1XUZA

Crystal structure analysis of sialic acid synthase (neub)from neisseria meningitidis, bound to mn2+, phosphoenolpyruvate, and n-acetyl mannosaminitol
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
348
structure length
348
Chain Sequence
QNNNEFKIGNRSVGYNHEPLIICEIGINHEGSLKTAFEMVDAAYNAGAEVVKHQTHIVEDEMSDEAKQVIPGNADVSIYEIMERCALNEEDEIKLKEYVESKGMIFISTPFSRAAALRLQRMDIPAYKIGSGECNNYPLIKLVASFGKPIILSTGMNSIESIKKSVEIIREAGVPYALLHCTNIYPTPYEDVRLGGMNDLSEAFPDAIIGLSDHTLDNYACLGAVALGGSILERHFTDRMDRPGPDIVCSMNPDTFKELKQGAHALKLARGGKKDTIIAGEKPTKDFAFASVVADKDIKKGELLSGDNLWVKRPGNGDFSVNEYETLFGKVAACNIRKGAQIKKTDIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Biosynthetic protein
source organism Neisseria meningitidis
publication title Structural and mechanistic analysis of sialic acid synthase NeuB from Neisseria meningitidis in complex with Mn2+, phosphoenolpyruvate, and N-acetylmannosaminitol.
pubmed doi rcsb
molecule keywords polysialic acid capsule biosynthesis protein SiaC
total genus 117
structure length 348
sequence length 348
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03102 NeuB NeuB family
A PF08666 SAF SAF domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1xuzA01
3.90.1210.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Type Iii Antifreeze Protein Isoform Hplc 12 Antifreeze-like/N-acetylneuraminic acid synthase C-terminal domain 1xuzA02
1W3TA 1HO4A 1PE1A 4CCDA 5AFDA 4IWWA 4BWLA 4AXKA 3W7LA 1HG3A 2C18A 2E6FA 1F74A 2FDSA 4LC8A 3S8HA 5G5IA 5ABTA 2O7QA 1JUEA 3NQGA 4N9EA 4BI5A 1JCXA 2BXVA 4NXKA 5DBTA 5H2ZA 5F1UA 4RJEA 3QPZA 5BW6A 4PTNA 3B0VC 5AOUA 3MMTA 3GLCA 3THQA 2PRLA 5AYXA 4MFEA 3NQEA 1TV5A 3QQ1A 2GOUA 5AHEA 4GUFA 5D2TA 5HUPA 3TX9A 4IJBA 4GC4A 1ONRA 3P84A 1KFKA 4HSNA 2RDTA 5DBUA 4NNBA 3BGJA 1XDMA 2F7FA 5E1QA 2ZRVA 1O4UA 1ADOA 4UTMA 1U5JA 3GXTA 4LVAA 3QW3A 2BSLA 