5LGXA

Structure of oxidised pentaerythritol tetranitrate reductase
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
AEKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Pentaerythritol tetranitrate reductase
publication title Combining X-ray and neutron crystallography with spectroscopy.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacter cloacae
total genus 142
structure length 363
sequence length 363
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5lgxA00
1Q3NA 3ZR4A 3QMRA 1KM3A 3S1VA 1L9WA 2Z6JA 3QMTA 3UXDA 1SZGA 2QCFA 3EWZA 2ZZ1A 3H55A 4IJBA 1PHWA 2R91A 3TSDA 4JX5A 2CZ5A 3CQ0A 3LRLA 1VGAA 1PV8A 1SO5A 3GDMA 1A50A 4PEKA 4W9TA 1YXDA 4Y8FA 4LVDA 1O94A 2E6YA 3HGJA 3ANYA 5IBXC 1FWNA 4I7VA 3IGXA 1ZAIA 1I8JA 5F4XA 5AYZA 3DI0A 2PE4A 2PRLA 1H7OA 2ZZ3A 4AMAA 1B3OA 3U2OA 1N8FA 5MHBA 1C9DA 4MVAA 1P0KA 3G1YA 3NZRA 4O54A 4AWSA 2NX1A 1LBMA 2Y63A 5K2ZA 3DHFA 4JYDA 3HB9A 3M5VA 3DFPA 3E9AA 4LS2A 4UR8A 1FUYA 3T40A 5AOUA 3TR2A 3W72A 1JCMP 3S9YA 3LV5A 1GG0A 4RCXA 3L0NA 1VC4A 3CWOX 1VRDA 1OFEA 5U4NA 4CNPA 1MEHA 4OHQA 4BF9A 4ORMA 3TDFA 4O4WA 5AC7A 3B06A 2QJHA 3CHVA 3LRMA 3TA6A 1GYNA 3C2OA 2FQIA 4LRSA 1O95A 3PBWA 4BI6A 3BLFA 4N9DA 4M7SA 3HPZA 4UTHA 1R46A 2A6NA 4GUGA 2A85A 5F4WA 3NDOA 4IMDA 3KAOA 1IXPA 3QSTA 1TRDA 2E1DA 1GJPA 2RDWA 1YDOA 4WXZA 1WBHA 3HO8A 4RLIA 4X22A 5IBXA 4IUOA 3F1QA 5D02A 1JCLA 4RV8A 4O16A 1W54A 2QUVA 1IGSA 1L6YA 1T0OA 2VENA 2JKEA 2BX7A 2NWRA 2YZRA 4M6VA 1HG3A 4UMBA 3LTPA 5HUOA 1V7YA 1NFBA 2RH9A 1VHCA 2VFFA 5CZTA 1QPOA 3TE9A 1SZEA 1RQHA 1EP2A 5D09A 3WK3A 1KTBA 5H2ZA 3PUEA 2A0NA 2GQAA 1XL9A 5HR6A 1H63A 3MHFA 1GVQA 2HMCA 5LNVA 5L9FA 2GVGA 1QWGA 5D2WA 2VFDA 3MWAA 1R2RA 5C55A 1UASA 5HQEA 3PB0A 3HGOA 1TPWA 3N73A 1QOPA 2E77A 3SW6A 3G1DA 4HPXA 4CCDA 2GVJA 3MYPA 4MZYA 1FDZA 4JIQA 3UWZA 