3D5HA

Crystal structure of haementhin from haemanthus multiflorus at 2.0a resolution: formation of a novel loop on a tim barrel fold and its functional significance
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
ANLDIAVYWGQNFDERSLEATCDTGNYAYVIIGFLNTFGGGQTPALDISGHSPSGLEPQIKHCQSKNVKVLLSIGGPKGPYSLDSRSDANDLAVYLFNNFLLPPGHSENRPFGNAVLDGIDFHIEHGGPSQYQLLANILSSFRLAGTEFALTAAPQCVYPDPNLGTVINSATFDAIWVQFYNNPQCSYSSGNAEALMNAWREWSMKARTKKVFLGFPAHPDAAGSGYMPPEKVKFHVFPAAKKSYKFGGIMLWDSYWDTVSNFSSKILGEGW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Protein binding
publication title Crystal structure of haementhin from Haemanthus multiflorus at 2.0A resolution: Formation of a novel loop on a TIM barrel fold and its functional significance
rcsb
molecule keywords Haementhin
total genus 91
structure length 272
sequence length 272
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3d5hA00
2FDMA 3ALFA 1CZ1A 2DH2A 3WH8A 4MJ4A 1E40A 4MAZA 4W89A 1CGVA 3U5UA 2J7GA 2WMIA 2E0PA 1D3CA 1JD9A 2WWCA 1MFUA 4QFUA 4AIOA 2PWHA 1GPFA 4PMXA 4BQ5A 3VKKA 1CXEA 4GI9A 4D72A 5BYWA 1HKIA 1JZ5A 3DYPA 4W84A 3MSDA 3CUHA 4OOUA 2WMIB 3CZJA 5CGTA 2ZUWA 3VMNA 2VX6A 3CZGA 4DWSC 1EQPA 2OYLA 3IJ7A 5A6JA 5I79A 1ZBCA 1QI5A 2VUYA 5IFTA 3OLIA 4PCSA 3VVGA 1MFVA 3W6LA 1JXKA 1Q6CA 3N18A 1CGYA 1E6QM 1GOMA 1ITCA 3SCQA 1OIMA 1JIBA 1K9EA 2DT2A 2CCRA 5CSUA 1V3KA 2YA2A 3CH9A 3OZPA 2Y2WA 1E3ZA 1BHGA 4Z2HA 2CXGA 3ZT5A 2VURA 1PJ9A 2VCCA 2ZUTA 5CJ5A 4AC1X 3VIKA 2GDUA 3MUZ1 4HMCA 3RDKA 4M80A 2D0FA 2BHYA 3VDHA 4CCDA 1JF5A 1KR0A 2D1ZA 2CBVA 3K8KA 1XRVA 4WIWA 4HOWA 2JF6A 2O9TA 4JZ5A 1PBGA 4WLCA 3HN3A 1O7AA 3AHZA 1US2A 1W1VA 3AZTA 1JXJA 4IISA 4QCEA 1E70M 3VD4A 1OGSA 4TXEA 4ATLA 4E8DA 2WZHA 4W5UA 4HZ8A 4PMZA 2WBGA 5CZKA 1G1YA 2WZIA 3T0BA 4C7GA 1HJUA 2VJXA 2XVGA 3WD2A 4L4OA 3VGFA 4PSPA 1TVPA 1J10A 4W87A 2RGMA 3KL3A 5FKYA 1H11A 2ZWYA 2F2HA 3AMLA 