4DQWA

Crystal structure analysis of pa3770
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
466
structure length
415
Chain Sequence
MLRISQEALTFDDVLLIPGYSEVLPKDVSLKTRLTRGIELNIPLVSAAMDTVTEARLAIAMAQEGGIGIIHKNMGIEQQAAEVRKVKKHETAIVRDPVTVTPSTKIIELLQMAREYGFSGFPVVEQGELVGIVTGRDLRVKPNAGDTVAAIMTPKDKLVTAREGTPLEEMKAKLYENRIEKMLVVDENFYLRGLVTFRDIEKAKTYPLASKDEQGRLRVGAAVGTGADTGERVAALVAAGVDVVVVDTAHGHSKGVIERVRWVKQTFPDVQVIGGNIATAEAAKALAEAGADAVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQISAIANVAAALEGTGVPLIADGGIRFSGDLAKAMVAGAYCVMMGSMFAGTEEAPGEPYKGALSAIVHQLMGGLRAAMGYTGSADIQQMRTQPQFVRITG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title MgATP Regulates Allostery and Fiber Formation in IMPDHs.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 121
structure length 415
sequence length 466
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.580.10 Alpha Beta Roll CBS-domain CBS-domain 4dqwA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4dqwA01
1Y0EA 1YYAA 1YLVA 4CQAA 3ZS4A 2X16A 2EMQA 3IIZA 2CLHA 1JQVA 3Q37A 3TJXA 3LCWA 2W79A 3QW3A 1SFLA 3SGZA 1VHCA 3ORGA 2FPTA 3S5NA 5E0KA 5BMXA 3C56A 1X6UA 5E1QA 1I2OA 5CZSA 1VR6A 1W5QA 2QUTA 1M6JA 1G4PA 3KVKA 2V8ZA 3W1UA 4IQLA 3L66A 1X1OA 4NJGA 4MYAA 2V2DA 5CZJA 1TSIA 2YVZA 2WNQA 4O52A 3M41A 1LP6A 4IYSA 1WQ5A 2ZTKA 3Q2DA 4A22A 4EVZA 4DELA 1OFQA 1UCWA 1KLYA 2B0MA 4ALDA 3QFEA 3TQKA 3RFAA 2WPBA 4LV4A 1LLZA 2RH9A 1W1ZA 5CSRA 1N7KA 4IUOA 1DQWA 1GWJA 4N9CA 3PG9A 5G2HA 3FV6A 3UY7A 4BF9A 3W1MA 1PHWA 4NJKA 4JTTA 3QPZA 3VFLA 4DXVA 4NU7A 3L0KA 1QFEA 3PC2A 4UTHA 3O63A 4K6AA 2OT0A 5AHMA 1XC4A 3SFKA 2P1FA 3IV3A 4WOZA 4L3VA 4AVFA 4DPQA 4BI6A 3MHGA 4H3DA 1XL9A 3QMTA 3BLFA 1DJQA 4IY4A 1ZALA 3IIOA 5IIPA 3HG3A 4JY9A 4UMAA 2DZPA 3C8FA 3W7RA 1TRIA 3MMTA 2CZ5A 5AC8A 2E1DA 2CLIA 2V5BA 2HMCA 4WY0A 1ZAIA 1SU5A 3OEXA 5FF0A 1FY6A 5I3JA 1FDZA 3W2LA 1QMLA 3GB6A 5DCBA 2DZVA 3CIXA 4L27A 2ABBA 4IMDA 2EHHA 4I7VA 4ORIA 2YW4A 3G1VA 4RCXA 2NLIA 3K6EA 3S1UA 1VCVA 4IXHA 5G2IA 3HOJA 5G5IA 4EOUA 2VFGA 3G1XA 1TV7A 2C13A 1F2JA 4PCFA 2YFNA 3TU9A 3FJ6A 4JEQA 3CEUA 3UXDA 2C1HA 