1X7F | Genus

Total Genus 123

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	123
sequence length	361
structure length	347
Chain Sequence	MERKLGISLYPEHSTKEKDMAYISAAARHGFSRIFTCLLSVAEFKEIINHAKDNNMEVILDVAPAVFYSDLSFFAELGADGIRLDVGFDGLTEAKMTNNPYGLKIELNVSNDIAYLENILSHQANKSALIGCHNFYPQKFTGLPYDYFIRCSERFKKHGIRSAAFITSHVANIGPWDINDGLCTLEEHRNLPIEVQAKHLWATGLIDDVIIGNAYASEEELEKLGNLNRYMLQLKVHFVDEATEVEKRATLQELHVRRGDITEYMVRSTEVRKKYKDYDFPVRESVLQERGQVVIGNNSFGKYKGELQIILKEMPIDERKNIVGTIAEEELFLLDYVGAWTQFTCVE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of an uncharacterized B. cereus protein rcsb
molecule keywords	outer surface protein
molecule tags	Structural genomics, unknown function
source organism	Bacillus cereus atcc 14579
total genus	123
structure length	347
sequence length	361
ec nomenclature
pdb deposition date	2004-08-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF05913	DUF871	Bacterial protein of unknown function (DUF871)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.40.100.10	Mainly Beta	Beta Barrel	Cyclophilin	Cyclophilin-like	1x7fA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1x7fA01

2IGWA 2A0NA 3EXRA 5CGQA 4UCGA 4NVTA 1K8XA 3UWZA 2Y63A 1N55A 3WFAA 1OHLA 2FPVA 4BI7A 4FF7A 1VJIA 1W0MA 5F4XA 3IV3A 1UBSA 4N9EA 4M6QA 1J5TA 2C16A 1HUVA 2VC6A 1LOLA 2EKCA 3HF3A 3MI6A 5LHFA 1VAIA 4BI5A 3NZRA 3G1SA 1FUYA 3LTPA 1G4EA 2B7QA 2CFEA 1W3IA 4XBKA 2ZZ2A 3EWXA 3PBUA 4YUMA 5HNRA 1H7RA 1TREA 1MEWA 4I9YA 1HL2A 2ZRZA 3TROA 4BFAA 2YXGA 4IJBA 3WJXA 2BLEA 1H7PA 3JS3A 3L5AA 1H50A 4NNBA 3HJZA 4MZ8A 1F7BA 5I3HA 1FXPA 2EPHA 3O6YX 4FXRA 2ISWA 3HGSA 4O28A 4O52A 4JYDA 4AH7A 4WY0F 4O4WA 4A21A 3VFLA 4QM1A 3N2XA 3UXDA 3I65A 1TPVA 2E1DA 4O53A 2E5DA 2XN1A 3NO5A 1IIHA 3K0RA 1LOPA 1C8VA 2FPYA 3UPBA 3G8EA 3PB2A 1CX9A 1EIXA 1SW3A 2Z0IA 4O8HA 3ABQA 2WNNA 4IXHA 3G3DA 4OT7A 2LLEA 2ABBA 1EWEA 3BLFA 2ZDRA 5C5YA 3W1AA 1RPXA 2VEPA 3LCFA 5F4WA 1IIPA 3EX4A 4GFSA 2Z6JA 5I3JA 1L2UA 1W3NA 4N4PA 5HQEA 1A5AA 3U6WA 3NOEA 1YNDA 1KFEA 1KFLA 5CSSA 1VCVA 4ADUA 3IIPA 3EX1A 3CB8A 5G2WA 4A2SA 4JY9A 3QQ1A 3W1LA 3CQ0A 3PULA 3CYSA 4LV4A 1QO5A 5F2MA 3K0QA 3I7SA 