5FOOA

6-phospho-beta-glucosidase
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
463
structure length
463
Chain Sequence
MLAFPKEFWWGGATSGPQSEGRFAKQHRNLFDYWYEEEPDLFYDYVGPDTASDAYHQIESDLTLLASLGHNSYRTSIQWTRLIDDFEQATINPDGLAYYNRVIDACLANGIRPVINLHHFDLPIALYQAYGGWESKHVVDLFVAFSKVCFEQFGDRVKDWFVHNEPMVVVEGSYLMQFHYPAIVDGKKAVQVAYNLALATAKVIQAYRRGPAELSDGRIGTILNLTPAYPASQSEADMAAAHFAELWNNDLFMEAAVHGKFPEELVAVLKKDGVLWQSTPEELALIAENRVDYLGLNFYHPKRVKAPDAIPVISPSWSPEWYYDPYLMPGHRMNVDKGWEIYPEAVYDIAIKMRDHYDNIPWFLSENGVGISGEDRYRDETGQIQDDYRIQFLKEHLTYLHKGIEAGSNCFGYHVWTPIDGWSWLNAYKNRYGLVENNIHTQVRRPKASAYWFKKVATHNRLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Chemoenzymatic Synthesis of 6-Phospho-Cyclophellitol as a Novel Probe of 6-Phospho-Beta-Glucosidases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pyogenes
molecule keywords 6-PHOSPHO-BETA-D GLYCOSIDASE
total genus 194
structure length 463
sequence length 463
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2015-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5fooA00
1G1YA 2VOTA 1Q6DA 3AXHA 3FXYA 3N11A 1IZJA 1JIBA 1SMDA 2V38A 3T2PA 4CD4A 2ESCA 2YLAA 2GSJA 4AIOA 4UFKA 2XSBA 2YDSA 1V0KA 4AZ6A 2ZX7A 2VZOA 2V5DA 1BF2A 3SCVA 1VFUA 3W0KA 4HU0A 1FH8A 3WNKA 2VVNA 1AVAA 2EPLX 4GI8A 4Z2IA 2YDQA 3W25A 4PEEA 1CLXA 4GI9A 5A3HA 1QI3A 1Q6GA 1MXGA 3BC9A 2FHBA 3OG2A 3RM8A 1VFFA 1JG9A 1MQQA 2JEQA 1E0XA 1HJXA 3F5JA 4N42A 3WQ8A 2XUCA 2VO5A 5D9PA 2VCCA 1ZBVA 4KRTA 4V2XA 4AW7A 1UKSA 2G3IA 1UD8A 2OSYA 2VURA 4J3XA 3AYSA 1B31A 4U31A 3N17A 1XH0A 1AQ0A 1UD6A 2EBNA 2ZUWA 3W82A 1W1VA 1KXVA 2J7BA 1NOUA 3MO4A 3VIPA 2RGLA 1CZ1A 2ZE0A 3VIJA 5A6BD 2WHLA 2VX6A 2JF6A 1C3FA 1MW0A 1XCXA 2IXVA 5CLTA 1TE1A 1B3XA 1YHTA 1ZB5A 3QHOA 3ZM8A 1G5AA 3CUHA 2QF8A 1GNXA 1US3A 1CXLA 3QOKA 1EA9C 4BQ4A 5ECUA 3VM7A 4HPHA 4MNJA 3POHA 2J62A 1LJYA 1W9BM 2VR4A 3FHQA 3WD4A 1L0PA 5DO8A 1Q6CA 1EGZA 4H41A 5CZKA 2XTKA 