2P0O | Genus

Total Genus 113

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	113
sequence length	370
structure length	353
Chain Sequence	AMYGISVFLGEEITNDTIIYIKKMKALGFDGIFTSLHIPLYRQRLTDLGAIAKAEKMKIMVDISGEALKRAGFSFDELEPLIELGVTGLRMDYGITIEQMAHASHKIDIGLNASTITLEEVAELKAHQADFSRLEAWHNYYPRPETGIGTTFFNEKNRWLKELGLQVFTFVPGDGQTRGPIFAGLPTLEKHRGQNPFAAAVGLMADPYVDAVYIGDPTISERTMAQFGYYHQTNQFLLEVAPSESRYLKRILGTHTNRLDAARDVLRSELATIESEQTEARPVGTVTIDNEKYGRYMGEIQVTLVDLPKDEKVNTITRIIDKDQTILPLIKAGNQFTLVTEGTIENEFRKLNN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The structure of a conserved protein from locus EF_2437 in Enterococcus faecalis with an unknown function. rcsb
molecule keywords	Hypothetical protein DUF871
molecule tags	Structural genomics, unknown function
source organism	Enterococcus faecalis
total genus	113
structure length	353
sequence length	370
ec nomenclature
pdb deposition date	2007-02-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF05913	DUF871	Bacterial protein of unknown function (DUF871)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.40.100.10	Mainly Beta	Beta Barrel	Cyclophilin	Cyclophilin-like	2p0oA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2p0oA01

1W5PA 5KZEA 1VGAA 1DORA 5KSWA 3OREA 2A5HA 3W1AA 3W7QA 3O06A 3QRHA 3W3OA 1LLZA 3F03K 3BG5A 5U7SA 2X30A 4FXRA 1TTIA 1Z41A 3LCLA 3P81A 1LBFA 4PEKA 1CWOA 1AWRA 3TDFA 3MJYA 1KFCA 2ISSA 3C3NA 2ZTKA 3K0RA 1KTBA 3W2MA 1JULA 4Y8FA 1EIXA 3T55A 4UFMA 1CX9A 5G4WA 5DCDA 3PVFA 4JD4A 3W7DA 3NQAA 2OJUA 3PBWA 1IXQA 4JTSA 5FI8A 3C0JA 1DBTA 1FXPA 2B7PA 3P82A 5KUSA 1QOPA 3YPIA 2GQAA 4LS0A 4LW7A 1M9FA 3HMJG 1N8FA 2CLHA 1FUYA 3O15A 3RDDA 2YSWA 5EBUA 5DLCA 3TAOA 4K37A 4JDYA 2GW2A 1FDJA 2PRLA 1XQ7A 1TPB1 4LVFA 5DN1A 5KUZA 1XBZA 4CCCA 1TB3A 3TXVA 1O4UA 2Z0IA 3KRSA 1O94A 2A2IA 4KFPA 1CWHA 3TMLA 4Z1AA 4IGHA 4GUJA 4MY8A 1VCFA 2EGZA 1H7NA 2HS8A 3HGOA 4DO5A 3CTLA 3S9YA 3RCKX 3W7OA 4N9EA 3WK1A 1Q45A 4GFSA 3MMTA 3I65A 4JDBA 1LORA 5K9XA 1IIGA 1SR9A 3IVUA 1W8VA 4HIBA 3D0CA 3PC0A 3HPZA 4O18A 3K2CA 3STCA 1G7UA 4UTWA 4DF1A 2ABAA 1FWRA 3CPRA 4NZJA 1V9TA 5G2HA 3KVKA 2D73A 5EYWA 4L4MA 1PCWA 4I7WA 1D9EA 4LNYA 1C29A 1JCLA 3KFTA 2WSYA 3MYPA 4DGDA 1WDWA 3HB9A 5CGQA 3MHFA 4L4LA 1HL2A 1H1YA 4OT7A 3PUDA 3BARA 3I7RA 5KUOA 4HSNA 1FDZA 4QAIA 1RQBA 3W76A 1LROA 1PL9A 1TQXA 1B3OA 5D32A 1B57A 3N2XA 1K8ZA 4XBKA 3QZEA 3E9AA 2EF9A 3W73A 3C6CA 4TOTA 3JB9d 2ZCGA 2I1OA 3O6CA 1QPQA 5K7JA 4X9SA 1TPC1 2R94A 1ME9A 3HF3A 4YUPA 4HNTA 1RZMA 2RKXA 5A5WA 3HG4A 3MP3A 3MBFA 3PBUA 1E3BA 1RD5A 5D33A 2GOUA 2XFWA 3A22A 4ORIA 3SW6A 3OVQA 1KBIA 2H3BA 4BFAA 2CZDA 2C18A 1G7VA 4FO4A 5CPMA 5D30A 3GKAA 1GVOA 3G22A 1OABA 5D09A 1I8JA 3O8AA 3M9YA 1YADA 3ZWTA 1BCKA 3G8EA 2I14A 2A2NA 1ZKCA 3RLUA 4ZQCA 1H1ZA 5CCNA 5F1UA 3NPWA 4DGAA 4O10A 1DQWA 3LOTA 1TREA 2CFEA 1OFQA 2Y88A 4UNKA 1V5XA 3ZS4A 1FWWA 5DCEA 2IQTA 1S5VA 1W1ZA 5D2XA 4ZQMA 3GAKA 4WY0A 3PBYA 5D37A 3TX9A 1EPXA 5KUVA 2WKJA 3LRMA 1Q6QA 3SR7A 2P1FA 3UWWA 1L2UA 1M5WA 1SSDA 5FESA 3NQCA 3TJXA 1JUKA 2ESLA 4N1RA 2G97A 2H90A 3EWWA 1XWNA 1G4PA 5HQEA 2NUYA 3NO5A 1I2QA 5DUDA 4QQ3A 4MZYA 4AVFA 1K8XA 1QOIA 3EOVA 1QWGA 1OFOA 2X2GA 5LNSA 3R49A 4UMCA 1YTEA 1KM2A 1JR1A 4N6FA 5F2IA 3MP4A 1F7BA 1IGSA 1TIMA 4HN4A 3BW3A 3R89A 5BMXA 1WAUA 1F2JA 1KFKA 1Z42A 4S1JA 4X2RA 1NF7A 1XBXA 4AB4A 4UTHA 4H4IA 4MKNA 1SSGA 1N55A 4DPPA 2CLLA 1RVGA 1LOSA 1LOLA 3PG8A 2Y62A 5G4EA 1TV8A 3EWZA 3LV6A 4LOCA 2VENA 3VI2A 3S8HA 2J9YA 2Y7EA 4XBSA 4J9JA 2R99A 1OFAA 4JJMA 4UIOA 5F2LA 3Q94A 2FTPA 4FX8A 4IMGA 1D3HA 3CEUA 3HO8A 3HG3A 4NNBA 4S2CA 1JCMP 3CWOX 2XN2A 1G69A 3TK7A 3STEA 1A5SA 1IXPA 4PC8A 1EP2A 4FEZA 4DBDA 2CPLA 3W72A 2ZZ7A 5IBXA 2RDUA 1TV5A 3S6DA 4HKPA 2H6RA 4UUIA 4N2YA 4M6PA 4IPZA 1F6KA 4PCFA 3LHUA 3NL6A 3W88A 2XN1A 3GB6A 1PHQA 4JTLA 3RLVA 4GBUA 4UR7A 3W84A 3O7TA 3B03A 4JYFA 4DBEA 4JR5A 3VE7A 3DBPA 2KZHA 4GUFA 1X7FA 4UFLA 1QO5A 3PUOA 5F66A 1HUVA 3IIVA 3LV5A 5G1TA 3OA3A 4LUIA 3NM3A 3P5ZA 1FBAA 3L5MA 3GYEA 2Y7FA 4QJ1A 1MIKA 3NQFA 5BMWA 1H63A 4GUHA 1S5TA 3TIMA 5C54A 3PULA 1CW2A 3KHJA 4A29A 2N0TA 5F4XA 4M5PA 1VS1A 2YDAA 2ZZ2A 3LX9A 4UMBA 5I3JA 2V9DA 4E1QA 1AK5A 5AHFA 2Q3RA 2QKFA 3N73A 5F1VA 3U2OA 1FWSA 5LGXA 1R2TA 4JXCA 4AWSA 3LCGA 2ZYFA 5FEWA 3CYHA 1WOBA 3DKJA 1W8LA 4JTIA 4JTTA 2P10A 1BWKA 3S5NA 5EA9A 1LDCA 3NG3A 2BZNA 4BR1A 1KM5A 3A9IA 3DHDA 4HY7A 1LOQA 3USBA 1NSJA 1OX6A 4P2VA 2GPTA 3I68A 4LQWA 2DZVA 3EXRA 1ME7A 4PTNA 1C8VA 4RV8A 2YPIA 2EAWA 1JRCA 4N1MA 3FEMA 4K8EA 5U4NA 1CWJA 1DV7A 4RXGA 3L67A 3P74A 1I45A 1X1ZA 2DZPA 1MEWA 4RZ5A 1H5YA 1A5BA 1OK6A 4FX7A 4LVGA 4DO4A 2Q8LA 4IMEA 1U83A 3OBKA 2WNZA 2RMBA 3ZWSA 3W1RA 1OK4A 1N7KA 1OX5A 2OT0A 3LHWA 3V75A 3QYUA 1SO5A 2Y85A 3HPSA 2WOQA 2JK2A 3CLMA 3SY5A 3RDAX 3EWBX 5HNRA 2Z6JA 4O4VA 4R34A 2V2CA 5EL1A 1HTIA 3DI0A 1YLVA 1R30A 3TSBA 1HG3A 3K0OA 2ALDA 3HGJA 2CLEA 3W2LA 4YXGA 1ZJIA 3N3MA 1QO2A 2VFDA 4QIUA 3TW6A 2RH9A 3RCIX 4C1LA 4CCDA 5I3HA 1G6CA 3C56A 3P67A 3T4CA 3SSJA 3QQ0A 4UTTC 4YUJA 3MYOA 3RDBA 4D2JA 3DXIA 2NXIA 5FF4A 1H0PA 3S1VA 2H3DA 1YDOA 3RF9A 2VFIA 3CU2A 1HO4A 3Q2DA 4Y90A 1BWLA 1T99A 3NL3A 5D2TA 4EYVA 3E12A 1F73A 3PM6A 3S5ZA 3BT8A 3R4GA 4DELA 4XTIA 3LBMA 4JTUA 3W23A 4RZ6A 4MJMA 1FWTA 2QCLA 3CB8A 4NX0A 5KURA 4EVZA 2QEZA 3W1QA 1W54A 3QPZA 5GVJA 2CYHA 2R8WA 2O7SA 3MBDA 3NYZA 3UWVA 2EHHA 4J59A 3NDOA 3NL5A 3QPYA 4LY8A 1I2OA 3R54A 4OU1A 2OX1A 3LBCA 4N1QA 1UB3A 3I6RA 4K7VA 1ISTA 3M7WA 3N34A 1K7EA 1TPVA 4FNPA 4AWUA 5E93A 4UMAA 2FU0A 1TTPA 1JCXA 5BOOA 4GUIA 1AW1A 3G1SA 1P0NA 2QCDA 4ZL1A 1M7PA 3M43A 1TSIA 4A21A 5KITA 3GDMA 3MW7A 2TPSA 1IF2A 1VPXA 3VFLA 5AC6A 1PS9A 3LHZA 2FPVA 1RQEA 5D38A 3ANYA 1PCKA 4JX4A 2B71A 1IXOA 3P5YA 5LKYA 1LZOA 4O19A 4O53A 1VLIA 3PB2A 1BEUA 5AYXA 1J4EA 4K7YA 4UXDA 2QF7A 1CWMA 1MSSA 4AF0A 2X1UA 1F74A 1JCJA 2POEA 2CZEA 4LV9A 1J2AA 2VC6A 4HNVA 4IX2A 1AWQA 1LBLA 3W2UA 3Q58A 1WYIA 3LHTA 3QC3A 4PFMA 1SFLA 3SI9A 2C6QA 1FGLA 4RX0A 4LVDA 5EKYA 3TFXA 3I7SA 5I3GA 3B04A 5K3VA 3HGRA 3TA6A 1ZKFA 1FXQA 1CI1A 2ZQ0A 1K03A 3IIPA 4FB7A 5HR7A 4N02A 5AHNA 3W7JA 1NMKA 2GUUA 3S1WA 2NULA 4ONVA 1XBYA 2WJZA 4JIPA 1SW0A 1VQTA 2V2HA 3IGSA 4NJIA 3MUXA 3G0XA 2ZRZA 3W22A 4AHPA 3VKJA 2AGKA 3EX6A 3TXZA 2C0AA 2MC9A 3FKKA 1SW3A 2RMAA 1SZEA 3TQKA 1W5OA 1L6SA 4UTMA 3BGGA 3VA7A 5KV5A 3TNOA 2FB3A 3UWZA 1AL8A 4HPJA 3GXPA 1QNGA 3MO7A 4Q33A 3UPBA 4CYHA 3G1YA 4O4WA 4W9TA 3A5FA 3DHFA 3KVMA 1DOSA 3NQEA 3LTSA 1EWEA 4N6EA 1A5AA 1OYAA 4IQLA 1CWKA 1AW2A 1RQHA 3F1QA 3ODLA 4DGEA 2JKAA 3LI0A 2P0OA 4RR4A 3W1TA 3IGXA 4UTWC 3DU0A 4J5AX 1VYRA 4XNCA 2FPYA 3FA5A 1WBHA 1GWJA 4DXVA 3ABOA 3KX6A 2E6YA 5LUDA 1MXSA 4FXSA 1C9DA 4WD0A 1YXDA 3UZJA 2POYA 3AJXA 3UWYA 4LC6A 1ZALA 4ZVJA 1AWSA 5TQLA 1H7OA 2CLFA 1YDVA 2A1YA 1ZFJA 3IVTA 1W3NA 2UV8G 1FX6A 4S1EA 5KV4A 3W1PA 2ZZ6A 4MZ1A 1H7PA 1KM1A 3DI1A 3B0VC 3LXCA 3ATYA 4WZHA 2ZBTA 1Q6LA 2VEMA 1AK4A 2WLWA 5FEZA 2NXHA 3QJAA 2I9EA 1KLZA 4HNUA 5CBTA 5J5RA 3FYPA 1VCGA 3TCEA 4YLWA 1QNVA 1WXJA 4FRVA 2C19A 2OSEA 2ZZ1A 1CWLA 3EWYA 4O1DA 1AG1O 1ICPA 3FOKA 4NXSA 1LLWA 1P1XA 3FFSA 3M6YA 1J5TA 2DJLA 4XWUA 2DZXA 3WJWA 3H54A 3ABRA 3NM1A 4PL1A 1O60A 4UNLA 1DKWA 2DZTA 1K8YA 2YFNA 5A8GA 5LNWA 3HG2A 3RNDA 2LLEA 3EX3A 3S1UA 5HUOA 1NAL1 3OPFA 4ZQOA 5L6UA 2CW6A 2X1SA 5AC7A 3GR7A 4MZ8A 3K0NA 3CM4A 4GC4A 1UUMA 3PG9A 4WX2A 3T40A 2A7NA 4YUGA 1CWAA 1OG0A 1XM3A 3DENA 2ZA2A 3QEZA 4TMCA 5CPOA 1T96A 3ATZA 4IPJA 1TJRA 1VZWA 1KLYA 5BRBA 2A0NA 5DELA 2W79A 1SO4A 3UCHA 4M6QA 3N19B 4Y9AA 4IXHA 2NZLA 3TH6A 5K4XA 4MPQA 1W74A 4Y96A 4BF9A 1VHNA 3NOEA 1IHGA 2B7OA 4DGBA 3IIOA 4EWND 4OQVA 4NU7A 2V30A 2RDTA 3NPXA 1XI3A 1W31A 5D03A 3MMLA 4I7VA 5KUWA 4CCEA 5I3IA 4CQ9A 2GQ9A 4AWTA 1OFEA 2BTMA 3DAQA 3LRLA 3INPA 3BLFA 1CWFA 1W5MA 4DF2A 4OBTA 2PURA 4ZQRA 1TCDA 4OE7A 3RCGA 1TMHA 3GDRA 4S1FA 2E6AA 2E1DA 3CQ0A 1QCWA 6ALDA 2MZUA 4NX5A 5H91A 4FNUA 1OFPA 1SFJA 3W1XA 5CYHA 5E0KA 4O8RA 1G4SA 5KV1A 1CWCA 3RCFA 3MHUA 2X7KA 4IMDA 2HQJA 2V5BA 5AB3A 3G1XA 3UWQA 4DQWA 3P60A 1OX4A 3PSWA 1PVNA 2JKEA 3M47A 3QH2A 3EXTA 2OZ0A 4TX9A 3W7PA 2GVJA 5AHIA 1YNDA 3CWNA 5LSMA 1SU5A 4YUOA 3E49A 3K0MA 3GK0A 5IBXC 3TV8A 1A58A 3NQ6A 3K0PA 1TV7A 1UASA 2XGYB 1OF8A 1ICQA 4RJEA 2A21A 4IX0A 4EF8A 3SECA 4FRUA 2MVZA 2GQ8A 1VR6A 1VLWA 1OJXA 3GNNA 4O17A 5A0EA 4FNRA 1TJPA 4ADUA 2WNQA 2WV8A 3TW7A 3GXNA 4LWWA 3TC6A 2IGVA 3RCLA 1H61A 5HMSA 2Y6ZA 2C3BA 4MLRA 2X1TA 4NNAA 3P8IA 4YL2A 2TRSA 4LUJA 3L21A 1LBMA 1FCQA 3EEGA 4M19A 2A6NA 3T7VA 1VRDA 1GYNA 4YUIA 3L0NA 5DCBA 3TJLA 3TE9A 3ZR4A 3H53A 5D2VA 2Y7GA 4JX5A 4LS2A 5EY5A 1TPWA 3MWAA 3P8JA 1ZENA 1ML1A 2ALFA 2QERA 4HPXA 4ADTA 2R14A 3JS3A 4RLIA 1TTJA 1P4CA 2J9XA 1OFDA 3IEBA 3NPVA 3QW4B 4MY1A 2VFEA 3G0UA 2WSRA 2IGWA 4DGCA 4CLMA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2P0OA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations