5LXEA

F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase from rhodococcus jostii rha1
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
334
structure length
324
Chain Sequence
MVIKFGYKASAEQFGPRELVELGVLAEAHGMDSATVSDHFQPWRHEGGHAPFSLAWMTAVGERTSRLQLGTSVMTPTFRYNPAVVAQAFATMGCLYPGRIMLGVGTGEALNEIATGFAGEWPEFKERFARLREAVALMRELWLGDRVDFEGNYYKTVGASIYDVPEGGIPVYIAAGGPVVARYAGRSGDGFICTSGKGMELYTEKLMPAVAEGAEKADRDVAEIDKMIEIKISYDTDPELALENTRFWAPLSLPIEMERAADALPIEQVAKRWIVASDPDEAVAQIRPYLDAGLNHLVFHAPGHDQKRFLELFQRDLAPRLRGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase 1
publication title Discovery and characterization of an F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase (Rh-FGD1) from Rhodococcus jostii RHA1.
pubmed doi rcsb
source organism Rhodococcus jostii (strain rha1)
total genus 121
structure length 324
sequence length 334
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.98.2: Glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme-F420).
pdb deposition date 2016-09-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00296 Bac_luciferase Luciferase-like monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.30 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Luciferase-like domain 5lxeA00
2I7GA 3SDOA 1F07A 4US5A 1FVPA 1EZWA 1NFPA 1XKJA 4J2PA 4US5D 3B9NA 3C8NA 3B4YA 1TVLA 5DQPA 2B81A 1LUCA 5LXEA 1YW1A 1RHCA 3B9OA 4UWMA 3FGCA 1LUCB 1Z69A 3RAOA 1NQKA 1M41A 5AECA 1BSLA 1BRLA 3FGCB 1BRLB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FA4A 5BCAA 4FIRA 1CNVA 3TOPA 2DH3A 4GXPA 4G2DA 3A23A 3NNTA 3RU8X 3CPUA 1HP4A 4QSHA 1PV8A 4NRRA 3EWWA 3SJ3A 3BZGA 4M6VA 1C8YA 2Z28A 5I3FA 4ZL1A 3QMRA 1V02A 4FNRA 2XH2A 3VKBA 4R34A 1FWEC 4KETA 5FF7A 9XIMA 3KL3A 3KP1A 4A3QA 1EPVA 3ORWA 4H83A 1EC7A 2PDMA 4RL3A 3WIJA 4FOKA 2PZ0A 2FHBA 3UR8A 2XN2A 1M9HA 3Q67A 4HK7A 4EWND 1NWTA 5AHEA 2VZVA 1XG4A 1B5TA 2ZUWA 3MCMA 3N2TA 4K6AA 1IE7C 3GU1A 3VZYA 4PEEA 2J7DA 3P6LA 3STCA 1UR4A 3P5ZA 1WAUA 1D3GA 4CN4A 2VEMA 3WH7A 1WBHA 2QUMA 3IIVA 1UWAA 3L4TA 1OCNA 1MEIA 1DJIA 1GK8A 3CB3A 3AYSA 4CQ8A 2WLYA 1IGSA 4O52A 1SR0A 1JULA 4LYRA 3R8HA 3PZVA 5FI8A 3LN3A 1DJQA 1GYNA 2WVVB 3R7MA 4UNLA 4PULA 4RLIA 3CQ0A 2REQB 4ZENA 4A2RA 3LLDA 