5F2GA

Tagatose-1,6-bisphosphate aldolase from streptococcus pyogenes glu164gln mutant in complex with fbp
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
323
structure length
323
Chain Sequence
TLTENKRKSMEKLSVDGVISALAFDQRGALKRMMAQHQTKEPTVEQIEELKSLVSEELTPFASSILLDPEYGLPASRVRSEEAGLLLAYEKTGYDATTTSRLPDCLDVWSAKRIKEAGAEAVKFLLYYDIDGDQDVNEQKKAYIERIGSECRAEDIPFYLQILTYDEKIADNASPEFAKVKAHKVNEAMKVFSKERFGVDVLKVEVPVNMKFVEGFADGEVLFTKEEAAQAFRDQEASTDLPYIYLSAGVSAKLFQDTLVFAAESGAKFNGVLCGRATWAGSVKVYIEEGPQAAREWLRTEGFKNIDELNKVLDKTASPWTEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title NON-STEREOSPECIFIC SUBSTRATE CLEAVAGE BY TAGATOSE-BISPHOSPHATE CLASS I ALDOLASE
rcsb
molecule tags Lyase
source organism Streptococcus pyogenes serotype m1
molecule keywords Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2
total genus 127
structure length 323
sequence length 323
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.40: Tagatose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2015-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5f2gA00
2E5BA 1WA3A 2ZRYA 1YPFA 1LOSA 1FDZA 5KSWA 3P7YA 4HPXA 2V8ZA 4HNVA 3P74A 4WXYA 1UJPA 4N6EA 2GVLA 3A23A 5FF0A 1TTJA 1KFBA 3W86A 2WNZA 3C0JA 1LRNA 1K03A 1KTNA 4HPJA 3NQ7A 5DBUA 4MIMA 1O4UA 5HQEA 4FO4A 1NF0A 4FX6M 5G5IA 1SR9A 2CLEA 3A5FA 3VI2A 5DN1A 3GXPA 3QFEA 3TMQA 2FLIA 2VFHA 3W73A 4TO8A 2Y7GA 3W1XA 2YX0A 4WOQA 3C52A 3ABQA 4NT0A 3PBYA 2QCMA 4IX2A 1IF2A 5KITA 1JJKA 4O0ZA 1KBJA 2VEMA 4FX7A 2ZQ0A 1NVMA 2CLLA 1IXOA 1UB3A 1H7OA 3CM4A 4IX0A 4E2DA 3B06A 4UFMA 2BWGA 3EX3A 3TCEA 5K9DA 4CQAA 4L4MA 4K39A 1I4NA 1KV8A 3W84A 3LCWA 3Q2DA 3SJ3A 4X22A 3L65A 3PC0A 4OU1A 4ICNA 3CWOX 1R46A 2C19A 1BEUA 2YYTA 3W76A 1N7KA 3CT7A 4ZQMA 2QUTA 4NJJA 1NSJA 4O54A 3UPWA 2Z0IA 3DI0A 1FX6A 1F2JA 1XBZA 5EY5A 5D03A 1NFBA 1KFCA 3TSMA 2NWRA 1LM1A 3GXNA 4JTSA 1JUBA 3QRHA 1XUZA 4AEOA 3KAOA 5BMWA 3MYOA 4JTKA 4UTMA 1QNVA 3KRUA 5CSRA 4Z1CA 1Q6OA 1OVDA 4PTNA 3I7SA 4OV4A 3HG5A 1H63A 1KFEA 3S1WA 2VOMA 4OHQA 4LVAA 3O6DA 2ZCGA 1DHPA 1HFBA 2WOQA 2R8WA 2NV2A 4PCFA 3LB0A 3CU2A 1MZHA 2E09A 5C54A 3M41A 3S42A 1H62A 