4FXSA

Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from vibrio cholerae complexed with imp and mycophenolic acid
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
484
structure length
467
Chain Sequence
MLRIAKEALTFDDVLLVPAHSTVLPNTADLRTRLTKNIALNIPMVSASMDTVTEARLAIALAQEGGIGFIHKNMSIEQQAAQVHQVKIFEAVTHPVTVRPEQTIADVMELTHYHGFAGFPVVTENNELVGIITGRDVRFVTDLTKSVAAVMTPKERLATVKEGEVQEKMHVEKILVVNDEFQLKGMITAKESKPNACKDEQGRLRVGAAVGAAPGNEERVKALVEAGVDVLLIDSSHGHSEGVLQRIRETRAAYPHLEIIGGNVATAEGARALIEAGVSAVKVGIGPGSICTTRIVTGVGVPQITAIADAAGVANEYGIPVIADGGIRFSGDISKAIAAGASCVMVGSMFAGTEEAPGEVILYQGRSYKAYRGMGSLGAMSKGSSDRYFQTADKLVPEGIEGRIAYKGHLKEIIHQQMGGLRSCMGLTGSATVEDLRTKAQFVRISGAGMKESHVHDVQITKEAPNY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from Vibrio cholerae complexed with IMP and mycophenolic acid.
rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Vibrio cholerae o1 biovar el tor
total genus 114
structure length 467
sequence length 484
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.580.10 Alpha Beta Roll CBS-domain CBS-domain 4fxsA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4fxsA01
4BF9A 5T26A 4LVBA 3W6YA 3IIVA 4O1DA 1DOSA 2X16A 5D2YA 3TQKA 3PUEA 2DP3A 1Q45A 1WQ5A 3W7IA 1Y0EA 3L0NA 3QW4B 5KZMA 1B4EA 5G2IA 4IMEA 4O11A 1A5SA 3HG2A 4MY1A 3W87A 4M6PA 2NXGA 2QCDB 2WO5A 5CZJA 3ZS4A 3IIZA 2CLHA 3M1ZA 3QQ1A 4FXRA 2DORA 2EPHA 5HMSA 3H53A 3P5ZA 3LOTA 2R14A 3GYEA 1WAUA 1YADA 3ATZA 1SUXA 3C61A 3R89A 4JICA 3O05A 2E5BA 4TU1A 1O4UA 1DHPA 1E51A 4GFSA 4R53A 3MP4A 2Y62A 2PURA 3L0GA 3LHUA 4FNUA 3GKFA 4MJZA 4IX2A 1AL8A 4I7VA 3PR2A 3CLMA 3ZWTA 1VLIA 3B05A 3NL6A 3VFLA 3SY5A 3MI6A 3T4CA 4NJKA 5CPOA 2RH9A 4KKXA 4N6FA 1SZEA 4OQVA 3MHGA 1FXQA 1TB3A 2HSAA 3EXRA 1VRDA 4N2YA 4O54A 4DQWA 1X8FA 4HKPA 3W7CA 3G8EA 1TIMA 3W7RA 2ZY9A 1YLVA 4ZQPA 2ALDA 2J27A 3NEVA 4BI6A 3NXFA 3LV9A 4K39A 4ESYA 3W1PA 2FDSA 2FJKA 1NAL1 3KPDA 3PB0A 1EB3A 3SW6A 4E2BA 5EBUA 1PIIA 1W5OA 4N9BA 2RDUA 3L65A 1W56A 3KFTA 3KH5A 4JTTA 4CNOA 1GVRA 8TIMA 4O15A 3UWZA 5CPLA 1GG0A 5KMYA 3I8NA 3DI1A 1RD5A 5AHLA 3S5ZA 3O07A 3P81A 2VENA 2GOUA 5IM51 4O1AA 3RLUA 2OCZA 5I3IA 3IVTA 4TX9A 5F2IA 1ME8A 4CNNA 3LRKA 1XUZA 5C2XA 3GNNA 3DFNA 1GWJA 4IWWA 1JQVA 4ADUA 4PC8A 2IQTA 5CKSA 3MW7A 5K9DA 4GBUA 2HTMA 2Z6IA 1F05A 1NF0A 3DENA 3DKLA 6TIMA 3G1DA 2AQWA 1RR2A 5AHFA 3LI0A 4E0CA 2JBMA 4YWIA 2YZIA 1QO2A 3NQEA 3R13A 3M44A 4P1OA 1MZHA 4CQ9A 1PE1A 1FBAA 4C1KA 4PCFA 3O15A 3EWBX 4GUIA 3WJYA 3FWRA 1SQ7A 3DDJA 3W88A 1Z44A 3HPXA 3W07A 1PV8A 1TPDA 4ORIA 1SO5A 3P82A 3HG5A 3LV6A 2Y7GA 4WY0A 3UWYA 1V7YA 3S8HA 4ZQRA 1W3NA 2E09A 2YPIA 4YMZA 2JGQA 4O28A 4ML9A 2ATSA 2C6QA 3G0SA 4JR5A 3WK0A 4QNEA 3TH6A 3TDHC 1JJKA 4FX8A 3TAKA 4LRSA 3NL5A 4NXSA 1ICQA 4ICNA 3O8AA 3ZWSA 2CLEA 5CSRA 3DI0A 3ANYA 4DBEA 3SIZA 5CSSA 3EXTA 1XFBA 2V5BA 5DBUA 1KTBA 2KZHA 5DY3A 3MUXA 5U7SA 3HGJA 5F1UA 2O7QA 1PCKA 2XN0A 3RFAA 2ZA2A 1YTEA 2I9EA 2J9ZA 1ZAIA 2QH1A 1WYIA 1ONRA 5G4EA 5G5IA 4LW7A 2UV4A 3EX4A 1R2TA 1BTMA 1EA0A 4O50A 3PM6A 3L5MA 1P5BA 1W5QA 4EOUA 3PBWA 1TTIA 1TPH1 3TSMA 4LRTA 4JTEA 4AWTA 3STEA 2TRSA 4QM1A 3MMTA 2HS6A 2NYCA 4FNTA 5K24C 4AAJA 4DXVA 3TKFA 3WJSA 3RF9A 3DAQA 2YVYA 5SWUA 4HG0A 3NOEA 2CZDA 4UFHA 4JNMA 2J6XA 5F2MA 5BOOA 1VC4A 4RLIA 2E6AA 3QSRA 3FHMA 3TC7A 2VEIA 3LXAA 3LLFA 3VE9A 3QF0A 2VOMA 1J5TA 3LCGA 2C19A 2C0AA 1H61A 3P8JA 4FX6M 2B7NA 3CEPA 2A21A 4JTKA 1THFD 1C9DA 3BW4A 4MIMA 4LS2A 1LDCA 2QKFA 3W23A 1FDZA 1VQTA 3NPWA 4ADTA 5AC8A 1RPXA 3E9AA 1DBTA 4UMCA 4JGDA 4GWEA 3PC0A 3W2KA 4IOTA 2E6DA 5LGZA 4RCXA 4M7TA 2YXGA 3TIMA 4O4VA 3W76A 3W7LA 1YTDA 1H7NA 3NZRA 4DO5A 4UUUA 1LRNA 1YPFA 2QAFA 2X1SA 1LTDA 2RHGA 3UY8A 4RZ4A 4JDBA 4NNBA 2VELA 3QMSA 1OX6A 3TSBA 2P1FA 4BK9A 3NQVA 3W1NA 3W7KA 5AFDA 2A2IA 3LCWA 4K8EA 4JD4A 4WD0A 3O6YX 2YX0A 4RJEA 2FLIA 1EP3A 2CW6A 3BLIA 1QWGA 4ESYB 3RNDA 1TPFA 3TDFA 2ISSA 1GQNA 1VS1A 3QZEA 4OWGA 