5U4N | Genus

Total Genus 129

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	129
sequence length	350
structure length	350
Chain Sequence	MALVSMRQLLDHAAENSYGLPAFNVNNLEQMRAIMEAADQVNAPVIVQASAGARKYAGAPFLRHLILAAVEEFPHIPVVMHQDHGASPDVCQRSIQLGFSSVMMDGSLLEDGKTPSSYEYNVNATRTVVNFSHACGVSVEGEIGVLGNLETGEAGEEDGVGAAGKLSHDQMLTSVEDAVRFVKDTGVDALAIAVGTSHGAYKFTRPPTGDVLRIDRIKEIHQALPNTHIVMHGSSSVPQEWLKVINEYGGNIGETYGVPVEEIVEGIKHGVRKVNIDTDLRLASTGAVRRYLAENPSDFDPRKYLGKTIEAMKQICLDRYLAFGCEGQAGKIKPVSLEKMASRYAKGELN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of a fructose-bisphosphate aldolase from Neisseria gonorrhoeae rcsb
molecule keywords	Fructose-1
molecule tags	Lyase
source organism	Neisseria gonorrhoeae
total genus	129
structure length	350
sequence length	350
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2016-12-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5u4nA00

4HNNA 4GWEA 3OIXA 1XM3A 3W7RA 2V5LA 3LHTA 4LS1A 3KFTA 4NNCA 2YGYA 2GOUA 4FX7A 3N2XA 5K9CA 3JR2A 3C56A 5G4EA 1K7FA 3LDVA 3W7QA 1XCFA 3A5VA 4TMCA 3GZ3A 1FWSA 2VEKA 3C2OA 3RMJA 3STCA 1WV2A 4W9TA 1G7UA 1VRDA 2G5WA 2NXGA 1PCWA 1CX9A 3GR7A 2Y7FA 3QYQA 2DU2A 1QCWA 2QCEA 3O8AA 3P84A 2A85A 1H7WA 3B0PA 1G4EA 3PY2A 2JBMA 3SI9A 1VR6A 2ZZ5A 3N2MA 4HKPA 5TBOA 2WV8A 4GUIA 1UASA 1ICPA 2Z6IA 4E38A 3QJAA 2J9YA 4E2BA 1SSGA 3W7KA 2YXGA 2FQIA 3NQDA 1SO6A 3PSWA 4AB4A 5C6MA 3QM3A 4IQLA 4FB7A 2C18A 3GDTA 1KLYA 4N9DA 4Y9AA 3ABSA 1NF7A 1S3HA 3M6YA 5DXYA 3MW7A 4HNUA 5HUOA 2B7PA 2VFIA 5D04C 3TJLA 3ABOA 4IGHA 1ZAHA 5AN7A 2ZRUA 5F2LA 1YXDA 3PVFA 1OFOA 4FNPA 4IPIA 5EL1A 1DV7A 1TQJA 1KV8A 3R89A 4MY9A 1L6SA 1W3IA 1M5WA 2P1FA 3M5ZA 3QRHA 2TSYA 5E93A 5EA9A 3W7NA 5KTLA 1GOXA 4LWWA 1FCQA 4RZ5A 5LKYA 3IIOA 3W7MA 3BG9A 1WYIA 5FEZA 1O94A 3E9AA 1G4SA 3TIMA 2JKPA 3C8FA 2GVGA 4UNKA 3UWZA 5C5YA 3FS2A 3TQKA 1J2WA 4MOZA 3TCEA 1ZJIA 3T78A 1A5CA 4N4QA 3BARA 4EF8A 1FQ0A 1Q45A 2ZCGA 3MI2A 4RZ4A 4QNEA 2QR6A 5CKSA 2G97A 2J9XA 3EX6A 3G24A 2C0AA 3HGOA 1K8YA 1JCJA 4O8RA 4O19A 1F6KA 4JTTA 2GVJA 5I3KA 3NPXA 2VFEA 1RQHA 3STGA 1TMHA 4HNTA 3GXTA 3WK1A 