5LGZA

Structure of photoreduced pentaerythritol tetranitrate reductase
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
AEKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Pentaerythritol tetranitrate reductase
publication title Combining X-ray and neutron crystallography with spectroscopy.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacter cloacae
total genus 140
structure length 363
sequence length 363
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5lgzA00
1K8XA 3MBFA 5C5YA 3HGRA 3PM6A 1X6UA 1LBFA 5CZJA 5CZ0A 1R46A 2V9DA 3W1LA 4OBTA 1L6SA 3F03K 3P5YA 1R30A 3N34A 1SR9A 4QITA 4DO6A 1GJPA 4O12A 3N14A 3BLEA 3UWYA 4ADUA 2H8XA 3W23A 1LYXA 4MZ1A 3S1UA 4MY1A 2ZFAA 5A8GA 5CPMA 3IRDA 4UNLA 4GBUA 2E77A 1W8SA 5HJLA 4XQ6A 3MP3A 1OFEA 1KM6A 3BVJA 1DBTA 1VH7A 1FCBA 4DO5A 5K4XA 1AW1A 1SW3A 4QIUA 4HT3A 2VELA 4A2SA 5CG7A 2EPHA 2QCFA 5HQEA 3VE9A 3JRKA 8TIMA 1TPDA 3UYCA 3Q94A 2GQ8A 2CLHA 5DCEA 5AYYA 1DJNA 3BLFA 3SR7A 3QF0A 2X30A 1ALDA 3NPUA 5I3HA 3W1AA 4OT7A 1OFOA 1R2TA 3EB2A 3PSVA 1GVQA 4AH7A 1LDCA 1GVRA 3GIYA 3NZ1A 2DJLA 1SZEA 1UUMA 3UPBA 3W3OA 1WOAA 1ICPA 5K9DA 1FY6A 1JVNA 3EWBX 4WXZA 1FWRA 2A6NA 3W2KA 1UB3A 4LWWA 4XWUA 2ZRVA 4UFKA 1OX4B 2BX7A 1OFRA 3FLUA 4NQ1A 1X8FA 1HTIA 3M5YA 2DJXA 4I7WA 4FX7A 2B7PA 3IVSA 3M41A 3QPZA 1XBYA 3W72A 2NWRA 1TRDA 1P1XA 1RQHA 3QRHA 3S5ZA 6TIMA 3PG9A 3TNOA 4LU0A 3O06A 1I2QA 4LS2A 1C8VA 3G1XA 4JX5A 4NZFA 5FEPA 2NUWA 4DEFA 1VYRA 2ZRYA 4UFJA 5EY5A 3LV6A 4O10A 1H7NA 3W7QA 3QMRA 5L9FA 3KVKA 3VE7A 3TIMA 1JCMP 3LLDA 1KTCA 3LCGA 3FYOA 4LV9A 2CZEA 3SFKA 4AWSA 3QM3A 3ABRA 1JUEA 3N73A 2H3BA 2E6DA 3CIXA 3THQA 1B4EA 2DZTA 4ONVA 1DL3A 3HJZA 3PB2A 2RDWA 3RFAA 4UTWA 1QNVA 2A6LA 3IGSA 5CZSA 4NZJA 2VFHA 3R12A 3CQ0A 3QH2A 1IXPA 4RX0A 1XUUA 3TW7A 1IIHA 4IPJA 1KFLA 5EYWA 