7TIMA

Structure of the triosephosphate isomerase-phosphoglycolohydroxamate complex: an analogue of the intermediate on the reaction pathway
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
ARTFFVGGNFKLNGSKQSIKEIVERLNTASIPENVEVVICPPATYLDYSVSLVKKPQVTVGAQNAYLKASGAFTGENSVDQIKDVGAKWVILGHSERRSYFHEDDKFIADKTKFALGQGVGVILCIGETLEEKKAGKTLDVVERQLNAVLEEVKDWTNVVVAYEPVWAIGTGLAATPEDAQDIHASIRKFLASKLGDKAASELRILYGGSANGSNAVTFKDKADVDGFLVGGASLKPEFVDIINSRN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Intramolecular oxidoreductase
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
publication title Structure of the triosephosphate isomerase-phosphoglycolohydroxamate complex: an analogue of the intermediate on the reaction pathway.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 88
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 1991-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 7timA00
4WQ6A 2FIQA 5EA9A 1HFBA 1GG0A 2QAPA 3PBWA 4FNSA 2Z0IA 1PL9A 3C2FA 4O12A 5BRBA 4NXSA 2H8ZA 3I7QA 4MY1A 1FWSA 2FFCA 3QJAA 1OFRA 2BX7A 4KFPA 2Y88A 3PUOA 3KVKA 2YW4A 5FF4A 5EL1A 1W31A 2J9YA 2F84A 3MW7A 2R14A 4RZ5A 4CCDA 2C14A 1WBJA 1KFEA 5T26A 3W2KA 5FF3A 2GVGA 3HG5A 3UXAA 1W5NA 2QCHA 1JCYA 1TIMA 3MI2A 2C1HA 1DJQA 3DU0A 1KTBA 3KVJA 3Q2DA 5G2IA 1VHCA 3LB0A 5BMWA 3W3OA 3UY7A 2YGYA 1IXPA 1FCQA 2RH9A 1SFJA 1FWTA 3TW7A 2RFGA 1ZHAA 1O4UA 1TSIA 2NXIA 3HBLA 4QIUA 2PE4A 4JICA 3P7YA 5HQEA 1NAL1 1YYAA 1FDYA 2VENA 3YPIA 5AHLA 2I1OA 5HR7A 3BGJA 4KKXA 4PTNA 5C55A 3NO5A 1TQXA 1AW1A 3GDMA 5D37A 4PFMA 5AC7A 3G24A 4HKPA 4XTDA 2GUUA 4JEQA 3HF3A 5IBXA 2QUTA 2XN1A 4BI7A 4O8RA 3ABSA 5EBUA 1OK6A 4N9DA 2OX1A 3QMSA 1KFBA 3UZJA 4P61A 1DQWA 1HL2A 3LTYA 2Z6JA 1F74A 4P2VA 5LKYA 5BOOA 4O54A 1H1ZA 3FKKA 1VQTA 3DGRA 4MPQA 2NWRA 3HJZA 3SW6A 1U83A 3HQ1A 4LWWA 4K38A 1F76A 4CNNA 2X30A 3N3MA 1QPQA 3B0VC 1F7BA 4QNEA 3O05A 1H61A 2V30A 4MFEA 4OHQA 3WJSA 5GVJA 3RF9A 2Y7FA 1OX6A 3PBUA 3LI0A 5HWMA 4NT0A 3SY5A 5AYXA 4JYEA 3GR8A 1GPWA 1KA9F 3W73A 4DBDA 2VEPA 2VC6A 3MP3A 5DBUA 3FIGA 1D3GA 2V5LA 2J88A 5LHFA 5AHNA 3W71A 