5FOOA

6-phospho-beta-glucosidase
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
463
structure length
463
Chain Sequence
MLAFPKEFWWGGATSGPQSEGRFAKQHRNLFDYWYEEEPDLFYDYVGPDTASDAYHQIESDLTLLASLGHNSYRTSIQWTRLIDDFEQATINPDGLAYYNRVIDACLANGIRPVINLHHFDLPIALYQAYGGWESKHVVDLFVAFSKVCFEQFGDRVKDWFVHNEPMVVVEGSYLMQFHYPAIVDGKKAVQVAYNLALATAKVIQAYRRGPAELSDGRIGTILNLTPAYPASQSEADMAAAHFAELWNNDLFMEAAVHGKFPEELVAVLKKDGVLWQSTPEELALIAENRVDYLGLNFYHPKRVKAPDAIPVISPSWSPEWYYDPYLMPGHRMNVDKGWEIYPEAVYDIAIKMRDHYDNIPWFLSENGVGISGEDRYRDETGQIQDDYRIQFLKEHLTYLHKGIEAGSNCFGYHVWTPIDGWSWLNAYKNRYGLVENNIHTQVRRPKASAYWFKKVATHNRLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords 6-PHOSPHO-BETA-D GLYCOSIDASE
publication title Chemoenzymatic Synthesis of 6-Phospho-Cyclophellitol as a Novel Probe of 6-Phospho-Beta-Glucosidases.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pyogenes
total genus 194
structure length 463
sequence length 463
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2015-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5fooA00
3SCPA 4AZIA 4U3AA 3AIEA 3CHFA 3SCRA 1V0MA 3DYPA 4CU6A 3AFBA 1JIBA 2BXYA 3QGVA 4UFMA 1XCXA 5E0CA 5LA0A 3NIYA 1EXPA 4F66A 1M01A 5I77A 2JIEA 3NSMA 2PWGA 4XUYA 4W85A 4GQQA 1ZB5A 4JIEA 1LJYA 2JE8A 1PZ3A 1M03A 1UR1A 1W32A 1KR0A 3POCA 2DSVA 4CCDA 2OSXA 1JI1A 3UG5A 4MB3A 1JF6A 4PBGA 2XVKA 2WC3A 5LA2A 2VTFA 2VC9A 2VT0A 3AXHA 4AZHA 1E1FA 3GNRA 3RJXA 3AS0A 3FXYA 2WZHA 1LF1A 2D3LA 2A3AA 5D4YA 3T08A 3MUY1 3J7HA 3AIQA 3K8KA 1Q6DA 4DUVA 3SUWA 3VIKA 3NDYA 3VGGA 1XC6A 2Z1KA 1J18A 3POHA 1W2PA 3W81A 2UY3A 3OGSA 3SUTA 3WQ6A 5FD0A 2F2HA 4CU7A 5ABFA 2F61A 3AMKA 2BS9A 1M04A 1ECEA 1JZ5A 3VD4A 1B9ZA 3EMZA 3VD5A 1GCYA 2VX5A 3HU7A 1WNOA 1ISXA 2GDVA 3JUGA 4HOXA 2VR4A 4OUEA 5FL1A 1QNSA 3CZEA 5CLWA 3VDBA 3GBEA 4W8BA 2ZX5A 1JNEA 2GK1A 1E4LA 1GOKA 2JIWA 4DWSA 4QLLA 4BA0A 4LYRA 1G1YA 3PZ9A 3B9EA 3QOKA 2XFRA 1CXKA 3VUPA 1CGWA 4PMVA 2DEPA 1UWTA 8A3HA 5E70A 1GPFA 3PZIA 1EO7A 4EK7A 4M1RA 3CMGA 3AJ7A 1J9YA 1PZ2A 4RE3A 3W37A 2V3FA 3WBEA 1JFXA 2ZXQA 2EEXA 3MUAA 2YA0A 4GQRA 1RP9A 3T0AA 1M7XA 2ZUTA 3OA5A 1OIFA 3QR3A 3MKKA 5GQBA 1I75A 5BXPA 1K6AA 4MB1A 2QLYA 5CLTA 4M24A 1XV8A 2EPOA 2XSAA 2VO5A 2J77A 2OWCA 3K4DA 1C7TA 2Y5EA 2YKKA 2GJRA 4Q7NA 1WDSA 2EJ1A 1NARA 2WANA 4KMQA 3AIWA 1DWGM 3VIIA 1JXKA 1LL6A 1Q6EA 1V3JA 4QLKA 2V38A 3ARQA 4EKJA 1FFQA 1MW3A 1EIBA 1MQPA 4NRSA 5FKYA 4W8LA 1V0LA 5DEZA 1V3KA 4AZGA 2DSWA 1JZ3A 5CPQA 1VB9A 4MJ2A 1D3CA 2VMFA 3SCSA 1DP0A 2WK2A 1CGUA 3AS3A 1XGZA 4WSKA 1J0IA 1LWJA 3PN8A 2WMIB 4IPNB 2QF8A 4PUDA 5D8ZA 3ECQA 3RCNA 1C92A 4UQ9A 3GXFA 5GNYA 3ZT5A 3CHDA 2CBVA 3VGBA 4E2OA 3TTQA 3VGDA 2W63A 5A8NA 2VZTA 4AIEA 3NSXA 4JFTA 4PMXA 2E3ZA 4JAWA 5I3DA 1SFSA 1CECA 1CNVA 5C71A 4JL2A 1V03A 2PWEA 3W28A 3EBVA 4HA3A 4HMEA 1HN1A 1A3HA 1D7FA 3WQVA 3ARPA 3LPFA 4Z2GA 4KWUA 4D1JA 1QW8A 1ODZA 5CJ5A 1AMYA 1BTCA 4MTVA 4U5IA 1X1NA 1E72M 2HISA 4H8UA 3U5UA 7CGTA 3W24A 2E4TA 1R87A 4AZ5A 2ZUVA 1NWUA 1V6UA 3WY1A 2CHNA 4QLJA 2VCAA 2XWDA 3ZOAA 2EPLX 1DWAM 3U7VA 4FLQA 4BF7A 3VVGA 1Q4NX 4X9YA 4AD3A 4MJ4A 1OGSA 2WHKA 3BLPX 4JFUA 3ARWA 1E0XA 3ALFA 4R5EA 3ZJKA 1MW1A 3BAWA 2BFGA 1UH2A 1QI5A 5BCAA 4W7UA 3SCOA 2DSKA 2D23A 4XX6A 3VX0A 3AHXA 5IFPA 3W6MA 3TOPA 4AYSA 1PJ9A 3AXXA 4LYQA 4Q22A 6A3HA 4BQ2A 1MQRA 1G94A 3SCTA 1E6PA 2RGLA 2Y8KA 1DTUA 3ARXA 2WMKA 3OGRA 1F4HA 3AISA 5C70A 1MFUA 4W7VA 2XM1A 2WVTA 3F4VA 4HPHA 1J0KA 3D5HA 7A3HA 1JL8A 3CBWA 1UR9A 2DIEA 4LYPA 1NOUA 3AXIA 4TOQA 2DT3A 4PMQA 4ZE5A 1VEMA 1NWSA 4GZIA 1GOMA 1VFUA 1C8QA 1WZKA 1Q6CA 2D24A 5A1AA 3VD3A 1VJZA 1VRXA 1O6IA 3VKKA 1CYGA 1WKYA 3L4UA 1UD5A 2OYLA 3FW6A 1HT6A 4PMRA 1E56A 5IFTA 2FH6A 1XSIA 1E4MM 4J3SA 4ATDA 5CQ1A 4PMDA 5I23A 2CKSA 3GM8A 2V3EA 3ARZA 2XYLA 3N04A 1PX8A 4Z2LA 4UCFA 4KRUA 4FMVA 2IUZA 1B3VA 3WENA 1UG6A 3CTTA 3MO4A 3VM5A 1BQCA 1TVNA 4J3WA 4CVUA 1JG9A 1IZKA 5A2AA 1E3ZA 5HOSA 3ARYA 3VD9A 1OCQA 2YLLA 1FH8A 1R85A 2DPEA 1UD8A 4TX6A 1G5AA 2EO7A 2XSBA 1W3KA 3RILA 4XZWA 1KQZA 5IDIA 2XVGA 2YOCA 3PZTA 1W3LA 3VTRA 2YA1A 4D6DA 1AQHA 3AIRA 1ISYA 3DECA 4ACZA 5FIPA 4CD4A 3ZSSA 3CUFA 4D6EA 3WQ4A 2DH2A 1J0HA 3UCQA 1EA9C 3BH4A 4W7WA 1CBGA 3A4WA 1GVYA 2RGMA 3PZUA 1JI2A 2EBNA 1KR1A 3LPGA 3WQ8A 5JBDA 4TVUA 4HP5A 2JEPA 5M03A 3SCVA 2XGBA 1CXFA 2CPUA 4YN5A 4LQ1A 1NP2A 1H0GA 4D6FA 2BVDA 4BZYA 3CZGA 1QBAA 4W93A 4XZBA 1HX0A 3CMJA 1J01A 2J8FA 1HKIA 3WL0A 5C8BB 1HKMA 1JYVA 1OINA 2X0YA 1E43A 4AZ7A 1WCGA 3E1F1 1PX3A 1LL7A 1GJUA 2A3CA 3RM4A 2IXUA 4RE4A 2WBKA 1V08A 2XG9A 3WIJA 1E6RA 1S46A 3BXWA 4IPLA 3FNDA 3AYSA 1PX4A 1UUQA 5GPRA 4JHZA 1CZ1A 5D8WA 2WVSA 1EOKA 4J28A 2WC4A 1XD1A 1R86A 4PCSA 3ZJ7A 1XH0A 1JD7A 4S3KA 2YIHA 3W53A 5CGMA 1WE5A 2VVNA 2BHZA 4QAWA 1QOXA 5ABGA 1K9EA 1C91A 4P7RA 1QHZA 4JFSA 4OOZA 4HPGA 3TTSA 1F4AA 2EPNA 3K46A 1W9XA 1E6ZA 1M53A 3VD7A 3WD2A 3M07A 3ZIZA 3HJEA 4DUXA 3WUGA 2WCAA 4RE2A 5CXPA 3WFZA 3RIKA 1C90A 4CD7A 1V3LA 3MMWA 3WSUA 2BY2A 3W25A 1CGVA 1H1NA 2F8QA 2YL6A 2E9LA 3L2LA 1LG1A 2UY2A 3WQ5A 3KWXA 1UD3A 3CUHA 4M81A 3HN3A 8CGTA 3IJ8A 3EMQA 3OGVA 5HPOA 5E6YA 1BFNA 1BG9A 1OT1A 2ZICA 2BHUA 4CD5A 2AMGA 3RO8A 3EDKA 5FL0A 1B3YA 5DFAA 2X8RA 4Z2KA 4UZUA 1H49A 3ARUA 3SUVA 3O6AA 1UD6A 2UWFA 3WH6A 4UFIA 2XIBA 4PTMA 1CENA 1SMAA 4CN1A 1D2KA 4HOWA 4MAZA 2YBUA 1GOWA 2YL8A 2BXZA 5AYBA 1BYBA 4R27A 1HJQA 2W92A 1TA3A 6CGTA 3UEQA 1WP6A 4UFKA 1V0NA 2BVYA 1JXJA 3BSGA 2VX7A 4K68A 4GO9A 3ZM8A 1CGYA 3MUZ1 4CU8A 4P7QA 1VFOA 1NOWA 1OWQA 3FHQA 3DYOA 1KCKA 3WUEA 3OG2A 1IV8A 5D9NA 1FP9A 3S6TA 1MXDA 1BF2A 1J0ZA 4HZ8A 2WVUA 1W1VA 5EFDA 2ZXAA 6TAAA 2XJ7A 5EFFA 1V3HA 3CPUA 2VX4A 5D9PA 1CLVA 2CBIA 4KGLA 1JZ4A 4UQDA 1CXIA 3DC0A 4IUGA 3AI0A 2D3NA 1W9UA 3AHZA 4P7OA 4H41A 3WD1A 1OB0A 2NSXA 4C7GA 1KXHA 2BHYA 3D3AA 1N82A 2QMKA 4BCEA 5BXTA 3PZNA 1XD0A 1UR0A 1JD9A 1GVIA 4OJYA 2CCRA 2BV9A 3QHOA 4URIA 1NP0A 3QHMA 4UTFA 2FHBA 3ARTA 2VZSA 5KZ6A 2BNJA 4ZENA 4HU8A 1H41A 4DWSD 2O92A 1CIUA 3WD3A 1OSEA 4ATLA 1UA3A 3LPPA 3WQWA 1Z32X 4CD6A 3OLIA 4AIOA 1XSKA 2ESCA 2E8ZA 3IK2A 3W38A 2W5FA 3WH7A 3FAWA 2A3EA 1E40A 3BAYA 2VZOA 5BRPA 1KGWA 1R8LA 4B15A 1E6XM 2WWDA 7TAAA 5A6MA 1G01A 5DF0A 3VNZA 1EQCA 1XYFA 3PZQA 3A4AA 4LXFA 1OBAA 2D2OA 1UOKA 1QI3A 1VF8A 3N1AA 1E71M 3QHNA 5LYRA 1AVAA 1XRVA 4D6IA 4UQEA 3SCNA 1JYXA 3ZT7A 4H04A 1UD2A 4AY1A 4CN4A 3MS8A 3BCDA 4HOZA 3U5YA 1HKKA 4XV0A 2YBTA 3OBAA 1C8XA 1SMDA 2CESA 4Z2JA 3NUKA 3CO4A 1VAHA 1B30A 2VQTA 2C7FA 4A3HA 3W4RA 5CSYA 1J12A 2J7DA 1GQJA 1MVYA 3A47A 3W26A 1P6WA 3M6DA 1ZJAA 5AY7A 4PRWA 2WYSA 3N17A 1QNPA 1K9DA 1JAEA 5A2BA 