2NRWA

Crystal structure of the c terminal half of uvrc
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
217
structure length
204
Chain Sequence
GLRKEALEELMKLLNMKDFPYRIEGIDISHTVASLVVFEDGFPKKGDYRRYKIEQDDYESIRTVVKRRYSKHPLPNLLFVDGGIGQVNAAIEALKEIGKDCPVVGLAKKEETVVFENREIHLPHDHPVLRLLVQIRDETHRFAVSYHRESLRSVLDNVPGIGPIRKKKLIEHFGSLENIRSASLEEIARVIGSTEIARRVLDIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the C-terminal half of UvrC reveals an RNase H endonuclease domain with an Argonaute-like catalytic triad.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
molecule keywords UvrABC system protein C
total genus 63
structure length 204
sequence length 217
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain 2nrwA02
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrwA01
4F3OA 2HHVA 4M04A 3EW9A 4MF8A 2BQRA 5J2KA 4I27A 4HYKA 2PFOA 3GIIA 1HJPA 2BQ3A 8ICOA 4RU9A 4DO9A 4ED3A 7ICOA 3Q8PB 3HPOA 5KFIA 3V6KA 2W9CB 2AQ4A 3TFSA 9ICAA 8ICLA 2HHQA 8ICZA 5KFJA 3KHLA 1SL0A 3PX6A 4J9LA 1BPZA 5HHHA 3PX4A 1TV9A 9ICXA 4ECZA 1XC9A 5J0UA 3QE9Y 4NM2A 5D49A 4F4KA 5KFTA 5KT2A 1JMSA 3MR2A 4QZIA 4KMUA 5CB1A 4F50A 1ZQXA 1SZPA 2FPLA 3GFKB 3TARA 2FLLA 5EOZA 4I2FA 1TK0A 4IQUA 4YR3A 2FLPA 2JEJA 4C8LA 7ICRA 3HT3A 1XSLA 3EWAA 1IM4A 4QZEA 3RTVA 4RUCA 4DS4A 1QSYA 2FMSA 4ELUA 7ICFA 3H4DA 1KSPA 4BWMA 4DF4A 5J2FA 3GIKA 4C8KA 3B0XA 3C1ZA 4ZH4A 4F5OA 4X5VA 5KFRA 5J0RA 4MFCA 2A1JA 3H4BA 3UQ2A 1RXVA 4IRCA 4GLXA 3E2EA 4F4ZA 4KLLA 3KHRA 2KZZA 4FO6A 5KFXA 5J2EA 1KFDA 3Q8RB 4B9SA 4DQPA 4FS2A 2ALZA 2NRXA 3PR5B 1UA1A 1ZQIA 3RJFA 4I2DA 2XO7A 1Z00B 1T4GA 5L1JA 1XSPA 5KFMA 5DBBA 5KFCA 3EZ5A 1C7YA 4K4IA 5J0OA 5DB7A 2C2RA 4XRHA 3Q8KA 2FPKA 2BCRA 4XA5A 4TQSA 4YR2A 3Q8LA 4B9LA 1QLNA 2C22A 3FDSA 3PMLA 7ICEA 1NJXA 3MR6A 1S0MA 3RB6A 2NRWA 