2FPTA 4PC8A 3M41A 4N4PA 4JY8A 1UCSA 2X2GA 1K7FA 1EUAA 3DBPA 3TC7A 1WXJA 3O6CA 3WJSA 2QJGA 1FCQA 1GT8A 3STGA 4JN6A 3LBCA 4GXMA 1IXOA 4WJEA 3QMTA 3FYOA 1EWDA 1GYLA 3KRSA 5HQEA 3YPIA 3QFEA 1H63A 1VR6A 3M9YA 2FPVA 2AMEA 1SFLA 1GYNA 1F6PA 2ZZ5A 3NQVA 3THAA 1OVDA 3TC6A 3G1YA 1F76A 1TMHA 1NF0A 2BTMA 1P1XA 5CPNA 5G2IA 4MY8A 4M7SA 4NU7A 1PHWA 4JTJA 3BLFA 1TREA 1UASA 2YW4A 1B7IA 3STFA 1SW0A 5KITA 3C52A 2CZEA 3C2RA 1KFLA 4RZ5A 1NSJA 4LTSA 3HBLA 4HSOA 4NX5A 5D2XA 3W7EA 4A2SA 4AWSA 4GFSA 3RFAA 4OHQA 5F2LA 1W3IA 3SI9A 1VJIA 1XUZA 3PBWA 2XFWA 4QSHA 1WOBA 4MKNA 3H55A 4PODA 1T96A 1ZY9A 4RX0A 1U83A 4ZL1A 4K6AA 3BLIA 3NOEA 3MHFA 4MSIA 2TPSA 4DPPA 4UMAA 1G4TA 4K36A 4TMCA 2Y88A 3SZ8A 3N2MA 4TR9A 4MVAA 1X1OA 4EF8A 2FTPA 3KVMA 4ZMGA 1M7OA 1XKYA 4KFNA 3V1PA 4NNAA 3W7PA 1QNVA 2EGZA 3L67A 1D9EA 3GKAA 3S42A 4A2RA 3QEZA 3HMJG 4BI7A 1TSIA 3FFSA 3CWNA 2HS8A 3DH7A 3T7VA 3MP3A 2H3BA 4EVZA 1F73A 4AHOA 4M19A 3PVFA 4O16A 1I4NA 4H6KA 3LXCA 3O15A 4OWGA 7AMEA 4O15A 4LRSA 1MEIA 2FLIA 2YFNA 1W5PA 4WOZA 3HIJA 5G1YA 3SR7A 5CPOA 3HG5A 3BW4A 3O07A 2FJKA 2XN2A 3PBUA 4TMBA 2DZTA 3UWQA 1THFD 1TTPA 1EP1A 1W5OA 2GJLA 2NXIA 1YXDA 2F84A 3GDTA 5F2GA 2YZRA 1QPOA 1R47A 2D73A 1L6YA 5EMUA 4YLWA 2YCEA 1TQJA 2Y62A 3NDOA 1TV8A 3L0KA 1YXCA 1W5QA 2QCGA 4AWUA 3L9CA 3KHJA 3PF3A 3M5YA 4LVBA 1MSIA 1VYSX 3LCLA 3W6YA 1OFEA 1SZFA 2VXNA 3O16A 4RV8A 3G22A 4Y9AA 2QR6A 5AHLA 1QMLA 3T44A 1Y0EA 4DBEA 2QCCA 4LVGA 3GYEA 4XZ9A 3GDKA 4M6VA 1EWEA 3W7CA 3FYPA 4HNNA 2DP3A 4CNNA 1AMKA 2E09A 3A22A 4LNYA 2E6YA 3GR7A 3O1NA 3Q37A 3A9IA 3EX1A 5G4EA 1YPFA 5BNKA 1Q6LA 2ZQ0A 3LB0A 2GUUA 3TMLA 1JABA 3TSMA 3KAOA 1HO1A 1J2WA 4RXGA 4O0ZA 5CPMA 4AVFA 4WQ6A 3FOKA 3O06A 4LRTA 3HGSA 4HT3A 2EKCA 4JR5A 2EPHA 4DEFA 1G4SA 4DF2A 2GJNA 3H53A 1TJPA 5HWMA 3EWBX 2Y89A 2YYTA 4IMCA 2Y7FA 3W2JA 1SO5A 5LNRA 1XC4A 2XN0A 4GNJA 1KM6A 1W31A 4ZZ9A 1EEPA 2CLEA 3O8AA 4GUGA 2R91A 4U28A 4WX2A 