1BG9A 1C7TA 3WNNA 2DT0A 3WMBA 2OWCA 1B3ZA 2GUYA 4OJYA 3AIVA 4GZJA 3SUVA 4X9YA 2A3BA 3GNOA 3GBEA 1LWHA 4CN6A 4RE3A 1AQMA 1HXJA 1QW8A 2BVDA 3EDEA 3WNLA 2VRQA 2WMFA 1H11A 1UKOA 3HJEA 3CHEA 3L4YA 3G6LA 2XJ7A 3RILA 3AIWA 5I3DA 3ZT5A 3T2QA 2GDVA 1E71M 4P7NA 2ZXBA 3EYPA 1C8QA 4PTXA 2V3GA 3MMWA 3U5YA 5JBFA 1WDSA 2ZX5A 4FF5A 2X0YA 2WM0A 3WDQA 3ZO9A 2XFFA 2X09A 3CUIA 1GOKA 1GHSA 3II1A 4HP5A 3CZJA 4W7VA 3BAYA 1KGXA 1M04A 4AD0A 3BAXA 5TD4A 3ECQA 4PYSA 3T2OA 1JZ2A 1ODUA 3AMDA 1GORA 3LPOA 4HOXA 2CBVA 1OSEA 3KEHA 4PRWA 1MQPA 1JD7A 3CZGA 3PN8A 4J3SA 3VGBA 3TTOA 4W7WA 2CITA 4AC1X 3NDZA 3MU7A 4CUCA 1E55A 1J0KA 4PMYA 3B9DA 2Z1SA 4H8VA 2DT2A 1OD8A 3KWXA 1KR1A 2WC7A 3WUEA 2CPUA 3VIIA 2J74A 3IANA 1BFNA 3CZLA 1ZBKA 1W3LA 3PZIA 4E8CA 5JIWA 2JIWA 1KB3A 1U2YA 1XH1A 3UG5A 5IFTA 3VUPA 4Z2HA 4HMDA 3WD3A 1MFVA 1CGWA 1QI0A 1QHPA 2X1IA 3AMLA 2E4TA 3ZJ6A 4TVDA 4F9JA 4W85A 3ARXA 2ZXDA 4PTVA 4QCFA 4CN1A 5LA1A 4CD6A 3AMGA 1KXQA 2FGLA 2JF7A 3FN9A 3VIOA 5A1AA 4PMUA 2FHCA 1W1TA 3PZNA 3RIKA 3WH6A 1TVPA 3AIQA 1ZS2A 3OGVA 4PMZA 4NRRA 4UZUA 4W7UA 2WKGA 4QDMA 4XZWA 3VGEA 4CGTA 1JAEA 1NM9A 2ZX8A 3VGFA 1V6VA 5BXTA 4OBRA 3WSUA 2YOCA 1LL4A 1QOXA 2XVNA 4H7VA 1UG6A 2F61A 2FHFA 2G3NA 4HTYA 1E6PA 2WB5A 1UWRA 5EFDA 1GVIA 2CKSA 4X0VA 1C92A 4D6CA 3D5HA 4PTWA 3AS1A 3W53A 4UFLA 4GIAA 1UZ4A 2W92A 5HBFA 3DECA 4B15A 1W1YA 3CUJA 2Q8XA 1KQYA 5FL1A 4QLJA 4D6EA 1GQIA 5BYWA 2W4XA 1QPKA 2ZXAA 2PB1A 3OLEA 1JXKA 3RDKA 2WSKA 4ATDA 1HJVA 5LA0A 3ZMRA 2EJ1A 5IXEA 3MUIA 4P7LA 3WD1A 5ABEA 2D1ZA 5IHRA 1ISVA 4F8XA 5IFPA 4DUVA 3WQ6A 4Z2GA 4H2CA 2CBUA 4KRUA 5CPSA 1NWRA 1JGIA 5E0CA 4B3KA 4D6JA 1EQPA 2JE8A 1UR4A 1CECA 4ZXOA 4OOZA 4HA4A 4M24A 3B9AA 3HN3A 2JALA 2BY0A 2PBOA 4JFTA 3NSMA 4D72A 2XGIA 3N15A 1CGXA 4ZENA 2XYLA 3AHVA 2WBKA 4PCSA 3WEMA 3B8SA 1HF6A 1XV8A 4W88A 4D71A 1R7OA 2WW5A 2W5FA 1SYTA 4LXFA 1HJQA 2AMGA 3RMEA 1OIFA 1DWGM 1EHNA 1KCKA 2VZUA 4FLOA 1HJUA 1EXPA 2PWGA 2B31A 