3V7LA 8ICRA 4C8OA 3OJSA 5J2CA 4PHPA 2J6UA 4RUAA 7ICJA 5KFKA 1SL2A 4B9VA 3RRGA 4C8NA 3EPGA 4I2JA 1U47A 4LZDA 4KLGA 3RJIA 3PO4A 4IR1A 2HW3A 4YN4A 5L1IA 5CJ7A 7ICTA 3JPPA 5KG0A 3V7JA 2IHMA 4M9LA 4JWNA 1RXWA 7ICSA 5IIJA 1KRPA 1T3NA 1MQ3A 1BPDA 2W9MA 4ECVA 3TQ1A 1CUKA 1ZQKA 1L3UA 4PHAA 4PGYA 4J9KA 3M9MB 4QW8A 1NK8A 1TK8A 4LZGA 1NK5A 9ICMA 4YFKA 4UBBA 1ZQZA 5BOLA 4I2EA 3M9OB 4F5RA 4DFMA 3OHAA 2KZMA 8ICMA 3PW7A 5DKWA 5KG1A 4QWEA 2PFPA 4DL4A 5KFOA 4ED7A 4Q44A 9ICBA 3QZ8A 3OSNA 5C5JA 4DSIA 4EBCA 4DQRA 3HWTA 3OSPA 4O5EA 1U45A 3JPOA 2ISOA 4RPXA 4RQ0A 3RJJA 7ICMA 1BPYA 1TAQA 1T7PA 4KLEA 4J9PA 7ICLA 2B21A 4YD1A 4DSKA 3GILA 1ZQNA 1QSSA 1ZQOA 4J9QA 4ED6A 3V72A 9ICIA 5KG6A 4O3QA 4GC6A 4DL5A 3UXOA 3T5LA 2A1JB 4ECUA 4QZ9A 1L3TA 1T8EA 3ZDDA 2XC9A 3H7IA 4ECSA 8ICYA 4RNNA 4LVSA 3BJYA 4GXKA 5D4BA 4EEYA 2V4RA 4TURA 3RJHA 5J2AA 4RNMA 3GV5B 1TFRA 4UBCA 1X2IA 4KLDA 4BXOA 3M8RA 1U4BA 1NK0A 4RQ7A 4DFKA 2C2EA 3H40A 4K4GA 4J9RA 4DLGA 2IA6A 3HW8A 2JEIA 1RYRA 4DOAA 3THVA 2BQUA 2ISPA 4ECYA 4I2AA 2ZUBA 4NLZA 5HNKA 4YXJA 5KT3A 3G6VA 4DLEA 1JN3A 3RH4A 4F5NA 2BCVA 2UVVA 5KFEA 4QWAA 2IHNA 3QZ7A 2PI4A 5HMLA 1QTMA 5F9NA 4B9MA 2ZUDA 4KITB 3ISDA 3ZDAA 3RH6A 5DB9A 4F92B 4QZGA 7ICPA 4UQGA 5JUMA 4QWDA 3T5KA 4Q8FA 8ICJA 3N97B 3T3FA 3RH5A 3BQ1A 1ZJNA 3RB3A 3MR5A 1S10A 4IRKA 4XQ8A 4R8UA 4RQ1A 1IXRA 4O5CA 2JZBA 4GC7A 1HUZA 2XGPA 1ZQBA 5HMMA 4JV2A 5CWRA 4KTQA 4M9JA 2KZ3A 3MGHA 7ICUA 8ICUA 4O3PA 2ZTDA 5KT5A 1L3SA 7ICVA 1QSLA 5KG4A 2HHXA 1ZQRA 3N4MB 2AGOA 4P4OA 4QZFA 2P66A 4M0AA 1X9WA 5L1KA 3T5JA 1ZQTA 3TAPA 3UQ0A 4MF2A 9ICQA 5L1LA 2IBKA 2AU0A 2MUTA 3GDXA 2PFNA 1U49A 3OGUA 1Z3EB 7ICKA 1ZQYA 2V4QA 4M6WA 4KLJA 3NTUA 4DWIA 2BHNA 2ZJ5A 2PFQA 5DLFA 8ICXA 4KLFA 1ZQHA 4BDPA 4ED1A 3SI8A 2FMPA 5KFZA 4EZ6A 4E0DA 1ZQSA 1N48A 1BPEA 2C2DA 4O3NA 1D9FA 5KFGA 