1UZ4A 1V3IA 5A6BA 1Y7VA 5HXMA 2PI6A 3SEPA 2ZX5A 2GJRA 3VIPA 4OIFA 3AHYA 3HMCA 5CXPA 2YL9A 4CCCA 5GNZA 5HDRA 3VIHA 4FLSA 1V3JA 1WAWA 4XX6A 1BVZA 2D22A 5CPTA 3AIBA 3VGBA 5DEZA 1CYGA 1PX3A 2XTKA 4PN2A 3CZKA 4UQAA 5ECUA 4UQ9A 1H0IA 2WCGA 4Y7EA 3CHFA 4HP5A 4MTVA 4A3HA 2ZICA 2IUZA 1BVNP 5BRPA 3RJYA 1QI3A 1GJUA 2WSPA 1GQKA 4NRRA 4JAWA 4CN6A 3ARRA 4U2YA 3RPMA 3QR3A 1ISZA 3B9AA 1JI2A 4JHZA 4WKHA 1EHNA 5LA0A 3GNRA 3WDJA 1FA2A 3SUTA 1MQRA 2DSUA 2E4TA 2VR5A 1G9HA 3FXYA 5HNNA 1OSEA 1M03A 1E6SM 4GKLA 3WNOA 3MUY1 4U3AA 3EDKA 1JDAA 1L0PA 2VT0A 2WVSA 5CLTA 3PZMA 3AMKA 3WQVA 4P8WA 2EPMX 2Y24A 1J18A 4UCFA 2W67A 4EK7A 1LWHA 4S3KA 4MNMA 5A6KA 2WBKA 3WNMA 5FOOA 1ITXA 4PTMA 1KGUA 1QHPA 1W9BM 2X8RA 1V3MA 4J7RA 5DT5A 1JZ3A 1NOUA 1CECA 5LYRA 3II1A 2BHUA 4ZEPA 1CGWA 2CESA 2O9OA 4D6JA 2UY2A 2ZUVA 3PTKA 2BVDA 5E6YA 1K9TA 1HJSA 2NW0A 1JZ6A 4QLLA 1ECEA 3NSMA 1GQJA 3ZSSA 3CHCA 4P7OA 4CN4A 9CGTA 3B9DA 2C8NA 4UQBA 4AD1A 1J0IA 3ARWA 1UZ1A 3WD4A 1EOKA 4KGJA 1XCWA 7A3HA 3N17A 4D1JA 1KXHA 3MS8A 3U57A 2DT1A 1BYCA 2E9MA 4ZE4A 5M17A 4UOQA 1W3JA 1H41A 1AQ0A 2JALA 2XFYA 3PZ9A 4LQ1A 3MV01 3QHOA 5I77A 2BXZA 4M24A 2OYKA 1UD5A 4UQEA 3MANA 4BQ2A 4P7QA 1LQ0A 1QVBA 4RL3A 4M1RA 1BSIA 2D3LA 3GDBA 3WL0A 4ZFMA 3CHEA 4JFVA 1JL8A 2G3JA 1W1YA 1TA3A 1E43A 1JYVA 2WXDM 3OZOA 1JG9A 1C3FA 2JFEX 4MNJA 3PHAA 3S2CA 5BXSA 4R27A 3HJEA 2XWEA 5D9PA 4CVWA 2OLHA 2EJ1A 2VZUA 1ODZA 1PZ3A 4QAWA 1XSIA 1BAGA 1UR9A 3DECA 2WC3A 5D8WA 4UQDA 4AD5A 5KEZA 4Z2KA 2F61A 2J25A 1B0IA 4B9YA 2J7EA 5A8QA 2F8QA 3AIWA 1WDRA 2PB1A 5A94A 4BF7A 2EPOA 1BYAA 3OLDA 2WHJA 4DM1A 4JIEA 3AYRA 1FOBA 4ACZA 4IUGA 4EANA 4J28A 4AXNA 2CPUA 1WKYA 2VCAA 4OBRA 1CXHA 4C7FA 3ZT6A 1J0KA 1UUQA 5M03A 4GQRA 3WUGA 4HA4A 4U33A 1GOOA 4TX8A 5HOSA 2O9PA 3GM8A 1V6UA 3T0AA 4W8AA 2AAAA 5A3HA 1J11A 4X9YA 3OBAA 3N11A 5E70A 3WFLA 3MO4A 2WMHA 2CIPA 1VFFA 4QLKA 5FD0A 2VL4A 1JYNA 4RE4A 3F5KA 4IPNB 