5DY3A 2FPYA 2BZNA 3FOKA 3P5YA 1TYGA 2NV2A 2RDTA 4O15A 4GRSA 1OX4B 1XFBA 5C2XA 2Y63A 3N3MA 4O1DA 3A23A 1EWEA 2ATMA 1JUBA 3T4CA 1MEIA 3BV4A 2PRHA 3LB0A 3P81A 4TR9A 4MZ8A 5G4WA 1XDMA 1VCFA 4GNJA 4XQ6A 4FIQA 3HGJA 2CLIA 3C2EA 4EIVA 4OU1A 1VJIA 1FWWA 5D2TA 4MUZA 2VFGA 1KTNA 3QZEA 1RPXA 4NVTA 5HR7A 2RKXA 4N9CA 4NZJA 3FA5A 1ZHAA 3AJXA 5HWMA 1I2PA 1NEYA 5I3HA 1KTCA 5HNRA 5D2WA 1LLWA 4FX6M 3HQ1A 3I7SA 4MKNA 1JQVA 1KW1A 3NPWA 5HMSA 4E0CA 3KVJA 3IVSA 3S1XA 1SO3A 2A7PA 2Z1BA 3TFCA 3HG5A 4A21A 2GUUA 2ZBTA 3M5VA 5KZEA 3ANYA 1XBYA 3EWZA 2A2IA 1W56A 3IVTA 1Z42A 1TTJA 2NXIA 4IMCA 5I3FA 3CB8A 3LLFA 3DGRA 3FYOA 3PM6A 1A5SA 1OK6A 4LUJA 3TQ0A 5EYWA 5AYYA 3KVMA 4HIBA 2HSAA 3L65A 1O60A 4PH6A 1JUEA 3NL5A 3GXNA 5CZTA 3G0XA 4JTIA 4AWTA 4H4IA 1L6YA 2VENA 1VCGA 4Z1BA 1P0NA 1QPQA 3UXAA 3MMTA 3E12A 3F4NA 4LT9A 4XTDA 2ABBA 4AF0B 1MO0A 1RQBA 4IWWA 3BG3A 4UCGA 2C6QA 5K7JA 3QC3A 3BW2A 5CGQA 3D0CA 3P5ZA 1M7OA 3F1QA 2NX1A 5AC6A 3NVTA 5AOUA 1QR7A 4ZQOA 1YADA 4B5NA 1P1XA 1JCMP 2X1TA 3DXIA 1SW0A 3P61A 1BKSA 3OHIA 2BX7A 1C8VA 1F5ZA 1V7YA 3LCIA 2YW3A 3G22A 3TE9A 5LHFA 2E5CA 4UMBA 3F03K 4N2YA 4AEOA 4UTLA 5E1QA 3LX9A 2E09A 4WD0A 1PHWA 1LOQA 1DVJA 3SJ3A 3MP3A 4UR8A 4QIUA 1H7XA 2NXHA 1EB3A 3QW4B 1SZEA 4HN4A 5FF4A 4K37A 2QCMA 4HT3A 2DZVA 4O54A 4A3UA 1GG1A 4OQVA 4RV8A 1VLIA 4Z0SA 1XBXA 1WDWA 1RVGA 5DCDA 3G3MA 5K9XA 3SGZA 3MUXA 1YTEA 1TTPA 5LGXA 2Q8LA 3ZWTA 3HO8A 4S2BA 3IIXA 3OEXA 2V82A 4M6PA 2OMAA 3W7EA 3NZRA 4WOZA 3W85A 1G7VA 3W74A 1QAPA 1OFRA 3I7RA 1CI1A 4N4PA 4AHPA 2CLFA 4ZVJA 1GVFA 2NLIA 4CQ9A 3PAJA 2TMDA 1XL9A 4X9SA 2W0UA 4MPQA 1TREA 3SECA 3W2KA 4UFIA 4XWUA 1H7OA 2R8WA 3FJLA 4LRSA 3L0GA 3DFOA 3UWVA 2CLEA 1N55A 4JTLA 3TDFA 3DENA 3B0UX 4EOUA 1GQNA 4MZYA 4LS0A 3K30A 1G4TA 4RXGA 2GPTA 1LDCA 3IIVA 3C2FA 1Z41A 4CCCA 1LZOA 5HULA 3H55A 3R12A 2BWGA 4AHQA 1HO1A 4IMEA 4UFLA 4NZFA 3W1UA 3N73A 1H50A 3MBDA 1XUZA 5IBXA 5H91A 3GDLA 1I2NA 3DFTA 4JYEA 4HPXA 4N6FA 3RF9A 1GJPA 1LOLA 1Q6QA 4GUGA 3TW7A 1GVRA 4Y96A 4JDYA 4FXSA 2FPTA 1EUNA 1LOSA 1X6UA 1KFEA 3M43A 3TW6A 5F2IA 1P0KA 2A21A 1TPUA 4WY0B 3DBPA 1KM6A 1AG1O 4OV4A 