4YMOA 3C2MA 3KHGA 5DG7A 1TKDA 2J6SA 4M9NA 4UB3A 4Q8EA 5J2IA 2ZJ8A 3K75D 3SV4A 4DL2A 5EWEA 5IIKA 4DSJA 2HVIA 4QZHA 2XY6A 1NJYA 5KFFA 1KFTA 1ZQVA 1BPXA 3RRHA 8ICHA 1UT8A 2ASJA 1SKWA 4UB2A 4YR0A 1RYSA 1XO1A 2AGPA 8ICEA 4EBEA 4M9GA 2PI5A 3JPSA 9ICFA 3UXPA 4I2HA 4DSEA 4IQTA 4UAWA 2XY7A 3V7KA 1NK7A 4BXOB 4PHDA 4I2GA 9ICOA 3AUOA 4B9NA 3MABA 5D46A 4O5KA 3C65A 2VA8A 5IIIA 4JV1A 1XWLA 3MR3A 3MGIA 1ZETA 5BOMA 4DOBA 2AQ0A 3SYZA 1NKBA 2NRTA 4G3IA 2BKEA 4JWMA 4KLTA 9ICPA 3RAXA 5KFPA 3HX0A 4DQSA 1ZQQA 8ICKA 4GXIA 1LB2B 2R8KA 3PO5A 2HHTA 1NKCA 1JX4A 5BPCA 2JEGA 4P4MA 4PPXA 5DQGA 4R66A 1ZQAA 1S0NA 1NOMA 3G6YA 2R8HA 9ICUA 4O3OA 5EWFA 1TVAA 3H8JA 1K1QA 2Y1IA 4KLQA 4R8UB 4QZAA 3ZDCA 1U48A 2JZBB 5KFSA 4KLSA 2P6UA 4ECQA 4YMMA 3OHBA 5J2BA 3FYHA 4TQRA 3C21A 2HHWA 1TAUA 1AROP 4UB4A 1DOQA 4RNOA 1NKEA 9ICGA 3MDCA 4MFFA 9ICRA 1KTQA 1NJZA 9ICSA 9ICTA 4RPYA 3JPQA 4DFPA 5J29A 4YQWA 5DBAA 1S76D 7ICQA 2MUTB 4F4XA 4YCXA 4QZCA 4XUSA 2J6TA 1JIHA 1L3VA 1ZQPA 5J0TA 2KTQA 3H8SA 3AU2A 4M6WB 3IHQB 3ZD8A 1CEZA 3ISCA 3EPIA 2F1JA 4M2YA 3PNCA 3LWLA 2W8LA 4ED8A 4DS5A 4ELTA 5J0PA 2C28A 2F1HA 3PW4A 4J9NA 3ZD9A 2ASDA 1S0OA 4B9TA 1ZQUA 5IIMA 4R64A 2XGQA 3BQTA 1RZTA 8ICTA 1TK5A 8ICPA 1SKRA 4DQIA 3C5FA 5KT4A 4Z6FA 4F5PA 1B43A 3PMNA 2FLNA 5KFVA 3MFHA 3RJEA 4QZDA 3ZDEA 4EYIB 5DQIA 5HP4A 1BPBA 2BPFA 2KFZA 1N56A 2M9NA 2NRVA 5KG2A 7ICNA 4RQ8A 2ZUCA 3M8SA 3V6HA 4IQVA 5J0YA 7ICHA 4EBDA 3RJKA 1XSNA 1X9MA 1DGSA 1JXLA 5KFDA 4QWCA 8ICAA 4RQ5A 4QWBA 3KTQA 9ICHA 2XY5A 2FMQA 9ICCA 3LWMA 1WCNA 4Z6DA 3C2LA 3RAQA 5KFHA 3GV7B 3UPQA 4DF8A 4JUZA 4IQWA 3PW0A 1RPLA 3BDPA 4QZ8A 3PY8A 4ELVA 3MDAA 4PHEA 4NLGA 4J9OA 5HHIA 4DL7A 2UVRA 4F91B 3M9NB 3RB4A 4JV0A 1V9PA 2VANA 1LV5A 4KLHA 9ICLA 4F2RA 3BQ0A 3C2KA 8ICFA 4F8RA 9ICVA 3BQ2A 5DQHA 3PR4A 5J0QA 4FBUA 4QW9A 4TUQA 