4G7EA

Crystal structure of pigeon pea urease
Total Genus 283
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
283
sequence length
840
structure length
831
Chain Sequence
MKLSPREIEKLGLHNAGYLAQKRLARGLRLNYTEAVALIATQIMEFVRDGDKTVAQLMSIGRELLGRRQVLPAVPKLVESVQVEATFPDGTELVTIHDPIACENGNLELALLGSFLPVPSLDKFTANDEIPGEIIVVGGNLVLNDGRKAVILKVVNNGDRPVQVGSHYHFIELNPYLTFDRRKAYGMRLNIAAGNASRFEPGEMKEVLLVSIGGNKVIRGGNAIADGPVNASNCIAAMQAVITRGFGHVEEANAAEGQTGEDASCPFTTVISREEYANKYGPTTGDKIRLGDTALFAEIEKDFAIYGDECTFGGGKVIRDGMGQSCGHPPALSLDTVITNAVIIDYSGIIKADIGIKDGLIHSIGKSGNPDVMDGVFQNMTTGVNTEVIAGEGLIVTAGAIDCHVHYICPQLVYEAVTSGITTLVGGGTGPTAGTRATTCTPAPIQMKLMLQSTDDLPLNFGFTGKGNCAKPDELHEIIKAGAMGLLHEDWGTTPAAIDSCLTIAEQYDIQVNIHTDTLNESGFVEHTIAAFKGRTIHTYHSEGAGGGHAPDIIKVCGEKNVLPSSTNPTRPLTSNTIDEHVDMLMVHHLDANIAEDVAFSASRIREATIAAEDILHDMGAISIISSDSQAMGRIGEVISRTWQTADKMKSARGPLQANDNFRIKRYVAKYTINPAIANGFSQYVGSVEVGKLADLVMWKPSFFGAKPEMVIKGGEVAYANMGDPNASIPTPEPVKMRPMYGALGKAGGALSIAFVSKAALDQRVKVLYGLNKRVEAVSNVRKLTKLDMKLNDALPAITVDPDSYTVTADGVVLTCFVATTVPLSRNYFIF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural and functional studies on urease from pigeon pea (Cajanus cajan)
pubmed doi rcsb
molecule keywords urease
molecule tags Hydrolase
total genus 283
structure length 831
sequence length 840
ec nomenclature ec 3.5.1.5: Urease.
pdb deposition date 2012-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00449 Urease_alpha Urease alpha-subunit, N-terminal domain
A PF00547 Urease_gamma Urease, gamma subunit
A PF00699 Urease_beta Urease beta subunit
A PF01979 Amidohydro_1 Amidohydrolase family
A PF18473 Urease_linker Urease subunit beta-alpha linker domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.150.10 Mainly Beta Ribbon Urease, subunit B Urease, beta subunit 4g7eA03
2.30.40.10 Mainly Beta Roll Urease, subunit C; domain 1 Urease, subunit C, domain 1 4g7eA02
