3TXVA

Crystal structure of a probable tagatose 6 phosphate kinase from sinorhizobium meliloti 1021
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
406
structure length
387
Chain Sequence
RGIPSICSAHPLVIEAAMLRAHREKAPVLIEATCNQVNQDGGYTGMTPEDFTRFVGAIADRIEFPREKILLGGDHLGPNPWKHLPADEAMAKAEAMITAYAKAGFTKLHLDTSMGCAGEPTALPDATTAARAARLAAVAEDAVLPVYIIGTELEVTAPEAAIETVRVHRAAFEEAGAAGAFSRVVGAVVQPGVEFGNENVIAYDRARAEKLSATLGQLHGMVFEAHSTDYQTPDALRELVADGFAILKVGPGLTFALREALYGLDQIAAFLFPAARERTLAEVTEAVMREEPANWAKYYHGSAEEQRLQRHFSYSDRIRYYWPHPKAAAAVDELMSLLDGVAIPETLISQFLAGSYARVRNGEVAPQAKPLALAAVDAVLQDYFAAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a probable tagatose 6 phosphate kinase from Sinorhizobium meliloti 1021
rcsb
molecule keywords Probable tagatose 6-phosphate kinase
molecule tags Transferase
source organism Sinorhizobium meliloti
total genus 138
structure length 387
sequence length 406
ec nomenclature ec 2.7.1.144: Tagatose-6-phosphate kinase.
pdb deposition date 2011-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08013 Tagatose_6_P_K Tagatose 6 phosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.400.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle GI Alpha 1, domain 2-like putative tagatose 6-phosphate kinase domain like 3txvA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3txvA01
1TV7A 2G95A 3W1NA 4LS2A 2YPIA 2Y89A 4JTGA 2VKZG 2R91A 3PG9A 3DU0A 1C8VA 3HQ1A 1GYNA 1YXYA 4ALDA 5G2WA 3TW7A 1V7YA 3W87A 3LBCA 2CLLA 1AMKA 1DVJA 1X7FA 4GUIA 3W70A 4N02A 2E5CA 4O1BA 4N2YA 4PODA 1ML1A 2QJIA 1Y0EA 1YPIA 2WJZA 4UTLA 4EOUA 4RXFA 3R13A 2EF9A 3O07A 4RKAA 3DFNA 1BEUA 1H1YA 4ZQCA 1XBYA 2E5BA 3BG3A 2J9ZA 1WBJA 3G18A 3N2XA 3UQNA 5AC8A 2QJHA 1MEIA 5HMSA 2YYUA 4FEZA 1OHLA 3UPBA 2C3ZA 3A9IA 4K36A 4EVZA 5BMXA 1C29A 1ZHAA 1G7VA 4LVDA 1VQTA 3SGUA 3W86A 1VLIA 1H51A 1M7OA 2VENA 3CLMA 4TO8A 4ZL1A 3G24A 2CFFA 3I7QA 1FQ0A 3FKKA 1Z44A 3GB6A 2BSLA 5L6UA 1MSSA 1GPWA 1FWRA 5CZJA 1FXQA 3BLFA 4WD0A 1OX6A 4O52A 3EKZA 3NA8A 4NJGA 1MEHA 1QO2A 5CZ0A 1X8FA 3C52A 2DJXA 2A0NA 3KRZA 1JUEA 1UB3A 4JD4A 3MP5A 1RR2A 4HPXA 2CLHA 4JICA 3VCRA 2A4AA 4O4VA 1GT8A 1LRQA 5FF3A 4IXHA 3P61A 1K7XA 1XDLA 