5GNXA

The e171q mutant structure of bgl6
Total Genus 175
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
175
sequence length
451
structure length
451
Chain Sequence
TARSYRFPEGFLWGAATAAYQIEGSSMADGAGESIWDRFSHTPGNMKDGDTGDVACDHYNRWREDIELMKRLNLQAYRFSVSWSRVIPQGRGAINPKGLAFYDRLVDGLLEAGIEPLATLYHWDLPAALDDRGGWLNPDIADWFADYGQVLFEKFKGRVKTWGTINQPWVIVDGGYLHGALAPGHRSAYEAVIAGHNVLRAHGAAVRRFREVGEGQIGIVLNIEPKYPASDKPEDEAARRRAEAQMNRWFLDPLMGRGYPEELTDVYGAAWREFPKEDFELIAEPTDWMGLNWYTRAVPENAPDAWPTRSRPVRQTQHAHTETGWEVYPPALTDTLVWLSEQTGGKLPLMVTENGSAWYDPPHAIDGRIHDPMRVHYLQTHIKALHDAIGKGVDLRGYMAWSLLDNLEWSLGYSKRFGIVHVNFATQERTIKDSGLLYAEVIKTHGDVLNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Structures of a glucose-tolerant beta-glucosidase provide insights into its mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Metagenome
total genus 175
structure length 451
sequence length 451
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2016-07-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5gnxA00
4PMDA 3SUWA 2VO5A 2CXGA 1GONA 1UR4A 3TOPA 1JXKA 1UQZA 1FFQA 3VDBA 3D3AA 3RJYA 4U5KA 4LPCA 4Z2IA 1O7AA 1D3CA 3WQ8A 3QHNA 4S3KA 1FHDA 4CCCA 1GPFA 1E5JA 4QCEA 1R87A 1J01A 7CGTA 2WCGA 3L4VA 5D9NA 5AC4A 4JL2A 4MB1A 2BXYA 5D9MA 5HPOA 2WWCA 1VFMA 1Q6CA 1CXIA 4AW7A 1J0ZA 4XB3A 2UY5A 4JFTA 2AOSA 1JYNA 4WKFA 2VX4A 1BF2A 5DT5A 4NZCA 1CGWA 4X0NA 1XRVA 2DQXA 5A6SA 3MUY1 4P7RA 3II1A 3ARUA 1RP8A 1CEOA 4OOZA 2EBNA 1Q4NX 2YLAA 1JZ3A 2DSZA 3GH7A 3OLIA 2V3EA 1JFXA 2WCSA 5LA2A 3WY1A 1UWUA 1G0CA 5JIPA 4J27A 1QI2A 3CZKA 3L4ZA 5BXSA 2F2HA 1EQPA 1OWQA 2VX5A 3RM4A 2NW0A 3VMNA 4C7DA 3EDFA 1CBGA 2D23A 3VILA 3BSGA 4GZIA 5ABFB 3CZ8A 3AMKA 4AZCB 1QNPA 1DWJM 2XGBA 5A6BA 3WFZA 1C7SA 1UKQA 7A3HA 3T0DA 4JIEA 3VGFA 2YA2A 2VT0A 1TFVA 2JE8A 4DWSB 5I0DA 3RM9A 4P7LA 2Y8VA 4LYRA 2UY3A 4NI3A 1MWOA 1X1NA 3BXWA 1C7TA 4W8AA 1QI5A 1E5NA 5ABHA 1C91A 3PZOA 1A3HA 