2NRXA

Crystal structure of the c-terminal half of uvrc, in the presence of sulfate molecules
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
GLRKEALEELMKLLNMKDFPYRIEGIDISHLQGKYTVASLVVFEDGFPKKGDYRRYKIEQDHPDDYESIRTVVKRRYSKHPLPNLLFVDGGIGQVNAAIEALKEIGKDCPVVGLAKKEETVVFENREIHLPHDHPVLRLLVQIRDETHRFAVSYHRKRREKESLRSVLDNVPGIGPIRKKKLIEHFGSLENIRSASLEEIARVIGSTEIARRVLDIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the C-terminal half of UvrC reveals an RNase H endonuclease domain with an Argonaute-like catalytic triad.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UvrABC system protein C
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
total genus 75
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain 2nrxA02
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrxA01
1KRPA 4YR0A 4F5RA 3TI0A 1MQ3A 4QZEA 3QZ8A 3PO5A 1A77A 2W9MA 3C5GA 4F5PA 2B21A 3V6JA 4LZDA 5BPCA 4PGXA 4DS4A 1NK6A 8ICTA 4RQ2A 3ZDBA 4QZBA 4ZH4A 4QW8A 4R8UA 4KLUA 4IQVA 2BCRA 3RB0A 3HPOA 4PHEA 1ZQSA 8ICOA 1L3VA 5TZVA 2PI5A 5DQIA 4RQ8A 4RQ1A 2ASLA 4DWIA 3EPIA 5HHHA 1TK8A 3RJFA 4TUPA 3OJSA 4RQ6A 1IXRA 3UQ0A 5KFPA 4KITB 8ICJA 3JPNA 4MEYA 4JV0A 2AGPA 5J2CA 4O9MA 4UB3A 1T7PA 4KLLA 2J6UA 3K75D 4HYKA 4I27A 4DOAA 1NOMA 2NRVA 2FLLA 8ICPA 9ICLA 1X9MA 4J9LA 8ICSA 4PHPA 2BPCA 3G6YA 1BVSA 2P6UA 2AQ4A 1T3NA 3ZDDA 2ISOA 4B9LA 4NY8A 4YG2A 4M9NA 2FPLA 3B0XA 3T5HA 3EWAA 1ZQEA 8ICKA 2UVVA 7ICLA 9ICXA 2C28A 8ICIA 1NK0A 5HMLA 5DKWA 1SZPA 3M9OB 3H8JA 3GDXA 5EWFA 4DQRA 3TAQA 3GV5B 3RH4A 4DQQA 4JWNA 1UA0A 2JZBB 1ZQRA 4QWCA 4KLQA 5KFTA 2AU0A 1L3SA 2J6SA 7ICOA 4KLMA 3PW5A 3T5LA 3V72A 4C8LA 3C2MA 4NM1A 5DGBA 1B22A 4MF8A 1QSSA 2VA8A 4I2FA 5KFNA 1TV9A 4Z6EA 5JUMA 2XC9A 3TFRA 2BDPA 4F3OA 3ZD9A 3FDSA 1ZQUA 4M47A 5KFVA 4J9MA 3OHAA 3UPQA 4ECYA 4ECTA 4BWMA 3PX4A 4IRDA 3EYZA 1ZQFA 8ICCA 4M6WA 2KZ3A 5EOZA 9ICHA 5CR0A 5KT3A 3LWMA 1U47A 8ICRA 1ZJNA 1BPDA 5F9LA 4I2GA 5KT7A 2PFQA 