3FKRA 3H54A 1W56A 5D32A 3KRUA 1ZAIA 1DORA 3O6CA 2VOMA 3MHGA 5FEWA 4UTJA 4OBTA 5KZDA 2B7NA 2NV2A 1TPUA 4G1KA 4O4WA 1Z48A 2X1RA 3VI2A 4B5NA 3E9AA 4WX2A 3TV8A 5E1QA 5KINA 3L2IA 1R2SA 4JR5A 4A2RA 1JQVA 1W3IA 3C56A 1LOQA 3NQMA 2I9EA 2QCMA 3M41A 5IBXC 2OT0A 1TTJA 5CPMA 3IRDA 1UUMA 5HUOA 3EXRA 4ZQPA 1EWDA 3TDFA 3PUDA 3M0ZA 1ZNNA 4IX0A 4AH7A 4X9SA 1KM6A 3C6CA 1RD5A 4IPIA 1M5WA 3P82A 2O7QA 1PVNA 2GJNA 4HHPA 2FPVA 2ZRZA 3UWWA 5FEPA 2EAWA 3VCRA 2V2DA 3GAKA 1PV8A 4ORMA 4JIQA 1HO4A 3FOKA 1GVSA 1B4KA 2DZSA 4X22A 1Y0EA 1SPQA 2EGZA 4UMBA 1MEWA 3MBFA 3O07A 3THAA 4X2RA 3M5XA 3PY2A 1UCWA 4AVFA 1VJIA 3TA6A 1FWWA 3S0CA 4LRSA 2V9DA 3TAOA 2YZRA 4OV4A 2ATMA 2WSYA 1TTIA 3L0NA 3NPUA 3M44A 1V7YA 3S5ZA 1QPNA 2ZTKA 2RDWA 4DPQA 5J5RA 3BPWA 4I9AA 1LBMA 1OFOA 4YMZA 3TFXA 4OV9A 2E5CA 2ZZ5A 1F05A 2WQPA 3QPYA 4TX9A 3NPXA 4RX0A 3NG3A 4O14A 2FPTA 3V75A 1XBYA 1DOSA 5K3VA 5LNVA 3QMRA 2HMCA 4O1CA 3NOEA 4DF2A 3A9IA 2QJGA 2YYUA 3KAOA 3NQ6A 4JTJA 1EUAA 2Y62A 2QCDA 4JS3A 3NM3A 4ZQNA 5AB3A 3CPRA 4R33A 1A5AA 4LOCA 1O95A 3B04A 3TMQA 4IOTA 4EOUA 1GVOA 3LHWA 2V81A 3B4UA 3HPSA 4XBSA 3LRLA 3CQ0A 3M5ZA 3NPVA 2DU2A 5D2TA 3TJLA 1Q6OA 2AGKA 5AYZA 2GQAA 2Y70A 1LBLA 3G1FA 2ALDA 3IIOA 4OE7A 2ZZ1A 4OU1A 4MLRA 2VFHA 2GQ9A 6ALDA 5FF7A 1PE1A 3NL2A 2YR1A 3PUEA 5CPNA 3S5OA 2QJHA 1IXQA 1Q6RA 4HSNA 3GB6A 3ABQA 1T0OA 1X6UA 1QDSA 2FB2A 1FX6A 2CZ5A 3M5YA 3NAVA 1DQXA 1YTDA 3EX1A 4I7VA 4JX5A 4JTTA 3BG5A 3RFAA 3QQ1A 1SZNA 4BF9A 4KFNA 3DENA 3DFNA 3W1TA 4A2SA 4QAIA 2FDSA 3S5YA 3O06A 3G8EA 1GVQA 1XKYA 1JRCA 2A7PA 1Z41A 2H3DA 1MO0A 4LUJA 1JCJA 3CIWA 4PH6A 3OG3A 3TIMA 1EIXA 1M6JA 3FEMA 1RQEA 4GXMA 3DAQA 2V5BA 4JTGA 3I68A 5FEZA 1OF8A 3LCHA 3E0IA 1K8XA 1TPH1 2HTMA 1LDCA 2VFFA 3CU2A 4ALDA 1FWRA 3W83A 4IQLA 4D2JA 4Z0JA 2YYTA 4DO4A 4UR7A 3EEGA 3LRMA 2WJZA 3PULA 2VEMA 4FX6M 3A22A 3LHYA 2VKZG 4UMCA 3GXNA 1YPFA 2WKJA 1TPB1 4FX8A 2CWNA 5F2LA 3NZ1A 3FYPA 4K8HA 3TSBA 2DZXA 1EX5A 1M7PA 3LXCA 2H90A 4GUFA 1FBAA 5F2MA 1TCDA 4FNPA 1DJNA 3W1LA 3TSDA 4RCXA 3KHJA 1WX0A 2H3BA 4Y96A 1W8SA 3CTLA 3NEVA 1BWKA 2CZDA 4JTIA 1X1OA 4YLWA 2ISSA 1DBTA 3N19B 1SZEA 1KM4A 