1TMQA 5CXPA 3APGA 3W38A 1BAGA 1G94A 3O9NA 3F5JA 4UZUA 2WPGA 2X09A 1NWSA 2XIBA 1VFFA 3GTNA 4LYQA 2CIPA 1CDGA 1XYFA 1OIMA 4KGLA 4U31A 3WBAA 4D6GA 2E9BA 3WUGA 4QLKA 1FHLA 2D0GA 2VOTA 1JZ5A 2DT0A 2EO7A 3RM8A 1UYQA 2XIIA 4PMRA 1C93A 4UCFA 1WDPA 1ZBCA 1BQCA 1GOQA 1XC6A 3WF1A 4A3HA 3WMBA 1UKTA 1DWGM 3BMVA 1CGXA 1FH7A 4DM1A 4BF7A 4KRTA 1UWIA 1NWUA 2JFEX 4ZENA 1ISZA 3GM8A 1ZB5A 3ZM8A 2DT3A 4H04A 4QDMA 1TE1A 3WF2A 4D1JA 2DIEA 3QGVA 2VCAA 4GQRA 2VNCA 2BY2A 1TA3A 3AMLA 4MJ2A 4OJYA 1JYXA 1DWIM 4RE2A 3I3DA 5HNNA 1UKOA 2VTFA 4CKQA 1MW0A 2XTKA 2CBJA 3OLEA 4V2XA 3CZGA 2IXUA 1EDQA 3AOFA 1ITXA 4F66A 3VKKA 1UD6A 3WNLA 3OG2A 2WW5A 4HZ7A 1FOBA 2Y24A 1MYRA 1XV8A 2BY0A 5GQBA 3BLPX 3VX0A 1JI1A 1K9FA 1FP9A 4UQEA 4BQ5A 1E6RA 1OSEA 4S3JA 1NH6A 4F79A 4HA1A 4NSBA 3FY1A 5BRQA 5ABEA 3VIMA 1NQ6A 3L2MA 5I79A 2FH6A 2YL8A 1J18A 5EFDA 4HOZA 3T2QA 3W4RA 3OGVA 2CERA 4OBRA 4JFVA 3ZT6A 1NOFA 1QNQA 1SYTA 1JD9A 5AYBA 3AIVA 4FLOA 4LQ1A 4AD0A 4GXPA 4CCEA 1J0HA 4JCLA 4AZCA 4FLRA 1SMDA 4FLQA 1KR0A 1C8XA 4XX6A 4D6IA 4CVWA 3UEQA 1TVNA 3WUBA 4AZHA 1GQJA 1EQCA 3LPFA 3VVGA 2JIWA 1WO2A 2VR4A 4DWSA 3ARSA 1JZ7A 1HP5A 3CZJA 3B9AA 3VO0A 1VAHA 1X6LA 2V3FA 1JIBA 1J9YA 2BNJA 4D6HA 3CTTA 8CGTA 3T2PA 2G3NA 3K4AA 5DO8A 3SUVA 5I2UA 3NSMA 2D2OA 4W7VA 4PSRA 4W84A 3FHQA 4U3AA 4E8DA 4GI9A 5CLTA 9CGTA 1V0LA 1UG6A 1H09A 3AIEA 4ML4A 5A94A 4PTWA 3WQ6A 4AD1A 4WF7A 2B31A 3VD7A 2WANA 1CTNA 3ALFA 4Z2KA 4WKHA 1KCLA 4MB3A 4IPNB 2DSVA 5A8PA 3NYDA 1UWQA 4PTVA 3VD4A 3UESA 3HU7A 3AXXA 4P8XA 1D2KA 4BQ2A 2QF8A 3KL5A 3NDZA 4CN1A 3L2LA 4MAZA 3SUUA 1DEDA 4HOWA 2X0HA 3L4WA 3WH6A 4AIOA 4HMCA 5IHSA 4GQQA 3WQWA 2VC9A 5A2AA 4PUDA 1H3GA 2YA0A 2BVTA 4LYPA 4C7FA 5CGTA 2WMHA 2ZX6A 4DWSC 4PMVA 5KEZA 3N18A 1WP6A 3AIQA 4TXEA 4AIEA 2D22A 1HVQA 1OCQA 3MUAA 2DT2A 2WMGA 3ZJKA 3AIBA 4UOJA 1OIFA 1ISYA 5M3WA 1EXPA 3VGHA 3CUGA 4U5IA 2OYKA 1ODUA 1YQ2A 2XYLA 3WF3A 3W0KA 4W5ZA 1CGTA 4AD3A 1K9TA 7TAAA 1OGSA 