5LGZA

Structure of photoreduced pentaerythritol tetranitrate reductase
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
AEKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Combining X-ray and neutron crystallography with spectroscopy.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Enterobacter cloacae
molecule keywords Pentaerythritol tetranitrate reductase
total genus 140
structure length 363
sequence length 363
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5lgzA00
3G1FA 4LTSA 1LOQA 3NOEA 5TQLA 2QUTA 3G18A 4A2SA 2A2IA 4N9CA 3CLMA 2ALDA 3TSBA 2Y6ZA 3NL2A 1WXJA 1R2SA 5G5IA 4HSNA 5GVJA 1WOBA 3KVMA 3LXCA 3DZ1A 2C19A 2R14A 4DO4A 1QPRA 4EF9A 4JTHA 1F05A 2I14A 2Y88A 2A7PA 3P62A 2EKCA 4J9JA 3C2OA 3GXPA 4ZQMA 3S0CA 3S1UA 3LV5A 4O1DA 3MYPA 3BW4A 3G1VA 3HB9A 4RLIA 4WUIA 1I45A 3CQ0A 2WKJA 1X8FA 1SW0A 1P1XA 3WJZA 2TPSA 3I7RA 1W5NA 5AC8A 4BK9A 5FF2A 4JX6A 2GQ9A 1TPDA 3HPXA 3W70A 3GDMA 4QQ3A 4UTLA 3BW2A 1GJPA 2WSQA 1OFQA 3IVTA 2NLIA 3GXTA 1JUKA 1G7UA 1G4TA 1KM4A 1RQHA 3QSRA 1G69A 2ZZ5A 4MY8A 2GJLA 5MHBA 1YPIA 3GLCA 3L21A 5DN1A 2QCDA 3PG8A 4UC5A 3S6DA 5C6MA 2RH9A 4LW7A 3TNOA 2QCLA 4NXKA 2A85A 5LNSA 1QOPA 3LCFA 1JVNA 4GJ1A 1DORA 1XBZA 4O16A 4EIVA 1W37A 1XUUA 4HIBA 2QR6A 2ISWA 2H8ZA 1KFKA 2NXHA 3MHUA 1MEWA 3DKJA 2E6YA 1WAUA 3QFEA 5FF0A 4M5PA 4XWUA 4DPQA 3TK7A 2VFGA 5AHEA 3B04A 3QC3A 2QJGA 3W88A 3CT7A 3W1QA 3WJXA 4HNUA 5K4ZA 4FXRA 1SZEA 3M0ZA 4O57A 4Y90A 5HUPA 3UZJA 1QO2A 3QW4B 2GQAA 3BO9A 3G24A 1GEQA 2H6RA 1FWWA 3HGRA 3NZRA 3TQ0A 3LRMA 3EB2A 1F7BA 1G4EA 2O7QA 1FDYA 1H61A 5K9CA 3QMRA 4MPQA 5J5DA 4O18A 3W2NA 3EKLA 2X30A 2YW4A 2WOQA 4GUIA 5CSRA 3QYQA 1W31A 3IVSA 3BPWA 3PBVA 1EP1A 1JJKA 3G1AA 4LOCA 2DZSA 4JTFA 1BWLA 1HL2A 3W1MA 4B5NA 1F2JA 1EP3A 4YWIA 3TA6A 4N4PA 3EX4A 4LS1A 1TV8A 8TIMA 1SPQA 