1QWGA 2CZFA 2WQPA 2D73A 2VC6A 1FY6A 1ALDA 1EPXA 5LHEA 2TPSA 1TTQA 2VKZG 2E1DA 4K39A 2VXNA 1SU5A 3ATZA 2H3BA 4IUOA 3ZWSA 4WJEA 3FJ6A 1QPRA 3W1MA 1I45A 3G3DA 3Q2DA 4X2RA 3TK7A 1K3UA 1DQXA 1R2TA 5G2IA 1VHNA 5AHIA 3S1VA 2FDSA 3FFSA 5T26A 3EXRA 3PUOA 5EKYA 2WSRA 1X1ZA 3A24A 5DCBA 4Z08A 4KFNA 3G8EA 4IX2A 3GVGA 3THQA 3A9IA 1BTMA 1CW2A 1AL8A 1LBMA 4Y90A 1H7NA 2ZQ0A 2Q3RA 3OG3A 1TPVA 3TXVA 5EMUA 2C3ZA 3NQ7A 3UPBA 4TU1A 4GC4A 3T7VA 1JULA 4HSOA 3P62A 1M7PA 1O4UA 2XN2A 2H90A 1W5NA 2ALDA 5G5IA 1WBHA 2UV8G 2ABAA 3N9SA 2CFFA 3LRKA 4RKAA 4LVDA 3NQFA 3PR2A 1OFBA 4IXXA 2Z6JA 4CQAA 4JTKA 4UFKA 1YYAA 1EA0A 3LOTA 1IXOA 2V2CA 5BNKA 1XKYA 1PV8A 3FEMA 3MHGA 2YFOA 3QPYA 5BMXA 4O10A 4NXKA 3O15A 3DKLA 1F74A 3PBYA 3STFA 4PFMA 3DHDA 4KFOA 1OYCA 1YLVA 3L5MA 4R33A 2PRLA 3R13A 1EEPA 4JY8A 4NU7A 4YMZA 1MZHA 3UY8A 3W83A 1FBAA 3V1PA 2CZ5A 3GIYA 1UCWA 3WJZA 5HWJA 3LXCA 4UTKA 4OWGA 3OVPA 4JTHA 1SQ7A 2FPVA 2ZRXA 1S5WA 2E68A 2ZZ2A 4UTJA 1QMLA 4Z1CA 1JCXA 3QW3A 4UTTC 3NAVA 1J4EA 3IGXA 1FDJA 1N7KA 3EKZA 5FEXA 2ZA3A 1U5JA 3GX9A 2J88A 3IV3A 2ZZ3A 4JS3A 1FCUA 1VPXA 5A8GA 2O7QA 4D2JA 1VYSX 4FXRA 3NO5A 3HIJA 3UPWA 3G1SA 4CQ8A 1QFEA 3NL6A 3LXAA 1JR1A 4UXDA 4LY8A 1YPFA 3P74A 1YPIA 3MHUA 5U4NA 1ZALA 1HTIA 1TPB1 3G0UA 4CNOA 2BTMA 3W7OA 2A6LA 1GVSA 3TAKA 4QM1A 3HG4A 4P2VA 5K4ZA 1T8XA 4WXYA 2QCDA 1DHPA 2E6DA 3WJYA 2X1UA 5D33A 3KAOA 3M5XA 1ZNNA 1PIIA 2QJGA 1L2UA 3S5ZA 4IJBA 4H6KA 2NX3A 3S5NA 1W5QA 2A0NA 3KHJA 7TIMA 2NUXA 1A53A 1JRBA 2V81A 4RLIA 5G1YA 4XTIA 3W2JA 1OFQA 3ELFA 1JVNA 3TJXA 3C2RA 1VYPX 1TRIA 1FWNA 3G1XA 3SY5A 1C9DA 2VFHA 4KFPA 1KTBA 4YLWA 3P60A 3GDRA 5SWUA 3MYPA 4MYXA 4MJMA 5F4SA 4DF0A 1TV5A 1OHLA 2JKAA 4Y6GA 3QPZA 3NQCA 2JK2A 5CZSA 3TX9A 1YXYA 3B04A 3BW4A 4K6AA 4NNBA 4DF2A 1HG3A 3LV6A 2ZA1A 1RZMA 1LRQA 3L67A 4QNWA 3MP4A 3W6YA 1QOQA 1XBVA 2CU0A 3WK0A 3EX4A 3PF3A 2R14A 3A22A 4YCPA 2V8ZA 3CIWA 1U83A 4ICNA 4MZ1A 1OFDA 1L6WA 5FF7A 3INPA 1B57A 4PEKA 2GJLA 2V9DA 5BW6A 1SPQA 2DORA 3LCFA 1LTDA 1F76A 4UUIA 1QO5A 3EX2A 3I68A 4K8EA 2G95A 5DY2A 5EBUA 3G1FA 5HINA 4FNUA 3PS7A 1TJRA 1ZAJA 4JXCA 1OK4A 4MVAA 4WZHA 