3.20.20.140 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Metal-dependent hydrolases 4g7eA04
3.30.280.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Urease; subunit A Urease, gamma-like subunit 4g7eA01
4DIAA 3MJMA 2ANUA 4LAKA 2FVMA 3PAOA 1KCXA 1K70A 1EJSB 1FWFA 2WJFA 3MSRA 3AU6A 1I0DA 3F2CA 2VUNA 4C6DA 1DPMA 5G4HB 4IFKA 4V1YA 1GKRA 3NEHA 2O4MA 3OQEA 4KEUA 3URQA 3LY0A 4CQBA 4WVXA 1KRBB 3SO7A 4PCPA 3QGAA 1UBPC 1ITQA 2DVXA 2Y1HA 1EJRA 4EPDC 2AQVA 2GWGA 1A5MA 2BB0A 1FWAA 3FDGA 4H00A 4C6PA 1RA0A 4EPDB 2OOFA 3MTWA 2FVHA 1YNYA 2YXOA 3IACA 4RDZA 4G7EB 1P6CA 4C6IA 2R1KA 4LCSA 1EJVA 1M65A 4UBPC 4F0SA 1EJTC 1EJSA 1PTAA 1P1MA 3N2CA 1K6WA 3A3XA 3F2DA 4JOMA 1HZYA 4H9YA 3QGKA 3S2NA 3MPGA 1GKQA 4V1XA 4GOAA 3F4DA 4EP8B 1EJWC 5FSDC 1PB0A 4CEXB 4LFYA 1KRBA 2FVKA 3LGDA 4C6CA 3OU8A 4HA0A 2A3LA 4I6KA 4QS6A 3AUOA 4LEFA 3MVIA 4C6KA 4RDVA 4EPDA 4L6DA 1FWIC 2PUZA 1RA5A 1UIPA 3F4CA 3TN5A 3GIPA 3LNPA 4H01A 4CQCA 2OB3A 2QS8A 5HMFA 3LS9A 4GZ7A 3RCMA 1R9XA 4FURA 1EJTA 1FWDC 4XAFA 4CNSA 4DLMA 2G3FA 2OODA 4QTGA 3RN6A 2WJEA 1FWDB 3FDKA 3WZ0E 1EJWA 1V7AA 2Z24A 5FSDA 5AKQA 3S2MA 2I9UA 4M51A 4XAYA 4H9TA 2DVTA 1E9ZB 1S3TC 3GRIA 3LU2A 1VFLA 4C6QA 3CAKA 2AMXA 2VC7A 2ADAA 4XAGA 2WM1A 2OGJA 1FWIA 2D2JA 4LANA 3RYSA 1FWFB 3CJPA 1R9YA 3HPAA 4C6BA 4PBEA 1FKXA 3IV8A 1FWCC 4KIRA 4C60A 1FWDA 1EZ2A 3K2GA 1EJRB 3ISIX 3PNUA 1FWAB 3NQBA 3ITCA 1NDZA 3E74A 1E9ZA 3HTWA 5HMEA 3R0DA 1RJPA 3MVTA 1YIXA 1FKWA 1S3TA 1EF2C 1EJVB 1GKPA 2Z29A 3AU2A 3B0YA 4LCQA 1PO9A 3EGJA 2E25A 2ICSA 3LA4A 4DZIA 3UBPC 4R88A 1IE7C 4WHBA 4GBDA 3GTXA 5CH9A 4B90A 4LH8A 4AC7C 1POKA 2R1PA 1RK6A 1FWCA 1ITUA 4RDWA 1FWHC 1J79A 4CNTA 3IGHX 2F6KA 2IMRA 4F0RA 4NP7A 3O7UA 3S4TA 1UBPB 1YRRA 4ERAA 4C6NA 4ICMA 4H9VA 2Q01A 1ZZMA 1XWYA 1RJQA 4QS5A 1BF6A 4QROA 4I6VA 3NURA 4LAOA 3E0FA 1YBQA 3TNBA 2FFIA 1EF2A 1O12A 4LAMA 4KQNA 2CZVA 