3TROA 4UMAA 4FXRA 2EAWA 3GZ3A 1FDYA 5A8GA 4NJJA 1TV8A 1UUOA 3GDRA 4O0KA 5F2GA 3W88A 3F03K 3NPWA 1EIXA 2C6QA 5I3GA 2QJIA 5K4XA 5ABTA 3LHYA 4MFDA 2CLFA 3KHJA 1VLWA 1KM4A 4C1KA 3TJXA 4AVFA 2QAPA 4XZ9A 4IMGA 5D2YA 1P4CA 2Z1BA 3UPWA 2FB2A 5KTLA 3LDVA 1A5BA 6TIMA 3P67A 3W6YA 3N2XA 4UTIA 3IIXA 3FOKA 3W83A 3M9YA 2FIQA 3TQ0A 3I7QA 4BR1A 1FWSA 3G1HA 3BK0A 3NPXA 3QC3A 3RNDA 1VCFA 1YLVA 3W1UA 1PHQA 1LLWA 3FFSA 1O60A 1K8ZA 1VR6A 3YPIA 4EIVA 4AWTA 3ABOA 4NNBA 4M7TA 3P81A 4FXSA 3OEXA 2E5BA 2EPHA 1FBAA 4Z1CA 4HNNA 2WO5A 3N9SA 1J5TA 1LRNA 2A6LA 4O1BA 3LCWA 3TW7A 3EWXA 3R2GA 4S2BA 3Q37A 4HKPA 4UNLA 4IMFA 1ZNNA 2C19A 4HT3A 1JUEA 1XDLA 3EX4A 1W5OA 2X1SA 2O7SA 3QH2A 1KTCA 2Y61A 2YDAA 4POCA 4GUFA 2D73A 5CGQA 1WV2A 4KKXA 3O15A 3B8DA 2OZ0A 2E6AA 1JUBA 4Z0JA 5LNSA 2ZTKA 3W7DA 2VEKA 2EKCA 2Y89A 1AK5A 3N34A 5C6MA 4IPJA 4RR4A 3NG3A 1I2PA 1GVFA 2ZZ6A 2QCEA 1F5ZA 3DAQA 3SI9A 3CC1A 2E6FA 5EBUA 4MLRA 5T26A 5KINA 3W1XA 1H1YA 2EF9A 1SU5A 4GXMA 4RX0A 1Z42A 2BWGA 4TR9A 1H7WA 4N2YA 4MFEA 5DELA 3DBPA 2ISWA 1LZOA 3KFTA 4Y96A 3W7GA 3OBKA 2IQTA 5AHMA 3GXPA 4ZQPA 1SO6A 1ICPA 2PURA 2XN2A 1BWKA 1DJQA 1XCFA 3IV3A 5F4SA 5C5YA 1H51A 4EVZA 3GK0A 3NQ2A 1S5VA 4Q32A 1B57A 3P61A 4UTWC 1F73A 3SIZA 1VPXA 3G8RA 4O53A 4Z08A 3THAA 5I3IA 4JTJA 3LM7A 4O18A 3VFLA 3STEA 3DFSA 3UWYA 1VS1A 2W79A 3M16A 1YYAA 5BMXA 3CIWA 1GVSA 5HULA 1LP6A 3G22A 3A23A 4ICNA 3W1PA 3MP3A 4O4VA 2UV8G 2NZLA 3IVSA 3Q58A 3N3MA 4NXSA 5KSWA 5A5WA 1EUAA 1ZY9A 1W5QA 3TQKA 2E68A 4XBSA 1LRTA 5BMWA 4NVTA 7TIMA 3CLMA 1D3HA 3PWAA 3M5ZA 3SGUA 3I7RA 3FYOA 3N9RA 1H60A 5CG7A 3TQVA 4LVGA 1TB3A 3MMTA 4PC8A 5TIMA 3MI6A 3HQ1A 1YPIA 1ME7A 4HSNA 1DQXA 2P1FA 3O05A 3MO7A 1QAPA 5CZSA 5AFDA 2V2CA 1LOQA 3PSWA 3PC0A 4ALDA 4MUZA 1MEIA 2J9YA 2G97A 1AW5A 4FHAA 1FY6A 1OFAA 1KLYA 2OCZA 4DQWA 1TPH1 1OK4A 5DCEA 