1N8FA 4QRNA 1E3XA 1K7FA 2G95A 1TZ7A 3GZ3A 1FCBA 5D33A 4IP5A 3L4XA 3L12A 1BGAA 3JW7A 2BX7A 3A9IA 3VPLA 1R7OA 4DJFD 5A8OA 2BY3A 4YTSA 2H9AB 4UTUA 2WPGA 3QGVA 3SZ8A 1HO4A 1P0DA 5C2CA 1QPKA 4RXGA 1S2TA 2OT1A 4NKCA 3ZR5A 8RUCA 2DORA 2ZZ3A 4KFOA 3V5CA 3G2GA 1UIPA 2ZA2A 5F1UA 2YYUA 1YX1A 7CGTA 3IWPA 3PZNA 6A3HA 1IR2A 1E6NA 4LH8A 1N8WA 1YKWA 2BVWA 3F7JA 3LEPA 3T78A 4YHGA 1C7SA 1GQLA 3EOSA 3O06A 3CQKA 4IGSA 3URBA 1XYLA 3DI1A 1AVAA 2QVHA 2XISA 1MZRA 1RY0A 5DANA 1NWSA 3FA3A 4S1FA 4BF9A 4GI9A 5KZEA 3M6DA 1CWYA 3N6JA 4MPQA 5M2FX 2OGYA 3KXQA 3LERA 4DHGA 2ONEA 4DJDC 1RJPA 3LI0A 3I3DA 1W56A 4MSSA 3M5XA 2XH4A 4HVXA 2FPVA 2QMKA 1LLOA 3VIMA 2WC3A 3RPTA 1KBKA 4ZE5A 5G4WA 4UBPC 3HV9A 4JQ4A 4WQ6A 2GWNA 4HMEA 2KX9A 3EA3A 3RK8A 4ZOBA 5EMUA 3ALFA 3P8IA 3THAA 1B57A 3UPWA 4FXJA 1A5KC 3URAA 3MA8A 2WC4A 3QV9A 4Q8PA 3K30A 1EHAA 3GFYA 5AYIA 1GOQA 3HG3A 2YL8A 1XPYA 1L6FA 1A49A 2CZVA 3V5OA 2GJXB 5C54A 5CZKA 4PMOA 1WA3A 3GXPA 4O1EA 2CLOA 3EEZA 4NI8A 2H8XA 3EX1A 2VD9A 3HGJA 3AUJA 5TQLA 3LG3A 4DI8A 2Q71A 1BHGA 3N18A 2ALRA 2X1UA 3TW9A 2CLPA 2Y7DA 4M7SA 4CU7A 1TV3A 2CLIA 3SCUA 3STGA 3BCJA 4LX4A 1YMYA 1RK5A 1SU5A 1FKWA 3QMTA 1EC9A 4J3SA 2DJXA 1AFSA 1P1MA 1UMLA 4O28A 2E0PA 4YVVA 1M6JA 3CNYA 2W63A 1TIWA 2IW0A 1LL7A 4YL2A 3UXIA 4GOAA 4N42A 2JF7A 4AZIA 5BROA 5DFAA 2CBUA 4LBSA 5IDIA 3M5VA 4PBEA 1E43A 3T42A 3OYZA 3L4YA 3THQA 3W2JA 3TVAA 3QXBA 4XUGA 1PKLA 3W25A 3U2OA 4F0KA 2ZXQA 3F5JA 5GQBA 3UA3A 4LVDA 1FP8A 1CI1A 3CL8A 4UMAA 2YGYA 1Q4WA 3G1RA 1U1UA 5EFDA 1OIMA 3ARVA 3HJZA 5HAOA 3VC5A 2W0UA 1K8CA 4N6EA 5KZ6A 1N7KA 4GUFA 4MPKA 4ZTXA 1XFCA 1M3UA 3CUZA 3LPGA 3WCZA 1SFJA 2NSOA 2A3LA 3WNPA 1B3XA 5H8MA 3KM8A 1AW2A 4NJKA 1EGZA 5ABGA 3FJLA 3OVQA 3SSZA 3G3DA 1XF0A 2CHNA 3ARZA 2PBGA 1UH2A 4J3TA 3K2GA 3KEHA 1KR0A 4PYSA 1VHCA 4R88A 3SN1A 2VFFA 1I1XA 2ZZ2A 4BI7A 4ZQMA 2QIWA 1XYAA 4XZWA 1LTDA 2VGFA 3OZYA 1JF5A 4AFYA 1H1NA 1PX3A 2I17A 1W1A1 2GGGA 3VD4A 3CB8A 4XD3A 1OGGA 4AF0A 1VS1A 3TN4A 3PM6A 2WVSA 1L6YA 3ARPA 3PBWA 4GVIA 3B4YA 1W17A 3GU9A 4YXGA 1S5WA 3E0LA 3WFLA 2HK1A 4MWAE 2OCZA 1VFUA 1VFFA 3R12A 4PB3A 1EDQA 4FO4A 4QCEA 3BXWA 4D6DA 1GNXA 4B2DA 2GVEA 1LOSA 1GVSA 2TYSA 1KLYA 1MO0A 3P84A 2DFAA 3MSGA 3MI3A 1HKMA 2W9MA 3DGRA 4AIUA 1J93A 2GVGA 4J1OA 3CAQA 1QPNA 