6ALDA 2QEZA 3FKKA 2R14A 1JRCA 4QITA 1ZALA 3TXVA 2VC6A 4A2SA 1Q6QA 4FNUA 3NEVA 2Q8ZA 3W74A 4XWUA 2Q3RA 2WSYA 1GVFA 3S1XA 3LXCA 3LOTA 4RXGA 1RQEA 2HS6A 4C1KA 3IGUA 2FPVA 4HNNA 3W1QA 4BR1A 1KM6A 4GXMA 4M7TA 1TPDA 3MP4A 4UCGA 4DF2A 2CZEA 2DP3A 1EEPA 2X1RA 3UD6A 2FQIA 5D38A 3W22A 3PS7A 3S6DA 1A5AA 3I7QA 4DO4A 1TTQA 1UBSA 4NQ1A 1ZFJA 3T40A 4UTIA 3O6CA 1W1ZA 3NQ2A 1W5NA 1VYRA 1A5BA 3ABOA 1GYNA 3QPYA 1W5OA 1TTIA 1QO2A 3RFAA 3B4UA 4WY0A 4JY9A 4IMGA 4MFDA 3HG4A 1H7RA 1SFLA 1GTHA 2LLEA 3KHJA 3N9RA 4DO5A 5F2LA 1P0KA 3MI6A 1AW1A 1KA9F 1S5TA 2ZYFA 3KVMA 1TQXA 4Y6GA 1CW2A 2ZZ6A 1FCBA 3GDKA 1XXXA 2A0NA 4RXFA 3P84A 4KKXA 4FX8A 3QYQA 3UWVA 3DENA 1H1ZA 3TX9A 2JKAA 4QNEA 4GUIA 3EXRA 2I1OA 2OX1A 3EB2A 2ZRVA 4MFEA 4FF7A 4ZQNA 3BLIA 4HSNA 4NZJA 2B7PA 2B4GA 3W7MA 1KLYA 3TC6A 4I7VA 5LKYA 1BWLA 3F03K 1LP6A 5BOOA 1UUMA 3N14A 4MLRA 1PV8A 4JGDA 3NVTA 1XC4A 2GUUA 3RK8A 4S1FA 2FB2A 2C0AA 1QOPA 2A2IA 3HGJA 3PVFA 3MBFA 1XUUA 3W72A 4QSHA 4FIRA 1FQ0A 5G1YA 4X3ZA 1JCYA 2J9ZA 3KVJA 3W1RA 4N9BA 2AGKA 3PAJA 2QCLA 3S8HA 4ZZ9A 1M7PA 5T26A 4Z1AA 3P80A 2WNNA 3DXIA 4WX2A 5CG7A 4R34A 2QCNA 3GIYA 5EMUA 1SUXA 2E5DA 4N02A 2YZRA 3USBA 1JCXA 3E49A 4QJ1A 3L0KA 5F4WA 3SW6A 3NQ6A 3EWUA 2NX1A 1ZHAA 3FLUA 1YTKA 3QEZA 3SZ8A 4O12A 2WSRA 5DY2A 3W75A 1I8JA 2PRHA 1QO5A 4A22A 4E38A 2JGYA 1XKYA 4AAJA 3W07A 4PEKA 4JR5A 4MUZA 2ZBTA 2XN0A 2Y7EA 1YADA 3P8IA 5FF2A 4RZ4A 1TIMA 3TU9A 3G1YA 4JX5A 1RQHA 1FWTA 3TQKA 1JCMP 2W79A 5D32A 1I2QA 3UPBA 1F5ZA 5AHFA 3QMTA 1EWEA 2FPTA 4CCEA 4GUJA 1D9EA 5J5DA 3BW4A 4R53A 3A22A 4RK8A 5FF3A 3HB9A 1WQ5A 2ZRWA 3ZWSA 4O8RA 4BI7A 4RJEA 2AQWA 3IIPA 1F05A 3P82A 3UXDA 3S5NA 3W7LA 3W1LA 2EHHA 1VYPX 1K7FA 1AW2A 2A6NA 1Z41A 3BG5A 3M1ZA 4JY8A 3IIZA 3LI0A 2QJIA 1BKSA 2OT0A 2A1YA 3S9YA 5EKYA 5I3IA 4IXXA 5U4NA 3LCXA 3GXTA 4N9DA 1HUVA 4K6AA 4P61A 2YFNA 1LOQA 4A21A 3B0PA 3HPSA 4MY8A 5D30A 1VCGA 4UUIA 3OBKA 4A2RA 2CLKA 4CQ8A 2VELA 3CB8A 2J9YA 1FCUA 1HTIA 3WJZA 1QPRA 4OT7A 3OG3A 3QPZA 3FKRA 3M16A 3K30A 4A3UA 4FNQA 5I3KA 4BWLC 2CW6A 1KM1A 3Q94A 4O10A 1FXPA 3W7IA 2X1SA 3GDMA 2ISSA 4I7WA 1JQXA 3TSBA 4WOZA 2GQ9A 2BLEA 4JIPA 3T4CA 1M5WA 1QPOA 1FWNA 4UC5A 