2ZZ1A 1W3TA 5A0EA 3Q94A 3UWWA 3B4UA 3C0JA 5AOUA 1QMLA 4M7TA 2C3BA 1B4KA 2ISVA 2YFOA 1V9TA 3UPWA 1BWKA 3T4CA 3BG5A 2OSEA 1TO3A 4M6VA 4NJJA 5HJLA 1LP6A 3TJLA 3RNDA 1XFBA 1DBTA 1DORA 1LORA 3MYPA 3RK8A 5BMXA 5KMYA 3G1AA 1MF8C 1TRDA 4J5BA 5HUPA 1I2QA 5K9XA 4PL2A 5K9CA 4MVAA 4JXCA 2OCZA 2ZQ0A 1GEQA 4NNAA 3GDRA 4LRTA 2R91A 4FHAA 4WY0A 2IGVA 2A6NA 1VGAA 2Q8ZA 1QPNA 5LGXA 4FNSA 1JCYA 4JTSA 1VHCA 2ZA2A 4JTLA 5KUNA 4WY0B 3GIYA 2E09A 2A7PA 1E8KA 5CBVA 1KFCA 2FLIA 4DGCA 3G1XA 1EA0A 3NL3A 3W1XA 3PM6A 3E96A 1W8SA 3QSRA 5IBXA 4DO5A 3R5EA 5H2ZA 5D05A 4MLJA 2HSAA 1BEUA 2CFFA 5J5RA 1MEIA 2HS6A 3L5LA 2HTMA 2YGYA 1OX4A 1RQHA 2C3ZA 3W7MA 3TFCA 1DQWA 1J2AA 1SO6A 4AHPA 3LLFA 3PUEA 4HNUA 1Q3NA 1S3HA 2MS4A 1OX4B 1LDCA 1M9CA 4JDBA 3LBCA 1AK4A 2BSLA 4NJIA 3W71A 1CYNA 4C1KA 4EYVA 1CWKA 1LOSA 1VLWA 4ALDA 3RFAA 2O7SA 3L5MA 4K7YA 3E02A 4WD0A 3DU0A 4JTEA 2H6RA 3AO0A 4B5NA 1E51A 5KZMA 1D9EA 2GQAA 1TV8A 1PHQA 4CLMA 3N9SA 1F73A 4AXKA 1SUXA 3VNDA 3MHUA 3DXIA 4RXFA 5FEWA 4GE8A 4LVGA 3WK1A 4GC4A 3TW7A 5KUSA 4Z1AA 3RCKX 4XTDA 1T8XA 7TIMA 1TQJA 2OMAA 1VDNA 3PG8A 4DF1A 4E2BA 3W2MA 3BLEA 1CWMA 3NQAA 3U8GA 4PC8A 1ZY9A 4MYXA 3GR7A 2X7KA 3R59A 3DFNA 3S1VA 2GW2A 2YDAA 2FIQA 1T96A 1ZAJA 3B0VC 1MO0A 2DORA 1FWSA 4O19A 3L0KA 4ZSCA 4YUHA 1LROA 3RCFA 5CZSA 2NV2A 5KV0A 1VYRA 1WX0A 3JR2A 4RLIA 4YUJA 1QAPA 1Z41A 2GOUA 4MKNA 3KAOA 1UJPA 2G95A 5KTLA 4N02A 4JTFA 3SW6A 3R4GA 3LCLA 3ZFHA 3DHFA 3LX9A 3LCWA 4NJGA 1O95A 2TSYA 4UFLA 1A33A 1SW7A 4JNMA 3W74A 3W72A 1FCVA 1W5PA 2WV8A 3LBMA 1KLYA 4JYFA 2PRLA 3RLVA 3CYHA 3W2KA 3O1NA 4LS2A 4CQ9A 1LLWA 2DP3A 3G0SA 4DQWA 2Q3OA 4MLRA 2V2CA 2ALDA 4S1FA 3FJLA 3G1VA 4UTUA 4AF0A 4UTWC 3JRKA 3G1FA 3R89A 2A4AA 2Y61A 4RKAA 5CBTA 1R2TA 2KZHA 4A2RA 1DL3A 4EF8A 3WK3A 5F66A 4AF0B 1CWLA 1Q6QA 1TTIA 1XUUA 2A6LA 2D73A 4FNQA 4MIMA 4UFIA 3G0XA 4PFMA 3FKRA 3IGSA 5G1YA 4Z0SA 4O8RA 1S5VA 1V7YA 3EWUA 5KUQA 4LUJA 5CPLA 4YUPA 3GAYA 1CWHA 3BG3A 3OEXA 4O1BA 1KM0A 2OJUA 5F2IA 2Y7GA 1SFLA 3HPSA 1YDVA 4NX5A 4J59A 3TW6A 5FF3A 5AHEA 1CI1A 4RJEA 1EX5A 1OCAA 1XL9A 2RKXA 5K3VA 2E5BA 2X30A 1BKSA 5CPMA 4I9AA 2F84A 3OVPA 3MMTA 1QFEA 2ZZ3A 3LXCA 2CZEA 1I8JA 1P1XA 3P7YA 2CZFA 