4WA 5CG0A 3FNDA 4AZ5A 4M8UA 3ZIZA 3W4RA 3WY1A 3WDIA 1PJ9A 2GJXA 4A4AA 3CZJA 4M1RA 1EGZA 1E40A 1EDGA 3HN3A 3ARRA 3VM5A 3U5UA 3SEPA 1D3CA 1CZ1A 1B3XA 3F4VA 4UOZA 4WKFA 3GXDA 1RP9A 1U33A 2J78A 3PTMA 2E40A 4HU0A 3IK2A 2CESA 2E9LA 3M46A 1ISVA 1MW1A 1BSIA 4Z2LA 1E6ZA 1UD8A 3I3EA 5A8MA 1VBRA 3AMGA 1W1YA 4GZEA 4Z2KA 1LJYA 4PTMA 4UQEA 5A2AA 1FHDA 3CPUA 1NP2A 2WW5A 3AOFA 4J3UA 2BY0A 1SMAA 2YL6A 3FW6A 2HISA 2WVVA 2ZUSA 4GINA 2G3JA 1IT0A 4WIWA 2Y24A 1X6LA 2ZUWA 4JAWA 1CWYA 1KR0A 3CHDA 3VINA 1JZ7A 2V5CA 2X09A 1JYXA 3WDJA 3CZ8A 4W86A 4F9DA 4MB3A 4UCFA 5A8OA 5BRQA 1HL8A 4AD0A 1V0MA 1ZJBA 2WHJA 2XSBA 1J01A 1FH7A 1BVNP 4CUCA 1GNXA 2CBJA 1HKKA 1BGAA 4MDOA 1V3JA 3WNOA 1O7AA 2EQDA 1VFFA 3BGAA 1CBGA 5KZ6A 4D72A 3B9AA 4AIEA 4AD2A 4PMOA 1E6SM 2FH6A 3WF1A 5EB8A 4JL2A 3K8LA 4WSJA 2JF7A 2E8ZA 4QCEA 4H04A 5IFTA 3AS2A 2ZXDA 2WMIB 2XYLA 4MDPA 1J0HA 3WNNA 1NOFA 3PZIA 3WBAA 1QVBA 1XH2A 2ZXBA 2QPUA 3PZMA 3BCFA 3ARYA 1WNOA 4FLOA 2W4XA 4BQ2A 5A6KA 1C91A 3IAQA 1FP8A 5A94A 2OSYA 3TONA 3EDKA 4RE3A 1E6RA 4CVWA 2D22A 4CCCA 5FCZA 1BYCA 4PMVA 1XD1A 2B31A 4OBSA 2MANA 7CGTA 3MU7A 1BGGA 1MXDA 3WD1A 4HOZA 2VL4A 4UQAA 1TR1A 1JZ3A 4M56A 2DSWA 3D5HA 3EDJA 3AXHA 7A3HA 5I0DA 4FLSA 4D6EA 3TP4A 4P7QA 3RJYA 2WCAA 2QF8A 4UFKA 2VZVA 4YHGA 2BXYA 2CBIA 1V6VA 2JALA 3BH4A 3CZGA 1CPUA 2W5FA 4N42A 3SCTA 3RDKA 1UD5A 1E6QM 3ALGA 4KMQA 4PMDA 1I1XA 3WH5A 3WQ5A 4URIA 3WENA 1GOIA 4RL3A 3WFZA 4KGLA 1E3ZA 2X8RA 1C8XA 1PZ2A 2OWCA 1GOOA 2EEXA 2PI6A 3WN6A 3VGEA 3SCVA 3UETA 4GPNA 1GQJA 2WHLA 3ZSSA 1KCKA 2ZX5A 2J25A 2G41A 1W3HA 4CCDA 1DP0A 4UFMA 5CJ5A 1K9TA 1H11A 8CGTA 2F61A 1E4NA 2PBOA 4Q7NA 4TTGA 3VIJA 1FHLA 4U3CA 1K9FA 1OBAA 3VTRA 1CECA 2YA0A 4IPNB 2J4GA 4PN2A 1QI4A 1QNSA 1QNRA 1RD6A 1LWHA 3VU2A 4NRSA 1UZ1A 4Y7EA 1FP9A 4AZBA 4F9JA 1UR1A 3PBGA 5I78A 4HZ6A 2CPUA 1C90A 3TTQA 3FAXA 3OA5A 4CD4A 5D9OA 2RGMA 1J9YA 3CUJA 1QI2A 1H2JA 2JF6A 1PX8A 2XG9A 2YLAA 2XJ7A 3IJ8A 4D6IA 3WQ6A 4J7RA 1HX0A 4PMUA 3WMCA 3AJ7A 3AHXA 1UHVA 4DM2A 1KXQA 2QPSA 2RGLA 3POCA 1MQQA 4YHEA 1V0KA 1BYDA 2JEQA 1J10A 1OGBA 5BRPA 3SUWA 2ZICA 5LA0A 1H41A 3ARTA 3VO0A 2IXUA 3OLDA 4PMNA 4H2CA 4Z2GA 4CN4A 3PN8A 1EIBA 2VR5A 3AQUA 3BSGA 4X0NA 3WNLA 2WAGA 3I3DA 3VMPA 1B30A 3T08A 1E0VA 4IPLA 1VIWA 2YA2A 3GBEA 3EMZA 1UKSA 3A6OA 2J8FA 5A6BA 1WB0A 2A3BA 5AY7A 4CD8A 1FFRA 1EQPA 1MWOA 3AHYA 3OGRA 5TD4A 3WDQA 3GNRA 3EMCA 5CPSA 1TA3B 4K68A 1W3JA 1DEDA 2A3EA 3PHAA 5JBFA 5ABFB 2WNWA 1V3IA 4C7DA 2QLYA 5GNZA 2VT0A 3II1A 4EANA 3OIHA 4UFIA 1YQ2A 3WH6A 1OIFA 2BHUA 2EPKX 4EK7A 2QMJA 2YA1A 2O9OA 3AIUA 5CQ1A 4UNIA 2CHNA 2XFYA 2VI0A 3KL5A 5A1AA 5I77A 4A3YA 1JG9A 2D20A 1MW3A 4B9YA 4C7GA 3BAKA 4W88A 3K1DA 1PZ3A 2NSXA 5BXSA 1OIMA 1W91A 3AHZA 1ITXA 3AS1A 1MFVA 4D6HA 2NW0A 2ZOXA 1C7SA 3CGTA 2Z1KA 4JZ5A 3EDFA 2DIEA 3L4TA 1FA2A 3KZSA 2VVSA 4WJXA 1V0LA 4W7VA 2XGIA 2OYKA 1KB3A 1UUQA 1PBGA 1M01A 4TX6A 3WL1A 4AD4A 2J7HA 4BZYA 1JIBA 1LWJA 4TVDA 3WH7A 1K9DA 5BCAA 4PCSA 2WPGA 3W25A 2ZXQA 3SCSA 1V02A 2J7DA 1EQCA 1VRXA 3PTQA 4CVUA 5CXPA 2WMKA 1CEOA 3L2LA 5E9AA 1TG7A 1JZ8A 4AISA 4W85A 3CZKA 4H7VA 4X9YA 3D3AA 4DM1A 5A6MA 4V2XA 3SCQA 2YBUA 3RILA 1LL4A 2BVTA 2X05A 2VZTA 1BF2A 4HA1A 4WKHA 3VGFA 1GORA 3AS0A 1ITCA 1B1YA 3PZUA 2DT2A 1UWQA 1UKQA 1CXIA 1IV8A 5A2BA 3S2CA 4D71A 5HDRA 1JDDA 3AIRA 3BCDA 3VKKA 1J0YA 1ZBVA 3FN9A 4UQCA 4Z2IA 1W9VA 3VMNA 3VX0A 3MMUA 1DWJM 3ZT7A 3U7BA 4CGTA 3CBWA 1BFNA 2XIIA 5I24A 4CD7A 1WO2A 4HPGA 2D2OA 3MV01 1EA9C 2WLYA 2WWCA 1TFVA 1NWSA 1UKTA 1X6NA 1XRVA 3VIKA 3TOPA 4JFTA 1V6XA 3S6TA 2UY4A 1UQYA 3MSDA 4BCEA 1WZAA 4DWSB 5ABEA 4AZ7A 2X0HA 4P8XA 4U3AA 5IHSA 2VC9A 2BNJA 4J28A 2G3NA 3AS3A 2W67A 5KEZA 1C8QA 3AIQA 3W26A 2CKRA 3T0AA 1JFHA 3NDYA 3NSXA 1B3WA 1AQHA 1SFSA 1E55A 2BHYA 2XPKA 4ZFMA 1UR0A 3VGHA 2GJPA 2AOSA 3CMJA 4P7LA 1MXGA 4AY1A 3UR8A 1QBAA 2DSUA 1LG2A 2WMIA 3VIOA 1CGUA 2WKGA 4WF7A 2C8NA 2XHYA 1R87A 1EOMA 1E4MM 2VRKA 2ESCA 4FLQA 2XVNA 1CXKA 2E3ZA 1PX3A 2CBUA 3AXXA 1W1TA 3GXIA 3LPGA 1JXJA 3WQWA 3MANA 2VX5A 2VVNA 4GI6A 2WMGA 4AXNA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2WVT A;  1H49 A;  2Y5E A;  5FKY A;  3IAN A;  3ARV A;  1JYW A;  1E3X A;  4CU7 A;  4PBG A;  1R86 A;  1UKP A;  4W8B A;  4P7R A;  1B3Y A;  3LMY A;  2XSA A;  1PIF A;  4FLR A;  1GHR A;  3VII A;  2VCA A;  2VZS A;  1ZBW A;  3MKK A;  2BV9 A;  5AC5 A;  4PUD A;  4U2Y A;  1J0K A;  3ZJK A;  3WIJ A;  3CIV A;  4E4P A;  3AI0 A;  2GSJ A;  3BC9 A;  1XYF A;  2EPO A;  1GUV A;  2XVL A;  1GVY A;  1J0I A;  1UQZ A;  1CGX A;  1CTN A;  5CGT A;  1U30 A;  4MAV A;  1JD9 A;  2OYL A;  3W81 A;  1OT1 A;  2J79 A;  4P8V A;  1Q6D A;  3BAW A;  2WHK A;  5JBE A;  1ZJA A;  3WFL A;  1JZ4 A;  2EJ1 A;  1OT2 A;  4B9Z A;  1B3Z A;  5HOS A;  3AZR A;  3BAX A;  1GPF A;  2WHM A;  2YKK A;  1UD3 A;  4PMX A;  1WZL A;  1I75 A;  3N9K A;  3UG3 A;  3VUP A;  1G5A A;  2IUZ A;  1QNO A;  1W9D M;  3VDB A;  3MUZ 1;  5HNN A;  3WD3 A;  3VDH A;  3UR7 A;  1KXH A;  1CLX A;  5ABF A;  4E8D A;  1C93 A;  3WH9 A;  3GXM A;  2W91 A;  3CZE A;  4CKQ A;  2VX7 A;  5AYB A;  1W9P A;  4W5Z A;  3NJ3 A;  3CUI A;  3WEL A;  1Z32 X;  2YLL A;  2CBV A;  2J62 A;  4EE9 A;  2YDQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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