5LHFA

Phosphoribosyl anthranilate isomerase from thermococcus kodakaraensis
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
208
structure length
208
Chain Sequence
MVEFVKICGVKTMDELRLVERYADATGVVVNSRSKRKVPLKTAAELIEMAEIPIYLVSTMKTFPEWANAVEKTGAEYIQVHSDMHPKAVNRLKDEYGVSVMKAFMVPRESDDPAEDAERLLELIGQYEVDKILLDTGVGSGRRHDYRVSAIIAKEYPIVLAGGLTPENVGEAIRWVKPAGVDVSSGVERNGVKDRVLIEAFMAVVRNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a phosphoribosyl anthranilate isomerase from the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakaraensis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Thermococcus kodakarensis (strain atcc baa-918 / jcm 12380 / kod1)
molecule keywords N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase
total genus 78
structure length 208
sequence length 208
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.24: Phosphoribosylanthranilate isomerase.
pdb deposition date 2016-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00697 PRAI N-(5'phosphoribosyl)anthranilate (PRA) isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5lhfA00
4EVZA 5GVJA 4TIMA 1LLWA 3M16A 2GVLA 1I2QA 1WQ5A 3B0PA 3GKFA 3UWVA 5K3VA 2RH9A 3CU2A 4HKPA 2AGKA 1Q6LA 3PF3A 1FUYA 1EWDA 3CWOX 3N34A 5F2IA 4H4IA 1H63A 1ZY9A 5DXYA 4GRSA 3Q37A 3EKZA 4WX2A 3W7OA 1HL2A 1R2TA 2J9XA 4PTNA 1KM3A 4FXRA 4K38A 4FF7A 3LDVA 3DENA 1V5XA 2JGQA 3OG3A 3V1PA 3NQFA 3OVQA 2YW4A 3GX9A 2CW6A 4NX5A 4ZVJA 2FIQA 3O6CA 5BOOA 4O12A 4WY0F 3MI3A 4MJMA 3G1VA 1GQNA 3ABQA 3NO5A 1KTCA 3C52A 5I3GA 4JTIA 1TJRA 1WA3A 3EEGA 4S2CA 1ICSA 1F6PA 1FWSA 4RZ4A 5AN7A 1YDNA 1VCVA 4FX8A 4JTLA 3BW2A 4K39A 3GXTA 1GVSA 5IBXA 3QJAA 3GVGA 3DXIA 2WOQA 4L4LA 1LDCA 3GNNA 5FI8A 4TMCA 1K7EA 3TW7A 1SW0A 2LLEA 1FWTA 1KFLA 5EMUA 1JCXA 4JTGA 1JRCA 4O4VA 3PC0A 1C29A 2B0MA 3RLVA 3O15A 3GR8A 3QM3A 2Y7DA 4CQ8A 4XZ9A 3WK1A 2WKJA 2ZQ0A 3ATZA 4LOCA 4YCOA 2V5LA 1RD5A 4O4WA 3GDLA 3C2FA 1ZAHA 3GDRA 3TROA 4LWWA 4WY0A 1RQHA 4LVAA 4ALDA 1F05A 1LROA 1LBFA 5C6MA 2DZWA 4IQLA 1FXPA 3TSMA 1Q6OA 4IXXA 5I3IA 1A50A 5D33A 3ATYA 4N9EA 4FNSA 3G3MA 4K36A 4TMBA 4HPXA 3HO8A 5FF3A 4I7UA 1DVJA 2C1HA 