4IUGA 1W3KA 3PTQA 4AIUA 3BSHA 1NWUA 4MJ2A 2FH6A 3TTQA 4MPKA 4BZYA 1NOWA 4B9YA 1IV8A 3TP4A 3MV01 1V6UA 1QW9A 1UD4A 2E8ZA 1EHAA 1CENA 3WMCA 3EDKA 4GINA 2FGZA 1RP9A 1EDQA 2QMKA 4U2ZA 1LL7A 2O9RA 3VIFA 1M01A 1QHZA 3IJ8A 3RO8A 2CYGA 3ALGA 3T08A 1J01A 2GDUA 1XGZA 5A94A 3UEQA 2VRKA 2XWDA 1DWHM 4JL1A 1LF1A 2QPUA 2G41A 4JKMA 1F4AA 1HKKA 1E6NA 1LG1A 4UFMA 2BXYA 4OKDA 4Z2LA 1NWSA 3MSGA 3VIHA 1E4NA 2X05A 4U3CA 3E1F1 3MMUA 2J7GA 3QHNA 4TVUA 2GJRA 1KXHA 3PZGA 1V6WA 1JZ4A 1JXJA 2VX4A 1UA7A 3ARWA 4P7QA 4ACYA 2DQXA 3BAIA 4KWUA 4YN5A 3SCPA 1PZ3A 3SEPA 5ABFB 9CGTA 5GNYA 4JAWA 4B9ZA 1ISWA 4CKQA 1XD1A 1Z32X 5I23A 4WKFA 4UQEA 4W86A 3NUKA 4W8BA 2WCGA 4TTGA 4QLKA 5JIPA 3SUWA 1WZKA 4BQ5A 1TA3B 1L8NA 2BFGA 1GJWA 3VD7A 3CZEA 1LG2A 1OBAA 3VO0A 3FY1A 4M56A 4JHOA 2CETA 3WKZA 2OYKA 2W91A 1A3HA 2ZWZA 1BLIA 3OLIA 1K9DA 1PX3A 1K9EA 2DGAA 4UQDA 2OYLA 3GXDA 2D3NA 1NP0A 3AIBA 5DMYA 3LPGA 1UQYA 3AQUA 4Q7NA 4YHGA 1D2KA 1EOKA 5FOOA 4CD7A 2CNCA 3CIVA 2YL5A 1KGUA 5KEZA 3I3DA 1CNVA 1XCWA 3G6MA 4AZBA 3WF2A 1HJWA 1JD9A 4V27A 1RPKA 4MAZA 4CD8A 2YL6A 3OBAA 4GKLA 1GOQA 3THDA 1XYZA 5E09A 3L4WA 1DWFM 2D20A 1C8XA 3ZR6A 1OCQA 2J78A 3AZRA 1H3GA 3T0AA 2WKLA 3SURA 4UR9A 2OWWA 1FH9A 1ITXA 1H09A 3L4TA 5BCAA 1G9HA 3N18A 3VM5A 5ABFA 5FD0A 4V28A 3PZTA 3WIJA 2BVYA 4CU8A 3CLWA 3AYRA 1UD5A 4OBSA 4XUYA 2BVTA 2J8GA 4HZ8A 2O92A 5D9OA 3A4XA 3AS0A 8A3HA 3CZKA 3OIHA 1TA3A 3CO4A 4AD2A 1ZBCA 2BNJA 2EXOA 3BSGA 3WDRA 3S2CA 3ZT7A 1DP0A 2DH2A 2E40A 4MDOA 4JIEA 1ZU8A 4W89A 3ZOAA 4U33A 2WMIA 1E15A 3K4DA 1V0LA 1M7XA 1E6SM 5A6JA 1H41A 4U2YA 1J0ZA 1B9ZA 4AYSA 1WP6A 4CVUA 3GNPA 5I0DA 1CXKA 4LPCA 1JZ3A 4RE2A 1DTUA 3ARUA 3FHAA 2J4GA 1GVYA 4JHZA 4DWSB 1VIWA 1Q6EA 2TAAA 3CZ8A 3VD5A 2WWDA 3J7HA 3K8KA 4PMRA 1CXEA 3BAWA 1H5VA 1WKYA 4DWSD 3A3HA 4U5IA 1CXIA 2WZEA 4CD5A 1JFHA 3PZ9A 1E73M 1ZL1A 1W3HA 1GOOA 4EAMA 1OM0A 5CGTA 3QOMA 4JZ5A 2V3FA 3WQ5A 2DSUA 1KQZA 3MSDA 2WC3A 3AZSA 1W9UA 4WLCA 3ZSSA 