1VYRA 1QO5A 4KFNA 2E77A 4G1KA 2C13A 3RFAA 3W2KA 3F4WA 3W1PA 4GBUA 2X1RA 4MOZA 1OG0A 2QJHA 3GNDA 4RZ5A 1RZMA 3NQVA 4MZYA 3G1XA 3TFXA 4O28A 1TO3A 2QKFA 3SIZA 5DLCA 2ZTJA 4WQ6A 2ZFAA 3O8AA 3WK2A 4IMGA 4JTJA 1HO1A 4NQ1A 4QAIA 1GYLA 3PVFA 4MLRA 1JCNA 5BW6A 3HJZA 3WK0A 4XKYB 2H90A 3SGZA 1FWRA 4YLWA 2A6LA 3W71A 5LGXA 3LHTA 2G96A 1YDOA 4M6VA 3N2XA 1VQTA 3WK3A 4LV9A 1PIIA 3W7NA 1FY6A 3N9SA 4A3UA 4E2DA 5G1YA 4M6PA 3QMTA 5G2HA 2ZZ1A 1EUNA 4K8HA 4ZQNA 3CC1A 1KFEA 3GDKA 5D2VA 1TPH1 5IM51 4NNCA 5EMUA 4RK8A 1TRDA 3S5NA 1JR1A 2ZRXA 3MMTA 2FJKA 4N2YA 3STEA 2BXVA 3C56A 1HO4A 4MY9A 4DELA 1I8JA 3ABQA 3UNDA 3LRLA 2G5WA 3W1TA 5A5WA 1G7VA 1JCXA 1AW1A 3DI1A 4QNEA 5D09A 4OE7A 2VEMA 2WNZA 3EX3A 3VNDA 2DJXA 3FYPA 1FCQA 1H7NA 3W6YA 3NQAA 1W0MA 1XL9A 5CZJA 2Y7GA 4NVTA 1K8XA 3NZ1A 4HKPA 3DFOA 1DJNA 1EEPA 2ZDRA 1OX4A 1XM3A 3W7DA 2QCMA 4NU7A 4PODA 1UCWA 1LRNA 1TIMA 2R8WA 4DQWA 1ZAJA 2I9EA 1DL3A 1ZNNA 2CLOA 2WV8A 4OHQA 2Y89A 1Q6QA 5D30A 4AWTA 3M43A 1B4EA 1HG3A 3BLIA 1KFCA 1RPXA 3TCEA 4O1BA 1AW2A 3IVUA 3UY8A 3O16A 1KBIA 1UJPA 4LWWA 4RV8A 3UXAA 3NDOA 2E1DA 2EHHA 3KRSA 4ADUA 4BI7A 3P80A 2EF9A 3TC7A 1Q6LA 1NEYA 1AL8A 2WO5A 1O60A 3JRKA 4D2JA 1OX6A 1GT8A 1OJXA 5CZ0A 5AHLA 3C2RA 2CLHA 4IUOA 3TE9A 2R91A 3OHIA 3PUDA 4K36A 2YW3A 2ZZ4A 4O50A 4GC4A 2OX1A 1FCBA 2H3BA 4LC6A 1LP6A 1W5QA 2BLEA 4AAJA 4O1CA 3DFQA 1J4EA 4PA8A 5I3KA 2P10A 2Z0IA 2BZNA 1OFAA 2OMAA 4NUWA 3MW7A 2V2HA 1DBTA 4L4LA 4UUIA 1SO5A 2XFWA 4CQ8A 3O06A 3C3NA 1W1ZA 4AVFA 3TUUA 3S8HA 2NWRA 1K03A 4Z1CA 2G97A 3HG4A 1F74A 4MIMA 5AYZA 3Q2DA 1Y0EA 3L9CA 1JUBA 4DEFA 5BRBA 1K7EA 1EUAA 1PCWA 4FXSA 1EB3A 5F4SA 5LNWA 3C4UA 3W1UA 2FTPA 1NF7A 2A7NA 1V7YA 3FJLA 4JDYA 4RZ6A 3LM7A 4CCEA 2V0TA 2ZZ3A 2OT1A 3FS2A 1TMHA 4WXYA 3T78A 3NM3A 2UV8G 3B8DA 1Z42A 3L5MA 4L4MA 3P61A 5HWJA 4IPJA 1M7PA 4IMEA 4UTIA 1AG1O 4KWWA 4EWND 1T99A 1YTDA 3TXZA 1TRIA 3NPWA 2V2DA 2XN1A 4O12A 2NV2A 3G8EA 4QSHA 4JTIA 2ZZ2A 3S1VA 2ZTKA 1Z41A 4M7TA 4WJEA 4NXSA 4O4VA 1JCLA 5HR6A 2FDSA 1ZJIA 4LU0A 3C61A 2QCFA 1A5CA 4RR4A 2YYUA 4HT3A 2QCHA 4ORMA 4TX9A 2PRHA 1K02A 3BV4A 4DBEA 4ZQPA 3EWBX 3PS7A 3LXAA 2DZUA 2Y7FA 1ZY9A 3PUOA 4LVAA 2V81A 5AYYA 1KM5A 3LOTA 4TIMA 4XBKA 1TQJA 5KZEA 1S5TA 4NJIA 1Q3NA 1Q6OA 1S3HA 3HPZA 1H1YA 2PRMA 2X1SA 2NX3A 4TMCA 4UFJA 3H55A 3HF3A 4NZFA 3S5YA 1VCVA 2E6FA 3L67A 3C2VA 3E12A 5D37A 3MHGA 2WSYA 4IQLA 3M5ZA 3C52A 4UFKA 3PR2A 5D04C 3QH2A 1RD5A 5FESA 4FIQA 5ABTA 1TJPA 1PHQA 3LI1A 2G95A 1W8SA 3EX1A 2ZQ0A 4U28A 1QMLA 3EX6A 5LNRA 3LCLA 1I4NA 3HGJA 2HMCA 3B4UA 4POCA 3V75A 3W75A 4K7VA 5U4NA 3S5OA 4E38A 4UNLA 2W79A 1O5KA 2VFIA 2P1FA 3SR7A 1VCFA 1O94A 1C9DA 2EPHA 1UB3A 1IGSA 3BGJA 3G1SA 4DXVA 1T0OA 4UIOA 3A5FA 3AO0A 1L6SA 2FPTA 4AH7A 2WJZA 1O95A 3NEVA 4MZ1A 1EX5A 3W84A 1KTNA 2J24A 4AWSA 4QM1A 1U83A 4WD0A 2QCCA 4UFIA 3FEMA 2DZVA 4X22A 5EPDA 3HG2A 3PF3A 3MBDA 2VFEA 3D0CA 1H63A 1PS9A 4S2CA 1QPOA 2A0NA 4BWLC 4WOZA 3SFKA 1KM0A 3ZFHA 4JIQA 3R13A 5G4EA 3TIMA 3THQA 3LBCA 1ML1A 4O1AA 3PM6A 3M5XA 3P5ZA 2NZLA 4AXKA 3LLDA 3W87A 2Y7DA 3GXNA 3EEGA 3L66A 2FIQA 3HG3A 3E49A 1B57A 3BLEA 4Y8FA 2R94A 1EP2A 1RQBA 2J9YA 1A5BA 2HTMA 3Q58A 5K9XA 3C6CA 1GTEA 2QJIA 3VFLA 4CCCA 3KHJA 3RF9A 1OYBA 5DELA 4HNNA 2NX1A 5HQEA 3GR8A 2CLEA 2PC4A 3NQGA 2B7OA 4ADSA 1H51A 2JKEA 4O15A 5D2YA 3RU6A 1OVDA 1UASA 2ZA1A 4UCGA 2E5BA 3W7IA 1LCOA 5I3FA 4JYDA 1DV7A 4DBDA 4JEQA 4C1KA 5FF3A 3LTPA 1M7OA 3W7CA 4X3ZA 2CZDA 3CB8A 1OFDA 3EWYA 3QQ1A 2J27A 1YADA 1OHLA 3E9AA 2ZRWA 3M47A 4AHOA 3G1DA 1QNVA 4FX7A 1ME9A 1I2RA 4I7WA 3DKLA 4JTKA 1TTPA 3CWOX 1YPFA 1M5WA 3N9RA 1D3HA 4AF0B 1WDWA 1KM3A 1H5YA 5HNRA 3A5VA 1IIGA 2FPYA 4O0KA 4LY8A 1VLWA 1K8YA 1TSIA 1MO0A 3SY5A 3N2MA 