5FCZA

Streptomyces plicatus n-acetyl-beta-hexosaminidase in complex with thio-naglucal (tnx)
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
499
structure length
499
Chain Sequence
DRKAPVRPTPLDRVIPAPASVDPGGAPYRITRGTHIRVDDSREARRVGDYLADLLRPATGYRLPVTAHGHGGIRLRLAGGPYGDEGYRLDSGPAGVTITARKAAGLFHGVQTLRQLLPPAVEKDSAQPGPWLVAGGTIEDTPRYAWRSAMLDVSRHFFGVDEVKRYIDRVARYKYNKLHLHLSDDQGWRIAIDSWPRLATYGGSTEVGGGPGGYYTKAEYKEIVRYAASRHLEVVPEIDMPGHTNAALASYAELNCDGVAPPLYTGTKVGFSSLCVDKDVTYDFVDDVIGELAALTPGRYLHIGGDEAHSTPKADFVAFMKRVQPIVAKYGKTVVGWHQLAGAEPVEGALVQYWGLDRTGDAEKAEVAEAARNGTGLILSPADRTYLDMKYTKDTPLGLSWAGYVEVQRSYDWDPAGYLPGAPADAVRGVEAPLWTETLSDPDQLDYMAFPRLPGVAELGWSPASTHDWDTYKVRLAAQAPYWEAAGIDFYRSPQVPWT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title N-Acetyl glycals are tight-binding and environmentally insensitive inhibitors of hexosaminidases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces plicatus
molecule keywords B-N-acetylhexosaminidase
total genus 182
structure length 499
sequence length 499
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5fczA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 5fczA01
5E9AA 3MMWA 4BCEA 1AQMA 1V3MA 5LA2A 2VCBA 3WDIA 1IT0A 1ITCA 2QLYA 3W26A 3KE0A 3T0DA 2J25A 5BYWA 1ISYA 3T2QA 3A4XA 3VIMA 3ARPA 5JIWA 1FFQA 4W8BA 4MADA 3N9KA 2DT1A 2WWDA 2QF8A 3AIRA 2ZWZA 1M03A 4PUEA 3SCWA 5E09A 5C8BB 4AEEA 1QHZA 1JDAA 3CGTA 1NM9A 2ZIDA 3UEQA 1PZ2A 5D9OA 1H49A 3GNOA 2NSXA 4AZGA 4QLJA 4ACZA 4WF7A 5A8PA 3NSMA 3GYCA 5A6JA 2WCGA 2G8ZA 3EYPA 4PEEA 2WMGA 2D20A 1WCGA 3T2OA 2XFYA 1DWJM 1QNOA 2WZEA 3TP4A 4HOWA 4WK9A 1B2YA 4MB4A 2WC3A 2GK1B 2DQXA 3B8SA 3AROA 1GQJA 1CGVA 3FAXA 4FLOA 2G3MA 1E73M 3VDBA 3M6DA 2DGAA 1JI2A 1MFUA 2OWCA 1V3LA 3EDKA 1HJSA 2VO5A 4BA0A 3PBGA 4IPLA 1FOBA 5EFFA 1CBGA 4W84A 4JL1A 1LJYA 3AIVA 5A2BA 2ZUNA 1OIFA 3SCPA 3L4VA 1UD3A 3OGVA 2BHZA 4UFJA 4PTVA 2Y24A 2WANA 4TX6A 1W3KA 1KXVA 2YJQA 1W3LA 