5AHFA 3V1PA 4PA8A 1OFBA 3G8RA 1KFBA 1P1XA 3O1NA 1VHNA 2JGQA 4IUOA 4UFHA 4ZQPA 4AWTA 4ZQRA 3M43A 1FCBA 4LUJA 2XN0A 2WV8A 5BW6A 3O6CA 1P0NA 4ZZ9A 2Z6JA 1SO3A 3GIYA 3L66A 4HPJA 1DORA 3NPXA 5CPMA 1XM3A 3TDFA 3LTYA 3T4CA 3LHYA 4OWGA 4RZ4A 2QUTA 1SO6A 3CQ0A 3S1XA 2F7FA 3FJLA 5U7SA 3BW2A 4AB4A 5EYWA 3KVJA 3NL6A 1GG1A 4FIRA 3STEA 2FFCA 3STGA 3M7WA 3W7JA 2C15A 1QWGA 4TR9A 1JULA 1EP2A 3FYPA 4GUHA 3GDKA 3L65A 2RH9A 2G96A 1K7EA 1EA0A 3SZ8A 5FESA 1QPRA 3AJXA 2DZWA 5CKSA 3ZS4A 1OX4B 3LI0A 1LROA 1ZFJA 4NQ1A 3S9YA 3LB0A 4AHQA 1MZHA 1OVDA 3PF3A 3WJZA 1WOBA 4M7SA 3N9RA 5K3VA 3SFKA 4LVFA 5CPLA 3A5FA 5FEWA 3G8EA 1OFQA 2YYTA 2A6NA 2Q3OA 1B9BA 2Y88A 5D30A 2QCEA 5FF4A 1L6YA 2OCZA 2Q8ZA 3CM4A 5EMUA 4KWWA 1QCWA 3C8FA 5D33A 4I7VA 2ISWA 3GDRA 3L67A 3QJAA 4BWLC 3NOEA 3G1YA 2Y6ZA 1VHCA 4GC4A 4QIUA 3DENA 1KM3A 2TMDA 3QW4B 1I4NA 2TPSA 3T40A 4NJHA 3UWYA 4FX6M 4K7VA 2CLKA 5CSSA 3N19B 4IMGA 1SFJA 1BKSA 2V5LA 3CTLA 3RLVA 2YW3A 5C55A 2EPHA 5C5YA 4IWWA 2H8ZA 5D03A 4LRSA 4H6KA 1TV5A 2C18A 1M7PA 4PTNA 1IIHA 3BPWA 4O17A 4K7YA 1YLVA 1KM6A 2CZEA 2ZZ3A 3M41A 3MI2A 5D32A 2GVJA 2BLEA 3TX9A 3B04A 5G2HA 4NVTA 3QH2A 3VFLA 4O4WA 4MFDA 3GX9A 2C6QA 1H7OA 1GG0A 3PBYA 2QR6A 5FF2A 3IRDA 1GQNA 3LRMA 3LXBA 2B7PA 4NU7A 1IXQA 4QJ1A 2QAFA 3BW3A 2OZ0A 1TREA 5HJLA 6ALDA 5CSRA 2PURA 1KLYA 4QNEA 3ABRA 3M5XA 3TMLA 3TQKA 2CWNA 1HL2A 3CIWA 3NQ8A 4WJEA 5DY2A 1TPEA 2Z1BA 5D04C 3N2MA 5D02A 5CZSA 3DFTA 1SO5A 4Y96A 3W22A 2VEIA 5DY3A 1GOXA 1K7FA 3CPRA 2A7NA 1EEPA 2VFIA 2W0UA 3TIMA 1H50A 3LTSA 2X1UA 3PY2A 1FWWA 3W85A 1F74A 3HIJA 2ZRZA 2G5WA 2NWRA 4DF2A 4KFNA 2B7OA 2CLFA 1SQ7A 2ZYFA 1A5BA 4K8EA 3G0XA 4H4IA 2FTPA 1TO3A 1SZFA 3B05A 3TNOA 2CZ5A 2VFGA 3TXVA 5DBUA 4DPQA 4LVGA 1NVMA 2YR1A 2QJGA 3W7DA 3LDVA 4JTUA 5KINA 4O53A 2V82A 5CPNA 5F1VA 3P5ZA 4X2RA 4LU0A 3PC0A 4IX2A 3LHWA 2R94A 3W7QA 1J4EA 2YW4A 5AHLA 5AHEA 3TC7A 4CQAA 2RDWA 4BI6A 1YDOA 1X1OA 1EUNA 4MOZA 1LORA 5KZMA 3PBVA 2J24A 3F4WA 2VFDA 4IOTA 5AHIA 3W7MA 3LXAA 4JDYA 3VE7A 5AHMA 2ZZ6A 5LGZA 3LGEA 5DCBA 1KA9F 5DXXA 3H55A 1VPXA 3E96A 4E2BA 3LHZA 3C4UA 3G3DA 3MO7A 4JEQA 1ZCOA 3QSRA 4BK9A 4MZYA 3BK0A 5HR6A 5HWMA 2DZPA 3NZRA 5A8GA 1M6JA 3EWZA 4DBDA 3M44A 2QDGA 3TC6A 1EWDA 4IMFA 3HPZA 3NQCA 3STCA 3IIZA 3T78A 3CC1A 4LTSA 4AVFA 2OT1A 1TPUA 3W1UA 3GAYA 1KM5A 2VFFA 3PSWA 3N73A 5TBOA 1NEYA 2BXVA 1AK5A 3P82A 4I7WA 4MKNA 3OBKA 5HWJA 3TCEA 2Z6IA 3HJZA 3I65A 3VKJA 2A7PA 1C9DA 3BW4A 3THAA 1PIIA 3HO8A 4QQ3A 1SW0A 2ABAA 2G97A 3EX1A 3LCXA 4MFEA 4UMAA 2KZHA 4WY0A 4RZ5A 1BTMA 3UZ5A 4BWLA 3S1VA 4YMZA 2JK2A 4UTWC 1IXNA 4S1FA 3QQ1A 4RX0A 2B7QA 2BWGA 4LC6A 1Q45A 3IVTA 5DLCA 4XWUA 2A5HA 2VOMA 3GR7A 3QPZA 1LP6A 3W73A 3LBMA 5F2GA 4AMAA 3RFAA 3W7NA 3QM3A 3MYPA 5IBXA 4A2SA 1LLZA 1W5QA 1HG3A 3QEZA 3UXDA 3EXSA 2JKEA 1AW1A 4MYAA 3O06A 4O28A 1R2RA 3GXNA 2JKAA 1VRDA 2I9EA 3OVPA 1QDSA 3ZR4A 5KZDA 4A29A 1O4UA 1SZEA 4UTIA 3QRHA 1N8FA 3NM1A 3PUDA 5H91A 3CWNA 1HUVA 1KV5A 1DKWA 1H62A 4UIOA 1R2SA 4AHPA 2VFEA 3H53A 3QQ0A 2WO5A 3LERA 3C2EA 4M6QA 4HSOA 1RV8A 4MVAA 2A21A 1W31A 4LVBA 3W7HA 3B4UA 3FS2A 1B4EA 2C1HA 2FLIA 5AFDA 5EKYA 2FPVA 1D3GA 4Z1BA 1GZGA 1ZY9A 3LTPA 1QOQA 2NUYA 5I3IA 3TU9A 1FWNA 2FQIA 3GNNA 5F4SA 4LVAA 5FI8A 5D05A 1HO1A 3B06A 4IXXA 3GZ3A 3W23A 4ZQOA 2E5DA 3DZ1A 2E6FA 2CW6A 2HS8A 1ICPA 3PBWA 4JIQA 2Y61A 3MUXA 4RZ6A 1RPXA 3G1AA 2QCHA 1T99A 4YCPA 1W1ZA 4FX7A 4ML9A 4LRTA 2YZRA 3U6WA 3DH7A 1B3OA 3U8GA 5HR7A 1SUXA 3NVTA 4IQLA 1OF8A 4FNUA 5D09A 3NQGA 3NO5A 1S5WA 2ZZ1A 1VCGA 4ORIA 5LNRA 3QC3A 4BI5A 2ZDRA 1AW5A 1DHPA 5D2VA 4JY9A 1GVOA 3NM3A 4OBTA 1RVGA 3P5YA 4JXCA 2O7QA 3HPXA 2C13A 4QSHA 3G1XA 5I3HA 2H8XA 3CT7A 3L5MA 3QFEA 3EB2A 5IM51 1S5VA 2WSYA 1P5BA 4EF9A 2PCQA 4HNVA 3FJ6A 2J6XA 2PE4A 3OVRA 3O15A 4UMBA 4NJKA 3DAQA 4KFPA 1VYRA 5I3KA 2QCLA 4R34A 5EY5A 4XBSA 5BNKA 5HINA 5C2XA 3W1AA 1YYAA 1K8XA 5DELA 3N3MA 4QAIA 2E68A 1JRCA 2HS6A 3R12A 4RV8A 5K9DA 3ABOA 3NL5A 3R5EA 4C1KA 4GE8A 3IIVA 1QPQA 5DN1A 1VYPX 5LNWA 4GWEA 1LOLA 3P67A 5E93A 3UWVA 2ABBA 1JCXA 4FF7A 5H2ZA 4P61A 1VH7A 2EGZA 4UTUA 3PB2A 3EXTA 2QAPA 4GNJA 3I7SA 4GRSA 3PUEA 2HMCA 1KFKA 5K9XA 1KBJA 1NSJA 4GXMA 4YL2A 3M5ZA 3HB9A 3A22A 1O95A 3FA5A 2X16A 5HNRA 4YXGA 4CLMA 3IGUA 4JIPA 3LCGA 2QCMA 1KM0A 1Q6LA 1OABA 1UUMA 3MI6A 4G1KA 3UYCA 3LCHA 4OV4A 3GAKA 2JBMA 4XBKA 2NXGA 3F1QA 1Q6RA 5LZLA 2V81A 4JTFA 3TJXA 4Y90A 5DCDA 5AYYA 3M16A 3IEBA 1QOPA 2P10A 4ONVA 1GYLA 4FNPA 2Y70A 3EWYA 3C0JA 1NAL1 3P74A 2NWSA 4JTEA 1TQJA 3NPWA 4FO4A 4GFSA 1PCKA 2H90A 3W7CA 1OX4A 3W7GA 3WFAA 4CCDA 2DJLA 4UTWA 4EWND 4NJIA 4KFOA 1JR1A 4U4MA 1KM4A 4IJBA 1A5AA 1UJPA 2E77A 2RHGA 3YPIA 4LWWA 3AO0A 2H3DA 1G4EA 4JYDA 2ATSA 1W37A 3W2NA 2AGKA 3NQVA 1SW3A 4Q32A 1E51A 2WPBA 1LYXA 2ZA1A 4HSNA 4OV9A 2GUUA 2Y7FA 2AAMA 4CQ8A 4EF8A 1R47A 3EWUA 2TRSA 1W0MA 4O1AA 3FKRA 1KBIA 3UNDA 2RFGA 3HGSA 2J88A 1VCVA 2PRLA 1HTIA 1SU5A 4Q4KA 4R53A 4Z1DA 1K03A 2DP3A 3TV8A 3C56A 3KVKA 2YXGA 3NYZA 4JR5A 4NJJA 2NLIA 3FOKA 3BGJA 5LGXA 1IXPA 3MHUA 3FFSA 3PB0A 2AQWA 3O6YX 1NF0A 3NEVA 2C0AA 4UTMA 2FPYA 3A5VA 2B7NA 4FXSA 3W9ZA 1J2WA 1YTKA 1MO0A 1GVSA 1B57A 1ME7A 3DFOA 3WJXA 1I45A 3GR8A 3QYQA 2NX9A 1TPFA 4OHQA 5D38A 3TUUA 4D2JA 1ADOA 3RNDA 4MLJA 3P62A 4LT9A 4AF0B 4JTLA 4WXZA 2QKFA 3LCLA 3P81A 4NNCA 3GXPA 3G1DA 2CZFA 1JRBA 4JTHA 3L5LA 1G6CA 4MLRA 3DKJA 4HHPA 1L2UA 3G1FA 3W2KA 3THQA 1OFRA 1LBFA 4JTIA 4OQVA 4LS0A 4AEOA 2V2DA 3TE9A 4X3ZA 3G0SA 2DZSA 4W9TA 1G7UA 3SR7A 1KTCA 2DORA 3UPWA 3STFA 5TQLA 1KTNA 4PFMA 4UFIA 4WQ6A 2OMAA 2QDHA 3MJYA 2ZZ5A 4JX5A 4GJ1A 3KAOA 5SWUA 4IPIA 1BWKA 3GNDA 5AHNA 2A1YA 2OT0A 3QSTA 4RR4A 3OA3A 1FDJA 3GLCA 1JQVA 3L21A 3KRSA 3SGZA 2LLEA 1XXXA 2V5BA 5IBXC 3G1HA 4ADSA 1OYBA 4NUWA 5D37A 2C19A 3C2VA 3C61A 1GTEA 3W84A 3DHDA 1TRIA 3NQAA 4AWUA 1WA3A 2E6YA 3P60A 3NQFA 4L4LA 3W1TA 5LNVA 2X1TA 4PC8A 1OFAA 1DBTA 1HO4A 1SSDA 1LLWA 2NX3A 3R2GA 3EEGA 2C16A 4O16A 2A6LA 2ZZ7A 1ZNNA 4OE7A 4IGHA 3MHFA 3GDTA 3P84A 1AG1O 3JR2A 1YDVA 3W7OA 1Z48A 2VEPA 4UFMA 2Y7DA 4Z0JA 4LC8A 3SIZA 4DBEA 4LOCA 1I2RA 3RU6A 1TIMA 4CNPA 4ADUA 4N6FA 1OFOA 3W6YA 3L2IA 3E9AA 4LW7A 1PHWA 1I2PA 3Q2DA 3I7RA 4O1CA 3HG3A 5I3JA 5D2WA 5F1UA 1YDNA 1DQXA 4M19A 1PVNA 2CZDA 3HGOA 4ZVJA 1U5JA 4FNQA 1SO4A 1I2OA 3BG9A 4I9AA 4PL1A 2WSQA 3UWUA 2OX1A 3INPA 3KHJA 1WQ5A 2RKXA 2A2IA 3L5AA 1FWTA 3DBPA 2J27A 2X1SA 2ZTKA 5T26A 1TYGA 3DI0A 3IIPA 3TAKA 1WAUA 3Q58A 1FDZA 3L0KA 4LV9A 1QPOA 5I3GA 4UFJA 3EX6A 4N4PA 4CCEA 2I1OA 2W6RA 3UXAA 4HNNA 1F6PA 2WSRA 5FEPA 3P8JA 1LTDA 4UCGA 3W7IA 3HMJG 3RLUA 4JX4A 4O11A 2GOUA 3FEMA 3UWQA 3QMRA 1YPFA 3S42A 3E0IA 4FIQA 3HG2A 3IGSA 3A23A 4IPJA 2XFWA 3EXRA 3QMTA 5LKYA 1G67A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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