1JJKA 3LHTA 3TX9A 3WK1A 2ZRUA 5FF2A 3KFTA 4CNOA 1MEHA 2Y63A 3BW3A 1PHQA 4IMGA 4NNBA 4JTGA 4JEQA 1B3OA 3GAKA 4LTSA 4BI6A 4Q32A 5G2IA 5G4WA 4WOZA 3NYZA 1ZALA 4AF0B 3LCHA 2KZHA 5IBXC 3G0XA 1SW0A 3TSMA 3UWVA 1LLZA 4NJIA 1K8YA 3WK2A 1KM3A 2QUVA 5LGZA 5DBUA 4GUGA 3LM7A 4QM1A 4K7YA 4BF9A 2CW6A 1G4PA 1Z41A 1LTDA 2Z2UA 3DFTA 4O4VA 2FJKA 3GXPA 4ICNA 3PSWA 3WJWA 1XBVA 3GDKA 4GUHA 3OG3A 5E1QA 1P4CA 4Z0JA 4C1KA 4UR8A 2CLEA 2QJGA 5D02A 3N19B 5AC8A 3D0CA 2NLIA 3HOJA 3F4NA 3QQ0A 3GVGA 3UXAA 3TA6A 5EA9A 3GDTA 3S9YA 3P8JA 5G5IA 3FA5A 1GEQA 1LRNA 4O54A 2NXHA 4GE8A 3W7CA 5FF4A 3W9ZA 4MLJA 2NUXA 2E09A 4LW7A 4CQAA 1TQJA 1H61A 2V2HA 4MFDA 1JCXA 3CTLA 3ZWTA 1XI3A 4IGHA 3NQ2A 3B03A 3PUEA 3LXCA 3W07A 2QCEA 4M6VA 5IM51 1TPEA 2QAFA 1QPQA 2JK2A 1F6PA 4JD4A 4BR1A 5HR6A 4EIVA 2J9XA 1LM1A 1S5WA 3UZ5A 2TRSA 1H7PA 1ZAHA 2YW3A 3HF3A 5TIMA 4Y96A 2FFCA 3LHYA 2BXVA 5D03A 5F4SA 5FI8A 1XBZA 3BK0A 1O5KA 4PFMA 3HPSA 4FEZA 3RK8A 1MXSA 4M6PA 3W1PA 1BEUA 3CM4A 1FDJA 1J2WA 1H7RA 1ZAIA 3LRKA 4BI7A 3MI3A 3P74A 4NJJA 3TROA 2VEKA 3HBLA 3P80A 3QW4B 4ZZ9A 1EUAA 1VC4A 4XBKA 1EWEA 1H7XA 2J88A 4Q33A 1OK6A 1XCFA 4CQ8A 5K9XA 4N9CA 1W5MA 4PH6A 3OA3A 4O15A 1GQNA 1GTEA 4LY8A 4UCGA 1H7OA 2ZZ5A 2J9YA 3C2OA 4N9DA 4OV4A 5I3IA 3GK0A 2QCMA 1VJIA 3L67A 4JYFA 2E6YA 3K30A 4DBDA 2C13A 3HPXA 1Q6OA 3LXBA 1TJRA 3W1XA 3W75A 1OK4A 4LV4A 2GJLA 5LNUA 4K37A 3I7RA 1Z48A 1LRQA 1ADOA 3KOFA 1WA3A 1HL2A 2QKFA 3W7OA 2P1FA 1AW5A 4ADSA 2ZZ7A 4N6FA 2JGYA 3RMJA 4Y6GA 3EXRA 3TAKA 2ZZ2A 1VRDA 1AG1O 2QF7A 3R5EA 3WK0A 1N8FA 1G4TA 3TQKA 2PCQA 1KTBA 1KV5A 1VCVA 5AHNA 3W1NA 1PCWA 3NZRA 4U4MA 1M5WA 1XBXA 3L0NA 1SSGA 2WV8A 3OHIA 4GRSA 2I14A 1WBHA 4LVAA 3TW6A 5D33A 3UZJA 3NL5A 3LHWA 2VFFA 1H62A 2YFNA 2RH9A 3DENA 1TJPA 2CLMA 4HNNA 5G4EA 2QCHA 2HS8A 2JKAA 2GOUA 2UV8G 3NPXA 4PTNA 