6ALDA

Rabbit muscle aldolase a/fructose-1,6-bisphosphate complex
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
343
structure length
343
Chain Sequence
HSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAAWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
source organism Oryctolagus cuniculus
publication title Structure of a fructose-1,6-bis(phosphate) aldolase liganded to its natural substrate in a cleavage-defective mutant at 2.3 A(,).
pubmed doi rcsb
molecule keywords FRUCTOSE-1,6-BIS(PHOSPHATE) ALDOLASE
total genus 138
structure length 343
sequence length 343
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 1998-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 6aldA00
3QQ1A 4G1KA 3O07A 4ZQPA 3P82A 2NX9A 1P4CA 1A5BA 4QISA 4ML9A 4S2BA 1TRIA 3NQAA 3HOJA 1WXJA 1TTQA 2VOMA 2TPSA 5KITA 1H7OA 3W7MA 3GDMA 3ATYA 3W7PA 1S5WA 1O5KA 4YLWA 4D2JA 2QAFA 3WJWA 4MJMA 1ADOA 3L67A 1X1OA 2QCNA 4AHOA 3B05A 4XTIA 1NFBA 4J9JA 3TXZA 1J2WA 3INPA 1H51A 2V5LA 1XBVA 4PFMA 4OV4A 5D2TA 3UD6A 5G1TA 4OQVA 1R30A 1W0MA 3GLCA 1SW0A 1NF7A 3DZ1A 4JX6A 3GNDA 4H3DA 4WY0B 4YMZA 1I4NA 2DU2A 2GQ9A 4UFLA 2CFFA 4DO5A 2ZFAA 1W5NA 1ZAHA 3FOKA 3GKFA 5C2XA 3NM1A 3O15A 2ISWA 1K3UA 3W74A 3QYQA 4MY8A 1WV2A 3FJLA 4FXSA 1GTHA 2VXNA 3EWZA 2CLIA 4Z08A 3EX1A 2B0MA 4LRSA 3S5OA 3LLFA 1KTCA 3DXIA 5C55A 5KINA 3TSDA 4HSOA 1OFAA 3W1RA 1FWNA 2GJLA 3KVLA 1LLWA 2Z6JA 4YWIA 3G1VA 1FCVA 1RR2A 2Y7GA 4GC4A 1ZAIA 2TMDA 1GVFA 1DKWA 1SR9A 3PY2A 3RU6A 3P61A 4UTHA 4JYDA 1RQHA 3YPIA 4AVFA 3F03K 1W3NA 1EX5A 4ZL1A 1N55A 3T7VA 2QJGA 4N02A 4HNVA 3SW6A 3S5NA 2ZA3A 3TC7A 1F74A 3O6CA 3SSJA 2E5CA 2VEKA 3RLUA 1YTDA 3MBFA 3P8IA 1OX4A 4WJEA 6ALDA 4W9TA 5I3KA 2QCFA 1W5OA 3N9RA 1FY6A 4IMGA 3L0GA 3BG3A 3TJLA 3T55A 3BLFA 4UUIA 4FX8A 4OT7A 3M43A 3LBMA 4XWUA 4TIMA 1SFJA 1QAPA 2QCEA 5CZ0A 4O54A 1EPXA 3EWWA 1ZNNA 1UJPA 1H1ZA 3PF3A 4PL2A 1FWSA 4MZYA 2CWNA 4NNAA 1G4EA 1OFOA 1GVRA 4P61A 3WK2A 4FIRA 5EPDA 1PCKA 2A1YA 3LCFA 4PTNA 5H91A 2NX3A 3HPZA 3NDOA 2I14A 2Y7FA 3A5VA 3MO7A 