3PC0A 1V5XA 4IMDA 1GPWA 3NGJA 3G0SA 2ISVA 2PURA 5IBXC 1DQXA 1K7XA 1P4CA 3Q94A 3G8RA 1TB3A 5HWNA 1GWJA 4GUFA 4I7UA 4LVBA 1G6CA 1SFLA 3O1NA 4FIRA 3MYOA 1WBHA 2BSLA 1GYNA 1FXQA 1GZGA 3W7EA 4O13A 1JULA 2Q8ZA 1Q45A 4HPJA 3O15A 1TQXA 1A5AA 4NNBA 4RZ4A 1TCDA 4N9DA 1VRDA 4IXHA 4W9TA 1FCVA 1F6PA 1LTDA 3DHFA 4LVDA 3STCA 1XBYA 4NX5A 3PUEA 1W3TA 1JUEA 1CX9A 3W7HA 2C6QA 3N34A 2B4GA 1DJQA 2IQTA 3LBMA 5F4WA 1KLZA 4UTMA 1VHNA 3I7SA 4PTNA 1LRQA 2C18A 1BTMA 2WNNA 1EIXA 4KFOA 5K3VA 2CLFA 3KRUA 1WOAA 4JTSA 1C29A 4HPXA 2ZBTA 4WX2A 5LNVA 5BMWA 2QAPA 3EWWA 5D03A 2Z1BA 1N8FA 5CG7A 4BWLA 4XZ9A 4AWUA 2YXGA 2Q8LA 5HMSA 1H7WA 1T96A 2Y61A 1XCFA 2A7RA 4WY0F 2ZYFA 3RNDA 1MZHA 1VR6A 1PL9A 3B06A 1N7KA 2YYTA 3CWNA 3USBA 2CW6A 2VELA 3MP5A 4IMFA 3UXDA 5I3IA 2VENA 1SZFA 1VYSX 2CLIA 1OYAA 2DZWA 1W5MA 3L2IA 4Z08A 3SI9A 1GVQA 1ZHAA 3ZS4A 3HGOA 2A21A 4X9SA 3GDLA 1JQXA 4JIPA 3DGRA 4UTKA 3MHFA 4NX0A 4AMAA 4XKYA 2QEZA 4XBSA 2RDUA 1OX5A 1KV5A 3CIXA 1XBVA 3EXTA 1LBMA 5KZMA 4FX8A 4OV9A 4JGDA 4Z1BA 2J88A 4CQ9A 3E0IA 4LUJA 3LCIA 3EXRA 1W56A 1SW3A 1HFBA 1BWKA 3W74A 4PL1A 1TPUA 4UR7A 3TAKA 1FCUA 2QDHA 3W1XA 3BG3A 5DCDA 3PB2A 1P0NA 4NJKA 1GG0A 3W7KA 1MXSA 1ALDA 5HJLA 4O52A 3GYEA 3LCXA 3W23A 4ZL1A 3FA5A 3LB0A 2VFDA 3NQ2A 5BNKA 3UPWA 1TV5A 4DO6A 1G4PA 1H50A 3M16A 5DXXA 3MBFA 3PULA 1YDNA 1OF6A 1LRTA 1LBFA 1YXCA 3FFSA 3TQVA 3P81A 3LHVA 1XC4A 3TSDA 3ATYA 3W2LA 4OWGA 2TSYA 4OV4A 4RKAA 3DFNA 3GX9A 4MFEA 1BEUA 2V8ZA 1DVJA 1YXDA 2ZZ7A 4PH6A 3IRDA 3EWZA 3NA8A 3G1YA 3QRHA 2QDGA 4CNOA 3DFPA 4S1FA 1R46A 2ZRZA 2PRLA 4JD4A 3W85A 4PL2A 3P7YA 1VC4A 4Q4KA 2J9XA 1NVMA 3GKAA 1E51A 3QW3A 5LSMA 4M6QA 4X2RA 3HMJG 2O7SA 2V2CA 3OG3A 4TMBA 2RHGA 3OEXA 4O10A 3B05A 3WJYA 4A21A 6TIMA 4QIUA 4I7VA 1VJIA 1OYCA 4MYXA 2Q3RA 4U4MA 2RKXA 3NNTA 1R2RA 1KA9F 3KVKA 3LGEA 3T40A 5CSSA 3W2JA 