4TO8 | Genus

Total Genus 109

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	109
sequence length	286
structure length	279
Chain Sequence	PLVSMKEMLIDAKENGYAVGQYNINNLEFTQAILEASQEENAPVILGVSEGAARYMSGFYTIVKMVEGLMHDLNITIPVAIHLDHGSSFEKCKEAIDAGFTSVMIDASHSPFEENVATTKKVVEYAHEKGVSVEAELGTVGGDDVVADGIIYADPKECQELVEKTGIDALAPALGSVHGPKLGFKEMEEIGLSTGLPLVLHGGTGIPTKDIQKAIPFGTAKINVNTENQIASAKAVRDVLNNDKEVYDPRKYLGPAREAIKETVKGKIKEFGTSNRAKH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	Fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II
publication title	Structural and Functional Characterization of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus's Class IIb Fructose 1,6-Bisphosphate Aldolase. pubmed doi rcsb
source organism	Staphylococcus aureus
total genus	109
structure length	279
sequence length	286
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2014-06-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4to8A00

2JGYA 1MSSA 1N7KA 1KFLA 2AAMA 2A7NA 3BV4A 2P1FA 2ZRVA 3BARA 1JRCA 5L6UA 1K8XA 1XKYA 4LS1A 2ZA2A 3IEBA 1EIXA 2RDWA 1SO4A 4JTSA 4GXMA 1H7NA 1I8JA 5CSRA 2XFWA 3LHUA 5C54A 5DN1A 3M1ZA 1FWSA 3MHFA 3HJZA 4QJ1A 3UWVA 2YW4A 3LRLA 2LLEA 5G4WA 2ZZ2A 5DCDA 4XBKA 2V0TA 3BG9A 2C19A 1H63A 1V7YA 4NJGA 1IGSA 5HR7A 2CLLA 4LS0A 4NNBA 3H54A 3NR0A 1YDNA 5CGQA 5LNSA 1RV8A 4QQ3A 1M7PA 4W9TA 3P8JA 2Y63A 4K39A 1GQNA 3HGRA 1B3OA 3BLIA 4HPJA 3R12A 3W70A 3L5MA 2ABAA 2HMCA 4IXHA 4JTFA 3UNDA 1YTEA 3TAOA 2ZZ4A 3QEZA 4ZQMA 5HJLA 5CKSA 2A4AA 2W79A 1GWJA 3EXSA 4O1BA 3T78A 3N9SA 1R2RA 2CZFA 3ATYA 4IOTA 3WJXA 1D3GA 3PVFA 1JCNA 1FCBA 2DJXA 3CU2A 1WV2A 4O15A 4GRSA 3CWNA 1TQJA 3WK2A 5HWJA 3TAKA 4GJ1A 1LZOA 1PV8A 3TW7A 3GLCA 2C3ZA 3R13A 3IIXA 4UNLA 3SGUA 4TIMA 1VCVA 4K7YA 5D2XA 4JR5A 1WBJA 2Y89A 3S5NA 3ZS4A 3O06A 4H3DA 3LCFA 1TRIA 1VZWA 5K9XA 1Q6LA 4MVAA 4X3ZA 3UPBA 1EUNA 2QCNA 5F2GA 2YYTA 5I3FA 4N02A 2ATMA 4TMCA 3SECA 3G0UA 3W7QA 3IVTA 2B7PA 4FB7A 2YX0A 3TC6A 4GFSA 3MHGA 3WFAA 3NQFA 4O28A 2JKAA 5EKYA 2YYUA 5G2HA 3OBKA 4PEKA 5KZMA 3SSJA 1UUOA 2QDHA 4LVBA 1LDCA 4Z08A 3W88A 3TCEA 1DQWA 5J5DA 3S1VA 5G2IA 1DHPA 2G5WA 3YPIA 3N2MA 1SO6A 2BXVA 3NVTA 4RZ4A 1K8ZA 2NUXA 1GJPA 2R8WA 2WSRA 3LLFA 4K37A 4NZFA 3BO9A 1TMHA 4ORIA 4IMEA 4E38A 4UTIA 3W7KA 4IMDA 4JDBA 3A5FA 3C2EA 1P0NA 3M9YA 1BEUA 4C1LA 3HG3A 2RDTA 3O6DA 2NWRA 1WAUA 3TROA 2YW3A 2QJIA 4OT7A 4DO4A 2E5DA 1E51A 3SJ3A 2BTMA 4BR1A 4LVAA 4RZ6A 2NV1A 4ICNA 1JUKA 1HFBA 4KFNA 4UUIA 1I2QA 1O95A 3LI0A 4CQ8A 2R14A 1MO0A 3NGJA 5F2LA 3LHZA 1WBHA 3PS7A 4RXFA 1JVNA 1BWLA 3W6YA 3GAYA 3SIZA 1G4TA 3ABSA 4MFDA 5DY2A 1KW1A 3B03A 2QCLA 4QNEA 2FDSA 4RX0A 1G4PA 3S9YA 2CW6A 3GYEA 4WOZA 3PWAA 3C2RA 3STEA 1C9DA 1LRTA 3EWXA 4JICA 2BZNA 3G8RA 5D02A 3M7WA 2B7QA 4UTUA 3SZ8A 1K7XA 3L0NA 4O57A 3O15A 3M5VA 4NU7A 4R53A 1YYAA 1Z48A 3HPZA 2C0AA 1RR2A 3MP3A 3NL2A 3KRUA 5D2WA 1H60A 1YPIA 4S2CA 4FO4A 1NFBA 2QF7A 5AN7A 1A5BA 2WOQA 1NF7A 1TB3A 4KFPA 4FX7A 4O16A 5AYZA 3NPVA 4Q33A 4DO5A 3HGSA 2ALDA 5F4SA 4JX5A 1DBTA 1VH7A 4HSOA 3EWZA 4NXKA 5G2WA 2V2DA 1QO5A 2NX1A 4JNMA 3RNDA 5FESA 1G7VA 1Q6RA 1FWTA 1TIMA 1WOBA 1KBJA 2GVJA 1QAPA 2DJLA 4RLIA 1K3UA 2X1TA 1O5KA 4ZVJA 4Z1AA 3W74A 2H3DA 2I1OA 3STGA 3TK7A 4LVGA 4LRSA 2VENA 3DHFA 2RH9A 5FF0A 4PA8A 1Q45A 3LCWA 2G96A 3O07A 1XFBA 2YR1A 3NA8A 3W83A 4TMBA 2E6AA 3DFNA 3TMQA 5F1VA 1HG3A 3TSDA 3PBWA 5CZJA 5CPMA 4LNYA 3NAVA 1XCFA 3SR7A 3EX3A 4CQ9A 1BWKA 2OT1A 1A5CA 1ZY9A 3GXPA 3LCXA 2H3BA 3C4UA 1W3NA 5CSSA 3IIVA 4DPPA 5AC7A 1X7FA 1T99A 4M6VA 3GNDA 3HB9A 4O8RA 4OBTA 3KRZA 1ICPA 3W76A 4WXYA 1Z42A 3LHTA 2E77A 4X9SA 4AWSA 4WUIA 1MZHA 1W3IA 4M19A 3E49A 1QOQA 1OF8A 2QCGA 1VHNA 3QMTA 5E0KA 3TSMA 4ZQRA 3NNTA 1W5OA 4M5PA 3TFCA 2R91A 1Q6OA 4QSHA 1Z41A 1LOSA 3W2MA 4O4VA 1KM6A 1LCOA 3TSBA 3CEUA 2AQWA 3TDFA 4Q4KA 3IV3A 1IIHA 2YZRA 1QR7A 4A22A 1MEIA 1F6PA 3W7NA 3W3OA 3EEGA 2WV8A 3VFLA 5F2MA 3A5VA 5AOUA 5LSMA 3LXBA 5KINA 4YLWA 1W56A 3L68A 3A9IA 3WK1A 3DFQA 4H4IA 4TR9A 1A5AA 2V5LA 1EB3A 1Z44A 1P4CA 3NQAA 3HPXA 2FIQA 1R2TA 3L0GA 1F05A 2HTMA 3V1PA 2UV8G 3ABOA 4JTHA 3LCLA 2CZ5A 2A6NA 3LERA 2ZRYA 3W2KA 4N9DA 5FF2A 3GDTA 3FEMA 4O54A 3TE9A 2V82A 3R8RA 3G0XA 2Y88A 3MP4A 3KVLA 3QC3A 1SW3A 3P67A 5K9CA 2A0NA 4P2VA 4Y96A 2J9YA 3UQNA 3C6CA 3DKLA 