2ZRWA 1GQNA 3LCGA 3C2OA 4XKYA 3PG8A 2VFIA 1DQWA 3MHFA 3WK0A 5G1YA 3TC6A 4GRSA 4DPQA 2H90A 4TO8A 2EAWA 1PCWA 3W73A 1FCUA 3DFTA 4IX0A 1JR1A 2HMCA 5BW6A 3VI2A 1XFBA 4ALDA 4BFAA 1RZMA 2E6FA 3IVUA 2RKXA 3IVTA 4OWGA 1KM5A 2EPHA 2QCHA 3PSVA 5GVJA 4K8EA 2WSQA 4N6EA 4X22A 4C1LA 5DLCA 5AC8A 3KVKA 3W1NA 2CW6A 1QMLA 4QSHA 4LUJA 3NQ8A 4O18A 3N2MA 1OYAA 3PULA 3P62A 4X9SA 1YDOA 3GKAA 4UR8A 3FKRA 1W5QA 3B0VC 4JNMA 4FF7A 3R12A 1Z42A 3KFTA 3LI1A 5BMWA 3OEXA 1K7XA 3LCXA 2YFOA 1QNVA 3JS3A 2ZBTA 4M6VA 4N4QA 5D03A 5HMSA 1A5AA 1TMHA 2WO5A 5HR7A 5EMUA 3PAJA 4O15A 4UFHA 3F4NA 2A85A 4PODA 4UXDA 4WX2A 5E1QA 1OVDA 2PURA 1CX9A 3MP4A 4DEFA 3CLMA 3I65A 3NNTA 4AMAA 2E6AA 2E5DA 2VEIA 4RXGA 5TQLA 5K3VA 1B4EA 3S6DA 4A22A 2A7PA 2YXGA 5AHIA 3W84A 1G7VA 1IF2A 4NVTA 2XN1A 4UFKA 1KTBA 5LHEA 2ZA2A 2KZHA 1F05A 4EF9A 4NXKA 4JEQA 2CLLA 1D9EA 5LNUA 1H60A 1KV5A 2JK2A 3MP5A 3QW3A 3Q94A 1L6YA 2B7OA 1WBJA 1XM3A 1AMKA 1TV8A 2FFCA 1D3HA 1OF8A 2E5BA 3NQMA 2J9XA 3QF0A 1KFBA 1U5JA 1FXQA 1VS1A 4QM1A 3L0NA 2I9EA 3C4UA 3W86A 1RPXA 4O12A 3NPUA 4P2VA 5LHFA 1YXYA 1LOLA 3SGZA 3Q37A 3PBVA 2Z0IA 3ABOA 3LCWA 1BWKA 3GR7A 2QCLA 3W72A 1K8ZA 1W8SA 1TV7A 5D30A 4GUGA 1M7PA 4FHAA 1G4PA 4OE7A 1IXNA 2GVLA 3NL5A 2J27A 4DF0A 3P67A 3PBWA 2J9ZA 4JX5A 3FA5A 2RH9A 3EWYA 2WOQA 4PL1A 2QKFA 3HQ1A 4CQAA 2V9DA 4H6KA 4NQ1A 1KFJA 2QF7A 3UXDA 2C16A 1L6SA 3W7DA 3HPXA 2GUUA 3W1MA 3HG3A 1VRDA 1ALDA 4JIPA 4NJHA 1XBXA 1EIXA 4GUJA 2G5WA 1FUYA 3TW7A 2X30A 5D38A 3NQEA 4Z0JA 2CZEA 2VENA 3TV8A 3VKJA 3PM6A 1OX5A 2ZA1A 7TIMA 1TO3A 1KM6A 4N2YA 1QPNA 5G4EA 1F6KA 3W9ZA 1W37A 2RDTA 4MOZA 4JN6A 1VHNA 5CZSA 1YDNA 1YXDA 1BWLA 1GVSA 3T4CA 3LHUA 2Y63A 4DQWA 8TIMA 5IBXA 4WOZA 3MBDA 3SZ8A 2Y70A 2EGZA 1KFKA 3BW4A 4UTWC 1TQJA 2C0AA 1O95A 1TPVA 3OBKA 5I3GA 4N4PA 4MVAA 5I3FA 3FYOA 3ANYA 1AW1A 3KRSA 2RFGA 3KRZA 3W7QA 4CNOA 4FEZA 3W7NA 3WJSA 1OF6A 1JUKA 4K7YA 2DORA 1ICSA 2HS8A 2E1DA 3BV4A 1PL9A 2PE4A 2Q3RA 3GAYA 4Z1DA 1BEUA 3RFAA 2Y62A 1O5XA 4A3UA 5D2WA 5FF7A 2GQAA 1SFLA 1JQVA 3C8FA 3H53A 5CZJA 3LV5A 5FEPA 2QCDB 3CU2A 3CB8A 1XCFA 