1KFCA 5I3FA 5HJLA 4Z1BA 4IUOA 2VEKA 2J6XA 3MJYA 5HMSA 3H53A 1W5MA 4MOZA 2D73A 3MHUA 1TB3A 4O1BA 4NNAA 5KZEA 3LI1A 4A29A 3P67A 2Y7GA 4UTUA 4QISA 4JN6A 2P0OA 4JY8A 3C2VA 1XBZA 1IIHA 4LVAA 2DZVA 1Q45A 4UFMA 5G1YA 4BI6A 1TTQA 3P60A 3STEA 3GAYA 1KM5A 1W54A 1JCNA 2E09A 4GUHA 1SW0A 2FQIA 3TXZA 2NX9A 4QITA 3GIYA 4RZ4A 5EY5A 2QCCA 4XTIA 3LTSA 3DBPA 3M7WA 4K7VA 5TBOA 3A23A 2A7NA 3KFTA 2A2IA 1IXOA 3EX6A 4XUGA 5IM51 2CLIA 4H4IA 3W70A 3G1XA 3ZWTA 3S1XA 1IIGA 3EX2A 4JYFA 1AW5A 3CC1A 3EWXA 4LC6A 2QCFA 1FUYA 5G5IA 4LNYA 1OG0A 2QJIA 1IF2A 2ZZ4A 3B8DA 4FF7A 2BTMA 3NDOA 3RMJA 2YFOA 3W7QA 3LBMA 4O15A 1I45A 3VKJA 3B05A 1T99A 3LLFA 3B06A 3G1DA 1I2PA 1LLZA 4O13A 1ME7A 2ZRVA 4ZQRA 3UWZA 3TE9A 1TRIA 2GQ8A 3UWUA 4DO6A 3THQA 3FS2A 4XZ9A 1MEIA 1UB3A 1G4TA 1VYSX 3DHFA 4S2BA 4O16A 2R91A 2UV8G 1NEYA 5H2ZA 4ZVJA 4RXGA 1G67A 2V82A 3BO9A 2PC4A 1RZMA 2Y6ZA 1SW7A 4BR1A 3JS3A 4QQ3A 2OJPA 4EWND 5TIMA 2ZQ0A 5LNSA 5AYYA 4GRSA 5LZLA 3IIXA 3TSMA 3QW3A 1OF6A 5HNRA 4K6AA 1L9WA 1T96A 3GNDA 1H51A 2VFIA 1VLIA 5FESA 4MVAA 5K4XA 1SO6A 2R94A 2CLLA 4IMCA 4WD0A 2ABAA 2JKAA 3W6YA 1G7VA 4N9CA 1JR1A 4FEZA 3O8AA 4JTLA 1S5TA 2C16A 3GXPA 4FNQA 1F73A 1TV5A 1P4CA 2J9XA 4Z08A 2WNZA 4GJ1A 4FO4A 2YPIA 3C61A 3W1NA 5K9DA 4Z1DA 3LHVA 1QMLA 3P5YA 1LM1A 2JK2A 4JX6A 5HINA 3RLUA 1JRBA 2NX1A 2TYSA 3TK7A 1SW3A 4OWGA 3RLVA 4JDYA 2QAFA 4O4VA 4M5PA 1R2TA 3QW4B 1KBJA 4UCGA 3FJ6A 2ZFAA 5LGZA 2EPHA 3OVRA 2ZBTA 4Y8FA 2G96A 2AQWA 3W23A 3HOJA 5CPOA 1C8VA 1JUEA 2V0TA 3KXQA 2QCGA 1A5BA 3CWNA 2PURA 1J4EA 4UXDA 1LORA 3L21A 4RKAA 3W2NA 3PC0A 3G22A 1RQBA 4HNNA 1G69A 2E1DA 4AWSA 1W3TA 3W2MA 2ZDRA 3IIPA 4ZQOA 4L4LA 4YCOA 3W7NA 1WA3A 3W87A 3CM4A 3W7DA 1ME8A 3AO0A 3QM3A 3UWYA 4CCCA 5LGXA 2A6LA 3FYOA 5LNUA 1XCFA 5CZ0A 3C8FA 3G1SA 3W1PA 3PB2A 5AC8A 3QPZA 3P74A 4Q32A 1S3HA 1WOAA 1W0MA 2GPTA 2WO5A 3NPWA 4O10A 1EP1A 3C52A 3DI0A 4UTLA 1SUXA 1H7PA 3F4NA 4M6VA 3GK0A 4CNPA 1VS1A 3LOTA 4R7JA 4A3UA 3HG2A 1EP3A 4DQWA 1QO2A 2CLHA 4LC8A 3O1NA 3SIZA 5U7SA 3UZ5A 1KW1A 5D03A 2FLIA 4EF9A 3MMTA 1QFEA 2VFDA 4AHOA 1TPC1 3ZS4A 1TMHA 3W1RA 2FB3A 2V8ZA 3GX9A 2RDTA 3NYZA 4IXXA 