4O3SA 1XSLA 3BDPA 1UT8A 2W9CB 4QWBA 3GV8B 5IIJA 4ED8A 1RYRA 2P66A 4I29A 4M0AA 2BQ3A 3PR5B 4Q45A 4UAWA 4BWJA 1S10A 1U45A 4PPXA 4QW9A 8ICZA 3MGHA 8ICFA 9ICMA 3PY8A 1NJXA 4I2DA 3OSNA 4KLGA 4XA5A 4BGDA 5KFBA 1U4BA 4Q44A 1ZQXA 2I1QA 4O3QA 2W9BB 3T3FA 3RJEA 3TANA 4UBBA 4DL3A 1NKEA 2XCAA 3MFHA 2HHWA 5EWEA 2KFNA 2R8IA 4I2BA 4NLNA 2KFZA 3C1YA 1JXLA 1BPZA 4RNNA 1ZETA 4C8KA 5J0YA 4J9KA 5IINA 3RAQA 1D9FA 5HHIA 9ICTA 1S0NA 5KFFA 3LDAA 5KFHA 4M9JA 5HMMA 3H7IA 3MABA 3OSPA 4RNOA 3HWTA 2V4QA 4DL2A 3TFSA 4R65A 4Q8FA 5KG6A 2RDJA 4YXJA 1XC9A 9ICUA 5J2FA 4B9SA 4FBTA 5KG1A 2VA2A 2BPFA 1HJPA 1D8YA 3NGDA 3RBEA 5J0OA 4UAYA 2C2DA 1CEZA 1RXVA 1ZQNA 3PVXA 3NTUA 2PFPA 3Q8MA 3BQ0A 2R8GA 1Z00B 4YVZA 4F4ZA 1S0MA 4QWAA 3RRHA 2NRTA 3RJJA 3PMLA 4F93B 4JWMA 9ICPA 5KFDA 2F1IA 3JPRA 3PX6A 1WCNA 3UQ2A 4RQ0A 5J0UA 4GC6A 1X9SA 4QZ9A 2W8LA 1RXWA 2XO7A 5J2DA 4PH5A 7ICGA 5CHGA 3H4BA 2R8HA 4DQIA 2BGWA 8ICAA 3HT3A 9ICBA 4F4XA 3Q8LA 1X9WA 4RQ4A 3ZDAA 3M9MB 4ECXA 3ISDA 1S97A 8ICLA 4DFJA 2DPIA 1TVAA 3QEBZ 2VANA 1NKBA 3GQCA 4MFAA 4JUZA 2WTFA 4DFPA 1QLNA 1MC8A 4QZHA 5KG0A 2FLPA 5KFZA 4PHAA 4YMMA 1ZQCA 4MFCA 1TAUA 2IBKA 9ICGA 1JXEA 1Y88A 4UB4A 2BCSA 8ICGA 5KG3A 4MF2A 3ZDEA 3H40A 5IIMA 5L9XA 7ICTA 3TARA 2XY5A 4YD2A 2H5XA 3T5JA 2A1JB 5KG7A 1U49A 1ZQIA 5BOMA 1XU4A 4IRKA 7ICJA 4FS1A 3SYZA 4KLOA 3TQ1A 5KFXA 2ZUBA 4KLIA 4DF4A 4M9LA 3ZD8A 2HHTA 3GIKA 2J6TA 2C22A 4KMUA 4QZCA 4O0IA 2JZBA 2M9NA 2HW3A 7ICNA 4F2RA 4UQGA 1NK7A 7ICQA 2BQUA 1NKCA 4PHDA 1ZQMA 4KLEA 9ICEA 2NRRA 5CJ7A 3SV4A 4UB5A 3RRGA 3EW9A 4IQUA 4QZFA 4RQ5A 1KEJA 3TAPA 5DB6A 3JPPA 2R8JA 3ETLA 3PMNA 3UXPA 4YR2A 3M8SA 2XY6A 4KLJA 3K4GA 3AU6A 4M9HA 3H8WA 4J9QA 9ICWA 4BXOA 1BGXT 3KHLA 4DLGA 4F2SA 4YQWA 2BCVA 4RT3A 4JK1A 2V4RA 3OJUA 3JPTA 1JN3A 1UT5A 3IHQB 2UVWA 5J0XA 1JIHA 3MDCA 5DB8A 4YMNA 4RPZA 4DSFA 4LZGA 3LWLA 4ED2A 5F9NA 4RPYA 8ICBA 5CP2A 4DL6A 8ICEA 7ICUA 5KFUA 3BQ1A 4GXKA 3H4DA 2JEIA 4QZAA 5IIIA 5HP4A 3HX0A 2GWSA 4NXZA 