2FPVA 4LV9A 1TTJA 4IWWA 4JIQA 5F4XA 3HGSA 1R2RA 4NU7A 1UASA 1NEYA 3GK0A 2FB3A 3WJXA 4JTLA 4XBSA 3IRDA 4IQLA 2YDAA 2YCEA 4KFNA 3STFA 2P10A 2R8WA 3LTSA 1MZHA 1C8VA 2NX1A 1OFDA 2YW3A 3S1UA 3CQ0A 4GXMA 4Q33A 1LLZA 2X1RA 4HNTA 3EWBX 4O53A 1C29A 2ZQ0A 3NGJA 4CQ8A 3KVMA 5K7JA 4UTKA 4HPXA 2C13A 2GVJA 2G96A 4UTUA 3I7RA 3LRMA 2NXIA 3KX6A 3UWVA 2FPYA 1PE1A 1R46A 1KTNA 5CGQA 3H55A 5LGXA 1FDJA 3W1LA 1YADA 4M7SA 3NAVA 3W87A 3FFSA 2X1UA 3DH7A 1KW1A 4O1CA 4DBDA 3QC3A 4I7UA 3GDRA 1K7FA 5CG7A 4X2RA 5G4WA 3PC0A 4CNNA 2QEZA 3PSWA 4N9CA 4ONVA 4A2SA 3T40A 4O4WA 3N34A 1A50A 1SZNA 5EBUA 3IIPA 1I2OA 3PUEA 5C54A 1V7YA 3ZS4A 4XTDA 4EWND 1XKYA 1QO5A 3L5LA 4TU1A 5D37A 4IMFA 4GNJA 3R2GA 2CLMA 3LV6A 4HNNA 3UWWA 2V2CA 5HWMA 3C0JA 4QQ3A 1XUZA 3QMTA 3SI9A 4TMBA 1TPUA 1G67A 1XI3A 5KTLA 1AK5A 2R91A 5KZDA 2QCCA 4JTSA 2ZZ7A 2YPIA 2VEPA 5DCBA 3EX6A 3TMQA 1VQTA 1R47A 1LRNA 3LHWA 1P5BA 1BKSA 3GXNA 4LVGA 4ORIA 1K03A 2PC4A 3C2VA 4XQ6A 1DORA 4UTTA 2ZRYA 2OCZA 2R14A 3DFSA 2AAMA 4FB7A 3HJZA 2FJKA 5FEZA 1VLWA 4NXSA 1EA0A 2V8ZA 2W6RA 4O52A 4ORMA 4Z1BA 1HTIA 1JCMP 4NJIA 5CSSA 2DJXA 3VE7A 2HSAA 3WJZA 2OJPA 1WQ5A 1IGSA 3FS2A 2YW4A 1UUMA 3HG5A 4AXKA 4GFSA 1KV8A 1VYPX 1P1XA 3L66A 2ABBA 1WA3A 1UB3A 3W7OA 4DF1A 1HG3A 1X7FA 2WSYA 2H8ZA 5FEXA 5AHNA 3WJYA 3HF3A 2ALDA 4LY8A 4JR5A 1DJNA 3QSTA 2QCMA 2E68A 4FO4A 3C52A 4UNKA 1AW5A 3T44A 3W2KA 3W2NA 1H63A 1JCXA 4LS1A 2ZTKA 5G2WA 1KBJA 3TW6A 4O13A 3BARA 4UNLA 1XL9A 3C2RA 2GVGA 3TAKA 1H7NA 3M41A 1WAUA 1GOXA 3M5ZA 1T99A 3UNDA 3U6WA 4LUIA 3CHVA 2ATMA 2NXHA 2Q8ZA 4GUFA 5HJLA 4NNBA 4BWLC 4PCFA 3LBCA 3W7KA 2QAPA 4UMAA 4CCCA 1Y0EA 2BTMA 5EA9A 1W56A 4M5PA 1VCGA 3GVGA 2ZZ1A 2P1FA 4MKNA 4XBKA 3NPXA 4WZHA 1F7BA 1JUEA 4MLJA 3N2XA 1QO2A 5DCEA 3OA3A 1ZAJA 3E0IA 3L2IA 2BWGA 2E77A 3M0ZA 5I3IA 4O1DA 3BLEA 2WNNA 3EWUA 3R89A 4FNUA 2XN0A 4JTTA 2E09A 1LM1A 1H61A 1OYBA 4MFEA 2DZSA 3R8RA 2D73A 3TROA 5CPNA 1N8FA 1KM3A 1FWTA 5CPMA 2CLOA 3CT7A 5D2XA 3OHIA 4K37A 4PA8A 3W1XA 4HIBA 4Y90A 5T26A 2UV8G 2FIQA 3SECA 1SPQA 3EWXA 4JTFA 2Q3OA 1Q45A 3E96A 3HG2A 