5FEXA 5DELA 1F6KA 3UQNA 1JULA 4JTEA 3W7JA 1KLYA 1R47A 1TQJA 3DFTA 4O50A 4N02A 4TIMA 1YDNA 2QCLA 3FJLA 5KITA 1F2JA 5F4SA 1YDOA 5DY2A 4XKYB 3W07A 1H7XA 2ZYFA 2A6NA 4N4PA 1W3NA 1ICSA 3PS7A 3G0XA 4AAJA 1GEQA 3KRSA 1HUVA 1MEHA 3IV3A 4O53A 2ZA3A 2OMAA 4ML9A 1VH7A 3MUXA 1NF7A 3SJ3A 3FLUA 2ISWA 3R5EA 4I7WA 3OIXA 4AB4A 1O94A 2NX3A 4PA8A 1TPEA 3B0UX 4BI5A 1OX4B 2C0AA 2JKPA 3Q37A 3S8HA 3BVJA 4LVDA 3O16A 1L2UA 4HPXA 3S1WA 1CX9A 3IVTA 4A22A 1K3UA 1H60A 1OYAA 3W72A 4WY0B 3LX9A 4FXRA 1W37A 1HG3A 5A8GA 3STCA 1W1ZA 1H5YA 2JGYA 2W79A 4LT9A 2C18A 5F4XA 4AF0B 3IIVA 3IIZA 3NXFA 3S1VA 2DORA 2HS6A 3NNTA 3STGA 3NVTA 1FXQA 3T55A 3NL6A 3TUUA 2Y63A 4MKNA 4M6PA 5I3HA 1WXJA 1XM3A 4EF8A 2ZA1A 4W9TA 1LRTA 3PBVA 4M7TA 2YX0A 3VFLA 3W7EA 3BW3A 4U4MA 3P8IA 4NJKA 7TIMA 1IGSA 3SI9A 4UTHA 2E6AA 4K8EA 3W7CA 3DKJA 3NQAA 1Q3NA 3WFAA 1RQHA 2BLEA 1QOQA 1O60A 1YADA 3MI6A 3WK0A 4RJEA 3NQEA 2OT1A 4Z0SA 4JYDA 4O0KA 3E12A 4PEKA 4AHPA 1XUZA 4UIOA 4LU0A 1H7WA 1H7RA 2H6RA 3OEXA 2BWGA 3DHDA 3HGSA 3PSWA 5AHFA 3M6YA 5F1UA 3S6DA 5DXXA 1FY6A 3W7PA 1G4SA 1M7OA 5D05A 4HPJA 3O63A 3IEBA 1TO3A 1EEPA 5LHEA 1RR2A 5C5YA 5HR6A 4LS1A 5CPLA 4O11A 5E93A 2Z6IA 3R89A 1BKSA 2X2GA 3LCIA 5EKYA 4JTHA 1N55A 5HULA 3EB2A 4CQ8A 4OQVA 1OJXA 4LV4A 1H63A 1TTPA 4U28A 4LVBA 4JIPA 4TMBA 2W6RA 2E5DA 3C3NA 3CT7A 1KM0A 1LOLA 1EB3A 4UC5A 5EMUA 3G0SA 3W7KA 5HWNA 3PVFA 1FCVA 2ZRYA 4HNVA 2YSWA 1JJKA 4UTKA 1ZY9A 3JR2A 3L68A 4DF1A 1TREA 4K7YA 1H50A 3A5VA 3GVGA 2RKXA 1GZGA 4MUZA 3BARA 3W2LA 1VYPX 3IGSA 2WNNA 4FNUA 1K7FA 3GDLA 1R2RA 3N9RA 2VFGA 1QPRA 4HIBA 4FX7A 3NQCA 5CZSA 4N2YA 3EX4A 3OVQA 1SO3A 4Y6GA 3EWBX 5DY3A 4CCEA 3I7RA 4MZYA 3S1UA 1K7EA 1EWEA 1PS9A 3W7OA 1YXYA 1AW2A 2ZRXA 3QYQA 4MLJA 1QPOA 4CNOA 3PR2A 4WOQA 3USBA 1KM2A 2VEIA 3P62A 5CSRA 1BEUA 3TH6A 4ZZ9A 3LGEA 3BW4A 4FIRA 2G95A 3ELFA 4NUWA 3STFA 3W88A 5D02A 2X1TA 4JY9A 2DZTA 1EA0A 5DN1A 1WYIA 1TV7A 4RR4A 2A5HA 3LCXA 1JUBA 2Y85A 2HSAA 3HIJA 1SSGA 2CLEA 3TROA 3ZR4A 1KLZA 3HGOA 2FPYA 1WDWA 5G4WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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