3KL0A 1CWYA 1VRXA 1VEMA 3VDCA 2EEXA 4F9DA 1W1PA 1E4IA 3MUY1 2C8NA 2BY2A 2WLZA 1Y7VA 3APGA 3SCWA 3W38A 4P7RA 1E3XA 4AD3A 4UOJA 2CHNA 4C7FA 1KGWA 1KFWA 5A8OA 4PMOA 3CHCA 4S3KA 3W28A 3UETA 5EBAA 4IM4A 1D7FA 3MUZ1 2J7EA 4JKLA 2WXDM 5BXPA 5A8PA 4AMCA 3RM4A 2EQDA 4AZCA 1HN1A 2QPSA 1OINA 1GW1A 1SMAA 1CXFA 3MMDA 3VPLA 4DM1A 1JNDA 3NJ3A 4AD5A 1E1FA 1XYFA 1OIMA 3M46A 1UWTA 3AS2A 4UFJA 5FL0A 1OT1A 4J7RA 2UWFA 1LQ0A 4HA3A 2BS9A 4DWSA 4M8UA 4D1JA 2ZUSA 2XVPA 1OWQA 2UY4A 2O9OA 4E2OA 1ISXA 1V02E 3HU7A 2W63A 1XD0A 5M3WA 4M1RA 1O6IA 3VDBA 1RP8A 1AQHA 3GTNA 1WZMA 1I1WA 2OWXA 4MNLA 3VMNA 3NSXA 4AIEA 4IISA 1UA3A 1J12A 4NRSA 2VC9A 2Z1KA 1FP8A 4D6DA 1ESWA 3MANA 2WC4A 5D9NA 2VX7A 1GQKA 1V3IA 3WENA 1UR0A 2JFEX 2VMFA 1W91A 2J7FA 2O9TA 4NSBA 4X0NA 3WDJA 3BAJA 1G0CA 3WUGA 6CGTA 2MANA 1QBBA 2IUZA 3W26A 4HMEA 1E70M 1MVYA 2Y5EA 5ABHA 5GNZA 3BCFA 3MKKA 3GZAA 4J3WA 1QNPA 4OIFA 1IZKA 3AHZA 3QGVA 4AZ7A 1JYNA 3A47A 5D8WA 3NIYA 1U30A 3SUSA 5CJ5A 3BAKA 3WQWA 1UHVA 3F4VA 4S3JA 1J9YA 1GCYA 5CPQA 4AEFA 1GOIA 3IK2A 2E9BA 3DHUA 4YPJA 4HOWA 2YBTA 1E4MM 2D0FA 4TTUA 3JUGA 4P8WA 2XSAA 1TCMA 2J79A 3BGAA 1RH9A 1E0WA 4UCFA 1TFVA 3WUFA 1MQRA 1UUQA 2YIHA 2ZUMA 4UQAA 1XRVA 4AISA 1GOMA 1X1NA 3AXXA 3EDDA 1EDGA 1XC6A 3VTRA 5LYRA 2WHKA 3EMCA 1PIFA 2ZICA 5I24A 5C71A 4WJXA 5BXRA 1HKIA 1BVNP 1WDRA 1BSIA 1W2PA 4ZFMA 3WMSA 1JFXA 4ZE5A 4BS0A 1M03A 2A3EA 5IHSA 2VNCA 4A3YA 1MFUA 1GJUA 1PAMA 3PTKA 4HZ7A 2CBJA 1OT2A 3L4XA 2BXZA 4QAWA 2GK1B 3RPMA 1TG7A 2J8FA 1V03A 2VZSA 5JUVA 1V3MA 1C91A 2PWEA 2J7DA 3L2MA 1VF8A 3GNRA 3OB8A 3AMKA 1PZ2A 2WVVA 1CGVA 1W9XA 5A95A 5EB8A 3VDHA 1V3HA 5A8NA 2CIPA 1W9DM 1QNOA 1PPIA 1X6LA 1E72M 2DDXA 1UKPA 4PMNA 2WWCA 2YDRA 2WYSA 2GJPA 4OZOA 5A6KA 4U3AA 3POCA 1LL6A 1E9LA 1GQJA 1UOKA 2CKRA 4EANA 1VENA 2CHOA 4PMDA 4TOQA 2WVTA 1JZ5A 2VL4A 2YKKA 4MB3A 4JFUA 1CGTA 4UNIA 3WD0A 2RGMA 3ARRA 2EO7A 1P6WA 4ZXLA 3SIMA 5AC5A 2ZXQA 1I75A 2ZIDA 3A4WA 3WN6A 3SUUA 3KL5A 3PZMA 1E5NA 4A3HA 5CXPA 4Z2KA 2D3LA 5E9AA 3M6DA 5I78A 4TXEA 3BCDA 3W6MA 1XHGA 4D6HA 4F66A 1BTCA 2WHJA 1FFQA 4UQCA 6A3HA 4HPGA 4LYQA 3CUGA 3GDBA 3VINA 3AHTA 4HZ6A 1V0NA 4EK7A 2FDMA 4GQQA 3AIRA 3OLGA 3RCNA 2AAAA 4LX4A 3VGDA 3WH8A 3CBWA 2GK1A 7A3HA 2HVMA 1W3JA 2PBGA 1JI1A 3OLDA 5A6SA 1XSKA 2E9MA 3N13A 4AZHA 3FAWA 1ECEA 4H8UA 1B90A 2BHZA 2DT3A 1DEDA 3VIKA 4NI3A 4J3TA 3FW6A 1UR2A 2AOSA 2WBGA 3T0DA 2C0HA 4E8DA 5GNXA 3N04A 5HPCA 4CN4A 3MS8A 1KBBA 2EPKX 1BYBA 4QFUA 2J7CA 1JL8A 4R5EA 2XM2A 4WSJA 3PZUA 3VU2A 1CGUA 1V3KA 3W4RA 1UH2A 3ARZA 1XSIA 1AMYA 4C7GA 4AWEA 4XV0A 4M81A 3WF3A 4PMVA 4XB3A 2VTFA 1QNRA 3WNPA 3O2LA 4OOUA 4J28A 1J11A 1VEOA 3ZT6A 5HXMA 1U33A 4UOQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1G1Y A;  2VOT A;  1Q6D A;  3AXH A;  3FXY A;  3N11 A;  1IZJ A;  1JIB A;  1SMD A;  2V38 A;  3T2P A;  4CD4 A;  2ESC A;  2YLA A;  2GSJ A;  4AIO A;  4UFK A;  2XSB A;  2YDS A;  1V0K A;  4AZ6 A;  2ZX7 A;  2VZO A;  2V5D A;  1BF2 A;  3SCV A;  1VFU A;  3W0K A;  4HU0 A;  1FH8 A;  3WNK A;  2VVN A;  1AVA A;  2EPL X;  4GI8 A;  4Z2I A;  2YDQ A;  3W25 A;  4PEE A;  1CLX A;  4GI9 A;  5A3H A;  1QI3 A;  1Q6G A;  1MXG A;  3BC9 A;  2FHB A;  3OG2 A;  3RM8 A;  1VFF A;  1JG9 A;  1MQQ A;  2JEQ A;  1E0X A;  1HJX A;  3F5J A;  4N42 A;  3WQ8 A;  2XUC A;  2VO5 A;  5D9P A;  2VCC A;  1ZBV A;  4KRT A;  4V2X A;  4AW7 A;  1UKS A;  2G3I A;  1UD8 A;  2OSY A;  2VUR A;  4J3X A;  3AYS A;  1B31 A;  4U31 A;  3N17 A;  1XH0 A;  1AQ0 A;  1UD6 A;  2EBN A;  2ZUW A;  3W82 A;  1W1V A;  1KXV A;  2J7B A;  1NOU A;  3MO4 A;  3VIP A;  2RGL A;  1CZ1 A;  2ZE0 A;  3VIJ A;  5A6B D;  2WHL A;  2VX6 A;  2JF6 A;  1C3F A;  1MW0 A;  1XCX A;  2IXV A;  5CLT A;  1TE1 A;  1B3X A;  1YHT A;  1ZB5 A;  3QHO A;  3ZM8 A;  1G5A A;  3CUH A;  2QF8 A;  1GNX A;  1US3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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