2B7OA 3O63A 1EUNA 4P61A 3E96A 3NDOA 4EWND 2JK2A 3LRMA 1LP6A 3ABQA 4IPJA 1KM6A 2E77A 1J4EA 2D73A 2C1HA 4WXYA 5HWJA 1UJPA 3MHUA 5C6MA 2X30A 4U28A 1KM4A 3A5FA 1LOQA 4M19A 2Y7DA 3LTYA 1P1XA 1QFEA 3G8RA 4OV4A 2UV6A 3TUUA 3NM1A 1IXOA 2VC6A 4A21A 1JUBA 1SU5A 2XN2A 1JRBA 3C4UA 1G4PA 3PC4A 1LBFA 1FWTA 5D05A 1O5KA 1KBJA 4BI5A 3QMRA 2H8XA 1MEIA 3CIWA 3B0VC 2WSYA 3GDLA 1VLWA 1ICPA 2Y6ZA 1K8XA 3L21A 1GVSA 3KVMA 4NOCA 4TMCA 3P7YA 1L6YA 3G0XA 2QCLA 3Q58A 3A22A 4KFPA 4Y8FA 3W2MA 5D09A 4O1BA 3GBYA 2CLOA 4AVFA 3S5OA 3LBMA 1W8SA 5DELA 5K7JA 1UB3A 4WY0B 3G18A 3FA5A 3QEZA 3S42A 2BTMA 3ELFA 1O95A 4IYSA 3BV4A 3GR8A 4A22A 5EL1A 4OHQA 1TJPA 3L0KA 2QAPA 2XFWA 3F4NA 1RZMA 4L3VA 1H5YA 4LVDA 3OCOA 4M6VA 3HGOA 4S2CA 1YDVA 2JGYA 3ABSA 3OEXA 1D9EA 3FS2A 3W3OA 4N9DA 2OZ0A 1OFPA 2H6RA 3HPSA 4QNWA 1FCVA 3WJZA 2EF9A 4JX5A 3NQGA 4QJ1A 4GJ1A 4UIOA 5HWMA 1MEWA 1AW1A 2NX9A 2WNZA 2V9DA 2A7PA 1Q6RA 3FEMA 4NJJA 3B04A 4PL2A 1KFCA 3M41A 2Q8ZA 3KRSA 2WNQA 3TQVA 4Z1AA 5D2WA 5HJLA 2EF7A 2Z2UA 4H4IA 2X2GA 1OHLA 2V81A 1S5TA 3S1VA 1GPWA 1ZY9A 4S2BA 4FF7A 1NVMA 4FB7A 3WK2A 1AW2A 4XUGA 4YL2A 3VE7A 4PCUA 1HL2A 3W75A 3TR2A 3CWOX 1Q6OA 3FYPA 3THAA 1OK6A 4HN4A 4IY0A 5KZDA 5K22B 1LLWA 3CC1A 5AHMA 1HUVA 3LTSA 3UD6A 2DZWA 5DN1A 1K3UA 3I6RA 2VFFA 3GR7A 4UR8A 4Z0JA 2NX3A 2AGKA 4QQ3A 3NO5A 1FWRA 1VYRA 2WOQA 2NWRA 4NZFA 4R34A 5LKYA 1GJPA 3PY2A 3U8GA 3UNDA 1H50A 4IJBA 2YGYA 2GQ9A 5LNWA 4LC6A 2R94A 1LM1A 1CI1A 2Y70A 5K9CA 4O53A 2QCNA 1DJNA 5I3KA 3TK7A 3FFSA 3R5EA 4A29A 2RIHA 1VHCA 3L31A 2A7RA 3HGSA 3MYOA 2WSRA 5K4ZA 4QISA 2ZYFA 2YZRA 1H7PA 3I7RA 2I1OA 4GUJA 3MO7A 2VXNA 1LROA 3BGGA 1P0NA 3GZ3A 5AC6A 2YZQA 3NAVA 4XWUA 2Y63A 2NX1A 2CLFA 2VEMA 1YXDA 3WJXA 1F5ZA 1K8ZA 4N9EA 3SZ8A 5U4NA 2QEZA 1GT8A 3N3MA 4LUIA 3NYZA 3EEGA 5IBXA 5F4XA 2WKJA 4Y6GA 1BWKA 1FUYA 1R30A 3I68A 3PUOA 5CZSA 2P9MA 5D04C 4O19A 5D2VA 3W1RA 3QC3A 2VFIA 4O0KA 5DBTA 4O9KA 1DKWA 1WDWA 2ZZ4A 1R2RA 4ZVJA 3C2RA 