2Z2UA 3KVLA 4O10A 5HUOA 2QDHA 3S5ZA 1FDYA 3IVSA 3UD6A 3GIYA 4Y8FA 2NV2A 4O8RA 1GVOA 1W54A 1TQXA 5EL1A 3FWSA 1BWLA 3TSBA 3PBUA 4XWUA 1H7PA 4FF7A 2ZCGA 4O28A 4K39A 4ADSA 2I14A 4JTGA 3BK0A 4BR1A 3QRHA 2QCEA 3HO8A 3MP5A 3EKLA 1FCQA 4C1KA 1QO2A 1SFJA 3HIJA 5LGXA 1JULA 3P8JA 1MXSA 3M5VA 1FCUA 2E09A 4MZ8A 5HR7A 4Q33A 3BO9A 1I2NA 3HGRA 1SQ7A 4H6KA 4JD4A 2FJKA 5HULA 1FXPA 1PCWA 1V7YA 4ZQOA 2CLKA 3P60A 1Z44A 4QNWA 4BK9A 1KBJA 3QM3A 3O05A 1PL9A 2NYCA 4LW7A 4O4VA 1XFBA 1DOSA 4O4WA 3GX9A 4Y6GA 4O1AA 3B0UX 3UPBA 3WFAA 3SGUA 3PSWA 1RQHA 5H91A 3W7PA 4JX6A 3NZ1A 3EX1A 2QJGA 3BGGA 5HWJA 4UTWA 3W7DA 3KHJA 1R46A 4FX8A 2XN1A 1SUXA 3LDVA 3EB2A 3BG9A 5K9CA 1ME7A 3DFQA 3MW7A 1K8YA 5AN7A 2HS8A 2QCDA 5C6MA 3M5YA 4NZFA 3LBMA 2Y88A 3DKJA 2CU0A 3PSVA 1AK5A 2QCHA 3OVQA 4AMAA 1JJKA 3S5YA 4TO8A 4E38A 2CW6A 3OVPA 3TNOA 2HSAA 5AFDA 2FPVA 3C2VA 3DDJA 2YZRA 2ZDRA 2Y61A 3TIMA 2E68A 4LVFA 1GVFA 3UZJA 2ZA1A 2WO5A 4NOCA 4O12A 2VEKA 3N19B 3W87A 2H3DA 3G1DA 1F05A 3MP4A 4XTIA 5HR6A 2JKEA 3TW6A 3G1YA 1PV8A 4QNEA 4N02A 3MO7A 3BW3A 4IY3A 4IGHA 2NUYA 1TPVA 2OX1A 3QW4B 3UNDA 4R7JA 4GWEA 3E02A 2J9XA 3N73A 1WYIA 2GVLA 4ESYB 1YDOA 2C3ZA 1T99A 4GUJA 1KW1A 3LHZA 3W7OA 1OHLA 2RHGA 4Y90A 4UTLA 4CCEA 3M5XA 2WNZA 4NXSA 1GT8A 4P1GA 4OE7A 2EGZA 2Q8ZA 1JUEA 3R8RA 1QOQA 3LERA 4UTUA 1H61A 4FNUA 1VLIA 1SSDA 4AF0B 4LVAA 3VNDA 1KTBA 3ABOA 4NZJA 3N14A 3W2MA 1SZGA 1H1YA 4LS1A 4KFOA 7TIMA 1W37A 1H7OA 2B7NA 1C8VA 5DXXA 1DBTA 1W5MA 4QIUA 3WK3A 2J24A 3STFA 4M6QA 1L2UA 1DJNA 1S5TA 1A53A 2RDWA 1VH7A 3SW6A 1HO4A 3L65A 3MI6A 2V81A 4WOQA 5HINA 3LV9A 1P0KA 3S0CA 1EP1A 1VPXA 5F2IA 1TPDA 2QCFA 3LRMA 3U8GA 4MPQA 3C2FA 3HJZA 2NV1A 4LC6A 4MJZA 3EWBX 1LRTA 4RK8A 4KWWA 2Y7FA 4GE8A 1G4SA 1B3OA 2P9MA 2AAMA 1EP3A 5FEZA 3DHFA 4AB4A 1HL2A 1TCDA 5FF7A 3MYPA 5HQEA 1ZY9A 1JRCA 2WSQA 3S6DA 3W7LA 3LRLA 2ISSA 2ZRXA 2GPTA 2BX7A 4EIVA 1RZMA 1A5BA 2JBMA 4EWND 3R5EA 3FJLA 4UNLA 2C14A 2R8WA 3PB0A 2CZEA 2H6RA 4MFDA 3WJWA 2E6DA 1Q6LA 2B7QA 3NQCA 3W7EA 1A50A 5D2WA 5F1UA 3VKJA 2QR1E 4ADTA 2YDAA 3LXCA 3BV4A 2CLOA 1OJXA 3FS2A 4NXKA 2RIHA 3LHTA 3LV6A 1FBAA 1LRQA 4IX2A 3GBYA 1TV5A 