4D6HA 2BY2A 2WSKA 5I23A 2OSWA 3ZSTA 1HKJA 4PRWA 1US3A 1B30A 1NARA 2GK1A 3T0DA 1JYWA 1XD0A 3MMDA 1OWQA 1XCXA 5CPQA 1Q6DA 2YOCA 4GZEA 3WEOA 3PZIA 1DWIM 1OGBA 4D6IA 3VILA 2YL6A 4B9ZA 1ISWA 1HP4A 3TTYA 1XC6A 3ZJ8A 2A3HA 3W0KA 1G01A 2OSYA 1GVYA 3MU7A 1EDQA 3UG3A 4JFTA 1JNEA 2GUYA 1QW9A 3CLWA 5BROA 1W3LA 4J3UA 1LF1A 1DWGM 2VO5A 1N82A 3ARUA 2YL8A 3T2OA 3WDRA 2WMJA 3EDDA 4ATWA 3WQWA 1G0CA 1UWRA 3BAKA 1WB0A 3OIHA 3WNPA 2WCSA 2CEQA 1V6YA 4GZIA 3RCNA 1B2YA 1CWYA 3WD1A 3EDFA 3IJ8A 4W86A 2XFFA 4GINA 4TVCA 2G3NA 1V3LA 1JZ8A 3G6MA 1CXFA 3UCQA 1BG4A 1JF6A 4AEFA 2WMGA 2W62A 2QMJA 2OWWA 1ESWA 1XV8A 1YQ2A 3LPGA 3AI0A 2J78A 4CU6A 1KCLA 3IAQA 3AMDA 3DC0A 4NF7A 1JAKA 2PWGA 1VB9A 3VMOA 5HPOA 4UFMA 1NOWA 2PWFA 2XUCA 1NOFA 3UG4A 3IANA 5JBEA 1WZMA 4EE9A 2WNWA 2V3EA 2DGAA 2QMKA 4J3SA 2FH8A 4GIAA 4AISA 3OGSA 2V3FA 5E0FA 1GOWA 2XSAA 4ACYA 1SR0A 2VC9A 2EPNA 2VQTA 3VGDA 4EAMA 1E73M 2QHAA 4AZBA 3L4TA 4B3KA 4NSBA 3AZRA 4FLOA 3E1F1 1JD7A 1TUXA 4W8BA 3RM4A 3SUUA 2YL5A 1MWOA 1BTCA 1PX8A 2J7CA 1AQHA 1E0VA 4YHEA 3W53A 3BCDA 3U5YA 2XSBA 3QOKA 1C8XA 3CUIA 3W37A 1X6LA 1WCGA 3N04A 3SCVA 3TP4A 5BRQA 4NI3A 3S6TA 1JNDA 1VAHA 2VMFA 5I5RA 2NT0A 4HMDA 1VBRA 3WF2A 2WCAA 5C70A 3L4UA 1R85A 2WWDA 2VOTA 5EFFA 4CD4A 1FHDA 1IZJA 3DHPA 2WHKA 6TAAA 1BGGA 2FH6A 1V6VA 5A1AA 5ABEA 1UWQA 1F4AA 1UA7A 3WBEA 5TD4A 4GXPA 3PZOA 1B3XA 1CEOA 1HVQA 3BAWA 3VO0A 1GONA 1C91A 4WJXA 3WN6A 3AIRA 4PMVA 4NRSA 1V0KA 1HN1A 3GXDA 3GYCA 4K68A 1MW1A 2ZUNA 3CZEA 3N15A 4J3VA 1CXIA 3POCA 2EEXA 3WDQA 4CUCA 1JZ7A 4JKLA 3J7HA 5A2CA 1EO5A 3PZTA 2A3AA 1HKMA 3RMEA 1MQPA 4ZXLA 2VR4A 1CTNA 2WZEA 3NIYA 3BAIA 3AISA 1QHOA 2E40A 3KL0A 3WKZA 1W3HA 1MYRA 2WM0A 2XFRA 1V0LA 3VD9A 1V02A 4HA3A 4U5KA 1TVNA 5JUVA 1U33A 1W2PA 4JL2A 1WNOA 3ZOAA 4LXFA 2W91A 1QBAA 1NP2A 2J47A 3SUWA 3W26A 1CPUA 1P6WA 3SCPA 2WANA 3CTTA 3NDZA 1J12A 3ZJ7A 2D3NA 4P7RA 1C92A 3TONA 4KH2A 3FHAA 3VDAA 2W4XA 