3N9R | Genus

Total Genus 109

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	109
sequence length	307
structure length	297
Chain Sequence	MLVKGNEILLKAHKEGYGVGAFNFVNFEMLNAIFEAGNEENSPLFIQASEGAIKYMGIDMAVGMVKIMCERYPHIPVALHLDHGTTFESCEKAVKAGFTSVMIDASHHAFEENLELTSKVVKMAHNAGVSVEAELGRLMGIAVLVNPKEAEQFVKESQVDYLAPAIGTSHGAFKFKGEPKLDFERLQEVKRLTNIPLVLHGASAIPDNVRKSYLDAGGDLKGSKGVPFEFLQESVKGGINKVNTDTDLRIAFIAEVRKVANEDKSQFDLRKFFSPAQLALKNVVKERMKLLGSANKI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Rational Design, Synthesis, and Evaluation of New Selective Inhibitors of Microbial Class II (Zinc Dependent) Fructose Bis-phosphate Aldolases. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags	Lyase
source organism	Helicobacter pylori
total genus	109
structure length	297
sequence length	307
chains with identical sequence	B, K, P, U, Z, e, j
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2010-05-31

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3n9rA00

3G8RA 3MHFA 4RJEA 4UMAA 5HINA 4DO4A 1XUUA 5J5RA 5HNRA 2ZRXA 1WOAA 3PSVA 4TMBA 4MJMA 3L5AA 2CZDA 4DF1A 2CWNA 3RNDA 5HUOA 2CLEA 3HG3A 3WK1A 3LM7A 2YGYA 3TQVA 1FDJA 4HSOA 1FCUA 2C13A 3CTLA 3ABQA 4BI6A 4O1CA 1ME8A 1OFDA 2Y7FA 1XL9A 3GR8A 4DPQA 1OYBA 5SWUA 3W72A 3B4UA 3TROA 1FY6A 1H7XA 5D2TA 3W22A 3NPVA 3BV4A 4JTEA 1PHQA 2BTMA 3W7JA 1VYSX 2PE4A 3NEVA 4R33A 5EA9A 3W07A 2X2GA 1WX0A 4LWWA 4A29A 5DLCA 1PV8A 3ATZA 3CHVA 3TV8A 1TYGA 2C6QA 3LCFA 3C2RA 1LBMA 3EX6A 5LKYA 4ZQMA 1FX6A 3MBDA 4FXRA 1B4EA 1KTCA 3T44A 2DORA 3SY5A 2E6FA 3O07A 3DKJA 1O5KA 5HMSA 4UUIA 3N9SA 2YCEA 1PL9A 1I2NA 4YL2A 1TREA 2X1RA 2QJGA 4UNLA 2XN0A 2HTMA 2C0AA 4MYXA 1P5BA 3NO5A 2QDHA 5K4ZA 5DN1A 4ZQPA 5D38A 3PBYA 3PUEA 3UQNA 2RDTA 1GT8A 4JTSA 4IXXA 1LLZA 1M7OA 3RLVA 2V81A 3CT7A 2QUVA 3ZFHA 5FF0A 3WFAA 4JTIA 3KVKA 4EWND 4LNYA 3S5NA 4HNNA 4U28A 1QPQA 3NGJA 1WV2A 1LOSA 4TX9A 3HBLA 1KLYA 5LZLA 3LDVA 3L68A 4FEZA 3N3MA 5FEPA 1YPIA 2QCDA 4FXSA 3MMTA 3Q2DA 3P7YA 3ZR4A 1X8FA 5KMYA 4ADTA 3UWYA 2A7NA 4AAJA 3QEZA 4UR8A 5D2VA 4L4LA 2ABAA 5D05A 1T99A 2R14A 2F7FA 3H54A 4TIMA 3UWQA 1I2RA 4WY0B 2WSYA 2Q3OA 3QSTA 1SO3A 1HUVA 1DV7A 3B0PA 1VGAA 4B5NA 1TJPA 2JKPA 3CPRA 1A50A 3PR2A 4RXGA 3I6RA 3KVMA 3SZ8A 1CX9A 2EPHA 3L66A 5EMUA 4R7JA 4YXGA 1TB3A 4PC8A 3VCRA 2ZZ1A 2E09A 3P5YA 5DCBA 4XTIA 3C0JA 4FNPA 1HTIA 1RZMA 2C1HA 1JQXA 2FLIA 3GNNA 5AC8A 5MHBA 4ML9A 1VPXA 1QFEA 4HIBA 4RZ5A 1W3NA 3O6CA 3TAOA 1ZHAA 3SJ3A 2J24A 1LM1A 3NQGA 1UBSA 2FPVA 3C2OA 2JBMA 3F4WA 3MUXA 2CZEA 4A3UA 3M44A 4XBSA 3NOEA 1VCVA 4WJEA 4RK8A 1LLWA 4Z1CA 3H55A 1F05A 3MI2A 3NPUA 2EGZA 5LNUA 4ONVA 5C6MA 1UASA 2ZQ0A 3BARA 3NL2A 2ZRUA 3BO9A 1TQJA 2TYSA 4IQLA 4X3ZA 3W86A 3M7WA 3KXQA 2X1TA 4LS2A 3T78A 2C18A 1W5NA 4O12A 5F2IA 3QYQA 3ABSA 4HNUA 2ZTJA 4DELA 7TIMA 4RLIA 3W1LA 4H6KA 1R2RA 4I7UA 3I68A 4BWLA 3THQA 3W73A 2DZXA 2W79A 1L9WA 3FLUA 4LW7A 3VI2A 1BTMA 1VS1A 3N2XA 4XQ6A 3W7NA 1BEUA 1OVDA 3EWBX 3NL3A 4GRSA 3GR7A 3LRMA 2ZRYA 4YCOA 4C1LA 1G4EA 2FPTA 3MI6A 1PCKA 4N4QA 3CU2A 5F1VA 1Z48A 1N8FA 1THFD 1TPUA 4GUIA 3NQAA 2ZZ3A 3EWUA 3LTSA 5D2WA 2DZVA 3GX9A 1JJKA 5I3HA 4O10A 5LSMA 2DZUA 2WQPA 1ICSA 4DO6A 3P8JA 1F74A 1TV5A 4MZYA 1VZWA 3QC3A 4I7WA 1F5ZA 3HO8A 3W1UA 3PS7A 3EXTA 1V5XA 3LHVA 2X16A 3DHFA 1I8JA 1GEQA 1JULA 3MWAA 1ZNNA 1EIXA 5AN7A 4A2RA 1DVJA 3PB2A 3H53A 3C2FA 3N34A 3LHZA 5CPLA 1VR6A 4IJBA 1ADOA 2Q8ZA 4KWWA 1OHLA 2EKCA 4GNJA 4NZFA 3FYPA 2Y70A 1KFLA 5KTLA 3NXFA 4N2YA 4RCXA 5CG7A 4LVBA 5AC7A 2X1UA 3IIXA 2ZFAA 1OF8A 5TBOA 2ISVA 3CQ0A 1TTPA 3F4NA 3QSRA 1PS9A 4IWWA 5G5IA 5AFDA 4BFAA 5I3IA 5KZEA 4DXVA 1H50A 3UYCA 1AW1A 1H60A 1ZAIA 1GZGA 3O6YX 3G0XA 3KOFA 3L67A 1LOLA 2A2IA 4OV4A 3HPZA 3LI0A 1G7VA 1MSSA 2VFGA 3N19B 4EVZA 2VELA 3LCXA 3TSMA 2TRSA 1R30A 3A5VA 1E51A 1SW7A 3DBPA 4Q4KA 4ZVJA 2Z0IA 5AYZA 3HG5A 1G7UA 3QQ1A 3QW4B 2UV8G 1S5WA 1RVGA 1RV8A 4BR1A 3EX2A 1QCWA 3D0CA 4ZQRA 2BWGA 1M5WA 2WNNA 3QMRA 5CZTA 5HR6A 4JYDA 1GYNA 3OG3A 4XUGA 1LTDA 2Z1BA 4XBKA 1IXNA 4BF9A 2NUYA 1YXDA 5F2MA 4MZ1A 2V82A 4E38A 3C6CA 2A6LA 2XFWA 3G1YA 4M6PA 3QFEA 2BXVA 5H2ZA 5DXXA 2WKJA 1LRTA 2F84A 1ZALA 3W7EA 1PCWA 1I2QA 1ZJIA 3LBCA 2NXIA 3SGUA 2LLEA 3NQVA 1K8XA 1VH7A 3G1SA 2JGYA 1J5TA 4LU0A 4S2CA 3GXPA 4EF8A 3FKKA 1JCJA 2NWSA 5FF4A 5KSWA 2AGKA 3FJLA 4O8RA 3R89A 2O7SA 5FEZA 3BLFA 3HOJA 1TO3A 4AEOA 5C5YA 1U5JA 3W7OA 4MLJA 4UFLA 3GKFA 4KFNA 4WOZA 1OK6A 1SZNA 3HG2A 3JRKA 2CU0A 1I2PA 4CCEA 3N14A 1OYAA 2TSYA 3IEBA 1OFBA 3ANYA 1T0OA 3W75A 2B7QA 1F6PA 1ONRA 3LV6A 3M6YA 3N9RA 1LOQA 1SZFA 3TQ0A 5GVJA 4M7SA 2Y89A 2QJIA 2R91A 2GQAA 2V2HA 4PL1A 1GVRA 2DP3A 1UUMA 4GWEA 5F4SA 1TRDA 3IIVA 3UPWA 1F2JA 1YLVA 1SQ7A 4X9SA 5BNKA 5CGQA 4AVFA 3TMQA 2NLIA 1B3OA 3ZS4A 2H8XA 1XUZA 3WJZA 4JX4A 3W85A 1Q3NA 3GZ3A 3TXVA 3QMSA 4MPQA 1QOQA 4HT3A 3U2OA 3NQFA 1Q6RA 2NX3A 5E1QA 2Y7GA 5LGXA 3UZJA 3DFTA 5DCEA 2ATMA 1ME7A 2CZFA 2W0UA 1TV7A 1IXPA 1IIHA 1VLIA 3GDKA 5G2IA 3TUUA 4LVGA 1Z41A 4OGZA 1R2SA 2GQ8A 3W7CA 3ELFA 3BGJA 4U4MA 5EKYA 3GK0A 2PURA 1SO5A 3KHJA 3C2EA 3LLFA 4OWGA 4KFPA 2JK2A 3Q37A 4YCPA 3O05A 2NV1A 1H1ZA 4XZ9A 2NXGA 3LTYA 4JS3A 1MEHA 4NJGA 4FO4A 1O5XA 3W2MA 2H90A 5FI8A 1ICPA 1KTNA 2NUWA 2GVLA 3TJXA 5F2LA 2J9ZA 5FF7A 3A21A 4YLWA 3T55A 4KWVA 1J2WA 1K03A 2ZBTA 3G1VA 5G2HA 3ZWSA 1C8VA 3EEGA 3SIZA 4HPXA 4CNNA 1G6CA 3IIPA 3NQEA 2RDWA 3BK0A 4Q33A 1TV8A 4HKPA 4M5PA 4N4PA 1SR9A 2YXGA 3LCHA 1QOPA 3LXAA 4HNTA 3B0VC 1VHCA 3JR2A 1VYPX 4FB7A 3HF3A 3EX4A 1LYXA 3SW6A 2FB3A 3M5VA 4JXCA 3MO7A 4JEQA 4DO5A 2BLEA 4LS1A 2FFCA 3SR7A 3DAQA 4O1AA 3EB2A 3P5ZA 4UIOA 3EWXA 1TSIA 1FXQA 4UTUA 5K3VA 3TFCA 3TSDA 1HO4A 3B03A 4UTHA 3TJLA 4N6EA 3NNTA 2VEKA 2QCDB 1OX5A 3EWZA 3PM6A 1H51A 3W2KA 4GE8A 1EB3A 3DGRA 1WOBA 1DJQA 1G67A 1SW0A 1NVMA 4O1BA 3W7LA 4AH7A 4Y9AA 4AHPA 3S5OA 1VCFA 4O13A 3Q58A 3IVSA 1O94A 3KAOA 1TQXA 2I14A 3WJXA 3B04A 1K7XA 1GJPA 1KW1A 1DQXA 2R94A 1H61A 3NM1A 1XM3A 3KVLA 1GG0A 5CZJA 4QNWA 1JCNA 4ICNA 5EY5A 1OFQA 3STEA 1X1ZA 2H6RA 2YR1A 2CLOA 2EF9A 2ZA2A 3R13A 4H4IA 2WNQA 2RH9A 5DXYA 2ISSA 4OV9A 3E96A 3V1PA 1XDMA 4ORIA 2E5CA 3DZ1A 1LORA 3GKAA 1F76A 3QM3A 5K9CA 1N7KA 4Y6GA 3W1AA 3W7GA 1C29A 1J4EA 2QCNA 1F73A 4QSHA 1KFBA 1WQ5A 3QPYA 2W6RA 4PCFA 2JKEA 4POCA 4RV8A 3IGXA 2VENA 3C52A 1YDNA 4UFMA 3P60A 4QM1A 1W1ZA 2CLIA 3UD6A 3WJYA 2ATSA 2E5BA 2B4GA 1FWTA 3W71A 3G1XA 3LHUA 5AHIA 4R34A 1DOSA 1SSDA 3IIOA 4ZZ9A 5KITA 5HULA 3UPBA 1K8YA 4HN4A 4LRTA 4JDYA 1LBFA 4O52A 3GXNA 1SO6A 3W1PA 4OE7A 4CCDA 1H7RA 3S1WA 2YDAA 4JR5A 2P10A 2FDSA 3UWZA 4ZQOA 2C3ZA 2YX0A 2V5LA 2J27A 5J5DA 1EUNA 3GDLA 1TPH1 2GUUA 2WNZA 3NQ7A 3PBWA 3RFAA 1KA9F 4UR7A 2J9YA 1XBYA 4ZQCA 1LRNA 3UZ5A 3PAJA 1W56A 3AO0A 3A24A 1CI1A 4I9AA 4O17A 4YWIA 1ZAJA 3NL5A 3M5ZA 4N9BA 2QUTA 5HWNA 1L6YA 4O57A 2DJXA 3W1NA 4CQ9A 5DELA 1TTJA 2RHGA 3OBKA 3LHTA 1EEPA 4WUIA 3CM4A 5K4XA 2ABBA 4UFIA 3IGSA 5EYWA 3R5EA 1EP1A 4HHPA 4TMCA 3G1DA 1KM4A 4FX8A 3TMLA 3PBVA 1JUKA 3W76A 4CCCA 1KM1A 3A9IA 3OEXA 1TCDA 1SFJA 3W1TA 1OABA 1X6UA 1ZAHA 4TO8A 3NQCA 1RR2A 3PUDA 3LBMA 3HPSA 4D2JA 4BK9A 4WOQA 3TQKA 2DZWA 4NVTA 1ME9A 3M16A 3BVJA 2QCHA 2Y7EA 5CKSA 4CNOA 1H63A 2EHHA 3W3OA 3R8RA 2OT1A 5F2GA 2VFEA 3GNDA 4MYAA 3LX9A 3FJ6A 4UTWC 3WJSA 1IGSA 4WXYA 3W74A 2NWRA 4JTTA 3EWWA 4O50A 1NSJA 3E02A 5EPDA 3UWWA 3RMJA 2A85A 2V2CA 3EXRA 1W5QA 3L5MA 3W7IA 5D30A 2RKXA 4FHAA 3O6DA 3QJAA 2G97A 2JKAA 2QF7A 3O16A 1SPQA 3EKZA 3P61A 4UTLA 2WOQA 4CNPA 3PG8A 2E68A 1FCBA 5AC6A 4LV9A 2Q8LA 3ZWTA 2Z2UA 4JTUA 4ALDA 4Z1BA 5C54A 1YXYA 2Z6JA 4NX0A 3B05A 3STGA 5CSSA 2ZZ4A 4UTKA 4FNRA 2ZTKA 4DBEA 3GDTA 3O8AA 5HQEA 3W7MA 4IX2A 3PB0A 4UTWA 3W2LA 3CWNA 1KTBA 1OFRA 3OA3A 4O0KA 4MJZA 4MUZA 4WX2A 1EWEA 3JS3A 4A2SA 5I3JA 2YZRA 4LVDA 5L6UA 3I7RA 2P0OA 2VFIA 1TPB1 3A22A 3KRUA 4JY9A 1KV8A 5U4NA 4K6AA 4NXSA 5H91A 4CLMA 3MI3A 1I2OA 1QDSA 1ZCOA 4OHQA 1LRQA 1KM0A 4IMEA 4AWTA 4AHQA 1T96A 2OZ0A 2IQTA 1PVNA 4RXFA 3TKFA 5A8GA 1V7YA 2ZZ7A 2NV2A 4UTTC 2AQWA 2P1FA 2VC6A 4FIRA 3A5FA 1HG3A 3PG9A 3W87A 4Q32A 4DEFA 2E6DA 2YSWA 2WJZA 3CC1A 3W23A 2BX7A 1UJPA 3CIWA 1JUEA 1VYRA 3BLIA 1A53A 1PIIA 1ML1A 3HIJA 5L9FA 1R47A 1TTIA 3KRZA 4EF9A 3QMTA 3USBA 1YDOA 3HJZA 3W7PA 4WZHA 2J88A 3LV5A 4ADUA 4ZMGA 1WBHA 3TIMA 3P8IA 4JYEA 4R53A 3RLUA 4JGDA 4Z1AA 5CZSA 2E77A 5DY3A 1G4SA 4IPJA 1LDCA 1ZFJA 1XI3A 3NPXA 3PULA 1W0MA 3G0SA 1JCLA 1JUBA 4FNTA 4FX7A 2PRMA 3UNDA 1W3IA 4UTTA 2OT0A 4K39A 3W7QA 1AL8A 3L2IA 4MKNA 3M0ZA 2OX1A 1YDVA 4AXKA 3EWYA 4GC4A 4I7VA 3G0UA 3DFOA 3MW7A 3OHIA 3HGOA 2ZDRA 4IXHA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3N9RA

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