5DY3A 2TSYA 5D05A 3N14A 3KXQA 1H1ZA 1XUZA 4GUGA 1FXPA 1GG1A 1RZMA 2GUUA 1OF6A 2V81A 1QNVA 4OHQA 3W7MA 4IMFA 2DZUA 4UFHA 3P62A 2GJNA 1QPRA 1OX4B 1H51A 4JYDA 3G1XA 3GAKA 4LU0A 2CLFA 2QCHA 3IGXA 1ZAJA 3PUOA 4GE8A 6ALDA 1OYCA 3H55A 2F84A 5F4WA 3GNNA 4N9CA 3S5OA 1FDJA 3W1AA 3W7CA 3G3MA 1K7FA 1JQXA 2CLOA 4A2SA 3QZEA 1SZEA 3C0JA 3S1XA 1PE1A 4WY0B 4UMCA 4MOZA 3W72A 1VHCA 3IGSA 2VFFA 4N6FA 3OVRA 5GVJA 1GVOA 1VCFA 1OK6A 3QQ0A 3TIMA 1IXOA 4O1DA 3EWBX 3M0ZA 4L4LA 1TPC1 2PRMA 3LCGA 1W37A 1OFAA 2CFFA 4O10A 1B9BA 1C8VA 1OFPA 2DP3A 3HGJA 2E5BA 3MUXA 2CLIA 1FUYA 1WXJA 1G67A 2V2HA 4IPJA 2OX1A 1ZCOA 5D33A 4LUJA 3B8DA 1GVSA 2V30A 5LZLA 1EP2A 1YPFA 3MJYA 2WNNA 3NZRA 1T96A 4Z1CA 4CNNA 4JY8A 3UWUA 3IIZA 3I7SA 4FNQA 1I2RA 3EWWA 4O50A 1DOSA 2CLEA 3Q37A 5DBTA 1G6CA 1J4EA 4O11A 4UFLA 2QCDB 4CCCA 1W54A 2C13A 3G1FA 4M7TA 3UXDA 1SO5A 3SFKA 3B05A 1DVJA 3EWUA 1JR1A 2DU2A 3STFA 1SQ7A 3MI2A 4KWVA 4OQVA 3MP5A 4EOUA 1FQ0A 5TBOA 3BLEA 3O63A 4ORMA 4M6QA 3S5YA 3WK3A 2O7QA 4CCEA 1KFCA 1C29A 4UTTC 4JTIA 3O6CA 2B4GA 4FIQA 3NL5A 1LTDA 4O0ZA 1OYAA 1K7EA 3F4NA 3LOTA 3M41A 3P8IA 4E2DA 4LRTA 3P74A 5A5WA 3WJSA 3C2FA 1U83A 4X22A 2WJZA 3JS3A 3W73A 4MUZA 1LYXA 3KOFA 5LNUA 3DU0A 4Z0JA 3LI1A 4ZQCA 2J24A 2V5BA 4NT0A 4AF0B 3E02A 2FPTA 5FI8A 3W7RA 2GQ9A 2EF9A 1LLWA 2VFDA 3HOJA 3OVQA 2QDGA 3ZWSA 2JK2A 4IX0A 1LORA 4K6AA 5IBXC 3FKRA 1G7UA 2QCDA 3PY2A 3E96A 2QAPA 4HT3A 1MEHA 2J6XA 2VXNA 3NOEA 2VEMA 4LS2A 1EWEA 2I14A 4Q32A 3U2OA 1ZENA 3FA5A 1G4EA 1H1YA 1OFBA 4MJMA 3FLUA 3NPXA 2C16A 2QAFA 4XWUA 3UWYA 1GPWA 2DZPA 3W7HA 3N9RA 2NXHA 5DXXA 5FEZA 2OZ0A 1L9WA 4MJZA 1TREA 3HBLA 3MMTA 2QJHA 4UTWA 3GDLA 3KAOA 1AMKA 1FCUA 3P5YA 3ELFA 4MZ1A 3WJWA 3PR2A 5LHEA 3FJLA 2HS6A 3NXFA 2KZHA 5C55A 2BLEA 1H7XA 4IGHA 4UTMA 3NPWA 1R47A 4ZZ9A 3UZ5A 3DZ1A 5D09A 1KTCA 4UFKA 3UPWA 5HWNA 4UR7A 3BGGA 4FXSA 3G1SA 3LV6A 4JTTA 4C1KA 4MYAA 3P60A 4YWIA 1EEPA 4O53A 1ONRA 4LC6A 4XKYB 2EPHA 4ZQOA 4J9JA 3LHWA 4ZQNA 3PUDA 1TTJA 1ZHAA 2IQTA 1R30A 4M7SA 5D2YA 4OV9A 3QW3A 7TIMA 4NNAA 1A53A 1VGAA 2C1HA 3KHJA 1YTKA 1ME9A 3Q58A 3BG5A 4ONVA 2GVLA 1LP6A 1KV8A 1OFOA 3F03K 2VEIA 