1MQQA 5C71A 2G3MA 1GOQA 2JEPA 1EA9C 1LLOA 2CNCA 1BYDA 2EPKX 1CIUA 1XSKA 3BC9A 5A6BD 3WEZA 2UWFA 4HOZA 3M7SA 1GUVA 6CGTA 4OOZA 1C8QA 4WKAA 1BFNA 1M53A 1UD3A 3K1DA 4W7WA 1DHKA 2BHZA 2XWDA 1PX4A 1ZBVA 4OUEA 4NZCA 1IT0A 1VEMA 2WVTA 1QNQA 1LWJA 3T2QA 2YLLA 1RD6A 1ZB5A 4DM2A 2WMFA 3GZAA 1CBGA 1XYFA 2WPGA 1ZBWA 4AD0A 2ZXAA 5A8NA 1XD1A 3AXXA 2Q8XA 2WK2A 4YPJA 2EQDA 1VIWA 3MUAA 3WENA 2X0YA 4MPKA 2Y8KA 3T09A 1DWFM 5A6SA 2WKGA 4AW7A 2D0HA 1M01A 4CU7A 2J7BA 4P8UA 3W25A 1SFSA 3BXWA 4OBSA 2BXYA 2WKLA 1E6NA 1HF6A 1QW8A 3GH4A 4F9DA 2YDSA 1QI4A 4UNIA 3G6LA 2VZVA 3KWXA 4OKDA 2WMKA 3TA9A 1KBBA 1UH3A 2IXUA 4MB3A 1XH0A 5DT7A 2VZTA 1WZLA 3RJXA 5ABGA 1HJWA 1V0MA 1E72M 3PZQA 2CBJA 2QLYA 3N13A 5DMYA 2E9BA 1NWRA 1D2KA 2J75A 3W38A 1HXJA 4Q22A 2Z1KA 2AOSA 3RO8A 4R5EA 1DWJM 1UKOA 3OLEA 2WW5A 4H41A 2W5FA 3VD5A 3BGAA 4DWSA 4MB1A 1NP0A 2GSJA 3GBEA 1BYBA 4PMRA 1E6PA 5GNXA 4Z2LA 4J3WA 2ZXQA 4V28A 3SUSA 1S46A 2VZSA 2A3CA 2YDQA 2ZUMA 4DWSB 2XG9A 5IDIA 3W28A 1NQ6A 3T08A 3SIMA 4B16A 2XGIA 4FF5A 2V38A 3CHDA 4PBGA 1E0XA 1WO2A 1H3GA 4L4PA 5GPRA 4EKJA 2WLYA 1TR1A 2X09A 2DIEA 3NDYA 4PMYA 3AXIA 2Z1SA 5GNYA 4D6CA 2WVVA 5EB8A 4GZJA 1RPKA 4HPGA 4HZ7A 1B3WA 4WSJA 2BY3A 4XZWA 1QNSA 4PMQA 3FAXA 3ALGA 2JF7A 2WVVB 3WELA 3AHVA 3KL5A 4S3JA 1H0GA 1B90A 4BA0A 1CXKA 3OGRA 2RGLA 3WSUA 3WIJA 1HP5A 4FLQA 2YIHA 2YBUA 2WC7A 4CVUA 4N42A 1E9LA 4JCMA 3AJ7A 3L4WA 4PUEA 4H8UA 3SUVA 4A4AA 2CITA 3ZR5A 5A69A 3PTMA 3RM8A 3O9NA 1O6IA 2X05A 7CGTA 3PZVA 2OWXA 1VBUA 4PCTA 3WQ5A 5EBAA 1KCKA 2WAGA 2BV9A 3BMWA 1CXLA 1I75A 3CUFA 5IXEA 2ZX9A 1GCYA 4E2OA 1FHLA 3FAWA 4WSKA 1R8LA 3CO4A 5A2BA 3BMVA 2A3EA 1J0HA 4TX6A 4AD3A 2G8ZA 1CLXA 3KEHA 4DUVA 5CG0A 3M07A 4UOJA 3A6OA 1DTUA 1NH6A 2XVNA 3I3BA 1K9DA 1QI2A 1AVAA 1HL8A 1WPCA 3MKKA 2W92A 3ARYA 5BXPA 2VTFA 3GTNA 4JFWA 3CMJA 2VNCA 2J7HA 2J7DA 4WK9A 4AIEA 4CD6A 3EMQA 2C0HA 3I3DA 1M04A 3MV11 3IK2A 3TTOA 3AXHA 2G41A 