3JR2A 1J5TA 3UNDA 4D2JA 5LGZA 4RLIA 1FWRA 5DCBA 2HS8A 4YLWA 3KX6A 5FF4A 3NXFA 1G4EA 3I68A 1P4CA 3EKZA 4DBDA 4UFKA 5CZSA 3S1UA 1O60A 4FHAA 1SO4A 3FJ6A 3TQ0A 4TMCA 4BWLA 3HGSA 3QM3A 4LRSA 1K02A 1XBVA 4LOCA 1R47A 4RR4A 4AWSA 4NJGA 1VHCA 5AHLA 3O16A 2FPYA 2Y61A 4AXKA 1LRQA 1OX6A 3TQVA 3FEMA 1LOLA 1JULA 5CSSA 1G4PA 2DU2A 5DELA 3W70A 1W3TA 3F4NA 3L68A 1R2SA 3LBMA 4B5NA 1ZNNA 5AFDA 2RDTA 4IMFA 4CNOA 3R89A 2DZSA 1PE1A 3Q37A 4WY0F 4YCPA 3B04A 3TW6A 1GYLA 1IXPA 4FB7A 3JRKA 1VLWA 3VCRA 2GVJA 1V5XA 4AHOA 2NUWA 2QR6A 2KZHA 1DORA 3PUEA 4LV9A 4IXHA 3QQ0A 5K3VA 4O14A 1OFOA 2C14A 5ABTA 3MWAA 4UTTC 4NX5A 1CI1A 1YLVA 2Y62A 1VH7A 3GDTA 5F4XA 2EGZA 2YGYA 3LERA 3LHVA 3LV5A 4N9CA 1OK6A 4KFNA 3IVSA 4UTWA 1T8XA 1ME8A 4DF1A 1B57A 3ABRA 4NJKA 1TPWA 2QUVA 4MZ8A 3OVQA 3GNDA 1GTEA 5AHNA 5GVJA 3T78A 1YDOA 2C15A 3W1AA 1X8FA 1TRIA 3C2FA 1ZY9A 1JVNA 1S3HA 5FESA 3S5YA 3M5ZA 2E1DA 2ABAA 5C2XA 4K7YA 2ABBA 1SPQA 1DV7A 2EPHA 3BG9A 3SGZA 4UTTA 1RR2A 4LUJA 3S1VA 4UMAA 2ZA1A 1FDYA 3I7RA 5TQLA 4PH6A 4I7UA 4NVTA 1VGAA 2O7SA 4DXVA 1RZMA 3QSTA 3ZFHA 3W1MA 3TROA 1R30A 4XKYA 1A53A 3GR7A 4AWUA 1AW5A 3W85A 1LZOA 1J2WA 1RQBA 2VEPA 4JTJA 3SSJA 1TTPA 1I2NA 3CTLA 4E2BA 1Z48A 1WX0A 3TK7A 1TJPA 4KFPA 2ZZ4A 3DFTA 3ZWTA 1JQVA 4UFIA 4O1AA 4KFOA 3BGGA 1PHQA 1YTEA 1EA0A 4HIBA 1W3NA 3NYZA 1AL7A 3NNTA 1VCFA 1PVNA 2YR1A 4EVZA 1O94A 3MHFA 4NX0A 2EF9A 1OF6A 4ZVJA 3RLVA 2VFFA 1TPH1 1KLZA 4IMEA 3INPA 4PL2A 1TO3A 3IVUA 3WK2A 4MY1A 3NL6A 1W8SA 1H50A 1TSIA 3BPWA 4DELA 4MY9A 2PRLA 2A7NA 2QF7A 4Z1BA 3C4UA 3M0ZA 5DXXA 4K38A 3V1PA 4X2RA 1OFBA 3LXBA 1ICPA 2X1TA 3CPRA 5D04C 3UWUA 3BLEA 1SZFA 3TNOA 1W5PA 3ATZA 5BW6A 3F4WA 1TV7A 1EP2A 1F76A 3CEUA 1PCWA 2H3DA 1YXYA 4Z1DA 1QPNA 3W23A 3E0IA 4Z08A 3PBVA 3E9AA 5AC7A 2YSWA 1OF8A 1ZCOA 3RNDA 3NAVA 2WQPA 4O1BA 4W9TA 4A29A 1K8XA 4I9AA 4XTDA 2DZVA 3NR0A 5AC8A 3LLDA 2QAFA 4UR8A 4HKPA 3GVGA 5AB3A 5K4ZA 1QR7A 1VRDA 5EL1A 4JTEA 4RKAA 2O7QA 3THAA 2QCGA 3S0CA 4RZ5A 4Y9AA 1A50A 3MI3A 1VPXA 3C61A 2E6DA 3G22A 1SO3A 3DAQA 3LTPA 4UTHA 4ZQRA 2X16A 3LLFA 4O0KA 3W1PA 1C29A 4O11A 3HQ1A 1GJPA 3L5MA 2ATSA 2WJZA 4K36A 3VE7A 3NQGA 5AYXA 2WKJA 1X7FA 1Z42A 