2NRXA

Crystal structure of the c-terminal half of uvrc, in the presence of sulfate molecules
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
GLRKEALEELMKLLNMKDFPYRIEGIDISHLQGKYTVASLVVFEDGFPKKGDYRRYKIEQDHPDDYESIRTVVKRRYSKHPLPNLLFVDGGIGQVNAAIEALKEIGKDCPVVGLAKKEETVVFENREIHLPHDHPVLRLLVQIRDETHRFAVSYHRKRREKESLRSVLDNVPGIGPIRKKKLIEHFGSLENIRSASLEEIARVIGSTEIARRVLDIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
publication title Structure of the C-terminal half of UvrC reveals an RNase H endonuclease domain with an Argonaute-like catalytic triad.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UvrABC system protein C
total genus 75
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain 2nrxA02
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrxA01
4IRDA 5KFXA 4UB2A 4DWIA 4NLKA 2FMQA 2RDJA 4DSEA 3AU6A 4P2HA 5KFBA 4TQSA 5JUMA 3G6YA 5C5JA 5J0SA 7ICLA 1ZQGA 4MEYA 4QWDA 3RB0A 1ZQYA 3V7JA 4RUCA 4RT3A 2OWOA 1JIHA 5KFZA 1L3SA 5KFUA 1BPZA 2AGPA 5CR0A 1K1QA 7ICMA 7ICVA 4F92B 5L1JA 2V9WA 4DQIA 5J0TA 2W9AA 2XC9A 5DG7A 3PO5A 4EBCA 1A76A 4YMOA 4NM1A 1Z00B 4QWEA 3PMNA 5KT2A 4KLFA 3C23A 5DQIA 4P4MA 3AUOA 2KTQA 4DO9A 4NM2A 2AQ4A 3V7LA 1SL0A 1KFSA 1BVSA 2JZBB 3ZD8A 4F5NA 1ZQBA 8ICEA 4PHAA 1A77A 3KHRA 8ICZA 2P6UA 4QW8A 1ZQFA 4QZAA 4J9RA 5CWRA 2H5XA 2NRXA 5KG0A 4QW9A 9ICNA 1B22A 1V9PA 4NY8A 2NRTA 2BCQA 1QSLA 1BPXA 4NLGA 4PGQA 5KG1A 3BQTA 3HW8A 5HP4A 4B9NA 4I27A 2HHXA 1TK8A 3RB4A 4FS2A 3QE9Y 2UVUA 4MF2A 1S77D 3TARA 3ZDAA 4ELUA 3SI8A 2R8KA 1ZQEA 4GC6A 5KFMA 2KZMA 3UXPA 4DL4A 1ZQUA 4J9QA 4HYKA 5EOZA 4EZ6A 3BJYA 3GIMA 2IBKA 4J9LA 4EBDA 9ICRA 4B9LA 9ICBA 4ECYA 1XSNA 4RNMA 5DGAA 1U4BA 3OHBA 4YXMA 2BR0A 4O0IA 3HT3A 3MBYA 1TAUA 1NK7A 4J9MA 5J2EA 2JEJA 3C2MA 2NRVA 3V7KA 4F5RA 4ELTA 4FBTA 4Q8FA 3PR5B 5J0PA 2VA8A 1U49A 4ECUA 2IHMA 4RNNA 4GXJA 7ICFA 2XY6A 1UT8A 5KG5A 4RPXA 8ICQA 4DOAA 9ICSA 3MR5A 4YD2A 3HX0A 4KLSA 3GILA 4QZIA 4C8KA 4KN7A 8ICSA 5KFWA 8ICNA 4DQRA 4ECWA 8ICPA 2ZJAA 2AQ0A 4F93B 2Y1JA 2ASDA 4K4GA 5KT7A 4DL7A 3ZDCA 4F4YA 5KT6A 3EPIA 4F5QA 4I2EA 5IIIA 4EYHB 3FYHA 1ZQSA 7ICSA 5DG9A 1MSWD 3EWAA 3MFHA 1ZQRA 4B9UA 4DOBA 2ZTCA 3RJEA 2P66A 2ZTDA 3E2EA 4JK1A 4BWJA 1D8LA 3OJSA 3PW5A 1NJXA 4ECZA 4PPXA 2KN7A 5EWFA 3BQ2A 5DBBA 4PHEA 4RQ3A 4YQWA 2XGPA 3GQCA 3RH4A 3QEAZ 3B0XA 5DKWA 3H8WA 4DS4A 2AGOA 1BPBA 1X9WA 1KFTA 4YMNA 1BPYA 5KFHA 1ZQXA 2PFPA 3HWTA 3GDXA 1RYSA 8ICJA 3RJIA 3PMLA 4UBCA 8ICYA 9ICTA 5J0YA 1ZQLA 7ICGA 5HMLA 1B43A 1ZQPA 4F5PA 4IQUA 4Z6DA 2R8GA 4MFAA 2DPIA 7ICHA 2JEGA 4LZDA 5DQGA 9ICLA 2DPJA 5F9LA 4GXKA 4KLEA 5J2IA 1NKBA 1NK0A 1LV5A 3EYZA 4LVSA 4O9MA 3C1ZA 4M9GA 2A1JB 4GLXA 5KFSA 1NJZA 4IQVA 5J2BA 1ZQJA 4IR1A 5KFFA 3RJKA 4R64A 3BQ0A 4RZRA 1TAQA 4QZ9A 3Q8KA 4I2AA 8ICKA 4CCHA 2R8JA 4ECTA 3MR2A 3MGIA 4RQ8A 4O5CA 4QZBA 8ICLA 2AJQA 8ICBA 9ICMA 2NRZA 3C65A 5D49A 1ZQIA 1UT5A 4RT2A 4G3IA 4R66A 9ICWA 4XQ8A 3PNCA 2BCSA 4IQTA 7ICTA 8ICAA 1ZQOA 2ZUCA 5CB1A 4RQ7A 8ICRA 1Z3EB 4Q45A 4ED8A 5CP2A 1S0OA 1NJYA 4KLGA 2ZUDA 5KT3A 4TUPA 5DDYA 4O3RA 4QZCA 4QWCA 4KLUA 9ICUA 4F5OA 5J0UA 4I28A 3H4DA 2HHTA 9ICQA 3H8SA 4RQ2A 3OHAA 4R63A 3K75D 2XCAA 3UQ0A 4ED1A 3RJJA 4FBUA 1K1SA 3ZDBA 3ZD9A 5DB9A 2PFOA 5KFDA 2BDPA 5DLFA 4M6WA 1T3NA 2ZJ8A 3UXOA 3LWMA 2FLNA 5KT5A 3RAXA 2C22A 5KFJA 4GC7A 4O3PA 1T8EA 4M04A 2BQRA 4ED2A 4NLZA 2F1IA 1L5UA 5F9NA 1ZQKA 4KLHA 1TK0A 2ISOA 1ZJMA 3Q8LA 4DFMA 5J0XA 1SZPA 3T5HA 5TZVA 4YD1A 1BPEA 1EXNA 1X9SA 2ASLA 5KFIA 3V6JA 1U45A 3RTVA 8ICMA 3GIJA 4C8OA 2C2EA 9ICAA 1ZETA 2LYHA 4DSLA 1QSSA 9ICGA 5J2JA 4K4IA 1KTQA 2F1JA 4DFJA 8ICOA 2MUTA 3TI0A 5BOMA 4J9NA 4ED7A 3RR7A 5IIOA 1LB2B 2HVIA 5KFVA 4B9MA 2V4QA 3TFSA 1TKDA 1X2IA 4R8UA 5KFAA 5DDMA 1BPDA 2RDIA 2BCVA 2BKEA 5J2CA 2IHNA 4C8LA 1RZTA 1KDHA 4JV0A 8ICGA 1U47A 4IQWA 3ORYA 3V6HA 3RJHA 1AROP 3SZ2A 3V72A 3PY8A 4PH5A 2P6RA 1SKRA 4KLIA 2C2DA 4YG2A 3LK9A 3OSPA 4B9VA 8ICHA 5KFQA 3SYZA 4XUSA 8ICFA 4DSIA 4QZ8A 1ZYQA 4DQSA 1PZNA 3QZ7A 2A1JA 4M6WB 3M8RA 1ZJNA 1S0VA 5CHGA 9ICHA 1ZQNA 9ICVA 2XO7A 1MC8A 4QZHA 3RAQA 3EW9A 4DFKA 5KG6A 4RQ5A 2XGQA 3JPNA 3JPTA 4Q8EA 2VA3A 5DG8A 2HVHA 8ICXA 3T5JA 3H40A 3KHHA 3PR4A 3RJGA 1S9FA 4IR9A 9ICEA 5J2DA 4KLQA 4YR2A 2M9NA 3QZ8A 2PFNA 7ICQA 3PW2A 4UAYA 5HNKA 5IILA 2MUTB 3GFKB 4RPYA 3RB3A 1KLNA 2R8IA 4DQQA 3HP6A 4KLOA 9ICCA 3TFRA 3KHGA 3FDSA 4R8UB 1S0NA 4BGDA 3MDCA 1NK4A 1N56A 3Q8MA 1UA0A 4BXOA 2VA2A 5DBCA 1IXRA 1XS9D 3LDAA 3THVA 7ICPA 1UA1A 4RQ0A 3OSNA 3OGUA 3MABA 3TAPA 9ICJA 1HUOA 3RBEA 4YP3A 3GIIA 4I2GA 1CUKA 2ZTEA 4DL2A 3RH5A 2I1QA 3N97B 5D46A 3H8JA 2XY7A 1NKCA 4KLMA 4MEXA 3JPRA 3V6KA 3PV8A 4J9SA 1NK8A 4M9HA 4UB1A 4XA5A 1ZQDA 2ATLA 4O3SA 3RJFA 2NRWA 1S10A 3PO4A 5BOLA 5KFKA 3EPGA 4M2YA 4M9JA 4QWBA 4TUSA 3JPSA 1ZQMA 4P4PA 1WCNA 1NJWA 4ELVA 4DLGA 4DF8A 1DOQA 1SKSA 2R8HA 1RXVA 5DB6A 4UBBA 1L3TA 1ZQTA 4RQ1A 2I9GA 1T7PA 4F2SA 5J0WA 5KFEA 4KLDA 1XO1A 4O3OA 3PW7A 1SKWA 1NKEA 1U9LA 2W8KA 4YXJA 5L1IA 1L3UA 5L1LA 4JWMA 1QLNA 2W9CB 5EWGA 1NOMA 5IIMA 1HJPA 1NK6A 4YN4A 4BDPA 4O5EA 4DSJA 5KFRA 4K4HA 2F1HA 5DBAA 1KFDA 2ZJ5A 2KFZA 4BXOB 2HHWA 2J6TA 2HHQA 4RU9A 3ISBA 4ECQA 1Y88A 5J0QA 4ECSA 4QZDA 3Q8SB 4NLNA 3SV4A 4ED3A 4YFKA 1TK5A 4C8NA 4UB3A 2W9BB 2PFQA 7ICRA 4P4OA 3K4GA 5EWEA 4MFCA 3H4BA 4EZ9A 1JMSA 3RR8A 2HHSA 4I29A 4IRKA 4MF8A 3GIKA 1TV9A 1D8YA 1ZQWA 1U48A 3ZDDA 2J6SA 2W8LA 4JWNA 4TQRA 3UPQA 3PW0A 3BDPA 7ICUA 2BPFA 4DLEA 2BCUA 4DL3A 8ICUA 1ZQVA 4QZFA 9ICFA 5KFNA 3C5FA 4J9PA 3T5LA 3MR6A 3MDAA 4I2IA 4F4XA 3PX6A 4KTQA 4DSFA 2BQ3A 4FO6A 8ICCA 5BPCA 3RRHA 4F4KA 4DQPA 1JN3A 4RPZA 5KFOA 4ED6A 2FLPA 5KTQA 7ICKA 1NK5A 3JPQA 3UQ2A 3C21A 3ZDEA 1S76D 3TANA 5KG3A 3RH6A 1SL2A 2J6UA 3MFIA 5D4BA 4UB5A 1COOA 5J2AA 4RNOA 4I2HA 3KTQA 3RRGA 3LWLA 3T5KA 4O3QA 5KFCA 1QSYA 2NRRA 4XRHA 4YVZA 4YCXA 4UAZA 5DLGA 2V4RA 1KRPA 1XSLA 1QTMA 4BWMA 1SL1A 3Q8QB 5KFYA 4UAWA 3GV5B 3RB6A 4NXZA 2FMPA 4RQ6A 5J2KA 5HHHA 2BHNA 2UVWA 7ICEA 4DOCA 2UVVA 4KLTA 4QZEA 2MAXA 4RQ4A 4DL5A 4I2BA 5DB7A 3G6VA 2AU0A 1MQ2A 1JX4A 3UXNA 3ETLA 5DQHA 3ISDA 4F4WA 4DEZA 1ZQHA 1CEZA 2ALZA 3BQ1A 9ICXA 8ICWA 4I2JA 3GV7B 4LZGA 2VANA 3MR3A 1KSPA 3JPPA 5CA7A 4B9SA 9ICIA 3T3FA 4ECVA 3G6XA 2JEFA 4EEYA 1DGSA 5J2FA 1IM4A 1NK9A 2BPGA 4EYIB 4DSKA 2KFNA 1TFRA 2DFLA 1S0MA 1WCLA 2W9MA 1MQ3A 1C7YA 1D9DA 2FPMA 1JXLA 8ICTA 4C8MA 4DS5A 5J2GA 3JPOA 5J0RA 3MGHA 3PX4A 4Z6CA 2BQUA 3PW4A 4I2CA 4Q43A 2W9CA 5L1KA 2ISPA 2UVRA 3H7IA 4GXIA 2HW3A 3C5GA 4DF4A 1D9FA 5KFPA 1T4GA 3OJUA 3ISCA 5KFGA 5J0OA 2ZUBA 3NTUA 5IIJA 1ZQCA 2HHVA 5CJ7A 1RYRA 9ICOA 5KG2A 4TUQA 2BGWA 1H38A 3TQ1A 2KZZA 1S97A 3PVXA 4EBEA 3QEBZ 1X9MA 4F4ZA 2C2RA 4KLLA 4UB4A 2W9BA 5J29A 1JXEA 1XWLA 2Y1IA 1XU4A 4O3NA 2XCPA 3HPOA 4ECRA 1ZQZA 4O5KA 4ECXA 3C2LA 7ICNA 4J9OA 4E0DA 1ZQAA 4KITB 3Q8RB 4J9KA 8ICVA 4RUAA 1ZQQA 4Q44A 4PGXA 5KG4A 4F91B 2PI4A 4JV2A 9ICPA 5KFLA 4PHPA 4PHDA 5J2HA 2B21A 2IA6A 5DGBA 9ICKA 3M9OB 7ICOA 4M9LA 4PGYA 1N48A 1HUZA 5HMMA 2ASJA 3GV8B 2GWSA 1XSPA 5IIKA 8ICIA 3RBDA 4ZH4A 1TVAA 4R65A 4YR3A 4UQGA 4JV1A 3M8SA 4F3OA 1L3VA 3B0YA 7ICIA 4QWAA 5DB8A 5KG7A 4IRCA 4F8RA 4ED0A 5IINA 4DL6A 3M9NB 3IHQB 4X5VA 2JEIA 5KFTA 4F50A 2PXIA 4DFPA 2PI5A 2AGQA 4I2FA 3C2KA 2FPKA 4Z6FA 1BGXT 2WTFA 2BCRA 3Q8PB 1Z00A 3AU2A 1RPLA 4YMMA 4I2DA 2FPLA 5L9XA 2KZ3A 3N4MB 2FMSA 2HHUA 3KHLA 4M9NA 2JZBA 4M47A 3TAQA 4KLJA 3C1YA 1KEJA 4FS1A 7ICJA 2FLLA 3EZ5A 4TURA 4F2RA 3SV3A 4B9TA 4JUZA 4Z6EA 3PX0A 4QZGA 1RXWA 4KN4A 3IM1A 3NGDA 4M0AA 2BPCA 4KMUA 2XY5A 2Q0ZX 5KT4A 4YR0A 1XC9A 4MFFA 2IMWP 5HHIA 2C28A 3M9MB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IRDA 2QKKA 2QWMA 3HRDD 2FBTA 2QB0B 2OPSA 3V1QA 5AZJA 4N5SA 5BN9A 5JUMA 2PBDA 4H0XB 4JKAA 4CF4A 3VQAA 7ICLA 3O3GA 4PL7A 2Q0UA 3WU2U 4RUCA 5HR6A 3CC2N 1JIHA 3CCLN 3N7RC 5EE0A 3UE5A 5CYQA 1DGKN 3FM9A 2AGPA 3CHWA 3DXMB 4DQIA 4PKGA 3D2FB 4M3XA 3MMVA 1Z00B 1LAVA 2AP1A 2YJEA 4P4MA 3M5RA 3AUOA 3VQPA 2OANA 3HYFA 4FJIA 