3ZT6A 6A3HA 1JZ2A 1GNXA 3DHUA 1GHRA 1ISZA 3WUGA 1HL8A 1C92A 4LYQA 1KR1A 2YL9A 2WBKA 3FN9A 5D9PA 3AZSA 5HDRA 4J28A 1JNDA 3VNZA 3PZQA 1H3GA 2VRQA 4PSRA 1HJQA 1MQPA 2D24A 4H8VA 1V0LA 2D0HA 2Z1SA 4WJXA 2CHOA 3PN8A 3RIKA 4UQEA 2BVTA 1ZBWA 1I75A 2QPUA 4QLLA 5FD0A 1V0MA 5ECUA 1WDSA 4FLRA 3VTRA 3GH7A 1O7AA 1GJWA 1B1YA 2J8FA 4XX6A 3VIJA 9CGTA 2QPSA 2CKRA 1O6IA 3F4VA 4LYPA 1R8LA 1J11A 4AD3A 5I6SA 5E6YA 1J10A 4HA4A 3CUFA 1UOKA 2VMFA 4JHZA 2XUCA 1E1EA 3UR7A 3VDCA 4AY1A 3T08A 4A3HA 1IV8A 4QP0A 3AOFA 5GQBA 1QNPA 1H41A 3LPOA 1L8NA 2ZXDA 2XGBA 3PZ9A 1B3WA 4GINA 3VPLA 5CJ5A 1BHGA 1RP8A 3AQUA 5DT7A 1SMAA 2D0FA 4QCFA 1FH9A 3TTSA 1H09A 4AD5A 3ARXA 3E1F1 2VT0A 4ZXOA 3CHFA 1Q6GA 4ZFMA 4B9ZA 1KFWA 3ZQ9A 1WDPA 1DWGM 1W91A 2DEPA 3CO4A 1ZBCA 3GNPA 3WFZA 2D3LA 4M56A 4PMVA 3WH8A 3OGSA 3WQ6A 3OZOA 1QHOA 4UFHA 2CXGA 1EOMA 2FHFA 5TD4A 4S3JA 3QOMA 4LPCA 3W29A 3ALFA 3WQ8A 4ACZB 1QNQA 1CIUA 1V02A 3WNPA 4M29A 2DT2A 4ZE5A 2JIEA 1KQZA 4JAWA 1M01A 4D6IA 2PB1A 1UR9A 4EKJA 1HJVA 5I78A 1HKIA 2ZUSA 4PSPA 4D6GA 1E43A 1HVXA 2O9PA 2EO7A 1XH0A 1GOWA 2E4TA 2XTKA 3WENA 5JBDA 4RE2A 1KWKA 2PBOA 5JBFA 2FGLA 1JYWA 4UOZA 1XYFA 2FH8A 1BAGA 1W9DM 4W86A 1VFFA 2WYSA 1ZJBA 2A3EA 5A6BD 2FH6A 1GHSA 1PZ3A 4AD0A 1XD1A 1HKMA 3N12A 4GPNA 2J7DA 4GQQA 2PWFA 1JFHA 3VD4A 1BQCA 1E4NA 3NYDA 2WVSA 3AXHA 4WKAA 2EEXA 4CU8A 4OOUA 1E72M 1C91A 5ABEA 3WDQA 1DWHM 1JZ3A 2JE8A 3N15A 2O9OA 4FF5A 4E2OA 5A6BA 3AMKA 3RPMA 5CQ1A 3SUSA 3WH6A 1XSKA 1JF6A 1J01A 2G41A 1ZJAA 1JAKA 2GFTA 5LA0A 1EA9C 4CU6A 4J27A 2WHJA 1BTCA 4BQ2A 3EMZA 3ZO9A 4HU0A 3B9EA 4UNIA 4JFTA 1OM0A 1PIFA 3O2LA 3VD3A 1V08A 4DM2A 1ODZA 3BAJA 1E6QM 1WPCA 3MU7A 1B3VA 2WZHA 4M82A 4XUYA 4ATDA 2DDXA 2C0HA 4C90A 1JF5A 3BMVA 3MANA 2D1ZA 1WZAA 2G4FA 2OSXA 1ODUA 1TCMA 4W8AA 4YN5A 3RJXA 1GW1A 2GVYA 1GORA 2J78A 1HP4A 3WUEA 4CGTA 1UD2A 5BCAA 3ZT5A 2Y5EA 1NARA 2ZXBA 4H8HA 3WD3A 1XH2A 4JCLA 4PMDA 3OLEA 2OYLA 8CGTA 4X0NA 1GUVA 4NI3A 3CZLA 4AXNA 3BXWA 