3L00 | Genus

Total Genus 47

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	47
sequence length	175
structure length	156
Chain Sequence	CEMKRTTLDSPLGKLELSGCEQGLHEIIFLGGGPEPLMQATAWLNAYFHQPEAIEEFPVPALHHPVFQQESFTRQVLWKLLKVVKFGEVISYSHLAALAGNPAATAAVKTALSGNPVPILIPHRVVQGDLDVGGYEGGLAVKEWLLAHEGHRLGKR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	SNAP-tag structure rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	SNAP-tag
total genus	47
structure length	156
sequence length	175
ec nomenclature	ec 2.1.1.63: Methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase.
pdb deposition date	2009-12-09

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain	3l00A02
3.30.160.70	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Double Stranded RNA Binding Domain	Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase domain	3l00A01

3MFKA 1HQCA 4M6XA 2EA2A 3FWEA 2QQAA 5DYMA 1K78A 2D1HA 4JBAA 2LNBA 2PN6A 3H3ZA 3K9TA 4FX4A 3PQKA 2XHKA 1XSVA 1U6GA 2B0LA 1L3LA 3WTXC 4YFXF 4RB2C 3LSTA 4BHCA 5BMZA 1Z9CA 1ZARA 3R0JA 2FMLA 2W24A 3T0YA 1FSEA 1MKMA 3DPTA 4MHGA 2OU2A 1B4AA 4HW0A 4HAMA 1YO5C 1KQ0A 2A6HF 3U9GA 2VE8A 1R1VA 1YQAA 1R22A 5LEKA 3V7SA 4IPAA 1B59A 4M71A 2FBHA 2QUFA 4L0YB 4IF4A 1FNNA 1UCRA 4M9SA 2HYGD 2GXBA 5BQTA 2LF7A 1SFUA 1SD5A 4RS8A 3GFMA 4KFCA 4EMSA 3C7JA 2OQGA 1MD0A 4G6DA 2AS5F 3CJNA 4HDUA 1D8JA 2HFHA 2NYXA 3RKWA 3MEXA 3LFKA 2GA2A 5DCMB 2DTRA 2IA1A 2ZO4A 3GO5A 3WTZA 2JPBA 5CVIA 3KP7A 4G7ZF 1JGSA 2Q0OA 1QO0D 2DQLA 1TBXA 2XGXA 4EJWA 3GFJA 3WGIA 1F1ZA 2AXLA 2EV6A 2COMA 1PUEE 2W57A 1T38A 2IPQX 2RKHA 3CDHA 2QYOA 4PGGA 1FP1D 3V8JA 3IL2A 4P9FA 2XVCA 4I01A 2K27A 2L4AA 3CUQA 1WKMA 1ZAOA 2HGCA 1H9TA 3SQNA 1D8KA 2PFBA 5D6FA 2K02A 2DO7A 4CZZA 3RI4A 2NNNA 2KJBA 4KIGA 3WTSC 3HRTA 1Q1HA 1H0MA 2ZNZA 1YLFA 3HHGA 1XSXA 4EM1A 2EB7A 3SZPA 5HDNA 3EYIA 1IF1A 4R8HA 1B9MA 3L09A 1W5SA 2OA4A 2VONA 1RZ4A 5ILSA 1V3FA 4ESJA 5L3DA 1HBXG 1HKSA 3L9FA 2XKPA 4ESBA 3HUGA 4U7BA 5HDGA 1XSDA 2FRHA 2VC1A 1T2KA 1AOYA 3WU1B 4BHPA 4KICA 3F22A 4HA8A 4CYDA 1W5TA 1KQ9A 1ZRFA 1IN6A 3ECOA 2VBXA 2ZKZA 2O3FA 2VODA 3BP8A 2HS5A 4AIKA 1B9NA 2CW0F 4LB6B 1P2FA 4GYGA 1KQ8A 5CLSA 3KCCA 1T0FA 2F5DA 4L9TA 4OIRF 1FP2A 1GHCA 4EQQA 1Z05A 5D8LB 5A2QZ 1UHWA 3NRVA 2IRFG 2MC3A 4I0AA 3HHHA 4L9JA 2YX7A 1UB9A 2YX4A 3ZMZA 4HX4A 4GYIA 2JZYA 4N9IA 2GQQA 4HV6A 2NNYA 2DK5A 2V1DA 5CVRA 1TTYA 2O6GE 2Z5UA 1E17A 1FY7A 4A5NA 2WWYA 2BYVE 1YG2A 1OYIA 5D5UB 4IRHA 1P4WA 5BPDA 4M73A 3FXUA 1PP8F 3DPLC 3JW4A 3B73A 4GGGA 2QBYA 3S2WA 1P6RA 4L9NA 3GF2A 1EH6A 4OIOF 2ZNYA 2K4JA 1Y0UA 1USTA 2XROA 2BEOA 5F1RA 1TLHB 1T6SA 4LLLA 5HOOA 5LLQA 3LQRA 2L4MA 1IN5A 4A2UA 3I59A 3JAMK 4JQFA 3SHFA 2EFWA 1TQIA 3WTUC 3GYHX 1TNSA 1OPCA 1QBJA 1RI7A 4OU0A 3BJOA 3HIFA 1GXPA 3FX3A 1ON1A 1LJ9A 1Z6TA 3BZ6A 2XAFA 4S05A 2A68F 2MH2A 5CVJA 3TQNA 2H6BA 2KJCA 1HW5A 3F8CA 5F64A 3M9AA 1K7AA 1FYLA 2ZJ2A 3KETA 3I54A 4A5MA 2NRAC 5D8KB 3BOQA 3I64A 2HEOA 3V7CA 4G8XA 2QVOA 1W4MA 1TQMA 3R61A 1V4RA 1MZBA 5IT3A 3P9KA 4G6QA 3NQOA 3ZMTA 3J7AO 5BS6A 4UV9A 1O7LA 1F9NA 1SFEA 3OOPA 1OR7A 3SFZA 4OMZA 2QWWA 5BOXA 2STTA 2CQKA 4BQAA 2Q8KA 2HYFA 1O7FA 2A5YB 4CO8A 2W84A 2ESHA 3R4KA 4YFNF 5LHGA 2QBYB 4YG2F 3IKTA 4PCQA 2LDUA 3C3WA 3QP5A 1FBQA 2QQ9A 3F6VA 5L3GA 5L3EA 2HDCA 1BI2A 1YFHA 3HOTA 1J5YA 1J7KA 4Q5SF 2P5VA 2OZ6A 1D5VA 3M1EA 3E5QA 5EEGA 4EJUA 1SD7A 2PI0A 3QP6A 2ISYA 1HSJA 3WTYC 2CYYA 3VODA 2FEZA 3WGHA 5ILVA 3GZ6A 3Q9VA 3V7RA 2PBIA 2LF8A 3FHZA 2R7DA 1HW2A 3H3UA 4I0BA 5H6QA 3T5XA 4KN7X 3ERED 2DAOA 3EDPA 1JXSA 3BJAA 3TKYA 3MCZA 1ZYRF 4BNCA 5JR3A 4YIFA 3GFLA 3CLOA 5DUIA 2E1CA 3E97A 1R5GA 3C1DA 2ZFWA 2A69F 4LK1F 2PLYA 1CF7A 3QU3A 5ICCA 4M74A 3K1PA 1XN7A 5FLXK 2L54A 4WCGA 3M7GA 4EGYA 4LK0F 1HSTA 3LAPA 1G6NA 4HLXA 1ZLKA 3JSPA 1MJBA 4HQEA 2IA2A 3E5UA 1XB4A 4XLNF 1YS7A 5FFXA 3DV8A 3P9IA 2G9WA 2IVMA 4OMYA 4ZH4F 2HKXA 4O3MA 4HF1A 4RB3C 3T1BA 1R5HA 2Y75A 4MEYF 4M9XA 5HLHA 1IXRC 2H27A 1RNLA 2A61A 3GVAA 4ON0A 1LVAA 4WF2A 4B8XA 3WTVC 3G73A 3E3VA 3VFZA 3EYYA 1J0RA 2DU9A 2HTJA 4ZYEA 1SD6A 4BAYA 4OOIA 3I4PA 4KT5C 1JHHA 1T98A 5F6FA 1UHMA 3QPTA 4HQMA 2FOKA 3J81K 4EGZA 1ZRCA 1BI0A 3ZMSA 2G7HA 4AWXB 1RUNA 4ENMA 1ZGAA 2GIVA 4HBLA 3U1DA 2EK5A 3M8FA 1YW9A 1IXCA 2VE9A 3QPHA 2HWVA 2EFPA 3R0AA 3TGNA 3EETA 1ODDA 4G9YA 2QENA 1KYZA 1R36A 5ILUA 2VOPA 5LEJA 1JE8A 2D45A 2H09A 3W6KB 2FQ3A 1G3YA 2EA4A 3H92A 2ZCWA 5DEQA 1LDKB 1SAXA 3I53A 3GEZA 4EJVA 1O3SA 4BHBA 2CSOA 2NS0A 1K78B 3D5LA 2FSWA 2FF4A 4L9VA 5FD5A 5IT9K 3FXQA 1OKRA 1LDDA 2IA0A 4ASNA 4KMFA 4QWQA 4HV5A 1QGPA 1G4DA 3WE2A 2FNPA 1BC7C 3K2ZA 4RAYA 4XSXF 1R58A 1EH7A 1HKTA 3DKWA 1GXQA 2EFOA 3G3ZA 1HXDA 1ZG3A 3FF5A 1RIOH 2XAJA 5LGNA 5FD6A 1I1SA 1YW7A 2FU4A 1E2XA 3REOA 2OAZA 5KVRA 4CGZA 1F4KA 1NHAA 4Y15A 5D4SA 4A12A 3WGGA 4IJAA 3RIRA 2IP2A 2P5LC 3JSOA 1H9GA 4LGWA 4UNOA 2GXGA 5HS7A 2ZBKA 1OMIA 3TOBA 3J80K 4FHTA 4HZFA 1MJAA 2K7LA 1O57A 1TW2A 5AONA 1XD7A 2Z33A 2ZMEA 1CGPA 3VEPA 5KK1A 1JHFA 1FPQA 4PZJA 2Q2EA 1SD4A 2DBBA 4AVPA 3WG9A 1R23A 4HYEA 2P6SA 5L3BA 2MBFA 4L5IA 3BWGA 3F8NA 4A0ZA 4OINF 2RC4A 3TOAA 5J8FA 4UVCA 3MZHA 3M8EA 3RJPA 2FA5A 4Q4ZF 1KU7A 3L00A 1QPMA 4LLNA 3CUQB 5LBQA 4LMYA 4XSZF 2UZKA 3F6OA 2E7XA 4P55A 3LA3A 1R1UA 1TQPA 3FMSA 1BJAA 3ULQB 2MH9A 5HLIA 3HTUA 2F5CA 1SFXA 1VTNC 1FSHA 1XMAA 4RGRA 3Q9SA 3GFIA 4I2OA 4ZZDA 3HSEA 4ZYDA 5HDKA 3HYIA 4A6DA 1O3QA 3RYRA 4MQVA 3IC7A 3GLXA 3CUOA 3GX4X 3LAJA 1I5ZA 2WV0A 5LGUA 4WWCA 5HLGA 2E7WA 4P5OA 4CXFA 3KEQA 1FLIA 3FMRA 2QM3A 1HKQA 4U88A 2FMYA 4KIFA 5D6EA 4R79A 1S29A 2PMHA 1HW1A 2VT3A 5A2QK 4LG0A 2PG4A 4A6EA 2DW4A 2FBKA 2FNAA 3DEUA 4P96A 1EH8A 3IKVA 1KU3A 2JRTA 5E8GA 2ETHA 1REPC 4NB5A 1X3UA 1L0OC 3LA7A 4K2EA 1DPUA 5CVUA 2GWRA 4RGUA 1LEAA 1QQIA 3WODF 2BGCA 2JT1A 4WX9A 4HOBA 3FMQA 2XV4S 1KYWA 1FC3A 4UV8A 3MWMA 3R60A 1FWZA 4Y13A 2ZXJA 4H0EA 1ON2A 2W25A 3HSFA 4XRFA 5H20A 4A0YA 1QZZA 5LRRA 1FX7A 1ZG5A 4BXUA 1D3YA 1IW7F 1WI9A 1J59A 2P6TA 2V1UA 4ENNA 1BI3A 4EM0B 2DPUA 3RKYA 4KYWA 3GW2A 3P7NA 1XGOA 1S7AA 4CICA 3RYPA 5E20A 1Z91A 3KLNA 1UFMA 3C18A 3E5XA 2DFIA 3V8KA 1ZLJA 2JSCA 3HRMA 1I6XA 1WWXA 2MD5A 1ONVA 2W85A 5L3CA 3DP7A 3KZZA 1I27A 1O3RA 3BY6A 2K4BA 4ENJA 3BPXA 1LB2A 5EEHA 3BROA 4G7HF 1IN7A 3ZQ7A 4EV0A 1XGNA 2QLZA 4CDGA 5FLXZ 3ZP5A 3ROUA 3I59B 5H6RA 2VBYA 2V79A 2XRNA 2J5PA 3ZMVA 5E8IA 2P8TA 2O61A 4F7ZA 3DQVC 2RV8A 3RDIA 1XGMA 2ACJA 1I1GA 3IHUA 3MZYA 4Q48A 1IN8A 2QQBA 3B02A 2EFQA 3KE2A 1XCVA 5LGTA 3WU0A 5TRDA 2STWA 3MQ0A 3CTAA 3ABUA 1U3EM 3CUQC 3OV8A 3PQJA 1AWCA 3ABTA 1IRGA 3KP6A 5AIQA 3I5UA 4LFUA 2X4HA 4RGXA 2M87A 5FGMA 2BE5F 2L01A 2A6EF 3COAC 2XASA 4G94A 4I7HA 4YIIA 2H6CA 3MAJA 2XAHA 3HSRA 2FE3A 4UHTA 1BOAA 2R7FA 3DXJF 5DD4A 3J81Z 1XDSA 3KFWX 5LRSA 4KDPA 4I09A 1U8RA 2IJLA 3KP2A 5DV5A 1SMTA 2RDPA 4HLYA 4KA4A 2V6CA 1QZYA 5JVTA 3F8MA 4EM2A 1YIOA 3O2PE 2XIGA 5DCFA 4IVNA 2KIMA 4NHJA 1P4AA 1Z7UA 1FZPB 3TO6A 4Y17A 2DQRA 3ELKA 3WTWC 2EJRA 4HDVA 2Z9OA 4WXCA 2VN2A 4I98B 3RPQA 3IWZA 1FYKA 2ESNA 1G3TA 2MA3A 4D0PA 2KIUA 1Z6RA 1YTYA 3JTHA 3L7WA 3PFIA 1BBYA 2VC0A 2LKPA 2F5FA 5IT9Z 1R7JA 4DNCA 1BC8C 1ZRDA 2VT2A 1ULYA 5FFZA 3HRSA 2XAGA 1DUXC 3RTRA 3N4MA 2M1BA 3KZYA 4ENKA 2CGPA 2KKOA 2YU3A 5K5OA 1USSA 3KP4A 2HZTA 1DPRA 3K69A 2EFNA 2VBZA 2M45A 3TO7A 2CG4A 4RB1A 1BM9A 4FX0A 4ETSA 4PGHA 1FBSA 5ICEA 4N0BA 3QOPA 2HOEA 1PP7U 3RPUA 4IHSA 1B6AA 5DUKA 3F8FA 2IT0A 4S04A 3DF8A 2FXAA 2UWMA 3W6JB 2Z99A 1BIBA 3K1NA 5E17F 2GZWA 1CF7B 2NAZA 1RUOA 1LNWA 2FBIA 4G7OF 3CO7C 1U5TA 4L0ZB 2MLKA 2UXXA 2WC2A 2YR2A 4MTEA 1YW8A 3J80Z 1KA8A 2DI3A 4L18B 3IWFA 5AIPA 1TW3A 2RNJA 3F21A 1FBUA 3LA2A 2WTEA 3F72A 3RKXA 1XMKA 3VB2A 1W7PD 2EV0A 4GXOA 1GVJA 4DQ2A 2L3DA 2ISZA 1T39A 1KU9A 3ZN0A 1R1TA 4P9UA 5K1YA 3QRFF 1BN5A 4B09A 2PJPA 1U78A 2M30A 3ZPLA 2O03A 1S6LA 2MLGA 1WRJA 4O6JA 4JK1X 1J2XA 4A0XA 4EJTA 4RGSA 3F23A 1DDNA 1OYYA 3TDUC 4AIJA 2P4WA 2V1XA 3LWFA 5ERIA 1DP7P 4AIHA 2Z3YA 4OIQF 2P7VB 3QU6A 5E1ZB 4CHUA 4MNUA 1G3WA 3WE3A 4MTDA 4GCVA 1OYWA 4LD5A 2HKOA 1FT9A 4ZYHA 2EV5A 3IRQA 4UXNA 2CWEA 3F8BA 3ZMDA 3I0TA 3VOEA 3Q5FA 5K5RA 2LSOA 4ESFA 2DK8A 1KGSA 3ML6A 5J8CA 2D2WA 5HS9A 1W7PA 1WQ2A 2HQRA 2X0LA 5ICGA 2DPDA 2YSRA 1XDUA 1C0WA 4WXDA 4IHTA 4WXHA 1S3JA 2O0YA 4FT8A 3U2RA 4LB5A 1YS6A 1LDJA 3O6BB 3TO9A 2XKOA 2J5OA 3SXYA 1U5TB 3R6SA 4HX8A 5K5QA 2HQNA 2F5EA 1QNTA 3ZN1A 3JAMZ 4BH9A 4U0YA 5E18F 4UUVA 2M8EA 2H94A 3AAFA 3GWZA 2HTSA 4XLPF 2P5KA 4KNYA 1P92A 3I58A 2Y48A 1B1BA 1BI1A 2PQ8A 3EUHA 2BBYA 4MEXF 1BIAA 4WK8F 2BV6A 5D5VB 2XAQA 3TDZC 1R00A 4HX7A 3E6MA 2OZUA 4UVBA 1P4XA 1SMYF 4KMUX 2R3SA 3NEUA 1U2WA 2RVCA 5HS8A 2Y0MA 5BPIA 5CVVA 1G3SA 4MGRA 4UVAA 2F2EA 1WSUA 3GUDA 5CYVA 2A3SA 4M72A 5L3FA 2G7UA 2KIFA 4IRGA 4O5VA 1ZH5A 3BPVA 4N9HA 3IRRA 2K86A 5HVQC 4M9ZA 4EVIA 3WTTC 4RAZA 2OD5A 4KN4X 4I02A 3FXRA 5JI6A 1STZA 2DT5A 3E6DA 5ICFA 5D5XB 4HF2A 1KU2A 2EWNA 3FM5A 2ZMEB 5LHHA 2A07F 4HF0A 4LJZF 1J75A 3K1MA 1W7PB 2ADUA 6PAXA 3QAHA 1PDNC 5E1XA 2M5WA 3L2CA 3N97A 3KP3A 3ISPA 1IN4A 1A04A 3JTGA 1FYMA 5FB2A 3F3XA 4IRIA 4IXAA 2PEXA 3V8LA 3P9CA 3GXOA 1K6OA 3HOSA 1IZ1A 3CO6C 2HR3A 1MJ9A 4RB0A 2TDXA 1MDMA 3HTSB 4LLGF 2PMUA 4KUMA 3FM3A 3KLOA 4U7DA 1ZG1A 4EJOA 2CO5A 4ZYGA 5ED4A 2D1VA 4R1HA 3V4GA 2L02A 2YPRA 1O3TA 1K79A 2VBWA 3GZ5A 4TV7A 5DDGA 4M6YA 1IUYA 1LEBA 3SZTA 1MGTA 2C6YA 4YFKF 1YYVA 2UXNA 4ZZLA 5FO5A 2ELHA 5E1WA 1ZGJA 4L5JA 2KRFA 2VOOA 4QLCU 5JFRA 3D0SA 5JHUA 3ZMUA 2JPCA 1IRFA 3T8TA 3KEOA 2QZ8A 3BDDA 1ZREA 4AD9A 1F5TA 2CFXA 4OIPF 3O3KA 2V9VA 1IXSB 2E1NA 3LQQA 3EQLF 4PDKA 3FZVA 1U5TC 5TJJA 4NQWA 2GAUA 3KP5A 4U0WA 1XGSA 3I71A 2VXZA 4LG0B 1Z1DA 2IW5A 2DLLA 4BYYA 1ZHFA 2RGVA 4GO1A 4KIBA 3T8RA 5D4RA 2JTVA 1LQ1A 3BJ6A 4Z2YA 2RN7A 4XBFA 1MDMB 3HRUA 1S8NA 3K0LA 5LHIA 4E70A 1S7OA 1TNTA 3E6CC 5J6XA 5D5WB 1J9IA 2O8XA 2OQRA 1FOKA 4U0VA 4MQ9F 3ECHA 3E6BA 1EV7A 1IAWA 2OBPA 2P7CB 3DFGA 5DCMA 2RQPA 1XCBA 5DD8A 2GA1A 1ZN2A 4Q47A 5CJ9A 2XUBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

3I3LA 4XIDA 3MFKA 1HQCA 1W5CC 1YOVB 1GDTA 4M6XA 4XKCA 2R7ZJ 2EA2A 3FWEA 2QQAA 5DYMA 1K78A 5EZHA 1HDPA 4DV1E 1VQMI 2LD5A 3TQMA 3CCYA 5CPRB 2CT1A 2EOZA 2D1HA 2N3GA 4JBAA 2LNBA 2PN6A 3H5NA 2HI3A 3H3ZA 1J5EE 2GPIA 5IXMB 2PX9A 2FOWA 3K9TA 2X6XA 3PQKA 2XHKA 4D5FA 4FX4A 2YRHA 1XSVA 4XNFA 3BTCA 1JK1A 1U6GA 2ZMEC 2R0QC 2EMKA 5AE3A 2B0LA 2JVHA 2LY1A 2LLKA 3FXMA 4UUSA 1L3LA 2ENAA 4B4CA 3WTXC 2EMFA 4YFXF 4RB2C 1RQ0A 3LSTA 1WH5A 4V2GA 4BHCA 2EM5A 3LSKA 3E7LA 3DEWA 5BMZA 1SFKA 1Z9CA 5FRMA 3IH2A 1ZARA 3R0JA 2FMLA 1J26A 2L2OA 1IC8A 4JI6E 2Z1DA 2W24A 2X1DA 3T0YA 1FSEA 1MKMA 2PMZN 3DPTA 5IOYA 4MHGA 3C2BA 2EM0A 2OU2A 3HJEA 1B4AA 1FMVA 4NQWB 4HW0A 4HAMA 1YO5C 5J40A 2DRPA 1KQ0A 2E60A 2A6HF 3U9GA 3S8PA 3ZOBA 1R4NB 2VE8A 3ZR8X 1S7EA 4DYRA 5FROA 4XRMA 1R1VA 2MABA 3AFHA 2LT7A 1ZR4A 1HC8A 3TW7A 1YQAA 3GTPJ 4K0KE 1R22A 5LEKA 3BBGA 3V7SA 4IPAA 1B59A 4M71A 2ZJPF 1TF3A 2UXBE 3ASOH 5F04A 4LU9A 4NC6A 2FBHA 2QUFA 1GLNA 4L0YB 4IF4A 2L3CA 3HOXJ 3K70C 1MH3A 3SDGA 1FNNA 4ZC3A 1AU7A 2M4IA 1UCRA 4M9SA 2HYGD 3EUKL 3EUHC 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3L00A

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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