4UBPB 3GU1A 1EJXC 4F0LA 1EJTB 4CEUC 1O5RA 4G2DA 4ZSTA 3G77A 1WXYA 4HK5A 2VHLA 3LGGA 3GG7A 2Z2BA 3UBPA 4PBFA 1FWEC 1IE7A 1NDWA 3GU9A 4HJWA 4TQTA 1EJWB 3V7PA 4AC7A 5FSDB 1A5NC 2FTYA 4KEZA 2KAUC 1A5LC 2PGRA 2I5GA 1UBPA 1M68A 2Z27A 4DO7A 4OFCA 2GSEA 3PNZA 3MDUA 3SFWA 2Z25A 1V79A 1KRAC 1V4YA 3K5XA 4INFA 2W9MA 1XRTA 1A5OC 4C6OA 1FWIB 2Q09A 4H9MA 1KRAB 3QY8A 2UBPC 1EYWA 3GIQA 3OJGA 4UB9A 4CNUA 4UBPA 1A4LA 5LXXA 3LSBA 3E2VA 3GTIA 4GK8A 4GX8A 4B92A 4KEVA 4KF1A 1R9ZA 2Z26A 1EJXA 2VM8A 2XIOA 4CEUA 4IFOA 1FWJC 1FWEA 3CS2A 1EJUC 4D8LA 3EWDA 1FWJB 4IG2A 2KAUA 3MKVA 1A5LA 3JZEA 4EPKA 1S3TB 4DNMA 3LSCA 5HMDA 3A3WA 4H9UA 4J5NA 1JGMA 2R1MA 4C6MA 4J35A 3OVGA 1KRAA 1M7JA 4R85A 3TN4A 1A5OA 2GWNA 4QSFA 2HNHA 3C86A 1K1DA 2P9BA 2UBPA 2VC5A 3RHGA 4LCRA 5FSEC 1V77A 3F2BA 1FWCB 2UZ9A 2PGFA 2YB1A 4GYFA 4C65A 4IQJA 3E0LA 3T81A 3MDWA 3OODA 2HPIA 3IJ6A 4DYKA 4XD6A 4EPBC 1QW7A 4AQLA 4B91A 4C5ZA 2DVUA 1FWJA 1FWGC 1EJUA 3GU2A 4RE0A 4C6FA 1I0BA 3IARA 2QVNA 1YBQB 4KERA 1EF2B 3T1GA 5A6TC 4BJHA 2YZ5A 3WYZA 1YMYA 1FWBC 1KRCC 1A5MC 3WMLA 4IF2A 3URBA 2PAJA 3GGMA 4NG3A 1FWBB 1KRMA 1WXZA 2Z2AA 1E9YA 4EPEC 4ZSUA 3UBPB 1IE7B 3PBMA 4AC7B 4GC3A 5FSEA 1RK5A 2HQAA 4NI8A 4E3TA 1RJRA 1J6OA 3DC8A 4HK7A 1EJSC 1FWHB 1QXLA 3O0FA 3QGKC 4EPBA 1P6BA 5G4HC 3DCPA 2O4QA 1FWGA 2QT3A 3HM7A 3QY7A 1UIOA 2HBVA 1V51A 2AQOA 2QPXA 3B0XA 1A5KC 1KRBC 2RAGA 2R1LA 2P50A 4YIWA 2D2HA 1A5KB 5A6TA 2D2GA 4CQDA 4BY3A 1FWBA 1EJXB 1KRCA 3QY6A 4CEUB 2EG7A 4EPEA 3ICJA 4L9XA 1FWEB 2BGNE 3GTHA 1UMLA 4PE8A 3EWCA 3IRSA 1A5NB 1FWHA 4DI9A 2KAUB 4IG2B 1A5LB 4IGNA 1J5SA 2HBXA 4EP8C 1ADDA 4R7WA 4CEXC 4H9XA 3TN6A 4Z42C 4PCNA 5G4HA 1A5OB 2ZC1A 2PLMA 2UBPB 4Z42B 1A5KA 4GX9A 1POJA 3UPMA 4GXWA 4IH3A 4C6EA 1XGEA 4WGXA 4J2MA 3S2LA 4XD4A 3TN3A 3OOQA 1PSCA 1NDYA 4XD5A 3T8LA 3ORWA 2EG8A 2Z28A 4G7EA 4XD3A 4B3ZA 2R1NA 2GZXA 4GY1A 4P5UA 3GTFA 1A5NA 1NDVA 4ERIA 1EJUB 3PANA 3FEQA 1ONXA 4MUPA 4DLFA 3UF9A 2E1WA 3DUGA 2VR2A 2HPMA 3BE7A 1J6PA 4EP8A 3UR5A 2YB4A 4CEXA 4KETA 3E38A 4Z42A 3URAA 1W1IE 4HK6A 4IFRA 4H9ZA 2EG6A 2Z4GA 1E9YB 3URNA 1A4MA 3A4JA 2P53A 5FSEB 2WJDA 3KM8A 4C6JA 3ID7A 4BKNA 4RDYA 4LALA 1ONWA 1FWFC 4DZHA 4C5YA 4ERGA 3UR2A 4QRNA 4EPBB 1XRFA 3K4WA 3GUWA 1RAKA 4GY0A 1FWGB 4RZBA 4GY7A 3D6NA 4IFKB 3QGAC 4IGMA 1EJRC 4C6LA 1FWAC 3IPWA 5A6TB 4KESA 2OQLA 2GOKA 1KRCB 1A5MB 1NFGA 3E3HA 3S2JA 3B40A 4DI8A 2Z7GA 1EJVC 2Z00A 2FTWA 5E5CA 4EPEB 4XAZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MKVA 2E67A 1OFEA 1C8QA 1W17A 1K70A 4R34A 2WJFA 3I4KA 1AL8A 3UNDA 2WYSA 4DNHA 4NX0A 1J4EA 1UD6A 3DFYA 3WQPA 4HU8A 1B5TA 3NEHA 1S0NA 4CQBA 4E8GA 4I8DA 1BF2A 1JNDA 1XDMA 2A5HA 3G5EA 2GWGA 3TLQA 2VEIA 3WLOA 1JXJA 1XYBA 1XLLA 5KFSA 3EWYA 3HJZA 1XXXA 4FO4A 1W91A 3ZYZA 1ECEA 1DJIA 1RYSA 1RSCA 3QH2A 6XIAA 1XUZA 3C4UA 3N2CA 2XDFA 3MPGA 3LPOA 3EB3A 3VUSA 5CGMA 2FJKA 1DQWA 3WK1A 4HA0A 1B3XA 3LI0A 1VEMA 2I9EA 3PPFA 4LAZA 4KMQA 1Q65A 1PS9A 2P1FA 5DQIA 3A4AA 3R2GA 3F4CA 3C0SA 3TK7A 3KZSA 1BG9A 2D3LA 4ZQCA 3THDA 2CW6A 1F4HA 3WF4A 2JGQA 1D8CA 2B81A 2Y7EA 4WDTA 5H8PA 4GC6A 3SADA 5C8BB 1EJWA 1PHWA 5AKQA 2CERA 3VMPA 1IV8A 2BOFX 4XAYA 3REQA 3EPNA 5CBBA 1OK4A 1WZMA 1XH0A 3VZYA 5KG0A 3WMSA 5FI8A 1OBAA 2O55A 3GIYA 3EKGA 1TWDA 3GO2A 3WJYA 1TR9A 1W1ZA 3W1XA 4XZNX 1BG4A 4GO9A 5FACA 3G6YA 1C8YA 3VO0A 5JIPA 3GY1A 4LUSA 4NAEA 3W72A 1SO6A 1R3TA 3WLIA 2ZX5A 3K2GA 2JE8A 3TYZA 2XINA 1Q7MA 2D1ZA 3H70A 4N9BA 3P2VA 3ITCA 1W54A 3BCDA 4ENLA 1B3ZA 2C3ZA 2Y0FA 3R0DA 1YIXA 1BWVA 3V3WA 2OZTA 2Z29A 3IS4A 5FJTA 1AH4A 1PO9A 1ZL1A 2ONEA 5CBJA 5MF5A 3G1YA 4DZIA 2J78A 4DL7A 2PD5A 1Q5MA 4B90A 5CPQA 3VIHA 2G3NA 4RNJA 3THUA 3UWUA 1Q2SA 3EMQA 5EMYA 3UESA 1EP2A 1XP3A 1BXCA 1T94A 2R24A 5KFUA 4HSOA 3W1QA 2YA2A 2GVLA 1TWIA 3DFOA 4H9VA 1ONEA 2CLHA 3S9ZA 4GINA 5I24A 2J9XA 2PDQA 4W4QA 2DY3A 2PDJA 3E0VA 2FH8A 1MW2A 3BW3A 