3BW3A 5K4XA 1H7OA 3EKLA 3RU6A 3FFSA 4MIMA 4ADSA 2Z2UA 2A7PA 3EWYA 3IIPA 3O16A 1EA0A 1TPVA 3BGJA 5J5RA 1A50A 4O19A 5T26A 3RLVA 3PM6A 3CB8A 4FF7A 2P10A 5U7SA 1XI3A 1I2NA 5LGXA 3OIXA 4IWWA 4UTTA 1KLZA 3G1DA 1DJQA 3NQDA 4HSNA 5U4NA 1GVRA 1RVGA 4Y90A 3C2VA 3UY8A 1TPB1 3P5ZA 4GBUA 4AB4A 1OFRA 2GVGA 5CPNA 1UASA 2VFHA 2ZZ3A 4LOCA 5HULA 4IJBA 2E1DA 3AJXA 3WK0A 3M6YA 3CWOX 5CG7A 5D37A 3T55A 3S0CA 1PVNA 1P0KA 3NM1A 1NAL1 4GC4A 1R46A 3GIYA 1H50A 4OE7A 2OJPA 2NX3A 1J2WA 3IIOA 1DL3A 3GDKA 1IXQA 4HN4A 1O5XA 1W5NA 3CLMA 1KTBA 3EX4A 2OT0A 3QMRA 4DO6A 4XZ9A 4KFOA 2GOUA 5K4ZA 2QJGA 3KRSA 3JR2A 3CIWA 1GVQA 1TSIA 4MLRA 2A6LA 4NXSA 1TCDA 2V2CA 4RR4A 4ALDA 1QO2A 1LRNA 2JKPA 4Y6GA 3O6YX 2BX7A 1B4EA 3IVSA 4Z1BA 1OFEA 2B0MA 4D2JA 3ABRA 1VPXA 4LV9A 2YFOA 5AHEA 1VRDA 3T7VA 3DENA 4O0KA 4E2BA 1OG0A 5EBUA 4NUWA 5CZ0A 3VKJA 2FLIA 1YLVA 2A85A 1XL9A 1RD5A 3L5AA 2GJLA 2NZLA 2H6RA 3TNOA 1DJNA 3SY5A 4FEZA 1SSDA 3MI3A 4EF9A 2QUVA 4LV4A 2NUYA 4NVTA 1B4KA 1KM0A 4LVDA 1OVDA 4U4MA 1P1XA 3SI9A 1LROA 2Q3OA 1IIGA 3MBDA 2DZWA 1FDZA 2E68A 3CHVA 3EXTA 4I7VA 2X1SA 2X1UA 3N73A 4RCXA 1Y0EA 3G1AA 3LX9A 3KVMA 2ATSA 4TO8A 1IF2A 1U5JA 1TPEA 1TPH1 1W5QA 2WSYA 3FKKA 3BVJA 2C14A 2YXGA 4DBEA 4UC5A 3FJ6A 3G18A 2H8XA 3W1PA 4LUIA 3P81A 4NQ1A 4BF9A 5AYXA 3PB0A 4FNUA 4JTEA 3R5EA 1UB3A 4NZJA 1XC4A 4WXZA 3C52A 1GG0A 4AEOA 3G3DA 1XDMA 5IM51 3B0PA 5BOOA 3NEVA 1ZALA 4DXVA 4X2RA 4O17A 4YCOA 3HG5A 5MHBA 1LOLA 3NPUA 3W2NA 3T44A 3DI1A 1H62A 3QH2A 3W7JA 3U6WA 1ICQA 1AW1A 3W7EA 4MZ8A 3W23A 5DBUA 4HPXA 2QCFA 2TRSA 4NJHA 2EAWA 1OX5A 5AB3A 4R33A 2Y70A 3L67A 4O14A 4AAJA 3QSRA 5BMXA 3TJLA 3L9CA 1SUXA 1PIIA 5FEWA 3LTYA 1RQEA 3UWWA 1EP3A 2Q8ZA 5EMUA 1KM5A 4N4PA 3NQMA 3A23A 3DFPA 4AVFA 3M47A 1NSJA 4IPIA 3PG8A 4FNSA 3ZFHA 2ZZ5A 2Y7GA 3N2XA 2ZTKA 1KM3A 3G8EA 1TV8A 5F1UA 1SZFA 1GTEA 3TKFA 3DAQA 3I7RA 4LVFA 3LXCA 4JTJA 1D3HA 1HL2A 1KLYA 2CLKA 4A2RA 4QAIA 1EX5A 1CI1A 3NQ7A 1O94A 3W07A 4A29A 1H7RA 5BRBA 3B04A 1HO1A 3G1VA 1SO3A 1X1OA 1IXPA 1FX6A 2PRHA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4TO8A

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