4XKYB 2QCHA 2ZA2A 3LCXA 5CSRA 3UD6A 4N4QA 1ZAJA 4CQ9A 3SZ8A 3S5YA 3NQEA 1GVFA 4FIRA 3TH6A 2GQ8A 3W7MA 4UC5A 3FKKA 3NA8A 1OHLA 3C0JA 4GXMA 5BNKA 1GTEA 1M7OA 4AHOA 1TJPA 5FESA 2Z6JA 5K9XA 4ZQOA 1J5TA 4UTHA 4LS1A 3TUUA 3W7RA 1TPVA 2W79A 4EIVA 3GZ3A 3TQVA 3PBVA 4PEKA 2G96A 4OU1A 2YSWA 1RQEA 1LBLA 2V30A 1OYAA 3I7RA 3O1NA 1DQWA 4JX4A 2V9DA 1Y0EA 4UTLA 3QW4B 4Z1AA 3ZWSA 2A2IA 4IXHA 3L68A 3C4UA 1BWLA 1PE1A 2A7NA 4M19A 4UTJA 3GNDA 5D2WA 3I7SA 4A22A 6ALDA 3BG5A 4X22A 5AHIA 4GUHA 4MZYA 1X8FA 2X16A 3PBUA 4OGZA 3F03K 3W2NA 3W7NA 1FCBA 3M5VA 2A7PA 4QNEA 3I6RA 5HWMA 1ZENA 3BG9A 4JTFA 3CQ0A 1LTDA 1KW1A 3LHYA 1XM3A 4O54A 2ZRZA 3LXCA 4WZHA 2TMDA 4OHQA 4ORIA 1O5XA 4O10A 2QR6A 3LHZA 3QMRA 5AC7A 1PVNA 4DQWA 4NVTA 4LC8A 4H6KA 1XI3A 4MZ8A 4P2VA 5CSSA 3W72A 4DBDA 2KZHA 4AAJA 3TAKA 3EWBX 3HPSA 4NXSA 2WNQA 3PUOA 4X9SA 3GLCA 5EL1A 3N3MA 3W74A 3C8FA 4RXGA 2QCNA 1D9EA 3M5YA 2JBMA 1TMHA 2YX0A 3NQ2A 1DBTA 4FNRA 1H7WA 1JCMP 3O07A 1ME8A 1OX5A 2CZFA 2DU2A 4Y96A 2H90A 1ADOA 4MYAA 1W0MA 4FHAA 3VE7A 3GAKA 4ZQNA 3W1UA 2CWNA 3QMSA 3W1MA 2ALDA 3RLUA 3ZR4A 4AWTA 5E0KA 2Q8ZA 4AXKA 3KVLA 3MMTA 3UZJA 3FEMA 5BW6A 4UTMA 1FDYA 2IQTA 1TRIA 3IEBA 4JTTA 3AO0A 1J4EA 1TTQA 1QMLA 4KFPA 5D2TA 4I7VA 3TA6A 4ORMA 4EF8A 4GUFA 2QAPA 1WYIA 4HSNA 4I7WA 5EYWA 3TXZA 3LCIA 1F5ZA 5HR7A 5D30A 4FIQA 4NU7A 1TPB1 5CZJA 3S9YA 3W83A 4AEOA 1OX4B 1TPUA 1YADA 5AC8A 4MFDA 3W2UA 3E0IA 1H5YA 3NXFA 2NUWA 3WJYA 3BG3A 1SQ7A 1FDZA 2XN0A 4JGDA 2CLLA 2QCCA 5CKSA 1H7XA 3RMJA 1ICPA 1GG0A 1VCFA 3CT7A 2CLOA 2JK2A 4YLWA 3LOTA 3UNDA 5IM51 4S1FA 3E96A 3L0KA 4IMDA 3RK8A 4O19A 4TO8A 2C15A 3QZEA 2OCZA 3ZWTA 5G1YA 2AQWA 1SFJA 1A5CA 4FNQA 3BLFA 2CFFA 1WV2A 4A2RA 1Z44A 4ZMGA 1SUXA 5DN1A 4QNWA 1W3TA 2E1DA 2WQPA 3JS3A 1UJPA 2QCDB 1WBJA 1FCVA 5LKYA 1Q6QA 3KVJA 3EX3A 2NX9A 3PBYA 3TV8A 2YZRA 5K4ZA 5FF7A 3M9YA 1G7UA 4CLMA 3TJXA 5CG7A 3TX9A 3UWYA 5F1UA 3P80A 3R8RA 3UWQA 3VFLA 3KRZA 2ZCGA 1XUZA 2QJHA 1ZHAA 2HS8A 4NJGA 2QEZA 3IIOA 1O94A 3IV3A 5AOUA 4GNJA 1AMKA 1OG0A 3N19B 5LGXA 2VEKA 4FXSA 4WOQA 4UFJA 3ELFA 2BTMA 3OHIA 4UFMA 1EWEA 3A24A 1YPFA 1YDVA 1FCQA 4DXVA 1BWKA 5TQLA 4JY9A 1MZHA 5AFDA 3NQ6A 3G0SA 3BGGA 