7A3H | Genus

Total Genus 118

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	118
sequence length	300
structure length	300
Chain Sequence	SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Snapshots along an enzymatic reaction coordinate: analysis of a retaining beta-glycoside hydrolase. pubmed doi rcsb
molecule keywords	ENDOGLUCANASE
molecule tags	Hydrolase
source organism	Bacillus agaradhaerens
total genus	118
structure length	300
sequence length	300
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	1998-08-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	7a3hA00

1NWSA 3WF1A 1EQPA 3PZGA 3DHUA 1W9VA 2EJ1A 3GBDA 4HZ7A 5GNZA 3T08A 3VIGA 1GZJA 4TOQA 2PC8A 5EMYA 4AD1A 1IZKA 4GI8A 4JKLA 2VL4A 1CGUA 1CWYA 3WUBA 2FGZA 3N18A 4Z2HA 4DUVA 3CUIA 1CLVA 1C3FA 4J3WA 1CXIA 4J28A 4Q22A 4WK9A 3U7BA 5CLWA 4UQEA 2YA1A 1LG1A 3HU7A 2XVKA 4PMQA 5I79A 4UFKA 1XSIA 1MXDA 4UCFA 2WLYA 2CHOA 4W89A 1KGWA 3F5LA 3GNOA 3WH9A 4EE9A 2Y24A 3ARRA 4GO9A 2CERA 2WKLA 2DSKA 2UY4A 3L4ZA 4LGXA 1S46A 3AIEA 4PCTA 1JFXA 3CUHA 4D6JA 1CXFA 4MB5A 3MUAA 4V2XA 1EOMA 2YLAA 4W5ZA 4NF7A 1XH2A 3SUVA 5HOSA 1CDGA 1VENA 1W1TA 1VF8A 1SR0A 4AEEA 2NW0A 3O6AA 5I24A 3KE0A 1IT0A 1HNYA 4AMCA 2CESA 1UD3A 5BWFA 2J77A 1OSEA 2XM2A 2O9PA 3W38A 4KMQA 3CHFA 1GOMA 1LL6A 1UA7A 2GSJA 4U33A 2D2OA 5IFPA 1NH6A 5CQ1A 3W25A 2JE8A 3NSXA 2G8ZA 1XV8A 2J78A 4H8HA 3AMKA 1LLOA 3W0KA 3I3EA 4OZOA 2E4TA 4AIOA 4DWSC 3AZTA 3F4VA 1E72M 1JI2A 1PX4A 1V0KA 2VNCA 4JFWA 3AHYA 1GVIA 1R86A 5E0CA 1WKYA 3E1F1 2Z1SA 4HP5A 4GXPA 3CZJA 4UOQA 2ZUNA 4PTVA 3ZT7A 4AW7A 2ZUMA 4U31A 3WNLA 2X09A 3IK2A 1CYGA 2EPMX 3N04A 1JZ7A 1ECEA 1XHGA 3ZR5A 2CETA 3WNMA 2X05A 4AISA 3WDHA 2WSKA 4BS0A 3AQUA 3MMUA 3EDDA 1R7AA 1ZBCA 5FL1A 1UYQA 2ZUTA 1YQ2A 1V3MA 3CGTA 4A4AA 2WVSA 4OIFA 4JFUA 3PTKA 1V6UA 1F4AA 3SCOA 1QI0A 