3TXVA

Crystal structure of a probable tagatose 6 phosphate kinase from sinorhizobium meliloti 1021
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
406
structure length
387
Chain Sequence
RGIPSICSAHPLVIEAAMLRAHREKAPVLIEATCNQVNQDGGYTGMTPEDFTRFVGAIADRIEFPREKILLGGDHLGPNPWKHLPADEAMAKAEAMITAYAKAGFTKLHLDTSMGCAGEPTALPDATTAARAARLAAVAEDAVLPVYIIGTELEVTAPEAAIETVRVHRAAFEEAGAAGAFSRVVGAVVQPGVEFGNENVIAYDRARAEKLSATLGQLHGMVFEAHSTDYQTPDALRELVADGFAILKVGPGLTFALREALYGLDQIAAFLFPAARERTLAEVTEAVMREEPANWAKYYHGSAEEQRLQRHFSYSDRIRYYWPHPKAAAAVDELMSLLDGVAIPETLISQFLAGSYARVRNGEVAPQAKPLALAAVDAVLQDYFAAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Sinorhizobium meliloti
publication title Crystal structure of a probable tagatose 6 phosphate kinase from Sinorhizobium meliloti 1021
rcsb
molecule keywords Probable tagatose 6-phosphate kinase
total genus 138
structure length 387
sequence length 406
ec nomenclature ec 2.7.1.144: Tagatose-6-phosphate kinase.
pdb deposition date 2011-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08013 Tagatose_6_P_K Tagatose 6 phosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.400.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle GI Alpha 1, domain 2-like putative tagatose 6-phosphate kinase domain like 3txvA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3txvA01
1N7KA 3TNOA 3W1XA 4FIRA 4LT9A 3VE7A 1FQ0A 2FIQA 5D2XA 4FB7A 1H60A 3LI1A 2ZZ3A 4N9BA 3HGSA 3M5XA 3NZ1A 3C2OA 3EX6A 4H3DA 3G0SA 4JTUA 4UNKA 5AYZA 3BG9A 4K38A 4K7VA 2WO5A 4C1KA 1UBSA 3EEGA 1SW7A 1PHQA 3ATZA 5D2WA 4O1BA 2YW4A 3N2XA 4RCXA 5I3FA 2QR6A 1NSJA 3TX9A 2WNQA 3UXDA 1OHLA 5CKSA 1RV8A 1HTIA 4Z0SA 2PRLA 4UTLA 2ZRWA 4Z1CA 3W1LA 1K8YA 4FNPA 2X2GA 4E0CA 2YFOA 3RF9A 4ADTA 2OMAA 2VFGA 1JCMP 3LLFA 5F2GA 1L6YA 3T7VA 4QQ3A 4IX0A 3W86A 1EIXA 1FCBA 5FI8A 4N9CA 5F2IA 4XWUA 1I4NA 3C2EA 2A2IA 3OG3A 2VFDA 3WJSA 3NQAA 4XTIA 1UUMA 3GR8A 5T26A 4QNEA 3V75A 3G1XA 1TB3A 5DCBA 4UTWC 4NQ1A 