4O14A 3NQ8A 2VKZG 3OIXA 4LTSA 1YPIA 2ZZ3A 2WPBA 4FX7A 2OX1A 1HFBA 3IVSA 4RR4A 5G2HA 4UXDA 4R33A 5KSWA 3VKJA 3BVJA 3KPCA 1JVNA 4UTJA 2Q8LA 3P84A 1PVNA 1VH7A 5FEWA 2XN1A 5D37A 4DF0A 1KV5A 4XZ9A 4ZQMA 2ZA3A 5FF4A 4IQLA 1QNVA 4HIBA 1XM3A 4PH6A 3K6EA 1G4SA 3N14A 3NM3A 3UPBA 2QR1E 4L28A 1KM5A 3OVQA 5K3VA 3NPUA 2NYEA 2Z1BA 4AWUA 2A4AA 4Z0SA 1S5WA 2CZFA 4QAIA 4L4LA 3G22A 3STFA 3V1PA 1W5NA 3GX9A 1S5VA 2RDTA 2H3BA 3L9CA 1W5MA 1KBIA 3G0UA 4QIUA 3TE9A 5FF0A 3ORGA 3GDTA 3VNDA 2B7PA 3G3MA 3N9SA 3VI2A 6ALDA 4DO4A 5A8GA 4GUHA 1SZFA 3NQDA 5I3JA 2C18A 1L6SA 4UTIA 2VFEA 1R46A 5C55A 2NLIA 2Q3RA 4O18A 2YW4A 4K7YA 4PFMA 3DBPA 5G1TA 2DZVA 4NUWA 3FJLA 3NQ6A 1ADOA 4ORMA 3W7HA 4NNCA 5DCBA 1LOSA 3PG8A 1JCXA 4IMCA 2EGZA 2A1YA 4HPXA 4BR1A 4YCOA 2ABBA 2G97A 3KXQA 3ABOA 1KFJA 3UZJA 3NGJA 2GUUA 3LRLA 4LV9A 1K8YA 1JCMP 2QDGA 4UTKA 1WOAA 3L68A 1EX5A 5AHNA 2WJZA 2Y88A 3A5VA 3FWSA 1A53A 4DELA 4CCEA 2ZFAA 5FI8A 4BWLA 3G1FA 3GNDA 4GXMA 3L2IA 1DQXA 5MHBA 2X1RA 2HS8A 2PFIA 1XBVA 3GIYA 1HG3A 3RU6A 1MXSA 1IXPA 4FHAA 3M47A 3TFCA 4LOCA 1VYPX 3W70A 1VZWA 1OFEA 3FKRA 3OHIA 1F6PA 2FB2A 1G67A 4AH7A 5HNRA 4IY3A 1TPB1 2JKAA 1I8JA 1KV8A 5H91A 3H55A 1R47A 3HJZA 1AL7A 4XKYA 1VCFA 1SSGA 3E12A 3QPYA 4X2RA 4M5PA 2B7QA 5EA9A 4I7WA 1TPVA 2V8ZA 1FQ0A 4FXSA 1XUUA 1F74A 3HG4A 1VCGA 1SW0A 3P80A 4QSHA 1LYXA 3KAOA 5TBOA 3TX9A 2E68A 2F7FA 3C56A 3KVJA 5EPDA 1H7RA 3N34A 2EKCA 1IIHA 3TROA 3W7OA 1M5WA 1UCWA 2DZUA 3B4UA 2E1DA 2ISWA 2YR1A 4KWWA 3W1LA 3SL7A 2BX7A 2Q3OA 3SI9A 1I2NA 4HNTA 3E49A 4ZQOA 4CQ8A 3UYCA 1TTJA 3NNTA 2R91A 3ZR4A 4LUJA 2O16A 5KZEA 4JTLA 1QR7A 2QR6A 3EKLA 4NNAA 5AYYA 5FF7A 1KLZA 2FPVA 3L2BA 3U6WA 1DV7A 2NV1A 3PG9A 4G1KA 4LVAA 2EMQA 4FRYA 1G6CA 5DCDA 3UZ5A 3MBFA 1ZAHA 3PC2A 1VHNA 2OMAA 2QF7A 3NL2A 2A0NA 1F73A 5G4WA 2FQIA 2Z0IA 4UR7A 3W2UA 4BI7A 5L6UA 4AHOA 4O57A 1OF6A 5KS7A 3PB2A 3JRKA 5L9FA 1DL3A 3O6DA 4W9TA 2F84A 1VGAA 3FJ6A 1C8VA 2OT0A 3EX2A 5FESA 3KRUA 4CQAA 