3CPUA 3MMUA 1E6XM 2V5CA 2E8YA 5IHSA 1UQYA 3A4AA 3AOFA 3IAPA 4XZBA 3VUPA 2BY1A 1Q6EA 3A4WA 1R86A 1NWSA 2DT0A 2WB5A 1K6AA 1UA3A 2ZOXA 3MMWA 5A8OA 5ABHA 1UKSA 2B31A 2DH3A 3L4VA 1TZ7A 1EGZA 1HKKA 1WP6A 3FW6A 2VZOA 3UG5A 4UFKA 5DO8A 1CGTA 3AS0A 4MDOA 2ZE0A 5E9AA 4AD4A 2VRJA 1UWTA 3F4VA 3TTSA 5E6ZA 5D9MA 3F5JA 2NT1A 1QPKA 3RM9A 1V3HA 1XGZA 8CGTA 4GQQA 1TG7A 3LPPA 3WH5A 3VNYA 1UD2A 8A3HA 3UESA 1MW3A 1GORA 4JKKA 3L4YA 4LYRA 4UZSA 1A3HA 4KWUA 3WH9A 3DYOA 4TOQA 1ZU8A 2MANA 2VX5A 1HJQA 5JIWA 3VIJA 1OD0A 1V6XA 3ARXA 4JHOA 3NUKA 3GH5A 1XHGA 3D5HA 1QNOA 2HISA 1UKQA 3VPLA 3GXIA 4HZ6A 2ZX6A 1OB0A 2D20A 1EQCA 4UFIA 5M5DA 4QLJA 1PPIA 4PMNA 2JIWA 1GHSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2FDM A;  3ALF A;  1CZ1 A;  2DH2 A;  3WH8 A;  4MJ4 A;  1E40 A;  4MAZ A;  4W89 A;  1CGV A;  3U5U A;  2J7G A;  2WMI A;  2E0P A;  1D3C A;  1JD9 A;  2WWC A;  1MFU A;  4QFU A;  4AIO A;  2PWH A;  1GPF A;  4PMX A;  4BQ5 A;  3VKK A;  1CXE A;  4GI9 A;  4D72 A;  5BYW A;  1HKI A;  1JZ5 A;  3DYP A;  4W84 A;  3MSD A;  3CUH A;  4OOU A;  2WMI B;  3CZJ A;  5CGT A;  2ZUW A;  3VMN A;  2VX6 A;  3CZG A;  4DWS C;  1EQP A;  2OYL A;  3IJ7 A;  5A6J A;  5I79 A;  1ZBC A;  1QI5 A;  2VUY A;  5IFT A;  3OLI A;  4PCS A;  3VVG A;  1MFV A;  3W6L A;  1JXK A;  1Q6C A;  3N18 A;  1CGY A;  1E6Q M;  1GOM A;  1ITC A;  3SCQ A;  1OIM A;  1JIB A;  1K9E A;  2DT2 A;  2CCR A;  5CSU A;  1V3K A;  2YA2 A;  3CH9 A;  3OZP A;  2Y2W A;  1E3Z A;  1BHG A;  4Z2H A;  2CXG A;  3ZT5 A;  2VUR A;  1PJ9 A;  2VCC A;  2ZUT A;  5CJ5 A;  4AC1 X;  3VIK A;  2GDU A;  3MUZ 1;  4HMC A;  3RDK A;  4M80 A;  2D0F A;  2BHY A;  3VDH A;  4CCD A;  1JF5 A;  1KR0 A;  2D1Z A;  2CBV A;  3K8K A;  1XRV A;  4WIW A;  4HOW A;  2JF6 A;  2O9T A;  4JZ5 A;  1PBG A;  4WLC A;  3HN3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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