2GDUA 3WQ4A 1H49A 3WD3A 1EOMA 3GH5A 1W3HA 4PMUA 1JDDA 2JIEA 1E4IA 1OD0A 3WD0A 3WMSA 2WVSA 2JALA 1NP2A 5CJ5A 1HJQA 3RO8A 4NF7A 4ACZA 1WE5A 1BVNP 1HJXA 1PEZA 4CUCA 2WSKA 3HMCA 1F4AA 2O9PA 3TTYA 1IT0A 2FHCA 4J28A 1KBBA 4GZEA 1LF1A 2WLYA 1MQQA 3GZAA 1B3WA 3AXHA 2IUZA 2EPKX 4FK9A 3RDKA 3NSNA 1E6ZA 2CESA 4GZJA 1OT1A 1E6XM 2XPKA 1WDSA 1FH9A 3NSXA 4B3LA 2X2YA 1EGZA 3TONA 3AZSA 5E0FA 4ZE4A 2W66A 2WKLA 1AQHA 2ZWYA 4H7VA 3IJ7A 2OLHA 1BG9A 2J79A 2CPUA 1XSJA 4R27A 5A3HA 3MUIA 2CETA 1B3ZA 3ZOAA 1V6XA 3S2CA 2UY2A 1OB0A 4TTGA 4HPGA 4YHEA 1E73M 3VGBA 3DHPA 1LLOA 5IDIA 4U3CA 2BHZA 2NT1A 4DUWA 4OIFA 2O9TA 2GJPA 3M7SA 3WL1A 1E70M 2WC3A 3NCOA 1P6WA 1CXFA 2GJXA 1ZBVA 2CKSA 4D6CA 2VL4A 1XHGA 5M5DA 1HKKA 5LA0A 4AC1X 1E56A 5IXEA 2CCRA 4W8BA 1GOKA 5TD4A 3WIJA 1I1XA 1V6VA 3AZTA 1GCYA 3VIOA 1DTUA 1UR8A 4JL1A 4GO8A 1S46A 1KXVA 3CMJA 4MDOA 1GQLA 2C7FA 4UQAA 1QHZA 2UY4A 3RMEA 2OSWA 4MB5A 4L4OA 3QOKA 1B9ZA 3PZMA 3AFBA 1E9LA 3PZVA 3NIYA 2WBGA 3CHCA 3TTQA 1OGBA 1J10A 4P7QA 3SCOA 1W1YA 2GJRA 5A2CA 4YPJA 2Z1KA 1QI0A 3AZRA 3U7VA 1CXLA 1QW9A 2XM1A 3GDBA 3KE0A 3VIGA 4M1RA 1R85A 3QOMA 1UD8A 3VGEA 2W91A 4IPLA 3THDA 3WH8A 1G9HA 3OLDA 2E3ZA 3VMOA 1VBRA 4HU0A 1LJYA 2QMJA 5DFAA 3PTMA 1UKSA 2XFFA 2ZWZA 3BGAA 3THCA 4QFUA 3W29A 3IAPA 1H5VA 1QNRA 2V38A 1HL9A 1LWHA 3VX1A 2XVKA 3N13A 1UHVA 4M29A 3VD9A 2YDRA 4Y7EA 2WVVB 3IJ9A 4WJXA 5CZKA 5AY7A 1H11A 3CMGA 4OOUA 2OWCA 1B0IA 4AYSA 4UR9A 2ZUTA 4P7OA 3SCRA 4AZBA 3WDIA 3VM7A 4UFMA 4TX6A 1GHSA 3BCDA 3SCNA 3NUKA 3MMWA 3ARZA 2EXOA 3OGRA 1N82A 3BAKA 1HP4A 3PZUA 5E6YA 3A47A 1JXJA 3SEPA 2J7HA 4TOQA 4NRSA 1JF6A 5LA1A 2D20A 4Z2HA 4WSKA 5A8NA 1EO5A 4V28A 3HN3A 4MNLA 4LXFA 1UWSA 2J7FA 4BA0A 4B9YA 3L4UA 1G01A 2CHOA 3WDQA 5DMYA 3N9KA 2JF7A 1W2PA 1E55A 1LL6A 4JFUA 3FNDA 1UZ4A 3MKKA 3N11A 3BAIA 4P8WA 5D9OA 4AZGA 5JBEA 2E0PA 1MW3A 1RH9A 4GPNA 3AHYA 3MMDA 1X6NA 2JEPA 2FDMA 3RJXA 2OYMA 1JFHA 5ECUA 4A4AA 4KMQA 1PIGA 