1RZTA 4M9GA 1K1QA 4EBCA 3C2LA 4YMOA 2BCQA 7ICHA 4DS5A 5J2AA 5DBBA 1RYSA 5KFQA 2ZTDA 5KFJA 4R66A 2XCPA 4UAZA 1HUOA 2IMWP 3IM1A 4JV1A 1NK8A 4I2JA 1NJYA 1COOA 4GXJA 3THVA 4Z6FA 1XS9D 1TKDA 1ZQKA 2FMPA 2UVUA 3AU2A 7ICRA 3Q8SB 3Q8PB 5DG7A 4YFKA 4IR1A 4I2EA 9ICSA 7ICSA 2BHNA 1ZQZA 3JPQA 5KFCA 4NLKA 3HW8A 5J2GA 3PV8A 9ICVA 4ECRA 4G3IA 1ZJMA 2XY7A 5DLGA 1TK5A 4KTQA 3OHBA 2NRWA 5KFGA 5KT6A 2ZTCA 1SL2A 5J2EA 2AQ0A 2BPGA 9ICAA 5J29A 5KT5A 3SZ2A 4PGYA 4DF8A 1ZQDA 4K4IA 3V6HA 4DSJA 3BQTA 4B9UA 3MFIA 4IQWA 2MUTA 7ICKA 4DQPA 7ICVA 3EZ5A 2NRZA 1KTQA 3LK9A 1XSPA 1SL1A 8ICHA 7ICPA 4YN4A 5J2KA 5KFOA 3RB4A 4DLEA 3GFKB 3RH6A 4RQ7A 4JV2A 4EZ6A 3PX0A 3GV7B 2HVIA 2HHUA 2KTQA 4DSEA 3RJIA 5KFAA 5DDMA 9ICFA 3Q8QB 2FMSA 4M6WB 2FPKA 2HHSA 1H38A 3SV3A 5IILA 1K1SA 4EYIB 1XO1A 3ZDCA 1WCLA 4RUAA 3RB3A 4I2HA 2HHQA 8ICMA 1MSWD 4F5NA 4EEYA 1KSPA 1DOQA 5KFLA 2AGQA 1HUZA 2ASDA 1ZYQA 4Q8EA 1AROP 5CA7A 4J9NA 5KFMA 1Z3EB 1N48A 4P4OA 3GIIA 4CCHA 4R63A 2F1HA 5D49A 2HVHA 4DO9A 1UA1A 4J9RA 2XGQA 5J2JA 8ICVA 3C5FA 3M8RA 3RB6A 3KTQA 4O5CA 3N4MB 4RZRA 9ICNA 4NM2A 3QE9Y 5KG2A 4K4GA 2PXIA 5L1KA 2IA6A 5J0WA 5KFEA 5J0QA 1KLNA 8ICXA 1A76A 9ICJA 3C23A 4ECUA 7ICEA 1DGSA 1BPEA 3UXOA 5DG9A 4TQRA 1QSYA 1D9DA 5DB9A 3PW7A 1ZQQA 3KHHA 2ZJAA 4J9SA 3V6KA 4DFKA 1LB2B 4ELUA 5KT2A 5DQHA 4ECVA 5J0RA 4R64A 3MR5A 1BPXA 9ICCA 1S77D 4I2AA 4KN7A 3MR6A 3C21A 5DB7A 4QWDA 8ICYA 4J9OA 2ZTEA 1ZQBA 5HNKA 4B9TA 4DSLA 1S0VA 1NK4A 1SKRA 4KLFA 9ICIA 1PZNA 1TFRA 2FPMA 3RAXA 5DG8A 4UB1A 4RT2A 4IQTA 4TQSA 4TUSA 1NJZA 2R8KA 4B9MA 3EPGA 5KFIA 1L5UA 4NLGA 1ZQVA 4O3NA 1ZQTA 9ICKA 2ISPA 8ICQA 1ZQAA 3PO4A 4F8RA 9ICOA 5L1IA 5D46A 2W9CA 5DBCA 1EXNA 5J2HA 2NRXA 5J2IA 5KG5A 5J2BA 4KN4A 3SI8A 3G6XA 4FO6A 1ZQPA 5IIKA 3RR7A 4DOCA 4ECWA 3PW0A 1LV5A 4RU9A 4GC7A 8ICWA 5DQGA 1KFDA 4GLXA 4YXMA 1JMSA 2RDIA 4I28A 7ICFA 5J0PA 1L3TA 4YD1A 5D4BA 2KN7A 4DL4A 2BKEA 2ZUDA 4DSKA 2OWOA 3AUOA 3RJKA 3UXNA 2W9BA 4DFMA 4F91B 2XGPA 1TK0A 3ORYA 4R8UB 4TURA 3C65A 4F92B 5KFYA 2C2RA 4GXIA 3PW2A 1S9FA 5DGAA 1KFTA 4F4YA 4PGQA 3B0YA 2ZJ8A 2JEGA 4O5KA 4Z6DA 2C2EA 7ICMA 4C8MA 2BCUA 2DPJA 4UBCA 3PR4A 4O5EA 4RNMA 1XWLA 2F1JA 4UB2A 4LVSA 3PW4A 3T5KA 1T4GA 4F5QA 4ECQA 4QZ8A 2P6RA 3RH5A 3MDAA 4YR3A 4EBDA 3HP6A 3V7JA 3V7LA 4DQSA 3C2KA 3RTVA 5IIOA 4KLSA 2I9GA 1V9PA 3GIMA 5DBAA 3JPOA 1QSLA 3E2EA 1D8LA 4BXOB 1Z00A 4P2HA 2Q0ZX 1SL0A 3ISCA 4C8OA 2ASJA 4ELTA 3MR2A 4F4KA 2Y1JA 4X5VA 1S0OA 2ATLA 4IR9A 4XQ8A 5L1LA 1KDHA 2KZMA 4O3OA 4ED1A 4ECZA 2Y1IA 1NK5A 5KFSA 4J9PA 3GILA 3JPSA 3OGUA 1JX4A 4DL7A 2UVRA 2IHNA 4FS2A 4FBUA 4EBEA 2ZJ5A 8ICNA 4EYHB 4B9VA 4DL5A 4Q43A 4QZDA 4DSIA 5KFWA 1ZQGA 8ICUA 1ZQHA 4QWEA 3QZ7A 4KLDA 4F50A 4ED6A 4YCXA 5KFRA 1NJWA 1T8EA 4I2IA 2FMQA 1ZQYA 3ISBA 1N56A 3GIJA 5J0SA 2IHMA 3FYHA 1B43A 1C7YA 2AJQA 3Q8RB 4KLTA 3RJHA 1IM4A 2MAXA 1MQ2A 2HHVA 1ZQWA 2DFLA 3N97B 4RQ3A 4ED7A 2PFOA 2A1JA 4QZIA 3PNCA 2JEFA 4BDPA 2PI4A 3M9NB 4NLZA 2KZZA 4XUSA 1X2IA 5C5JA 4XRHA 5DLFA 5KTQA 2V9WA 4ED3A 4I2CA 4QZGA 1NK9A 1BPYA 1L3UA 1ZQJA 2PFNA 4TUQA 3MBYA 2W9AA 2VA3A 4ELVA 2JEJA 4ED0A 1SKWA 1ZQLA 2HHXA 1TAQA 3H8SA 4EZ9A 5L1JA 4F4WA 4MEXA 4P4MA 4ECSA 4RUCA 4K4HA 3MGIA 1BPBA 3C1ZA 5BOLA 1RPLA 3KHGA 2W8KA 3KHRA 4F5OA 4DOBA 1U48A 3RJGA 1U9LA 3BJYA 4O3RA 1KFSA 3V7KA 3RBDA 3BQ2A 3QEAZ 4RPXA 9ICRA 5DDYA 5CB1A 4E0DA 3MR3A 2MUTB 1XSNA 1SKSA 3Q8KA 4MFFA 5KG4A 5CWRA 1ZQOA 1S76D 4KLHA 4P4PA 4M04A 2FLNA 1CUKA 5EWGA 2BQRA 4IRCA 7ICIA 5KFKA 4M2YA 4YP3A 2BR0A 4DEZA 5J0TA 2ZUCA 4O3PA 4Z6CA 9ICQA 5KT4A 3RR8A 2LYHA 4B9NA 4C8NA 3G6VA 2ALZA 2AGOA 1QTMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YR0A 1M6YA 4F5RA 4QZEA 3QZ8A 3GOIA 4BGBA 3PO5A 2W9MA 4PJ0U 4F5PA 2B21A 3HYFA 2LBOA 4PGXA 4DS4A 2P5OA 2D0OA 3DRPA 1WSFA 1XNRK 2D0AA 1FKOA 4ZH4A 4Z4CA 4QW8A 4R8UA 4N5SA 1JCEA 4JS4A 3CQXA 3PSFA 3L2UA 4C23A 5TZVA 3N4QA 5GAEP 2ZG6A 4FLZA 1HQUA 4HUEA 1EWRA 5CEHA 4OLBA 4RQ1A 2ASLA 4DWIA 3ZT2A 3AGRA 1HIWA 5HHHA 2O8EA 4TUPA 4IC9A 2ZJRL 1IXRA 2LM4A 2FBXA 2NO5A 1TE2A 3TAFA 4JV0A 3VQPA 3CJ9A 1XMQK 3ID8A 3DLKA 1G15A 3K75D 4HYKA 1BDGA 1NOMA 2YB4A 3I28A 3SQ2A 4LFBK 8ICSA 5BREA 5HRPA 2BPCA 2P6UA 2PMZC 2ISOA 4QAGA 4RW6A 4M9NA 4JYAK 2QI2A 3WXKA 3EWAA 1ZQEA 4H0XB 5HMLA 4DV2K 3O6WA 1SZPA 3RH4A 2P9LB 4OJPA 3GV5B 1ZQRA 1YXQA 1PK3A 2YX8A 2J6SA 3SCXA 4RG8A 4M3UA 4FZYA 4NM1A 5DGBA 4IZ9A 3F9KA 4MF8A 2YMQA 1SV0A 3MDQA 1TV9A 4Z6EA 5JUMA 2XC9A 1N34K 5JVHL 4O8KA 1ZD2P 2RHFA 3KZBA 1QVGM 3M6ZA 4M47A 4NCGA 3WNEA 3PX4A 1KAYA 1Q81O 1RTDA 4M6WA 4CDGA 4ZHRA 1U47A 5HBMA 4AP9A 2Q97A 5AHXA 3O1BA 2WAQC 5F9LA 3W0LA 2ZIUA 1Q3VA 3KKSA 2KSOA 4CZJA 3RSEA 4QWBA 2B6GA 4IFEA 4FZLA 4M0AA 3WKDA 2BQ3A 2WFBA 3GL1A 4B1ZA 1TL3A 4H0YB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1KRP A;  4YR0 A;  4F5R A;  3TI0 A;  1MQ3 A;  4QZE A;  3QZ8 A;  3PO5 A;  1A77 A;  2W9M A;  3C5G A;  4F5P A;  2B21 A;  3V6J A;  4LZD A;  5BPC A;  4PGX A;  4DS4 A;  1NK6 A;  8ICT A;  4RQ2 A;  3ZDB A;  4QZB A;  4ZH4 A;  4QW8 A;  4R8U A;  4KLU A;  4IQV A;  2BCR A;  3RB0 A;  3HPO A;  4PHE A;  1ZQS A;  8ICO A;  1L3V A;  5TZV A;  2PI5 A;  5DQI A;  4RQ8 A;  4RQ1 A;  2ASL A;  4DWI A;  3EPI A;  5HHH A;  1TK8 A;  3RJF A;  4TUP A;  3OJS A;  4RQ6 A;  1IXR A;  3UQ0 A;  5KFP A;  4KIT B;  8ICJ A;  3JPN A;  4MEY A;  4JV0 A;  2AGP A;  5J2C A;  4O9M A;  4UB3 A;  1T7P A;  4KLL A;  2J6U A;  3K75 D;  4HYK A;  4I27 A;  4DOA A;  1NOM A;  2NRV A;  2FLL A;  8ICP A;  9ICL A;  1X9M A;  4J9L A;  8ICS A;  4PHP A;  2BPC A;  3G6Y A;  1BVS A;  2P6U A;  2AQ4 A;  1T3N A;  3ZDD A;  2ISO A;  4B9L A;  4NY8 A;  4YG2 A;  4M9N A;  2FPL A;  3B0X A;  3T5H A;  3EWA A;  1ZQE A;  8ICK A;  2UVV A;  7ICL A;  9ICX A;  2C28 A;  8ICI A;  1NK0 A;  5HML A;  5DKW A;  1SZP A;  3M9O B;  3H8J A;  3GDX A;  5EWF A;  4DQR A;  3TAQ A;  3GV5 B;  3RH4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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