4NJHA 4UTTA 1B4KA 3QQ0A 5TIMA 2WSQA 4NT0A 3DFPA 4M7SA 3RFAA 3SZ8A 2QCFA 4O52A 3PULA 1KFJA 5AHLA 1F6PA 1PL9A 1TPFA 4QQ3A 4G1KA 3GLCA 3HF3A 4ONVA 2C14A 4TO8A 3UY7A 4IMGA 2WO5A 3DFNA 1O5XA 3LHYA 3C2VA 4O13A 1YDVA 5C55A 4U4MA 5L6UA 4JICA 1NF0A 4IMDA 4DXVA 1VGAA 4CCDA 3SFKA 1T0OA 1T99A 2I9EA 1BEUA 5GVJA 3DZ1A 3I65A 5J5DA 3C4UA 4Y8FA 1JCNA 1FX6A 4A2SA 1C29A 1RV8A 1GWJA 2DZWA 3O6DA 5CSSA 4IMFA 3Q37A 2VFFA 3B8DA 4AWUA 3C52A 2AQWA 4CLMA 4DEFA 4FIRA 3LERA 5D2XA 3KRUA 2CLMA 4UNLA 3MWAA 2RHGA 1Q3NA 2WOQA 5DCEA 3TUUA 4M5PA 4JYDA 3LRLA 1P4CA 1RD5A 1ADOA 2QCGA 3EWUA 3EXTA 5HUPA 4BF9A 2ZZ7A 3M41A 2ISVA 3EKLA 1S5VA 1W31A 1I2RA 4FO4A 4O18A 5D38A 1LM1A 3PWAA 3HPSA 3O07A 2RDWA 4UFHA 1XC4A 4E2DA 1D3GA 3PB2A 2WPBA 3UZJA 3DFQA 2E6AA 3VI2A 5ABTA 3M47A 3NM1A 2DZTA 3LI0A 3UQNA 2E6FA 1VCVA 1W8SA 1ZY9A 4ZQMA 3CHVA 3LRMA 4ZQPA 3G18A 1JQXA 1LP6A 1ML1A 1L9WA 4O4VA 2VFDA 1ME9A 3BGJA 4AF0A 3ZS4A 3W1TA 5FF2A 5DN1A 5F1UA 4IX0A 1KFKA 3TA6A 3VFLA 2QUTA 4YXGA 4ADUA 1XDLA 3M5YA 3DAQA 2XN1A 3W1NA 1HUVA 2Y6ZA 3UD6A 1DQWA 3W2MA 2V30A 1X1OA 1ZCOA 2QAPA 1UB3A 3LCLA 4GXMA 2GQ9A 4K38A 3W1LA 1OG0A 4K36A 2QCLA 3CWOX 3TROA 3LI1A 5I3GA 4IPJA 4BI7A 3L5AA 3TSDA 3S5OA 3FKKA 4AVFA 4LNYA 3NQEA 1LROA 2EKCA 2QUUA 3RNDA 2ZRWA 4CNNA 3R8RA 2NWSA 3N19B 3WJWA 4Z1DA 1VZWA 4UMAA 1Z48A 4WXZA 4P61A 4LU0A 4JY9A 3CLMA 1FXQA 3LBCA 3SIZA 3QEZA 3LBMA 4OE7A 3WFAA 4FX8A 1ICQA 4JDBA 3G8RA 2DJLA 2CZDA 3VNDA 2ZZ6A 4UTWC 4JTJA 1Q6RA 3W7DA 4R53A 3NPUA 3EX1A 4I7WA 3QSRA 3DKJA 3MHFA 3W7IA 2A5HA 2Q3OA 3IEBA 4RZ6A 1KFCA 4DBEA 1LRTA 4DF1A 2Z2UA 5FESA 5D09A 1FWRA 2TYSA 4LUIA 4ORIA 4DPQA 2Z0IA 3NQGA 2Y89A 1SFLA 1NAL1 3BVJA 2YZRA 2WNNA 4OBTA 1DBTA 2X2GA 4I9AA 2E77A 4A2RA 2QCNA 3CPRA 1OABA 3VCRA 3NQ8A 3N34A 4DO5A 4FHAA 3PB0A 2X30A 2YR1A 4LTSA 3M1ZA 3EB2A 2DP3A 2R94A 3TR2A 1GT8A 4YWIA 1AK5A 5J5RA 3W84A 1OJXA 1TB3A 2P10A 4MJZA 3NQMA 1FCVA 2V0TA 3RK8A 4BK9A 1H60A 4XZ9A 3HPXA 3W07A 5BRBA 4BFAA 1GVOA 2NUYA 1QNVA 4FEZA 1GTHA 1MXSA 5F4XA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5U4NA

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