4F4WA 2XCAA 1WCLA 2Y1JA 1EXNA 3MFIA 4B9UA 1ZQFA 4J9MA 4BWJA 5J0SA 2Q0ZX 5DLGA 2H5XA 4ECTA 3PW2A 3GIMA 4O3SA 5J0XA 2WTFA 3PVXA 3ORYA 4ECWA 1A76A 4O0IA 4FS1A 3PX0A 4K4HA 5DBCA 3PV8A 2ZJAA 1S77D 4EZ9A 3SZ2A 2BR0A 1Y88A 1PZNA 2W8KA 3OJUA 4O9MA 1JXEA 4J9SA 4P4PA 4DOCA 5J0WA 1ZQEA 5KFAA 4PGXA 2LYHA 5DB6A 4MFAA 1MC8A 5KT7A 4IRDA 4UB1A 2R8JA 4F2SA 2RDJA 2W9BA 3JPRA 2V9WA 3RR8A 2F1IA 1ZJMA 1H38A 3Q8SB 2P6RA 5KFBA 2BCQA 1ZQWA 5KG3A 5CP2A 4GXJA 2ATLA 9ICEA 4YXMA 2ZTCA 1A77A 4R65A 4Q45A 4F4YA 2RDIA 3IM1A 3GV8B 3SV3A 1ZYQA 4F93B 2XCPA 3V6JA 4O3RA 8ICBA 1SL1A 4NY8A 1NJWA 7ICIA 5TZVA 8ICNA 5J2HA 2AJQA 4TUSA 3B0YA 1NK9A 8ICIA 5CR0A 3MBYA 4Q43A 2R8GA 8ICCA 4DQQA 5KTQA 4DSLA 4QZBA 3T5HA 4YMNA 4I28A 4RT3A 9ICKA 4ECXA 1ZQGA 2AGQA 4RQ3A 1X9SA 3ETLA 3G6XA 1UT5A 3C5GA 4KLUA 4UAZA 1HUOA 1ZQDA 4DEZA 3RBEA 4I2BA 2UVWA 3Q8MA 4Z6CA 5DDYA 1MSWD 4R63A 2DPIA 8ICVA 5KT6A 3NGDA 3EYZA 4NM1A 1D9DA 4NXZA 1XU4A 5KG5A 4UB5A 4DSFA 4DL3A 4C8MA 4KLIA 3KHHA 2R8IA 3AU6A 3PW5A 4NLNA 2DFLA 3LK9A 2VA2A 3RBDA 1B22A 5KG7A 1D8YA 2BCUA 2OWOA 4RPZA 2I9GA 1K1SA 3TI0A 2BDPA 2NRRA 2ZTEA 1S9FA 2W9CA 4KN7A 8ICGA 4YP3A 3TANA 2DPJA 5DG9A 1UA0A 3TFRA 1KEJA 4ECRA 1ZQLA 3RB0A 5KFYA 1ZQCA 2BPCA 1NK6A 5J2JA 4BGDA 4F5QA 4ED2A 2BCSA 4Z6EA 1KLNA 2I1QA 5KFUA 4YD2A 4JK1A 1KDHA 4RZRA 2VA3A 5IILA 3RJGA 4PH5A 4M47A 4M9HA 3K4GA 5KFLA 3H8WA 5DDMA 4PGQA 7ICGA 2KN7A 1XS9D 4NLKA 2W9BB 5DG8A 2HHUA 3JPTA 9ICJA 2MAXA 2NRZA 5L9XA 4MEXA 2JEFA 4KN4A 1S0VA 2HHSA 3QEBZ 1BGXT 5DB8A 4I2IA 4I29A 2PXIA 1MQ2A 4EYHB 5CA7A 4YG2A 1KFSA 3ZDBA 4KLOA 3GIJA 5CHGA 5J2DA 4IR9A 3QEAZ 4FBTA 2ASLA 2UVUA 4RQ6A 2BPGA 2GWSA 3ISBA 1ZQJA 4YVZA 8ICWA 2BGWA 4P2HA 5KFNA 5EWGA 1BVSA 8ICSA 5J2GA 5KFQA 4RQ2A 2HVHA 1SKSA 1Z00A 2FPMA 4DFJA 1COOA 3TAQA 2IMWP 4DL6A 4MEYA 5DGBA 4UAYA 1ZQMA 4CCHA 5KFWA 4I2CA 