3ANYA 2NXHA 5GVJA 3TUUA 4FF7A 3ABQA 2X1SA 4ORMA 4FXSA 3UWWA 3EEGA 3W7HA 3ATYA 1OABA 1QR7A 1DQWA 1SPQA 3LRKA 5D2YA 2SPGA 5C6MA 1UUOA 3VI2A 2NV1A 2VKZG 4HHPA 2C14A 3W22A 3NQ6A 2B7PA 4MUZA 3L2IA 2R14A 5F4XA 3U6WA 1MXSA 2QJHA 2OT0A 1GG1A 1A5BA 4LV4A 1RZMA 3S0CA 4ADUA 1AW5A 4AWTA 3GDRA 2J24A 2I1OA 1KTBA 1DORA 1FXPA 4Z1CA 2QF7A 1QAPA 4FX6M 1VCGA 3PB2A 3W1UA 4AB4A 4RLIA 2QCNA 2C0AA 2HSAA 1XXXA 3QRHA 1H50A 2CU0A 4X3ZA 2QDGA 3G1VA 1HTIA 1T99A 2V5BA 4RKAA 4QISA 1DVJA 3G3MA 3TNOA 3CC1A 3CEPA 2QUVA 1W1ZA 3LCFA 4JX6A 4I7VA 4LVFA 4MPQA 4UTUA 3EB2A 1SSGA 3W7KA 1JR1A 1FWRA 3NZRA 1G7VA 1BWKA 3H54A 1L6WA 5C54A 4MZYA 4E0CA 3PAJA 3TXZA 5I3JA 3DKLA 3I7QA 1FQ0A 4EF9A 3W75A 1FX6A 4MZ8A 5HULA 4UFJA 1AK5A 4O50A 1H1YA 4NXSA 3W1AA 4TO8A 4UIOA 4JYFA 3VKJA 1H5YA 1BTMA 5DY3A 2Q8LA 1FY6A 3P8JA 3RMJA 3BPWA 3DI1A 3BVJA 3W7JA 4UTWC 5HJLA 1WOAA 3NZ1A 2Q3RA 5CSRA 3C2FA 1TTIA 3PS7A 4FNQA 3EX2A 4NJGA 3SFKA 3FLUA 3TKFA 1ML1A 1VH7A 3NL3A 1SQ7A 1FDYA 1Z41A 2DZXA 4ML9A 3CPRA 1SZGA 2WSYA 2ZZ7A 1TPFA 2QEZA 3NAVA 1W0MA 1TB3A 2Z6IA 3M0ZA 4O28A 3A21A 3L0GA 3SJ3A 3OVPA 3IGUA 1O5XA 4XKYB 2YYUA 1PCWA 2A5HA 3W7QA 1MSJA 3W1LA 4JX5A 4LW7A 4N9BA 4OE7A 3QZEA 4HNTA 3C56A 3F4WA 1A5AA 1I45A 5D02A 1SO6A 4O13A 5CZJA 3LHYA 1WV2A 1K03A 2AQWA 3QM3A 4UTHA 1XBXA 2X1TA 1LBLA 5MHBA 3W76A 5K9CA 4M6PA 1SZEA 1UCWA 1SFJA 3C2VA 2Y6ZA 1LBMA 3OVRA 5IBXC 4ONVA 5HWJA 4Z0SA 4A22A 1LTDA 1N8FA 1FUYA 4CCCA 1QFEA 4RR4A 3UY7A 5LNUA 5U7SA 2DZUA 4ZQCA 3PBVA 4N9DA 4KWVA 2QAFA 5AHNA 3T78A 3T40A 4AEOA 3DXIA 3MHGA 1XBZA 3UY8A 1GZGA 1KM0A 1XCFA 2VFEA 4DELA 2A6LA 3RLVA 1SZNA 1H7RA 2Y63A 1FCVA 1CI1A 4NJHA 2ZZ2A 2A7NA 3LRMA 3W1XA 5BRBA 2H3DA 3LCXA 2B4GA 4IX0A 5AYYA 1YXYA 4O4VA 3DHFA 4Y96A 4H4IA 2CLKA 1B57A 3WFAA 2LX2A 2HMCA 4MLJA 1OG0A 2FPYA 3NQAA 1JQVA 5I3FA 1FBAA 3L5LA 5E0KA 3HJZA 5CPLA 3W7NA 4JXCA 4XKYA 1XBYA 3N3MA 3E49A 4G1KA 3HGOA 1VRDA 3IVSA 4UR8A 3NG3A 1OF6A 1SUXA 