2O7QA 2YR1A 3NQ6A 3LRLA 3M1ZA 3GDKA 3GVGA 1TMHA 3CEPA 2E6AA 3SZ8A 3OBKA 4ORIA 4O1DA 2CMTA 4ZL1A 3S6DA 1RR2A 1SO4A 1FWRA 2YW4A 3Q37A 4UMAA 1Z48A 3RCIX 3K30A 1H60A 1AWUA 3PWAA 4LWWA 1Q6LA 3VKJA 3IIXA 2WPBA 3S42A 1H0PA 1A5BA 5KV1A 4O1CA 1DJQA 4AWUA 2ZCGA 1O5XA 1WAUA 3K0OA 1QWGA 3E9AA 2Q8LA 3SI9A 1XUZA 1SZNA 2FJKA 1AL7A 3NM3A 2HS8A 5AHNA 2VFFA 3T44A 1SZGA 4DF0A 4FEZA 2QDHA 4YUKA 1FBAA 1GVQA 3NDOA 4O10A 1XM3A 1WBHA 3BLIA 1M9DA 1L6SA 1XXXA 2ZA3A 5G4EA 4K36A 5KV2A 4W9TA 4HSNA 5SWUA 3DH7A 4A29A 3LHVA 3B05A 1FWNA 4CYHA 3EWBX 3QW3A 3R13A 4NJKA 4ADSA 1A5SA 3LHUA 1C29A 4IX0A 2HE9A 4O16A 3L67A 4DEFA 4J5DX 2CLFA 2HQJA 1R2RA 1GZGA 4JTUA 3NGJA 2H90A 4L4MA 3DZ1A 4LRSA 1W54A 4BI6A 3Q2DA 3NQMA 4O50A 3ZS4A 2X1SA 4MY8A 2DZVA 1LLZA 4HNVA 1O60A 2VFEA 4YXGA 3S0CA 3NQ7A 1W31A 5IBXC 1TSIA 1KBJA 2ZZ5A 2X16A 1ALDA 1OFBA 3N19B 2WJZA 4LQWA 1FCQA 1G4PA 3QW4B 1PCWA 4N4QA 1EP2A 1JQXA 1MZHA 4UMCA 5TQLA 2PCQA 1JCNA 3NPUA 3OREA 3SIZA 4HNNA 3T7VA 4DGBA 1MEHA 1LM1A 1XO7A 4NU7A 3TK7A 3S8HA 3B0UX 3D0CA 1LTDA 4IMDA 2A85A 4D2JA 5KUOA 3A22A 4RXGA 4E38A 4EVZA 3LV6A 1TPEA 3SY5A 4UFKA 2VKZG 4MFDA 2TRSA 4GJ1A 3W7LA 1EEPA 5F2LA 5E1QA 3P80A 1DVJA 2W0UA 4ZQRA 1GVRA 4IOTA 2QCHA 1JQVA 3DGRA 4ZQPA 1CW2A 2CLIA 3OPFA 1PCKA 3LHYA 2A7NA 3NPWA 4GUIA 3I6RA 3BT8A 4NJHA 3STCA 2FPTA 3O7TA 6TIMA 2C15A 1VLIA 3S5NA 4EIVA 3BGJA 3RCLA 2E68A 3TMQA 4Z0JA 4CCDA 1W8MA 5AHFA 4GWEA 4HT3A 1TCDA 1KTBA 3RCGA 5HINA 2VFHA 4O4VA 5DBTA 1SZFA 5G5IA 3M5VA 3B06A 3QQ0A 3W70A 1FGLA 3M0ZA 1M6JA 3LCIA 3PBYA 5CPOA 3NQCA 2ZRYA 5IM51 4FRUA 1TYGA 4X2RA 2G96A 3K2CA 1UASA 4KFOA 1JRBA 2QUTA 3LGEA 3TCEA 2WSRA 3TC7A 2N0TA 5I3KA 4HY7A 1YTKA 1S5TA 3W2UA 4LVAA 2TMDA 4HIBA 2IQTA 3BW4A 4IWWA 1FQ0A 1JUKA 1DQXA 2DZWA 2RMBA 2QCMA 1H1YA 4K6AA 3R57A 3HPZA 3NXFA 1CWBA 3K0MA 2QCEA 1JRCA 1NSJA 1A53A 2XN2A 3GNNA 3FYOA 4FIQA 1LCOA 2QJHA 4CNNA 1SR9A 3CEUA 3STEA 3QH2A 3A5VA 4TO8A 1AG1O 2B7NA 3TR2A 4HPXA 4N1NA 1ICQA 5H91A 3TV8A 2QCFA 3PVFA 2E6YA 3KVLA 3QZEA 3R49A 3IIZA 4IPZA 4S1EA 2JKEA 3FEMA 4FX6M 3IRDA 3N9RA 1AL8A 1AWSA 4UXDA 2G97A 5L6UA 3LM7A 1QCWA 3R56A 2K7NA 3LI1A 4NX0A 4OE7A 1KM4A 5LNRA 2FQIA 3QM3A 3ABSA 3O8AA 1WA3A 1WOAA 5D02A 3PC0A 2H8ZA 1EB3A 4JJMA 3LDVA 4X3ZA 2WFJA 5AB3A 2WSYA 3GLCA 1VC4A 4WOZA 2Y62A 2MC9A 4QJ1A 4M6PA 5KURA 2NWSA 4QITA 1K7XA 3DFTA 3LXBA 1VRDA 1GQNA 2GQ8A 3M43A 1YLVA 1F2JA 3NQDA 3FKKA 4TMBA 4J9JA 3C52A 4YUOA 1F6KA 4WX2A 5CCRA 3GZ3A 4UTWA 2FU0A 1CWFA 3FFSA 5F2GA 1JR1A 1NF7A 1GG0A 5HR6A 4JTHA 2V9DA 1VQTA 4RZ5A 3W7RA 1Z44A 3BG9A 2NXIA 4UFMA 1ME9A 4DGDA 3M5ZA 2NUYA 2E77A 4L4LA 3DFOA 3MWAA 1OFAA 1OYBA 1H7OA 3IGXA 1I45A 3RD9X 5DY3A 1GVFA 4JDYA 1TV7A 3NL6A 3P62A 5LGZA 2B7OA 4ZVJA 4JTTA 4TU1A 2I9EA 4JIPA 1ZKFA 5FF4A 1OK6A 1OFEA 1PE1A 2V30A 5FEPA 4Y96A 2J27A 4YWIA 1BWLA 3TNOA 3UD6A 2J24A 3W83A 5KV3A 1SPQA 4MJMA 1EUNA 4LU0A 3M16A 4XQ6A 3EKZA 4IGHA 5D2XA 1RD5A 3N2MA 1J4EA 3W75A 4JYEA 3TQ0A 1KV5A 2E6DA 4AWSA 1SU5A 1G4SA 1NFBA 1FCUA 4O18A 1YXDA 3NA8A 4OHQA 2GVGA 1MSSA 5D04C 3BW3A 2J9YA 3QPZA 5J5DA 4Q32A 1KM2A 4LTSA 5DXXA 2OT1A 3LLDA 4CQAA 4MYAA 3VI2A 4A3UA 3MI3A 1F6PA 1PS9A 2NX9A 1B4EA 4JY8A 5DELA 2DJXA 1OFQA 3O15A 1CWCA 5T26A 4AVFA 4K39A 3ELFA 4QIUA 3W7NA 1FDYA 1G7UA 3HOJA 1K7EA 1CWAA 1F05A 2V81A 1UUMA 3NL5A 3KRZA 2VFGA 1SSGA 2VXNA 5HWJA 1VBTA 3P84A 1Z42A 1WBJA 3W7KA 4U28A 1XWNA 1XDMA 1ZJIA 4K8EA 3QPYA 4M7SA 4O0KA 3RMJA 5G1TA 4K37A 3BARA 2R14A 1KTNA 3KXQA 5D30A 3TAOA 3QMRA 1EP1A 1MIKA 1AK5A 1DYWA 1X8FA 3UY8A 3MW7A 3TA6A 2X2DB 3M5YA 4RV8A 1HFBA 2BZNA 2EHHA 3HG5A 3GB6A 2UV8G 2CLHA 4XNCA 2TYSA 3CM4A 1NEYA 5KZDA 1FXQA 5TIMA 2NULA 3SFKA 4LNYA 1SW0A 3LV5A 3O07A 4RK8A 1D3GA 3ATZA 2WNZA 2YYUA 5KUUA 4FNUA 4CNOA 2V2DA 2ZZ7A 4FB7A 4KKXA 4WUIA 4WOQA 2C14A 5KZEA 4RX0A 4NXKA 3BPWA 5EYWA 3TE9A 3EWZA 4CCEA 3W84A 3STGA 1FY6A 1EP3A 1O94A 4MZYA 4DPQA 3M9YA 5CZ0A 2RDTA 1GVOA 3LERA 3KVMA 1TIMA 3QSTA 1UB3A 3NL2A 4LVBA 4I7WA 3TXZA 3BW2A 3TUUA 4J5EX 5CKSA 2WLWA 2YZRA 2VEIA 1W5NA 1CWIA 1JJKA 1QNGA 2CK1A 3NPVA 3UWUA 1VHNA 2V2HA 5K4ZA 3BKPA 5G4WA 3GKFA 3F4NA 1XBZA 4DGAA 3STFA 1KM5A 3DHDA 5C54A 3S1XA 3O63A 1G6CA 5DCEA 1KTCA 2Y89A 5CG7A 1SQ7A 4POCA 2CLMA 2DZXA 3W3OA 3S5ZA 4S2BA 1UUOA 2NUXA 2ALFA 2RDUA 2QERA 4DF2A 3LOTA 5HR7A 1VR6A 3FYPA 3QYQA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1X7FA

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