1D8LA 4TUPA 9ICNA 3Q8QB 2KFNA 9ICWA 3UXNA 3RR7A 1L5UA 4KLMA 3LDAA 5DGAA 1NK4A 8ICQA 3C1YA 3JPNA 1S97A 2W9AA 5IINA 1U9LA 5F9LA 3C23A 4RT2A 3HP6A 3GQCA 5IIOA 4ED0A 4RQ4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DM7L 2YMLA 4F3OA 1BCOA 1HEKA 2HHVA 2XY8A 4CJPA 2OPQA 2BQRA 3LPUA 1S5JA 5M1QA 5EX5A 2BQ3A 5HRSA 3O3FA 1Q82O 2E1ZA 4RU9A 4ED3A 8ICZA 1J2MA 5AQTA 5AZJA 3KHLA 4BGAA 5IT9O 4KAZA 5HHHA 4L3QA 2KEYA 5F2RA 2W11A 1ZD5A 2QARA 1XC9A 3QE9Y 5D49A 1CXQA 4KHNA 2HBKA 5KFTA 5KT2A 1JMSA 2D0PA 1C0FA 5CZ2A 4BRDA 4E19A 2HBMA 5B5EU 1X66A 2FPLA 2ZIWA 1LAVA 3TARA 1YZ6A 2FLLA 1PUZA 4I2FA 4KBOA 5HOOA 4C8LA 4PKGA 1BUPA 4M7XA 1ZD3A 2ES6A 3SBGA 5HR7A 4ELUA 3H4DA 4RW7A 1YTAA 3L2UA 2O8EA 2EZYA 1TUYA 1OH8A 4F5OA 4X5VA 5KFRA 1LW0A 4C7ZA 2A1JA 3QNMA 3B6PA 4KLLA 3KHRA 3O8MA 2XIDA 3TABA 1VSLA 1V4TA 4HCCA 3Q7BA 3AVNA 1KFDA 2E4LA 3IRXA 2IVPA 4FS2A 2ALZA 1GOCA 3PR5B 2H3QA 3V9WA 1Z00B 4UATA 3KKRA 4FWMA 3FLCO 1C7YA 1LAWA 4H03B 3NVKA 5J0OA 5DB7A 2AH5A 2C2RA 2DGZA 1S1WA 5CEHA 4TQSA 3Q8LA 3CFPA 4CEZA 1NJXA 4BRKA 4BRAA 1N5WA 3E9PA 3WQTA 2JGUA 1QZ6A 3LDSA 2E1FA 3QO9A 1SXDA 8ICRA 1KQSM 2J6UA 5C2DA 3RMDA 4FJXA 1BIUA 3G25A 4FWKA 4C8NA 1X40A 4CF9A 4DV5K 4E7KA 2Z1HA 3WK4A 4IR1A 3NE6A 4FJJA 4QIWF 2RP5A 3BZKA 5L1IA 1XC3A 4LY7A 1UWBA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4F3O A;  2HHV A;  4M04 A;  3EW9 A;  4MF8 A;  2BQR A;  5J2K A;  4I27 A;  4HYK A;  2PFO A;  3GII A;  1HJP A;  2BQ3 A;  8ICO A;  4RU9 A;  4DO9 A;  4ED3 A;  7ICO A;  3Q8P B;  3HPO A;  5KFI A;  3V6K A;  2W9C B;  2AQ4 A;  3TFS A;  9ICA A;  8ICL A;  2HHQ A;  8ICZ A;  5KFJ A;  3KHL A;  1SL0 A;  3PX6 A;  4J9L A;  1BPZ A;  5HHH A;  3PX4 A;  1TV9 A;  9ICX A;  4ECZ A;  1XC9 A;  5J0U A;  3QE9 Y;  4NM2 A;  5D49 A;  4F4K A;  5KFT A;  5KT2 A;  1JMS A;  3MR2 A;  4QZI A;  4KMU A;  5CB1 A;  4F50 A;  1ZQX A;  1SZP A;  2FPL A;  3GFK B;  3TAR A;  2FLL A;  5EOZ A;  4I2F A;  1TK0 A;  4IQU A;  4YR3 A;  2FLP A;  2JEJ A;  4C8L A;  7ICR A;  3HT3 A;  1XSL A;  3EWA A;  1IM4 A;  4QZE A;  3RTV A;  4RUC A;  4DS4 A;  1QSY A;  2FMS A;  4ELU A;  7ICF A;  3H4D A;  1KSP A;  4BWM A;  4DF4 A;  5J2F A;  3GIK A;  4C8K A;  3B0X A;  3C1Z A;  4ZH4 A;  4F5O A;  4X5V A;  5KFR A;  5J0R A;  4MFC A;  2A1J A;  3H4B A;  3UQ2 A;  1RXV A;  4IRC A;  4GLX A;  3E2E A;  4F4Z A;  4KLL A;  3KHR A;  2KZZ A;  4FO6 A;  5KFX A;  5J2E A;  1KFD A;  3Q8R B; 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 4RPZ A;  2I9G A;  1K1S A;  3TI0 A;  2BDP A;  2NRR A;  2ZTE A;  1S9F A;  2W9C A;  4KN7 A;  8ICG A;  4YP3 A;  3TAN A;  2DPJ A;  5DG9 A;  1UA0 A;  3TFR A;  1KEJ A;  4ECR A;  1ZQL A;  3RB0 A;  5KFY A;  1ZQC A;  2BPC A;  1NK6 A;  5J2J A;  4BGD A;  4F5Q A;  4ED2 A;  2BCS A;  4Z6E A;  1KLN A;  2I1Q A;  5KFU A;  4YD2 A;  4JK1 A;  1KDH A;  4RZR A;  2VA3 A;  5IIL A;  3RJG A;  4PH5 A;  4M47 A;  4M9H A;  3K4G A;  5KFL A;  3H8W A;  5DDM A;  4PGQ A;  7ICG A;  2KN7 A;  1XS9 D;  4NLK A;  2W9B B;  5DG8 A;  2HHU A;  3JPT A;  9ICJ A;  2MAX A;  2NRZ A;  5L9X A;  4MEX A;  2JEF A;  4KN4 A;  1S0V A;  2HHS A;  3QEB Z;  1BGX T;  5DB8 A;  4I2I A;  4I29 A;  2PXI A;  1MQ2 A;  4EYH B;  5CA7 A;  4YG2 A;  1KFS A;  3ZDB A;  4KLO A;  3GIJ A;  5CHG A;  5J2D A;  4IR9 A;  3QEA Z;  4FBT A;  2ASL A;  2UVU A;  4RQ6 A;  2BPG A;  2GWS A;  3ISB A;  1ZQJ A;  4YVZ A;  8ICW A;  2BGW A;  4P2H A;  5KFN A;  5EWG A;  1BVS A;  8ICS A;  5J2G A;  5KFQ A;  4RQ2 A;  2HVH A;  1SKS A;  1Z00 A;  2FPM A;  4DFJ A;  1COO A;  3TAQ A;  2IMW P;  4DL6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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