2QRCE 2QJIA 1JCLA 1X1ZA 3UXAA 3TV8A 5FEPA 1OFQA 2YW3A 2ZZ2A 4UMBA 2E6YA 2QRDE 1LLZA 4N9CA 5C54A 4AB4A 1L9WA 3I7QA 1TPUA 1F76A 4HSNA 1XCFA 2GQAA 2PC4A 1SPQA 4ADSA 4CCCA 3FYOA 3W7GA 2YYTA 2GVJA 3NPXA 4ZL1A 4JS3A 1SW3A 1Y5HA 2RKXA 4JTHA 3DFTA 4LY8A 2BLEA 4A3UA 1OFRA 1LORA 2NV2A 2ZCGA 4WOZA 1EWEA 4RKAA 3BG9A 4UUIA 4NX0A 4O0ZA 3INPA 7TIMA 3FOKA 3HOJA 4EF9A 1KTNA 1FDYA 4I7UA 5LSMA 1XC4A 3QQ0A 3M5YA 1YXYA 4R7JA 5LHEA 4UTMA 1W37A 2G5WA 3T78A 3TFXA 3SJ3A 1LBLA 1SO6A 1NF7A 3PBUA 5LZLA 3DHFA 3HF3A 2CLLA 1FWNA 4K36A 1GVOA 5HINA 3UWUA 1SO3A 1SSDA 3LERA 3LCXA 3TU9A 2UV8G 3EWUA 2I14A 4K7VA 3GK0A 4GQWA 4EF8A 3TW6A 2G95A 3CM4A 3RMJA 3LXBA 1YDNA 1G69A 1WBHA 1KM1A 3IIOA 5DCEA 1Z48A 1FCBA 2OT1A 4WOQA 3STCA 3P61A 4ZQCA 1UBSA 1MEHA 5LXQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LT8 A;  3WLQ A;  6ENL A;  1FFR A;  1SJB A;  1ZB5 A;  2YXO A;  2VWS A;  4AEE A;  4IME A;  3WLJ A;  3HG2 A;  1ZJH A;  2WO5 A;  3NUR A;  3ZS4 A;  3IIZ A;  1WNO A;  2CLH A;  3AI0 A;  4KMQ A;  2OGJ A;  2R14 A;  4J3T A;  3ATZ A;  3IJ8 A;  1XLK A;  1O4U A;  1DHP A;  1E51 A;  4PUK A;  2QIW A;  3MP4 A;  3PHA A;  4IG2 B;  4IP5 A;  1ADD A;  3TN6 A;  1FHD A;  3GKF A;  1K77 A;  3ZWT A;  2VRQ A;  4S3C A;  2HXU A;  2P3E A;  4F66 A;  1EJ7 L;  5G1M A;  3MI6 A;  1R86 A;  4W85 A;  2VR5 A;  2CBJ A;  3CAQ A;  4N6F A;  5EMJ A;  4HA3 A;  3MHG A;  1VEP A;  1FXQ A;  3NCO A;  2BS9 A;  4JHM A;  4N2Y A;  4DQW A;  3WQO A;  1J11 A;  3W7C A;  4DWS A;  3MO4 A;  2A3L A;  1TIM A;  3W7R A;  1SYT A;  2QHA A;  4ESY A;  2GSE A;  3U2E A;  2CNC A;  2FJK A;  4EPE C;  4BF7 A;  1JDE A;  1GCY A;  4A8N A;  3FXG A;  2JAL A;  7XIM A;  4AFY A;  3VNZ A;  3PB0 A;  3QYS A;  5EBU A;  1PII A;  3TTY A;  2OU4 A;  3MSR A;  1H09 A;  3RN6 A;  3CV7 A;  8TIM A;  4NAE B;  5CPL A;  1ZBW A;  1XRV A;  3N2O A;  5KMY A;  1RD5 A;  5AHL A;  4C6M A;  2YJQ A; 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