2DP3A 4O50A 2E5DA 3NQ7A 3O8AA 3STFA 4JTJA 1F5ZA 2WSRA 3P60A 3PS7A 3FS2A 3W7HA 1P0KA 1ZNNA 4E2BA 1M7PA 3O6CA 3CIWA 3LRMA 3PY2A 1F6KA 1S3HA 1GVFA 1H51A 3A22A 3MMTA 2TYSA 4AWUA 3GNDA 3W73A 1FQ0A 3B0VC 3IGXA 3I65A 4BK9A 3R13A 5LNVA 1IGSA 1X1ZA 1O60A 2NZLA 2TMDA 4JTUA 1GTHA 1QO5A 4O18A 1ZFJA 4FF7A 3UQNA 2OZ0A 3LCLA 3SZ8A 1VR6A 1IF2A 2Z1BA 1OYAA 3PBYA 4DF2A 3G24A 5DXYA 4XUGA 1R47A 1JRBA 1QPOA 4WZHA 3WJYA 3BARA 1TV7A 3LCXA 3LXAA 4G1KA 4HSOA 5HNRA 4NX0A 2NV2A 3VFLA 1DQWA 3AJXA 5FEZA 2RDTA 5HWMA 1J5TA 5LNSA 4IX2A 3SECA 2WPBA 4EF8A 3G1DA 1Q3NA 3CEUA 2P10A 5MHBA 1A5SA 3TU9A 3ZWSA 2B0MA 2ZTJA 2AAMA 3QSTA 3WJZA 1NF7A 1OVDA 1TMHA 4DBEA 1DQXA 1F73A 4R34A 3P8IA 1PHWA 2WSYA 5F4XA 1D3GA 3QQ1A 1L6WA 4RKAA 3W22A 4JTTA 1TREA 2ABAA 4RZ4A 4TMCA 1JCYA 3LB0A 3MP4A 4O14A 3DU0A 2HMCA 4D2JA 1ZY9A 4O1BA 3OIXA 1FCVA 5HR7A 4IWWA 3PBUA 1GPWA 4WUIA 4AHPA 4UR7A 3S8HA 3IV3A 1VHCA 1AMKA 1TPB1 3S5NA 1GG0A 1FXPA 1TYGA 5D37A 2OT1A 3C2VA 2ISWA 3WJXA 3TV8A 2ISSA 1VLWA 2ABBA 1W3TA 3EX2A 3SW6A 1W5OA 5E0KA 2WKJA 1G67A 1LOQA 1K7FA 5DN1A 1UJPA 4MUZA 3W7DA 4A22A 2W79A 4JN6A 1RR2A 4EVZA 1TCDA 4ZQOA 4ADTA 3GR7A 3GX9A 3ABOA 4KKXA 3NAVA 3EX6A 5FF0A 1OYBA 1BTMA 4XTIA 2ZA3A 2FLIA 4K38A 4BI5A 2AQWA 4B5NA 2I9EA 2ZBTA 1R2SA 1UUOA 5C6MA 4QNEA 1JCLA 3T44A 4A3UA 4IOTA 3PF3A 3O6DA 3L66A 5J5DA 1HO1A 1TTQA 3OVRA 1H63A 4UC5A 3HGOA 4PEKA 3LBCA 4FNPA 4RLIA 1SPQA 4WXYA 3TSDA 3CHVA 3G3MA 1K8ZA 1I45A 4GUIA 3NG3A 2X1TA 1SFLA 2VC6A 5AHMA 2A2IA 4JYDA 3QEZA 4LRTA 4IMEA 5BOOA 1KW1A 1O94A 1XM3A 3ATYA 2DORA 3PWAA 2OCZA 1WDWA 2NV1A 1NEYA 3N9SA 4JS3A 3LGEA 3W74A 3S0CA 3I7QA 1W1ZA 3I68A 2QCCA 4JTEA 4JTLA 2CU0A 4PA8A 5HUOA 3B8DA 4J9JA 2NUYA 4UTMA 4ALDA 1XDLA 2ZTKA 3CWNA 2YYTA 2C16A 4WJEA 4O1CA 3P81A 3ELFA 1L6YA 3L2IA 4R7JA 2ZZ6A 4HPXA 3EWYA 4O8RA 2QAPA 4WY0B 4AB4A 5FEWA 3MJYA 2DZVA 3G18A 4RXGA 4Z1CA 5DELA 2YW4A 4NJKA 5KINA 1KM4A 1N55A 4QISA 4MJZA 1K02A 3EKLA 2CWNA 4X9SA 3C2FA 4HNTA 2QR6A 2DZSA 3GB6A 4R53A 3C6CA 4MYXA 4PL1A 5EPDA 1HO4A 4JXCA 1DKWA 2QUUA 1OF8A 2VEMA 1W37A 4S2BA 1KFEA 4BWLA 1T8XA 3W7PA 3W2UA 2YCEA 4YXGA 3B4UA 4X2RA 2FIQA 3W85A 3C3NA 1FWWA 4YLWA 1ZAJA 1TTJA 4X3ZA 1A5CA 1GVOA 5LHEA 4K6AA 1WAUA 1M7OA 3MO7A 3PBVA 1GWJA 4K36A 1SSDA 5KZMA 3W1QA 4TU1A 1EEPA 5LNRA 3LCWA 1A5AA 4Y9AA 2V2CA 5CGQA 1FCUA 1MZHA 3STGA 2Q8LA 1H5YA 4UTWC 1MEWA 4E38A 1OYCA 1OFBA 3S42A 1LOSA 1D3HA 4O4WA 2B7QA 3GZ3A 4MYAA 3NQVA 4ZL1A 5DCDA 2G95A 4N9BA 2NX3A 3EEGA 4AHOA 1EB3A 1GT8A 2WOQA 2J9ZA 5BW6A 4PODA 3ANYA 3NPVA 5HWNA 4GJ1A 2CZFA 3W7EA 3W87A 5F2MA 1FDYA 1W31A 1TB3A 4IMFA 6ALDA 4TO8A 4O17A 3O63A 2FPVA 3L5AA 4RV8A 3USBA 3EX4A 4LVDA 1YDOA 1QPRA 2YXGA 1CW2A 3MP5A 2X16A 2V2DA 3DHDA 4UTJA 3UNDA 5L6UA 1EA0A 1KM1A 3G1YA 4S2CA 4M6QA 4UMAA 2Y70A 3O05A 3NO5A 1KM2A 1XDMA 4UFHA 4ZQMA 3GDLA 2RHGA 3HB9A 1F7BA 1ICQA 3JS3A 2CLOA 4JYEA 1K3UA 3NQGA 3M5ZA 1DHPA 4UTKA 1KFCA 3FIGA 1DJQA 1FUYA 2NXGA 1PS9A 4FX6M 4JTHA 3FEMA 3UPWA 3S5YA 3MYPA 4IQLA 2EAWA 1RZMA 5G1YA 2VENA 4NT0A 1GG1A 3U8GA 2QDHA 2VOMA 3LHZA 5D38A 4IXXA 3BG9A 4XKYA 4AXKA 5FESA 4AVFA 1EUNA 1PCKA 5BNKA 1AW2A 1ME7A 1PIIA 1CX9A 1SZGA 2C18A 4PCFA 3DZ1A 1IIGA 3INPA 4A21A 3UWWA 3NQEA 2C6QA 3TAOA 3W6YA 3W7IA 3STEA 4JDBA 3DI1A 3E12A 1XL9A 4UNKA 4NNAA 1G6CA 3P7YA 1OG0A 4MFEA 5CPNA 4UIOA 1VQTA 3G0SA 4FIQA 4RJEA 3W7LA 5DY3A 1VHNA 4O28A 1JQVA 4OE7A 3P82A 3P5ZA 1P5BA 3GXTA 3FYPA 3UXDA 3W1UA 1YYAA 1ZENA 4NJGA 4LNYA 3LCFA 2WO5A 3KRZA 3N2XA 3RLUA 1NF0A 1I8JA 4NU7A 3W2NA 3DKJA 4I7UA 4FNSA 3WFAA 5K3VA 1Z44A 2PRMA 3TC7A 1TQXA 3LERA 4QJ1A 1FX6A 3Q58A 4ORMA 5F1UA 5G1TA 2HSAA 1YADA 3NVTA 5LZLA 3E9AA 4XBSA 1T96A 1LRTA 3W88A 5C54A 1JUBA 5I3GA 3CC1A 3MI2A 3GKFA 5K9CA 4FNRA 1ML1A 3NQ6A 4UTTA 1RQEA 3NM3A 5ABTA 3LV5A 5AHIA 2YR1A 1X1OA 4LS1A 1Y0EA 4GWEA 4NXKA 1OX6A 2ZCGA 4N4QA 1LCOA 3NOEA 5HWJA 4LS0A 5AHFA 5K4ZA 2Y7GA 1SO4A 4PL2A 3KVJA 1X7FA 2Y88A 3FJ6A 3Q37A 1FXQA 1TO3A 2A21A 2NXIA 4YCOA 2A85A 5DCBA 3DFOA 5BMWA 2Y7EA 3CT7A 3TUUA 1H60A 3QPYA 2WSQA 3T4CA 3STCA 2FPYA 2ALDA 4HNUA 4N2YA 5SWUA 3T78A 2ATSA 1YDNA 1VLIA 2JKEA 4TX9A 1LORA 3FFSA 3O1NA 5D2VA 3LBMA 3GXNA 3MUXA 4M7TA 5LNWA 4O53A 3QMSA 2X1RA 4OU1A 3TKFA 3LRLA 2A0NA 3QYQA 1DV7A 3C61A 3M0ZA 3U6WA 3H53A 1HFBA 3BW2A 3B05A 1A50A 4AWTA 2OT0A 4YCPA 3MW7A 4XTDA 1M6JA 4FIRA 2FB2A 5J5RA 4Z1AA 4RXFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4WSJ A;  3MBF A;  3PM6 A;  3B4Y A;  1A5U A;  3H4X A;  3W1L A;  5ABH A;  3CAV A;  3F03 K;  4ENL A;  5DX7 A;  3P5Y A;  3L4Z A;  1R3V A;  4W7W A;  3BLE A;  4ADU A;  3T0D A;  1F8I A;  3EA1 A;  2H8X A;  3W23 A;  1OGB A;  1M1B A;  3S1U A;  3H2A A;  3H2M A;  4CU7 A;  1YRR A;  4UNL A;  1GOR A;  4HA1 A;  1NJJ A;  4KWS A;  4XSM A;  1FCB A;  4DJF C;  5K4X A;  2DEP A;  4WDT A;  4QIU A;  3FDG A;  3OLE A;  4QSF A;  5CG7 A;  3UT0 A;  2J25 A;  2HXU A;  2XGB A;  3VE9 A;  3JRK A;  3VGB A;  3UYC A;  1OT1 A;  2GQ8 A;  4CUC A;  3HU7 A;  1E3X A;  3BLF A;  3SR7 A;  2VZS A;  3B8U A;  3NPU A;  5JBF A;  5E6Y A;  3H2O A;  1DYS A;  3NZ1 A;  2DJL A;  4PYS A;  3AS3 A;  1FY6 A;  2J7H A;  1MDR A;  3HZ3 A;  2VTF A;  4UFK A;  3RUB L;  2BDQ A;  2BX7 A;  4QDP A;  1OFR A;  3FLU A;  1X8F A;  3M5Y A;  4L6H A;  3QPZ A;  1XBY A;  4H9X A;  1TRD A;  4HOW A;  4QLJ A;  3N6H A;  3O06 A;  4NZF A;  4DEF A;  4C7D A;  4UFJ A;  3LV6 A;  1H7N A;  1PKM A;  1JCM P;  1UOZ A;  2IKH A;  3IAN A;  3II1 A;  4HPH A;  3WLH A;  1OD0 A;  3FYO A;  4YVP A; 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