5LHEA

Phosphoribosyl anthranilate isomerase from thermococcus kodakaraensis
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
207
structure length
207
Chain Sequence
VEFVKICGVKTMDELRLVERYADATGVVVNSRSKRKVPLKTAAELIEMAEIPIYLVSTMKTFPEWANAVEKTGAEYIQVHSDMHPKAVNRLKDEYGVSVMKAFMVPRESDDPAEDAERLLELIGQYEVDKILLDTGVGSGRRHDYRVSAIIAKEYPIVLAGGLTPENVGEAIRWVKPAGVDVSSGVERNGVKDRVLIEAFMAVVRNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase
publication title Crystal structure of a phosphoribosyl anthranilate isomerase from the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakaraensis.
pubmed doi rcsb
source organism Thermococcus kodakarensis (strain atcc baa-918 / jcm 12380 / kod1)
total genus 82
structure length 207
sequence length 207
ec nomenclature ec 5.3.1.24: Phosphoribosylanthranilate isomerase.
pdb deposition date 2016-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00697 PRAI N-(5'phosphoribosyl)anthranilate (PRA) isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5lheA00
4WD0A 1XUZA 4WOQA 1KA9F 1UB3A 1UUMA 2ABBA 2ZYFA 2DZSA 2ISSA 2YSWA 3LHYA 4FXSA 4LWWA 1SZEA 1ICQA 1PV8A 4R7JA 3P8JA 3MHFA 3L67A 3QSTA 1P4CA 1V7YA 4IX2A 2YYTA 3B8DA 3I7RA 3TIMA 1Q6OA 2H8XA 1TPEA 4DEFA 3W1LA 2ZTKA 4JX6A 1TTIA 3G8RA 1H1ZA 3P67A 1EX5A 4I7VA 4UTIA 4GUFA 4AWTA 4UTTC 4IX0A 1IGSA 2CLMA 3KHJA 5AYZA 1GVQA 3QEZA 5EKYA 4RXFA 2YX0A 3GR8A 4NJHA 1AL7A 1KBJA 2OCZA 4FNRA 2YPIA 1FY6A 4IUOA 3S5OA 1I4NA 4FXRA 1H7NA 3MHUA 2GJNA 5L9FA 2VEMA 3W7MA 1UASA 5EYWA 4U4MA 2VENA 3F1QA 4AAJA 3TXVA 3U6WA 3P84A 3QYQA 3M5XA 4BI6A 1QO5A 1YTDA 7TIMA 4JTIA 3M9YA 1R2SA 1VRDA 3IV3A 3L66A 3STEA 2GQ9A 1GYLA 4I9AA 4DF0A 4HPXA 2CWNA 5CPNA 3C2FA 1RPXA 3W7LA 3NA8A 4A2RA 1F05A 1QFEA 2QDHA 1EP3A 3TH6A 2CW6A 3UWVA 1TPUA 5FF3A 3LV6A 3M47A 3NL5A 5G2IA 2V82A 4N4QA 1YPFA 2ABAA 3S1UA 2CLIA 1F73A 3PS7A 3A5FA 2J9XA 3LRKA 3HG3A 2NV2A 3HQ1A 3S5NA 3EX4A 1HO1A 3O6YX 4MZ1A 4CCDA 3LCWA 3A5VA 4XBKA 4JTLA 3NOEA 4O18A 2GOUA 2QCHA 2Z6IA 1SSDA 4HIBA 4DPPA 5DXYA 3P74A 4M19A 3G1VA 4B5NA 1G4SA 1A5BA 3QQ0A 4FIQA 3W3OA 4AB4A 3TNOA 2E5BA 4K37A 4GFSA 5G2HA 3L5LA 3BLEA 4S2CA 2PRLA 5D05A 1PCKA 3W70A 1Z48A 1G67A 4QJ1A 3UWQA 4NUWA 3ZWSA 2G96A 1A50A 2V30A 5CG7A 5F4SA 3DFNA 1EWDA 3NNTA 5G2WA 4ADUA 2GPTA 1TJPA 4N6EA 2OMAA 4UNKA 4PCFA 2Q3RA 5J5RA 1RD5A 2A5HA 4JTJA 2B0MA 1GG1A 2A0NA 3M1ZA 1AMKA 3PSVA 1I2NA 4BR1A 3LX9A 2PE4A 5MHBA 4O53A 1YDVA 3M5VA 4LS2A 2BWGA 3QPYA 1N7KA 3W07A 3OIXA 2R91A 4PODA 1TPDA 2QUVA 3E0IA 3RU6A 2VFHA 3FJLA 3EWZA 3P62A 1U83A 3PG8A 1LBLA 4JY8A 4Z0SA 3DENA 4AWUA 4AH7A 3W72A 1Z41A 4L4LA 1XFBA 4Q33A 2CZFA 3LCHA 5I3IA 1OFRA 1GWJA 2V2CA 1THFD 3PBWA 5CKSA 4UCGA 3G1YA 3I7QA 4ZZ9A 1T0OA 3G0UA 5D38A 3FFSA 1D3GA 4K8HA 4G1KA 1QAPA 4XKYA 3H54A 3IGUA 5HJLA 1AW5A 3HG5A 3BVJA 3W6YA 3JS3A 4IMEA 3S5ZA 3LHTA 3LCIA 2F84A 1OYAA 3FIGA 2V5LA 3VNDA 4M6VA 4WY0F 4UFIA 5TIMA 3NR0A 1LROA 3NPXA 2WSQA 2ZZ4A 1SW7A 2I1OA 1OX5A 2BTMA 2OX1A 4IOTA 4MYXA 4MJZA 1Z44A 1MO0A 1C9DA 1LTDA 1K8XA 3T55A 5AOUA 1TTQA 3R5EA 1QO2A 2QUUA 1KM6A 3G0SA 4FIRA 4UR8A 2NWRA 3N9SA 4JTKA 1KV8A 1OJXA 2H8ZA 4JICA 4RCXA 4RXGA 4POCA 5K4ZA 1DVJA 3M44A 3E02A 3WJWA 5FEZA 5TBOA 5AC6A 2R14A 1IF2A 4ZMGA 5KZDA 1VJIA 1W5PA 2P10A 1GYNA 1KFCA 5DY3A 3CIWA 1H62A 1SZGA 1LOQA 5K3VA 1SW3A 2C16A 2NZLA 3I68A 4RK8A 1QPOA 2VFEA 2GJLA 2P1FA 3FKKA 1DHPA 5KTLA 3LHZA 4U28A 2FQIA 3W71A 4K8EA 4NX5A 2UV8G 4JTTA 5CZSA 4K7YA 5DCBA 4PL1A 5K9CA 3TR2A 2Y7DA 4Y6GA 1DQWA 1FWWA 1N8FA 1JULA 3ABSA 2A7RA 3L21A 2J24A 2NUXA 4O8RA 1ZAJA 4A2SA 2BSLA 3W7HA 5DXXA 3H55A 4NJJA 3O06A 1TV7A 3PBVA 4RJEA 1LDCA 3UY7A 2C18A 3GB6A 2DZXA 3MI2A 3C52A 4A21A 1M7PA 1WBJA 3G22A 5HR6A 2PRMA 2DZUA 4XWUA 3SGUA 4EIVA 3NZ1A 1K7XA 4FF7A 1GZGA 3GKAA 1R2TA 6ALDA 2J88A 3FYOA 3GIYA 1LRQA 3ABQA 2JKAA 3QZEA 3W7JA 4XQ6A 3L5MA 3N2MA 5F4WA 3MJYA 3LHVA 1TPB1 1IXOA 3UD6A 2DJLA 4X22A 2YZRA 2WSYA 4N4PA 4O10A 3INPA 4PTNA 4UTLA 1VR6A 4ZVJA 3E9AA 5G1TA 3KVJA 3PR2A 1PVNA 1FWSA 3O16A 3IIXA 2DZTA 2FFCA 1FQ0A 1LLWA 2VFIA 4QISA 4ZQCA 2Y89A 4O0ZA 1F6KA 3BPWA 4NZJA 3PB2A 2I9EA 3TSMA 2B7NA 3MBDA 5EL1A 3GYEA 3W2JA 3DI1A 2IQTA 3ANYA 4MJMA 4LY8A 4MPQA 4MFDA 2WOQA 1KM3A 3W7IA 4EOUA 3DAQA 4MY1A 1TYGA 4QAIA 4PA8A 3W7OA 4DXVA 3BW3A 3WJZA 1SW0A 4I7UA 2A2IA 4IPJA 4C1LA 2V2DA 2EGZA 1YYAA 1E51A 4OQVA 1BEUA 3L2IA 2RDTA 1YDNA 1R30A 1C29A 3RNDA 1NFBA 3L65A 1HFBA 2H3DA 5LNVA 5D03A 3GLCA 4LOCA 1O94A 3N2XA 3W2KA 5EA9A 1EIXA 3KX6A 1OVDA 4NX0A 4NNAA 4GWEA 2QJIA 3NQCA 4N9CA 4UTKA 3GDLA 2YW3A 3CHVA 1LBMA 2X1RA 3TJXA 3B0UX 3DFTA 2E5DA 1K03A 3DI0A 3THQA 2PRHA 4HT3A 1XBVA 4JTSA 3CWNA 4CQAA 5FEWA 4IQLA 2FPTA 3IVUA 3USBA 1TIMA 2H3BA 1DJQA 4JYFA 3W7QA 3MI6A 2WSRA 3HMJG 3A24A 4QM1A 3T44A 2C13A 2VFGA 1I2OA 4GRSA 3L0KA 2OT1A 1LLZA 5F2MA 3O6CA 2VFDA 1DV7A 5D2YA 3GXPA 3LCFA 2FPVA 1G4EA 4XTDA 1RQEA 3T4CA 3DFOA 4AXKA 1OFQA 5AYYA 1TCDA 1TMHA 3GDTA 4O50A 3W73A 1TV8A 1ZHAA 5LZLA 4N02A 3TKFA 4WX2A 3I7SA 5LHFA 1ADOA 1OK4A 3TW7A 3EXRA 3U8GA 1JCJA 4AWSA 4KWWA 3DHFA 3BG9A 3DGRA 1RZMA 3O6DA 3W86A 5LSMA 1W5MA 4D2JA 4UFHA 2J9YA 3QW4B 1S5TA 2RFGA 4AHPA 1I2PA 2V5BA 3JRKA 4N2YA 3TDFA 1SO6A 3L68A 3NQ2A 1ZCOA 3Q94A 3CWOX 2GVLA 1G6CA 3TUUA 1J2WA 2A21A 5CPOA 3BK0A 5AHLA 3HOJA 3C3NA 2QUTA 3W85A 5CSSA 1PS9A 1W1ZA 3MUXA 1XI3A 1H7XA 1EP2A 5D2WA 1FCQA 1O5KA 3NL6A 4IPIA 3TSDA 1OFPA 4OU1A 3MP4A 4J9JA 3HB9A 5AHFA 4RX0A 4RZ6A 3LTYA 4CQ9A 2FLIA 3W1MA 3C61A 2VEKA 3EX6A 4EF9A 1KM2A 1C8VA 4LV4A 4UIOA 2G97A 4M6PA 1PCWA 3E12A 5AC8A 1DJNA 1L9WA 5A8GA 5G5IA 2PURA 4FHAA 3RLUA 3GDMA 4GBUA 1JCLA 3A9IA 1FXPA 4MFEA 3VI2A 1Q6RA 2NXGA 3R13A 3TAOA 3NQEA 3UPBA 4WXYA 4LU0A 1CI1A 2A6NA 3LXCA 5FESA 5LGXA 3QM3A 2QCCA 2C3ZA 2J27A 1BWKA 3MP5A 1ZNNA 1K7EA 3G0XA 3ATZA 2A7NA 2WNQA 1VCFA 3EB2A 3NM1A 5KITA 3BARA 5K7JA 1JJKA 2B7QA 4Z1BA 3ZS4A 1NAL1 1PL9A 5HWJA 3TU9A 4FX7A 4M7TA 3BW4A 1X8FA 4JN6A 1JUKA 1TPVA 4JS3A 4LRSA 2CLHA 4Y90A 4QITA 3F4NA 3P61A 1EA0A 2NUWA 1W54A 3TK7A 3B03A 4NJIA 2YR1A 1LBFA 2QDGA 4A3UA 1T8XA 4N9DA 2ALDA 3LRLA 3STFA 3R2GA 3NQ8A 1ML1A 4P2VA 2QCGA 1OX4B 4Q32A 3HGRA 1Q6LA 5H91A 2Y70A 3PUOA 1W56A 3B06A 3NPVA 4LT9A 1CX9A 1ALDA 4KFOA 3WK1A 1QCWA 1OK6A 4ALDA 4AVFA 1EB3A 2C0AA 4JYEA 2CZDA 1SZNA 3PY2A 3TX9A 3W88A 4O54A 1KBIA 4AF0B 4AMAA 4NXSA 1OX6A 4JTGA 4TMBA 1DKWA 5LNUA 4IWWA 2WKJA 4DF2A 4A29A 2DJXA 1W31A 3B04A 4YCPA 5HWMA 4JX4A 2YW4A 3N3MA 4FNPA 3DFPA 3L0NA 4UMCA 3LM7A 2H6RA 2HTMA 2AAMA 4OBTA 1PE1A 1WV2A 1TB3A 3QFEA 3EEGA 4W9TA 