2RDTA 3CPRA 3G1AA 4BK9A 1UB3A 1GVRA 4O1DA 4N6FA 4P61A 1QO2A 3M41A 4M7SA 5FF2A 5F2LA 3BGJA 2OX1A 3M44A 1M5WA 2FLIA 1XFBA 3W2LA 4LUIA 1W5NA 4ADUA 1H60A 1XBVA 4TX9A 5K7JA 2OT1A 4O14A 2ZZ4A 1ICQA 1RVGA 4UFIA 3CLMA 3GR7A 4JYDA 1OX6A 2AAMA 2PE4A 4M5PA 1WOBA 3L5MA 1RR2A 5LZLA 2FQIA 1H51A 1SZGA 3EXTA 1LM1A 5AYXA 4EOUA 1K3UA 3DFOA 1DOSA 1FXQA 3LXAA 4KWWA 2ABAA 4ADTA 1TCDA 1SZNA 2GJLA 3QYQA 5CZ0A 1A5SA 1W5PA 2PRHA 4XWUA 1IF2A 3ABRA 3IIXA 3MBFA 3DHDA 4IX0A 2ZZ5A 3WK0A 3PR2A 2NV1A 1PS9A 1RZMA 2V2CA 5I3KA 5FF4A 3I7QA 1T8XA 3W7EA 3UY7A 3PS7A 3TIMA 5G2HA 3OVRA 4NQ1A 3B06A 1PCKA 3NL2A 4JR5A 1SFLA 4JN6A 3RNDA 1WXJA 3HGJA 3HJZA 3MP3A 1O60A 5AHNA 4JX6A 2A1YA 3MHUA 2FDSA 1P5BA 3W7QA 1OVDA 4QQ3A 3W1LA 1LLZA 2EHHA 5TBOA 1H7PA 2BWGA 1L2UA 1KFKA 5KTLA 2NWRA 4OQVA 2Q3RA 3DI1A 3LM7A 1JUBA 1FY6A 4MUZA 5AYZA 1TV7A 2ZA1A 3EWXA 4U28A 4NJIA 1G4TA 5J5RA 5G4WA 3G1DA 4IX2A 3P60A 1NSJA 3KVKA 3UWUA 3HMJG 3O06A 2ZRUA 4N9CA 2CLMA 2Z1BA 5HJLA 2E77A 1LORA 2A85A 1S5WA 3EXSA 3M7WA 5HUOA 1TRDA 2Y85A 1FWRA 1EX5A 4PFMA 4AF0B 2E5CA 3PY2A 4O8RA 3VI2A 3UXDA 2C18A 2QUVA 3LLDA 3P8IA 2GVJA 1O4UA 1P1XA 3M1ZA 4KKXA 3CIWA 1OFQA 1BTMA 1W3NA 4JTKA 1VRDA 3W23A 5K9CA 5LNVA 4PL2A 5E93A 3HBLA 3DI0A 2BX7A 3HGRA 3LRKA 1EPXA 3IRDA 2YR1A 2NXHA 3LHUA 4O57A 3B8DA 3A21A 1GVOA 2R8WA 4DF2A 2ZZ3A 3I65A 3HGOA 3S0CA 1TTPA 1YXCA 1LRQA 5D2XA 4OE7A 3S8HA 3QSTA 5F4XA 5EBUA 5KZDA 4LUJA 3WJSA 4QITA 1ZFJA 5SWUA 2QAFA 4LVBA 1WX0A 2WJZA 3STFA 4CNPA 3PB0A 1QWGA 2FB3A 1KBIA 1HUVA 4KFOA 3P82A 4RR4A 1Q6RA 4NX0A 4LY8A 1KA9F 2Y61A 3FYOA 2X30A 3LX9A 4OBTA 4LNYA 3NQCA 2ATSA 4O0KA 4O18A 3STEA 1K03A 5EKYA 1B4EA 3IGUA 3QQ1A 3TR2A 1UASA 2QKFA 2PC4A 3BK0A 4X3ZA 1TPC1 1TSIA 4H3DA 2W0UA 4BR1A 2ZZ1A 3NAVA 1LCOA 1YTDA 4A2SA 2E09A 4BFAA 3QMTA 1KM0A 4FX6M 4O53A 1HFBA 1KFEA 3LCHA 4HIBA 3LV5A 1M6JA 1A5AA 4IGHA 2NV2A 5AHMA 4MFEA 4E0CA 1OK6A 3LV6A 2HMCA 4IMEA 3W3OA 3C61A 5LNRA 1C9DA 4CQAA 2EGZA 4NNBA 3DH7A 1DKWA 3L0NA 4UR7A 1A53A 4WJEA 1W56A 4QAIA 2B7PA 2V2DA 3BPWA 1GG1A 1KTNA 1VLIA 2WNNA 2JGYA 3FJ6A 3AJXA 4JY8A 4A3UA 2DP3A 3K30A 2DZSA 3W7DA 3NQAA 3IIVA 1XXXA 1TPWA 3MO7A 4IMCA 3UWZA 4RZ6A 3BVJA 3IGSA 