2CLMA 3G8RA 4LOCA 2E5DA 3UXDA 3NM1A 3A24A 2PCQA 1GEQA 5I3HA 4IOTA 1G6CA 5I3IA 2NV2A 1I2OA 5J5DA 1JCLA 4LUIA 1VGAA 1LOLA 1DOSA 3IV3A 3PSVA 4R34A 4IX2A 3TW6A 3GNNA 2DJXA 3OA3A 3W83A 3PR2A 1LBFA 2P10A 5AC7A 2ZYFA 3EWUA 3SGUA 2J9ZA 2GVJA 1KM3A 5SWUA 2MSIA 3W85A 4OV4A 4UCGA 3BW2A 2VELA 3WJXA 5K9DA 1S5TA 3W71A 2W0UA 1O5KA 2Y7EA 3M5ZA 1GVOA 1OPSA 2C3ZA 1K8YA 1H51A 3IGXA 5DN1A 1TCDA 4O53A 1BEUA 3EX6A 3K30A 3B06A 4NVTA 3MHUA 2WV8A 3QC3A 1EIXA 3HQ1A 3LBMA 3AMEA 3MW7A 1K8XA 4O10A 1SW7A 2GVLA 3MYOA 1C8AA 2C15A 3LOTA 5G1TA 1M5WA 2BZNA 3MUXA 1PS9A 4IMEA 4XBKA 2WOQA 3G24A 3TA6A 2BLEA 4BR1A 2QCDB 2ATMA 4UMBA 2CLIA 1EKLA 2ZBTA 2A6NA 2C19A 2H8XA 4LT9A 3CT7A 3SW6A 1E51A 3GDMA 1KW1A 3M6YA 1ZAHA 3VFLA 1TPEA 4ZVJA 4O57A 1OFRA 3IIZA 1SU5A 3LERA 3M44A 1G4EA 3PUEA 3NO5A 4LV9A 4JEQA 4M6QA 2G95A 1EA0A 5K4ZA 3F1QA 1VQTA 1DKWA 3NM3A 4ICNA 4AMAA 3FA5A 1RQEA 4FIQA 1MEHA 4UTTC 5L6UA 5BOOA 2Z2UA 3W7RA 1JCMP 2X30A 5D2WA 3LHUA 3DFNA 4JS3A 4BI6A 3PBYA 1AW1A 3GK0A 5CSSA 3DI0A 1JRBA 1B4EA 2VOMA 3PWAA 3RNDA 2J9XA 4YXGA 2ZTJA 1AW2A 4Y6GA 3JS3A 3W72A 1PCKA 3RU6A 3KX6A 3TQKA 4UTJA 4K37A 1I2RA 1Q6RA 4WXZA 4DXVA 1DHPA 4JTEA 2WSQA 4JTKA 4JYEA 1WBHA 3G1XA 2ZZ3A 1N7KA 1RV8A 3E96A 2QJIA 3G1AA 3NPXA 1KBIA 2ALDA 3W7IA 5AN7A 4AHPA 3CLMA 2PRMA 5DCEA 2VEPA 3NL5A 5CZ0A 2V2CA 5BMXA 3P74A 1GTEA 1WQ5A 2G96A 2JK2A 4BFAA 4DF1A 3KFTA 4IXHA 2Z1BA 4K7VA 3UZ5A 4DF0A 3LXBA 1KFBA 1RVGA 3ZWSA 2E5CA 5K3VA 1VS1A 4WZHA 3MO7A 4UTWA 3T4CA 1VCFA 3G1DA 1H61A 3G0SA 2IQTA 3VE7A 1FCUA 4DO4A 4N4QA 1I8JA 1KV8A 3AO0A 4MIMA 3LCGA 4ADSA 1TV7A 1HUVA 1R2SA 1WX0A 1J5TA 3MYPA 3S5ZA 5AC8A 3LLFA 4JGDA 4JTGA 1RQHA 1I2NA 1DJNA 1GPWA 3N2XA 4TU1A 2W6RA 3UPWA 1WDWA 5K4XA 4H3DA 2B7OA 3QF6A 4XTIA 4DO6A 1TPUA 3W7DA 4UTIA 3NQDA 3TAKA 3D0CA 4LVDA 2V0TA 4R53A 1R2RA 4FNSA 1RPXA 3F03K 4ZQPA 5HUOA 2ZZ4A 1YYAA 2EHHA 5D37A 4N6EA 4A3UA 1L6SA 3GVGA 2V2HA 3E12A 2JKAA 4KWWA 5IBXA 