1GOIA 5CLTA 4W5UA 1BYBA 2A3AA 3EMQA 3KWXA 2WZIA 1HVQA 3S6TA 1SR0A 2W67A 2OLHA 3A47A 3KL3A 1NWTA 2VX5A 1BYDA 1OD0A 5DF0A 2XWEA 3MKKA 1GPFA 1RP9A 3WH7A 1J0KA 3VD9A 1CXLA 3WELA 3FW6A 3SUVA 1G01A 2VX6A 3U7BA 4P7LA 4JKLA 3W37A 3BAKA 2WHKA 5A95A 1QI3A 3PTQA 2VJXA 2C8NA 3MSGA 4AIEA 1UZ1A 5C71A 1OT2A 1BYCA 5ABFA 1GOQA 4AZCA 1RH9A 4XZBA 1QW9A 4U31A 2J8GA 3L4YA 2UY5A 1W9VA 1NOFA 4IPNB 3AHVA 4C7GA 3RILA 5A6MA 3SCTA 4RL3A 3N17A 3IK2A 1SFSA 2JIWA 4MJ2A 6CGTA 5BXSA 1UR0A 1V3JA 1LQ0A 1MFVA 2G3IA 3MMUA 4H04A 4PYSA 3UG5A 4HMDA 2VQUA 4GZEA 2V38A 4UR9A 3QGVA 2YLAA 2EPNA 1WP6A 4W5ZA 3M46A 4UZSA 1KXHA 5DMYA 4OOZA 1CPUA 3ARZA 4HZ8A 1DWIM 1E4LA 4MB1A 2J77A 3GM8A 3W53A 2CCRA 2VZUA 4DM1A 1V02E 2RGLA 1TA3A 4RE3A 3T2PA 2O92A 2Y4SA 1BVNP 2FGZA 3OLDA 3AYSA 3K8MA 3WY1A 1QPKA 1UR2A 2O9TA 4GO9A 3L2MA 1JFXA 2ZICA 1OCQA 3ZOAA 3W38A 3DYMA 4GI6A 3SUWA 1FHDA 4QCEA 2JEQA 1UA7A 1CXKA 4EE9A 3ZSSA 5C70A 1VAHA 3W25A 2WKLA 5CPTA 4Q22A 4CVWA 3WUBA 1KWGA 2BXYA 3T09A 1ISWA 2X0YA 3OBAA 4KRTA 1W3HA 4TVDA 1WDRA 1YHTA 1MXGA 1E4MM 1OB0A 3RM8A 4J3SA 1US2A 1K9EA 2VUYA 4V27A 5I2UA 5IFTA 3KL5A 2PF0A 3MV11 5JIPA 2WMKA 4PTXA 5A8OA 4E8DA 3W6MA 4GI9A 3EDFA 3MUY1 2Z1KA 3D3AA 3VX1A 4P7NA 4XZWA 1QI2A 5IDIA 4U2YA 1WO2A 3SURA 3CUGA 4OIFA 2XJ7A 4MNJA 2V3EA 1OWQA 1JZ6A 5GNXA 1BPLB 2F2HA 2DT0A 4X9YA 1UQYA 4CUCA 1RD6A 4UFIA 4JKKA 1V6XA 3BSHA 4UQCA 3WF0A 2IXVA 4AZ6A 1UD6A 1JYVA 3IAPA 3U57A 1CGUA 1R7OA 3PTMA 3NSNA 1HN1A 1GOKA 3W81A 1UR4A 3BH4A 2V3FA 3VIFA 1VFOA 2E8ZA 3WNOA 2EPLX 3WQVA 1XRVA 3BLPX 4JFWA 4N42A 2G3JA 3L4ZA 5FL0A 1NWRA 2D3NA 4HMEA 2DT3A 2O9RA 1ZBVA 1G0CA 1V03A 1EGZA 3VVGA 1VJZA 1VEPA 3TONA 4OJYA 2CERA 4AZ7A 4ZEPA 4IM4A 2FDMA 4M8UA 1UH3A 2PWDA 4TUFA 2CBUA 3EDDA 5ABFB 3TA9A 4WIWA 4AZCB 1XCWA 1EO5A 3POHA 1OGSA 4GZJA 3SUUA 2YDRA 1XD0A 1G1YA 1EIBA 1MW2A 3AS3A 3VMPA 2ZX9A 3PZTA 4PMUA 3WQWA 3SCVA 2QV4A 3AMGA 3B9AA 2YLLA 5DEZA 1UG6A 3VIKA 4P8XA 2NT0A 3VO0A 2YA1A 4C7FA 4DUVA 4MTVA 4Z2HA 