5FF2A 3PM6A 3NDOA 4S2CA 5U7SA 4UFHA 4WY0B 5G1YA 3W1TA 3TXVA 3N2XA 4CLMA 1PE1A 1FWSA 2FPYA 3P81A 3G22A 5LNRA 1XUUA 4HT3A 1CX9A 2RFGA 2OT1A 3LCGA 3W76A 1GVSA 3TXZA 5D30A 1EWDA 1JCNA 3W07A 3NQ6A 1AL8A 5D04C 5D38A 1Q45A 4O53A 1H60A 1LOSA 1R2RA 2NUXA 2YW3A 4AHQA 5LNSA 3DI1A 3HF7A 5D2YA 1TTIA 2FQIA 1A5AA 4XTDA 5K22B 2GVGA 4MFEA 1F74A 2VEIA 4JYFA 3M1ZA 1LTDA 1EPXA 2VXNA 2PCQA 4NNAA 3OA3A 4X9SA 4PTNA 1VCGA 3N34A 2DP3A 5LSMA 3LI1A 5HJLA 1U5JA 3L2IA 1YDVA 2VENA 3W7JA 1OK4A 2YR1A 1H51A 2BSLA 4CQ8A 4K36A 4AEOA 4A29A 3BLIA 1KTNA 4HIBA 1ICQA 3AO0A 4LUIA 3PAJA 3P80A 2ABAA 3QZEA 2ZBTA 3ELFA 3QSRA 4UR8A 2Y7GA 3SECA 4LV9A 2P10A 4LVDA 5HWNA 2PURA 3W9ZA 3W1XA 4HNUA 3IVTA 4JXCA 1LYXA 4JTFA 4P1OA 3DHDA 3NPWA 4BWLC 4JTKA 1K03A 1QCWA 6TIMA 5L6UA 2D4ZA 1OFOA 5CSSA 3KRUA 1H1ZA 4Z1DA 1WV2A 5FF3A 1G7UA 4WZHA 2VEPA 1JQXA 3NL5A 4UFIA 3M43A 3BVJA 3HB9A 3HGOA 4OV4A 3KXQA 1GVRA 2QCDB 1M5WA 5KZMA 5DELA 4L4LA 2WV8A 1MEIA 3NQMA 3KPDA 1XCFA 1WX0A 1F73A 4AWUA 3L5MA 1TPWA 1YXYA 5G4WA 4QM1A 1PVMA 5KZDA 5CZ0A 5HMSA 5DCDA 1PIIA 4ML9A 4YMZA 1JRBA 3GXTA 2QR6A 2P0OA 2VFEA 2QRDE 4O54A 4JYEA 3GKAA 5K9DA 4MY8A 3H54A 4FXRA 2F84A 1UUMA 1YXDA 2RC3A 1S5VA 1GJPA 1IXPA 4RLIA 1QR7A 5CKSA 2VOMA 4ONVA 3K30A 2CZDA 1N8FA 2E6FA 3CM4A 2C19A 4TIMA 3ABQA 3DXIA 3UWYA 2ZRVA 4HNVA 3TE9A 5L9FA 3FA5A 3H53A 5BOOA 2QEZA 1S3HA 4K7YA 2QCMA 2VELA 1SW3A 4UNKA 3C0JA 1A5SA 5LHEA 1L9WA 3LBCA 3M0ZA 1G67A 1UBSA 1VQTA 2DZTA 4O9KA 3QF0A 3VCRA 1O95A 1UB3A 3TC6A 3L5LA 3HMJG 1XDLA 3KXRA 1RPXA 3MHFA 4H4IA 2O7SA 3QQ0A 1FWNA 1SO5A 1KFEA 2QKFA 4O0ZA 4K7VA 1T96A 1MEWA 2UV8G 2BWGA 4IMCA 3PBWA 4MLJA 3T4NC 5K24C 3RK8A 3MYOA 2Q3RA 1ZAHA 5IM51 4AWTA 1I2QA 3BARA 2J6XA 4UIOA 5J5DA 2QRCE 5KZEA 1CI1A 1RD5A 1KM2A 1LRNA 2J27A 4ZL1A 3HGSA 4OT7A 1RQBA 3IGUA 4CQ9A 4JR5A 2IQTA 4MY1A 4UFMA 1SW0A 3G24A 2FIQA 2Y7DA 1P0NA 4UC5A 3IIVA 4M7TA 2WSYA 2OUXA 4PFMA 1H7NA 2O7QA 5LNVA 3AJXA 3P5ZA 1SZEA 5D37A 2YVXA 4DEFA 3DFSA 3Q58A 1FWTA 4JTIA 4JTHA 3E12A 2Y89A 2DORA 4UCGA 5U4NA 2ZZ4A 3I68A 3R2GA 1HTIA 4E2BA 3OIXA 3EX6A 2C0AA 1JCMP 1GVQA 4AHOA 2A7PA 1DV7A 4O18A 1SW7A 1FCBA 1YTEA 5H2ZA 5AB3A 2H8ZA 4AAJA 3NNTA 1OX6A 3CLMA 4JDYA 3N2MA 4XKYA 3EWWA 2NXIA 2QAFA 1MSSA 4ZQRA 1OF8A 3C2RA 4BI7A 1TPH1 2E6AA 2CLEA 4MIMA 1TTQA 3NM3A 3G8EA 3W7QA 4OU1A 3S1XA 4YXGA 4MUZA 3CTLA 3FEMA 3NEVA 3SR7A 4HHPA 2NZLA 1OFAA 2X1TA 3EXRA 4CNOA 2UV4A 4Q32A 2YYUA 3JRKA 1AMKA 4DBEA 5F1VA 3BG3A 3QJAA 3QMRA 4HSNA 3T7VA 3W7GA 5EYWA 5AC6A 5BW6A 1L6SA 4M6VA 1VYRA 4WY0F 2D73A 3NPUA 3VI2A 1VRDA 1TIMA 4E0CA 4N9BA 3GLCA 3TA6A 4LTSA 1TYGA 5EPDA 1B4KA 3R89A 2TSYA 2V5LA 1PS9A 5FEWA 2JGQA 1Q6RA 4PCUA 1Z42A 3LV5A 4S1FA 1NAL1 1KM4A 1FWWA 4DQWA 2YSWA 1I45A 2OMAA 4YCOA 3DFTA 3LCLA 3LTYA 1DHPA 3IIXA 1TO3A 4MZ1A 3W7KA 3RF9A 4IOTA 3L67A 4KFPA 1FCVA 3YPIA 2FB2A 3CWOX 4JNMA 1JR1A 4XBSA 1PVNA 1DL3A 2PRHA 1EWEA 4FNTA 2OOYE 1FX6A 1GYNA 2X1UA 1W5PA 2TMDA 4MKNA 2CLMA 1K02A 3IGSA 5AHLA 3NQ2A 1WDWA 3TFCA 2XN0A 1QWGA 2C6QA 3W1PA 2A2IA 4IPJA 3ABSA 4NNCA 3QEZA 4XUGA 5D2VA 3MI3A 5F4WA 4COOA 1W56A 1JCJA 5AYZA 1YAVA 4DO5A 4X2RA 3JS3A 5C2XA 2DJLA 3HF3A 1H50A 1LZOA 4N6EA 3SSJA 1F5ZA 1KFLA 1OFRA 2VFDA 1U83A 3P74A 4UFKA 3M47A 1ZNNA 4FNSA 1FQ0A 3STEA 3L2BA 4A3UA 2RIFA 3TUUA 4GQVA 4IXXA 5TBOA 5D2XA 2QJHA 2NWSA 2ZY9A 2OOXE 1C9DA 2V30A 2YYTA 3N9RA 3EWZA 5DY3A 5LHFA 2ZZ2A 3MP3A 2XFWA 3GAYA 4O1BA 5CPLA 1VLWA 2Y7EA 4GC4A 4I7WA 1WBJA 4O19A 4DO4A 2YPIA 5J5RA 2VFHA 2XN2A 3C52A 2QCCA 3DAQA 3QH2A 1IXQA 1FDJA 2EF9A 3UYCA 1YDNA 2QCNA 1TV8A 4NT0A 3HBLA 2A6NA 3W72A 3S1WA 2ZZ6A 3LRKA 3HG4A 1PHQA 1ML1A 3B0PA 1M7OA 4FX6M 4O57A 4B5NA 3DGRA 1Z48A 3WK1A 1DKWA 2YZIA 1NF7A 1SZFA 1YTKA 2E5DA 3P8IA 5A5WA 2GUUA 3K2VA 4KKXA 4PC8A 4K8EA 3DENA 1H62A 2DZUA 1ICSA 4GRSA 3DBPA 4M6PA 3TDHC 4NJIA 2LLEA 1XBXA 1YPIA 3G18A 2QUUA 3EWXA 2ZFAA 2NXHA 1H7XA 2QUVA 1AW1A 3KPCA 1HO1A 3L21A 4LC8A 2C15A 3R12A 3PUDA 4N4PA 4OV9A 1ZHAA 1L6WA 3TQ0A 4OBTA 2QLVC 3NQEA 2V82A 2WOQA 3S42A 1J5TA 5DN1A 3TV8A 3H55A 3PY2A 3UZ5A 3NO5A 3T55A 3OBKA 5D09A 3GDMA 1TREA 1WBHA 2BLEA 3C61A 3HG5A 1EUNA 2X1SA 3CB8A 2FDSA 1W5OA 3TROA 3NOEA 4HN4A 4LY8A 1I2RA 5DBUA 3LM7A 4WJEA 1K7EA 2X30A 3BGJA 3W85A 3P7YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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