1HKKA 5EBAA 4TTGA 1ZB5A 5HBFA 1BVZA 2XWEA 5CGTA 3UG4A 3U5YA 4TVCA 3HN3A 5ABGA 4J3TA 1GNXA 4YHEA 1E70M 4P7LA 2WVVB 4J7RA 1P6WA 3W37A 1WZKA 2OYMA 1RP8A 1NP0A 4IISA 4WKHA 1H41A 3L4UA 1XGZA 1HJXA 1WE5A 3L4YA 1JNDA 1WDQA 4AIUA 2YJQA 4YN5A 4AZHA 1GQLA 1CLXA 1K9EA 2ZICA 4GKLA 1WZLA 3IJ9A 3SCRA 4J27A 1NP2A 1UQYA 1W3HA 4YPJA 5A6BD 2CBIA 1ZBWA 5KEZA 4X9YA 4WIWA 1JZ2A 1HL9A 2YIHA 3VD3A 3BAKA 3AI0A 1B3VA 1H0IA 3N12A 3WENA 2V3GA 1Y7VA 1C90A 2GDUA 1A47A 2WVUA 2IXUA 7CGTA 1HF6A 3AYSA 3IAQA 2PWDA 5BYWA 2V3EA 4W86A 2OYLA 2V3FA 4D6CA 3B9DA 3WH8A 1HJVA 1CIUA 4OUEA 2VZOA 2VR4A 1KXVA 1US3A 2W4XA 3OG2A 1KXTA 1V3IA 2F61A 3VIPA 5EB8A 1EDTA 3OA5A 4JL1A 4UNIA 4X0VA 1E5JA 1J12A 3AHXA 4HPHA 7A3HA 3VKKA 1B9ZA 3WBAA 4J3XA 4E8CA 3A3HA 4UOJA 3CIVA 1QOXA 5BXSA 1JG9A 5M3WA 3RJYA 1TA3A 4LXFA 2XYLA 1C7TA 3SUUA 3K1DA 1E6QM 4FLOA 1MFVA 1OD0A 1U2YA 3MSGA 5FL0A 4B9ZA 5FD0A 1BHGA 1VEMA 1C93A 2X2YA 3UETA 1W9BM 4CVUA 1ESWA 5IDIA 3RMEA 4UFIA 1TCMA 4D6GA 3VGDA 3WBEA 2W5FA 3ARYA 1NWRA 2VOTA 3VM5A 1V0LA 4W5UA 4P7RA 4H8VA 4DUWA 4NZCA 2Y8KA 4RE2A 3BXWA 5ABFB 2GJXA 2YOCA 2PWHA 2XIBA 2DGAA 1QHZA 2QHAA 2VZSA 5CPQA 3SCPA 4AD3A 1TMQA 2DSZA 3NUKA 2WWCA 3CMGA 1I1WA 4AC1X 3SUTA 2VC9A 4AZ6A 2VJXA 3A6OA 4M56A 2QPUA 2EBNA 1R87A 4D6EA 2D3LA 1W1VA 3I3DA 1B3YA 1XSJA 4XX6A 2J7HA 3WQ5A 2ZX6A 4PMVA 1B0IA 1XD1A 2GDVA 2XJ7A 1CGVA 3ZSTA 3ALGA 2DT3A 1E6ZA 4U2ZA 4YHGA 1G1YA 2NSXA 3PZVA 3VIFA 4PTXA 1PZ2A 1EH9A 1UR2A 5LYRA 3F5KA 1WO2A 4CD8A 2BHUA 4W8AA 1E1FA 2CBVA 2J79A 1BYCA 1BLIA 4BCEA 1W3KA 2CEQA 3ARVA 1PPIA 2VO5A 5JBEA 2XPKA 5JBFA 1E0VA 3TONA 1X1NA 3PTQA 4H2CA 5BRPA 4ZFMA 2VRKA 2VCCA 1UR1A 1BF2A 1R7OA 5A6BA 3AMDA 5CGMA 3AXXA 1GVYA 1UKTA 1V08A 2D1ZA 1QNPA 5A6MA 1K9DA 3B9EA 2CBUA 1J0YA 2W66A 2XVNA 3MANA 2WMKA 1DEDA 4JKMA 4PUEA 1J01A 3ARZA 2CIPA 3BSGA 1KWGA 4PSPA 1HVXA 3VIMA 1QNQA 4PMOA 