2C15A 1JCNA 4Z0SA 4QQ3A 4DO5A 3WJSA 5BRBA 1LORA 4UTWA 3LV6A 3F4NA 5CZ0A 3TU9A 3KVMA 2GJNA 3C61A 3LI1A 2V30A 3A24A 1Z48A 2X1RA 2X1TA 4ZQMA 2FJKA 3NQEA 5DXXA 1EEPA 6ALDA 3G24A 1GYLA 4U28A 4WJEA 1X6UA 3LHUA 1JCJA 4OE7A 3EB2A 5AC6A 2VFIA 1H7RA 2RFGA 3LXBA 4LWWA 3CM4A 3EWWA 1B9BA 2VEMA 3JRKA 3AO0A 1YPFA 3O8AA 3NVTA 1ZAHA 1FCQA 1WQ5A 2CZFA 3L5MA 3RLUA 3NA8A 3S5YA 3V75A 1SPQA 2ZBTA 5D04C 2YSWA 1IIHA 3CTLA 4M6PA 5I3FA 1XUUA 1MXSA 3C6CA 5F1UA 1KW1A 3NL6A 2OMAA 2QAFA 4FX8A 3SFKA 1TPEA 2TRSA 3C3NA 2TYSA 1P5BA 1OABA 3JR2A 2VELA 4KWWA 4O0ZA 2H8ZA 3MHGA 2YR1A 1BWLA 3VKJA 1HTIA 3HGSA 1ML1A 3QPZA 2A7NA 4O8RA 3NQFA 1AL8A 2QUTA 3C8FA 3LX9A 5G5IA 3G1XA 1VZWA 1VYSX 5FF3A 1OFDA 4E38A 4GUHA 3DI1A 4H6KA 2JKAA 4QNEA 4ZMGA 2QDGA 4NJHA 4PFMA 2QCLA 4GNJA 3F4WA 1TSIA 1JRBA 4YCOA 4Q4KA 1LLZA 1VH7A 1A5SA 3C0JA 4GJ1A 2ZYFA 5D2VA 1MZHA 3W87A 1EP1A 1G4PA 3MW7A 3M6YA 3V1PA 4FX6M 3C2FA 3NAVA 3EKLA 1XBZA 2ZZ5A 1OJXA 3G8EA 2NV1A 1ALDA 1HO1A 3IVTA 1F7BA 3W23A 4B5NA 2E5DA 4KFNA 3QW3A 4JXCA 3QMSA 4X2RA 1TTJA 3W7JA 2GVLA 3LHVA 1YXYA 5FEZA 2NUXA 4ADSA 3I65A 1G4EA 3CEUA 1IIGA 2G96A 2C14A 1OFOA 5EA9A 2X30A 4TX9A 2ZCGA 2YYTA 2VFHA 3P8IA 3WJYA 3WJZA 4K8HA 5LNRA 3RLVA 1B4KA 4JEQA 1D9EA 2H6RA 1WYIA 3P62A 3W2UA 3DKLA 1I2OA 4QIUA 1HUVA 1H62A 4MJMA 3S42A 4K39A 4ZZ9A 2E6DA 3CWNA 4A3UA 1TTIA 4LC6A 2B7PA 4RXFA 2C18A 4LOCA 2NUWA 4TMCA 1KFJA 3OIXA 2XFWA 1DVJA 3IIZA 1SO3A 4IMEA 2Z6IA 1UUMA 1W8SA 2G95A 2JKPA 3C2VA 4LUIA 4CNOA 3PF3A 3DFTA 4RZ6A 3UWVA 4Q33A 4D2JA 2RHGA 1NAL1 1CW2A 1TV7A 2VFEA 1GZGA 3GB6A 4MKNA 1H1ZA 1OYBA 2YYUA 5DN1A 2VOMA 1TPB1 3LHTA 2CLMA 2V2HA 3A5FA 2DZTA 2QCGA 4K8EA 2GQ9A 4I7UA 4YMZA 4XUGA 3W7KA 1DL3A 2ZA1A 3FJ6A 2NX9A 2H8XA 3MBDA 4N02A 2C16A 1WDWA 1DORA 4JTTA 2V81A 3UZ5A 2NWSA 5G4WA 1HL2A 4JD4A 3P5YA 2A21A 4HNVA 3PM6A 3W7IA 1XUZA 