1SUXA 3SJ3A 1H7XA 1XDLA 3L0NA 2Y62A 1B4KA 1RV8A 3LCWA 3ZWTA 2GJNA 2ISSA 3GAYA 1AK5A 2C1HA 3A9IA 4NJJA 1XXXA 3ABRA 3NQ8A 1ZAIA 1H7RA 3UPBA 5HUOA 5AN7A 4AB4A 1ME7A 3GDTA 5HINA 1A53A 1KBJA 2B7PA 3HQ1A 2GOUA 2YPIA 3ZR4A 4UFLA 1FWTA 3UD6A 1WQ5A 4XTIA 3WK1A 3ATZA 3RMJA 3LRKA 4Y96A 4FNPA 3PWAA 4R33A 5FI8A 4P61A 1S5WA 3B0PA 2Z6JA 3LCGA 3UWWA 1FBAA 3DI0A 2C16A 1ZALA 1NSJA 3TAOA 4NT0A 1VS1A 4RX0A 5D32A 3RLUA 4R34A 1O4UA 3AJXA 1B3OA 3HPSA 4QJ1A 4IWWA 5G1TA 3QJAA 4Q33A 2HS6A 3A23A 3B0UX 4UMAA 4OBTA 4TR9A 3TROA 2E09A 3TC6A 3TJXA 2YCEA 2NUYA 5F2GA 3M41A 1GVRA 2C15A 1DQWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3G1F A;  3NOE A;  3ISI X;  1WUF A;  4RNJ A;  3G18 A;  4BEU A;  3STP A;  3BSH A;  4GQQ A;  3WBE A;  4NZ5 A;  2OEJ A;  2A79 A;  1V6W A;  5HXM A;  1WDS A;  3KVM A;  3PFM A;  1SVD A;  3S5S A;  3DZ1 A;  1J0J A;  2WKL A;  1RVK A;  2R14 A;  2NVC A;  2VEF A;  3BCF A;  2DIJ A;  1DJX A;  7TAA A;  3ZQ9 A;  1XIJ A;  5HQM A;  1XRV A;  3WNL A;  3P62 A;  1EHA A;  4A3Q A;  3KBM A;  3B8S A;  1DIE A;  3W28 A;  3EOL A;  4J9J A;  3C2O A;  4HVX A;  3UGV A;  4JFU A;  3LV5 A;  1E9I A;  1BAG A;  3LEP A;  4O1D A;  1RA0 A;  3MYP A;  3BW4 A;  3G1V A;  4Z17 A;  4ICM A;  4WUI A;  2PDL A;  3IJL A;  2PC8 A;  5CC3 A;  2BHU A;  1MUC A;  4C90 A;  4E4F A;  4Q8T A;  4GZ7 A;  1XQL A;  1EXB A;  5I78 A;  4QQ3 A;  3WQ6 A;  4AZ6 A;  4QRO A;  3IVT A;  3SDO A;  3ABX A;  1G7U A;  2ZZ5 A;  4MY8 A;  1Z9A A;  3S6D A;  3PG8 A;  4KGL A;  5REQ A;  1M1B A;  2QCL A;  4NXK A;  5ABG A;  2A85 A;  4DJD C;  1UR4 A;  3GSM A;  3LCF A;  3ZZ1 A;  1P0E A;  4GVG A;  4A8N A;  3RYS A;  2P88 A;  1MDL A;  4HD5 A;  4C6O A;  4EIV A;  4JL2 A;  2PDC A;  1XUU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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