5CG0A 1OGSA 1B30A 2WZHA 1DHKA 3IJ8A 1VEOA 4KH2A 1BYAA 1KCLA 4QLKA 2CCRA 3VIJA 1E6PA 2XVLA 2JIEA 5EFDA 1FA2A 4TTUA 1ZL1A 1SYTA 4D6FA 2J7EA 1UA3A 2DT2A 4D1IA 1HJUA 2XVPA 3GNRA 4F9JA 2O9OA 1XCXA 1BG4A 4GQRA 1KCKA 4D6HA 5CPTA 5D8WA 4AZ7A 4KGJA 3TTSA 1JF6A 2WMJA 3OLGA 3WNOA 2HISA 3VGHA 1W9PA 4UFMA 3CHEA 1J10A 2XGIA 3OGVA 3A4WA 1TA3B 3EMQA 4CD6A 2D0FA 3OGSA 5CLTA 1UWIA 3CZKA 4P8WA 1B90A 2WCGA 1PZ3A 4Z2JA 4MNJA 3UR7A 2WCSA 4DM1A 4CCEA 1BTCA 3AFBA 1FOBA 4GZIA 1EHNA 3O2LA 3LPGA 2XGBA 2B31A 3K46A 1AQHA 4HOXA 2BHYA 1C8QA 2DIEA 2GJXB 4D72A 4PMUA 1KR1A 2FDMA 4AYSA 4HMEA 3WD0A 2ZWYA 1HVQA 3BMWA 1H2JA 2W62A 4MADA 1B2YA 6CGTA 3N13A 4AZGA 1GHRA 2ZUSA 1E71M 3D5HA 1BGGA 3GXIA 3WL0A 1UG6A 3G6MA 1OCQA 1H4PA 1C92A 3L2LA 1QW8A 5FCZA 2VX4A 4UR9A 3WF2A 2OSWA 3PZIA 1WDSA 3FY1A 1V02E 4MPKA 4V27A 1W3LA 3K4AA 3FW6A 3NDZA 3EDFA 2JF6A 1JZ4A 3GXFA 2E9BA 3ZMRA 2PBOA 3VIIA 3EDEA 1CGYA 4MB1A 1B3WA 4C7FA 5IHSA 2OWWA 3BAJA 3AZRA 2GVYA 3ZQ9A 2DH3A 1JL8A 2QF8A 2WK2A 3WH7A 4X0NA 2XSAA 1I75A 1EA9C 3M46A 4AD5A 1DWAM 1VFMA 2VI0A 4U5KA 4PMNA 3FHQA 4MJ4A 1K9FA 1GQIA 4AEFA 5DF0A 2VVSA 4H7VA 3GXDA 3KL0A 4LPCA 2ZX8A 3VD7A 2DSWA 4KRUA 1PIGA 1XSKA 5A8MA 5D9NA 4R27A 1JI1A 4AWEA 2IXVA 5A69A 4RL3A 1CXHA 2Y8VA 3VX1A 3VUPA 1OGGA 2J7DA 1UH4A 2IUZA 1QI3A 1QNOA 3AHTA 2V3DA 2WVVA 2BY3A 4HMDA 1BPLB 1HKJA 1OWQA 3WD4A 2J8GA 2W61A 2VCBA 3F5JA 1H5VA 1WP6A 3RM8A 1V3LA 2ZXDA 4PTMA 2YDSA 1UOKA 4ML4A 4JHOA 2F2HA 1SMDA 1E56A 1V03A 4JFVA 3T09A 4PN2A 1MVYA 5AYBA 3W6MA 3PBGA 3LPOA 3WELA 2WC4A 4EANA 1UKPA 1N82A 4GIAA 2YA0A 2WW5A 2Y2WA 4UFLA 1W9DM 4MAVA 3AXIA 1O7AA 4P7OA 1RD6A 1XYZA 2OWCA 2WYSA 2EEXA 4URIA 1G5AA 4W88A 1MQQA 1CECA 1OB0A 5D4YA 2DEPA 4W93A 1JFHA 3GM8A 3RILA 4W8LA 3WH6A 4Z2IA 2G4FA 3T0BA 2CNCA 2XVGA 1GOIA 1C7SA 3CBWA 1FH7A 2XUCA 1KXHA 2V38A 3AJ7A 1M01A 4F66A 1LJYA 1QPKA 2ZE0A 