3W0KA 2J74A 2QPUA 2WHMA 2BY0A 3BLKA 2YLAA 1QHOA 2WVVB 4H7VA 1CDGA 3WUBA 3WF4A 4M8UA 4AMCA 1VENA 3O2LA 3WEOA 4PSPA 1NWTA 1SR0A 1G9HA 2E40A 1FOBA 1BG4A 4IM4A 3OLEA 2WLZA 1NH6A 4PTVA 2Y8VA 3MV11 3VIMA 1U30A 3N12A 4V27A 4U5KA 4B16A 3SEPA 4L4OA 4J27A 1HJSA 1QVBA 1LL4A 4UOQA 1BVNP 4JCMA 1WZAA 2J7CA 4CCCA 5BXRA 5I24A 1JDAA 1BGAA 1GOIA 1HP4A 5CSUA 4PEEA 3WF3A 3U7BA 2WMGA 4F8XA 3UETA 4GI9A 1PEZA 1HKJA 2J62A 2G3IA 2C0HA 1EDQA 1HNYA 3KL3A 4F79A 1QBBA 3IANA 4AD5A 2WBGA 1W9DM 1WDRA 2XM2A 1H3GA 4GO8A 4Z2IA 1KWGA 2D0HA 3FY1A 4D6HA 3VDHA 4F9DA 1CLXA 4UQCA 3CIVA 3VIJA 2ZXDA 1GONA 5BROA 1ITCA 5DT5A 3GZAA 1LLOA 1B1YA 3ARVA 4KRTA 4TXEA 4W5UA 4LPCA 1B90A 3VDAA 4B3KA 1L0PA 3GTNA 3L4TA 1JZ7A 1EGZA 1MWOA 2CBUA 3M46A 1FH7A 2G3JA 3VIOA 1HF6A 1W1YA 5DT7A 1JNDA 3OLDA 1R7AA 2YA2A 4J7RA 2PF0A 4QFUA 1HJXA 1V6XA 1X6NA 1JYNA 2OWWA 2W66A 4OIFA 5A6BA 5A2CA 3LMYA 3WNOA 3OZOA 1EDGA 1V02A 3AROA 4GI6A 4EANA 4JCLA 3VIGA 4W88A 3PTKA 1UWQA 1UKTA 3AICA 3W29A 2WM0A 3L4VA 3K4AA 1PBGA 4H2CA 4ZE4A 3WDHA 2YL5A 1KBKA 4C7DA 2WMIA 4AWEA 4M82A 3GH4A 1CGXA 3ZMRA 1H11A 4M56A 4EE9A 1W1TA 4ZXLA 4WKFA 1GJWA 5FOOA 1QW9A 2Z1SA 4XB3A 4HTYA 3WDPP 3SURA 1JZ2A 4GZEA 5HXMA 3CZJA 2XVPA 4W86A 2FGLA 3WUFA 4PCTA 4P8XA 1H4PA 4M29A 3AIUA 2D20A 2X0HA 5M17A 5JIWA 1OIMA 1MQQA 3NDZA 1UKOA 4V28A 2GSJA 3VNYA 3CLWA 3CZLA 1FFRA 1HJVA 5EBAA 1GHSA 4WJXA 2ZUWA 4PUEA 4CKQA 2AOSA 3L2MA 4PMZA 1LQ0A 2O9PA 2EXOA 2V5DA 3WFLA 4MNJA 2VVSA 5HPCA 3PZGA 1JF5A 1E0VA 2VCCA 2GDUA 1J0YA 1UHVA 3LPOA 3WD0A 4MNLA 3ARRA 2JFEX 5JBFA 5HDRA 3WEMA 4HMDA 3K8LA 2VUYA 1TMQA 2G41A 3F5LA 4GKLA 2ZX6A 1JDDA 1UR8A 4QP0A 3ZJ8A 3MMDA 3AOFA 4AIUA 4H8VA 2JF6A 5CG0A 3BGAA 3OIHA 1VFMA 3AMDA 4EAMA 5JBEA 2VQUA 1OGBA 5I2UA 1XSJA 3VMNA 1QPKA 1WZMA 1HXJA 2WC7A 1CTNA 3KL0A 4ZEPA 1DWJM 1OT2A 1EOMA 3B9DA 2E8YA 1LWHA 1JFHA 4WKHA 2J7HA 2GJXB 1J10A 2XGIA 3UR8A 2PWDA 1U33A 5A6KA 4V2XA 3BSHA 3ZR5A 1E4IA 1V6YA 5KEZA 4OKDA 2J7EA 1E6NA 2FH8A 4J3TA 2WMFA 4YHEA 4PTXA 2DH3A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3SCP A;  4AZI A;  4U3A A;  3AIE A;  3CHF A;  3SCR A;  1V0M A;  3DYP A;  4CU6 A;  3AFB A;  1JIB A;  2BXY A;  3QGV A;  4UFM A;  1XCX A;  5E0C A;  5LA0 A;  3NIY A;  1EXP A;  4F66 A;  1M01 A;  5I77 A;  2JIE A;  3NSM A;  2PWG A;  4XUY A;  4W85 A;  4GQQ A;  1ZB5 A;  4JIE A;  1LJY A;  2JE8 A;  1PZ3 A;  1M03 A;  1UR1 A;  1W32 A;  1KR0 A;  3POC A;  2DSV A;  4CCD A;  2OSX A;  1JI1 A;  3UG5 A;  4MB3 A;  1JF6 A;  4PBG A;  2XVK A;  2WC3 A;  5LA2 A;  2VTF A;  2VC9 A;  2VT0 A;  3AXH A;  4AZH A;  1E1F A;  3GNR A;  3RJX A;  3AS0 A;  3FXY A;  2WZH A;  1LF1 A;  2D3L A;  2A3A A;  5D4Y A;  3T08 A;  3MUY 1;  3J7H A;  3AIQ A;  3K8K A;  1Q6D A;  4DUV A;  3SUW A;  3VIK A;  3NDY A;  3VGG A;  1XC6 A;  2Z1K A;  1J18 A;  3POH A;  1W2P A;  3W81 A;  2UY3 A;  3OGS A;  3SUT A;  3WQ6 A;  5FD0 A;  2F2H A;  4CU7 A;  5ABF A;  2F61 A;  3AMK A;  2BS9 A;  1M04 A;  1ECE A;  1JZ5 A;  3VD4 A;  1B9Z A;  3EMZ A;  3VD5 A;  1GCY A;  2VX5 A;  3HU7 A;  1WNO A;  1ISX A;  2GDV A;  3JUG A;  4HOX A;  2VR4 A;  4OUE A;  5FL1 A;  1QNS A;  3CZE A; 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 1G5A A;  2EO7 A;  2XSB A;  1W3K A;  3RIL A;  4XZW A;  1KQZ A;  5IDI A;  2XVG A;  2YOC A;  3PZT A;  1W3L A;  3VTR A;  2YA1 A;  4D6D A;  1AQH A;  3AIR A;  1ISY A;  3DEC A;  4ACZ A;  5FIP A;  4CD4 A;  3ZSS A;  3CUF A;  4D6E A;  3WQ4 A;  2DH2 A;  1J0H A;  3UCQ A;  1EA9 C;  3BH4 A;  4W7W A;  1CBG A;  3A4W A;  1GVY A;  2RGM A;  3PZU A;  1JI2 A;  2EBN A;  1KR1 A;  3LPG A;  3WQ8 A;  5JBD A;  4TVU A;  4HP5 A;  2JEP A;  5M03 A;  3SCV A;  2XGB A;  1CXF A;  2CPU A;  4YN5 A;  4LQ1 A;  1NP2 A;  1H0G A;  4D6F A;  2BVD A;  4BZY A;  3CZG A;  1QBA A;  4W93 A;  4XZB A;  1HX0 A;  3CMJ A;  1J01 A;  2J8F A;  1HKI A;  3WL0 A;  5C8B B;  1HKM A;  1JYV A;  1OIN A;  2X0Y A;  1E43 A;  4AZ7 A;  1WCG A;  3E1F 1;  1PX3 A;  1LL7 A;  1GJU A;  2A3C A;  3RM4 A;  2IXU A;  4RE4 A;  2WBK A;  1V08 A;  2XG9 A;  3WIJ A;  1E6R A;  1S46 A;  3BXW A;  4IPL A;  3FND A;  3AYS A;  1PX4 A;  1UUQ A;  5GPR A;  4JHZ A;  1CZ1 A;  5D8W A;  2WVS A;  1EOK A;  4J28 A;  2WC4 A;  1XD1 A;  1R86 A;  4PCS A;  3ZJ7 A;  1XH0 A;  1JD7 A;  4S3K A;  2YIH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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