4FNQA 5CPOA 4FB7A 2H90A 4RKAA 3W1NA 3GLCA 4BFAA 2FPTA 5D05A 5F1VA 4E2BA 4FNSA 1TTPA 4LW7A 4P2VA 4AH7A 5FEWA 2I9EA 1WA3A 4RZ5A 3IEBA 4IGHA 4A2SA 2DJLA 2AGKA 3WFAA 1VHNA 1J2WA 4NUWA 3S5NA 8TIMA 4TO8A 3VE9A 3FKKA 3ELFA 3TMLA 2YW3A 2ALDA 1U5JA 1K7XA 2DORA 2Q8LA 5AB3A 3BO9A 4WZHA 3PBUA 4MPQA 2Y7FA 4QM1A 3NQVA 4NT0A 4LV4A 1H7PA 3SGZA 3GX9A 1U83A 4M6QA 5SWUA 4E0CA 4DXVA 2FPYA 3HG2A 4UR7A 1XBXA 3MI2A 2C0AA 4RXGA 4QJ1A 3LXAA 1S5TA 4X3ZA 4LUJA 1AG1O 2H3DA 1MSSA 1M6JA 4LVFA 1BTMA 4GFSA 2V82A 1OX6A 3HG3A 3M44A 3UWQA 4Z1BA 3TK7A 1GVRA 2V0TA 3NQGA 3M1ZA 4AHPA 5G4EA 4DO6A 4BWLC 4FNTA 5CPMA 5C2XA 5CPNA 2JGYA 2Y70A 3W2JA 2ZTJA 3H54A 3DU0A 1FCVA 3PUOA 4R53A 5HR7A 1PS9A 1LROA 3SECA 4BI5A 2DP3A 4FIQA 1LDCA 1H61A 3TX9A 4TIMA 4MOZA 1TRIA 3PY2A 4LV9A 1DKWA 4XBKA 3NQCA 5DY3A 1I45A 1OX5A 3MJYA 5LKYA 4N6FA 5KITA 3MP5A 4KFOA 3SY5A 3PG9A 3KVJA 1TO3A 1PCKA 2QF7A 3R8RA 3U8GA 3NO5A 3USBA 2Y88A 3W85A 3JS3A 3QRHA 2WSQA 5HNRA 3QZEA 4JICA 3GDTA 2GQ8A 4IX2A 4L4MA 2PRMA 1OFPA 1Z41A 3QM3A 5EYWA 1RPXA 2ZZ4A 2EGZA 4ORIA 3LLDA 3GDKA 1XBVA 3THQA 1SW7A 1QO2A 3KVKA 5DCBA 4OBTA 3T44A 4MJZA 1WOBA 1EWDA 1KFBA 1V5XA 4GUJA 1QDSA 4GE8A 3B4UA 4O50A 3FLUA 2FFCA 2NXHA 1FWTA 3LHWA 3EX3A 4O11A 1OF8A 3NR0A 2ZRYA 4AAJA 4QITA 5AC8A 1Z44A 4EWND 1ZJIA 1QFEA 4MIMA 4NJIA 2VEIA 3O06A 1FX6A 2A2IA 4UFHA 3FS2A 4CCCA 3KOFA 2B4GA 3OHIA 1PCWA 4NJKA 4O13A 4DPPA 4IMCA 1OYCA 1G7VA 1H5YA 3DHDA 2VKZG 3MUXA 2Y7GA 5F2LA 3L66A 1TPUA 1M7PA 3EKZA 1I4NA 3S5ZA 4HNUA 1KFEA 2V8ZA 2CLKA 4CQ9A 1YDVA 3C2EA 2OJPA 5FF7A 4XQ6A 5HMSA 3TAKA 2H3BA 5G1YA 1L2UA 2WNNA 2ZFAA 3LB0A 4YLWA 3MBFA 3NZ1A 3DXIA 4OWGA 1GPWA 1W1ZA 5HWJA 4MYXA 1Q6LA 5AHEA 1YXCA 3DENA 1FDJA 3ATYA 2RDUA 3ZWTA 1LOSA 2B7OA 3KX6A 3HIJA 3GKAA 4LS0A 1SW3A 2BZNA 2WNQA 1QCWA 1F6PA 2NXIA 3QW4B 3P7YA 2ABAA 4JIPA 1VLIA 1WBJA 