1PE1A 2I1OA 1PHWA 3G1DA 2XFWA 4O13A 4QITA 6TIMA 4CQ8A 4JXCA 4O8RA 2QCLA 1KV5A 1FWSA 3GK0A 3MW7A 1GG0A 1HO4A 3W84A 4UTTC 2J9YA 4TIMA 3R13A 1N55A 1QO2A 3Q2DA 1YADA 1GQNA 1ICPA 1JCXA 2NUYA 4MZYA 5AHFA 3BW4A 2VENA 4AAJA 5AYXA 4DBEA 3M44A 1IXQA 2Y7FA 3LBMA 1B4KA 1QAPA 1TMHA 1TPUA 3QC3A 4EF9A 2CZFA 4M7SA 3OVPA 2FPTA 3I7RA 3MYOA 3G22A 5A5WA 2Y7GA 1EP1A 1OK6A 2YYUA 1PS9A 1Z41A 1R46A 5K4ZA 2GVGA 1DV7A 4MPQA 1TYGA 2EF9A 3DFTA 5IBXA 2QCNA 4NUWA 1GYLA 1SR9A 3R12A 4Z1BA 3LCIA 4JTLA 1LLWA 2TPSA 1PVNA 3M6YA 3BLFA 1O94A 2E6YA 5TBOA 3LERA 5HUOA 4UTHA 3MBDA 3QFEA 1FWTA 1FY6A 3W2UA 4MYAA 1TSIA 3F4NA 3PVFA 4OT7A 3EWZA 1ZALA 5LNWA 3PG8A 3M5YA 2BWGA 3W7JA 5AYYA 3MBFA 4AEOA 2DJLA 2FDSA 3CB8A 4ZMGA 1KA9F 1Q6LA 4K37A 3W88A 2WSRA 4JX6A 1EEPA 3PSWA 2A4AA 1GOXA 3LHWA 4LWWA 4GE8A 4XUGA 3THAA 3GB6A 3W2MA 1F6PA 1Z48A 4OWGA 3W7KA 4YLWA 3W74A 1ZAHA 3BLEA 2FTPA 5HWJA 1SSDA 4AWSA 2E5BA 2TRSA 1LLZA 5K7JA 1TPFA 2BX7A 3ZFHA 1K7EA 1KM6A 2OT1A 3HGJA 4KWVA 1AG1O 2FB2A 2Y61A 4LS1A 2EPHA 4PL1A 3SECA 4YXGA 1IXNA 4WJEA 3L68A 1L6SA 5LGZA 3BGGA 4DO4A 2P0OA 3CHVA 1IGSA 3EX2A 2NX9A 3O6CA 2YFNA 2B7NA 4UXDA 2WPBA 2CLLA 5HR7A 1F7BA 4U4MA 4GUJA 1XBXA 3GXPA 1KTNA 4JY9A 4GUIA 2QDHA 3W7DA 3MP5A 5KMYA 4K39A 4DF0A 1TV8A 1TV7A 3TC7A 3QH2A 3R89A 1I2QA 4HNVA 2DZVA 3HPZA 4IWWA 3W1TA 1YTEA 3DHDA 4UTMA 2YPIA 5U7SA 5I3KA 4FO4A 5CPOA 4M6VA 1XI3A 4LVBA 3W7QA 1K02A 3LDVA 3CLMA 2C0AA 3RMJA 4O14A 4O50A 2V8ZA 4UC5A 4XTDA 3LXAA 2KZHA 1AMKA 2GQ9A 4AXKA 3S9YA 2CLEA 1YXYA 4MKNA 1HFBA 1U83A 1ICSA 4JDYA 3HPXA 4PA8A 4I7VA 4I7WA 2DU2A 4IPIA 4A2SA 3FIGA 3PBWA 1SUXA 3NG3A 2EGZA 2X1SA 3GX9A 2QAPA 4BK9A 4E2DA 4HN4A 3W7OA 1B9BA 3TR2A 1TTIA 2Z1BA 1SQ7A 3FFSA 3B8DA 4ZVJA 1WQ5A 2BXVA 3FLUA 5CZ0A 1H7NA 3W71A 5AOUA 5D32A 2VKZG 4GUFA 4TR9A 4JY8A 3M41A 4O1DA 3CEUA 4PODA 3IEBA 2UV8G 2DZUA 1WOBA 4X2RA 4WX2A 4FNQA 3H55A 5KSWA 3LHVA 2NXHA 4Y90A 3NQGA 3TSBA 3B0VC 4M6PA 3SR7A 3E49A 3EXRA 1JRBA 3OA3A 1SZEA 1GVOA 1G7UA 3LTPA 2WOQA 1G67A 5KTLA 1YPFA 3EWWA 4AF0A 1TRDA 4GUHA 4MZ1A 4BI5A 2H6RA 1GEQA 1GVFA 1KFBA 2C1HA 3P5YA 1OFEA 4O0ZA 4HHPA 1QCWA 3TAOA 4PH6A 5HULA 5K9CA 5CPMA 4A29A 3G24A 1VJIA 3KFTA 2ZTJA 1EPXA 1RQHA 5F1UA 4M6QA 5HWMA 4JD4A 1P0NA 1N8FA 2H3DA 1ZAJA 3I6RA 4O52A 4ICNA 4RXFA 3GR7A 3G1YA 3EKZA 1OJXA 1W3TA 2LLEA 3MYPA 4HKPA 3RLVA 1FDZA 2QAFA 4IMFA 3M16A 3QMTA 3L5LA 4DXVA 4IMEA 4FHAA 3IVTA 4DQWA 1W0MA 1QDSA 5H91A 3TXZA 5DELA 5D33A 1VPXA 1VYPX 1TTQA 1VZWA 1LOQA 5LHEA 5CZJA 1LBMA 1JJKA 3GZ3A 4X9SA 4EF8A 1WV2A 5LNSA 1O4UA 2RKXA 5CG7A 1F2JA 1OVDA 3O06A 1D3HA 3VKJA 3NQ8A 1LRNA 1W54A 5E1QA 1YXDA 2C15A 4LNYA 3ZR4A 3ABQA 3NR0A 4HPXA 4R53A 1PL9A 2A7RA 4W9TA 5F2LA 3PUOA 1VRDA 3K30A 1Q6QA 5FEPA 2DJXA 2DZPA 4MY1A 2HTMA 5TQLA 3W1AA 4IUOA 1TRIA 2VEIA 5D2TA 5I3HA 4AMAA 3LHZA 1LYXA 1JCLA 4UTKA 2QJGA 4YL2A 3S5YA 5KZMA 1DOSA 2DZWA 3W73A 4ML9A 1OFQA 4JS3A 5AHLA 3WK1A 3TXVA 3DU0A 3M47A 5AC8A 2O7QA 3PG9A 1QOQA 1DL3A 3H54A 3L5MA 3FA5A 5C2XA 3CWOX 4O57A 3W87A 5D02A 1VCGA 1W5MA 5DBUA 1FDYA 1OFPA 3PB0A 3FS2A 3L0KA 4JNMA 5AC6A 4YCPA 3TC6A 2FJKA 4UFHA 3MP3A 1S3HA 3W7GA 4UFIA 1VYSX 4O0KA 3G1VA 1LTDA 4L4LA 3IVUA 4YCOA 4LY8A 1KLZA 1QPOA 4ADSA 1UASA 2CZEA 2Y85A 3UY7A 1Q45A 3N2MA 3A24A 2ZQ0A 1P4CA 3TAKA 2J88A 1R47A 4MFEA 1OX4A 3FOKA 1UCWA 1SFLA 1TJPA 1OX4B 2NX1A 3WJWA 5LKYA 2V2CA 2ATMA 3G1SA 3C8FA 3HJZA 1XM3A 3C2VA 2TSYA 5CGQA 4GWEA 2ZZ6A 4ALDA 3MUXA 2FPVA 3IGSA 3W85A 1VCFA 1LZOA 4Z1AA 1XBZA 2ZZ1A 4MLRA 1D9EA 3M7WA 4EIVA 1H1YA 1RPXA 3W76A 3CU2A 1ML1A 1FUYA 2IQTA 4JEQA 4HNNA 4A21A 3QJAA 1OABA 2ZZ2A 1I45A 4N4QA 3IV3A 4FNUA 5DN1A 2WNZA 3HMJG 3CT7A 1W5OA 5HUPA 1XDLA 3UWUA 1RQBA 1SW0A 3PAJA 2RH9A 4QAIA 1JULA 4EWND 1A5CA 4NJKA 1J4EA 4LVFA 3EWUA 3A22A 4OU1A 2E1DA 3Q37A 1FWNA 2CLMA 1MO0A 3MI3A 1JQXA 2JBMA 4DPQA 2QUUA 1XC4A 1H5YA 4WD0A 2Y62A 5J5DA 2J27A 1G4EA 3LCXA 4XKYB 1Q3NA 3T40A 3QYQA 4LC8A 4WY0F 2Q3RA 4I7UA 5CZTA 2A6NA 3O8AA 2ZZ7A 2YZRA 3NL3A 4OHQA 3IIXA 3VNDA 1OK4A 1HUVA 3PY2A 3Q58A 1MEIA 1KTBA 5G5IA 4JR5A 4JTSA 4NJJA 1TCDA 1WX0A 3D0CA 2QCEA 1TO3A 4RLIA 5HWNA 3CEPA 4JX4A 3HG4A 5GVJA 4QJ1A 1ALDA 1DJQA 5D38A 3TQ0A 3UQNA 2GVLA 3L21A 4Z08A 4IXXA 4JTFA 1GVQA 3ABRA 3NDOA 5DLCA 3NPWA 1YPIA 4NZFA 1NVMA 3A23A 4AHOA 1B3OA 1IIHA 4WQ6A 1XFBA 3UWYA 2WJZA 3O6DA 3DI1A 5HQEA 1KM5A 2RFGA 3GAYA 3S0CA 2ISVA 1DBTA 1A53A 3NQFA 3TQVA 1MEHA 2X1TA 3S1XA 4Q4KA 3M5ZA 1G7VA 1MSSA 1U5JA 3TMLA 3GDMA 3C4UA 1WDWA 3WJYA 2J9ZA 4X3ZA 1H61A 4PFMA 3G0XA 4AHQA 1H7XA 3BG3A 1XXXA 3BVJA 3MHGA 4CNOA 3O6YX 4RZ5A 5BRBA 1G4SA 3OIXA 1JCNA 3TK7A 4NXKA 3L67A 5LZLA 5F4XA 6ALDA 4N6EA 2I14A 2Z6IA 1RR2A 2CW6A 2JKAA 3M1ZA 1ZHAA 2NUXA 4H6KA 2ABBA 4QSHA 4AH7A 1KM0A 2A1YA 5AHNA 3FJLA 1KFJA 1SW3A 4FEZA 4IXHA 5F2MA 1EP2A 4FX7A 4MFDA 1M7PA 1JUKA 3HO8A 2A6LA 3KRZA 2VFIA 1TTJA 1WYIA 2OX1A 3HGRA 3HQ1A 4XBSA 3QF0A 1QWGA 3IVSA 3RNDA 2NWRA 2QUTA 4FXSA 3TMQA 2Z2UA 4O1CA 4A22A 3MP4A 1AK5A 4DF1A 2A7PA 4TMBA 1G69A 1ME7A 1QPQA 1ME9A 2C13A 2TMDA 1VS1A 5D30A 5EL1A 3LM7A 3S1VA 3VFLA 4UFMA 1KV8A 3W1RA 4D2JA 3G1FA 4NX0A 3UWWA 5DY3A 4UTWA 1ZAIA 2QJIA 4ORIA 4RXGA 1S5VA 3KRUA 4KFPA 3W1UA 3C6CA 3OVRA 3W22A 1UJPA 1OYCA 5EBUA 5D04C 1TREA 1HO1A 2CLHA 3EXSA 3PULA 2BLEA 4OGZA 1I2OA 1H1ZA 3ELFA 3PC0A 1MZHA 3RK8A 4Z0JA 3LRKA 4IOTA 4CCDA 3F03K 5BW6A 1QFEA 1TPC1 4IQLA 5G2HA 2NV2A 5DBTA 1W5PA 4C1LA 1F76A 1EB3A 1X6UA 3C2RA 3NYZA 3OBKA 4LS2A 1DQXA 2NUWA 3GDLA 4IMCA 4RV8A 4GRSA 4TU1A 2PE4A 4JTIA 3PWAA 5DXXA 1SZGA 2WV8A 3NQDA 4KFOA 3ANYA 3LX9A 2JKEA 3VI2A 2OJPA 4WZHA 2WSQA 1BEUA 4MLJA 3PUEA 4MJMA 4IPJA 3DXIA 3LCWA 4IMDA 1KBJA 1ONRA 4PC8A 2NX3A 3G0UA 4LU0A 2QCHA 5G4WA 3W83A 4ORMA 2C19A 1SPQA 1LP6A 1BTMA 1LBLA 3JS3A 1SU5A 3ATYA 3GDTA 1X1ZA 7TIMA 1ZNNA 3E02A 3EXTA 2R91A 1EP3A 4FX8A 4JIQA 4XBKA 5FF7A 1CI1A 3N73A 5EMUA 3USBA 5EYWA 3KXQA 1YDNA 3G18A 2HS8A 4WY0B 3DFPA 4EOUA 1H7OA 1XBYA 3O07A 4S2BA 3W7LA 3KX6A 5BOOA 4BWLA 4UFJA 1Y0EA 2GJNA 1KM4A 2GUUA 3PBUA 3AJXA 4R33A 1L9WA 4P61A 3EWBX 3M9YA 3L5AA 1OYAA 2E5CA 2JKPA 2BSLA 3SZ8A 3TSDA 3IRDA 1FCUA 1NF0A 4N2YA 3DZ1A 2R94A 2V5BA 4JYEA 1K7XA 