3UD6A 3EX2A 3DFNA 1V6VA 3W29A 4US6A 3KBWA 1E4IA 4YLWA 2DQXA 4GQRA 4GIEA 3STPA 3AROA 3PVFA 1Z89A 3JRKA 2Y1HA 3FCPA 3BDKA 4MB1A 4LC6A 3LHVA 3GVRA 2CITA 1AMYA 2V3DA 4AY1A 3AMCA 1U83A 2Q8ZA 3W01A 2DIEA 5LIUX 3NOEA 4GZJA 4O16A 4M8UA 4H8HA 2Y5SA 4FPSA 1UZ4A 5AOUA 4GH1A 1I2OA 4ZB0A 3QBUA 2BP1A 4O53A 5HUOA 3E38A 1BTCA 1RUSA 1HJSA 3L5AA 4QLLA 4FIQA 5CXPA 4E2BA 3VKDA 2VRQA 3OHIA 4RNIA 4TR9A 1W1B1 1QI3A 4ERGA 4LOCA 3BMWA 5TAOA 2RJGA 3MY9A 1QOPA 1MWOA 4W8AA 2JBMA 3R79A 4ONVA 4URIA 1KGXA 1JD9A 1FTXA 3EDEA 1J79A 2XUCA 1EJTC 1IEWA 1OWQA 1UKOA 3LMYA 2YSWA 1J2WA 1E1EA 3ARTA 3O15A 1A5BA 5CC5A 3ZJKA 1FHLA 1CXFA 1F3EA 3DIPA 1FXPA 2J78A 4B9ZA 2DH2A 5AC5A 3VU2A 2IXVA 2W3ZA 3N6QA 4S39A 4UTJA 1QRQA 3MO7A 2HS6A 3AJ7A 3RDKA 2ZWYA 5BNKA 3LSCA 1JGMA 2F7FA 3FA5A 4KEVA 4JFTA 4I8YA 3G0XA 2DZAA 3U9IA 2NUYA 3KHJA 4L1GA 5FJUA 2E5BA 3OIHA 4ORMA 5G2WA 1VH7A 4IWWA 4AZHA 2A6NA 3GSMA 2PDYA 1UQYA 2E28A 2RJHA 1SZEA 3BJSA 3E02A 1RLCL 3BLLA 4HU0A 4PSPA 4UC5A 3H4GA 3CH9A 1DWHM 2WHMA 4XZ9A 3A22A 4H6QA 4JTLA 5GJPA 3HF3A 3SCRA 3EPMA 2P10A 5LIXX 1UWQA 3KBJA 1E73M 4XKYA 4LAKA 1QU4A 3REQA 3FJNA 1G4SA 4A29A 4C6NA 5ABFA 2BXYA 3EEGA 3O0KA 3SW6A 3TJIA 5ABHA 1P6BA 2XIJA 3BGJA 3NAVA 3T2QA 3A6OA 2WK2A 5LHFA 3SQSA 1H60A 3W84A 4DEFA 2DT0A 2C14A 3W24A 1WB0A 5CBJA 2PGRA 1V6XA 1DJWA 5CPSA 3H7VA 2BGNE 3UA4A 2OWWA 2J9YA 5A8MA 3QJAA 5D9NA 3UJFA 1D8CA 1XP3A 1A4LA 3WJSA 4C7FA 2EPHA 4A22A 5A69A 1B3ZA 1NELA 5A8PA 1QWGA 1HKWA 4U33A 3C0SA 4UZSA 2QUTA 4RW5A 4US5A 4H7VA 2F6KA 1W37A 5I06A 3W88A 4IF2A 2Q8LA 4UQEA 4BF5A 4H04A 1XLDA 3DFOA 2IUZA 4JYFA 1KFEA 4GI6A 2D69A 3AIVA 3WMCA 4I7WA 4DLFA 3KCJA 1LLZA 1RD5A 1M7PA 4F0HA 9XIAA 1AUSL 1PAMA 1TV8A 4J3XA 4K68A 4AZCA 3AS0A 1BXCA 2RFGA 1OFBA 2OU4A 4O1CA 4HB7A 5A6BA 1QHZA 1L9WA 1FWJC 2A3EA 4AEOA 5I00A 5AN7A 4UR9A 1UKSA 1ESWA 3UZZA 5REQA 1IF2A 5HBFA 3DHDA 3MMWA 3KP0A 3LBMA 4JQ3A 3LHYA 1DHPA 1G4EA 1Q7QA 3DKJA 3TYEA 3VA8A 3T07A 1UC4A 2YJQA 3FS2A 3AOFA 1TE1A 4HJFA 1KTBA 1TV2A 2WJDA 1A3HA 4HZMA 2EF9A 1IWBA 5B7ZA 2DT3A 5FSEC 3NPUA 1YTDA 2J47A 3P60A 3PPCA 2WJFA 5I03A 1RP8A 4OGZA 5CPOA 1TV5A 2R8WA 5EY5A 3M16A 3G0UA 4QJ1A 7REQB 2POTA 3DYOA 1X6UA 3VDBA 3MTWA 1XI3A 1N8IA 4MZ1A 3M7SA 1KRMA 3TN5A 4AQLA 1YTEA 7TIMA 5JBFA 1QUMA 1SR9A 4P5UA 1V0KA 1W3IA 