1XC4A 3T55A 5G2IA 3GNDA 3W1QA 3TUUA 3K30A 5AHLA 3C2RA 5E1QA 1XDMA 5BW6A 1GOXA 3TKFA 2ZRZA 3WJXA 4DBEA 3B0UX 2J6XA 5TQLA 3EXRA 2W6RA 2R94A 4R7JA 4OU1A 5FEPA 3M0ZA 1W3IA 4PL2A 3TW6A 3O16A 4JTSA 1ICSA 4JTHA 1S5WA 5E0KA 3TJLA 1QOQA 1QPNA 2Z0IA 5LHFA 3BV4A 4UTJA 4FNUA 2J88A 4NZJA 4JTKA 5D32A 3L0KA 3T7VA 1G7UA 3S1UA 4K6AA 4HPJA 1F6KA 5BOOA 3RU6A 3QPYA 3QJAA 3G3DA 4AF0B 4DEFA 3NPVA 1W3NA 1GTHA 3LCGA 2RKXA 1SR9A 3GNNA 3BARA 3QQ1A 4JTGA 2A4AA 2NLIA 3MHUA 2Q3RA 3CPRA 3SR7A 2WV8A 4LS1A 1G4TA 1PVNA 3R5EA 3NQMA 4LC8A 3CEPA 5EMUA 3TMQA 1OFBA 3AJXA 3NOEA 3L67A 3QSRA 4JX6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1Q3N A;  1PBG A;  2J7H A;  3F5L A;  3ZR4 A;  3QMR A;  1KM3 A;  1J93 A;  2IPG A;  1DWA M;  1UWT A;  2POZ A;  1SMD A;  1PHW A;  4Q8N A;  2ZE0 A;  4WVX A;  3EDD A;  1Y7V A;  1LQA A;  1NWS A;  1PV8 A;  2A79 A;  3MMD A;  1HW6 A;  2HBX A;  3IV8 A;  1CCW B;  1BSI A;  3UVA A;  1O94 A;  2FGZ A;  3ANY A;  3EMZ A;  3IGX A;  2JFE X;  3GHT A;  1D2K A;  4AMA A;  3TJ4 A;  3U2O A;  2GL5 A;  1NH6 A;  5MHB A;  1C9D A;  4MVA A;  4YTS A;  3W37 A;  1P0K A;  4O54 A;  3U5U A;  4Q4S A;  3NCO A;  3CHC A;  4JYD A;  4DUW A;  3SCN A;  4RE4 A;  3H23 A;  1EQC A;  3CT2 A;  2XIN A;  1FUY A;  3T40 A;  3TR2 A;  4MDP A;  1CXF A;  4INF A;  3UJ2 A;  4NRR A;  1IR1 A;  3LV5 A;  5DX7 A;  3PPC A;  4RCX A;  2VZO A;  3L0N A;  1J0K A;  2HQA A;  4ROP A;  1VRD A;  4MWA D;  1OFE A;  4CNP A;  4IQE A;  4O4W A;  4RDV A;  4NZ4 A;  1K77 A;  2AKM A;  1GYN A;  4GKL A;  1UHV A;  1T6M A;  1E3X A;  1O68 A;  1X97 A;  3GVR A;  3OA5 A;  1HN1 A;  3HPZ A;  3BIC A;  4H9Y A;  7ENL A;  3NDO A;  4NYY A;  2ZVI A;  1C8Q A;  2E1D A;  3PZ9 A;  3WBY A;  4WXZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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