2NRXA

Crystal structure of the c-terminal half of uvrc, in the presence of sulfate molecules
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
GLRKEALEELMKLLNMKDFPYRIEGIDISHLQGKYTVASLVVFEDGFPKKGDYRRYKIEQDHPDDYESIRTVVKRRYSKHPLPNLLFVDGGIGQVNAAIEALKEIGKDCPVVGLAKKEETVVFENREIHLPHDHPVLRLLVQIRDETHRFAVSYHRKRREKESLRSVLDNVPGIGPIRKKKLIEHFGSLENIRSASLEEIARVIGSTEIARRVLDIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
publication title Structure of the C-terminal half of UvrC reveals an RNase H endonuclease domain with an Argonaute-like catalytic triad.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UvrABC system protein C
total genus 75
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain 2nrxA02
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrxA01
4YXJA 4KLLA 3G6YA 4DLGA 4O5CA 7ICJA 4RQ5A 3RB0A 4IR9A 3JPQA 4P4MA 4ECXA 4DL3A 1NJYA 5KFRA 4M6WB 1TKDA 2HW3A 1MSWD 3JPNA 4DO9A 4DFPA 1JMSA 4YN4A 4PGXA 5L1KA 2C2RA 3UQ0A 4MF2A 8ICCA 9ICRA 2ASJA 2MAXA 4YD2A 5DG7A 4I2AA 4TQSA 1IXRA 5IINA 3RJFA 4MEXA 9ICNA 2XCPA 4I2BA 4LZDA 4Q43A 4YCXA 2XO7A 3ISDA 1S9FA 4DSFA 4DSEA 2OWOA 1T7PA 3PO4A 3EWAA 4QWBA 4PGQA 4I2GA 4Q44A 1ZQRA 1QTMA 1X2IA 1KFSA 4YXMA 4ECVA 2NRTA 1UA0A 4PPXA 2FMQA 4CCHA 1D9DA 9ICBA 2JEIA 3T5KA 3Q8MA 4EYIB 2BPCA 1CEZA 3PW0A 3M8SA 3OSNA 4UB3A 1MQ3A 4I2FA 1S76D 5L9XA 3TAQA 2J6SA 7ICPA 7ICVA 4UB2A 8ICPA 3FYHA 2BKEA 5J0SA 4M9NA 3PX0A 3AUOA 1PZNA 5KFDA 4RQ6A 3IHQB 2KTQA 2BHNA 1NOMA 4IRCA 5IIOA 3PNCA 4Z6EA 4ECZA 1D8LA 3PMLA 1QSYA 4M9LA 4DSKA 2ZJAA 4RNOA 3ISCA 4EBCA 2XCAA 9ICKA 4JV0A 3JPPA 2C2DA 1NJWA 3PMNA 4C8KA 4MF8A 1NKCA 1ZQPA 3TFSA 4PHDA 4IRKA 2HVHA 4UAYA 3MBYA 2R8HA 7ICOA 4KLGA 8ICYA 5IIJA 1JX4A 3GV5B 5KFJA 4TUQA 3PY8A 3RR7A 3C1ZA 5DBCA 4ECYA 5C5JA 4YG2A 4ECRA 2ATLA 1NK4A 1S0MA 5KTQA 2ZJ5A 3B0YA 2BCVA 9ICAA 1ZETA 2FPMA 8ICJA 4BXOA 5KFGA 4NLZA 7ICTA 5HNKA 3QZ8A 4KLMA 2BCRA 4BGDA 3MR2A 2NRXA 4B9LA 3QE9Y 2ASLA 4DQPA 8ICOA 5D4BA 2R8KA 9ICGA 1ZQUA 2V4RA 2UVWA 4R8UA 3C5FA 4BXOB 4BWJA 4F4ZA 1XU4A 4Z6DA 4YMOA 3GIIA 4I2CA 2BPFA 2MUTA 3E2EA 4RT2A 5DBBA 4QZ8A 4I28A 3ZDCA 3RB4A 1ZQLA 2XC9A 4DOBA 4BWMA 2KFNA 1TAQA 3ZD8A 3MGHA 3MR3A 3ZDDA 1V9PA 7ICMA 7ICKA 5KFCA 4UB5A 3N4MB 2IMWP 2MUTB 4NY8A 2P6UA 3LK9A 1S10A 4MFFA 4F92B 4B9VA 8ICNA 4UAWA 4MEYA 5KFHA 1RXWA 2KZZA 4F93B 3V6JA 4TUSA 3BQ1A 3TQ1A 4ED8A 7ICNA 3SI8A 4DFJA 4XQ8A 3RJJA 4QZAA 1ZQKA 2R8JA 1EXNA 3LDAA 4P4OA 5KT4A 4IQVA 4QZHA 3HP6A 1B43A 4EYHB 5KFIA 3OSPA 1LB2B 4O3OA 2Y1JA 3MGIA 4GXJA 4RUCA 1BPZA 5DQHA 5J2AA 2DPIA 4I2DA 4JUZA 1LV5A 4F4YA 4C8NA 3AU2A 5KFWA 3Q8QB 1UA1A 5BPCA 2FPLA 1BPXA 2BCQA 4JK1A 7ICHA 3GDXA 3T5HA 3TI0A 4KLJA 4J9LA 2HHVA 1KLNA 4O0IA 2NRRA 3UXOA 1JXEA 3BQTA 4ZH4A 4DL4A 4ECQA 4YMNA 1ZQJA 4KTQA 1ZQYA 5J0QA 5DGAA 3NGDA 5DLGA 5KFAA 3HWTA 5KFMA 4QZGA 4FS2A 1ZYQA 2VA2A 4Q8FA 1Z00B 2W9CA 2NRZA 2AQ4A 3RJHA 7ICFA 3QEAZ 4GLXA 4RQ8A 4YP3A 4IQTA 1K1SA 4KITB 2JZBA 5KT5A 3ISBA 4DQIA 2KZ3A 3EZ5A 5BOMA 4MFAA 1XWLA 4F5QA 2XY7A 1NK5A 2LYHA 4M47A 1XSPA 5KT6A 3KHHA 3GQCA 5DG8A 4RT3A 4RPXA 4J9QA 4RPYA 1COOA 3PW5A 4YFKA 4J9RA 1RYRA 5KFXA 3SV3A 3AU6A 2ZJ8A 3FDSA 5HMMA 2F1IA 3V7KA 9ICQA 4DSIA 5KG0A 3JPSA 4RQ4A 2W8LA 1CUKA 5IIMA 2NRWA 3TAPA 9ICOA 3HT3A 3C21A 1L3TA 5JUMA 4DF8A 2ALZA 4NLGA 4K4GA 5J2IA 1WCNA 9ICXA 4O3QA 4QZ9A 5CWRA 5KFQA 1XS9D 4DFMA 1SL0A 1ZQAA 1S97A 4NLKA 4R64A 4XA5A 3LWLA 1TV9A 2HHSA 2B21A 5CP2A 3BJYA 2IHMA 8ICEA 1BPEA 2FLNA 4ECUA 3KTQA 5CB1A 4RQ0A 3RBEA 3KHLA 4M0AA 4C8MA 3SV4A 2PFQA 1RPLA 1ZQTA 4EBDA 3THVA 4JWMA 5F9LA 3PX6A 4KLIA 4JWNA 3GV8B 4I2IA 3V7LA 3N97B 3PR5B 3JPOA 1TVAA 4B9TA 8ICGA 5CJ7A 3RTVA 2W9AA 4J9SA 2XY6A 4O5KA 2H5XA 4XRHA 2ASDA 5DGBA 2BQRA 5KG3A 4RUAA 1A76A 3C23A 5J0UA 1ZQSA 4B9UA 4I27A 1A77A 4QWDA 5HMLA 1UT8A 4FO6A 1L3UA 4IQWA 7ICGA 1ZJMA 4F2RA 2DFLA 8ICXA 7ICSA 5J2FA 4IQUA 3HPOA 2HHUA 4HYKA 4R65A 4DOCA 4Q45A 3PVXA 3RH5A 1KFTA 2R8GA 3PW4A 2J6TA 4KN4A 4DS5A 4EZ9A 1S77D 9ICCA 2RDIA 5CR0A 4M9HA 3ORYA 4GXKA 3MABA 1NK0A 4KLDA 2FLLA 7ICLA 1S0OA 2UVUA 2W9MA 1SL2A 5L1JA 4DL2A 4RNMA 3GIKA 4QZFA 2W8KA 4J9NA 5KFEA 2F1JA 3NTUA 1Z3EB 5L1LA 5DQIA 3PV8A 1U45A 2RDJA 5J0XA 4RQ1A 4P2HA 3UQ2A 4I2JA 5KFPA 5J2GA 5KFYA 5J0RA 5DQGA 2BQUA 4R8UB 5J0TA 5KFOA 3C2LA 5J2DA 1ZQOA 3MR5A 1RZTA 2IHNA 3EYZA 1RYSA 9ICPA 1TK0A 5DB6A 4JV2A 4KLTA 1KEJA 1HUOA 2J6UA 2ISOA 1UT5A 2BR0A 2JEFA 3GV7B 3H4DA 1NK9A 2KFZA 3OHAA 4B9NA 4Z6FA 1NJZA 2PI4A 7ICUA 5KG7A 1KTQA 2HHQA 2ZUDA 2AGPA 3C5GA 3B0XA 7ICQA 3PW7A 1T8EA 2F1HA 1ZQEA 8ICRA 1ZQMA 2BGWA 4PHPA 1HJPA 4F2SA 4F5RA 1BPBA 4DQSA 3OJUA 1U47A 2VA3A 4FBUA 4DS4A 1H38A 4F3OA 1L3VA 4RPZA 2Q0ZX 4EZ6A 3KHGA 3GIMA 4F5NA 2XY5A 1U9LA 2Y1IA 8ICBA 4BDPA 3GIJA 4EBEA 3BQ0A 3H8WA 4PGYA 3RH4A 3UXNA 3H40A 3RAXA 3ZDBA 4Z6CA 3G6VA 8ICIA 2A1JA 3T5LA 1RXVA 8ICUA 3MFHA 1N56A 2V4QA 1NKBA 1NJXA 1QSSA 2I9GA 4NLNA 3RJGA 3BQ2A 5EWGA 5KG1A 2M9NA 3M9OB 4TURA 3V72A 2C2EA 1BGXT 4YR3A 4KLHA 2A1JB 3MR6A 4GXIA 3K4GA 3RJEA 4O3PA 2PI5A 4F50A 2NRVA 5J2HA 1ZQGA 1ZQDA 2BCSA 1XSNA 2FMPA 9ICUA 5KFFA 9ICEA 5J0PA 4UAZA 2WTFA 4DSLA 4KN7A 2W9CB 3BDPA 9ICFA 4M6WA 4RU9A 3V6HA 8ICWA 4F91B 3SYZA 2KZMA 5D49A 1ZQVA 5HP4A 2JZBB 2AQ0A 4J9OA 2HHWA 4DWIA 8ICMA 5BOLA 5KFVA 3SZ2A 4ED7A 3RBDA 3LWMA 3GFKB 4C8OA 4RNNA 4EEYA 1X9WA 3GILA 5EWFA 1ZQHA 2GWSA 3EPIA 2UVRA 5J2CA 4QZCA 2BQ3A 1NKEA 4E0DA 5KT3A 1SZPA 5TZVA 4DSJA 3IM1A 3V6KA 1D8YA 2BPGA 2IBKA 4QWAA 4ED3A 1NK8A 4GC6A 2HVIA 9ICWA 4NM1A 3H7IA 2C28A 1DOQA 3ETLA 3KHRA 4ECWA 4Q8EA 8ICFA 4DFKA 4YVZA 4B9MA 4I2HA 5DBAA 1IM4A 2PFOA 2DPJA 4M9JA 3Q8SB 4F5PA 4ELTA 2P6RA 1WCLA 5CA7A 4TUPA 2R8IA 1ZJNA 4F4KA 2IA6A 4M04A 2ZTDA 1KSPA 5KG5A 4B9SA 4PHAA 9ICLA 4I2EA 1AROP 4QZEA 1JN3A 8ICAA 4RQ7A 3ZDEA 1ZQIA 3M9NB 4DLEA 4LVSA 4DL6A 2ZTEA 4QZBA 9ICVA 3H8JA 4RZRA 3C65A 3RAQA 1SKWA 3Q8RB 5KG2A 5KFBA 3EW9A 4QW9A 5EWEA 4J9PA 4XUSA 7ICRA 3V7JA 1ZQZA 4ECTA 3TARA 4LZGA 5KFLA 1HUZA 3Q8LA 5KT7A 3K75D 