4JX6A 3LCIA 2ZFAA 5I3JA 2RH9A 5LZLA 1Q6LA 2NXGA 5FEXA 3MHGA 3DGRA 3WJXA 5CPOA 1PIIA 2ISVA 3ELFA 2ZA2A 3QMRA 5AYZA 3B8DA 1YPIA 4JDYA 1BTMA 1K7XA 2X1UA 5IBXC 4WXZA 4XZ9A 5HR7A 4EF8A 4ORMA 2C6QA 3SIZA 2F7FA 3LCLA 4YXGA 2W6RA 2D73A 5D02A 4OWGA 4U28A 1TJRA 4KWVA 4HHPA 4UMBA 3GKAA 4MZYA 1ALDA 3G8RA 3BLFA 1W56A 3OHIA 3FS2A 4LVDA 4M6PA 4NXSA 3L9CA 4JYDA 1OK4A 3EEGA 4DQWA 3H53A 1ZJIA 3UYCA 2V0TA 5KTLA 1THFD 3N3MA 1W0MA 2E6AA 3LHTA 2VFEA 1L9WA 3BVJA 3LX9A 8TIMA 2E6FA 2JKPA 5IBXA 4NNBA 4NNCA 3U6WA 1SQ7A 3UZ5A 3W7RA 2OT1A 3MP5A 2Z2UA 2CZFA 3P61A 2NZLA 3DU0A 4ZQCA 5LGXA 3EKLA 1AL8A 3QH2A 3R13A 3W2MA 1OFRA 2Y88A 3TIMA 5G4WA 3L5LA 3A5VA 3L5AA 4U4MA 2ZTKA 3PWAA 1LLZA 3RLUA 2Y70A 3HMJG 4O18A 1G6CA 5FEWA 2YW3A 1RD5A 3KFTA 3CIXA 2A7PA 4AF0A 5D09A 3DZ1A 3GDLA 4HSOA 4GUHA 4DPQA 1TV5A 2YYUA 4EIVA 1SZGA 4DBEA 2Y7FA 1M6JA 3O15A 1EP1A 1KM4A 5EYWA 1OYCA 1TQJA 1T99A 1W37A 1F74A 1KFJA 4M5PA 3HG3A 4LVBA 2XFWA 3N2MA 3PB0A 2FDSA 4HNTA 1TRDA 1TPB1 4JTTA 3M9YA 6TIMA 1S5VA 2DJXA 4GUGA 2A21A 2E5CA 3TV8A 1FCVA 4ZQPA 1P0NA 3MBDA 2J9XA 3NQFA 2G96A 1LTDA 2V9DA 3S5ZA 2EAWA 3SGUA 2R94A 3UZJA 2B7NA 3O07A 4GNJA 5HNRA 2TYSA 3LTYA 1SSDA 3B0VC 1EUNA 3PSWA 1OABA 2NX3A 4WY0B 1L6SA 3EX6A 3GX9A 5KZEA 4L4LA 1Q3NA 1XFBA 4GC4A 1XDMA 1G7VA 3MP3A 3O06A 4JN6A 3NPUA 2J88A 5H91A 2C1HA 5LNRA 3LM7A 3TXZA 1QMLA 5FF7A 4O28A 3L2IA 4R33A 4Y90A 4HN4A 3G8EA 3KVKA 2DZWA 3MYPA 2RKXA 3RF9A 3PUOA 4M6QA 1QDSA 4YMZA 3LCFA 4PODA 1H51A 4CNNA 2UV8G 1F7BA 1VHNA 1B9BA 1JUKA 1G67A 2BTMA 1KW1A 4JYFA 2I9EA 4FIQA 4RCXA 1DJQA 3NQ8A 3W2UA 3W7HA 1TREA 4MYXA 1OX4A 1J4EA 4RZ6A 2QCEA 2NV1A 4O15A 2ZZ2A 1I2OA 3ATYA 4JTLA 3V75A 1LYXA 1G4TA 3LGEA 1VYSX 1F6PA 2BX7A 3O8AA 3GDRA 3GK0A 3TDFA 1P1XA 2YPIA 4LV4A 3N73A 4AHQA 1O95A 2Y89A 1GG0A 2ZZ3A 3FJLA 4IUOA 2QCHA 3BV4A 1GWJA 1WDWA 3W7GA 2HTMA 3OIXA 3DFPA 1JRBA 3LCGA 1W5QA 3P62A 4CCCA 1SU5A 4WZHA 4O4VA 3LHYA 3M7WA 3R5EA 3G1AA 3CLMA 4IQLA 1M7OA 2ZDRA 3RU6A 1WBHA 1I2PA 1FY6A 3C2OA 1L6WA 2CLMA 1EP3A 1MEIA 3EWBX 5A5WA 3KXQA 4LS1A 4LVGA 5K9XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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