3LTSA 1FWSA 3LCWA 3B03A 4E2BA 4K39A 4D2JA 4GJ1A 3L65A 4UC5A 3W1NA 3HF3A 3NPUA 4UFHA 1OFPA 2QUTA 2DZPA 1OFBA 1TJRA 7TIMA 3G1SA 3LRLA 1RD5A 1A53A 1FWNA 2C1HA 4JIPA 4P61A 4I9AA 1F2JA 1J4EA 1O60A 4ZQOA 4IXXA 2CZDA 1H60A 3W84A 3MI2A 3G3DA 1TRIA 2WQPA 4JTTA 4O8RA 4XBSA 3R8RA 3TU9A 3JR2A 2MSJA 4IGHA 2J9YA 1ICPA 4ADTA 5A5WA 2EAWA 1XDLA 4LUJA 3BK0A 3B4UA 2ABBA 3MJYA 1P0KA 4JNMA 3I7RA 2QUUA 1V7YA 3UNDA 3GDLA 1IXQA 3R13A 3GNDA 5I3KA 3NYZA 2HS6A 3LHZA 2QCHA 4RK8A 1LCOA 4EWND 3S1WA 1W5MA 4NX0A 3W1RA 4QAIA 2V2DA 3NR0A 1EPXA 3RF9A 1G69A 3LCHA 1KM5A 2TSYA 3HPXA 5F1VA 4A29A 3I65A 3S1XA 4FEZA 4XWUA 2ISSA 3I7SA 2JGYA 1JQXA 1SSDA 1YDNA 1LOQA 4P2VA 4IUOA 4LWWA 1GZIA 2NWSA 2ZRZA 3DZ1A 3TV8A 1WYIA 4UXDA 3NQ7A 3NQMA 4R7JA 3W2MA 3R2GA 5HR6A 4YMZA 3QQ0A 2PRHA 3HB9A 1I2QA 2J27A 3KXQA 3QMSA 5CGQA 1ZAJA 2ZRXA 3W2KA 3UPBA 1QCWA 3DFTA 3N14A 3LI0A 5FF7A 2QAPA 3VCRA 2WSRA 3PB0A 5HR7A 3I6RA 4DPQA 3WJZA 3P8IA 1K02A 1VLIA 4JICA 2YFOA 3I68A 3B05A 1R30A 8AMEA 1H1ZA 3E02A 1B9BA 2NWRA 1FWWA 2DZVA 1JUKA 3UZJA 2V9DA 5K7JA 3N19B 1QPRA 1KA9F 3CU2A 1H7WA 3WJYA 2Y7GA 2I9EA 1YPIA 3JRKA 3LTYA 5CZTA 2A21A 2E6DA 4QNEA 2A85A 3LM7A 4IPJA 3Q58A 4HKPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3NA8 A;  2Y61 A;  1OFO A;  1OX4 A;  3TMQ A;  4Y8F A;  4XQ6 A;  3VE9 A;  4HIB A;  3EX4 A;  3TDF A;  4NJJ A;  3O6Y X;  3GIY A;  4MLR A;  4AHQ A;  5C55 A;  5D04 C;  5D33 A;  5CZS A;  1JCN A;  4N02 A;  3PSW A;  2YR1 A;  2YPI A;  2DU2 A;  4WY0 F;  3B0P A;  2DJL A;  5D03 A;  1ZAI A;  4L4M A;  5K9X A;  5E93 A;  1FDJ A;  1VYP X;  1RR2 A;  3SY5 A;  2NUW A;  1K7X A;  3L5A A;  4NT0 A;  3W1P A;  1LLW A;  4GUI A;  2X16 A;  4EOU A;  2Y85 A;  1KBJ A;  1O95 A;  3ATZ A;  3O63 A;  3TAO A;  4A21 A;  1F6K A;  1OFD A;  4S2C A;  3S6D A;  1KFJ A;  5FEX A;  3GAY A;  1S3H A;  5A8G A;  3W87 A;  2NUX A;  1XFB A;  3S5Y A;  3LGE A;  4YCO A;  3HG4 A;  1MEW A;  