4DOAA 4ED2A 2BDPA 4YR2A 4O5EA 4YD1A 5J29A 5DB8A 4KMUA 4F4WA 4ELVA 8ICSA 9ICSA 4UB1A 3PO5A 5KG4A 4FBTA 5KFUA 8ICTA 1TFRA 4NXZA 5IIKA 3H4BA 4YMMA 5CHGA 4O9MA 3C1YA 4YQWA 3G6XA 3RRHA 1T3NA 3ZDAA 8ICZA 3PX4A 2ISPA 4O3SA 1ZQQA 7ICEA 2V9WA 3RB6A 4R66A 2XGQA 3ZD9A 1KDHA 1ZQNA 4M2YA 2HHTA 4ED1A 4UB4A 4F5OA 4J9KA 5KFSA 5J0YA 5J2BA 2AJQA 1X9MA 2AGOA 3M9MB 3Q8PB 2UVVA 2AU0A 5F9NA 4M9GA 3MDCA 3HW8A 3TFRA 4F8RA 1TAUA 1ZQCA 3HX0A 4JV1A 2PFNA 4KLUA 4MFCA 4DL5A 4KLQA 1BPDA 4G3IA 4FS1A 1ZQFA 1QLNA 4DQRA 3C2KA 5DB9A 4KLSA 4O3RA 1NK6A 2JEJA 1L3SA 1JIHA 5J0WA 8ICLA 5J2KA 1N48A 4DEZA 2ZTCA 1SL1A 2FLPA 1KRPA 2FMSA 5KT2A 2I1QA 1S0NA 8ICVA 3RJIA 9ICJA 1ZQWA 5J2JA 5IIIA 5DDYA 1U49A 1MQ2A 3EPGA 1T4GA 1BPYA 3H8SA 2C22A 4QWCA 4KLOA 2KN7A 4QW8A 3OHBA 2XGPA 2HHXA 4DF4A 3M8RA 4DQQA 3JPRA 2FPKA 4IR1A 4J9MA 3UXPA 3RH6A 5DKWA 1JXLA 4KLFA 1C7YA 5L1IA 4C8LA 4QWEA 3T5JA 4RQ3A 4DL7A 9ICIA 2VA8A 1DGSA 1NK7A 8ICQA 4GC7A 3QEBZ 2PXIA 5J0OA 1S0VA 5KFZA 9ICMA 3C2MA 3T3FA 4PHEA 4P4PA 3JPTA 1D9FA 4PH5A 4YR0A 5D46A 3RB3A 1XSLA 1L5UA 4QZDA 4X5VA 2PFPA 2VANA 1U4BA 5EOZA 5DDMA 4QZIA 4TQRA 4UBCA 4ED6A 3OGUA 3TANA 3RR8A 7ICIA 4UBBA 2W9BA 3Q8KA 1XO1A 9ICTA 3MFIA 2AGQA 1QSLA 3RJKA 4R63A 1U48A 5HHIA 2JEGA 5KFNA 5DB7A 5J2EA 5KFKA 1TK5A 3RRGA 9ICHA 5DLFA 1B22A 3PR4A 2BCUA 1X9SA 1MC8A 4I29A 4IRDA 3QZ7A 4ECSA 4ED0A 1SKSA 2W9BB 4O3NA 8ICKA 1BVSA 1K1QA 1KFDA 1Z00A 3OJSA 4F4XA 4UQGA 3UPQA 1Y88A 4NM2A 5KG6A 1ZQXA 5HHHA 1TK8A 2ZUCA 3MDAA 1XC9A 1ZQBA 1SKRA 2P66A 4ELUA 4K4IA 5DG9A 4RQ2A 3PW2A 4K4HA 2ZUBA 4KLEA 5IILA 5KFTA 8ICHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D0PA 4FM0A 4DLGA 4O5CA 7ICJA 3MN6A 3HM8A 2W40A 1C0TA 2HW3A 1HQEA 4P4MA 4KX5A 4M6WB 1JCEA 3JPNA 4IFEA 4YN4A 4PGXA 4MF2A 3OTOK 1QVGM 2LSNA 1JI7A 3SMSA 2MAXA 3O3FA 5DG7A 1NGBA 1LCUA 4CF9A 2QARA 2ATQA 4JI2K 5AKLA 3DLBA 3VA0A 1T7PA 3I0RA 3PO4A 4Y2UA 2CH6A 3OS1A 1QTMA 1X2IA 1KFSA 4CZLA 4PPXA 1BQNA 2FMQA 3V9XA 5ALDA 