3DFNA 4J9JA 4IMGA 3W07A 3N9SA 2G95A 3THQA 1V7YA 2EKCA 3WJZA 4I9AA 4JICA 3QSTA 2W6RA 4U28A 4UFKA 4YWIA 3W1QA 3LLDA 1LOLA 4LRTA 3U6WA 4DPPA 4FNRA 3DI0A 1Z42A 4O19A 1BWLA 4UMBA 2ZRUA 3HPSA 1KW1A 4UTUA 3NQVA 3R8RA 3NL2A 3O16A 3U2OA 3NQ2A 3BGJA 4CNPA 3Q94A 5C6MA 3EX1A 5DY2A 4HIBA 8TIMA 1TV5A 4DO5A 2B7PA 3SY5A 4O4VA 4OQVA 4RR4A 1ZY9A 2QCFA 3L0NA 2DZSA 3VE9A 4NVTA 4MY9A 5C55A 3F1QA 2NV1A 1WA3A 3GVGA 3MMTA 5AHIA 5LNRA 2QCCA 1JR1A 3PS7A 2XN1A 1DVJA 3CM4A 3O05A 5D2YA 3W7MA 3M0ZA 2Z6JA 2F84A 3NPXA 4R34A 2QDGA 2PRMA 2WKJA 3M43A 3P62A 1F6KA 3W7EA 1OFRA 4DELA 3BW3A 5K4XA 3PF3A 1JVNA 1T0OA 4IJBA 1W5NA 3W75A 4ONVA 1M7OA 4UCGA 5DCDA 5KITA 2B4GA 4LC6A 1QPNA 1X8FA 4MZ8A 3NL5A 3LCLA 4PL2A 1KFCA 1GVRA 3LTSA 3P7YA 4IGHA 1FDJA 3B4UA 2E6DA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1N7K A;  4R85 A;  1OBA A;  3WEM A;  3TNO A;  4EK7 A;  3C7K A;  4AIO A;  3PZI A;  1UIO A;  3D47 A;  1FQ0 A;  2GGG A;  4QG9 A;  2CBI A;  3G0S A;  3FHQ A;  1AS3 A;  3BMV A;  5AYZ A;  2PA6 A;  4K7V A;  1SW7 A;  2VCC A;  3JUG A;  1EOM A;  1LL7 A;  2YW4 A;  4WKH A;  4RCX A;  3GFZ A;  5JBF A;  3RR1 A;  3SCR A;  1TX0 A;  1J0K A;  1XYC A;  1Q4N X;  2VVS A;  4Q22 A;  2JIW A;  1HTI A;  4UTL A;  4FNP A;  4GXP A;  4Y9P A;  4OTK A;  2X2G A;  3BE7 A;  4LB4 A;  2YFO A;  3BCJ A;  3RF9 A;  2VFG A;  3QPE A;  1A4M A;  3R7M A;  1L6Y A;  3T7V A;  1E0U A;  4QQ3 A;  2OU4 A;  1GOW A;  1XRV A;  3PZV A;  4CVW A;  1K70 A;  4XWU A;  3DEQ A;  1ZCB A;  2VFD A;  4X2P A;  3NQA A;  2PGR A;  2INE A;  3UEQ A;  2NVD A;  1TB3 A;  5DCB A;  4UTW C;  3MAA C;  3UA3 A;  1PE1 A;  2I1O A;  3AS0 A;  4W93 A;  3U4A A;  1WZL A;  2XFW A;  3M0V A;  3MZ2 A;  4ROP A;  3RJX A;  1QI2 A;  1X96 A;  2PWU A;  3CQI A;  4JXC A;  4CU8 A;  1MQQ A;  1FWS A;  3GK0 A;  3MW7 A;  1GG0 A;  2DT3 A;  2J9Y A;  4AZC A;  1KRM A;  1KD0 A;  3THU A;  3SBF A;  1YAD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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