4TTUA

N-terminally truncated dextransucrase dsr-e from leuconostoc mesenteroides nrrl b-1299 in complex with isomaltotriose
Total Genus 340
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
340
sequence length
1046
structure length
1036
Chain Sequence
KGLRQDSNGKLRYFDLTTGIQAKGQFVTIGQETYYFSKDHGDAQLLPMVTEGHYGTITTAWVYRDQNNTILKGLQNINGTLQFFDPYTGEQLKGGVAKYDDKLFYFESGKGNLVSTVAGDYQDGHYISQDGQTRYADKQNQLVKGLVTVNGALQYFDNATGNQIKNQQVIVDGKTYYFDDKGNGEYLFTNTLDMSTNAFSTKNVAFNHDSSSFDHTVDGFLTADTWYRPKSILANGTTWRDSTDKDMRPLITVWWPNKNVQVNYLNFMKANGLLTTAAQYTLHSDQDLNQAAQDVQVAIERRIASEHGTDWLQKLLFESQNNNPSFVKQQFIWNKDSEYHGGGDAWFQGGYLKYGNNPLTPTTNSDYRQPGNAFDFLLANDVDNSNPVVQAENLNWLHYLMNFGTITAGQDDANFDSIRIDAVDFIHNDTIQRTYDYLRDAYQVQQSEAKANQHISLVEAGLDAGTSTIHNDALIESNLREAATLSLTNEPGKNKPLTNMLQDVDGGTLITDHTQNSTENQATPNYSIIHAHDKGVQEKVGAAITDATGADWTNFTDEQLKAGLELFYKDQRATNKKYNSYNIPSIYALMLTNKDTVPRMYYGDMYQDDGQYMANKSIYYDALVSLMTARKSYVSGGQTMSVDNHGLLKSVRFGKDAMTANDLGTSATRTEGLGVIIGNDPKLQLNDSDKVTLDMGAAHKNQKYRAVILTTRDGLATFNSDQAPTAWTNDQGTLTFSNQEINGQDNTQIRGVANPQVSGYLAVWVPVGASDNQDARTAATTTENHDGKVLHSNAALDSNLIYEGFSNFQPKATTHDELTNVVIAKNADVFNNWGITSFEMAPQYRSSGDHTFLDSTIDNGYAFTDRYDLGFNTPTKYGTDGDLRATIQALHHANMQVMADVVDNQVYNLPGKEVVSATRAGVGNDDATGFGTQLYVTNSVGGGQYQEKYAGQYLEALKAKYPDLFEGKAYDYWYKNYANDGSNPYYTLSHGDRESIPADVAIKQWSAKYMNGTNVLGNGMGYVLKDWHNGQYFKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Leuconostoc mesenteroides
publication title Structural Insights into the Carbohydrate Binding Ability of an alpha-(12) Branching Sucrase from Glycoside Hydrolase Family 70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dextransucrase
total genus 340
structure length 1036
sequence length 1046
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2014-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02324 Glyco_hydro_70 Glycosyl hydrolase family 70
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.270.10 Mainly Beta Ribbon left handed beta-beta-3-solenoid Cholin Binding 4ttuA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4ttuA03
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 4ttuA04
3EBVA 1AQMA 4UOQA 1ITCA 3O2LA 1Q6EA 3W81A 5CPSA 4D6IA 8A3HA 1VFMA 2QF8A 3NDZA 1CENA 3VNZA 3WNLA 4UFLA 4RL3A 3THDA 3SCWA 1MQQA 5CXPA 3DYOA 3WH9A 1RP8A 4LYQA 1R8LA 1V0MA 1E71M 1VBRA 1HT6A 4N0RA 1BPLB 1HKMA 2D23A 1W9BM 4W88A 2OWXA 1JIBA 4BQ5A 4J27A 3AIQA 1HJSA 2V3FA 3AS3A 2O9PA 4J28A 4YHGA 4JAWA 1TVNA 4PTVA 3WBAA 4CCDA 2WWCA 3GDBA 2ZX8A 5I5RA 1SYTA 1KGUA 4D72A 5A94A 2A3CA 3G6LA 4MAVA 2PC8A 2O9OA 4PMUA 1G94A 1EDTA 3WNOA 3NSMA 5ABFB 2YJQA 2DGAA 4HZ7A 4WKHA 2CKSA 1LWHA 5JBFA 4CD5A 1DWFM 1WB0A 3WNMA 3KL5A 1TA3B 3WF0A 1K9DA 3UERA 4M1RA 4W8AA 4RE2A 4CU7A 2GJPA 2W66A 3S6TA 1WNOA 4W86A 2J8FA 1WCGA 2G3MA 3DHUA 3AIBA 4HPHA 1FH8A 2J25A 2E9LA 1HJQA 4NI3A 1HCXA 2XGBA 1DTUA 4D1IA 2QHAA 3VDCA 3ARPA 4H2CA 3OBAA 3DHPA 2A3BA 2J7CA 2ZOXA 1H11A 1E3ZA 2ZWZA 1NP0A 1UKOA 4D6CA 4ACZA 3OZPA 4CD7A 2W91A 4HU0A 2E40A 2V3DA 3TONA 3FHAA 1W1YA 3OLIA 4FK9A 1ECEA 4JHZA 1OT2A 1EOKA 2BFGA 4W87A 3GH7A 2MANA 2J7HA 1GONA 4PTMA 2VX5A 2VCCA 1WZMA 1V02A 1W2PA 4D6EA 5ABHA 1W1TA 2EPLX 3VDBA 3J7HA 2V5CA 1E55A 3WNKA 3KLKA 3WD2A 3EDFA 2XWEA 2PBOA 1M01A 4ZXLA 1LF1A 1J0JA 1B31A 3IANA 3SUUA 3W4RA 1XH0A 5ABGA 4QLKA 4OBRA 2RGLA 4F9JA 1M03A 3WH6A 1KXHA 3PZVA 5GNYA 2WNWA 4F79A 5M03A 1PIFA 5JIPA 4TX6A 3O6AA 5AC5A 2W67A 1KQZA 1MVYA 2PI6A 3POCA 1LJYA 2J7EA 4YPJA 1QW9A 2ZX9A 1UWIA 1J0HA 5TD4A 1GNXA 3QOKA 1UG6A 4WF7A 2XSAA 1MWOA 2GJXB 1OSEA 1GQJA 1V3JA 2FHFA 3SUTA 2WAGA 3UG5A 3II1A 2VOTA 4HPGA 4HA4A 5DT5A 4P7QA 2GK1A 2J7DA 2XUCA 1UR8A 3NJ3A 1CXIA 7CGTA 5DMYA 4W8LA 1E6RA 3OZOA 3SUSA 1GHRA 1CXKA 5A95A 1WZAA 2YBTA 2UY3A 1WZKA 5EMYA 4HOZA 4EKJA 1UR1A 2YDQA 2WSKA 1E70M 3I3BA 1R85A 4YHEA 1UWSA 3AHZA 5IHSA 3RO8A 3N15A 1G01A 1E6NA 4MNKA 3GXIA 1W3JA 4W85A 1J0ZA 1V6XA 4B15A 3TA9A 3VGDA 4RE4A 1E6XM 2XVKA 3QOMA 3W0KA 1B90A 2E8YA 1J0KA 3VIPA 3WQ6A 3BAKA 4J3WA 1EA9C 1W9PA 4RE3A 1CPUA 3CUGA 1BTCA 3BXWA 2FHCA 3NSNA 3MKKA 1MW1A 4AD1A 2YOCA 3AIRA 4AEFA 3EDKA 1EQPA 3SEPA 1JF5A 4GXPA 3W25A 2FDMA 3CZLA 4J3XA 3L4ZA 2Y5EA 1E4MM 1CXLA 4AZGA 3MSGA 1JZ8A 1KGWA 4XB3A 1JFHA 4PMVA 3T08A 1FA2A 1ITXA 3CHCA 2Z1KA 3VIKA 2GJRA 3QR3A 5DFAA 2Y8KA 3O9NA 4ZE5A 1E0WA 5M3WA 3RPMA 2PB1A 1XD1A 1G0CA 2EBNA 3W37A 2VZUA 3IAQA 3NDYA 5EBAA 3CMGA 2BVTA 4TOQA 4LPCA 2WMKA 2F6EA 1HNYA 2WZHA 1KXVA 5DO8A 1PX4A 3SCVA 3L4UA 4QFUA 3SURA 2WC4A 3W27A 4PMZA 2F8QA 1Q4NX 1V08A 1HX0A 4BQ2A 2EO7A 1FOBA 3UG3A 4TVCA 4HA3A 3AJ7A 1DWIM 1H49A 1BF2A 3MMUA 1B0IA 1JZ2A 2NSXA 2VUYA 5A6BD 1W9DM 1M7XA 3WH8A 1E56A 2W62A 1JD7A 1WP6A 1H09A 1OD0A 1E6SM 4UQCA 3PZGA 4CN4A 1ZBKA 3HIAA 1V03A 4WIWA 2DT2A 4BZYA 1J12A 1XCXA 1K9TA 3L4XA 1H2JA 1OCQA 4CD6A 3U7VA 5FOOA 1BVNP 1EIBA 1C90A 2XGIA 4H8VA 4XZWA 4JL1A 3SCNA 3ARUA 5I6SA 1GVIA 2X8PA 3WQ8A 1CEOA 2EPOA 3CO4A 5BXRA 5KZ6A 4AYGA 3ZSSA 5I78A 4WSJA 3GBEA 1OWQA 1WAWA 4LX4A 3T0AA 1US2A 3ZOAA 4P8VA 4W7WA 2YDRA 3ARRA 1HF6A 1E4NA 2XFYA 3VGBA 3NUKA 5E6YA 1GVYA 4B3LA 4U2ZA 4KRTA 1XH2A 3WEMA 1BVZA 4D6FA 1PX8A 5HXMA 4PEEA 2WWDA 4C7GA 2V3GA 3IK2A 5A8MA 4W93A 1C8XA 4UFJA 1G9HA 1VENA 4LGXA 4AZIA 1EO5A 3PBGA 2ZXDA 3ZT5A 5A8OA 5A2AA 1GPFA 1ZBCA 3CPUA 2WSPA 4GINA 3WD4A 2XVPA 5I2UA 4IISA 2WW5A 8CGTA 1QNOA 1J18A 3PZOA 3W28A 4MADA 4AC1X 2WC3A 1CGUA 1H1NA 4UOJA 4BCEA 5FL0A 2Y2WA 5GNXA 1XSIA 4B9YA 3ZJ6A 1BSIA 3AIUA 1MYRA 2WBKA 3F4VA 4UFHA 3OB8A 4WSKA 3ZJ8A 3VIGA 3TTQA 5FIPA 3BAJA 4V27A 1CGYA 2WZEA 2YKKA 2XFFA 4CD4A 1JXJA 5IXEA 1R7OA 3T2OA 1NQ6A 3ARSA 3A47A 3EDEA 2WKLA 3WDQA 1QBBA 3MUZ1 3WMBA 3KEHA 5A69A 1EH9A 1C8QA 3WQWA 5HNNA 1KXQA 1W1VA 2J47A 5CJ5A 2DDXA 4GPNA 3GNOA 2VZOA 2BS9A 2WBGA 2BVDA 3WH5A 3ZQ9A 3MV11 4HMEA 3VDHA 1UD6A 1E40A 2DSKA 3PTMA 4P7LA 3VVGA 3AS2A 1V0NA 3ARYA 1ZJBA 2JF7A 3OG2A 3VMOA 4W5UA 4AD0A 1MXGA 3ZSTA 2G8ZA 4BQ3A 1SFSA 3RCNA 5HDRA 3AMGA 1E15A 2W5FA 3B9DA 3CZGA 3K46A 2X0YA 1CZ1A 3W24A 4ZXOA 1CLVA 1UKPA 3QHMA 3TP4A 3ARQA 5E09A 4JFUA 4NF7A 3W53A 1UR2A 3M07A 1E73M 2D0HA 1QI5A 4PRWA 5DF0A 1UYQA 4UQ9A 3PZMA 1HN1A 1UA7A 1DWGM 3VMPA 1UWUA 1D3CA 4JKMA 3FY1A 5E70A 2YDSA 4CKQA 1E72M 1UR0A 3A4AA 4W89A 4U33A 4YN5A 1E1EA 3AIEA 5CPTA 2PWFA 4HOWA 3ZT7A 2X2YA 3AIVA 3VIOA 4DWSC 5I3DA 3AXIA 1CDGA 2ZUNA 5FCZA 1JI2A 1UWTA 1W9UA 2BV9A 3E1F1 4PUDA 4AY1A 2DQXA 1ISZA 1E5JA 1BYCA 5IFPA 2GJXA 3A6OA 5A3HA 1L8NA 2VT0A 1V0LA 3WENA 4D6JA 3L4WA 3ZJ7A 4PCSA 1BG9A 1XHGA 2DSUA 4U2YA 1HP4A 1PAMA 1GQIA 3RILA 3BH4A 3VGGA 2DSVA 2JEPA 1HXJA 3MUY1 1B9ZA 1W3LA 2D3NA 1B3ZA 2GDVA 3BCFA 1J01A 1NWSA 1PEZA 2JIEA 4Z2JA 3M7SA 3N11A 3M46A 1VAHA 1UH4A 4UR9A 3SCUA 1UKSA 2W61A 4S3JA 3SUWA 3WY1A 3GNPA 1HVXA 2OLHA 4DUVA 3UETA 1SMDA 3AMLA 2BNJA 3L2LA 4X9YA 2X8OA 3VM7A 3BAWA 1UD2A 4MDOA 3VD9A 2JFEX 1FFRA 4MNJA 3ARWA 3WDPP 1B3VA 1ZS2A 3VIHA 3TTYA 1U2YA 1TFVA 3GM8A 3U7BA 5E6ZA 1P6WA 1JNDA 3F5KA 3KLLA 1UWRA 4GZJA 3VD7A 1KXTA 5CQ1A 5D8WA 4BF7A 4J3VA 1O7AA 5A1AA 1SMAA 3N1AA 2JEQA 3WDJA 5BROA 4MJ4A 4NC0A 4DWSA 2F61A 1VEOA 3AXXA 3K8LA 2QV4A 4AD5A 1AVAA 1KWGA 1WPCA 4ZEPA 3BLKA 1UD4A 2VYUA 2ZE0A 4DM1A 1WO2A 4EK7A 5LA1A 3UR7A 3CZEA 3JUGA 1V3HA 1JXKA 4QP0A 4NRSA 4ZENA 2BVYA 5BCAA 3G6MA 1K9EA 1BGGA 1D2KA 1US3A 4M29A 1A3HA 3PN8A 1OGGA 4U5KA 2WHMA 4TVDA 4WK9A 2WYSA 1VFFA 2V05A 3IJ8A 1G1YA 4F66A 5GPRA 2GUYA 4HA1A 2DT0A 3NSXA 3WUBA 1NOUA 1QBAA 1W3HA 3CUJA 4CUCA 1LLOA 2BY3A 3KL3A 3CHDA 2G41A 1JI1A 4V28A 3ARXA 5HBFA 1FHLA 5A6BA 1KGXA 4D6HA 1XRVA 2JE8A 4OBSA 3UESA 4WKFA 1JG9A 1H41A 4GO8A 3VILA 5D9MA 5HPOA 1TUXA 1UR4A 3IJ9A 3AMCA 3BMWA 1V3LA 1OGSA 4UCFA 1I1WA 1X6LA 1SR0A 2V38A 4MNLA 2QJ6A 3FN9A 4NBYA 1WDSA 3F5JA 1KFWA 4U3AA 4CU8A 4QLJA 5IHRA 4Y7EA 3TTSA 2VCBA 2J77A 3VIFA 5BXSA 3NYDA 2UY2A 4B3KA 3FAWA 1QI3A 1BYAA 4E2OA 1OIFA 1JGIA 2WVTA 1JDCA 4U5IA 1HKKA 5F7UA 4KMQA 1QW8A 1LL4A 2YL9A 3BMVA 4D71A 4AD3A 2OYLA 2XPKA 2ZX6A 1UZ1A 1FFQA 1UD5A 3MU7A 4H04A 1CGWA 4XZBA 4AIOA 3OGRA 2XWDA 1E4IA 4EAMA 3ZO9A 4HTYA 5IFTA 2Y8VA 4BA0A 1U33A 4UOZA 4OIFA 3A4WA 4CN6A 1UD3A 1F4HA 4JHOA 1C92A 5A2BA 2WANA 2DT3A 1QI2A 4MJ2A 5CSUA 1IV8A 4KH2A 3RMEA 1EO7A 7TAAA 3RJXA 3B9AA 4DWSD 1K6AA 3U5YA 2QMKA 3DC0A 3BC9A 2D24A 3W82A 4TTGA 1A47A 1CXHA 1Q6GA 3GYCA 1B2YA 3CZJA 4F9DA 1TE1A 2PBGA 5EFDA 3I3EA 2ZUUA 3EMQA 5FL1A 2YA2A 1LG1A 1U30A 3CUHA 4CU6A 5D4YA 2E3ZA 2CHOA 2WPGA 4MNMA 4Z2IA 3EYPA 3VKKA 1C8YA 2WMIA 3GBDA 3DECA 4P8UA 4XUYA 2J8GA 3HN3A 1QOXA 1AQHA 1NARA 1V3IA 3IAPA 5AC4A 2BHYA 2JIWA 1NH6A 2VRQA 2WK2A 3VIIA 2PWEA 4JFVA 5I79A 1PJ9A 3NCOA 2VZSA 4LQ1A 3AHXA 4URIA 4TUFA 3HZ3A 4ACZB 1YHTA 4NZCA 2JF6A 2VJXA 1WDQA 1E6PA 1QVBA 4AZCA 4CVUA 3OLGA 6A3HA 3I3DA 4GIAA 3WD1A 3VM5A 3AIWA 3N17A 3BAXA 2E0PA 3FHQA 4MDPA 1HKIA 3GXMA 2NW0A 4PSRA 1E0XA 2DSWA 2UY5A 3QHOA 5AY7A 3RIKA 1DWJM 1GJUA 4MB5A 2ZXQA 2CIPA 1UA3A 2A3EA 5E0CA 2VNCA 3PTKA 1QNSA 2OWCA 5I24A 1QHPA 4TX8A 3VD3A 2D3LA 4TTUA 3VINA 1L0PA 1JZ7A 2VX4A 4HOXA 3FAXA 2VVNA 4GI9A 3CGTA 1TCMA 2WVVA 5CGTA 3ARZA 4D6DA 4E8DA 4HP5A 4XX6A 1BAGA 1JZ4A 3EMCA 1UQYA 1V6VA 2EXOA 5M17A 4IM4A 5D9OA 1LL6A 1MFUA 2D22A 1DP0A 1UHVA 3K1DA 1EQCA 2Z1SA 4U3CA 4FMVA 1ODUA 2CYGA 2EJ1A 4UFKA 1VB9A 1FH7A 4R5EA 1RD6A 2VZTA 4OUEA 4EE9A 4FLQA 1PIGA 1OD8A 4PMDA 2W63A 4XV0A 1X1NA 4J7RA 5E9AA 1BFNA 4AYSA 4OZOA 4AISA 2J4GA 4PMOA 3CZ8A 2GK1B 1TG7A 3AMDA 2ZUWA 1PBGA 3AICA 4X36A 1GZJA 3U57A 1W2VA 2X8RA 4B9ZA 4W8BA 3HU7A 1BGAA 3UR8A 2CKRA 1B30A 5ABEA 3VX1A 3BSGA 1ZL1A 1JDAA 1FH9A 5A6MA 1YQ2A 3CIVA 2VL4A 1S46A 3VD5A 1GQKA 5HPCA 1LQ0A 5ABFA 1NWUA 1JYNA 1I75A 1E5NA 3WUEA 1LWJA 3FW6A 4H7VA 2BHUA 2G4FA 3CHFA 2YA0A 3VIJA 4JFTA 1TA3A 2W4XA 1CLXA 3QGVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3EBV A;  1AQM A;  4UOQ A;  1ITC A;  3O2L A;  1Q6E A;  3W81 A;  5CPS A;  4D6I A;  8A3H A;  1VFM A;  2QF8 A;  3NDZ A;  1CEN A;  3VNZ A;  3WNL A;  4UFL A;  4RL3 A;  3THD A;  3SCW A;  1MQQ A;  5CXP A;  3DYO A;  3WH9 A;  1RP8 A;  4LYQ A;  1R8L A;  1V0M A;  1E71 M;  1VBR A;  1HT6 A;  4N0R A;  1BPL B;  1HKM A;  2D23 A;  1W9B M;  4W88 A;  2OWX A;  1JIB A;  4BQ5 A;  4J27 A;  3AIQ A;  1HJS A;  2V3F A;  3AS3 A;  2O9P A;  4J28 A;  4YHG A;  4JAW A;  1TVN A;  4PTV A;  3WBA A;  4CCD A;  2WWC A;  3GDB A;  2ZX8 A;  5I5R A;  1SYT A;  1KGU A;  4D72 A;  5A94 A;  2A3C A;  3G6L A;  4MAV A;  2PC8 A;  2O9O A;  4PMU A;  1G94 A;  1EDT A;  3WNO A;  3NSM A;  5ABF B;  2YJQ A;  2DGA A;  4HZ7 A;  4WKH A;  2CKS A;  1LWH A;  5JBF A;  4CD5 A;  1DWF M;  1WB0 A;  3WNM A;  3KL5 A;  1TA3 B;  3WF0 A;  1K9D A;  3UER A;  4M1R A;  4W8A A;  4RE2 A;  4CU7 A;  2GJP A;  2W66 A;  3S6T A;  1WNO A;  4W86 A;  2J8F A;  1WCG A;  2G3M A;  3DHU A;  3AIB A;  4HPH A;  1FH8 A;  2J25 A;  2E9L A;  1HJQ A;  4NI3 A;  1HCX A;  2XGB A;  1DTU A;  4D1I A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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