4LQ1A 4UQ9A 4PTWA 3QHMA 4P7RA 5M17A 5D9MA 4CN6A 4MB5A 1TA3B 2OYMA 4MNKA 4B3KA 3CTTA 4D72A 3W27A 4D6HA 1W1VA 2BV9A 5I23A 3F5LA 1MW0A 1MQQA 3ZSTA 2F8QA 1W2VA 1J18A 4FK9A 1KCLA 1NH6A 2XM2A 2J4GA 2D2OA 4A3YA 1LWHA 2X09A 5GPRA 1BFNA 3BSGA 1D7FA 3VIIA 5JBEA 5IHSA 2BHUA 2VC9A 4F9JA 2VZVA 3WMCA 4PMQA 3GXMA 2ZX8A 4GXPA 1XH1A 2XPKA 2JF6A 2J7GA 3MUIA 1V0KA 4U3AA 4BQ3A 1H4PA 2V3GA 2G3NA 4HA1A 2PWEA 5A6KA 2VURA 3VD7A 1GZJA 1UHVA 3GXFA 2ZE0A 5A2CA 2WNWA 1JZ8A 2GUYA 1M53A 4PN2A 1GONA 1E5JA 1U30A 1UD5A 2B31A 2GJXA 3BMWA 4YHEA 3ZJ8A 4WSJA 3GXDA 3NSXA 5AC5A 2BS9A 1PJ9A 2XYLA 4GKLA 5HNNA 1EQPA 1FP8A 2VZOA 2A3BA 1CZ1A 5IFPA 2E3ZA 3K46A 1F4HA 1I1WA 1HXJA 1W1YA 3II1A 3AIBA 1DWAM 1EO7A 3FNDA 3CHDA 1WB0A 1Z32X 3OLIA 2VQTA 1V6YA 4NZCA 1C8XA 3CUHA 3WQ4A 1CXFA 4URIA 1VFMA 1XV8A 2DPEA 2EPOA 4H2CA 2DSWA 2YDQA 4NRSA 3T0BA 3TTOA 1OGBA 3VX0A 1H0GA 4J3VA 1YQ2A 2VVSA 3I3DA 4U5KA 4D6EA 3ZM8A 1E15A 3POCA 1HJWA 1LLOA 4UQAA 1UWSA 1A47A 4F66A 2YA0A 2ZWYA 1QBBA 1CGYA 3NCOA 3WH9A 4D6JA 5EMYA 1AQHA 3UG3A 5IHRA 4C7DA 2VI0A 4AW7A 2WC4A 2ZX6A 2XIBA 1B30A 2BVYA 3CZKA 3CPUA 1NOWA 1E3XA 3AMDA 3PZIA 4D6CA 5JUVA 1VRXA 1TFVA 4TVCA 1BGAA 3O6AA 3PHAA 1JD9A 1XYZA 5E0CA 3VNYA 3WUFA 4TXEA 2F61A 1NP2A 2WK2A 4TVUA 4GO8A 5A3HA 3A4WA 1BG4A 1OD8A 1K6AA 3WF2A 5CG0A 2JF7A 1W9UA 1UD8A 1E71M 1PIGA 4N0RA 2W62A 1MYRA 1R7AA 2VNCA 1Q4NX 2BVDA 4R27A 1UZ4A 2X8RA 4JFSA 3SCRA 3F5JA 4CCEA 4M81A 2DH3A 2AAAA 3GZAA 1X1NA 2CBVA 1UKSA 4AEFA 1B31A 2BXZA 2TAAA 5CZKA 5AY7A 1CXIA 2BHYA 3ARUA 2MANA 4EANA 2X0HA 4JHOA 2J7CA 5BRQA 1IZKA 5I77A 2CITA 3I3BA 5E6ZA 4UCFA 3F5KA 1LL4A 4HZ7A 3LPFA 4AD2A 2XG9A 2W66A 3AHXA 3AS0A 5CGTA 2EQDA 1TE1A 3N1AA 4HZ6A 3AXXA 1TVPA 1G9HA 4DUWA 2IXUA 1W32A 4AZ5A 2WPGA 1LL7A 3WMSA 3K8LA 2WWCA 1UWTA 3SCSA 4ZXLA 4JL2A 3WMBA 4AWEA 2Q8XA 2X05A 4UQDA 1NWSA 1XCXA 2WVVA 2YA2A 3QHNA 1OIMA 4UOQA 3N18A 1C7SA 4WSKA 2ZUUA 1EHNA 1CEOA 2GJXB 3FAWA 2YKKA 3WH5A 4BF7A 3ARRA 4HOXA 1HX0A 5A6LA 3W28A 4ACYA 3FHAA 1UKOA 3LMYA 5ABGA 2WSPA 3W4RA 3CMGA 2EBNA 2QMJA 2VRKA 2YOCA 1E6ZA 4PBGA 1JXJA 1UWUA 4W7WA 1E5NA 1ITXA 4AD4A 3VMOA 1TMQA 1GVYA 4MJ4A 4AISA 2VCCA 2YIHA 2XFFA 3WD4A 3WDJA 1X6NA 3VGDA 3AFBA 1Q6FA 4W8LA 4JCMA 4ZE4A 3WF4A 3VGBA 1M04A 3KZSA 1V3IA 3WSUA 1QW8A 3SCQA 1UD4A 3GBDA 4AZIA 2CIPA 3VGGA 3WNKA 3ARSA 1US3A 3THDA 2BFGA 2OWXA 3CMJA 2PWHA 4K68A 1K9TA 1ISXA 3AISA 3RCNA 4PUDA 1CGWA 2OSYA 4PMNA 2YL8A 3DHPA 3AI0A 3WN6A 3GXIA 1JG9A 1B90A 5FOOA 5LA1A 1CNVA 3EDEA 2CETA 3NDYA 2J79A 3MUAA 3OIHA 3VILA 5CSYA 5M5DA 1QHPA 6TAAA 3RM4A 3IJ7A 2VCAA 4Z2GA 1Q6EA 1E6RA 1H5VA 4PMYA 2PBGA 1UKQA 3OA5A 1E6XM 2W91A 1E1FA 2NW0A 1W9BM 3NDZA 4D1IA 2XVGA 5HBFA 3VDAA 2WHMA 2WM0A 1J9YA 3B9DA 3PZVA 1E55A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5E9A A;  3MMW A;  4BCE A;  1AQM A;  1V3M A;  5LA2 A;  2VCB A;  3WDI A;  1IT0 A;  1ITC A;  2QLY A;  3W26 A;  3KE0 A;  3T0D A;  2J25 A;  5BYW A;  1ISY A;  3T2Q A;  3A4X A;  3VIM A;  3ARP A;  5JIW A;  1FFQ A;  4W8B A;  4MAD A;  3N9K A;  2DT1 A;  2WWD A;  2QF8 A;  3AIR A;  2ZWZ A;  1M03 A;  4PUE A;  3SCW A;  5E09 A;  5C8B B;  4AEE A;  1QHZ A;  1JDA A;  3CGT A;  1NM9 A;  2ZID A;  3UEQ A;  1PZ2 A;  5D9O A;  1H49 A;  3GNO A;  2NSX A;  4AZG A;  4QLJ A;  4ACZ A;  4WF7 A;  5A8P A;  3NSM A;  3GYC A;  5A6J A;  2WCG A;  2G8Z A;  3EYP A;  4PEE A;  2WMG A;  2D20 A;  1WCG A;  3T2O A;  2XFY A;  1DWJ M;  1QNO A;  2WZE A;  3TP4 A;  4HOW A;  4WK9 A;  1B2Y A;  4MB4 A;  2WC3 A;  2GK1 B;  2DQX A;  3B8S A;  3ARO A;  1GQJ A;  1CGV A;  3FAX A;  4FLO A;  2G3M A;  1E73 M;  3VDB A;  3M6D A;  2DGA A;  1JI2 A;  1MFU A;  2OWC A;  1V3L A;  3EDK A;  1HJS A;  2VO5 A;  4BA0 A;  3PBG A;  4IPL A;  1FOB A;  5EFF A;  1CBG A;  4W84 A;  4JL1 A;  1LJY A;  3AIV A;  5A2B A;  2ZUN A;  1OIF A;  3SCP A;  3L4V A;  1UD3 A;  3OGV A;  2BHZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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