2YL8A 1V6VA 3WMSA 5HPOA 1C8YA 3CZLA 2J47A 3ARPA 3W24A 1FP8A 3IANA 4AXNA 2UY5A 3PTMA 3N11A 4FLSA 5GNXA 2RGLA 4DWSB 2ZUVA 3WEMA 1RP9A 3SCSA 1GQKA 1F4HA 1XD0A 1UR9A 2WZEA 4FF5A 1VJZA 3RM9A 3CZ8A 2E9MA 3GBEA 3MUY1 1AMYA 5C8BB 1AVAA 5BXPA 1GOQA 3B8SA 4P8UA 1OT2A 3NIYA 4TX6A 4P7NA 3AMLA 1FH8A 1VAHA 2WHLA 3MO4A 3WDRA 3POCA 3VU2A 2WXDM 3EYPA 4WKAA 1CXEA 2NT0A 1RPKA 2J74A 2PF0A 5ABFA 4P8VA 2VRJA 3PZUA 1QNRA 3AISA 2VVNA 3AHVA 3DYOA 1EGZA 2AMGA 1FP9A 2DIJA 1MFUA 1VEPA 3QHMA 1HL8A 5A6KA 5HNNA 2GJPA 4PMDA 3PZ9A 1E3XA 1VFOA 1W9XA 3GTNA 1CXKA 4HU0A 3VDHA 5HXMA 2YBTA 3BCFA 2DPEA 1Q6EA 2BNJA 3UG5A 4GINA 2BFGA 3MMDA 2Y5EA 1JDDA 3KEHA 1OM0A 2X1IA 5GPRA 2JEPA 1LL4A 3EDKA 3PHAA 1V02A 2BY0A 2VRQA 1W32A 3VX0A 2YL9A 1OIFA 3ZIZA 3OB8A 5I23A 4UZUA 1GQJA 2G3NA 2VQTA 1VFFA 3AS0A 2DDXA 1CGXA 2VX7A 4TVDA 1GJUA 1OIMA 1UHVA 4W8BA 3CUGA 2WHKA 3WUEA 4ZE5A 1AQ0A 1UH3A 1CENA 2G41A 1KWKA 4M81A 4GI6A 5ECUA 1CBGA 3WN6A 2W63A 5CJ5A 1DWFM 1HIZA 2D3NA 3W6LA 1WAWA 4B15A 2ZX7A 3UG3A 3QOMA 2WC7A 1DWHM 1FHLA 1U30A 3RM4A 1E43A 4A3YA 4UQBA 3ZSSA 1ZU8A 1IV8A 3RIKA 3FNDA 5A6JA 1CXLA 1WZAA 2D23A 3KWXA 1BYBA 3L4VA 1E1EA 2EO7A 1KGXA 3CPUA 3WQ4A 2GJRA 2VCAA 5IXEA 3SCWA 4MAZA 5A2CA 4UQDA 2XHYA 4M29A 2VMFA 2VZUA 5E0FA 4HA3A 2EXOA 5KZ6A 4QLLA 1ZJBA 3EMZA 3T0DA 2YA2A 2BVDA 2WPGA 1UZ4A 5CZKA 3AIQA 1DP0A 1SMAA 3T2OA 1HJSA 1LQ0A 2CBJA 3VNZA 2BHZA 3PZNA 3VOCA 4IPLA 2WSPA 4PMZA 1XCWA 3EMCA 4GZJA 3M6DA 5A2BA 2ZUUA 5BXTA 4U3AA 5I78A 4MTVA 5FIPA 1EXPA 2BXZA 4U3CA 1KFWA 3MV01 2WLZA 5A8OA 3UERA 3IAPA 3WF0A 3VMNA 1Q6FA 1IZJA 3L2MA 3ZJKA 5A8PA 2QMKA 5CPSA 5DMYA 2CXGA 3ZT5A 1JXKA 3NSNA 1GJWA 3VD4A 5LA2A 3WFLA 4NRSA 1MQRA 4ZXLA 2E9LA 2W67A 3SCUA 1V3JA 2EPKX 1GORA 4H8UA 2XFFA 4RE4A 1GUVA 2EPOA 1JD9A 4V28A 4H41A 3L4TA 2WMIB 2X8RA 1AQMA 3WQ6A 1QI4A 1MW1A 4C7GA 2WB5A 3W29A 5FKYA 3K4DA 2QLYA 2C8NA 4HZ8A 3QOKA 2WC3A 2YDRA 1VRXA 1U33A 1M04A 4JKKA 4KRTA 1V6XA 5HPCA 2YL5A 1VBRA 3WFZA 1PX3A 1XRVA 2YDQA 3VDAA 2CYGA 3GXMA 1NOUA 1UZ1A 1B1YA 1PBGA 4Q7NA 5M17A 1OINA 2C0HA 4W85A 1D2KA 1UUQA 4JZ5A 4MNMA 1CZ1A 3BLPX 1CEOA 5FOOA 3OZPA 4W84A 3ARQA 5BRQA 2ZXQA 1E0XA 4QP0A 1E4NA 5AC5A 1UD6A 1JZ3A 4J3SA 3QHOA 3OBAA 3GH4A 3WNPA 3AIRA 1JZ8A 5I6SA 1ODUA 1SFSA 2UY2A 3BGAA 1HXJA 3OIHA 1ISZA 4F79A 1KGUA 2ZWZA 2VX5A 1UWSA 3W4RA 1JD7A 4DUXA 3L4XA 1OT1A 1V6WA 2BXYA 2YKKA 1EIBA 3IJ7A 3PZTA 3CHCA 4WSJA 4Z2LA 2J4GA 4U2YA 4CN4A 3FN9A 4EK7A 1A3HA 2OLHA 3CLWA 4JCMA 4ACZA 1BGAA 1CGTA 3K8KA 4W7WA 2VURA 3GDBA 5BCAA 1K9TA 2CHNA 5A1AA 1DTUA 3MU7A 1TZ7A 1Q6DA 1QBBA 4Z2GA 4WF7A 4AZBA 3II1A 5A95A 1D3CA 1WDRA 3A4AA 4E2OA 5BROA 3VO0A 1G9HA 3KL5A 2WZIA 4PTWA 5ABHA 5D9MA 2ZXAA 4PMYA 3WUGA 4ZXOA 3ZT6A 1X6NA 5E6YA 4HOWA 1NOFA 3T2PA 4UZSA 3QHNA 4MB3A 2XM1A 5CXPA 3N1AA 2O9TA 4EKJA 1UR8A 1EQCA 1UWTA 5LA1A 3ZJ7A 2WHJA 3VVGA 3TTQA 4ATDA 4LYQA 4CU6A 4QCFA 2PI6A 5TD4A 3W27A 2CKSA 1W1YA 2FH8A 2JIWA 1C8XA 3WH5A 4QFUA 1BVNP 1BG9A 2V5DA 4UOZA 1J0IA 2DSVA 5I77A 4BQ3A 1MW2A 3APGA 1KBKA 5F7UA 4QCEA 5I3DA 1BQCA 4CD7A 1K6AA 3ARUA 1NWTA 2VZVA 4TXEA 3ZR6A 1UWQA 2WBGA 1E4LA 1QBAA 3VDCA 4D6DA 4W7UA 5IFTA 1UKSA 4LX4A 1V3HA 1NOWA 4DWSA 1QHPA 3FXYA 4PMRA 5AC4A 2WM0A 3CZGA 4HPGA 2PB1A 2PWEA 3SCNA 3PN8A 1E5NA 4IM4A 1BAGA 4H04A 2E8ZA 2J7FA 3BAWA 1FFQA 3AOFA 4FLRA 1B3XA 2WHMA 4OKDA 2UWFA 2D0HA 4CU7A 1BYDA 1B3ZA 4Z2KA 5AY7A 1GOKA 4NI3A 4TUFA 3AS1A 5E70A 2ZIDA 4KWUA 4HU8A 2A3HA 3TA9A 3TP4A 1JDAA 3DYPA 3SCVA 3VM7A 1JAKA 3RJXA 4C7DA 1KXQA 4KGLA 1MYRA 1OGBA 3CUFA 1ZS2A 4AD2A 2JALA 3WMBA 4W87A 2WBKA 6A3HA 1LG2A 2VX6A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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7A3HA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations