3L00 | Genus

Total Genus 47

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	47
sequence length	175
structure length	156
Chain Sequence	CEMKRTTLDSPLGKLELSGCEQGLHEIIFLGGGPEPLMQATAWLNAYFHQPEAIEEFPVPALHHPVFQQESFTRQVLWKLLKVVKFGEVISYSHLAALAGNPAATAAVKTALSGNPVPILIPHRVVQGDLDVGGYEGGLAVKEWLLAHEGHRLGKR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
publication title	SNAP-tag structure rcsb
molecule keywords	SNAP-tag
total genus	47
structure length	156
sequence length	175
ec nomenclature	ec 2.1.1.63: Methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase.
pdb deposition date	2009-12-09

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain	3l00A02
3.30.160.70	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Double Stranded RNA Binding Domain	Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase domain	3l00A01

1H9GA 2MLKA 1BIAA 2PEXA 1FWZA 5F1RA 3I4PA 4BYYA 3G73A 2RN7A 1T0FA 2P8TA 3DFGA 2H6CA 1XDUA 4CXFA 3Q9SA 3F22A 3R6SA 4HQEA 1E17A 2FA5A 3GEZA 1G6NA 1FLIA 1P4WA 2HDCA 4KUMA 1ONVA 4YIIA 3QPHA 1FNNA 5D6EA 1FY7A 3ZMZA 3IRQA 5FD5A 1TNSA 2OA4A 5DD4A 4YG2F 3ZMUA 4KMUX 3IRRA 1XGOA 1F4KA 2ESHA 2RQPA 2XKPA 3NQOA 3E6CC 4Q5SF 2XAFA 5CYVA 4ENMA 3IKVA 3WTZA 4ETSA 5FLXZ 1ZN2A 4ESFA 1K78A 2Y48A 5HVQC 4Z2YA 4PGHA 1R1TA 3HRSA 1YIOA 5FLXK 4WF2A 3P9CA 3SZTA 3F23A 2VN2A 2IT0A 1DPRA 1YW9A 1I1GA 2HKXA 4LLGF 4RGSA 1O3RA 2XROA 1J75A 2PJPA 3ISPA 1Z6TA 5D5VB 2R7FA 2QYOA 2IA2A 2FOKA 1ON1A 1LDKB 4FT8A 5D6FA 5CLSA 1FYLA 5ILVA 1ZLKA 3BOQA 1WRJA 3I59A 3K1MA 1SFUA 5AIPA 5CVRA 1O57A 3BJAA 4IRHA 3CO7C 4HV5A 4E70A 3TOBA 3IKTA 4IXAA 4LLNA 3TGNA 2IA0A 3CTAA 1KQ0A 4L18B 3ECHA 4KN4X 3BPVA 3IL2A 1MZBA 1UHWA 1MKMA 3RYPA 2FSWA 1P92A 1U5TC 2HQRA 4U0WA 4OIQF 4ENJA 2D1VA 3ZQ7A 4EM0B 1PP8F 3LQRA 1SD6A 1U5TB 3WTWC 3EYIA 2A6EF 1BC8C 2ZFWA 4G9YA 1B1BA 1IW7F 2FBHA 4EMSA 3CJNA 4NB5A 2QVOA 3FXUA 1QBJA 2HFHA 3WTVC 3T0YA 4UV9A 4R1HA 3BZ6A 1FPQA 3KP6A 4M6XA 5KK1A 3JAMZ 3WTSC 1D3YA 4I01A 4XSXF 1OR7A 1T38A 1ULYA 1FSHA 4I02A 3ZMVA 4LB5A 3M7GA 3EYYA 4Y17A 4KIBA 2NRAC 2L54A 4HDUA 1YFHA 3RJPA 3O3KA 1BI3A 3I0TA 3SFZA 4G7OF 4FHTA 2H09A 3JSPA 4P5OA 2JPCA 2XAHA 2CGPA 4ASNA 2HKOA 3K1PA 5K1YA 3MFKA 5TRDA 3I64A 1SAXA 4GYGA 2HOEA 3R60A 1KU2A 4HAMA 5FGMA 1U6GA 3KP7A 2JRTA 2OU2A 4G6DA 4A0ZA 2UWMA 4M72A 4R8HA 2VC1A 3COAC 4O3MA 5HOOA 5LGUA 2ELHA 4M74A 2KIMA 4GXOA 2ETHA 3AAFA 5JVTA 3T8TA 1QPMA 4RGRA 1OKRA 5LBQA 2K27A 1XMAA 1ZGJA 1J0RA 1G4DA 2LDUA 4GO1A 4RGXA 1RI7A 3I71A 1W7PB 4B09A 4JBAA 3FMQA 3WTXC 4ESBA 3DF8A 3J80Z 2NAZA 2NS0A 2VOOA 1G3SA 3WE2A 4HA8A 1SD5A 4KFCA 1Z91A 1B59A 2P5KA 1HSTA 1G3WA 1BN5A 3J80K 3OOPA 2DAOA 1SD7A 2LF7A 2KRFA 2IP2A 2XIGA 3C1DA 1J59A 1IF1A 2L02A 2DLLA 2Q2EA 5CVVA 5K5RA 1W5TA 2VBZA 2XVCA 3IWFA 4UVCA 2IJLA 5DUIA 4G8XA 2K86A 3WU1B 3U2RA 3KP2A 5F64A 3GWZA 3GFIA 3GF2A 2Y75A 2XRNA 2KKOA 1BBYA 2GXBA 4U0YA 1QO0D 1SMTA 3ML6A 3ZMDA 4WCGA 1HKQA 1KYZA 1U78A 3GFMA 5D4SA 2VOPA 4YIFA 1YW8A 2Z3YA 5J6XA 3HYIA 3U9GA 3BWGA 4M71A 1LQ1A 1XSVA 3MZYA 1IXSB 2A5YB 4PDKA 4KIFA 4G6QA 1IRFA 3RI4A 4EJWA 1BJAA 2OQRA 3E5XA 4HX4A 1CF7B 2CFXA 3WTYC 3LA7A 4YFKF 4U7DA 4G7HF 4BH9A 2KIUA 3TOAA 1K6OA 2OZ6A 1C0WA 2O6GE 2UZKA 5DYMA 2CWEA 1VTNC 3LFKA 5E17F 1YO5C 4PGGA 1Z6RA 1LEBA 4L5IA 1IN8A 1ZREA 3JTHA 2OD5A 3RPUA 3GYHX 1ZYRF 3QRFF 5K5OA 1ZRCA 3N97A 2LF8A 1JE8A 1J2XA 4QWQA 3M1EA 2EFPA 5BS6A 2HEOA 4P9FA 4RB0A 3FM3A 2XHKA 1OMIA 2YR2A 1XGMA 3H92A 1RIOH 2W84A 4IHSA 4LMYA 3ZMTA 2VXZA 5D5WB 1U8RA 3P9IA 5L3DA 1GVJA 2EA4A 5CVIA 3GO5A 5TJJA 2V1DA 1PP7U 3DEUA 5CJ9A 2TDXA 3BJ6A 2LNBA 1KQ8A 3BDDA 5JI6A 4ENNA 2VE8A 3F8NA 1LNWA 2VODA 2EFWA 2DFIA 2YX4A 2RDPA 3Q9VA 1HSJA 2RC4A 4KT5C 3MEXA 3RIRA 3LAJA 3VFZA 1XSXA 1LVAA 4HZFA 4HQMA 5DV5A 3HTUA 2V9VA 1YLFA 2VT2A 1I6XA 2Z33A 4OU0A 1XB4A 1MD0A 3NEUA 4TV7A 2HR3A 3WE3A 6PAXA 3L09A 5L3CA 1XGSA 3LA2A 2Z5UA 2EV5A 2LSOA 4LD5A 2ZMEA 2P5VA 2EFOA 1WI9A 2L4MA 4EM2A 1QZZA 5ILSA 3MQ0A 2QBYB 1P2FA 3WU0A 2A07F 2LKPA 3KZZA 4EV0A 4HF2A 1OYIA 1KYWA 5DCMB 1ODDA 5DUKA 4MNUA 3QOPA 1R00A 3R0JA 3J81Z 3H3UA 1TBXA 2CW0F 2D45A 1IRGA 4FX0A 4S05A 1JHFA 2DPDA 3ZP5A 5EEGA 1K7AA 1I5ZA 1LDJA 3E6DA 3T1BA 1JHHA 3J81K 3V7RA 2WC2A 1JXSA 4FX4A 4LG0A 2JPBA 1EV7A 1ZLJA 3S2WA 1LB2A 4MHGA 3K1NA 5LEJA 3O2PE 1O3TA 2X0LA 4ZZLA 4B8XA 5FFXA 5BQTA 1PDNC 1Q1HA 2EFNA 5E1ZB 4HBLA 2E7WA 3E6BA 2A3SA 4WXHA 2ZJ2A 1J7KA 1MDMB 3BPXA 3KP3A 3TO6A 4UUVA 1ZARA 4RB3C 5E8IA 3HRMA 2L4AA 2FE3A 4R79A 3KEQA 2ZNYA 4NHJA 5AIQA 4OIRF 4HDVA 2OQGA 1S29A 5LGTA 4Q48A 1IXCA 2QLZA 4MQVA 3DQVC 3K0LA 5E20A 2FF4A 3I58A 1KU9A 2Z9OA 1TW3A 4M9XA 4L5JA 3WTUC 1ZAOA 2GXGA 2XASA 5LGNA 2IVMA 1FBUA 5LHGA 3DP7A 3ZPLA 4UNOA 5F6FA 3DKWA 1NHAA 2HYFA 1XDSA 3RKWA 2GZWA 2K7LA 3TDUC 2PMHA 1S3JA 4GYIA 4IPAA 2VC0A 3BY6A 1WQ2A 4RGUA 2K4BA 3GFJA 1R36A 2NNNA 2BBYA 2OBPA 1UB9A 2WV0A 3F8CA 1HKSA 4HLYA 2IPQX 1DDNA 2DU9A 2F5DA 3KEOA 4O5VA 2G9WA 4AIJA 1YYVA 2YSRA 4G7ZF 2EV6A 4LLLA 5ICGA 2ESNA 3HOSA 1L0OC 5ICCA 3DPTA 3JAMK 2CYYA 2FRHA 1LDDA 4WWCA 5L3FA 1D8KA 1T39A 3H3ZA 3Q5FA 4M9ZA 1U2WA 2EJRA 1IUYA 1KU7A 1B9NA 4UV8A 5D5XB 3GFLA 3T8RA 2KJCA 1UCRA 2NNYA 2STWA 3CO6C 3O6BB 4M6YA 1UHMA 2JTVA 4AIHA 3KETA 2HS5A 4L9NA 4I7HA 5ERIA 1O7LA 3M8FA 1MJBA 2YPRA 3QU3A 3DV8A 1K78B 2W85A 3RPQA 2NYXA 5HS9A 3LQQA 1W7PD 2ISYA 3V8LA 4ESJA 2RKHA 5LRRA 2XKOA 2GA1A 2FXAA 4L9VA 5HDKA 1TTYA 4L9TA 3VB2A 4LB6B 3KFWX 2DW4A 4UHTA 5D5UB 4YFNF 1TLHB 1S7AA 5AONA 1WKMA 3V7SA 1R7JA 2DTRA 4EJOA 1P6RA 2DO7A 3LA3A 1I27A 5LRSA 3F72A 2HYGD 3SHFA 4IVNA 1XCBA 4AWXB 1FYKA 4CHUA 1J5YA 3ULQB 3I59B 4AD9A 3R0AA 2P5LC 5E1XA 5ILUA 1BI1A 4IF4A 4OMYA 3ECOA 4L9JA 1SMYF 5DDGA 2UXNA 4XSZF 3CUQA 1WSUA 4M9SA 2E1NA 3KLNA 3NRVA 2DQRA 2ACJA 1P4AA 2O8XA 1R58A 1HXDA 2MLGA 5LHIA 4WXDA 1STZA 5ED4A 1OYYA 5BOXA 2KIFA 1REPC 4JQFA 4G94A 3TDZC 3D5LA 4BHPA 3FM5A 4KIGA 1BM9A 1B4AA 2QENA 4LJZF 5L3BA 4EM1A 2L3DA 2E7XA 3DXJF 5L3GA 3GX4X 3BJOA 4P9UA 1TQIA 3PFIA 3FHZA 1QGPA 2UXXA 2K02A 4CICA 1YQAA 2XV4S 4YFXF 5E18F 3V8JA 1YW7A 1FT9A 2A68F 2QWWA 2JZYA 2EA2A 3TO7A 2GA2A 3KP5A 3D0SA 1F9NA 5DCFA 1DPUA 2P4WA 1FP2A 1BI2A 2IW5A 4M73A 3QP5A 2BE5F 3KZYA 4NQWA 3HSFA 5KVRA 2DPUA 4EQQA 2HTSA 2MC3A 4GCVA 3F6OA 3FMSA 3F3XA 5DEQA 1FZPB 4BNCA 2ISZA 3KCCA 3P7NA 2HZTA 3C7JA 1S8NA 4GGGA 2ZKZA 2M87A 1MGTA 2CSOA 1V3FA 1Z05A 4P96A 1IN4A 4Y15A 3EUHA 3FZVA 4KICA 3WGHA 2H6BA 2MD5A 2PLYA 2P6SA 3L00A 4ENKA 5LLQA 2HTJA 4CGZA 3MCZA 4EJVA 1ZH5A 1R22A 3M9AA 1FYMA 3TKYA 1R23A 4DNCA 2BV6A 2O03A 3GXOA 2EV0A 2DT5A 3K69A 3V7CA 3F6VA 1O3QA 5J8FA 2V79A 1E2XA 4ZYHA 3EQLF 2V1XA 3CUOA 4N9IA 2A61A 1V4RA 4LK1F 2O3FA 3VODA 2CG4A 5FB2A 2M5WA 4ZZDA 5J8CA 1U5TA 2VT3A 5BPIA 4I0BA 3WGIA 2VBWA 1Z1DA 5JFRA 4OINF 2BEOA 3K9TA 2ZNZA 4XRFA 4HF0A 1XN7A 4OOIA 2JT1A 2PQ8A 4IHTA 1CGPA 2GQQA 2P7CB 2YU3A 2EB7A 2FEZA 2Q8KA 3E5UA 4Q47A 4KYWA 4HX8A 3M8EA 2V6CA 3KLOA 4QLCU 1YS7A 4UXNA 1T98A 4JK1X 3GUDA 2Q0OA 3I53A 3SQNA 4S04A 1ON2A 3T5XA 1U3EM 2EWNA 1MJ9A 1BIBA 2R3SA 1ZG5A 5FO5A 1ZHFA 5A2QZ 3C18A 5D8KB 3HHGA 1MJAA 2AXLA 2QUFA 2ZBKA 2P7VB 5BMZA 3HTSB 2ZO4A 5IT3A 2FMLA 5A2QK 1IN7A 4EJTA 1KGSA 4HW0A 1Z7UA 3E3VA 2IA1A 4I09A 1F1ZA 4KMFA 3F8MA 2J5PA 1QNTA 1RUNA 5HDNA 3E6MA 4WK8F 5E8GA 1B9MA 5IT9Z 2PN6A 2XAJA 1J9IA 2PFBA 1HBXG 1ZGAA 1Z9CA 2F5FA 1WWXA 5IT9K 4XBFA 4I0AA 1F5TA 1RNLA 3F8BA 2V1UA 1BOAA 1FP1D 1SD4A 1LEAA 4BQAA 4HX7A 1SFEA 4UVBA 1D5VA 2QM3A 1HW5A 5K5QA 2E1CA 5H6RA 2FBIA 1W7PA 1W5SA 4RAZA 2VE9A 4U0VA 4A0YA 4L0ZB 1G3TA 1EH7A 3W6KB 1S6LA 2D1HA 3HRTA 1QZYA 3I54A 2QQBA 3ROUA 2M1BA 3FF5A 1EH6A 3REOA 5HLGA 3E97A 2PMUA 3ABUA 2XGXA 2CQKA 5CVUA 1T6SA 2FBKA 2FNAA 4EVIA 2HGCA 1FSEA 4MEXF 2IRFG 3HHHA 1ZG3A 3HOTA 2QQ9A 2MH2A 3RYRA 3L2CA 3RKXA 2C6YA 1K79A 4XLNF 2DBBA 4HV6A 1RZ4A 1LJ9A 4LFUA 3P9KA 4A6EA 4Y13A 1TQPA 3HUGA 4CDGA 4BAYA 2KJBA 3G3ZA 1GXPA 1XMKA 2DK8A 1S7OA 4EGZA 3IC7A 1W4MA 1IAWA 5HS7A 1YG2A 2PI0A 2XAGA 3W6JB 3PQKA 5HS8A 4MQ9F 2PG4A 3CLOA 3ERED 1R5GA 2X4HA 2XUBA 3KP4A 3WGGA 3GZ6A 4H0EA 1IN6A 1KA8A 1UFMA 3QAHA 3R4KA 2B0LA 2RGVA 1RUOA 5EEHA 2PBIA 2G7HA 2O0YA 2ZMEB 2COMA 3JTGA 1DP7P 3FX3A 3HSEA 2GIVA 3FWEA 4P55A 3ABTA 1FX7A 4U7BA 4N9HA 1OYWA 3VOEA 5ICFA 3HIFA 4U88A 3QU6A 2A69F 4D0PA 1CF7A 1H0MA 4ZYDA 3LSTA 1XSDA 2RVCA 3TQNA 2F5EA 1ZRFA 1XD7A 3B73A 3I5UA 2OZUA 2H94A 2K4JA 4ZYGA 1X3UA 2QZ8A 3E5QA 4LK0F 4MTDA 1HW2A 4CZZA 4LG0B 3EDPA 4MTEA 1TW2A 4A6DA 1YS6A 4ON0A 3ELKA 1FBQA 2XAQA 2O61A 5HDGA 1P4XA 4K2EA 5BPDA 4XLPF 4PCQA 4F7ZA 1L3LA 3J7AO 3JW4A 2M30A 3GVAA 3L7WA 3FXQA 2VBXA 4KN7X 3F8FA 3SXYA 5E1WA 3MWMA 3RTRA 1G3YA 4KNYA 2FNPA 2WTEA 1XGNA 4KA4A 1HKTA 1ZG1A 4CYDA 3K2ZA 1PUEE 5H6QA 2Y0MA 3B02A 1XCVA 2QQAA 3RDIA 2FU4A 2ZXJA 4AVPA 1TNTA 2YX7A 1BC7C 2MBFA 4I98B 2D2WA 4ZYEA 4ZH4F 2M8EA 1AOYA 2M45A 3FMRA 3DPLC 2F5CA 3V4GA 2RV8A 4O6JA 2VBYA 4A5MA 4EGYA 3U1DA 4RAYA 4CO8A 1QQIA 2AS5F 1TQMA 3GZ5A 1DUXC 1AWCA 4AIKA 2MA3A 3ZN0A 4A5NA 4RS8A 1USSA 2G7UA 4IRGA 2BYVE 4A12A 1FOKA 2OAZA 4HOBA 3JSOA 1IN5A 2W24A 3V8KA 5DD8A 3OV8A 3HSRA 3ZMSA 2R7DA 1YTYA 2GAUA 1IXRC 1HW1A 2DK5A 2QBYA 5LEKA 4DQ2A 3FXRA 4LGWA 4RB2C 3QP6A 4IRIA 4EJUA 5DCMA 3MZHA 4WXCA 5L3EA 4N0BA 2RNJA 5JHUA 2DI3A 3MAJA 5LHHA 1D8JA 2ZCWA 5ICEA 3BROA 3F21A 3N4MA 3VEPA 1ZRDA 4IJAA 4BHBA 4A0XA 5FFZA 1FC3A 2VONA 1H9TA 3IHUA 4BHCA 2GWRA 4OIPF 5D4RA 2FMYA 2Z99A 2BGCA 1GXQA 5JR3A 3IWZA 4KDPA 2EFQA 3RKYA 3KE2A 3WTTC 1MDMA 1O7FA 5HLHA 4OIOF 4RB1A 2MH9A 3C3WA 3LAPA 4HYEA 2W57A 3GW2A 3L9FA 2H27A 1B6AA 1SFXA 4HF1A 1OPCA 3EETA 3R61A 1JGSA 2WWYA 4WX9A 4OMZA 1HQCA 5H20A 1KU3A 1FBSA 3GLXA 2P6TA 3WODF 1KQ9A 2A6HF 3CUQC 1BI0A 5D8LB 2JSCA 1T2KA 4MGRA 4MEYF 4I2OA 5HLIA 4HLXA 3CUQB 4PZJA 1R1UA 3WG9A 3SZPA 2HWVA 5FD6A 3HRUA 3QPTA 4Q4ZF 3CDHA 2W25A 2CO5A 1GHCA 2DQLA 2EK5A 3ZN1A 3PQJA 1R5HA 2ADUA 1USTA 1R1VA 2J5OA 2L01A 1Y0UA 5CVJA 3BP8A 1O3SA 2F2EA 3TO9A 1I1SA 3LWFA 1EH8A 4L0YB 4A2UA 1A04A 1IZ1A 2HQNA 4UVAA 2FQ3A 2STTA 4BXUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1H9GA 1XTAA 1WH7A 2KFDA 2MLKA 2ENCA 3DCFA 4BEHB 1BIAA 1JJ6C 2PEXA 2CH0A 3QYFA 5J1RA 1RMDA 3FK6A 1FWZA 5F1RA 2M3AA 3I4PA 2JQ7A 4BYYA 2EOFA 3MKZA 2EPCA 3G73A 2VQEE 2E1MA 3H9QA 5KAIC 2RN7A 1T0FA 5EG0B 2P8TA 3DFGA 2EM3A 2HVQA 2H6CA 1XDUA 4CXFA 5KL6A 2RS7A 1TWHJ 3HGYA 3Q9SA 3R6SA 3F22A 4HQEA 1E17A 3DJWA 2NUEA 2FA5A 2WB1A 3GEZA 3S16J 3ZQHA 1A1KA 5IOZA 3RPUD 3OSGA 1UILA 1G6NA 2L2OA 1FLIA 1NTCA 1P4WA 2HDCA 2EMIA 1YPNA 4IQJA 1DI2A 4KUMA 1ONVA 4PK4A 4YIIA 3J7AG 3QPHA 1FNNA 2KZGA 5D6EA 3IH2A 1FY7A 2EIKH 3FBNB 3ZMZA 3FBIB 2CRGA 3CMEI 3IRQA 4B3TE 5FD5A 2LRSA 1TNSA 1VQKI 2L33A 3HZJA 2NVUB 3GBGA 2OA4A 1GVDA 5DD4A 5CQGA 4CA0A 4YG2F 4Y52J 3ZMUA 4KMUX 3IRRA 1DP3A 1FTZA 3OY9A 3RKQA 3DWLE 1XGOA 1F4KA 2ESHA 2KL4A 5EZGA 2JA6J 2LMDA 2L9VA 2RQPA 1BA5A 3IH3A 4F2JC 3THNA 2XKPA 3NQOA 3E6CC 4Q5SF 2XAFA 2LKXA 1L4SA 2R0QC 5CYVA 4ENMA 2XB5A 3IKVA 4LOCA 2EM9A 3FHNA 3WTZA 4ETSA 5FLXZ 2HVSA 4DR4E 1ZN2A 3CC7I 4ESFA 1K78A 4M0VA 2BVLA 3PL8A 4IJDA 4BC7A 3DEWA 3RCOA 2Y48A 5HVQC 2XF7A 2L7FP 2M8GX 4Z2YA 4PGHA 3SJMA 2HU9A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3L00A

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