4IQL A;  4TIM A;  1CX9 A;  1UBS A;  4HNV A;  1OX5 A;  2FIQ A;  3INP A;  5D05 A;  1UB3 A;  2TYS A;  5LHF A;  1AME A;  3P61 A;  4FHA A;  5J5R A;  1QPN A;  5AHF A;  9MSI A;  2A0N A;  1X1Z A;  4XTD A;  1DBT A;  2B7Q A;  1W8S A;  1Z48 A;  2QDH A;  4FX8 A;  4LC6 A;  4UUI A;  2YDA A;  3M5V A;  4DO5 A;  2CLF A;  4PL1 A;  3CQ0 A;  3DU0 A;  3M47 A;  5LNS A;  3GR8 A;  2QKF A;  1VZW A;  4DBD A;  3PY2 A;  5D32 A;  2GQA A;  3GKF A;  3AJX A;  3R5E A;  3UQN A;  1P5B A;  1KDE A;  1JRC A;  3GXP A;  5C5Y A;  2CZ5 A;  1NEY A;  1AG1 O;  4MYX A;  3W23 A;  5AC6 A;  3L5M A;  3QH2 A;  1XL9 A;  1YAD A;  1SW3 A;  3W3O A;  2ZDR A;  2PC4 A;  5LGX A;  2VFI A;  5LNV A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2YL6 A;  4F0M A;  2OO6 A;  4LUS B;  3NVT A;  3ZYZ A;  2Z2B A;  4IIB A;  3GVR A;  4QJ1 A;  2I17 A;  3KS5 A;  1KKO A;  2VEI A;  1L6G A;  1VCV A;  3GBE A;  5JH2 A;  1F7B A;  1TEL A;  1CGY A;  2UV8 G;  4DJF C;  4O1C A;  5AYB A;  4C1N A;  3ENL A;  1CB2 A;  4O1E A;  1E3X A;  2Z29 A;  3TP4 A;  2EXO A;  3EXS A;  3IJ6 A;  1NF7 A;  2CWX A;  3QLL A;  1E6N A;  4JTU A;  2FGL A;  3CIW A;  1QU4 A;  3QHM A;  3ZR5 A;  3MPG A;  2VCA A;  5KMY A;  4C91 A;  4S3B A;  1SJC A;  2V8Z A;  1HJV A;  3GX9 A;  4W84 A;  5E0F A;  2ZID A;  2DT0 A;  4WUI A;  2PE4 A;  1CXL A;  1FCB A;  3B40 A;  3FEM A;  2O92 A;  3TSD A;  3QFW A;  2QCL A;  4IIG A;  4O1A A;  1TQX A;  1TIW A;  1K7E A;  3KWX A;  4LY8 A;  5HAT A;  3THD A;  1QO5 A;  2XVN A;  2AGK A;  8XIM A;  5L9F A;  2GJR A;  3WFZ A;  4IID A;  1D3G A;  3FJN A;  4W8B A;  3IUD A;  2E8Y A;  5AHM A;  3ARW A;  4LCR A;  3WL1 A;  1K1D A;  1KBK A;  1HJX A;  3IJI A;  1BKS A;  4LS0 A;  4PEE A;  1VRX A;  2YCL B;  2ZXQ A;  3K4D A;  4MY9 A;  4HK6 A;  2HBV A;  2V3F A;  3TR2 A;  5A6S A;  2I5I A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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