3PZVA 1ZUAX 1JZ4A 4Q22A 3VOCA 2ZUWA 1UR3M 3UBPA 4F48A 2OT0A 5BOOA 2D2OA 3TAOA 3UNTA 5MKGB 1JCNA 1RQHA 2Z27A 2PU1A 1QNQA 1Q66A 1RCXB 1V4YA 3JS3A 3T0DA 4R7OA 3WDPP 3TEVA 4XZHA 3FHQA 5DANA 4PRWA 4UB9A 2J62A 3BL3A 2FHCA 4UC5A 5JUVA 4F3HA 1GT8A 1TVNA 3ITYA 1DHPA 4LPCA 3OQ8A 1ALDA 3QEZA 3W88A 5F1VA 1LM1A 3W1RA 4DJFA 3E5PA 3HGSA 1AH3A 5HR7A 4E38A 2POZA 1WOAA 1A5OA 3S1UA 3VNLA 2UBPA 3VNJA 3XIMA 3RB3A 3QLLA 3FX4A 3P8JA 4Q8EA 3CNYA 5L1IA 4IQJA 1QU4A 3PG8A 5I78A 4CU8A 3M46A 2C13A 1LUCB 2CITA 2ZIDA 4FA3A 2XVLA 5I06A 2W3ZA 4JTUA 4B91A 4C5ZA 3O6CA 4DAIA 1FWGC 1NY1A 3UWZA 4TTUA 3H26A 1E70M 4B15A 3TNOA 4FS1A 2CBUA 3F1QA 3H2FA 1K8YA 4PUJA 3MYPA 1IR1A 1M7PA 1YMYA 3N13A 1QHOA 3URBA 3KTCA 5FESA 2Y5JA 3RDKA 2CEQA 3ITTA 1N2VA 3VNDA 2YW4A 4E3TA 3DC8A 1I45A 4HK7A 5DEZA 3GNXA 3UJSA 4JTKA 4FXSA 1UYQA 4JV0A 4UR8A 1QAPA 3WL1A 2CIPA 5FF0A 2W7OA 1NWUA 4E8CA 2D2GA 4CQDA 1G7UA 4JTRA 3GSMA 4K8EA 4ZOEA 1E6XM 2DPJA 2BGNE 2MNRA 5I3HA 2PP3A 4IR9A 3PHAA 3WDQA 2KAUB 1V02E 4LUYA 1XYAA 4PYSA 1R0MA 1CGTA 1MYRA 3A12A 5FL0A 3W2MA 5I3DA 3DECA 1MXGA 3IN5A 3FJLA 1TWWA 1Q3NA 3GK0A 3GNOA 4XUGA 3DC0A 2JALA 2GGGA 3EB2A 1GQJA 5BRBA 3KL3A 2ZUSA 1SZNA 5D9NA 3SI8A 2OWCA 4LU0A 3ZO9A 2EG8A 1OF6A 2R1NA 2P10A 3MSDA 4DELA 3GTFA 1KCZA 3PANA 3FEQA 4ED0A 3KCLA 1TO3A 3UZXA 5M3WA 3TA6A 3BW2A 1IGSA 1J01A 1CYGA 3QPZA 1HW6A 2PDCA 3CGTA 2WHJA 3QHMA 4PUUA 1B3VA 3FGCB 4O57A 1W9BM 1W1IE 3OVPA 4DF1A 4DWDA 2Z4GA 3UCDA 3ZFHA 2CLOA 2VX4A 4IM4A 1HJUA 3KM8A 3CZEA 2PWUA 1UH4A 1GYMA 3WJSA 1OSEA 4C5YA 3UR2A 1E0VA 3GD6A 1F07A 1KWGA 2DEPA 3EX3A 4GY7A 4D71A 1XGDA 3VMOA 5LIUX 5C54A 8XIAA 4AB4A 3TR2A 3I3BA 1R3YA 5D8ZA 3E3HA 4U3CA 1XCXA 2PWEA 3OZYA 2NWSA 4KW2A 3IIVA 5KFBA 3BQ1A 1S38A 3L2IA 4DXKA 2PGEA 4N4PA 4KGLA 4S1FA 3E49A 4HT3A 1TTQA 4E2DA 3ZMRA 2PDLA 1KRBB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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