2FFIA 1BQCA 1SYTA 2NWRA 3S4TA 4QNWA 3C4UA 3ISIX 4UXDA 4QDWA 4D6GA 1FFQA 4QLJA 4S3KA 4DBDA 3LB0A 2P50A 4PMYA 5HR6A 2YW3A 5C9XA 1XICA 4PC8A 2X8RA 4L4MA 2BOFX 4IPPA 2PI6A 4DBEA 2XFYA 1CIUA 2R1PA 4PMRA 4V28A 1JYWA 3F2CA 3OB8A 1SGJA 1LQAA 3IVUA 2DZBA 4BQ2A 4NX0A 2Q09A 3F4VA 6CGTA 1CX9A 3BANA 3L4UA 1UPPA 5CSUA 3TQKA 1YPXA 4WXZA 1GQNA 2X0HA 2Z25A 3R94A 4REQA 3RPMA 4JR5A 4F48A 4P7OA 2DUXA 3SY8A 3GIYA 2OEJA 3GTIA 1OVDA 1XBXA 3SO7A 4JHOA 5A2BA 3AMLA 2X41A 4Z2JA 1EJWC 2RDWA 2A2IA 4WHBA 3GBDA 2QLYA 3T0CA 4JTDA 1JFXA 4EX4A 1G7UA 2CKSA 3KDOA 2VX5A 3G1DA 5FJPA 2EPKX 4GNKB 3S1GA 3PWAA 2PTZA 1J0IA 3B8IA 3LLXA 3T2PA 1W3NA 1DPMA 2E9BA 4MWAB 4H9MA 4FLSA 3DDMA 1EOMA 4LNYA 4I8DA 1UKPA 2O4MA 1F74A 3LHTA 3SGGA 4O1AA 3SDOA 5DN1A 3LGEA 2QZRA 4KCUA 1E5NA 5JXQA 3TXVA 3GFZA 5FSDC 3CMFA 2EG7A 5E0FA 3OBAA 3CL6A 3GC2A 4OV9A 2WAGA 2NXIA 1XGZA 4IFKB 4O0QA 4MY1A 4GCXA 4IIEA 4OU1A 1MW3A 2XWDA 4QTGA 3C2OA 4J27A 5F4SA 4IZGA 3ZWTA 3C6CA 3VCNA 3PZGA 2W91A 2PLKA 3S9IA 2X40A 1DWFM 2HBVA 3BLDA 4IQLA 4QCFA 5F2MA 1IXNA 3G0SA 4HHHA 4JHMA 5A95A 1A5CA 3VABA 3EMCA 4NZ3A 2CIPA 1C29A 2OYKA 2PMQA 1KM0A 1K02A 1XQLA 4ERIA 4TIMA 3EDKA 4M5PA 1XGDA 1DIEA 3NTYA 2FZ9A 1PJ9A 4PR4A 1O4UA 2PDQA 2VVSA 3QN3A 5D03A 2BV9A 3AMGA 2GDUA 1S5NA 3DN5A 4OUIA 4KWUA 4RX0A 1GOKA 3BV7A 5GPRA 1JPDX 2G0WA 1CLVA 4LAOA 1PDYA 4FXRA 1J0JA 3IS4A 4LS0A 1CGWA 3AIRA 1KV5A 5I3JA 1EC8A 4NY2A 4EAYA 3EKGA 1V3HA 5HMFA 3O6DA 4Q8VA 3FAWA 3VUPA 1W8GA 2Q6ZA 4GNVA 2VRJA 4A3HA 2HSAA 4B3KA 2ACSA 4U10A 4L5ZA 4PUDA 1BLIA 2QVNA 4DF1A 2GUYA 3B06A 1XYBA 4GRSA 1KFCA 4UQBA 2O92A 1R3YA 4AWUA 5RUBA 1R2SA 3W7DA 5D30A 1ITCA 4ERAA 4DO6A 2HVNA 1GVEA 3KOWA 4LUSA 1V0NA 1HX0A 3ANUA 1RCQA 3CEPA 3LGGA 2WMGA 1BXBA 4JNZA 1HKKA 2V9DA 1TO3A 4CCCA 1P6WA 4A2SA 1QPOA 4IMGA 1MZHA 2V5DA 1ISXA 3DGBA 1NARA 1XWYA 4JX6A 1KRAC 3B0VC 3IJ6A 2KZHA 2WMHA 3LQLA 3S5NA 3MI2A 4GK8A 5AVHA 4WDXA 2QF7A 4IJCA 5AHMA 4QG8A 4HU8A 3G24A 3UNDA 1OC5A 3VIPA 3ABOA 3GNPA 3C0LA 4GY1A 1V3IA 3BWWA 3NZPA 4AEFA 4GBDA 5I5RA 2CCRA 5HINA 3TNBA 3TW7A 4RNHA 4EE9A 1EJXC 3EMZA 2EQDA 3N4EA 1HL8A 2R1NA 3TJLA 3B8TA 4AXKA 2Y0FA 3AUOA 3TR2A 3WH6A 4CVWA 2HXTA 2Y2WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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