2ZUMA 3WNKA 3KWXA 1GQIA 1PIFA 5DT7A 1BTCA 2YDSA 4D72A 1HJSA 4GI6A 1GORA 3B8SA 3B9DA 1US3A 1VENA 3CH9A 2YJQA 5A1AA 1HXJA 3AI0A 1W91A 1KCKA 1H0GA 1UA7A 3I3EA 5F7UA 1K9DA 3VNZA 4Q7NA 1DWAM 2WHLA 5M17A 1CENA 3WUEA 1BLIA 4PTXA 3GNOA 2TAAA 2ZX8A 3BAWA 1FH8A 1OGGA 1WB0A 3TA9A 3W6MA 1J0JA 2A3CA 2FHFA 4PCTA 3CO4A 3AICA 1AQMA 1C92A 4J3XA 3BAYA 1E6SM 4RE3A 3M46A 1E71M 2Z1SA 3AS1A 3POCA 2WHMA 3VMPA 1HT6A 2PC8A 4HZ6A 4CD5A 4HA4A 3PTQA 2VJXA 4AMCA 5BRPA 3W27A 4YN5A 1V02E 3ZO9A 1M7XA 1E4LA 1Q6EA 2GK1B 1CWYA 2XHYA 3WD2A 2FGLA 1ECEA 3BCFA 4HU8A 2ZX9A 1KR1A 3PZGA 1HN1A 2F8QA 1QHPA 2WVVA 2DDXA 3GXMA 3WDRA 4QCFA 4F8XA 1WZKA 4PMXA 1BGGA 1Q6DA 3VIIA 3NDYA 1XD0A 2Y5EA 1BSIA 2CITA 1BFNA 6TAAA 1VEMA 5GNYA 4CCDA 1Z32X 1K6AA 3UG5A 4HA3A 3ZT7A 1JZ8A 1WNOA 3O6AA 1J11A 4R5EA 1L8NA 1MFVA 1EH9A 3CHFA 1JDCA 2DH3A 1W1PA 3ARXA 5LYRA 1ESWA 2YDQA 2ZICA 5EB8A 4RL3A 3WFLA 1NWRA 4HMEA 2WVUA 1G1YA 4HP5A 3WQ5A 5CQ1A 2VX7A 1OT2A 4BZYA 5I23A 4N0RA 2IXVA 2ZE0A 3DHUA 1OINA 3GXDA 2W4XA 2BS9A 2W92A 4JKLA 3VU2A 2V3GA 1EHAA 1GOOA 3LMYA 1L0PA 3PZIA 4W88A 1W9PA 5CGMA 3CGTA 3EMQA 3G6LA 4GKLA 3GNRA 2WKGA 3ARRA 4W7UA 4AEFA 4AZIA 1LL7A 4CD8A 2A3AA 3ARTA 3ARVA 5ABFA 1WAWA 5GPRA 5JBFA 5IFTA 4EK7A 2YL5A 2YL9A 4XZBA 2W61A 3OB8A 4X0VA 2F61A 3N17A 1EIBA 4HTYA 3OBAA 2X1IA 1BYAA 1I75A 1HKMA 3U5YA 4AZ7A 1V3JA 3IJ8A 4P8UA 3SCQA 1VRXA 3UR7A 4M24A 2D0HA 4ZE5A 2CBUA 3U5UA 1ISXA 1QPKA 2J8GA 2A3EA 5JIWA 2ESCA 1KFWA 3BSHA 2W62A 3WF4A 2PF0A 3CHEA 3N04A 3U7BA 3KZSA 3AS2A 1JZ2A 3AHXA 2AAAA 1EOKA 1JYVA 5D9PA 1SR0A 5FD0A 1JZ4A 3MS8A 1R7OA 1UD4A 1GJUA 3VDCA 3O2LA 1BGAA 1MQRA 2GK1A 4AD5A 1HNYA 3FN9A 1H4PA 2VQTA 3PZ9A 1C3FA 3ZJ8A 3N12A 2QHAA 2VRJA 1JG9A 2WSPA 4E4PA 4OZOA 2OSYA 4PMNA 4BQ4A 3BLKA 1GNXA 3T08A 3S6TA 4PN2A 3DECA 5JUVA 3WELA 1HJVA 2BY1A 1TCMA 3WENA 3FXYA 1GVYA 3A6OA 2FHBA 2GSJA 3RCNA 1VIWA 5C70A 2RGLA 2W5FA 1PPIA 3VIHA 2WK2A 1LG2A 2WZEA 4AZ5A 2VZOA 1WKYA 1J0KA 1JDAA 8A3HA 1PZ3A 5FL1A 1CNVA 2ZOXA 1QW8A 1TZ7A 3N15A 1EDTA 1HIZA 4ATDA 4B15A 1XH2A 5ABGA 3VDAA 5D8WA 4M8UA 4D1IA 3ZQ9A 1E0WA 2PB1A 4WKAA 1DWFM 2UWFA 3ARYA 1CGYA 2ZIDA 6CGTA 3CIVA 1KBKA 4MNMA 5IFPA 1YHTA 4A3YA 3AISA 2WLZA 4JHOA 1GQKA 3DC0A 1OBAA 1FFRA 2J74A 2VUYA 3EDJA 5D8ZA 3T0AA 3WN6A 2GFTA 2G3IA 2G3MA 2VZUA 1KQYA 5BXRA 1TG7A 2ZUUA 2CKRA 4AD2A 1QBBA 1KWKA 2WYSA 3F5LA 4W5UA 2CBIA 4E2OA 3UCQA 3AXIA 1U30A 4OBSA 1PAMA 1NM9A 1U2YA 2E4TA 1V0MA 4JZ5A 1JI2A 4AWEA 3OIHA 3W81A 5A6BD 4MTVA 1H2JA 4L4PA 4ACYA 4HOXA 4JAWA 1VBUA 4XUYA 1CYGA 4N42A 1JD7A 2YLLA 3N1AA 2O9OA 4JHZA 1IV8A 2WCAA 3W26A 2V5DA 1QVBA 1V6YA 4J3VA 4V27A 1SMAA 2VI0A 4H8HA 4H8VA 3SCUA 1VJSA 2XWEA 1E4NA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4PMD A;  3SUW A;  2VO5 A;  2CXG A;  1GON A;  1UR4 A;  3TOP A;  1JXK A;  1UQZ A;  1FFQ A;  3VDB A;  3D3A A;  3RJY A;  4U5K A;  4LPC A;  4Z2I A;  1O7A A;  1D3C A;  3WQ8 A;  3QHN A;  4S3K A;  1FHD A;  4CCC A;  1GPF A;  1E5J A;  4QCE A;  1R87 A;  1J01 A;  7CGT A;  2WCG A;  3L4V A;  5D9N A;  5AC4 A;  4JL2 A;  4MB1 A;  2BXY A;  5D9M A;  5HPO A;  2WWC A;  1VFM A;  1Q6C A;  1CXI A;  4AW7 A;  1J0Z A;  4XB3 A;  2UY5 A;  4JFT A;  2AOS A;  1JYN A;  4WKF A;  2VX4 A;  1BF2 A;  5DT5 A;  4NZC A;  1CGW A;  4X0N A;  1XRV A;  2DQX A;  5A6S A;  3MUY 1;  4P7R A;  3II1 A;  3ARU A;  1RP8 A;  1CEO A;  4OOZ A;  2EBN A;  1Q4N X;  2YLA A;  1JZ3 A;  2DSZ A;  3GH7 A;  3OLI A;  2V3E A;  1JFX A;  2WCS A;  5LA2 A;  3WY1 A;  1UWU A;  1G0C A;  5JIP A;  4J27 A;  1QI2 A;  3CZK A;  3L4Z A;  5BXS A;  2F2H A;  1EQP A;  1OWQ A;  2VX5 A;  3RM4 A;  2NW0 A;  3VMN A;  4C7D A;  3EDF A;  1CBG A;  2D23 A;  3VIL A;  3BSG A;  4GZI A;  5ABF B;  3CZ8 A;  3AMK A;  4AZC B;  1QNP A;  1DWJ M;  2XGB A;  5A6B A;  3WFZ A;  1C7S A;  1UKQ A;  7A3H A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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