3SQ2A 3A0BU 1SL0A 1KFSA 1QE1A 4CJTA 4FZYA 4F5NA 3R1XA 2P6UA 2DFFA 4CDGA 2D0OA 4IO9L 2BUPA 2O4GA 3C29A 5ALVA 3VF2A 9ICNA 2Q1NA 1KW4A 3M6ZA 5ALKA 1BPXA 3LZIA 4NLGA 1QQ6A 4QS8A 2ZIXB 1X66A 4B9NA 3GBTA 4IBNA 1HYSA 2LPEA 3RB4A 4NO7A 1S77D 3O0FA 3L2RA 2OZSA 4GC6A 3OYLA 1GOCA 4NLCA 3D6RA 1Q81O 3QETA 1VQMN 4J9QA 2CH6A 3DLBA 4EZ6A 3VQ5A 1V4TA 2IBKA 4EBDA 2WONA 5HRNA 4DV3K 5AZJB 3OHBA 1YJNN 1EWRA 3WKEA 4H0YB 2KE7A 4KB1A 2BGGA 5AQNA 2PZSA 3VA0A 4PY5A 3C2MA 3CJAA 2VA8A 4PQUA 1EWQA 2RLTA 4RNNA 4J2BA 2VCPA 5BPNA 2VKQA 1VK0A 4IDKA 2QWOA 4CJSA 2P51A 4BRIA 5B8HA 1SXDA 4KLSA 3I28A 4MO4A 3IRXA 5ALWA 1DGJA 3JAMO 2JLEA 3Q7BA 2LSNA 3I1YA 3SJJA 4B3RK 5KFWA 4ECWA 4HCCA 3ZT2A 4LJXA 2ZJAA 4W5QA 2ASDA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4IRD A;  5KFX A;  4UB2 A;  4DWI A;  4NLK A;  2FMQ A;  2RDJ A;  4DSE A;  3AU6 A;  4P2H A;  5KFB A;  4TQS A;  5JUM A;  3G6Y A;  5C5J A;  5J0S A;  7ICL A;  1ZQG A;  4MEY A;  4QWD A;  3RB0 A;  1ZQY A;  3V7J A;  4RUC A;  4RT3 A;  2OWO A;  1JIH A;  5KFZ A;  1L3S A;  5KFU A;  1BPZ A;  2AGP A;  5CR0 A;  1K1Q A;  7ICM A;  7ICV A;  4F92 B;  5L1J A;  2V9W A;  4DQI A;  5J0T A;  2W9A A;  2XC9 A;  5DG7 A;  3PO5 A;  4EBC A;  1A76 A;  4YMO A;  4NM1 A;  1Z00 B;  4QWE A;  3PMN A;  5KT2 A;  4KLF A;  3C23 A;  5DQI A;  4P4M A;  3AUO A;  2KTQ A;  4DO9 A;  4NM2 A;  2AQ4 A;  3V7L A;  1SL0 A;  1KFS A;  1BVS A;  2JZB B;  3ZD8 A;  4F5N A;  1ZQB A;  8ICE A;  4PHA A;  1A77 A;  3KHR A;  8ICZ A;  2P6U A;  4QW8 A;  1ZQF A;  4QZA A;  4J9R A;  5CWR A;  2H5X A;  2NRX A;  5KG0 A;  4QW9 A;  9ICN A;  1B22 A;  1V9P A;  4NY8 A;  2NRT A;  2BCQ A;  1QSL A;  1BPX A;  4NLG A;  4PGQ A;  5KG1 A;  3BQT A;  3HW8 A;  5HP4 A;  4B9N A;  4I27 A;  2HHX A;  1TK8 A;  3RB4 A;  4FS2 A;  3QE9 Y;  2UVU A;  4MF2 A;  1S77 D;  3TAR A;  3ZDA A;  4ELU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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