1VSFA 2JEIA 3Q8MA 4TSXA 4CEBA 4GFJA 3QERA 3PW0A 1JUDA 3OSNA 5HP1A 4HAIA 4CHQA 2OTLN 4UB2A 8ICPA 3M1YA 1U2VA 4KHUA 3FYHA 5K4LA 1Q18A 2BKEA 1COKA 4LJXA 3ENBA 1JJ2M 1LKYA 2WONA 3K1RB 2FI1A 4X65K 4JMUA 2P9KB 4US9A 1Z1VA 3M7DA 1QSYA 2A1RA 3S9HA 4IL6U 2G8HA 4KAZA 2R18A 2Z7JA 3I8BA 3ISCA 3O4WA 3R9KA 1CXUA 4PKIA 4RTFD 3WKBA 3OYIA 3T19A 2QW9A 4DV6K 3L5KA 3TTFA 5AFUA 4FXDA 2JH7A 1TKZA 2ZQBA 3G71N 4BE2A 3TAEA 4UAYA 3MBYA 4H0TB 1JX4A 2P9LB 3GV5B 5KFJA 4C4RA 4UASA 1VSIA 1KVBA 4ECYA 4AH9A 5C5JA 1S0MA 1NK4A 1VK0A 4M42A 2KKVA 4CF4A 3WKDA 3L3UA 9ICAA 1KD1O 2FPMA 4BXOA 5HNKA 3SJJA 4KLMA 3H8MA 1RT7A 3MR2A 3GU3A 3QYPA 4BGBA 5BRHA 2R8KA 1XQSC 3MEGA 4PZOA 2V4RA 3AQFA 4O44A 2O8DA 4E3SA 4CD1A 4F4ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4YXJ A;  4KLL A;  3G6Y A;  4DLG A;  4O5C A;  7ICJ A;  4RQ5 A;  3RB0 A;  4IR9 A;  3JPQ A;  4P4M A;  4ECX A;  4DL3 A;  1NJY A;  5KFR A;  4M6W B;  1TKD A;  2HW3 A;  1MSW D;  3JPN A;  4DO9 A;  4DFP A;  1JMS A;  4YN4 A;  4PGX A;  5L1K A;  2C2R A;  3UQ0 A;  4MF2 A;  8ICC A;  9ICR A;  2ASJ A;  2MAX A;  4YD2 A;  5DG7 A;  4I2A A;  4TQS A;  1IXR A;  5IIN A;  3RJF A;  4MEX A;  9ICN A;  2XCP A;  4I2B A;  4LZD A;  4Q43 A;  4YCX A;  2XO7 A;  3ISD A;  1S9F A;  4DSF A;  4DSE A;  2OWO A;  1T7P A;  3PO4 A;  3EWA A;  4QWB A;  4PGQ A;  4I2G A;  4Q44 A;  1ZQR A;  1QTM A;  1X2I A;  1KFS A;  4YXM A;  4ECV A;  2NRT A;  1UA0 A;  4PPX A;  2FMQ A;  4CCH A;  1D9D A;  9ICB A;  2JEI A;  3T5K A;  3Q8M A;  4EYI B;  2BPC A;  1CEZ A;  3PW0 A;  3M8S A;  3OSN A;  4UB3 A;  1MQ3 A;  4I2F A;  1S76 D;  5L9X A;  3TAQ A;  2J6S A;  7ICP A;  7ICV A;  4UB2 A;  8ICP A;  3FYH A;  2BKE A;  5J0S A;  4M9N A;  3PX0 A;  3AUO A;  1PZN A;  5KFD A;  4RQ6 A;  3IHQ B;  2KTQ A;  2BHN A;  1NOM A;  4IRC A;  5IIO A;  3PNC A;  4Z6E A;  4ECZ A;  1D8L A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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