3W2KA 3A5FA 4M7TA 2B7QA 4WXYA 5K9DA 5D05A 4K6AA 3W70A 2J88A 3NR0A 1OFDA 2UV8G 2WSQA 3NZ1A 1L9WA 1X1ZA 5DY3A 3THAA 2DZXA 2GJNA 1U83A 2GQAA 3F4NA 1BEUA 2H8XA 1D3GA 1XCFA 3L0GA 1O95A 3KVMA 1I4NA 3UZ5A 3KHJA 5D38A 5A8GA 1FCUA 1W8SA 1OF8A 5HUPA 3HG5A 1JUEA 1OFOA 1G67A 3A9IA 3TNOA 1FWWA 3BV4A 3UYCA 2TRSA 3GXPA 1SO3A 3L21A 3R2GA 4WXZA 3RU6A 3W75A 3DFTA 3S42A 3E49A 3IVUA 3U6WA 1PV8A 3VKJA 2Y70A 1GYLA 1EP3A 1ME7A 5U4NA 3B04A 1YXYA 2OZ0A 2I14A 3QF0A 2W6RA 3W22A 3HQ1A 4QIUA 2BLEA 2ZDRA 4GBUA 4RXFA 2QF7A 4EF9A 1Z48A 3ABSA 3W1TA 5E1QA 1AL7A 1F6KA 5LNUA 3SY5A 5LNWA 2WV8A 3LTSA 5G2IA 1PHWA 2BSLA 5LGZA 4WY0B 3NYZA 4LS0A 4AB4A 3EX4A 1L6YA 1FBAA 3N2MA 2VENA 2YDAA 3MP5A 2J6XA 3CEUA 2GOUA 4N2YA 1UBSA 5DBTA 1TPFA 1GJPA 3N2XA 1L6WA 5AYYA 3SI9A 3T40A 1R2RA 3MHGA 1P0KA 1T99A 4PH6A 3W1RA 4UTWC 3Q2DA 3M47A 3MUXA 3LTPA 3NPUA 2G97A 4HT3A 4A29A 1DV7A 1H7NA 2VFIA 1B9BA 2ZRYA 3TFCA 3UPWA 3IVTA 4BWLC 2H8ZA 4K7VA 5H2ZA 4IPJA 1QNVA 4MLJA 2J24A 2QDGA 5AHFA 2Q8LA 4IJBA 4O0ZA 3R13A 2A21A 4PCFA 2PCQA 2JKAA 3CTLA 2CU0A 4AHQA 4MY1A 3N73A 2R94A 5BRBA 4BF9A 4WUIA 3SW6A 5DELA 4UXDA 1KFCA 2V2HA 4PL1A 4O15A 3G18A 4MOZA 1GOXA 4IOTA 2NXIA 2VFDA 3GKAA 3TFXA 3OA3A 1EEPA 3LCWA 3G8EA 1P0NA 4M6QA 4IMGA 4CCEA 2Y88A 3P8JA 2FPVA 3GK0A 5D2VA 4ZZ9A 2Y7GA 3RFAA 3CHVA 4UTTC 3NPWA 4ADSA 4X2RA 3S5ZA 3GDTA 5HINA 3OBKA 4Z1DA 1JCJA 2NUYA 3PG8A 1VCGA 2NWSA 3I68A 4NXKA 3KRUA 5CZSA 1GTHA 1ONRA 1LRNA 3PBWA 1QPQA 1PIIA 3HB9A 3DAQA 5HULA 1VYPX 5HMSA 3L9CA 3G0XA 3M0ZA 4LRSA 1NVMA 1JCLA 2V8ZA 4HHPA 3T55A 4O28A 3O05A 3EX6A 4DEFA 2O7SA 1JR1A 1YDOA 1LOSA 4UTUA 4R7JA 1QOQA 1IXPA 2E6FA 1P4CA 2ABBA 2R91A 4JIQA 4M6PA 2VELA 1THFD 1S5TA 3DFNA 3G3DA 2E6AA 2YCEA 3PWAA 2P1FA 3O6YX 3O8AA 3SIZA 3MHFA 4QM1A 4MZ1A 1TV8A 4GFSA 4S2BA 3NM3A 4JNMA 1W5QA 4JIPA 4KFNA 2I1OA 5KZEA 3TW6A 3LCGA 1SO4A 1F74A 2PRLA 1OFBA 5IBXC 4LT9A 3ABOA 4DPPA 4XQ6A 2VEIA 3O16A 3C2EA 1LYXA 2B4GA 2CLHA 4O52A 4JTSA 1JRBA 1VHNA 1XDLA 1K8XA 1D3HA 2FJKA 3LHVA 3M6YA 4IUOA 4O1AA 5FEZA 2QCFA 1OK4A 2NXGA 3QPZA 1TPH1 4JYEA 5FF0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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