3P5ZA 4RZ5A 5CSRA 3MWAA 3W7HA 3MMTA 5BRBA 1P0NA 1TYGA 3I68A 3TNOA 4WXZA 5CPLA 3W1TA 4AWSA 3WFAA 3M5YA 3W71A 3AJXA 4I9AA 4JD4A 2B7PA 4IMCA 3BGJA 5AHLA 1LP6A 1OX4B 2CLFA 1LBMA 4KFOA 3MW7A 4MYXA 3G0XA 4R53A 3P74A 4Z0SA 3LHVA 1TJPA 1IXQA 4RX0A 1SO3A 4PC8A 2ZRUA 4YCPA 1DHPA 1SW7A 1EP3A 2JGQA 3QJAA 4MLRA 5KZMA 5CKSA 3B0UX 4M6QA 1MEHA 4MY9A 1MO0A 1RD5A 4IXHA 2VFGA 5F2LA 3W85A 1TPFA 1S3HA 1AW2A 4CCEA 1TSIA 1F5ZA 4O11A 4OU1A 3TIMA 1QOQA 3LLDA 3CM4A 3TSBA 1Q6QA 1W3TA 4O16A 4JY8A 1KA9F 3A22A 2F7FA 1JULA 2GJNA 2VC6A 4DELA 4JDYA 3IGSA 1GG0A 5DXYA 3TSMA 4L4MA 1OFPA 2XN2A 2YFNA 4MIMA 4XKYB 3S1XA 1GJPA 1MXSA 3W1AA 1QPQA 1GWJA 4UMBA 1OK6A 5LZLA 3W2JA 4DF2A 5F4SA 3EX3A 2ZRZA 3IIXA 3MI3A 1H7PA 4JTIA 2XFWA 5FESA 2ZZ5A 1L2UA 4Y96A 3EXTA 4IPJA 3TU9A 2B7QA 3O8AA 3CTLA 3UY7A 3W07A 3E02A 2ZZ6A 5EY5A 4DO6A 1M5WA 4X3ZA 1WOAA 4O4VA 5C5YA 3ABRA 3HIJA 2ZTJA 5HUOA 2C3ZA 5J5DA 3TQKA 1ONRA 2H8XA 2YR1A 4A21A 4AH7A 1WOBA 1KM4A 2QDHA 5EL1A 3S5YA 3O05A 2HS6A 3SGUA 1I2RA 2QUUA 3GDLA 5L9FA 2Z6IA 2Y7EA 3OG3A 2NV2A 1FCQA 3LTYA 1QCWA 3W23A 1TPDA 1HO1A 3TH6A 1LORA 2F84A 5KMYA 3QRHA 2A6LA 1I45A 4BF9A 1TPWA 1O4UA 4HN4A 4N9DA 4NNCA 3G8RA 4ZMGA 3BG5A 3JR2A 3TDFA 3KHJA 4NX0A 4BI6A 2TYSA 3OVPA 3UWYA 1QFEA 3L5MA 1ZCOA 1LCOA 1TPEA 3GIYA 3TMLA 3R5EA 4B5NA 4O0KA 4E38A 1VYSX 2JKAA 3DGRA 2NWSA 2NXGA 2NLIA 4K36A 1KLZA 3ZFHA 1BTMA 3EKZA 4UIOA 3V75A 1LOSA 5MHBA 4AWUA 3TX9A 5HR6A 3P8JA 3NQVA 3G8EA 4O8RA 2J24A 4O57A 3DFNA 5F1UA 3QSRA 1QR7A 5LNRA 1FDZA 2OX1A 5C6MA 3G0SA 3GDTA 1PS9A 2CLEA 4M6PA 3U8GA 3E12A 2Z1BA 4IGHA 1QOPA 1ME9A 4IPIA 4FX6M 1CW2A 5A5WA 4JTGA 5FF4A 3IGUA 3LCIA 3SJ3A 1Z44A 4IOTA 1F73A 3CIWA 1G6CA 3S1VA 2TRSA 4O19A 4ADSA 2V5BA 2Z2UA 3NQCA 3CPRA 3DFQA 3E49A 2A5HA 1DBTA 1AL7A 4L4LA 3FKKA 1H5YA 4LV4A 4K7VA 3PB2A 3R13A 1T0OA 4JX4A 3G1DA 1ICPA 1O60A 2DZPA 2EHHA 3W7CA 1P0KA 4JGDA 1HUVA 4LC8A 1FDYA 3UPBA 1JRCA 1ME8A 1AL8A 3Q2DA 4ZQNA 1SO5A 4KWVA 1I8JA 1QPOA 2WSRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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