3EWXA 2VOMA 3GAKA 4LVDA 4K7VA 2DP3A 2A1YA 3M6YA 1BTMA 4BK9A 4O1BA 1FDZA 4BI5A 4LS1A 3A23A 3WK0A 5DY2A 3LV5A 5G4WA 3NPWA 1SUXA 3EX2A 3C4UA 5T26A 5GVJA 2YCEA 3NL2A 3PULA 3C2OA 1KTNA 3DHDA 1RQHA 3PUEA 3IRDA 3AJXA 2YDAA 3TQKA 1KFJA 1JUEA 3NAVA 4ADSA 1OFOA 2YGYA 3CU2A 3ABRA 1EP1A 5I3KA 1ZY9A 4UTTA 1ZALA 4K39A 3HG2A 2GVGA 3W1TA 3TQVA 2EPHA 3BO9A 3QMTA 1TQJA 1ICSA 1TRDA 3PBUA 2WV8A 4UUIA 3KVLA 3NEVA 1Y0EA 4LRTA 4UFJA 1D9EA 3NYZA 3EWWA 3KXQA 3LB0A 1R46A 1XBYA 2AQWA 2ZA2A 3LXBA 3A21A 3EXSA 1B3OA 2VC6A 1P1XA 1TRIA 2E1DA 4NJKA 1F5ZA 2ZRZA 3QJAA 3TA6A 2ZRVA 5CGQA 1OFBA 1SO3A 3CIXA 3BG5A 1LOSA 3EXTA 1NSJA 5LGZA 3W84A 3WK3A 2ISVA 1TPWA 4WOZA 4DO5A 3HGSA 3W87A 1XDMA 1VYSX 1WOAA 2XFWA 5DCEA 4YXGA 2G5WA 3W7NA 3W83A 3W2NA 1VYRA 1K8ZA 2E5CA 1QWGA 2ATSA 3O07A 5D2XA 1GVSA 1LCOA 3SGZA 3QH2A 5F1VA 4DBDA 3TQ0A 3P5ZA 1NEYA 3LCXA 1MEIA 2QJGA 3E96A 3UZJA 2QCDA 2G95A 4M6QA 2V2HA 1GT8A 4UFLA 4WJEA 4ZQRA 1SFJA 2NWSA 5HUPA 1TTPA 2ZDRA 3OVRA 1D3HA 1LOLA 3MBFA 2FTPA 4XUGA 1LRTA 2W79A 3HBLA 1P0KA 4JX5A 1YPIA 3EKZA 1W5QA 3NXFA 5C54A 5IBXC 2YYUA 2GUUA 3N14A 3ELFA 4O52A 4HNVA 5CPLA 3GVGA 3BLFA 3TMQA 4ADTA 4OGZA 1YTEA 1LYXA 2B7OA 5FEPA 4GUGA 4CNNA 4UFKA 1LRNA 2OJPA 1KM0A 4IGHA 1VQTA 1KTBA 3W1UA 4PFMA 4UTJA 4EF8A 4PL2A 3FA5A 1JCMP 1W5OA 1KFEA 1FXQA 4GE8A 4KKXA 4DO4A 4MZ8A 3WJSA 1ME9A 5AHEA 3LCLA 3BLIA 2VKZG 4O57A 2QCMA 1R2RA 2QR6A 4LUIA 1EEPA 4MZYA 3I6RA 5C5YA 5IM51 1G4PA 1K8YA 4X3ZA 2RDUA 3P60A 3QMSA 5CZJA 1I2QA 1DORA 1QPQA 3NQAA 3PG9A 1TO3A 3RK8A 3CLMA 3WJYA 1S5WA 3YPIA 2C19A 3LBCA 3IEBA 1HUVA 5KZMA 1H1YA 3FS2A 3QPZA 2DZWA 3NQGA 1I45A 3NQFA 3G1DA 4JXCA 3THAA 1DQXA 1OYBA 3LBMA 3NQ6A 2NLIA 3W1RA 3ATYA 1XL9A 3C0JA 2R8WA 3ZWTA 1JR1A 1GEQA 2NV1A 2NUYA 3PBYA 1XBXA 1TQXA 5I3HA 1S3HA 4EVZA 4PEKA 2XN1A 2CZ5A 1ME7A 2NXHA 3QW3A 3B05A 1A53A 1H7PA 1ZJIA 3W7CA 3FJ6A 1ICPA 5BOOA 3NM3A 3HGOA 1QOPA 4H6KA 4UR7A 3W75A 4R34A 1LORA 5HUOA 5C55A 2W0UA 3NZRA 4UC5A 1KLYA 2HS6A 4N9BA 2ZQ0A 3LHUA 2OZ0A 4YLWA 1KFBA 4Y8FA 3PUDA 2ZBTA 4KFNA 2C6QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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